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Associated RNAi Experiments
Homology
BLAST of EMLSAG00000004045 vs. L. salmonis peptides
Match: EMLSAP00000004045 (pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s215:915287:935724:1 gene:EMLSAG00000004045 transcript:EMLSAT00000004045 description:"snap_masked-LSalAtl2s215-processed-gene-9.4") HSP 1 Score: 142.51 bits (358), Expect = 1.394e-45 Identity = 71/71 (100.00%), Postives = 71/71 (100.00%), Query Frame = 0
Query: 1 MESTSTIGSSKNSQTNNKLFVIPLNEEETCGCELLCCIGCLEDIVVQYIIIIYYEYFERKKRNKNYLNSKV 71
MESTSTIGSSKNSQTNNKLFVIPLNEEETCGCELLCCIGCLEDIVVQYIIIIYYEYFERKKRNKNYLNSKV
Sbjct: 1 MESTSTIGSSKNSQTNNKLFVIPLNEEETCGCELLCCIGCLEDIVVQYIIIIYYEYFERKKRNKNYLNSKV 71
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of EMLSAG00000004045 vs. GO
Analysis Date: 2014-04-02 ( Blast vs. GO)
Total hits: 0
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
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BLAST of EMLSAG00000004045 vs. L. salmonis peptides
Analysis Date: 2014-05-10 ( Blastp vs. self)
Total hits: 1
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
| EMLSAP00000004045 | 1.394e-45 | 100.00 | pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s215:91528... | [more] |
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Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s215 | supercontig | LSalAtl2s215:915287..935724 + |
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Description | snap_masked-LSalAtl2s215-processed-gene-9.4 |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
| Note | Hypothetical protein |
Cross References
External references for this gene
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at LSalAtl2s215:915287..935724+ Legend: mRNA Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAG00000004045-686811 ID=EMLSAG00000004045-686811|Name=EMLSAG00000004045|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=gene|length=20438bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s215:915287..935724+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGAATCTACTTCAACTATTGGGAGTTCCAAGAATTCTCAAACGAATAA
CAAACTGTTCGTCATTCCATTGAATGAGGAAGAAACTTGTGGTTGTGAAC
TTTTATGCTGTATGTACGTAATATAACTGTATTTCCAAGCCTAACAAGGC
AATGTGTATAAATCAATATAATTATGTGAAGAGGTAGAATTCAATATATA
ACTAATTTATGTATGTAATTACTGCATTAATTATCCCCTTACACATAATA
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ACAGGTACATGATTCTGTCTGCGTTAAAATAATTGTGCGTAGATTGTAGT
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TTCTTTCACCTCTTCTTTTATTCTATCCAAAACTCCTTGACATACATCCC
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GTTACACGACACAAGTAACTTTGCTATGTACAAACTGAACGATGTGGCGT
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TTCAACCAATCAAATTCGTTCTTTTTCAACAATTTCAACAACCCTAAGTA
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TTTGTATAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAATCCATTGATTCTCACACAATT
AGTTTTCATTTTTAAAAGATAAAAAATTATCCCCTATTTTGGGATTAAAG
