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Associated RNAi Experiments
Homology
BLAST of EMLSAG00000000211 vs. C. finmarchicus
Match: gi|592852355|gb|GAXK01105189.1| (TSA: Calanus finmarchicus comp5861857_c0_seq1 transcribed RNA sequence) HSP 1 Score: 27.335 bits (59), Expect = 8.135e+0 Identity = 8/24 (33.33%), Postives = 17/24 (70.83%), Query Frame = 0
Query: 35 DWTSWHQFEKSLKSNGPNDQIITQ 58
DWT W FE +L++ P ++++++
Sbjct: 207 DWTDWKAFELTLRTTLPTEKMLSR 278
BLAST of EMLSAG00000000211 vs. L. salmonis peptides
Match: EMLSAP00000000211 (pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s102:521272:549412:-1 gene:EMLSAG00000000211 transcript:EMLSAT00000000211 description:"maker-LSalAtl2s102-snap-gene-5.9") HSP 1 Score: 187.193 bits (474), Expect = 1.503e-62 Identity = 94/94 (100.00%), Postives = 94/94 (100.00%), Query Frame = 0
Query: 1 MVVVFSETGTEDKWRLSSSSFKPQGKKSFSSSSHDWTSWHQFEKSLKSNGPNDQIITQTRNRRGYIKRIFIFLITIQQIIITASIFRIDSSFFI 94
MVVVFSETGTEDKWRLSSSSFKPQGKKSFSSSSHDWTSWHQFEKSLKSNGPNDQIITQTRNRRGYIKRIFIFLITIQQIIITASIFRIDSSFFI
Sbjct: 1 MVVVFSETGTEDKWRLSSSSFKPQGKKSFSSSSHDWTSWHQFEKSLKSNGPNDQIITQTRNRRGYIKRIFIFLITIQQIIITASIFRIDSSFFI 94
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of EMLSAG00000000211 vs. GO
Analysis Date: 2014-04-02 ( Blast vs. GO)
Total hits: 0
Match Name | E-value | Identity | Description | |
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BLAST of EMLSAG00000000211 vs. L. salmonis peptides
Analysis Date: 2014-05-10 ( Blastp vs. self)
Total hits: 1
Match Name | E-value | Identity | Description | |
EMLSAP00000000211 | 1.503e-62 | 100.00 | pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s102:52127... | [more] |
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Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s102 | supercontig | LSalAtl2s102:521272..549412 - |
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Description | maker-LSalAtl2s102-snap-gene-5.9 |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Note | Hypothetical protein |
Cross References
External references for this gene
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at LSalAtl2s102:521272..549412- Legend: mRNA Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAG00000000211-682977 ID=EMLSAG00000000211-682977|Name=EMLSAG00000000211|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=gene|length=28141bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s102:521272..549412- (Lepeophtheirus salmonis) ATGGTTGTTGTTTTTTCTGAAACTGGAACCGAGGAGTTACAAATATCTGC
AGTTGACTATATTAAAATTGACGAAGGATTCTTTCTACTTATGTAAGGTT
TTATTTCATTTCTAGCAAGTTTCTATATCTGTGATCCAGCACTTTTGTGG
AATAACGACCAAATTATTACTGCAATAGCTACAAATCTTTGACAGCTGTA
AGTACACTCTATTCAAAGAGGGGACTCAGTCACTAAATATACAATTTTGA
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TAGTTTGTGAGTTATTGTGCTAAATGTGGTGATACAATTGATATTTCTAC
