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Associated RNAi Experiments
Homology
BLAST of EMLSAG00000001625 vs. L. salmonis peptides
Match: EMLSAP00000001625 (pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s128:1010155:1034561:1 gene:EMLSAG00000001625 transcript:EMLSAT00000001625 description:"maker-LSalAtl2s128-augustus-gene-10.13") HSP 1 Score: 670.233 bits (1728), Expect = 0.000e+0 Identity = 324/324 (100.00%), Postives = 324/324 (100.00%), Query Frame = 0
Query: 1 MKGIAASLMDVIIFLLLTMVLKVSCYPFGHYGETILNPPQMIIGSRAWEIYNRPHSNVDLQSPFDNEGYFSNCSPCPFVVPECPCDYYIPYPPVRPTTPSTTVEPFHLPTWIRIDNETEWYLSAITHDSWHVAEAKAISLGGHLLEIREDSFFLKKMNKRVKKKKTTTTKRRSNDGSRIRGLLGKVLKKYKVPLWFGVNALADQSTWVWSSNGDKVDLKFPFWNVLDSQGECGDIRLLNGVIHGFQVSCDGSSRTKDDSKDSDAQGNESNSTTQPTSTTTPNPSNTYYPPTPVRSTNSTPTISTTTSQRPIVDGNTPGSPPSPV 324
MKGIAASLMDVIIFLLLTMVLKVSCYPFGHYGETILNPPQMIIGSRAWEIYNRPHSNVDLQSPFDNEGYFSNCSPCPFVVPECPCDYYIPYPPVRPTTPSTTVEPFHLPTWIRIDNETEWYLSAITHDSWHVAEAKAISLGGHLLEIREDSFFLKKMNKRVKKKKTTTTKRRSNDGSRIRGLLGKVLKKYKVPLWFGVNALADQSTWVWSSNGDKVDLKFPFWNVLDSQGECGDIRLLNGVIHGFQVSCDGSSRTKDDSKDSDAQGNESNSTTQPTSTTTPNPSNTYYPPTPVRSTNSTPTISTTTSQRPIVDGNTPGSPPSPV
Sbjct: 1 MKGIAASLMDVIIFLLLTMVLKVSCYPFGHYGETILNPPQMIIGSRAWEIYNRPHSNVDLQSPFDNEGYFSNCSPCPFVVPECPCDYYIPYPPVRPTTPSTTVEPFHLPTWIRIDNETEWYLSAITHDSWHVAEAKAISLGGHLLEIREDSFFLKKMNKRVKKKKTTTTKRRSNDGSRIRGLLGKVLKKYKVPLWFGVNALADQSTWVWSSNGDKVDLKFPFWNVLDSQGECGDIRLLNGVIHGFQVSCDGSSRTKDDSKDSDAQGNESNSTTQPTSTTTPNPSNTYYPPTPVRSTNSTPTISTTTSQRPIVDGNTPGSPPSPV 324
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of EMLSAG00000001625 vs. GO
Analysis Date: 2014-04-02 ( Blast vs. GO)
Total hits: 0
Match Name | E-value | Identity | Description | |
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BLAST of EMLSAG00000001625 vs. L. salmonis peptides
Analysis Date: 2014-05-10 ( Blastp vs. self)
Total hits: 1
Match Name | E-value | Identity | Description | |
EMLSAP00000001625 | 0.000e+0 | 100.00 | pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s128:10101... | [more] |
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Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s128 | supercontig | LSalAtl2s128:1010155..1034561 + |
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Description | maker-LSalAtl2s128-augustus-gene-10.13 |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Note | Hypothetical protein |
Cross References
External references for this gene
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at LSalAtl2s128:1010155..1034561+ Legend: mRNA Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAG00000001625-684391 ID=EMLSAG00000001625-684391|Name=EMLSAG00000001625|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=gene|length=24407bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s128:1010155..1034561+ (Lepeophtheirus salmonis) TTTTTGAAAAAAAAAAAATTTAATTTTTCTAATTTTTTCATACAAAATCC
AAAAACCAATCCCACCCCATATATATAATCCTGCGGACATCCTGCTCTGA
AACTTCCCACCGTCAATATCTTTGTTCCATGTGTCACATTCCTTACTTTT
