PREDICTED: tetraspanin-1-like, maker-scaffold127_size327531-snap-gene-1.6 (gene) Tigriopus kingsejongensis

Overview
NamePREDICTED: tetraspanin-1-like
Unique Namemaker-scaffold127_size327531-snap-gene-1.6
Typegene
OrganismTigriopus kingsejongensis (Tigriopus kingsejongensis)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Homology
BLAST of PREDICTED: tetraspanin-1-like vs. L. salmonis genes
Match: EMLSAG00000012176 (supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s87:2579:10248:1 gene:EMLSAG00000012176 transcript:EMLSAT00000012176 description:"maker-LSalAtl2s87-snap-gene-0.24")

HSP 1 Score: 58.151 bits (139), Expect = 4.366e-10
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Query:  241 QKCCGVDNFTDFQHSHQFQKTRL-SIQVVPPSCCILQMDKYPPFIEPADTAAVGG 294
             KCCG+DN+TDF+ +  FQK +    QV+P +CCI+  ++YPP+  P D   +  
Sbjct:  119 MKCCGIDNYTDFKKARIFQKKKEHYYQVLPSACCIINPERYPPYFVPEDLNCLAA 173          
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of PREDICTED: tetraspanin-1-like vs. L. salmonis genes
Analysis Date: 2018-04-19 (T. kinsejongensis vs L. Salmonis peptides)
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
EMLSAG000000121764.366e-1041.82supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s87:2579:10248:1 gen... [more]
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BLAST of PREDICTED: tetraspanin-1-like vs. SwissProt
Analysis Date: 2018-04-19 (T. kingejongensis peptided Blastp vs. SwissProt)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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BLAST of PREDICTED: tetraspanin-1-like vs. nr
Analysis Date: 2018-05-15 (T. kingsejongensis proteins Blastp vs. NR)
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold127_size327531supercontigscaffold127_size327531:53976..108107 +
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
maker2018-02-12 .496401
T. kinsejongensis vs L. Salmonis peptides2018-04-19
T. kingejongensis peptided Blastp vs. SwissProt2018-04-19
T. kingsejongensis proteins Blastp vs. NR2018-05-15
Properties
Property NameValue
Note-
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameSpeciesType
maker-scaffold127_size327531-snap-gene-1.6-mRNA-1maker-scaffold127_size327531-snap-gene-1.6-mRNA-1Tigriopus kingsejongensismRNA


Sequences
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold127_size327531:53976..108107+

Legend: mRNA
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>maker-scaffold127_size327531-snap-gene-1.6 ID=maker-scaffold127_size327531-snap-gene-1.6|Name=PREDICTED: tetraspanin-1-like|organism=Tigriopus kingsejongensis|type=gene|length=54132bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold127_size327531:53976..108107+ (Tigriopus kingsejongensis)
ATGGAGACGTGTGTCTTGCTATTAGTAGGTTATGTTATGAATGCGGAGTG CGAGGACACTTTGGTCGATCTCCAATATGCCGAGGTCGAACCAGATCACA AAGCCAACGGAGAGTCAATTATAGAAGCCGGAGTCAAGTGAGCCAAATCA GCGAACGGGAGCTCTCACCATCGGATAAAGATGATAGGGTTACTGCTTTA GTTGAGTGTTTTTTCCTTCGAGGAGTCAACGCAGCCACTCCGAAAATCCT TGCTACAATATCGGATCCGAAAGAAAAGGTCCGCATTCGGTGCAATATCA CGCCAGACACGGGTGCAACACGAAGTGTCGTGGCGTTAAATATTCTTAAA AGAGGGGGATTAACGCCCAACACTCAAGGGTCCGGCGGGATCCGACTCCG AGCAACCAATAAAACGTCCATGAAGTGCATTGGGACAATCAAACTGAAAA TTCGTAGTGAATACCACAAAAATGCTGTTATTGTTGATGCTATTGTATCA TCCGATTTAGATGACGAACTCCTCCTGAGTTGGCATGATCTGGTTAGAAT GAGTGTGATCCCTGCCAAATATCCATTGGTTGAGGCTAAAACGTCGATGC AAGACAAGCACGAAGACGACACTGTGGAATGCATCAAACAAGATTACTCT GATGTGCTTGGAGATACGCTCGACGAAGCCTGCAGAGTTATGAAAGGTGA CCCGATGACAATGATCTGAATGAAAAATCATGATCATGATCAATGAATCT CCGTGAAGACTTGGACATTAAACCCCTTAAAGGTAAAGACGACCCGCAAA CTCCGCTTCATATGAAACCTATGGCTGATAAATTCATTAACGAACTACTG CAATCTGGGGTAATTATACCTGAAACAGAACCCACAGATTGGATGTCCCC CGCCCACTTTGTCCCCAAACTAGTAGGGAAAAAGGGCAGACTGGTTACAG 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Synonyms
The feature 'PREDICTED: tetraspanin-1-like' has the following synonyms
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Tk07874
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