EMLSAT00000011137, EMLSAT00000011137-706984 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000011137
Unique NameEMLSAT00000011137-706984
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s756supercontigLSalAtl2s756:50121..64890 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000011137 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000011137EMLSAG00000011137-693903Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000049813EMLSAE00000049813-758741Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000049814EMLSAE00000049814-758742Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000049815EMLSAE00000049815-758743Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000049816EMLSAE00000049816-758744Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto770655auto770655Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000011137EMLSAP00000011137Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000011137

>EMLSAP00000011137 ID=EMLSAP00000011137|Name=EMLSAP00000011137|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=257bp
LISFVSSLGFFSAGLVRGWSAPXIASIQGFNNYTDYTLPQGPLSREEISW
IFPSGQIYITECVEPSVRGLLGSLPAASMALGIMICFMIGTGIPWHYLSF
LCGAVPVIEFTLLAFMPESPTYLLLKNREDVAYKSLLWLRGNRQRHIVSK
EFQKLKDDVQGSVFIVDKAGRRVMLMXSGLTXALANAVLGATFYLQKNSE
TYNSTTSLEWMPLFSLMLFIIGYSVGYASIPYVILGELLPNRLRGALGGV
VALVHML
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mRNA from alignment at LSalAtl2s756:50121..64890-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000011137-706984 ID=EMLSAT00000011137-706984|Name=EMLSAT00000011137|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14770bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s756:50121..64890- (Lepeophtheirus salmonis)
CTTATATCCTTTGTCAGTTCCTTGGGGTTCTTTTCTGCAGGACTCGTGCG TGGATGGTCTGCTCCAGMAATAGCCTCAATTCAAGGATTTAATAATTATA CAGACTATACGCTGCCTCAAGGTCCATTGAGTCGAGAGGAAATATCTTGG ATCTGTAAGTTGAAAGGGTTTTTATACGTACAAATGACGAGATGTGAAAA NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAATATAGACTC ATGAGAGCTGAATATATTTAAAACTTCAGAATAAAACTAAGTCCAAAAAA ACAACCATAAACAGGGGTGTCTGCAGGACTATATATCAAATTCATTCAGT ATGCTGTGAACGAACGTCTCACTGAGTCCCAGAGTTCAAGCAATTGTAAG GTTGTCTCTCCCGGTACGAATTCCAAGGAGGGATCCATGCTCCTTCCAAA TATTTTGGACAACGAATTCTTCAATTGATTCCATTTATTCAAACTAGTGC AGATTTGATGAAGACATCTAAACAAAAACCAGCTGCCTAAGTGCTCACGT TAGCCCAAGAGAGAGCCCCAAATTGGAGGCATAGCTGGCTTGAGTACCCT