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TTTGTACATCCCATAAAATGTGTAGGTTAATATGTTATATATCTTATTAA
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AAAAAAAAGAGAGAAATAAAAAGTGAAACTCTGGTTATATTTTCTACTTT
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AGAAAATTCATTAGATGAAATATCTGAAGCTAAATATTATTATTATGTGT
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TTGAGATACCCTTCGCAGTTCTCACTCTACAACAATCTACATAAGATAAA
CTATATCTACGCTGTACTTGTATAAGTACAGCGTACAAGTTGTAACCGAA
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AAAATAATCTTATTACCTCTTTGAGTGCACCACAAATTGTACTTGAAGAA
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TATCATTGAGTCCAATAATATGTCTATGAAATATTGGGTTGTATTTGAAG
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TATGTTGAAGCACCACATATTATAATTTATCATAAGGAGAGAGAAGGTGG
GGAGGAGAGTGGAGTGGAGGGGGGGGGGAGGGGGGTCTTAAATGGGTCAA
AACATGGTTTTGTTCAAAAAAAGAAAGAAAAAGAGAAAATTTTAAAAAGT
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GGTGGTGAGTGTGGAGGGTTCGAACCCCCTCCCCCTCAAAAAAATATTTA
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GCTTCTGACAAAATTTTTCGTCCAGTTCGGTTTTAAGTGATATTTTACCC
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ATATAATGTTTGTATAGGTGTTGTGGTGGGGTCATGATTAGAGTGGGTTG
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TGGCCGGTTTTTTTTGAAGGATCACATTTTATTAGAATTAAAATGAAAAG
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TTTTTCGGGAATAGGGGCGCATGTAACTCATAAATCTAAGTCAAAGTAAT
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CTATTTAGTTTGACGGTTATTTATGACTATTTATACAAAGTGATCCTCGT
AATCCAAGATATGACTGTTTGTCTACTTTTAAGTTAAATGTACGATCCCA
GTGAGTTTTTATTTTTTATGTGTGTGTGTGTCCTTATGTGGAAGGCCATT
CTATTTTTAAAAAATCTCCATCATGTTATATGTATGTACATATTTTATGG
GTCATGACCTCAAAAAAATTAAATAACTTATGAAGTATTCAATTTTAATT
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CTGAAAATGCTAGACCGGTCTGAAACTGTTATGATTTTTAGTGCACCAAA
TTATTTTGGTCCACTAAAGAAGTTTTTCAATGTTCATTCNGAATTTTTTG
GAGTAAAATTCAAAAATCCATAGTTCACAAAAAAAAAAAAAAGAATTTTT
ACACCTAATTTTGTGTAAAGTTATTCCATTCTGACCCATCAATTTTTAGT
AAAAAGCAAAAATTCCGTATTTCTTGTGGCTTATCCATGGAGATGCCCTT
GTAGAGGTTTGTTATTTATTTGTTTATTTCATTTAACTCTAGGAGGTAAT
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AAGTAACTCTAGACAAAATAATCCATCGGATTAAGGCCAAGGGAGCTAGG
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TGGCTTGAAATATCCAACTATGAATTCCATGGCAGTGTTTTGGTTCCTAA
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TAAATGCGTTTTTTTCACATTATTTTATAGTTTTGGGGTCAATCTAGAAC
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AACACTACGACTGTTTATAATTATAATATCTATAATATTACACCCGTCAC
ATACTTTGACTAGTATGAGCACAAAATATGTTCATACATTGTGCTCATAA
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TCTTCTTTTTCAATACTCAATGTACAAACATACACACATACATATGTGTG
CCCCTGACCTTTTTCTTTTCCCTTTGTCACAAAGGGGGATTTATTTTGGT
TATTTCTGTTGGAGTTAACCTTGGAACTCCTTCGTATCCTTTGTTTCTTT
TTAACAAGGGGTCGATCCTTGGTTTAAAAAAAATAATATTCAAGTGCTTC
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GATCATTGAACATTGTTGTATTATACAATATTATTATGGTCGTTATTTGG
ATTCCCAAAAAAAATAACACCTGAGCAAGTCATTATTAGTTTGAAGGAGA
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GCTTGGTCACCCCAAAACTATAAAATAATGTGAAAAAACGCATTTATAAG
