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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s4 | supercontig | LSalAtl2s4:1376725..1399746 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000008274 >EMLSAP00000008274 ID=EMLSAP00000008274|Name=EMLSAP00000008274|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=447bp
MKIYCDAGAAFSEMTSGIAAYFAQNCYNSRRWRIIPSAVLTNTPVNAYCR APGSTQGVAIIETVMDHLSHATGIDPLQIRRANFLTIGDPLLDKTYLKDS NPLDIMIGKMLESSNYTGRKKEIENFNKANKWVKRGISFNPTKYSYDYSP DARFDAYIAVYSTDGSILVTVGGXEMGQGLNTKVIQVIAKELNIPVNKIK ITTSSSLSSPENSTTGGSFGSESCAAAALNACRKLMERMKPVKEEMENPS DWEELVKRCFAKNIDLTVRHMGNPTNDKIKSYNIWSLAXSEXKVDILTGE TCILRADLAQDTGTSLNPDIDVGQIEGGFIMSSGFFTSEEIKHHPVTGKI MTNSTWNYKPPLSKDIPQDLRTSFYNGKRHDLGVFGSKATGEPSVLLGCS XLAAIRYAIQSFRSMTLDKHDWIVLNAPATPENIVTTSQMASQYFIL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s4:1376725..1399746+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000008274-704121 ID=EMLSAT00000008274-704121|Name=EMLSAT00000008274|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=23022bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s4:1376725..1399746+ (Lepeophtheirus salmonis) TATAAAACAAAACAATCTTGAGGCCGTAGCGGAGCAGCGTCATAGTAGTT
GGTGAGGTATACTATCTAAATTTATATTCTTATATATTGTACGTACATAT
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GGATTTTTTTTCTTTCAAAATTAGTTTTTCGATTTTTTTCTTTTAAAATT
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ATGTATTCGATCCAGTCCAATTTTATGACCATCCTATCAGTCTTCGGAAC
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AATATGAACATTTATTTAAAAAAATGAGTCTCTCCAAAAATGATTTATAC
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TGTTATAACATGAAGACTCATGTCTAAAATTGTATATAAATTATTTCAGG
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TTTTTGTGAGCTAATTTTAAGTTAATTAATAATCAAATTGTAACTTGATA
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ATGAATTTAAAATTCTTATTTGAATTCCACAGTCTTTTTTATATAATTTA
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GTACATTTTTTTCATCTTTTAGCTCATATAGGGTAGCAAATAGATTTGCT
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TTTTTTGGATTTTCAGGATAAAAAAAGCCTTCTTATTATAAATTAGGTCC
ATTTTTAATTTTTATCGAGCTTTTTTAAAAAAATCTTTACCTATAATTTT
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CTCGTCCCAAGGCAAACAAACTTATGAAACAGATCCATCATTCTATCCAG
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TTAAAATACACAGATGACGAAATGCCTGGAACAGGGGAATATTATGGGGC
TTTTGTTGTTTCTGATTTGGCAAACTGTAAAATTGACAAAGTGGATCCAA
CCAACGCATTAGTTCGTTTTATTTATTTATTGATTCTATGTATAGAGCTG
TGGGAAATATGACCTGAAATGTTTAAAAAAATAATCTATTTGACAATCTA
AAAACAGTACTTTATGTATAAAGTAATTAATGAAAGATGAAAAGTAATAA
TTAGGTTTTGTTGATGAGTTATGAGTATAAGTCCTTTTTGGATTCCGTAT
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ATGCCTGGTGTAATTAAATATGTGGATCATAAAGATATACCAGGGAAGAA
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GTGGCGTCATCTTATGGCAAATATTACATCTACCTGAATGATTAAATAAT
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TGCTCCATTTGGTAAACAACTAGCTACAAACTGTCACACCACCTTGAATA
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ATCATTWTTATGAAAAGTTAGTGGTTTATTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAT
TTACAAGTCATTTTCTCTTATTCTTATACAGAAATAATTAAAGTATTTTT
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GCAAAAAATGACACTAAAATATGTATATATTTAAAAAAATACTAGTCCAA
AAAAAATCGGACTATAAATAAAAAGGGAGGGGGGGAAGGGGCGGAGAGTT
GGTTAATTTATGAAAATTAGCAAATTGATATATTTTTGGATTGATGTAGC
TATGTATAAATTAATTTCCAAGATAGGATTCAGATTAATTATGAGTAAAG
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TCTATATATCATTGGAAGTAAATTGCTCAATATTAACAATTTGATAAAAT
ATATAAAATGGGGCATGATTAAGAATGATTTATTGGTTTCAGATGATTTT
TATTCATCTTTCAATGCTCAGGAGAGAGATGGTATCAAACAATAGTTGCC
ATTTGATGATAGATTCATTATTGTGGGAAATTGTATTTGATGATACTCCA
ATTACTTTATCTAAGAAATAATTCTATGCATTTCAGACCTTTTTTAATTA
TATTTGATCAAACCCCTTATCAGATCAAAATCTACAAATCCAAAGACGCA
TGTCTTCTTTTTGATAGAATCCCTCTGTTAGTTTGGGAAGATTAATGAAT
TTTACAACTCTGTTATAATTAATTGAAAGGCTGGCTACTTTGGAAATATC
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TATAAAATAGACGTCTAATAATACACGTCACTGCTAAATAAATGTAGAAA
AAATTGACTTCCTTCAAATGATAATGTAAGCAAGATTTTTGTGCCACGCC
CATATGTTGAGTGAAGTTATTATATATCAAGATAAAACTACATAATCATG
GGACAACGATAAATCCCAACAACACATGCTGGTCAAATTCATATGAATTG
ATTTCATGATTTATAATTGAAATCAGGACTAAAACATTGATGGTATAGTA
GTTCAACTGTTTTTTAATGGTATAGTGTTGGCTTGGTGCGGGCTTCAGGA
GCTTGATATTATTTTTTAAGCTTATGTCTGACCCCAAATAGAATTTATTT
ATTACTATTATTTATTTTCCCAAAGATTATCGTTACTATATAAACTGTAA
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GTAATACAAATTAACTATTGATTGATGGAATCTATAAAACTTTTCATAGA
GTTATCATCATAAATATTTCGAATAAACAAAAAGAAAGTAACAGTATTTT
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TGCTCTTGTATCTGAAAATTAAGGCTAAAATTGAAAATGATTGCAACACT
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GTGAGCAGAATAATAAATCAAATTGAACTTTGAATTTTATGATAGGTGAA
TCGGCTAGGAGGKGGATTTGGAGCAAAGATATCCAGGCCGAATTTATTAG
GAGCAGCAACTACAATTGCGGCTCATAAATGTCAAAGAAGTGTAAGGGTG
GTTCTGGATTTGAAAACCAATATGGAAATGATAGGCAAAAGACTACCTTA
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