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CAGAGAATAGGATATTACAATTTCCTCTAAACATATATTAAATTTTTTTT
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GAGGAAGGCTTGAAAGGATTTTGCATATTCTTTAAATGAATCACCACAGT
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CACCACGTTAAATCCTATTCGTGTTAGTAGTTCTAAAACTTTGAGATACC
ATTCTTTCATTCTTCTATATGATATCAGTATCATGGCAACTGCATCATAA
TATAGAATAGAGATAATTAGTACTTTAATAAGTACGGGGATTTTCCTTCA
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CAATTTCCATCGAGGTTATAAAGTCCTTTTTATTCATATCACTTAAGCAC
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AGAGTAGGGTATAGTAAGATATTGTTAACATTACATTAAGAGATGCTGAA
GGGCTTCAGAAACTTATTAAAGGATTTTAAGAGTATAGGCCAGTTTTCTA
GTAAAGTCCATCTTTTCCTGGTCCTCATGCATTCGATTCCAAATGCTTAT
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CTACTCAATAGATGCTAGATATATATGACTAGCTTTTATTTATTAACGTT
GTCATCTTCATGTTGAGGTCGGAAACTCATCAGCCACCTTCGTATTATTA
GTTTTTCGTTCTTTAGGACAGGGATGTCCAAACTTTTAAAATCATAGACT
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CTACATGAAATATAGCTTTATAAAACAAAAATATAAAATGCAGATTTATT
TCAAATTTAGGCCATAATCTAATTCTTCAAAGCCAAACTGCTTAAGAAAA
TGCGAACCGATGATTTTTTAAATTTTTTTTTTAAATTTCGTCTGCTGGAT
AATTTGATCGAATGATCTCCTTTTGTAAAGGACAAATCCTAAAAAATTCG
TAGAGTTGAGCATAAAACCGCAGTCTTTGCACGGTTAATAAAACTTGATA
TTGTCAGTGGAAATTTGAAATTGTGCCGTAAATTTGGTCCCGTCTGAAAT
TCCAGAAATGGATCGGAGAATTCTTCGTTCCCATGAAGGAGGAAGATCGA
GTAGTACCATATATAGGTATATCTGACACAGACTTCACTTCCACCGATGA
ATTTTGGCAAAAGCTCATTTTTAAAAACCATGGTTATGAAGGAGTAAAAT
ATTTAAGAGACCTCTCAAGGGGAAGACGGAATCTCCCACCCCAAAAGATA
GATTCCAATCTTAAGTCATGATAACTTAAAATTTCATGCTGGAGAGCAGT
CTTCTCTAATAAAAAAGGATTCCCAAACTTATTAAAAAAGGCATTTTAGT
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TTCCTTTCAATAAAATTCTCTGAATTGACGCTAGAAGCGGCGAAAAAACT
TCTAAATCCCGGTTAGTTGAGGGTGTTCCCATTTGGATCCATTCATAATA
TTTAGAAGACGTGAAATTCACCTTCCAGTCACTCAACGGGTATACACCTA
ATTCATCCACCTAATTTATACTTTGGACACTTTAAAGCAGGAATATAATT
TTTATGGAAGAGACCCTTAAACCATGCATATTCTTGTATCATTGCAGATT
CTGCTAGAGAAGGAATGGAGATCATACAAGAGAAACAATTCTCAAATTGT
TTAAATCAATGCGTTTTTTAGAGATAAATGACGCCATTTTAAGATCTGTT
TGTTGACCATCATATTTAATTGTACCCAATTATCTCTTGATGCCCCATTG
ATTGTCCATTCGATAGCTTAGATGTTCACCTTCGATACAACTCTACAAGC
TTCGATTATTGTAGAACTATCCGGCTTCCAAGATCTAAGAGGAAGGATGG
TGGTTTTCGTTAGATTCATTTCTAATACAGAGTAGACCTTAAATTTGTAT
AAAAAGTCAGAAGTACTTTGATCCTATACTGAAGTTGAATTTCTAATGGG
GTTCAATTATTAACGTTACAACATCAGCATATAGGTCAATTAGATGTGGA
GTCCCACAAAAAGAGACAACAAATCCCAAATACTTTTTCGAAATGGTCCA
TGTTAGTTCATCGATGGCAGATATAAACAGCAAGGGGGGAGGGGGGACTG
GACAACCTTGTCTACAGCTCTTTCTTAATAAAATGGGTTCACTCATTTTA
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ATTAAAAAAAGTTTGGGGAGTAAACTTTTAACAGATCTCATAATGTGGCA
GTGACGTACAGAGTCAAATGCTTTGTAAAAATCAATTGCAATCAATGCAT
CAAACTTGCCACTCCTATTAAGAGATTCAATTGTTGCAGCTATATTTCGT
GAAATATCCGTAATTTTTTTATTTCTCAGGAAACCTTTTTGCTCATCTTT
AATGTTTTGGTTTAACCTGTGTTCAATTTGCTTAGCTAAAACACCAGACA
ATATTCTGTCAACTTCATTTAAAACTATGGGCCTCCAGTGATTGAAATCA
GTTCCATCACCTCTTTTTAGGTATAAGAGCTATCCTTCCTTTTGTAAGAG