GGAGATTAAAGTTTAATGGTTCTAAAGAATGTTAGTTACAGAGAAATCTT CATCGTCTCCAGCAGAATAACAAATTGTCGGATTGACCACTACTTTGGAA AAATATGAACCATGTGATCTTATCTGCTGAATATTTTGTGCTTGAAATTT CCAAAAAATGTAGCAATAATTTTAAAAGAACCCTAATATTTTGCAGTTTA ACAATATCAACTTTTATATTTTATATATATTTAAACGCACGAGGATTTCA ACAATTTTCACATTTCCACAAATGACCATGAAAGAAGAATATAAATACTG AATTACTTCATGATTTAAGTAGATCTATTGTAGTCCAATGAGTAATATAT TTGTAGTATATGTATTGGAAAATGCACCTACAGTACATAATTCAAATTGT CRTWTAWCTTCKTAWAATGKATTTAGTAGGCGGAYAGCAAATTGTTTTAA TTCTCCTGAATTCAATTTCAAAATCAATCTAATTTCCAATATGACAAAGA AATTATATATCTTTTTTTAAATTGCCTATTATATATCAAACAATATTTCA ATTATACATATATATGTATGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC ATCTAAGCAAACAAATAGCCTCATGCTATGAGTACTTTATAGTCCGAAGG ATAAATAGCTATAATTGTGTTTCTTAATTAGAAGAAATTAACTCCAGACC AAGGTTAATAGAAATATTAGTTTATACAATAACGCTTTTACGACTGATGT TTGACTTGTACCACGCTTTTTAATATTGATGTGAAAGTATATAAGTTGTT GAGTGTTTTAGTCAAAATCTGTCTTTCTTGCCAAACAGTTGGACCAATAC ATCAAATTCAAAATTATATCAAAAGTGACGTCATAAAGTATGATTGGTTG CGTGTTTTGTCAAAATATACATGTCTTGCAGTGCAATCAGAAAGAAACAT CAAATTGAAAACTCTACAAAGTCTGATTATATGATGGTCTAAAGACAACT ACATTTGAGTAGTAAAAACGACCAAGCAAATAAAAATATATGCGCGTAAT ACGCGGTAGGAAAAGAGTATATTTATATACTCATGACATCTTTATAACTA AATTAGTTATAACGTGAGGCAAATTAGAGCATCAATGCTCAAATACTATT CAAAGACATACTTAGTATCTACATTTTTTAAATTTATAAAAACCCCATAT CTCGATTTAACTCGATAATTTTAAAGGAACAACATATACTAATCATTCAA TTACCTTTTTTTTTAATGTGAAAGGTTATTTTCTTGGTTAAATGAATAAA ATGACGAATAATAAATATGGTGCATACCAAATTACGAACTTTAGTAATTT CGATAGAATCTAATGTACACGCAAGTGCAACACAATATTTCATTAACTTA TATAGATCAATTAAGGGTTTTACAATCAAATGTATGGTATGATTACAAAT ATCCAAAAATGTTAACTATAGTTTAGAACAAGGGTGTCCAAACTTTTAAT ATAATGGGCTGTATTGCCATTGGAAATATTTGAATGGGCCATATAATCTA TTAATTTAAGTTTCATGGGGNAAAGGCTTCATAAAACAAAAATATTAAAT AAAATTTATTTCAAATTTAGTCCAAATATAAAATAAAGGATAACCCTTAT TTTTATTGGCTAAACTGCTTCAAAATAGGGCAACTACTGTTTCGGGGCGT CCGCAGGATTATACATGTGTAATGTTCTCCTATTTTGCTTTGTTTTTTGA TTTTTTTTAAATTACATTTTTTGGTAAACTTAATTTTTGAGAAAAGTAAT TCTTAAAAAAATTATCTCTGTATTCTAATGATTTTTTTTCCCAAAGCTAT TATTTTTCAAAAATATCTTTATTTGGGGAGTATTATGATACTATGACAAT TTGGCTAAAAAAATACTACTTCAAATGCGAAAGGGTAGAGGGCGCACTTA AACGTTATGCGGGCCACGAGTTGAACATCCCTGGTTTAAAACTTTTATTT CATTATTTTAAAGTTATTTATAATTCCCTTCGGTTTGTTTAGGCAGTGTT GCTCCAATGGGCGCGGCCATTGGGAGTGTAATGTCCAGTTTCTTACTTCA CAATTATGGACGGAAAGTTGCACTCATGGTGCCATCCTTCATCATGATTC TCAGCTTTAATATCTTGGCTCTTGCATTCTATTCGGGAAGCGTTGAGCAA ATGATCTTTGCACGGTGAGTATATATCTTTTTATGTAAGTTTGATTCTAA TCTGCTTACAATTACCAAGTCAGCTTTCCGTTGGCGTATAGCGAGCTATA