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Associated RNAi Experiments
Homology
BLAST of EMLSAG00000004694 vs. L. salmonis peptides
Match: EMLSAP00000004694 (pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s246:299731:327286:-1 gene:EMLSAG00000004694 transcript:EMLSAT00000004694 description:"maker-LSalAtl2s246-augustus-gene-3.6") HSP 1 Score: 582.793 bits (1501), Expect = 0.000e+0 Identity = 291/291 (100.00%), Postives = 291/291 (100.00%), Query Frame = 0
Query: 1 MSRQRSFTYMIEPSRRHRRNLDLSSLSTPKKIINSTIPENRIKEDLEEELSKIKSFRSPSLKPMAQSFFRIRRRPILKTQFSSIEETEEENDSDVFVYIRLVCLEDLSDCTFETRDVVFPINRVYRFGKPEKEDYLRFDSSSDSEAFATIKRANSASSTTYKIGLDCNFISKEHAELWYDENKQILCTGFPSVGSDLSLDEVRVDSGKNGEEILRRNSCATTNDNKEREDEEGSIERRIMIRSGDVVTLVSSENNGDASSKXSVSFRLYYRTGDXSYRDTWSNIAAKSEXD 291
MSRQRSFTYMIEPSRRHRRNLDLSSLSTPKKIINSTIPENRIKEDLEEELSKIKSFRSPSLKPMAQSFFRIRRRPILKTQFSSIEETEEENDSDVFVYIRLVCLEDLSDCTFETRDVVFPINRVYRFGKPEKEDYLRFDSSSDSEAFATIKRANSASSTTYKIGLDCNFISKEHAELWYDENKQILCTGFPSVGSDLSLDEVRVDSGKNGEEILRRNSCATTNDNKEREDEEGSIERRIMIRSGDVVTLVSSENNGDASSKXSVSFRLYYRTGDXSYRDTWSNIAAKSEXD
Sbjct: 1 MSRQRSFTYMIEPSRRHRRNLDLSSLSTPKKIINSTIPENRIKEDLEEELSKIKSFRSPSLKPMAQSFFRIRRRPILKTQFSSIEETEEENDSDVFVYIRLVCLEDLSDCTFETRDVVFPINRVYRFGKPEKEDYLRFDSSSDSEAFATIKRANSASSTTYKIGLDCNFISKEHAELWYDENKQILCTGFPSVGSDLSLDEVRVDSGKNGEEILRRNSCATTNDNKEREDEEGSIERRIMIRSGDVVTLVSSENNGDASSKXSVSFRLYYRTGDXSYRDTWSNIAAKSEXD 291
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of EMLSAG00000004694 vs. GO
Analysis Date: 2014-04-02 ( Blast vs. GO)
Total hits: 0
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
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BLAST of EMLSAG00000004694 vs. L. salmonis peptides
Analysis Date: 2014-05-10 ( Blastp vs. self)
Total hits: 1
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
| EMLSAP00000004694 | 0.000e+0 | 100.00 | pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s246:29973... | [more] |
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Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s246 | supercontig | LSalAtl2s246:299731..327286 - |
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Description | maker-LSalAtl2s246-augustus-gene-3.6 |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
| Note | Hypothetical protein |
Cross References
External references for this gene
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at LSalAtl2s246:299731..327286- Legend: mRNA Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAG00000004694-687460 ID=EMLSAG00000004694-687460|Name=EMLSAG00000004694|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=gene|length=27556bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s246:299731..327286- (Lepeophtheirus salmonis)
ACAATGTCACGTCAACGATCCTTTACATATATGATTGAGCCGAGTCGTCG
TCATCGACGAAACTTGGATCTCTCATCCCTTTCCACGCCAAAGAAGATTA