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AAAAAACGTGTTTTCTTTGCTAAGGGCATGTGTTATATAATGACGTCATT
TCACACAGATTATTTAATGGAACGGTTCTTAGCGTGCTTAAATGAAAGAG
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AATAATAGTTTTTCAATTCCTAAAGGCATTCACTATACAATTGTGTTAAT
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TTTTTAATAAATTATTATTAATATAGAATAATAGTAAATTTGTTTTTTAA
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TTTCCTCAAAATTAAGTTTAAATTTTACTTCTATTCTTTGACAAATAATC
AACGTCAATTTCTATCGACACATTATTCCCATTAATACTTTCCAAAAGCC
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GATTTTGAAATTTGAATTCAAAGTCTATAATTTACCTGAGGTGTCCATTA
AATATGATGTAAAAAAGTTAATATAAAATTTCGTCTTTTCTTGATTTTTT
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GAAGAGGCAAAATATATGTCTATTTTTTTAGAGGTAGGGAAAAAGACTTA
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TCCTTTTTATGGAAAACTTTTGAAGCAAAAGTTGGTAGTTCTACAATTTT
CCACACTTTTTACGCAATATGTTCCCCTCTATTCTGAATTATGGCCTCAA
TACAAGGATGAACAGAAGTACAGCTGGCTTTGATGAAGTCCGAGGAAAAG
TTGTTCCACATCTCCGTCATCACGGCCTTCAGGGTATCAAAATTCGGGTG
AGAAGTCTTGCTCGTCTTGCCCTCCAAGATGCACCAAACAGGGGTTTACG
TCGGGTGATGACAAAGTGCATAAGTCTAACACCCAGGAGGCACCCATATT
CTCCCTGCAAAAATGCTGCACCTTCTTGGACGTGAGTGCCCGAGTGCCAT
CTTGGGTAAACACATAGTTGTCCCCTGGGGAACGTGCTCTTCAACTTTCA
CAAGACATGGTACTTGAATACTTTTTAGTAGACGTCCGTGTATACTTTCT
CGTCAGCTTTGTGGAAATAAGGAGGCATCTTSCAACTGTCGGCCGCCACG
ATGCCGATAATCATGACCTGAGTTGGATGTTTGGTCTTGAAGGTTGCCTC
AACCTGAGTTCTTGATTCAAGCAAGAGGCGATCATTTCTCTTTTTCAGAA
CAGCGTCTACTTTGAAGAACTTCTTGTCGGATATCAACTTGTGCGCAGGG
GAGATCGCACACCCTCTGCCGGTTAGCTTGGTGCTCGGACATTTATGATC
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AATGGCGCCAAGTACAAAAAAAATCAGAATTTTAGAACTGAGGCTAGAAG
CCCCCAAAGAGGATTCTAACTTTTGATTCCCCACCCTGTATACCACAGAA
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AGCTATAATTGTTCAACTCAACAAGTCTGTATGACAAAAATTGAAGCATC
AACTTTTGATTGTAAAAGAAGACCTTCATATTGATCTAATTATTATTTGT
AAAAAAGATGAAAAATAGATATGATCTGTTTAGATTGGCTTTACTCAAAA
AGTATAAATTTTGTAATATTTGAAGTAAATGCCAGTATTTTGTGATATTT
TGTACGTCCATTTCTAAAATGAAATAAGTTTCTGTTGATTTTTTGTGATA
ATTCCTTGTCAAAACAATAGCAGAAATAAAGTTTTCTTTCTGTCATAAAA
TCATCCCTAAAAATGGAAAAAGCCAAGGAACAAAAACATCCGTATCTAGT
GCAGCTAATTGGTTACATTTTGTAGGTTGTCCGTTTTTGTTTTTAATTTG
ACAACCTCAAGAGGGAATTATATTATCCTAATCTGCTATCATTATTATCC
AATCCTGAGGAGTGAACATCCTTTTCTACTACATATCTGTAATCATTGAT
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TCCCTCCTCTCTTGTCAAAGCTGCTTGTAGATGATTGAATGAAGTGTCTT
GACAGCTAAGCTGCTCTCTTCCAAGAAATTCTTCAAATTGTTAAGGTTAC
CTTTTTGATTTTCGGTTTCTATTGTTTAACATGCTCAATCTGCTACCGAT
TAGCATTACTGTCTAAAATATGTACTGAAAAGTCCCTAACTTCACACATA
GATGGCGCTATTTTCTTCTAATTAACCTTATATTTAGTTTGTTCTAACCT
TAAAAAGACAGCCGTCCAAATTTCATTACAATCTGTACGTTAGTTTGTGT
GTTATTGTKCTGAGTGTCATGCTACTTTTGTTATTTCCAAAATAATGGAT
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TACCATTTAAGCTAAGCAATGGTTTGAAAAGTGTTATTGGGATTCCTCTT
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CCAATTTGTTATGTCAACGTAACCTCTTATAAGATTGAGCACAAATTTTG
CTTGATTCCATATTTTAATAACATTTCAAACATTTCCGAAAATTAACAAA