GGCGTGCAGTTAGGGGCCTTATAATGAGGGGACCATTCAAGTTGAGGCAT GTATCTAAATTTGTTCTAAAGTTTTGGGGGATTATGCATTTTTTACTTTT TGGTCTACCTTGACCTCTCAAAATTTAATGGTCTCTTACTGTGAACATAT ATAATGGTTGTACCAAGTTTTATCAAAGTCGATCTGTAACTTTTGCTCTA ATTCTGGTGACCAAAAACAAAGGGGCAATATCATAATCTCTGCTTAAATT CGTTGTGGAAGTAATTAATCTCTTACACAGACATGCCCCTTTTTTTAGAA TTTGGCCAGAGTGCTCTGAATTTTTTTTTTTCAATTCTTGGAATGTCTAG TTTTTATGAGACAAAGAGTTGAAACTTTTACTTATTCTTACAAAATATTT TTTTCGAAAAAAGGATCAAAATATCTTTACTTAAATAAAAAACCAAGAAT TGAAAATTTATTTTATACAAAATTTCAAATAAAAAGGATACTGAATAAAG AAATACCCGATTAAGATTAAGTTTTACTATTATTTAACAATTATCTTGTC TGGCATACAGTACTTTAAATAAGCTATGATAAATAAAATGCTTTTATTAC 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CATATTATTCATGACAAATAAATAAACATATTTGTTTGTTCCATCTCCCA AGGGAGTACCTTCAAGTCTGAGAAATATTATTGCATAGGAAGAGGAGGCA AGATAATTAGCTTTTATACCAAAAAAAAAAAGGTTTAAGGCCTCTGTTTG CAAATTGAAAATCAATTACAAAATTAAAGAAAAAACAATTATTGATGACT ATTAAAATACAAATTATTAGTATGTAAAATAACTTCCATATGAAAAAAAA GTTAAATGATGTAAAAACACAGAAAAAATGCTGTTTTTAATTTGCAAGCA GAGGGCTTAAACTATTTTTTGGTTTTTAACGGGGCTCTTTAGATGAATTG GTATTAGTTTTTAAGGATTCAAGGGTACCCCCAAGTACCCCACGCAATCT TGAAGTTTGAACAAAATACTGGCAATTTTATCCCGGGCAGTTTTCCTAGT TCCCATTTTTACTTATGTTATGACTTAAGTAATTGTAATCAGCTCTTCTA ATCTATTTGGGACCCCTTGAGTCTTCACTTACAGGCTTCTAATAAAATAT GACTCAGTTATCATTATTTCACACCCTCGCAGTTGACGAACATACTTTTA TAAATATCTTATAAAAATATATTGAAAAATAATACATATGAAAGAAATTA ATATCGATAAAAGCAGATATCCTAAATCCGATAAACTGGCAATAGAGCCC TATTGTTTCTAAACACTAGATTTATGATCTTTTAAAGAGTAAAGCTCTAT TATCACACTTTTTACTAGTCTTCCAATCCCTACCGGGACAAGTTGAGTGT TGACTCTTATATTCATACGATACTAAAGTAGGAGATTGGAGATCAAAAAG TATTCTTGTAGCTAATAAAATTTGTAGAAAAATAATCACTTTGTTAATAT ACATAATTGCTAAGAGGTGTTTCACCTTTTAAATTTATAAAACTTTAGAT TTTAACTTTTGGGAGAATGCCAAATCGTTCTATTGTTCCAGGATATAAAA CAGGTAATCCGTGTCATAAAAAACGCGCTTGAGAGATATTATTCTCTTGA ACTCTATGTGCGTTTGATCCCAGGTGATTCTTAGGAAAGAAATATATAAT ACTTGATGTGTATATATGGATTTTAGAAAAAGATACTTTGGTTACATGAA CTAATTGTAATACTATAATGTTTACGTATACTTAATCAGTGCAATTCCAT CCAACCAATTAAAGAAACATTAAAAAAAACAAAAAATAACGTAGAATATA TTTTGTTCACATAGATCTCACGGCTATGCATATTACTAAATTACCTCTAT AATACAAAAATATACTGTGTATTTTGTTGTCAGCTGTTTTAATATGTGTT TTGAACGTTGATTGGTTGAATAGTATTAGCTATTGTTAAGTTGTGAACAA TTCAAAATAATTATATTATAATACCTAAATGAAGAATTTGCTAACTACCA ACGGTTTTGTGCCTTTCTCTTGTTTCGTTTCGAAGGAGAGATTGCGTGGG AAAATAAAAGTAACGACGTGATGCCCAGTTGTTACTTTATTGAATTACTC AACCTTTTCTACAAAATGAAATAGAAAAAATAAACCAAAATAAATTGATA ATTACCCTATTCTTCTCAACCAGGGATTCTCGACCATTTTTAGTGATGTA