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Associated RNAi Experiments
Homology
BLAST of EMLSAG00000001625 vs. L. salmonis peptides
Match: EMLSAP00000001625 (pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s128:1010155:1034561:1 gene:EMLSAG00000001625 transcript:EMLSAT00000001625 description:"maker-LSalAtl2s128-augustus-gene-10.13") HSP 1 Score: 670.233 bits (1728), Expect = 0.000e+0 Identity = 324/324 (100.00%), Postives = 324/324 (100.00%), Query Frame = 0
Query: 1 MKGIAASLMDVIIFLLLTMVLKVSCYPFGHYGETILNPPQMIIGSRAWEIYNRPHSNVDLQSPFDNEGYFSNCSPCPFVVPECPCDYYIPYPPVRPTTPSTTVEPFHLPTWIRIDNETEWYLSAITHDSWHVAEAKAISLGGHLLEIREDSFFLKKMNKRVKKKKTTTTKRRSNDGSRIRGLLGKVLKKYKVPLWFGVNALADQSTWVWSSNGDKVDLKFPFWNVLDSQGECGDIRLLNGVIHGFQVSCDGSSRTKDDSKDSDAQGNESNSTTQPTSTTTPNPSNTYYPPTPVRSTNSTPTISTTTSQRPIVDGNTPGSPPSPV 324
MKGIAASLMDVIIFLLLTMVLKVSCYPFGHYGETILNPPQMIIGSRAWEIYNRPHSNVDLQSPFDNEGYFSNCSPCPFVVPECPCDYYIPYPPVRPTTPSTTVEPFHLPTWIRIDNETEWYLSAITHDSWHVAEAKAISLGGHLLEIREDSFFLKKMNKRVKKKKTTTTKRRSNDGSRIRGLLGKVLKKYKVPLWFGVNALADQSTWVWSSNGDKVDLKFPFWNVLDSQGECGDIRLLNGVIHGFQVSCDGSSRTKDDSKDSDAQGNESNSTTQPTSTTTPNPSNTYYPPTPVRSTNSTPTISTTTSQRPIVDGNTPGSPPSPV
Sbjct: 1 MKGIAASLMDVIIFLLLTMVLKVSCYPFGHYGETILNPPQMIIGSRAWEIYNRPHSNVDLQSPFDNEGYFSNCSPCPFVVPECPCDYYIPYPPVRPTTPSTTVEPFHLPTWIRIDNETEWYLSAITHDSWHVAEAKAISLGGHLLEIREDSFFLKKMNKRVKKKKTTTTKRRSNDGSRIRGLLGKVLKKYKVPLWFGVNALADQSTWVWSSNGDKVDLKFPFWNVLDSQGECGDIRLLNGVIHGFQVSCDGSSRTKDDSKDSDAQGNESNSTTQPTSTTTPNPSNTYYPPTPVRSTNSTPTISTTTSQRPIVDGNTPGSPPSPV 324
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of EMLSAG00000001625 vs. GO
Analysis Date: 2014-04-02 ( Blast vs. GO)
Total hits: 0
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
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BLAST of EMLSAG00000001625 vs. L. salmonis peptides
Analysis Date: 2014-05-10 ( Blastp vs. self)
Total hits: 1
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
| EMLSAP00000001625 | 0.000e+0 | 100.00 | pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s128:10101... | [more] |
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Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s128 | supercontig | LSalAtl2s128:1010155..1034561 + |
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Description | maker-LSalAtl2s128-augustus-gene-10.13 |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
| Note | Hypothetical protein |
Cross References
External references for this gene
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at LSalAtl2s128:1010155..1034561+ Legend: mRNA Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAG00000001625-684391 ID=EMLSAG00000001625-684391|Name=EMLSAG00000001625|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=gene|length=24407bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s128:1010155..1034561+ (Lepeophtheirus salmonis)