AATCAAATATTATTGGTTCATAAGCTATTTGACTTTATAGAGTAAAATCC
GTGTATCATGTGGGTCTGTCCCACTCTGCGTTTTTCTTCTTAATCACCAA
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AATAATACCCATTAATTTATAAGTTAAATTAATTTTTTATCGATTTTATT
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TGAGTTATATATATATTTTTTAATATTAATTAGTATGCAAAATCTAATAT
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TATGTTAATATGAAGAGCATTAAGTATGTAAAAAATATAAAACACCGGCT
GTAACTAGCTTAAAAATGACACTAATTAAAACTGTTGTGTTTGTACCTAA
ATGGATACGGACGGTGATATCTTACGGCCTAGTTAACAAAAATAATAAAC
TAATTTTGTTACATTTAACACAAAAAACATTCACACCGTAATCTGACCTA
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GAGTAAAAAACTATAGGTGTTGTTTTTTTCATATTATAAACAAAGTATTA
ATCAGGTGAAACCATGTAACATAAGTGGAAATTCTCAAAAACTTAAACTC
GAACATTTTGCTTGAATCCAACACCAATAAATTTATTAAATTGAAATTTT
CTATGAAAAAGCATTCTATTAACTCAAATAACCATATGATATATTTTCGA
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AAGGATGAGACACATTGATTTTTTTTCAAAATAACAGCCATATTTGCAAG
ACTAAGTACTAAGCTATCGTAATAAAAAATAAGTAAACAAACTACTAACA
AACAAAAGGTAGCACCACTATACTCGTGTATAAAAACAAACTAAACTGCG
TTTCAATAAAATGTATTGGGAAAAAATTATATATTAGATCCTAGTATCAT
CGGCTACAGACCTCAAAGACCAAGAATAGGATCATCAGTAGCTACTAACA
GATTTTAGTCTCGATTAAAGTTTAGGCCTGATAGATTCTTGTAAATAGAG
TAACATCAAACAATTTAATTTTAAATCTGTCAATAATAATAAATCTAGTT
ATTTTCGGAGGAAAGGTTGCAAAATAAAATAATATAAAATTTCTCATATA
TTACTAATCATAATATTACTATAGTAATAATGAACCCGAAATTGCTGAAC
GATTTAATTAAATAACGACATTTACTCTGTCTTTACTCATCATACTATTT
TTTAAATTGTATTATAACAAAAGAAGAAGATATACCGAGGCAGTTAGAGG
GAAAGTAGAAAACCTATTATTTTTAGCTTAATATATATATATATACAAAG
GTCATTTTTGTCCTTAAGACAAAAAGAAATTCTGCTCCTTCCTTCCATTT
ATATATCTTCTACAAAAACTCAATATATTTTTCATATTCAAATTCTTAAC
ATATTTTAGTACAAATTCAAATTAAAACAGACTAAAGGACTGCGCTTTTT
CCTCAAACAGCAAAATAAAAAGTATTGTTTCTACCTAGTTAAGCATCACA
GTGTAATTTTTTTGAGAGTATCATGGATATTAATGAATACTAAAAATTTT
AGAAGAGAACGCTGACGAAGGTACTCTGCTAAAAGATCCAATGGAAGGAT
GAAAAAAAGAGAGTTTAAACTGTATGTTAATACCCAGGTGGTTTGGTTGT
TCTGATTGATTGATTAGTGTCATTGGAAGCTTCAAAGCACTCGGATATAT
GGATCTTTATCAATCTATAATTCCTTTAAATTCATATCTTTTTAGTTGAA
TATCTTATCCACACGCCTTTATCTTGACACTGGGTGTTAAGGAATATCGT
CTCTGGGACGAGATTTTCATGCCTCACTCGGTGGATCTCATTTCCTTTAA
TAGAGAGATAATTCCTTGGTAAAATAAAGAATTCCACTTCTCGGATCATC
CTCCATAGGTTTAAGAATATATATGTTGCTCCTGATAGTGTAGAACAGTT
ATTCCTAATACGTACTACTGTGGTAAGTAAGAACTGAAAAGTTCCATAAA
GAGACAGATTATTCAAATTAAATCCCAGTGAGGAATAGTGAGAAACAGTT
CAAAAACTCCTCCCACAGCTTTTTAAGATATTATTGTAGAGCTATAATTT
TAAATATTCTCTGTACTTTTACCTTTTGAAAATCAAGATTGCGAGTGGAC
GAAAAAAGCTCCTTGTGTATACACAAAATCAGATATTATTTCCTATTTAA
AAAAACAAGATTTTATTCCTTTGAAATAAAAGGATCATTCCATATCAAAT
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ACATTTGATTTCTATCTGCAAACTCCAAATCTTTTTATTTATTATTTTTA
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GGTAACAGACAGGAACATATAGTAGTCACTTGTTGCTAGTTCTGGACTGT
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CTTCGAGTTTTTTTGTTTTTTTGTGTATCCAGCCTTCTTCAAATGGTTGA
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ACATAACGGTCTATCTCGATATTTTTCATGATTTTATTGACATTTTCGAC