CCAAATGTAAAATATTTATTTAACCCTTACAAGCACAAATAATTTTTAGC TTCAGTGACAGGGGCGTTCAAAGGATTATATATATACATTTTTTTTTTTG GGGGGGGGGGGGAGGGTCTTGATTTAAAAAATAAATAAATACCAAAAATT TCAATTTTTGGTATTTATTTGTTTTATAAATAAAAAATTTTAAAAATTGA ATTCTTTGGATAAAAAATTCAAAAATGATTTTTTTGGAAAAAAATTCCAA 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TTGATGCCAATCCCCTCGACTACACCTTTTGGGTGCAAATTCTAGGGGAT GGCCTGCAGTGTCTGTCATCCAAACACCGTGGTCCTCACACTCTCAGCCA TCACTGGGACGCCAAGACAGGATTACAACCACAGCGGGTGCCAGGGATTA CACCGCCACCTGGAAGGTATCAGTGCCCCTAAAGACGACTACATAAGAGA GCTCAGACACACATCTATATATTTTATTAATTTTGTTGAAATTCTATTGT TCATTAATAAATGATATCTTGTTTAAGTTTAATATTCAAATTGATTAGAT TTAAATGTACCACTCGGTATTTTTTTGAAACCTCTCAATGAAAAGTTATT TAAGAGAAAAAAAAACAAAAAAAAAAATCATCGCCTATTAAAGTATCCAA GTTCGATTTATTCAGTTTTAAACTGTCTAAAACAAAACATTAAACGTTTT AAATCATTATAAAAGAAAAATAAAACTTTTCCAATTTACATAACTTGTTT TTTGCCTTCTGAAAAAATGTAGTTATGTGGCCAGACCTAATAAGGCCACT CTAGTGTATATACAGCTGGAGTATTGCATGTATTGTAGCAATTTAATTAT TGCGCAAATACCATATTTTTTAAGCAATTACTGGATATGCAAATGAAATG TAATATATTGGTACTTAGTGACGTGTTTTCTGGTCGAATTTATATTACAA TTTATTATTCAACAATTAAGATTAAAAGTCCAATAAATAGTGATACTCTG TAAATATGTTCGAACTCTTTTTCGAGTAAGAAAATTAACAACCAGTAATC TACGTAGGAATAAACTCATAATCTGCAAATATACATGCTTATTTGAAATA TTAAGGGTTTATATTGTATGTAGAATCATCCAATTCTAAGGAAATGCAAT TAAAAGGTAATAATATTAACTTTTTAAGGGTATTGTTCTGAAAACAATAA 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TAAGCAGGAGTGTCGGTCCTTATTTATTGGGTCCATTCCAGTCTTAGGAC CGGTCCTATCGGTCCTTAGGACCGTCAGTCTTTGGGACCAGTCCTTCAGA CCATCCGTGCTTGGAATTTGTCATAAAAATATCAATGGTTTATTGAATGA TAAAAATACGAATTACCAATTAAATACAGGAAATTTTGATTTTGTACGAA AAATATGGGCATTTGTAGCCCTTTGGGACTCTAATTTCTTGAAATGGCCT GCAAATTGTGTCATGTCTTTGCTCAAACGCATTTATACGTCCTCAAAGTG CTATATTTCATGATTAAAAGACGAATTACCAATTAAATACACGAAATTTT GATTTTCTACCAAAAATATGGTCATTTAAGGCCTTTTGGACTTACTTAAT GAGCCAAATACGATATGTCAAATATTTATTAAAATTATTGCACATATCTT GCAAAAAGTWTTATATTTTTTAWTATAATAGAATATAATACGAACATATT ATATTGTTTATTAGTTATATACCATAATTTATTCAATTATATAACGGAAT AATTAAAAAGGGGAAAAACACCCTCATTGACGTCACTAAGGATCGATTTT ACCTTCTTTAAGGACAGACAAGTGAGACTGGACTTGACTGGATGGGAANN NNNNNNNGGGACTGGATTAAACTCTCCATTCCTCCGGTCCAGGTCTCCGG TCCTAAATAAGGAACGACAAAACACTACTAAGGAGTAAATCGWCTGTATT TTTTTTAGTAAGCCTGTTTTTTTTGTTTTTTTTAAATTGGTAATCTGGAA AATGCATTTTCTTTTCCTTAGCGGCTGSCATTATTATTTTWCTAAATGTA GACTAAGTTGTGAACTTCTATTCTTCAACATTAAATTATATTTAATACCT GAGTAAAGAAAATTGTAGAAATGAGTAGTCCATCTTTCATTTTTGTCAAA 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