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Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s496 | supercontig | LSalAtl2s496:50959..123619 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000008230 >EMLSAP00000008230 ID=EMLSAP00000008230|Name=EMLSAP00000008230|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=213bp
MWIYTHFXQSCLLFVVLILGIYVPGXXENFGIKMYNLKVPDPLILGSAAD LYCDYDMEGSQLYSKERSSSRKVRLKVVRWSTEGNYKCEVTAGKPYYDTV VNSSIARIVGPTITGRRDRYTSGDLVELNCSSNSSKPATELSWYINSIQA DNSTLIYYPIKEERDGRKTSILGIKFRLREHFFSVSISDACGCTYILNRF GLFLKLSDFVKFE back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s496:50959..123619+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000008230-704077 ID=EMLSAT00000008230-704077|Name=EMLSAT00000008230|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=72661bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s496:50959..123619+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGTGGATTTATACTCATTTCCAWCAAAGTTGTCTTCTATTTGTGGTTTT
GATTCTTGGGATTTATGTACCAGGTAANNCAGGTAATATTTATTCTCACT
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TGATCCTCAATTCTACTCTGATTCTAGCTAGAACATACAATTATAACCAT
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AGGACGAACTTTAAAATACACCTAATTTTTATCATTATTTTCTTCAAATT
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GCTTCAGCTCAATTTCTCATTTGTTTATTGTAATAATCAATTTTAGTTAC
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AATTAGTTGAACGATACAAATTTACTGTATGGAAAATTTTGAGATAATTC
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ATTTATATGTTAAATTAAAGAAAAATGATAGTTAAACTGATTAAAAGTTA
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TGGAAGTTGCGATTTCTGTACAAGTTACAACTTTAATCTCTTATAATAAG
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GCAGATTGTCCTGTACCTTGCCCGTTTGGGTACGTAATGCCATCCCTTAA
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GTTGAAGAAACAATAGTTCAACCTGAAACAACTATTCTAATAAGAATGAG
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ATATTACTTTCTTTTTTGTACTTCCAAAACGTATCTTATATAATCAAAGT
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TGACGTGTATACAAACTATATATGTTGTAACCGGCCTCCATATGAAAATA
CAGATTTGTTAACATGTTCTACATATGTAGAAGTATCATTATTCCAAACA
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AACTTATTTTATGATTTGAATAGACATACGAAAAAAATTGAACTACAATA
ATTTATAATATTGATTAAAAGTTGAAAAAATAAAACAATGCTTATAATAT
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AATTTACATTATTTTTCCTAAATACTTTATTAAGGTAGTTGATTAATTAT
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TGCCTTTTTTTTTTAGATATTTACAAAAAATAATATTCAAACCTTCATCT
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TAATACTTCAACTAATATATTATACTAAATATTTATAGACCGATAGAGCT
GAACCGAGACCGAAACCGTTTAAATGAAAGAACTGAGACCGGGATCGATA
GCACCGGTGAGCTTAAACCGGGCACAACCTTGCCTTTTGTCATTATTTTA
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GATAGTTGTAAGTCCTTGTTGGATTCCCAGTAGAATTGAGGATCGACATC
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CATCGAAGAAAAATTTTAGATGATCTATTTATGCTGCTCTCTTTCCAAAA
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CTATACAGAGTTGTTGACGAAGGCGTGTTCTTCTCTTTAAATTTAGTACT
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AATTAGTTACAAAACAAAACAACCCTGAGCTCTCTAGCTTATATGCAAGT
CAAAAAAATAACTTTTGAACGTGATCAACATTTGCACACTCCAAGTAGTA
AAGCAACTGCTATGCCGTCAGCAAGTCAAAAAGGCTAAAGTAGGCCAAGA
TGAGTTAAAGAAAAGAGCCCAGGCCACTCTCCTCAAGTTGAAGAGGGCTG
ATGTGATCTCGGGGTTTCACACCACACAGTCCTAACAGTTATCCAAAAAG
TCGATTATAAGAGCCGAATGAAGATTGAGAGGCCCCTTTTTACACCAGCA
ATGAAAATAACCCATTTCTTTCGTTGGAAGAATCTTTTGAGTTCTTTGAA
CTCTTTTTGACACTTATGCCCCCCCCCCCTACATCCCTGATGCCAAACCC
CTCAAAGGATTGCAGGGTCCGTCATCCAAACACTGTGGGCCTCAAAGCCA
