EMLSAT00000008274, EMLSAT00000008274-704121 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000008274
Unique NameEMLSAT00000008274-704121
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s4supercontigLSalAtl2s4:1376725..1399746 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000008274 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000008274EMLSAG00000008274-691040Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000036725EMLSAE00000036725-745653Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000036726EMLSAE00000036726-745654Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000036727EMLSAE00000036727-745655Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000036728EMLSAE00000036728-745656Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000036729EMLSAE00000036729-745657Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000036730EMLSAE00000036730-745658Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000036731EMLSAE00000036731-745659Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000036732EMLSAE00000036732-745660Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000036733EMLSAE00000036733-745661Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000036734EMLSAE00000036734-745662Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000036735EMLSAE00000036735-745663Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000036736EMLSAE00000036736-745664Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000036737EMLSAE00000036737-745665Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000036738EMLSAE00000036738-745666Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000036739EMLSAE00000036739-745667Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000036740EMLSAE00000036740-745668Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780721auto780721Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000008274EMLSAP00000008274Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000008274

>EMLSAP00000008274 ID=EMLSAP00000008274|Name=EMLSAP00000008274|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=447bp
MKIYCDAGAAFSEMTSGIAAYFAQNCYNSRRWRIIPSAVLTNTPVNAYCR
APGSTQGVAIIETVMDHLSHATGIDPLQIRRANFLTIGDPLLDKTYLKDS
NPLDIMIGKMLESSNYTGRKKEIENFNKANKWVKRGISFNPTKYSYDYSP
DARFDAYIAVYSTDGSILVTVGGXEMGQGLNTKVIQVIAKELNIPVNKIK
ITTSSSLSSPENSTTGGSFGSESCAAAALNACRKLMERMKPVKEEMENPS
DWEELVKRCFAKNIDLTVRHMGNPTNDKIKSYNIWSLAXSEXKVDILTGE
TCILRADLAQDTGTSLNPDIDVGQIEGGFIMSSGFFTSEEIKHHPVTGKI
MTNSTWNYKPPLSKDIPQDLRTSFYNGKRHDLGVFGSKATGEPSVLLGCS
XLAAIRYAIQSFRSMTLDKHDWIVLNAPATPENIVTTSQMASQYFIL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s4:1376725..1399746+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000008274-704121 ID=EMLSAT00000008274-704121|Name=EMLSAT00000008274|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=23022bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s4:1376725..1399746+ (Lepeophtheirus salmonis)