TCAACTCTACTATTCCAGAGAATAGGATCAAGGAAGACCTTGAGGAAGAA
CTCTCTAAAATCAAATCTTTTCGTTCTCCATCCCTCAAGCCAATGGCGCA
ATCCTTTTTCCGTATTCGTAGACGCCCAATACTGAAAACCCAGTTTTCTA
GTATCGAAGAGACGGAAGAAGAAAATGACTCGGATGTCTTTGTTTATATT
CGTCTCGTGTGTCTTGAGGATTTGAGTGATTGCACGTTTGAGACACGTGA
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AGAGCACTGATTTGTGTAAACGAAGCAAAAGTATTTAGACCTCTAAAAAA
ATATACAGTATATCTTTGTTTTAGTGAGATAACGCGTTGTGATGAACATA
TGGAGTGTTTTCGCTGACGTCATAAATTGCATCCTAATTTAATGAGACCC
CCATCTTGGGGGCTCAAAGTTGATATTTTTAGGACACAAAATAGACAAAT
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GTGGACATAAGTTGGTGACCATTGCGTAAAGGCTTTTGCTGTCGTCCTTT
AGCTTTTTAATCTTGGTAATGACTCTTGGAGCAAGGGACGATGTGGGAGA
TCTCCTCATAATTCATTCCAACGTCAAGAAGCGCTAACACACAAGGGTCT
ACACTGGAGTATATTAAGGGGGGAGCAGCTTGGTTTTTAAAATATTTTGG
AAAAAAAAAAATACAAAATGTATAGCTATTCACAAAAAATTCCAAAAATT
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AAGATAATCAAATATTAATTTTTTTGGAAAAAGTTTCAAATAGTAAACTT
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TTGTACAAAAATTTCAAAAATTAATAGCATTCCACAAAAAAAATTCAATT
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TTTTCATGTAAAAATTTTTTATCTCGAACAAAAAAAAAATCAAGTAAAAA
GTAAACATTCCTTAATTAGGGGGGAGGGGGCTTCATCCCTTCCAGGAGAG
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TGTCTTTCACACTTCGCTGGGACACGCTGTACAGCATAGGTTTTTATTTT
GTGTGTGTGTGGTGGGTAGGAAGTATACCACATGGATGTGTAGAAGATGC
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GTGCATCAAATGTCCTTAGTTACGAGCTTTCTTTTTCTTCAACTGTTCTT
TTTGCTCAATATATATAGGTACAACAATACTTTTTCTTGGTTCATTCATG
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GTCTTTTCAGGAGCAAAATGATGGGTGAGTTTCTTTGGTTATGTTATTAT
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TGATTTTGTGTTGACGCAACTAACCTTTTTTTAGAAAAGGAAGATTTGAC
GAATAACTTTACTTTTAAATTAAAAAAAAAGAATTTGACAGCAATAACTA
TTGTTGATTTCAAAACTGTGACATTTAAAAATAACACAAAACTTTTTTTT
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AAGACATATCGTGGATTGATAGTTATCGTTAATAATAAAGTAATTCATTG
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AATAAGACGTCATAAAAGCTAAAATGCACTCCTTCAAATTTTATTTTTAC
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TTTCTTATATGTAATTGAGTTAAATTTGTTCTAAAGTTATGGTAAACGAT
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ATAACCTCTTACAGTGACTATATATCTACAAGTTTGATCAAAATTGATTT
GTAACTTTTGCCGTAATCATGGTGACTAACCAACAAGCAAACAGTGTTGC
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GTTCGTAGGATTATTTCTGAGGGGGCTTGTGTTTTGGAATTGTTTTGATA
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AATGTTTAAGGAAAATATTTCAGAACTCCAAATAAGTTGACAAAAAAATT
AATATTTTGAAAAGAAATGTCAAATATTTTCTTTTTTTGAATTTTTTTTT
TGGAAAGTACATGCCTATTCACAGGAAATTATATGTTTTGGAAATAAAAT
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TTTCAAAAATCCATAGTTATTTACAGAAAATTAAATTTTTTGAAGAAAAA
TTTCAAAAATCCATAGTTGTTTACAGAAAATTAAATTTTTTGAAGAAAAA
TTTCAAAAATCCATATATATATTACCCGAAATCATATTTTTTGGAGAAAA
ATTTCAAAASYCCATAGCTATTTATAGGAAATTAAATTTTTTGAAGAAAA