TTTTTGAAAAAAAAAAAATTTAATTTTTCTAATTTTTTCATACAAAATCC
AAAAACCAATCCCACCCCATATATATAATCCTGCGGACATCCTGCTCTGA
AACTTCCCACCGTCAATATCTTTGTTCCATGTGTCACATTCCTTACTTTT
TTTCTTTTTGTAATTCCTCCCTTGTATTTTTACGGATGATTCCAACACTT
AAAGGATTTATATGTACGTAGCTCCTGTTTATTTCTATGTATTTGTTTTA
AGCAACCCCAAGCCTGATTCAATTCTTGGAGGAAGAATATGCATTGAGGA
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ATATACTTCAATTTATCTAATAATTTAAAAAGTAAAGTTACTTCAATTCT
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AATATAATAATAGGTGTTCATGTAATTAATACTATTATAAGTTATAAGAT
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TCATGTTAATTTTCAATACCGGATATAAGAATCGATTCCTTTACAATGTC
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GATAGCTCGGATTAATTTTGATCCTATCCTCTCTTATATGTATACAGTAT
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ATAAAATTGAATGCCTCAATCGCCCTGTTTTATTATATATATATATGATC
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ATTCGGTCCAGTCCAGTTTTAAGATGGGTCTATAAGACTATAAATCAGTA
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TCCCCATGTCCTTTTGTAGTCCCTGAATGTCCTTGTGACTACTACATTCC
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TGACTATTTTTGATGCTGTGTTAATTTCGTGTGCTATGACTAGAGAAAAT
GTCTTTGTCAACAAGCAATTTGGATGAAGATTACGAGGCGTAATGGAACA
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CAGGATAATTAAATTACTCGTAAATTTATACTAAAAAATAATTATGAAAT
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GCTTCTACAATTGGATTTTTAGAAGTTGTAACTTGTTCAAGGTATCGCAA
TTTGTACATCCCATAAAATGTGTAGGTTAATATGTTATATATCTTATTAA
ATATCAATTATAGTAGAACCCTTCCATCTCCCAACTTGGATACGAATTGA
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TGGCAGAAGCAAAAGCAATTTCCTTAGGAGGACATTTATTGGAGATCCGG
GAGGATTCTTTTTTTTTGAAGAAGATGAATAAAAGAGTCAAGAAGAAGAA
GACAACGACGACTAAAAGGAGGAGTAATGATGGTAGTCGTATTCGTGGAC
TATTGGGAAAAGTTCTCAAAAAATGTAGGTTGAACAGGTCAGGCAGGGCA
AAAAAAAAGAGAGAAATAAAAAGTGAAACTCTGGTTATATTTTCTACTTT
TTCCTTCTTGATGCATCGTATATATATATATATATACATTTTCCTGAAGG
AGAAAATTCATTAGATGAAATATCTGAAGCTAAATATTATTATTATGTGT
TTAAATAGCTCAAGGTTTGCTCTCTTCTTCTATATATAAATAAATATACA
GTATGTAAGTCTGATTGACGCAAAATACAAAGAGTGCTGTTATATTTATT
TTGTATGATTACTACGAGGAGCTCTAAGTAATAATGATAAAAAATCAGAA
TTGAGATACCCTTCGCAGTTCTCACTCTACAACAATCTACATAAGATAAA
CTATATCTACGCTGTACTTGTATAAGTACAGCGTACAAGTTGTAACCGAA
AAGTGAAGGATTTTGAGTACTGCTTTTGATAAGGATAATGAATGCATGCT
TTGAATGCTTGATATATTAATCATATAATTCATTATTATTCCCATAAAAA
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GTGTTGGGTCATTCCGTATTTAGACCCAAAAGACTATAGTCCCGTCCAGT
TGCAGTCTCAGTCCGGGGATTTGGACTCAAGACTTGCGACTTGACTTGAG
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CTGCTCGAATCGGACACAAAAGTCATCGAAATTTTTTCACTGATACTAAA
