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Associated RNAi Experiments
Homology
BLAST of EMLSAG00000003088 vs. L. salmonis peptides
Match: EMLSAP00000003088 (pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s173:277123:290523:-1 gene:EMLSAG00000003088 transcript:EMLSAT00000003088 description:"maker-LSalAtl2s173-augustus-gene-3.21") HSP 1 Score: 367.466 bits (942), Expect = 1.377e-130 Identity = 188/188 (100.00%), Postives = 188/188 (100.00%), Query Frame = 0
Query: 1 MDQNSRSIQLSVLQSRMIKLLLRASLVLLVFHVSFIDSLPQLGSLVRGSSGFLSDIVRSNVDEDSNRGKLAILIAENGGDTDKIKDSLKLRLKSKVPFLLTDEEKAELEKREKEEERQQEDAKNDSSLSSRLFNSAKDRVFGRSMKSEDLSQIMIKTGELLIILGKSSLIKPDNAGDYVEYALSNFNA 188
MDQNSRSIQLSVLQSRMIKLLLRASLVLLVFHVSFIDSLPQLGSLVRGSSGFLSDIVRSNVDEDSNRGKLAILIAENGGDTDKIKDSLKLRLKSKVPFLLTDEEKAELEKREKEEERQQEDAKNDSSLSSRLFNSAKDRVFGRSMKSEDLSQIMIKTGELLIILGKSSLIKPDNAGDYVEYALSNFNA
Sbjct: 1 MDQNSRSIQLSVLQSRMIKLLLRASLVLLVFHVSFIDSLPQLGSLVRGSSGFLSDIVRSNVDEDSNRGKLAILIAENGGDTDKIKDSLKLRLKSKVPFLLTDEEKAELEKREKEEERQQEDAKNDSSLSSRLFNSAKDRVFGRSMKSEDLSQIMIKTGELLIILGKSSLIKPDNAGDYVEYALSNFNA 188
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of EMLSAG00000003088 vs. GO
Analysis Date: 2014-04-02 ( Blast vs. GO)
Total hits: 0
Match Name | E-value | Identity | Description | |
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BLAST of EMLSAG00000003088 vs. L. salmonis peptides
Analysis Date: 2014-05-10 ( Blastp vs. self)
Total hits: 1
Match Name | E-value | Identity | Description | |
EMLSAP00000003088 | 1.377e-130 | 100.00 | pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s173:27712... | [more] |
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Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s173 | supercontig | LSalAtl2s173:277123..290523 - |
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Description | maker-LSalAtl2s173-augustus-gene-3.21 |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Note | Hypothetical protein |
Cross References
External references for this gene
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at LSalAtl2s173:277123..290523- Legend: mRNA Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAG00000003088-685854 ID=EMLSAG00000003088-685854|Name=EMLSAG00000003088|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=gene|length=13401bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s173:277123..290523- (Lepeophtheirus salmonis) ATGGACCAAAATAGGTAAGAGGGTGTGTAGTGTTTCTACCTTTTGTGAGT
CATCTCACATTTTCTGTTACTATACGTACTAGTTCTTCTTGTAAAGTAGA
TCTATTCAGTTATCCGTTCTTCAAAGCAGGATGATCAAACTCCTTTTAAG
AGCCTCTTTGGTAAGTTTGTTCTACAATTATGCTTTTTTGTATCTTTGTT
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TAGATTCTTTCTATCGAATATATTTTGTAAACAGTGCAATCAAACAAAGA
