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Associated RNAi Experiments
Homology
BLAST of EMLSAG00000004556 vs. L. salmonis peptides
Match: EMLSAP00000004556 (pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s238:322440:336261:-1 gene:EMLSAG00000004556 transcript:EMLSAT00000004556 description:"snap_masked-LSalAtl2s238-processed-gene-3.6") HSP 1 Score: 157.147 bits (396), Expect = 3.675e-51 Identity = 78/78 (100.00%), Postives = 78/78 (100.00%), Query Frame = 0
Query: 1 MANIDVVLSYTFSTLLSLMFRSSDISSSYSLINLSILLMALDCDDTPKLLGLRKYIIFRTLEKKNPSGRFPHHFIHKR 78
MANIDVVLSYTFSTLLSLMFRSSDISSSYSLINLSILLMALDCDDTPKLLGLRKYIIFRTLEKKNPSGRFPHHFIHKR
Sbjct: 1 MANIDVVLSYTFSTLLSLMFRSSDISSSYSLINLSILLMALDCDDTPKLLGLRKYIIFRTLEKKNPSGRFPHHFIHKR 78
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of EMLSAG00000004556 vs. GO
Analysis Date: 2014-04-02 ( Blast vs. GO)
Total hits: 0
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
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BLAST of EMLSAG00000004556 vs. L. salmonis peptides
Analysis Date: 2014-05-10 ( Blastp vs. self)
Total hits: 1
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
| EMLSAP00000004556 | 3.675e-51 | 100.00 | pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s238:32244... | [more] |
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Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s238 | supercontig | LSalAtl2s238:322440..336261 - |
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Note | Hypothetical protein |
| Logic name | ensemblgenomes |
| Description | snap_masked-LSalAtl2s238-processed-gene-3.6 |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this gene
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at LSalAtl2s238:322440..336261- Legend: mRNA Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAG00000004556-687322 ID=EMLSAG00000004556-687322|Name=EMLSAG00000004556|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=gene|length=13822bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s238:322440..336261- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGCAAATATTGATGTAGTACTATCCTACACTTTTAGTACACTCCTCTC
TCTCATGTTCAGGTAAATCCTGAAGTAGGGGAAATATGATAAAAGTCTTT
CTTTATTTTACTAGAAAAGAAAGGGTGATTATTTTTTTAATTATTATTAT
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AAATACATATTATTACGTATGTGTATATTTATGTCCATTTTTGTCAATAC
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GTGTCTCTTCATTGCTATTCATAAAATTGTATTGTTAAGTACATTTTATT
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GTATTTAAAAAGTAAATCCCATCATTATAATTGATGATAATAATTTAATT
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GTATGTAAGTATTTTTATTTAAAATGTTTAAAAACTAGAGGTTAGAACAT
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TTATGCCGTACATTTTGGGTTGTTATGTCATGTTGAAGAAACATTAAATG
TAGAATAAGTACCACCAAAAGAGTATGTATGTTATATTATATTTAAAAAA
CTGTGTTGATTACTCCAAGTCCAAATACATTCCCATTACCTTTACTGCAA