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TACTCCAGTCCGGTCCAGCTGGGTCCTGCATATCGCTCCTAAAAACTTGT
AAAGATGTCACTCAACTTTATTTCTTATATTTTTAATCTGTTCTAATATT
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TGTGGACTTGAACTGTACTCGACGAAAATATTCAAGGACTTGAACTTGTG
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AAAATTCAAAGTGTTCAGATTTGAATGGACCACTCGACTTTTTCCCACCT
CTGATTTTCAATACGTAATTTTTAGTCCTCCTTTTGATAAGGATATTGCT
TTTTTTGAATGCTTGACATATGAATGATATAATTCCTGACTTTTTTATTT
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GATTGATTACATCTGTATTCTTTGATAAATTATGCTCCATTTCTAACAAC
AAAATAATCTTATTACCTCTTTGAGTGCACCACAAATTGTACTTGAAGAA
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TCCGTCATATCGAGGCCAATACAAGTCAAATAAATGATTTACATTATAGC
TAGAATTCGTAGGTATCTTAAGGCATCCAACGTTTTTTGACTACAAAGCC
TATCATTGAGTCCAATAATATGTCTATGAAATATTGGGTTGTATTTGAAG
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TATGTTGAAGCACCACATATTATAATTTATCATAAGGAGAGAGAAGGTGG
GGAGGAGAGTGGAGTGGAGGGGGGGGGGAGGGGGGTCTTAAATGGGTCAA
AACATGGTTTTGTTCAAAAAAAGAAAGAAAAAGAGAAAATTTTAAAAAGT
AAGTAGAGAATGATTTGTGGGTAATAATGATTAGTAGTACTTTATACCTA
CATATATGGACTTCATTTCAATATATTCATTCCCTCCTATGACTTACTTT
CAACATACATACAATGCACCTAATATTGTCCTACCACCATCACCATAGTC
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TTTTTAAATGCAAACCTTTGTTTTGTTTTCCCACCTACTTTTTTTTTCAA
GGTGGTGAGTGTGGAGGGTTCGAACCCCCTCCCCCTCAAAAAAATATTTA
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GCTTCTGACAAAATTTTTCGTCCAGTTCGGTTTTAAGTGATATTTTACCC
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ATATAATGTTTGTATAGGTGTTGTGGTGGGGTCATGATTAGAGTGGGTTG
GAGCTTTTTTGACCGAATACATTTTCTATAAATCCAAATTAAACATTTAT
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TGTTCGGATTACAATTACTCCATCTAACCTAGGAATCGTCTTTGAAGTGA
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ATATATTGATCGTTGGCCCCATTAGCTCCAGAGCCACTGATCTAGATATA
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TGTATGCTGAATTTTTACTTTAATACCATTTCAGAAGGAAGATAGTTAAA
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CAATATTATAAAAATATCCAAAATGATACGTCACAGTAATATTTGATTCC
TTCCCTCTTTATCTTATATTTTCTTAACTTTTTGTTCCTTCTTCTTCATA
TGACCCCGGAATGAAGGTTTCAGGATTATTTCATTAGTTATATATGATAT
ACAGTAAACCCTCGGATTGCGAAGTAAATTGTACATAACACAAATATATT
GTACTTTTTCTGAAAAGTAACATAAGACCCAGTTTTCAATTAGGATGATG
TTTTTAAATCCTATCCGGGTTTTTGGAGACTTTTATATACATTCATTATA
TGGCCGGTTTTTTTTGAAGGATCACATTTTATTAGAATTAAAATGAAAAG
TCCGTAATTTGTTATACAAGATCCGAAATGTTTTATCTAAAAAACAAACA
AAATTTCTACTTTATCCTTGAATTGATTGATTTCAGAGTTATAGAATCGA
CAATGATTGGTGTCATTTTATGTCATTGTAAATACAAAAATATGGTCATA
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TCCACTGGTTTACTAACCATGAACGGTTTTGTAATATCTAAATGTAGCTT