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CTTGGTAAATACTTCAACCTTTGAGGGTCTCCTTTTCTTCGGGAAATTGA
GTCTCTCTCCACCTCAAATCTACGAGAACCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNTTTTCTTCGGGAAATTGAGTCTCTCTCCACCTCAAATCTAC
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ATTAATTTTATATTCACAAATTCTTATACTGTTTATCAAATTTTATTTGT
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TTTTTATTGGATACAATAACGACCTGATTAGTGTTGTATCTATCCTTATT
CTTTGTTTCTAGTCCAATTCAGTCTACTGAGTACTGGAAATGATAAAAAA
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TTCTAAATAAGGACCAACACTACATTACACGTCATCATTTTTTGTTCAAA
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CCAATCCCCTCAAGTCGATAGGTCCCATGCCAGATATCTCGAGTTTTCAC
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ACAGGCCACTTTTGACGCCAACAATGAAAGAAACCCCATCTCCTCCAAGA
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AGCCAGCAAGGAGACTCCAKGACAGAGGACTACATCTGCAGCAGGTGCTA
TGCCTTCCACCATTGCCTGGTAACCATCATTGCACCTGAGGTTGCCTAAA
TTAATGATTAAGAGAATTCAGACACTTCTAGTAATAATATTAGTTTTGTT
GAAATTATATTGTTAATTAATTAATTATATCTTGTTGAAGTTTAAAATTA
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CGCAACACTAAATTAAGATAATTATATGTGCTGAAATAAGTCACAAAACT
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TTTGTTCCCTGAAGTAAAATAAACTTGATACTATTTTGCGTCTCTGCAGA
AGGTCCAAAATAATTTGGTGGAGTTTGTAAAGAATATAAACAAATAGCCT
TTAATTGAGGTTGTATCAAATTTAACAATCGGAACACATTGAATAATCAC
GAATACGGCTTAGCTTTGTATTTCTTCATTTCCCCTCTTGAAGGAATTTT
AGTAGAAAAGGACGTACTTTTTTTTATTTCCTTTCCCAAGTCAATAACAC
CTTTTATATACTTTTAAGAAAAATTTAAAGTGCATCTTTTTTGTGTTGAT
CCTGAATTTTAACCAATTTGACCTGTTTTCACCAAACTAGAGTATGCAGG
TCATATATTATGCGTATTATCTTGTAAATAACCCTTGAGTACCTTTGTCC
TATTCCATGCATTTCAAGAAATATATATTCAGTGTTTTATATGTAACATC
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TTGGAGTCAACATGAAACAAAACATATTTAGAGTTTTCCGGATAGTTACG
CACTTAGAAATATGAGTCAATCAAATGCGGTTTAAAACTCAAAGAAACTT
CTTCACGAAAAAGTTTGCTGGAATTTATGAATATGTCACTCTTAAAAGTA
ACAAAACAGACTGATTATGCGGCCCACGCTCGTCATTTTTCATTTATTAG
GCCCGTAGTAAAAAAAGTTTGCTGACCCCTGGTCTAGATAAATTGGGAAA
ATATTGAAAGGCATATAACGAACAAACTAGAAAGGTTATAAACATATATT
TTGTCAATAATTTTGGGGGATTAGGACAAAAGTTTATGGACTTGCTCTCG
AGCCAACAATCTGCAGATGCCCCTAGAATAACGATAAACGGAGTTTGTGG
GAGAACCAGGGAGATGGCAAAAACCTCCTGATCCCAAAAATTTATTACAA
AAACACTATATTTTATATACTTATTATGGCAAAACAATTAATAAATTAGC
TTCCCTCTAAAACAATTTTCATACTCCCCCCCCCCCCCATTTCGACCTCC
GCCTTTAGGGATAACTTGAGCTTAAAAAAATAATAATTAGACGATTTTTT
TCTCTCTTAGACTTATCTATAATTCAATTTAATAGTAGGACTATAAAAAA
CGAAAAATATTAAAATCAATAAATGCATATACATAAACACACACACGTCT
ACTAAAACAAAAAGACACTAAATTTCAATCAACAACATAGAATAAAACAA
AACAAACATATCAAACAAAGATAAAGACAAAAACTTGAAAAGAAAACACT
GAACTGTAGAGTTTGTTTATAAAAGGACTATCCGTTTTAAACACAAAGGT
GAAGTTTCACAACGGATGAAATACCGGATATTTAATAGTCTGAAGAAGCA
CGTTTCGCATACAAGATATGTTTAACCTTTGTCATAGTTCCATTAATAGT
CTTTTCCTTTTTTCCTGGAGTAAAATAATAAAAAATCATCCTTCTTCATC
TTATAAAAATCAAAATGTTCCTCTAAAAGTTTGGTAATGGCGTTACAAAT
TGAAAAAAGAAATTTGAAATTGAAAGAAGCGTCTCGTATTCAAATGGTCC
GACAAAAGGCACATATTCTTTTATCTCCGTAAAAAGTAAGTAATCTTATA