TTAATATGTACCCTTGTTTATAAGTCCTTGTTTTATCTATGTAATATTGT
CCTTTAAGCATTACATAACAAAATTATACGGATGCTATTGCATAATAAAC
TAAATTGTATAAGCTATAGACAGTTACACAGACGTTAGTTTAAGTCAATA
ATAGATTTATGTCTTTTGTTTGGGCAAAGTAACAAAGGTTAAGAAGAAAT
ATGTAAAACTGGAGATACTACGGGGCTCAATTTTTGTTATTTGATTCTTA
TTTTTATAAAATAAAGTTTATTGGAGCTTGTTATCAATTAAAGAACATTA
AATTTGAATTTGACCTGGGACAAGGAGATACTTATTAAGATATAGGCCTA
GGGAGAGTTTGTATGAGGTTTAAGGAGGCAGGGTTCTTCCTGATCCTCAA
GATTTAGTATATTAACATGTAAGTCTTAGGACAGCAACTTCAACTTAATA
TTTCTCAACGGGTGCATATTTTTTAATGCGTGTTGCATATTATTCACACA
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GCAAAAAAAAAAAAAAAACGCTAGGGTATTCACAACAATTTTTAATGGAA
TTCATCATACAAAGGAGCTCAGAACTCAGAGCTGGATTGAGTTACATATC
TGAAATTTTATTTTTCAGTTTTCTAATAATTGGTTACGAAATTTTATTSA
AATATAGAAAAAAAAAAAATAAAGCGTATATTTTCCGTACAAGGACCTTA
TTAATTATAGAGTTTGCAATTTGTGATTTTATGATAACCCTGTTATAACA
AATTATACAAGTTACAACCAAAAAAAATATTCAAGTTAATAATTAATAAT
ATTTATACAAATTACACTACAATGATTGTTTGTTTGGTTGATTAATAGTG
TAATTTTGTACTTTTTTTATGAACACTACTAATTGATAATCATTCTTTGG
CACTTTAGTAAATCCATCTCCTTGTAATAAGCAATATAAGAGAAATTTAA
TAGATCATCCTGAAATAATGAAAAACCGTAGCTCAAACAACCACGGGATC
GGAATAAATTATTCTCTTCAAATAAGATGATCAATGACGAAAAACCAGTT
TAGAATGGGCATGTTAAATAAAAAAAAAATCAACATGGTAACCCTGAGAA
AGAATTATACTCATGAAGTTTTATTAGATCGGCTAAAATCATCTGTGACA
AGGGAAAAGGGAGAAAATGATATAAACACCCAATTCTACTCTGAGTCCAA
CAAAGAATTATAATTATAACTCTCCAACATAGCCTCAGGGTTACACTCCG
TCTTTTATGACCCACAAGGACGTTCAAACAGGTTTTGAATATAATTGAAT
CTATTTAGAACAGGATGGTTATTACTCAGGAATTAAATAATAATGACAAC
TTCTAAGGATAAGAAAATTCCTTCTTTATGCAACCAATTACAAATTTACT
GTCCAGCTAAAAAACATACCGGATTTACACCATTCCTTTGAATTAAAATC
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TCTTTCATTTCATAACTATTATATTAATAGAAAAATAACCCCAAGGGCTC
AAACATCAAATCTGCAACCTCTTTGGGCCGCCCTGGAACCAAATGTTGTC
GTCAAATATATATATATATACATATTTAATCCTGCAGAATCTACAGCCAA
AGCACATGTATTCAATCTAATTTTGTCACAATGAATGAACTACACTCGGA
GCTGCCGGATATTTAGTACACGGAGGAGGCACGAAGATGCTTCGTAGTTA
TGTGTTTAATTTAAAAGAAAGGACAATTCAGCAACCATGACATATGTAAT
ACCTCTTAGCTCACAATGTGTTACATCCAAGAAACCAGGAAAAAACTGGA
GGATTCGAASAACCTCCGGAGGGAGTTCGTGGAGGTCACAGAAGGACTCC
AGGAAGGTCAGGGAGACTGACTTAATGGAGAAGGTGCGCACTGTCATTGA
TCGGTCCCCAATGAGGTCATTTGTCTCAATCGGGGAGGAACTTGAAGTAT
GTGATATAATAGTTTGGGTATATGTTAAAGATGATCTCAAGTGCCAGTCT
TTGAGGCCCCCTACCAACCCCGAAATTAATCTTATGGACCATTTTGTCTG
GGGCTACCTTGAAGTACACATTAATGGAAGTCCCAACACAACTAAGGCAA
GTCTGATGGACACTATCAAGGAGGATGTTGCATCCCTGCCCAAGGACTTC
GTCATCAATGCCTGCTACCGCTTCAAAGACTGTATAGAGATAATAATCGA
GGCTGACGGGCAATTATATCGAGTAGGCCTCAAGAAACATGACCAACAAT
AAATGTATATTTTGTTTGAAATAAAAATATAAAACTTACGGATATTATAC
TATACCTACAAGAGAGGGTGTAGATTTCATCTTCGATTTCTGTATATTAA
AGGGGAAAAAAGAATGAACGTTTCATGTATGAAGAATTAAAATTAATTTT
TCACATGTAAACTATGTAAAATTCAACAATCATGTATTTTATATAAATGT
AAGTGGTTAAATTTAAATGAATTTAACACATAAATATAGAAATGATATAA
TATATTGTACAATGTACGTTGTATAGGATAAAAGTGCATAACAAAACTTT
GATCATAGTTTTATTTTTTTTATTTTTTTATTTGTCAGAAGATTTCCCCA
TCATTTCATACACAAACGTTAA back to top
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