GCTGAGGAAATATCCTTGTCTACAAGAATAACACTAATTGTGGCAAGATG
TTGCTTCTAAAATKCAGCCGATGACGTCACTTTATAATTTTTCTTCGTGA
CGTATTCAATTTTTCCATTCCCTTCACAGATTAGACCTTTTTGTATTTAA
TTAAAAAGGATTAATTCATGGTGGCTTAGAAATGACAACCTCAGCGCCCC
TAATGCACAAAAATTATTCTCAAACCCATCTAACTTTGGACAAGAATTGA
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GTTTAAACTAGGTGTCCAAGGTCGATTTGTTTCCGCTGGATTTTTTCTAG
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GGGCTGATTTTTTAGTCTCAATCCGTAGACCTACTTTTTTTTATGTCTTA
ATTAATGTACTCATTGTCTCCCCATCCCATGACCTGTACAAATATGAATT
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GACAGAATTTTCAATGAGACTGATTCAGGTCTAATTTGGCCACTAAAAAC
CATAACTTTTCTCAGACTGTATCCCCACACTAGTCCCTACGTATTACTAT
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TATAACCATGAGTCAACTCTAAAACTAAGAAATTTTATTTGTAAGTATCA
CTTTACTTACATTTTTTATTTTCATATTTTCGTTGTCGTTATTTTATTTT
TTTGGCAAACAATTGATAAATATGGAACAGAGAAAAAGAGATACCATTAT
TAATATTATTTTTTTTTGCGGGCCATGAACCAAAGGACATTTTAAGGATC
GTAAATTTACACAATAGAACTGTCTATCGTATTAGTTATAGACAGATTTA
AACAATCTGACAATACTACCAGGAAGAAATATATAATCCTTGGAAAGATC
AGAAACGATTCTTGACTGAACTCAAACACTGTCAGTAACAGCATCCCCAG
GTTATCATAAGAGTAAGTTGGCAAAAGATCGCCATGTGAGAAAGGCAGCC
ATCTAATGAGCTGTTTCTGACGATCTTGACCTTACCTTTTATCGCCACTA
GCTTTTTCATCTCTTCACTGATCTAAAGGACTCTAGTTAAAGAGTGGACA
CTCAAGGCAAGGCGGGMAGAATTTAGTAGTTTTTAATTCTGATAGATTAA
AATTACATGCTGCTACATGTTCCTCAATGCACGTAGCCAGTTTGAACAGG
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AATAACATGATATTATAGGTCGGTGTTAGGAACATAGTCTTCTTTGTCTT
TTGATTGAATTGTTTATTTTTCACTTAACCACTCTTTCCCTAAAGTCCTT
TACACTGATTCAATGAAGGCCAACAGAGTGATCGATGGGAAGATATTTCT
TTTCTTTCTAAAATCCACTGGTAGTTAGTTACCTTCCCTTCTCTTCTGAT
GAAAAACTCTTCACTTTAGACCGATCAATTAACAGCCAAAATGATAGGTT
CATGTTGTCTTCAGAAGCAAAAATACGGCTGCTATTATGACATTGGGTGT
CAAAAGAAGTGAATGGCATGTTATGGATCCTTATTTCTTTAGTTTTGGCC
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CCCTGGATGAAGACTGCAGCTGCTGGCAGGCCTGAACACAGTCACTGCAG
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ATCCATGCGATTATTATCTTTGAAGAAGGTTGGAAACCAGTGCCTGCCGG
KCCCACCATAAAAATATTACCTCCCTGAAACCAAAATGGTGGACAGAATG
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GAATGAAAAATGAATGTTTTTTTTCCCTTAATATTTAGAGATGTGAAGAT
ATCATAATTAACATTCTTTTGTCAAATTTGTATGTAGTCTAGAGTTATTG
TTACACATACAGTATATATATTGTATAATTGTTCATTCTCAAGCAGCAAC
TATTAGCCATTGCATACCTATCTCTCTTCATCCATCATTTATCTTAGCCT
TCAAATTCAAGGTTCTTAGCAATCGCATGGACAAAGAACATCAAGTTCTC
AAAATATGAATTGACCTTCTTTAAATTCATAAAGGGATTTTCAACTTACT
TAGACTTAAATATGATCACTTCAATGAATTCATCGAATATATACATATAT
ATAGTACATCTAGAGCGTTTTCATGTGACAACAGCACTTGGGTTGATGTC
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GTGTGAAAATGCCACTGACTAATAATAAAAATTAAGTCAGTTTACGATCT
CTCAAAAAATGTATCTCTCTTACGTCAGACTAAAAATATATTATTACATA
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CACTTTCAAGGATCAGATATTTTTATCCAATTAACCTATTTATTTTATTT
TTGTCACTACATATCAAAAAATATATTCGAGTATCTATAAATAATTGTAC
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TATTTATAATTAGGTTATTTATAACTTGGTTATTCGACATAATCGAAAAA
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