TAACACTTATGTTTTTCTTTACGGGGTAATTTATTGCCCTTCTCTCCAGG
TATTTAACAAAAGGCTCCTATGTCGAAGTTTGACTGGATTTTCTAAGATC
TGAAGTATCAAGAAAAAACAATCGAAGAAGTATCGGCAATGCAGGTCTTA
GAACATGTACGTAACTCCGAAAAGCTAACTTGTACTGTTCCAAGGCCATT
TTATTTATCAGCTCACCTGAATTTGTTGTTTGGCCTGCATAATCGACTCC
ACTTGTCCGTCCGTACCTTCATATCACTGAGAGAACCTCTGGTAGGAATT
TCCTACCTAAGGGACTCCTCAAAAGAGCATCTGTGTGGCAATTTCTTCAT
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TTCCATGCCTGAACTTTGTCCCAGCTGCTAAGATTGAAGGCTCAAAATAG
CCACAAGCCCGTCCAATCTTTTTGGTGATATCTTCCAAAAAAAAAAAAAA
AAATACAACGCACTCGGTTCCAATCCAAGACCCTAATAACTTCATGGTTT
CTATCGTATTAAAGGTCGGCTATGCTTTTTCAATTATTCCATGATATTGG
CTGAGTATTTCAGTTTTCTCATGGTTTATTTTTAGTCCGGAAACTATGGA
AAAACATCTAACAGACGTAAAGTTCTCTCAAAAGACTTTATTCTTTGTAG
TTGATACCCCAAAAAGTTACGGTTAATCCATTTGCATAACAAAGACATTT
TGGGTAAAACAAAAGGGTAGAAAAACCAATTATGTCACCATCCATTTGAA
TTTTCTGGATTAATGGGTTGATGCACATAATAAAAAGTAGAGCAGAGGAA
GATTCACCTTGTCGCACACCTCTTCTGCTATCAAATATAGGGGATTTGTT
TTCATACTGAACTATAGTTTGTGATTTGGCTAATAGAGCTCCAGCCATCC
TGACGATAAAATCACAAAATCCTTTCTTAAATAAAGTTTCACTTATGAAT
TTGTGAAAAAGAGTATCAAAGGCTTTAGAAAAATCAACAGTCATTAAAGA
AACATTGTCAGATGATTCTAAAAAGTTCTGCAACGCAAAAAGTATACTAT
CCATTAATTTTTTTTCATAATGCTTCAAAACTTGGCTCAACCGGTTCCCT
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TAAGTTTAAAAAAATATTGAATCCTTTTCTTGCCTAGTAATAAGAATAAA
GCGTCCGACCGAGGCGAACTCTGGAAAGTTACCATGGGATAGAACTTTTT
TATAAAATTGGAGTACAATGGGTGTTAAAAAATTAGGATACTTTTGATAA
AATTCAGAGGTAAAACCAAATGGCACGGGTGATCTATTAACTTTGGCATT
TGTATATATAGCATCCTGGATTTATTTTTTCGTAAGATGCTGCTCTAAAG
AATCAATATCATTCCCTTAAACTGAAAGCAATTTTTCAGGTGCATATCTC
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ACTGTCAATACAGAGAATCCAGGAACGACGATCGAGAGAAACAAGGAAAA
GGCGTGAAGGAATAATACTAGGGTAGATTTAATAGTAACACATGACGTAT
ATTTTATTTACACATAATATAAATTACTACTCTACATACACAAGTGATGT
CAGGCTATTTATACCATAAGAGTAGAACATAGTACTTTAAATATAGATCA
TATTTAATAATAATAAGGATAAGATGAGCGCAGAAGAACTCAGTGTACAT
ACACTACTTCCCATCATTTCAGCACCTTGCACAAGTAGAGGTTTTACTGC
AATCAAAGCATTTGTTAATTTGAGTAAAATATTACTTGATTTCTTGGGAG
ATGTACATATTCTGGATCGTCAGATATTTCACCAGTCGATGTAAACAGAG
ATGGATTTTTCTTTTTGTTCTTTATTTTATCTGCCTCGAGACATCGTAGC
CGTGAATGAGATTCCATTTTGAATTTGCTTCTATTTAAAAGGTGTGTTTC
TCTAAAAAGTTGGTTTGCTATATATCTTCTTTCTATCGGACTTTATTCAC
TCCTCGTAATTTCTTCGAGTCTAGCTATATCTCACCCGGCTTTTCCAACT
TTCATAGCTCCCTTTCTTCATAATAGGTTTTTGATTTTTAAGGGCATGCC
TTGAAATAGAGTAAATATGCTCGTGTGTGCATCAATGGAGTTATATGTCC
TCTGGATAACAGAAACAACTTCCTCATCTGTCTCGGGGTTATTTAGCAAT
GTGGAGTTGAGTTTCCATTGTCGTCTATTTCTCATTTCTCATAGTTTTGG
ATATATTTGTAAGCTAATGCCTTTATGATCTGATAACTGTGTGTCAAAAA
AATTGTAAGAAAAAATTGATTCCTTAATTTGAAACCCCTTAATCAAGAAC
AAATCAATCCAAAAAAGATATTTTCCTAGAATGCTTGTCTTTTGAATAGA
AGGTATGAGCAAAATCGTTTTATAAATGTATTATGTTCCTAATATCAACG
AAACCAAATGATAAATAATATGACAATGAAAGATCGTGCTCCTTTTAGAA
ATTGCAAGTTGCAACCTGATCAGGATCTTTTACTTTCCAAAGCTGTTAAA
GTTATTCTTTATCTGTATATTATGTGTGTGCATGTCTTCTTTATGGGTGC
CCACACCATTGGGCATAAGAGGCTGAAATTTTGCATGGGTGCCTCTTTTG
AACCTGTTCAGGTTAAGATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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