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GAAATTGTTTGCACCACTGTTGTGCAACACGAACCGAAAGTGTATTGGTC
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ATGAATTTAGTAGAGTATCGTTTTAAATATGTCAGTACACTCATCCCAAT
ATAGTACTGGTATTTTAAACAGAACTAGGTGGCACCACATGCAAGTAACA
AAATATTGATGTATTTAATTTTTGCTAAAAGTTGCATGAGGAAAAAAAAA
CCTTATTTAATCAATAACTTCTATAATTCTTGGAATAAATTATTCTTTCA
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AGTCCCTTAAAGCCACTGCCAGCCAACACTGGGATATCTCCACGGAAGAC
TACATCCACAGTGGGTACTAGGCCTTCCACTGCCACCTGGAATTTATCAT
TGCTATTAAGGATTGCTATATTAATGATTAAGAGAGCTCAGACACACATT
TATATATAGTATTAGTTTTGTTGAAATTCTACTGTTCATTAATAAATTAT
ATTTTGTTTAAAATTCAAAGTATTCAGTAAATAACACTCGGTATATAAAA
TATTCTTTAAAAAGAGGAAATATTTTTTCTTTCGTCATTTATATATATAT
AAGAGATAATGGAAGTATGGTAACCCCAAATAAAATTAAAGCAGATACAG
CTGTTCAAATTACTCTAATCACCGACCGTAAATTAGTCTTCCAACATCAA
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GGAATAAAATCAAGTCTTCTATTATAGGGAAGAAGTATTTCCTAACCGAA
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GGTTATTATATAGAACCCAAAGCCGAATAGAACAGCCCAGGAAGTATAGC
AAAAACTCGCCGAACACGGAAAATACTTCTAATCATTATGCCTCTCACAA
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CGACTGTATTAAATTCCCCGGGAAACTTTAAAAGTAACCTTATTTTGTGG
ACACACTTGGATGATTAGATTTATTTAATTCAGTGTTCTTTTTTCAATAA
ATATATTTTATTTTTAGCGGTACTGAAATATTGTAAAAGAGCTTAAAGTT
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ACAAATAAATTCAAGGCAAAAAAGGAATTTATCTTTCAGCATAAAATCCA
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ATTATAATCAGTCAGGACTATTATCGTTCAATGTAATTTTGACCCTCAAA
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ATATATTTCCATTTTAGGGTGAAAAAGAATGAAAAACAACACTCTTCTTT
AGACCCTTATAATTTATTCATTATGTTATAGAGATGAGGAATATCACAGC
TTACACTATAAAAAAATATTCAATCTATACCTAATTTAAAAAATATGCAT
CTGCAAGGAATTTTGTTCCATTTTGTATTTTTTAAGTGATCCCATTTTGA
AATATTAAAATAATCTACTCTTTGTGAATGGATCACTTTTTTCTTTCGAT
CCTGGCATCTCATTCCCATTGAGTGGAGTCCACTCTACTCAATTATGAGT
TCTAGTAATTTTCCTTGGTTGAATTCTCCTCACGTCGTCCCTTGTGGAAT
TCCGAGTACAAACTCGAACATCTCTTGAGATGGATNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCACAATATGAAATTGGCATTGAT
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CATTCTTTCATTATGAGTAATGATGTTTTTCAATTCTTACATTAAAATAA
ATCTTTTAAATTCAATTCAAGAGTCTGAATTTCTCGGCTGKCAAGTATTA
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CCCCCTAAAATAATTCTTTCTTCTAAACTGCATTGAAAATAGTTCCTCTA
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ATTAAATGGATGGAAGTGTGTACTTCTTCTACATGTAGCAAATATTATAA
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TTATGTTACAATATATATAATGTGTTGTTTTTCATACGAAATACTTGTTT
TAAAGGAACTTTTGAAAGAATATTTATTTCACAGAAATATTTATATTTTA
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TTAGATGGCAACAAACAGACAAACTTTGTCATCGTAAAGATATTAAATAT
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CCAGACAAATAACGTGGTCACCCAAACAATTTGAAGAATGTTTGGGAGGA
ATCTGAGCTGGCATGAGGTATCATTCAATTAGCTACAAGCAGCTATGAGA
TAAAAGAAATAAACACACATCCCACCCTGAATATAGCAACAATTCAACTC