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NNNNNNNNNNTCAAAAGTCCATAGGTAGTCAAAGAAAATTTAATTTTTTG
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AATATGGCTAMGACGKATTAAAAARACAGACACGTTATGTTTTKATTAAA
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CAAATAAAGAGTCTTAAAGATTAGTTGGGACTGAATTGAACTGCTTCTAG
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CTAAATGGGATTTCATTGCTGAGATCTTGAGTCTTCTTGGCCGTGTGTGC
AGGAACAGAGTCTTGCTGAAGCACGAACTGGGTTCCATTAACATCTTTAA
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GCTCCCCAGGACGTCGGAGGTCATAGTGGATCACATAAACTTGGTGTTGA
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CTGTTAATTTTAATTACTTAAAAGGGGTTACCATTATTGCTGATTTTTGA
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GTCAATCTTGTGGGCCAGAATACTTCTTTCAAGTGAAAGGGGGTCTCGTA
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GTCCGCAGGGTCATATGTTTGGGGGGAAAATTGATAAATTAACTTCTCTG
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ATTTTTAATATAAAATTTTTGTGAAAAAGATTTCAAATATTAAATTTTTC
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AAAAATTCAAAATATTAAATTTTCTAGTCAGAATTAAAAATTGCTTATTT
GGGGGGGGGGGGGCTACAGACTTTCCAGCCCTCTCCCTGTGGACATCCCT
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GCTAGAAAATACTTAGAATTTACAACTCTAATCCTTTTATTAAAAGTAAT
TTTATTTTATCCATTCTGCAGGTACAATAAATTGTTCATACAAATCTAGA
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TCAAAATGAACAATAGGATTTGAACTAAGCATAAATATTAGTGGTGGGCC
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AATAATGTGACCGGTAATTTTGCAAATAACATTTTTACAGCTCTGGTAAC
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TTTATATCATAGGTTCGAACATAGACTGTCAGTCTTATTGCCGTATATAA
GCTATAAATCAGAAGAGAAATGGAAAATAGTGAAGAAAGATGTGAATTGT
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ATTTTTGGCTACTTTAAGTACAATTTGCGGCACACACAAAGGATTAATAA
GAATTATTACTTAATAGAAATTGACAGTAATTTACACTCAGTTTTATGAA
AAGTCATTCCAGCTCACTTTTGTATTGACGGGGCTCATATAGTAGGAATA
GTGTTTATAAGGAAGAAAGAGTTACGGATCCGGATCATGAGTCTATTGTA
AAAGGACGTATTGACTAGTGGCATTTTAATCATTGGTATCATTTTAGTCA
AGGCTTGAAGAAATGTTTTAGCAGAATGCTTTCGCGTGGCCCTTCTCCAG
TCCTGACCTCAACCCTCTAGACATTGCAGTTTGGGATGTCTTCGAGAGGA
ATGTTTGCTACACCTCTCCTCCAGATTTGAATACGCTCCGAGCTGCTATC
ATGGTTGTGTGCTACGCTATGGATGCAACTTTCATCATCAAGASCTGCCA
ATCGATTTGTCGGTGTGTCGAGACTGTTATTGCTTGTGAAGGAGGTCATA
TTCAAAAAAATATATAGCTAAATAAAGTATTTAGATATTTTACAAATTGG
TTTCGAGTTGTCTTTTCTTAATTTCATAAAAATCACTTTGTCCGTCATTT
AGTCATGCACTGCAAGTTTTGGGAAGTTTTAAGAAATCAAATCATGCATT
TACTCTAATAATGTTATTTAACTTTTGTATCTATTCCTTATTTTGAGAAG
AAACAGTTGTTCATGTAATATGTAAATGGATCTAGTAACTCATCGCATGA
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TAGGTGAGCCCACGTTACTGTTAACATTGCTATCATCAGAATAAGTTGCT
TGCAATGTGCAGGTACTGCCCTTCCACCTGGACTGGCTAMAWTAGTCACC
MCAAGTAAAAWAGTTTTCTAAAAATTCGGATTCCCACTACGCGGGGGKCT
AACGTCGAAAAATTTACCCTAATATACTATTTAAACAATTCACGGATTGG
TTTTGAGTTGTCTTTTTCGATTCCATATTTTGTAATTTAATCATAATAAT
ACAAGTTTTGAGTCCCCACTCAGTAAATATGTAAAATCCACATAGTTTCT