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CTACTTTTAATAGATCAAAATGGAAGTATAAATTCTTAGTTATTAATTAA
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AAAATATTTATATTATATTTAAAAACGTATTTTTTGCAAAAAAAGTTTTG
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AGTTGCTTTTGGAGACGAATAATATAATTAATTATTATCAAACAATTTCT
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TCTATCCTACAAAATCACATTTTTTTTTATGCACCAGAACAGCATATGCT
CAACTTATTAGACTGTCCCTGTTTCATCAAACATAACATAGCAAAAATTA
ACGCCTAGTTGAAGTGCATAGTTGTAGAANTAAAAAGTAGGTACATTATC
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ATAAAGAAGTTGCGCAGTATTTATACTTAAAAAAAACAAAAAAACAACAA
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CGGACCTGAAAATCTCACCAAGTTTAATATCATATTATCTATTAACTTGG
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ACACAGTTCCTACTTTAAGCCTCAGGTATATTGTTTCTTTGAAAGAGTTT
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ATCATTCCATAGTTTGGAAGAAAACGTCCATGATTAATTAACTACCAATT
GGGTCTTTTTTTTACCTCTGCTACAAAGTTGAACGGAGTTATGCTTTTGA
CTCTGTTTGTTTGTTTGTCATCTTTATTACGGCAAAAGTTACCGATTGAT
TTTGATAAAACTTGGTACAAAGGTGTTGTATGGTCACACTAAGAGACCAT
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GTTATTCACATCTGTTAATAAATTTATATTTTTTCACAACTATAATTATA
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ATAGCTTTGGCCTGTCCTATATTCTTTTGTATACTAAAGGTACCTCCACA
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TGTTCACCTAAACATCCATTAAATGCAAAAAACCAAATTCTTTTGTCTTG
GTACAATATTTGGAAATGACGCAGTGGGAAGAAATATTACATGATTTGGC
AGACTCCTAACAAATTCTTGATTTATGGATTTTACATACTAACACAATAT
ACAAAAAAAAAGAACAACAAATAAAGTTATATCCAATTAGGTCGAATGTG
GATGAGGATAGTAATCGAGGAAAATTGGCCATTTTAATCGCTGAAAATGG
AGGAGATACTGATAAAATCAAGGATTCTCTTAAGCTACGTTTAAAGTCGA
AAGTTCCATTTTTACTCACCGATGAAGAGAAAGCAGAACTAGAGAAGAGA
GAAAAAGAGGAAGAACGTCAACAGGAGGATGCAAAAAATGACTCATCATT
GTCATCACGGTTATTCAATAGCGCCAAAGACAGGGTGAAGAATAAAATTC
AATCCATTTCACCTTTTGAAAGATAGTCCAGCTTTTCTGGATCTTTATTT
GATTAATTATGTCATTAATTAATTAACATCAATGTTTTACTTAGAGTATA
CAAAGATTCAATCAAATTCAATAAACGTTTAATTAACATAAATTGTATAT
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ATCCATAAAGTTTGTTGGCTTTGAAACAAATGAAAATTAATAATTGTTTT
TGGCATTATTTCACATCAAAAACCTACAAAGTTTATCAAAATATGTATTC
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CTCAATTTCAATTCAAAACGGAATCGGATGAGTAATTTTTTCCCAAGGCA
TTTTGATATATTGAATTACCTAAGCCAAATTATAATTTGTACCGATAAAT
TATAAAACTACTTTTAGTCTAGTCATTCAACTATTTCCTTTTGAAGAGGC
CTATGGTGTTTGATTCTATCTGGAGCTATTGATTTGTCCTATTACTAAAT
TTATGTACCTATTCGAATAAGCAGTTTTTATAACAATTTCTGAATGTTTT
TAGTTGAAAATTTTGGTTCATATTTGTAAAATTGGTTACTTGACAAATGA
AAATATCAATTTAAGTTAATGCCTTATAATGATACATTTTTCTAATTCTT
GGCATGACTGCTCAATTTGTGGGTAAATATAAATGATTTAACATTATATA
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AAATAAGCTCATACAGAAATCATTATCGTCATATTTATACCGTATTAGTA
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TTTTGATTTTAAACTATAATTTTTCCAAACTAAAATGGCTTKTWCCGAAA