CGACTCCAACAAGGACCCTCATTTGTATCTCCAAGTCAAATCCCTAGAGT
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TCTCTTCCTTAATAAAATAATAATGATGACAGGCTTTATAGATAAAAAAA
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CGCAACTACAAAGAAATAACAATGTAGTAACGAGCGCGTGTAGCTAAGGC
TCAGTGTGTTTATTAAAAAAGAAAAGGAGAGTATATACCTTATATATATA
TTATTAAAAAAAGTTTATTTGTTGGTTTCCCCAGACCTCATTTGGGAGAT
GTGCAACTTCTAAGTTTTGTTAAATATGGCGATAAGTTTTCTACGAGTAT
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ATTTCGAAAAAAAAAAAAAAGTTTAAGAACCTCTCTAATGTTATAAATCT
ATGTTTATGTTGTTGCAATGGAGACGATAGGTTTATACAAGCCTTCAATG
CATATACAATACATACATACATATTTAATATACATATTTAGACCTTTATA
TARAGAATATGTACAATATGGAAACATATTTAGAATAACTTATTAAGCCT
GTTGTTATTTTTATTTTGAAACGCTCAGTCATCGTCAACATGGCCTTCAT
TGAAATGTAGATTCCTTAACATTTCGAGAATAAATGACGGAAAAAATTGT
ATATAAAATGAATTTTGTGCATTATACTATATGTATTCTTGAACTAAAGG
CTGAAACTTTGCATGGGTTRTTTTGAACCTGGTCAGGCTAAYACAGGGMG
CCAATTTTTTNGGCTGAAACTTTGCATGGGTTCTTTTGAACCTGGTCAGG
CTAAGACAGGGTGCCTTWWTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGYGGGGTRTGYG
GGYTTWTTRTRTTGCCAAAAGTTGTTTTTAGAGATTAAAGAGACAAGATA
AGGGTTTGAGTTATTAATCGAAAAGACTGGTGTCTCAAAAAACAACTGCA
CGAATAATTACGTTTTCTTAATTTCTTCATATCACAAAAAAATATGGGCA
TAAAAAGAAATCGGGGATAATTGCAATTTTGTTTTTGGAGGTGCAAAAAA
ATTATCTTCGAATGAAATATTAGATTCGTAAATGAAATAAAGTTTGTAGA
AATTTGTCTGAAAATTCGTTTGCATATAAATTATGATAAATAAAAATTGT
TGTTTAACTGAAATATCTGTCATTTTCTTTATCATTTTTAATTTTTGATC
TCTTACTTTTCTTTCATAACTCGTCAATTTTGAATGTCAAAGAAGAAATG
CCTCAAAAACGATGCATTTTGTACATAAAATATTAGACACTAACAGTACA
ATATAATACTGTCAATTTCTGAAACATTTAATAAATAATTTTTGCAATAT
TTGCAAAAGTGAACCAATTATCGAGGGTTATTTTTTTGACAACATTATTC
TACATAAATTTTTTTTTACATGTACGAAAAAAAGCTTGGTAGATTCTTGT
TTCTCTATACATTTCTAATTAATGTTATTTACTGCTTTTTTTTCTAAAAT
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AGGCTTGACGTCATATTTTCAAAAACACGCAACCTCATTCAATGCTGCTA
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ATTCCCAATTGATTGTTTTACTTTATAAATATACAAGCCCCATTATTTCA
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TAACTATAGGTGCAAGCCTTTATTGTGNTTTGTTTAGTCCCGATATGGTT
TTAAATGTAATCTATTTTTTTATAACTGAGTGAAAATTTATCCAATCTCT
CAATTTGTCGTCACCTCTGAAAAATGTATCAAAATCATTGTTAATAGAAA
ATAATGTTCAGATTGAGAATACACAAGTAATCCAGACTCACGTTTGAGAA
AAATCATTCCAATTTGCTAATTTGTAGACGATACAGTTTGAAAGTATAAT
TATATAGAAGCCCCTAAAAATAGTCTGAAATATTTTTCAATTATGATTTA
TGATACGCAGTATGTAATTTGTAATGATTTGCGACGTGGGTTAAAATACA
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ACCTCTTCTCTGTATTCTTATGTTTGAAATATTAGAAATTACTTCAAATA
CATAATAATCTTCATGTTTTATATTATGGAGCTATTGTTTGATGCTCTTT
AACATATTATTTATGTATCTAACCAAAAATATTATGTTAAGTTCAGGTTA
TGTACAAATTTAACTGATATATATATTTATGTATATTTGGAATAGCATAA
ATTCTTTAAGGGATTTTACTCAAGTTTTCTCCCCACTGGGCTGAGATTCC
TACAATCTGATAACAATTTCCTTATCAGCTTGTTGCCAACCAAGAATCAA
TAGTTACAATTTTCAACAACATTATTTATATATTTTATAAGCACAGGATA
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CAGCAAGCATTTTTAGAATAGATTCTTCTTTTTTTATTTAA back to top
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