TTATTTTCCTTCCTCATCAGATTTTTTTTTCCAAGGGTCTTACCTAAGTA
CCATGTATGTATGTACAGAGCCGTGTGAGTTATGTATCCTTTTATAGAAA
TATTATGATGTGAAACACAAAATGTGTGTCCCCCACAGAGAGAAATTGCT
CTGGGGGGATGTTTTACATCATTTACACATGATGTTGATATACATTTACT
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CAATAATTAATGAAGGTTGAGTAATTGAAATGAATTCATACTTCGATATA
TTAAAGTATAAACAATTAGTTACAAAATAAAACTGAGCTCTCTAGCTTAC
GTACAAGTCGAGAAAATGGTTTTTGAACATGATCGATGAATTTTCATTTG
CACACTCCGAGCCGTTGTGCGGCTGCAGGACCACCTTCTACGCTGTCAGC
AAGTCCGAAACGTTGGAAAGGAAGAAGGGCTCTGTCAAAAATACCACACT
GGGCTCGGGGAAGTTAAAGAAAACAGCCCAGGTCAATCCCTTGAAGTCCA
TGAAGGCCCATGCAAAAGCTCTCGAAATTTCACTACAGATTATCCAGAGA
GATTTTAAAAAAGGGGGGGAAAGAGCCTTGTGAGGATGGAGAGGCACTTT
TGATACCAGTAATCAAAAAAACCTATCGCCTCAGTAGCAAGACTAATTGC
AATGAGTTTTGAATAAGTCTTTTGAGTTCCTTTGCAATACTTTTTGACAT
TTTATGCCCCCTTACTGCACCTTTTGGATGCATATCTAAGTGTAGGCCTG
TAGTGTGTGTCATCCCAACATCAAGGCCCTCAAAGCCACTTTTAGCCAGC
CCTGGGTCGTCATGACAGAGGATTAAATCTATTTATAGTATTAATTTTGT
CCAAATTCTATTGTTAATTAATAAAGTATACATGTATCTTGTTAATGTTT
AAAATTCAAAGTGTTCACATTTTAATGGACCCCTCGTTATATTAGACTGT
TCTTTTTTTGATTTAATATTTTTATTCCTCTGCACAAAAACCTTTTCTGA
TGGAAAAACAACCAAAAACTAACGTTGACTAAGTTACAGGCCTCTCAAAT
CATTTTTGCCGTGGTATGGGTCATTATACCATGGAAATAATTGTATTTTT
GGTCAAAATTAGTATGTGTTTGATCTCTTGTACCAACATGTAAAATGGTG
CCATGTAGTTTTTCCTTAAACTATTTAGCTTCAGTACATTTTGCCTTAAA
ACAATTTTGCCTCAAGGATATATATATAAATGAGATTTATAGATAGTTAT
AGCTTATTTTTTGGTTGAAACTGATGCTCTCTTTGAATTTTCTTAATAAA
AATATAGAATATTTGTTACTAAAAAATGCATAAATTTTTTGTTTTCTGTT
GAAATAATGATGGAATTAAGATTTTGTCTCATTTCACCCATTCCCTGCGT
TTTATAGTAGTATACATTACATATTTTGATTAAAAATTCCAAAAGAACAG
AAAGACATTTATTTATATATTAAGTCGAAATATCCTTAAGACTAAATAGT
TACATGCAAAATTGTCAAAATATGGTGCTTATGAGTTGTATTGTGTCAGT
CCAGTCCTGTCTTTAAAACCGTTGATCCTTAGGATTGTCGGTAAAAGAAC
TGATTAAAAGAAAAATAAGAATGAGAAAATGTATATTAATTTTACTTCGC
ATCGATCAAGGACAGTTTGGCCTACTTTCATTGTGCAATTTGAGACATAC
ACTAATGTTGATTAAGAACTAGAGTAGGTTTGCCTGGTGTTGCCCCCGGA
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TTGTATGTTGGTGTTAGTATGAATTTTTCATGGTTTTTAAAATAAGTAGA
TGGAGTAGATTTGTCCAGTGTTGCCTGGGACATAAAGATTTAAAAGTTAA
TCTGAACTTTTCTATTTTTTTTTTTTTTAAGTAGAATAAGAAATGTTCAA
GTTGAACTTTTGTTTGCTCATCTTTCATGTTATTGTCTAAAATCCTTTGT
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CCTCGAAGGCTACAAAATATGTAATTCACACTTAATTTGAAGAAAAAATA
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GTTTATGCTAGTGTAAAGAGGATGAAGTTAAAAAAAATTGTTTTCACTAT
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CACCAAGGCGTATTATTCTATAGCTCACATTTCCTTAAAATGAATCTTAC
TCATACTTGAGTCAGTATTAAAATAAATCCGTGTTTATTATGTGGTTTGT
CATCATCTAGTAATCTAATTATTATTATTTTGGATAAGTGAGGAGTCATG
GGGTGAGTCCCGCCTTTTTTTTTTTAAATCCTTTGTGGATTATGTTATTA
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ATAAATAAACAATGCTTATACTCTTTTGAGCTATCGTTAGACTTAGAATT
TTTGAGCAATTTTTTTTTTTGCTTTTTTGGTAAAGTTATAAAAAAAGAGC
TCTCAAATTTGGAAGAATGAGTACCCAAAATATCAGAATTGAGCAATTTG
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