TATAAAACAAAACAATCTTGAGGCCGTAGCGGAGCAGCGTCATAGTAGTT GGTGAGGTATACTATCTAAATTTATATTCTTATATATTGTACGTACATAT ATGTAACAGTTTTTGGGTTTGGCACAGGGCAATCGGCTTTCTACCCTTTC CTTTTATGAATCACAGTCATAAGTTAATAGAATAAATTGAAGAAATATCT CTTAACTTACACTAAGTACATAATTAATCCATAACCTTGGATAAATGTAA TTAAATTTATATAATATATTTCATAATATTTCTTGATATTGTGGAAATTG TTACTAAAATAATCTTTATGTAATACAATGTGAGCATTCTATCTCAATGA ATGGGAGGCATTTAATATAAATTAAAAGGTTGAGTGATTATTAGATAATA ACAATCATATGTCCGAGTTAAGTGTTGTTATTTTCATTTACCTACAATAG TAATACCTCGGAATTGACTGTCCGTACAGGTCAGATCGTTATCCCGAGTG TGCTATTTTCATTTCAAATCCCCTCCTGATCCTCTCTTCATCTTCATGTT GAAGTGATCTTGCCTCTTTGTGCCTCATTCGCCTGATCTCATCTCCTTTA ATTGAAGGATCGTTCATTGCACTKCTGCCCCTTCATATCAAGGTATGTGA TAGCCGATAGGGACTTTTGACCTCGCGAATAATTGTCTTTATGCACAAGA ATACATAAATTATTCTAGATCTTCTATGGAATCATCGTATACTTCTACAT ATTAGAACTATGGGGTTCCATAAAACGACAGAATAATGGACTGAAAGATC CAGTGAGGAACAGAGAGAGTTCTCATCCACCATCCACTTCCCTGTTATTC AAGTTCTTGAGTATTTTTTCCTTAAGTCAACTCTACTTTGGCTCCTACTC TAAGATAACTACTTCATTCATAAGTGTCCTTGATGTATATAACGCAGAAA TAACTGATTAGTGTTATTTATAAGATGGAGTTTGTGATGTATGGTCTATA AGACTATATACATAATTATATAACTTGGAAACTTTAAGCCTCATCCCTGA TTAGTGATTTCTTTATTACTTGTAAGTCTCTTTTGTGATTGAAAAAAAAG TGGAAGATGATTCTAGACTCTTACGATAGTAAGATAGTTTTCTCGATAGT TATGGCTGTAATGCATGTTCTATTCTGCTATTGTATATAAATTATTATTT TATCTTTGATCAAATCATCAAATACTTATATTATTGAACTGAAGAGACTT AGAAACACTATGAAAAATATAATGGAAAATACAGTGAGGAACAAAGAAGT TATCATCCTCCACCCACAGATCCTTCATTGAGACTTGTGTTCCATTCTCC TAAATTCAACTCCTACTTTAAGTTAACGCTTTCCTTGATAAGAGTAATTT ATTGTCCTTAATACCTATAACGCACGAATCACTACTGAATAATATCTACC CAAAATATCAATTCCATTTATAAGTAAGACTATTTTACCATTGGAAAACA AGTGGAAGATTATTTTTAAATCCTCATTTTTCTTAATATTTTGGTCTGCA ATGGATTATTCTATTATGTTATTGCATATAAATAGTTAATGGCACTGTCA AGTGATTAGGTGTTTAAAAAAATATAAGTGACTTCTGAGTTTCTGTAGAT TTCTATTGAAATGTCTGAATTTTGTTACAATTCCAAAATTATTGCCTCAG GAATTTTCTTCTAAACAGCTAAATTGCTTGTTAGCATATTGGAATATTAC TCTTGCGAAGATCTAGGATCTTTACAAAAATAAATAAATGTATGCCATAC GAGCTAATTATAAGTGTTTGATTGAAAAAAATAGTTAAAATTTAACAAAA CAATAAAACAAATGTTGAGTATTATTTGAACAAATAAAAATAATTACAAC ACCAATGATATTCTTCTAAATTTAAATGATCTATTTATGAGTTCTCCTTA TTTTTTATTACTGATTCGTTCGGTTTTATTTTTTGGAAATAAAGATGCTA TCCTGTTATTGAGATTCTTGTAAGGTGAGTAGAGATTTCAAAATCCTTCG TATTTGATTACCCTAGTATTTCTAATATATATATATATATATCTAGAGAT AATAGTCAAAATCACAAGCCAAAAGAAGCTTATTCAAGGCATCATATTCG GTTATATTAGCAAGATAATATAATTGAGCTCTATTTTAATAATGTTGAAG ATAAATGCCAAATTAAGATCTTATTGTTAGTTTATATTTTTCACATGAGC ATATTATGTTCAGTATATAGTATCCACTTATTTTTAATATTTTATTAATT TTTTCGCTATAATGATGGTTTTTTACTATAAAAATATACCTAATATTATA ACAATGATGTATAACCTTTATCTAAAGAAAATGTATTGAAAAATACTCAT AAATGTAGTCGTTTAAAGTTAAAAGGTAACTTATAGTAGTATACCGTATT AATAAACSTAGATAGATAGGGGAACAGGCCCCCCCCCCCAACAAACTACC CCCGGCCTTTAACCCCAACCAACTACCCCCTATCCTTTTTTATTATTGAG AAGTACAGTTAGTGAATGATAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGCCAAAGTAATAAATGAATTTAATGGT TGCTTGGATCGGTTGKTGRGGCATAAAAMTTTCAAGTTCGAATCGGRAAG KAATTATGAGKTCTATAAATTATCAAAGTTTTAATACTAAAATAAATAAA AATTTCAATTAAAATAGATACTTAGCCTGATTGTTTAACCATAGGCATAA TATATAAGATACAATAAATATTTATAATAATCCCTATTCTAATTTCCTTA ATCCCATGACAAAAAGTTGGAAAAACATGGAATTTTAGTATGTTATTAAT ACTAGGAATTTAGGGATTGATTATATTAAACGAATATACACATGATGTTA TAATAAATGTCTGAGAAGGATTTTCGGGTAACTCCTTCCCGAGCATAGAG TTATGCATATCCAAAATAAATAGGTTAATTATATCTAATTTTTGATATAT GTGTTTCAACATCACAAAAATCAAATAGAATCATCCAAAATCTTCTCAAG