CTGTCATTCAGCACTGGAACTACATATGGCTTRCACCGCCACCRGCAAGC
AATTATTGCTGCTAAGGTCAGTTACATTGATGATCCTATAAGCATGGGAT
GTAACAATATATTATATCTCTGTCGTTGTTTTTTTCTTGAGAATAGTGAA
TAGGATAATGCAAGTTGGAAATCTACAGTTGCATAATATTTTCTAATAGA
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TGCATTTTTTTGATATCTTGCCTTCCAAGAAAATATTCAGTGAAAAAAAA
ATAGAATACTATTTTCAGCAAACTTAGGTTGAGATTAGAGGACTCAGAAA
GATAACCAGTTACTATCTAATGAATTGAAAATAATGAATCCTTTATATGT
CAAGATGATAAATTAGATTTGGCTCGGAATACGAAACGGAAGGATTTAAT
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AATAGGGATGAAGGAAAGGTATTAATGGATTTAGCATTTTCAGAGTGTCG
ATACATTTTCTGATCCAGGAGTCTTCAATTTTTCAAGATTTTTCTTTCAA
AGCAGCTAACTGATGATTGAAATTCAATTATCGAGACCTGATATGCTATC
TCTCTAAAATCAGGTTACCCTATTTCTTTTATCTCAGGTATGGGTTTCTA
ACAAAAATAAATATAGTTTTTAGATATTGTAGCCCAGAGAAGTTAATTTG
GATTTGAAAAAAAAAAAAAGTTAAAGGGTCAGTAAACAATATTTTCCATA
ATAAATATAAATTGAGCATTGAACATTTGCGTGCGCTCATTTCAAGCCTA
AGAGTAACTGTGAGGATTTGTTGCAGAGCTATAATTGGAAGTCCTTGTTG
GACTGAGAGTAGAATTGAGGATTGACAATGGAGTAATTCTTGATAACATC
TTTTTTTTATTTACATTTCCCCCTTGTTATAGCTGCTATTAGCTGATTTA
ATGAAACGTTATCACAGCTAAGCGCCTCTCTTCAGAAACATGTTTTAAAT
ATGTATTAACTTTAGAACTAATATTATAGCAATACTCATATTTTAAGTCA
TTAAATTATGTCATCATTAAGTCATCAATAAGTCATCATTAAATTATACT
ATAAACTATGGTATTAATACCAAACCATAGACATTATACTTAACTTCTAT
GCGTATTCTTTTGATAAATATTGATTGGTTGAAGAGTTATAAGTATAAAT
ACCCGTTGGACTCAGAGTAGAATTGAGAATAGATCTTGGACTTTTTCCTA
TCATTTCCTAGCTAGATACGGACTTAGATGTGTGTATATATGCTTTCTCT
CATAGCTACTTGCAGCCAATCTAACATGACGTTATATAAGATCCCTGACC
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TGATGATTTAAAATACTAATTTTATTTTTACCCAAATATTTTTGAGTTTT
GTGGAAATTTTCAAAATCCTTGCGAGCGTTAAATCGAAAAAAAATTACAT
GAGGGGCACCAATAAAAAAAGTGTTCTTATTATTTCTTCCTCTCTATTTC
TATAATTCAAATGTTTACGTACGTGCGACTCTGTAAGCAAATATGTCGTT
TTTTAAGCCTGGTTTTTACACCTACCACGATTTTGACAATCTTTACATCT
CTAATATTTTTTTTTCGAAGCTTTCCAAAAAAAAAAAGAAGATGAATAAA
GTCTTAAAAATATGTCCCGCCCGTTTGTTAAAAAAATATGATGCAAATGA
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CTGGCATTACATAAATAAAATTCCAATCCGACTCCATATCAATCAAGGAC
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GTATACTTTTATATTATGCAATAAGGCTGTAAAATAAGTAGCGGAGTATA
CGTAGTTTCATTCTAAAGGCAAGATTATAATGTTTTCTTGGACATACCCT
CATTGCTATCATGCTTTGGAATAGTGAGGAACCTGCATTTAACGTCAAAA
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TGTTGCAATTATTAGTAATACAACATTAAACCAACTAAAGTTTAATATTA
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CAATTTGGAACTGTTGTTTCATGACTATTCTGATATATTAATAATAATGA
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CTGAAAATTAAGCAAACAATCTTTTTTCATATTTAAATCGCATATTATAT
GAATTTGAAGCTAATCATATGATAAAAAAACTGTTTCTAAAATGCATATT
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TTTTGATTACAGTAAATTCTCAAATAGTGGGAACACCCTGACATCTATCC
CTTTTCTGTTCTGTGGCCTCTTTTATTTCATTCATGTAGGACTAGGCCTT
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CCTGAGTGGTGAACTTCCTATCCTATTATATTCAAAACCTGATTGAACAT
TTCTATGTGCTCGTGAAAGAAGGAGATTAACCCTAAAGATTTGTTATGGA
GTTATAATTACGTTGGAGTAATTTTTGGCAATGTCTTTGTTTATTTCACT
TCTCCCCCTCATACATGTTGCAACTGATTGCAACTAATCTAATGAAATAG
CATTACAGTTAACCCTTTACCACCTGAATTTTATGGAATGAATTAGAAAA
AAAATTTCTCATTTGTATAAACTTTACTAAGTATCAGGATATAATATGTA
AGAAAAACATCAAAAATATTTGTTAATAAAAAAATTATATTGACAAGACT
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CCCTCTCCAAAGTGCCTCACACAGTAAAGTCCAACGGGTTCAAATCCGTC
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CTGGTGATCCCCCAAGCCAACAGTCGTTCCAACGGTTGTAGAGCTGGTAT
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CTACACCTATTTATTTAAAATGTGACTTTGAAGTACATTCAGGTAGTAAA
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TTAAAGAATGAACAAAATGATAACAGAACACATACAAAAACCTATTTTCT
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