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TTTTTCGGGAATAGGGGCGCATGTAACTCATAAATCTAAGTCAAAGTAAT
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CTATTTAGTTTGACGGTTATTTATGACTATTTATACAAAGTGATCCTCGT
AATCCAAGATATGACTGTTTGTCTACTTTTAAGTTAAATGTACGATCCCA
GTGAGTTTTTATTTTTTATGTGTGTGTGTGTCCTTATGTGGAAGGCCATT
CTATTTTTAAAAAATCTCCATCATGTTATATGTATGTACATATTTTATGG
GTCATGACCTCAAAAAAATTAAATAACTTATGAAGTATTCAATTTTAATT
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CTTTACTAGACTTAACCTTCCTTTCAGCCTTGGCTTTTCTCGCCTCATAT
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ATTTTCTGTCTTACAAATATTGTCCTTCTTACTTCCTTTTAAAACATCTG
TCTCGTAATTCATTTCAAAGTACTTCTACGAATTAGTGATGGACTTTGGT
CTGAAAATGCTAGACCGGTCTGAAACTGTTATGATTTTTAGTGCACCAAA
TTATTTTGGTCCACTAAAGAAGTTTTTCAATGTTCATTCNGAATTTTTTG
GAGTAAAATTCAAAAATCCATAGTTCACAAAAAAAAAAAAAAGAATTTTT
ACACCTAATTTTGTGTAAAGTTATTCCATTCTGACCCATCAATTTTTAGT
AAAAAGCAAAAATTCCGTATTTCTTGTGGCTTATCCATGGAGATGCCCTT
GTAGAGGTTTGTTATTTATTTGTTTATTTCATTTAACTCTAGGAGGTAAT
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GAAACTAACGCCCGATCTAAATTCTTACATTACAGGACGATGGAGTTGAC
CAGGGACTACTTCATGGTTGAGTGATGAACTCTGTGAAATTTTTTACCAA
AAGTAACTCTAGACAAAATAATCCATCGGATTAAGGCCAAGGGAGCTAGG
AGGGGAAATATCCTTGGACACCCAGTTGTAACAGTGCTCTTTGGTCTAAT
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TGGCTTGAAATATCCAACTATGAATTCCATGGCAGTGTTTTGGTTCCTAA
GTGAAACGTTTATAAATATATTTCACCACAAAAGAACACAGTTTGCAATA
TCATCATAATATCTAACAGTCATGAACGCCAAAGTATCGGTATTAACATC
TTGCCACAATTATTGTTATTCTTGTAGACAAGGATATTTCTTCAGCCTTA
TAAATGCGTTTTTTTCACATTATTTTATAGTTTTGGGGTCAATCTAGAAC
AAATCACTTGAGAGCGACCCGAACAAAAAATCGGACTTGATCCGAGTTTC
AACACTACGACTGTTTATAATTATAATATCTATAATATTACACCCGTCAC
ATACTTTGACTAGTATGAGCACAAAATATGTTCATACATTGTGCTCATAA
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TCTTCTTTTTCAATACTCAATGTACAAACATACACACATACATATGTGTG
CCCCTGACCTTTTTCTTTTCCCTTTGTCACAAAGGGGGATTTATTTTGGT
TATTTCTGTTGGAGTTAACCTTGGAACTCCTTCGTATCCTTTGTTTCTTT
TTAACAAGGGGTCGATCCTTGGTTTAAAAAAAATAATATTCAAGTGCTTC
TCAAACTTTTTTTTTCTTTTCGGAAATTAAGAAACCAATGGGGTGAAAAA
GATCATTGAACATTGTTGTATTATACAATATTATTATGGTCGTTATTTGG
ATTCCCAAAAAAAATAACACCTGAGCAAGTCATTATTAGTTTGAAGGAGA
AGAGGATATTTTTTTGAAGTTAATTAACTTCACAATAAAGTATTACTGAT
TCTTGTTTTTTTGCAAAATACATTTTTGAACTTGAATTTAGAAAGAGGAC
GCTTGGTCACCCCAAAACTATAAAATAATGTGAAAAAACGCATTTATAAG
GCTGAGGAAATATCCTTGTCTACAAGAATAACACTAATTGTGGCAAGATG
TTGCTTCTAAAATKCAGCCGATGACGTCACTTTATAATTTTTCTTCGTGA
CGTATTCAATTTTTCCATTCCCTTCACAGATTAGACCTTTTTGTATTTAA
TTAAAAAGGATTAATTCATGGTGGCTTAGAAATGACAACCTCAGCGCCCC
TAATGCACAAAAATTATTCTCAAACCCATCTAACTTTGGACAAGAATTGA
TCACGTGGTAATTGTTTCTCCGCTTAATTTATATCTTTGGGTCTCTCTAC
GTTTAAACTAGGTGTCCAAGGTCGATTTGTTTCCGCTGGATTTTTTCTAG
ATATTTCGGTCCAAACCGTGATCTGAGACCATAGAGCGAAATTTAATCGT