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TAGTCGCTTATTACACAGTATTAGGGATAATCATATATTAATTACTATCG
TGACCAAATGCATATTTTATTTCTTGTTCAAAAAGAAGGAAAAATAAAAG
TTGAGAAATATTTATCCACTTTTGGCAAAAAAATGAGATGCTGCTCACAT
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AAATTTGATAGGCTAGTTGTATTCAAGACTGCATTGGAAAATTTTTGTTG
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AGAAAAATTTGATCTTGTCAGTGTCACTAAAATTGTGATAATTGCCACTA
TGACTTCATATGAATGTTAAAATGTTTCATATATGTTCAATTTATATAAC
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TTGAATGAGAACGAAAAAATCGGTATATACAATTTAAAAGCCTGGTCTTG
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GCACCTCAAGACTAATATAATGTTACATTTTATGTGTTAATATCCTTCAG
AAATTATAAATAATTGTAGAGTCAGCTGCTTTAAAATAGAAATAATCAAA
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AAGTTTTTTTTAACGCGATTTGTGACAATGGCACCTTAAAACATTTCCAA
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TATTGTTCTGAACGTTCTATATCGATTTCTTGTTAAACTGTGAACATTTC
TATTTTGGAATAGTCCAACAATTGGAAATTGGCAAGCAACCAGTTAATTT
AGGACATTTTTGTCTTTTTGGGGGGAATACATTAATGATAGTTATGTATA
TATGTCACCAAACTTCTTTTCATCTTATTTTTTACATATTAATTTTCAAA
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TGATGTTATTATTTTTTTTACTAAAAAACAAAGTTTATATATCAAATAAT
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AATGACGATGCAATTATACTTCCTCCCCCCCTTATGTAATAAATAGCAAA
TTTAACTCTTCTAAAAATTAATTTAATTATATTTAAATATATTTTTTACA
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AAGGGTTTGACACGTTGATTACAAATTTGTGATGGAGCGCTTTTCCTAAT
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AGATGCTTTTATGAAATAAAATAGATACATTTCGAAATAATAGTGAAAAA
AAGTCATGAAATTAGTTTAAAATTTTTTAAACACTCAACATCTTTCTTTA
ATGCAGCTTGATACCAAATCAAATCCAATTATATTTGAATTAAACAAATT
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GTGCATCTGTGACTCTCTGCTGTTTCGGTTGACAAGTTTGCCTCTCATGT
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TGATATCATAAAAAAGATAATAACTCGGAGTGACCTGATGTTTGATAAAT
GTAGTCGATTCTTAAATAAGGAAAATTTGTATAAGCTGTTATTTTATAGC
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GCATACACAGTGCATTCCTTCGAAATTGTGAGTCAGGTTAATTTTTTCAT
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ATAAATTATGTATATTATATCTACATCATCAATGTGTGAGCCCAGTTTAA
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TGGACAGAATATATATTAGAGGAATGCTACGGAACACAACAGAAAAAGCT
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GCAAATTTATTATACTTCCATTACTTTATTGGGGTCTTATTGGGGTAAAT
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GCAAATAATATTGCGTCAGTCTATATTTATTCGCTCCAATCCAGTCTTAG
GACCGAATCAAGACTAAACTGAACAGAACTGCAGTTATGGGTCCTAAGCA
AGGATCGACACAACACTATTCCCAACTGTCCTGGTCTTCCTTTACACCAA
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AAAACAAAAACAAAATGATGTAAATATGTTAGATGTCTTACAACTTAAGG
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TTTTACGGATCAAATAATAGAACACTGTCATTCTAAGTTTCTACCTATAA