TAATATCTACATCAAAATACTGACTCAGATACATATAATTATTATCTCGT ATTTGATGAGATATATTTATTAATAATAATACGTATCACTAATATTTACG TCATTAAGTTAAATCAAAGACTCCGTGGTTAAATTAAGAATTACATTTGT ATGGCTGTTAAAAGGTTGAATGTTTGTTCGTATAGTTACTATTAATTGTA ATAGGGGATGAAATGCTGGGGGKAGATGGTTCTGGGGTTAGATGGCCTAG GGGGTAAAAGGAGGTAATTGATCGGGGGGAAAAGGACGGGGGATAAGAGC TAATCATTGGAGTATCTATCTTATATTTTTATTTATGCATAGTTATAGTA AATGGATTTGATGACCAAAGTTCATTTCTATGATGCCTATTACGTTCATC CTGTCGTAGTGAATTACTTAATTAGATCTGATCTCCTCCGGTCTCAAAGA GACAACCACTTCCACATAATGAGACCTTCCATTTAATTTCATGATCCTCC AAGGGGCTAATTGTCAGAATATATCGAAAAAGTCAATATCCCGTTCCTCC TACTCCAATAATATATTCCTTATCANGTCTATCCCAAATATATCTCCCAT TTACTCGAAAAAGGATAAAATATTATTTTGTAGTTCTGGRAGCACTGATA GTCACAAAAAGTCCGATGTATCAGATGAAACAATTACCCGTACTGTTCGG AGTACACGAACTTTTTGTATTTACTATGGTTATTTTATTGTGATATCATC AAATAAATTCAATTATTTCAATATTCATTACATTATTAATAAGACGTTCC ATATTGCAAAGTCGTATTACTTTTACATGAAATACAATCCCTAACACTTA ACAGTTCTGAGTATACTATTTAATGTTATGTTTTAAAGAGAAGTAACTTT TGAACTCATTTTGACAATGTGCTTACTTTCATGTTGTCTAAATAGAGTTT ATTAAATGTGTACTTATCATCAGTTATCACTGCTCATTTCATGCCATAAA 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TTTAGACATAAAATAAAAGTTGTTTAGAATTTAAAGTTACGTACGTAAAG CTCTGATAAATTCTGATTAGACTAGATTCCTGGGCTCTGGAGGAATGTTT CATTTTTGCAAATAAGTTGATATTTTTTTTTCATAAAACAAGATCTATTC CCCGTGTCTCAAAGTTTTGTAAGGTATGGATTGTCGATTCTAAAATGCAC CAAAAAAATTAAAAATCCAAAGAACGAATTATTGTATTAACTGAATATAG GAGAAAGTGTATTAAATACGAATTAAAAAAGAAGGTAAAGGAAGAAGATG AGCGAGTTAATCTTAGTATGTATCGTGAATCTTCACTTATGTTGAAGAAG GAACATGACAAGTTAGCAATGTCAATGACAATAAATAAATCACAAGGTCA AACATTTGAATAAATTGCTTTATATTTACCAAAATCAGTATTTTCACATG GTTAATTATATATGTTGCGTTTTCACAGTGTCAAAAAGGGTGCAAATTTG ATTATATTTACATCTAATGAACAGAAAACTAGAAAAATGTTGTATACATG GAGGTTTTACTATAGAAATTTACCTATTATTTAATTATAGTAGACTGTTT TAGTATAACATTTTAACATAAACAAGCCAAATAAAATTAAAATCTTTAAA ATTTTTCAATGGCTATTTTAAGATAAAGTGTTCGTGCCTGTATTATCTAA CATAATTTATAATTTTTTTGTTGACTAAAAAATACAATTTTATGTTGTGG ATTTGTGTGCTCTGAGTGGAGGCACGGAAAATTTATTTTTAAACAAGGTG TTGTTAATTAAACATATCGTATTTTTTTAATTCATGATACAAACTATAAT ATTAAGATTTACTGATTTTTTTTCAAATTTTTCTTCACAATTGCTTCCAT TTTTCTTTCAAAACAGTTCCACCAAGCACAATTTCATCTGTAACAACCTT GGGTCATTATCTAAGAAGAAATCTTCACTTAACTGGCACAAAACTAAGCT GTGAACAAGGAGGATGCGGTTCATGCTCTGTGCTAATGTCATCGAAAGAA TCCAATCAATTTGTTGCCGTGAACTCTGTGAGATAATTAGCTGCATGTTT TTATTATCAGATTTTGTATAAAGTGTTTTTTTTAGTGTTTAATTTCAATT GCTAGTTGTGATGGATTTCGAATAAAAACTGTGGAGGGTATAAATGATCA AGTTGTACCCCAAAGATTAGCAAAGTTTAATGGGTCTCAATGTGGCTTTT GTAGTCCAGGAATGGTCATGGCTATGGAAAGGTTTGTAATATTTTTATTG GTAATTTTAAAAAACTGATAATCTAATGACAAGGTTATAAGTAATGGATT TATTTTCTATTCTATCATTTTTAATTTTTCTAATATTCAGTCTAAGAATC AATGGAAAACCATTTACTAAAAATGATGTTGAAAAACTTTTAGATGGGAA TATATGTCGTTGTACTGGATATCGACCTATTCTAGACAGTTTCAAATCCC TTGTTGAAAACAATACAGAAACTATTCCTATTAAGGATATAGAAGACTTT AAACCTTGTCGCCTCAATTGTAAAAAGCTCCATTATTCGTTTGATGATGG AGTGCAGTATATGAAACCCAGATCCTTCAAAGAATTATTACATGACCTGG AAAACATTCAAGAGTCAAAGACATACAAGGTTGTGTCCGGTGGAACTGGA GTGGGTATGTAATTTCATAATCACCGTTACTGTGTTGAATATGTTATTAA ATTTATTTTTTATTTCCAGGTATTTATCCTAAGGAAGATGCTTATCAAAT AATCGTGGATATTAACTCCGTTCCTGAGTTCAAAGAGCATTCCATCAAAA ACAATGAGCTTTTTCTTGGATCGGCCATGTCAATACAGACAGTAATTGAT 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