GGGCTGATTTTTTAGTCTCAATCCGTAGACCTACTTTTTTTTATGTCTTA
ATTAATGTACTCATTGTCTCCCCATCCCATGACCTGTACAAATATGAATT
AGGCAACACATGCAACTTCATACGACGTTATTGTGCCCCATATGCTCACA
ATTTGAAACACAGAAAAGGACATCAAGCATTCATCTATAGAATCGGTCTA
GACAGAATTTTCAATGAGACTGATTCAGGTCTAATTTGGCCACTAAAAAC
CATAACTTTTCTCAGACTGTATCCCCACACTAGTCCCTACGTATTACTAT
ACATAATACAGTGTCTTTCAGATAAATTGTCCTCTTCTTAAACCACCATT
TATAACCATGAGTCAACTCTAAAACTAAGAAATTTTATTTGTAAGTATCA
CTTTACTTACATTTTTTATTTTCATATTTTCGTTGTCGTTATTTTATTTT
TTTGGCAAACAATTGATAAATATGGAACAGAGAAAAAGAGATACCATTAT
TAATATTATTTTTTTTTGCGGGCCATGAACCAAAGGACATTTTAAGGATC
GTAAATTTACACAATAGAACTGTCTATCGTATTAGTTATAGACAGATTTA
AACAATCTGACAATACTACCAGGAAGAAATATATAATCCTTGGAAAGATC
AGAAACGATTCTTGACTGAACTCAAACACTGTCAGTAACAGCATCCCCAG
GTTATCATAAGAGTAAGTTGGCAAAAGATCGCCATGTGAGAAAGGCAGCC
ATCTAATGAGCTGTTTCTGACGATCTTGACCTTACCTTTTATCGCCACTA
GCTTTTTCATCTCTTCACTGATCTAAAGGACTCTAGTTAAAGAGTGGACA
CTCAAGGCAAGGCGGGMAGAATTTAGTAGTTTTTAATTCTGATAGATTAA
AATTACATGCTGCTACATGTTCCTCAATGCACGTAGCCAGTTTGAACAGG
CTGMCCTCCCCTTTGTGAAAAGGGAAGAATAAAGGTGACTACGTCACAAC
AATAACATGATATTATAGGTCGGTGTTAGGAACATAGTCTTCTTTGTCTT
TTGATTGAATTGTTTATTTTTCACTTAACCACTCTTTCCCTAAAGTCCTT
TACACTGATTCAATGAAGGCCAACAGAGTGATCGATGGGAAGATATTTCT
TTTCTTTCTAAAATCCACTGGTAGTTAGTTACCTTCCCTTCTCTTCTGAT
GAAAAACTCTTCACTTTAGACCGATCAATTAACAGCCAAAATGATAGGTT
CATGTTGTCTTCAGAAGCAAAAATACGGCTGCTATTATGACATTGGGTGT
CAAAAGAAGTGAATGGCATGTTATGGATCCTTATTTCTTTAGTTTTGGCC
TCAGAATCAACTAAGATGTTTGCATGGATGTCCTAGAAATAGTTGTTGTA
CCCTGGATGAAGACTGCAGCTGCTGGCAGGCCTGAACACAGTCACTGCAG
GAGTGTACAAAGCCCGTACGTAGAACAGTTGAATGATTGAAGACATGATA
CATATCAGTTATGGCTAATTGGGTATGGCCTCCAAAATCCTCAGAATTAA
ATCCATGCGATTATTATCTTTGAAGAAGGTTGGAAACCAGTGCCTGCCGG
KCCCACCATAAAAATATTACCTCCCTGAAACCAAAATGGTGGACAGAATG
ACTCAAAATATTTTGTATATATCGGTATTTTAAGCTTTTTACTACATACA
TGACTTTTGTTGTCCTTGTTTAAGAAACAATGATATCATGTATAACCATG
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ATTTGTCATCCTCAGTCCTTCCTCACACCAATTAGTAAAGCTCCAAGAAA
GAATGAAAAATGAATGTTTTTTTTCCCTTAATATTTAGAGATGTGAAGAT
ATCATAATTAACATTCTTTTGTCAAATTTGTATGTAGTCTAGAGTTATTG
TTACACATACAGTATATATATTGTATAATTGTTCATTCTCAAGCAGCAAC
TATTAGCCATTGCATACCTATCTCTCTTCATCCATCATTTATCTTAGCCT
TCAAATTCAAGGTTCTTAGCAATCGCATGGACAAAGAACATCAAGTTCTC
AAAATATGAATTGACCTTCTTTAAATTCATAAAGGGATTTTCAACTTACT
TAGACTTAAATATGATCACTTCAATGAATTCATCGAATATATACATATAT
ATAGTACATCTAGAGCGTTTTCATGTGACAACAGCACTTGGGTTGATGTC
AGCCATTTTGGGGCCTTAGGAATCAAGTTTTATATGAATCAAAACCCTTT
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GTGTGAAAATGCCACTGACTAATAATAAAAATTAAGTCAGTTTACGATCT
CTCAAAAAATGTATCTCTCTTACGTCAGACTAAAAATATATTATTACATA
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CACTTTCAAGGATCAGATATTTTTATCCAATTAACCTATTTATTTTATTT
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