ACATCATGGAAAAATTCACATTACTTTTTCGATACAATCATAATAATCCA
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CAATAATCATGTAATATATCTATTTATCTTCAAAACATGAATGTCAGTAG
AGAGCCATACAACCTTTTCATAATATTGTGTGTGTAATACTCAGGTATTT
GGCAGGTTAGTAATAATTTATATGTCTCTTTATTGTTATTGCTATATGTG
TATATATAAAACATATTACCTTGTTACTAACTAATAACAAAGTAAATAAT
GATATATTATATTGTATTTAATACTCTCAAATCCTCAATTTAAAGTTAAT
CCTTTAGTCAAATGTGTTTTATGTTAATATTAGTAGTATATTTATCAAAA
AATTAAGTTTACTTTTCAATAACTCGCTTTTAGCTAAACATACATATAAT
ATTTACCTAGGTATGAGTATAATTTCTAATTAATATAAGCTTTTACTTTG
TTTAAAATTAATTAATTACGTTTGTGTAAGTCCTTTTATAACAAAGCATT
GTAAATGTATTATGTAATTATCAGAGATGTGAAAATTGCTGAAATCCCGC
CCAACGTAATAACTCCATATTTGGTTTTTTTTCTAATACACGGTCCCTGG
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GAAGTTATTTTCAGCGAGTATCATCTTATTGTCATTTATATGAGCGAAGA
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TTTAGTTATCAAATAAAAGTTATGCAGAATTTTCAGTTATGGAACGAGGT
CTATGTTTAATTCTGATCAGAACAGATTCCTTGGCTCTGGAGAGAAAGTT
TATATCTACGTAGATAAATTAATTGTTTCCATAAAACAAGAACAATTCCA
CACGTCCCAATTTTTTTAAAGGTATGGATTGTCACTTCAAAAATGCTCCA
AAAAAATAAAAAAACAAAAAAAAAACCAATTATGTATTGTACTAATCGAA
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GTCTTAAACTTGGAAAACCAAGTATAAGGTCTCCGCCCGCAGGGCTTAGC
TGCTGGAGCCCGGCTATCAGTGTTGGGTTTCAATCTGAAAAAAACGAGAT
CGGTTTGACACAGTTATTTTTTTGTTGGACCTGACTAATTCGGTGCTTCA
AAAAAGTTTGGTCTAGATTGGTTTCATAGAAAAATTTAGTCTGGATGTCC
CCAAAGGTAAAATTCGGCCGAAGGAAAAAATCGGTCTTATTTAAGTCTCA
AAATAGAGAACATTGTTGCCAAGGTAATGGAGATAAACTGAAGATTAATT
TTAGAGTAAGACAACCAACAATTCAGCTATTCGGACTTAGGAGAAAAAAA
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TTCAATCGTAAATCTTTTAATTTTTTAAACTTTTCAATAGTTTTTTTTGT
ACTTGATGTACTCTACACGACAAAGCACACGAAGGAAATTATGTAACTAG
GAACAGAAAGATATGTGTAGACATCGATTAATATCATGTACTCCTTCTTC
AGTAGAGGGACACCACTAGCAACATAGTAATCATTAATCACACTGTTGAT
AAACAACATCCAACCTGGGAGTGTTGTTTGTCAGCTTTGACCCTGCTTCT
TTGAAGGGAAGGGGGGGGGGGCAAGACAAAAGGTGTACCTTTTCTATAAA
ATAAAAAGAAACCTTCTTGGATTTTGTATTCTAAAATGTATTAACCAGTA
AAACTTTATAAAATCTAAATTTAGGACATTCATGTTTTTGTATATTCAGT
AGGAAACATTTAAATTGTTATTATAAATAACTTTAACTCCTAGAAAAATC
AACCAATTATATAATCCTTAAATAAAATAAAAATGTTTATTTCTTCCTAG
ATGATGAACTTATTACAATCACACTATAAGACTCTATTTATTAAATTAAT
ATGTTTATATCAAAAAAATATTAGAGGGGAAATAAAAAATTAAATATATA
TTCATATATGAAAATGTCGTTGAAAAGAAGCTCACTTAAATAATTTCTCG
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TGAATGTATGTCCGAACAATAACAACAACCCTCTATTTAATATTTATCAT
TATCTAATTATATTTAGATGCCTGTTTTGTTTTTTTTAAATCTTAAAGTT
GTTTATTTTGGTAGATATTGCCACTTCTTTGCTCGGGAGTAATTACTGTT
TGAATGAAAAACTAGTTCAATAAAAAATAAATGTTGTTTAGTTGTAAAGG
AAATCCATTATTTTCAATGCCATTTCCAATGTGTAATGCATAATTATACA
TTTTTTTCTTAGGAGTATGAAGTCAGAAGATCTTAGTCAAATCATGATTA
AAACTGGAGAATTACTGATAATTTTAGGTAAATCGAGTCTCATCAAACCA
GATAATGCAGGAGACTATGTGGAGTATGCTTTATCTAATTTCAACGCTTG
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