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Associated RNAi Experiments
Homology
BLAST of EMLSAG00000010344 vs. L. salmonis peptides
Match: EMLSAP00000010344 (pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s685:281092:291372:-1 gene:EMLSAG00000010344 transcript:EMLSAT00000010344 description:"snap_masked-LSalAtl2s685-processed-gene-2.17") HSP 1 Score: 473.396 bits (1217), Expect = 5.998e-171 Identity = 231/231 (100.00%), Postives = 231/231 (100.00%), Query Frame = 0
Query: 1 MFLEQDVSQIQVQISHAIDGGYQKEFRETYGQKAKMPRLERCEVNKNEAARLSNFFSNYESKAIDYDILDKITTANLKANERKRTESFKEAYENIFNPQTTNPCMSIRNSVSNQDKFIATGSPHRLKKVDIPLMAFEVPEKKSPPPVQTDNTYVNLNELDESTDTYAAFDKLLLDMSKETEILDTNYMNISTRESLPLPPPPEYSEYSLIENDSDEEMPPPLPNNVMVPNL 231
MFLEQDVSQIQVQISHAIDGGYQKEFRETYGQKAKMPRLERCEVNKNEAARLSNFFSNYESKAIDYDILDKITTANLKANERKRTESFKEAYENIFNPQTTNPCMSIRNSVSNQDKFIATGSPHRLKKVDIPLMAFEVPEKKSPPPVQTDNTYVNLNELDESTDTYAAFDKLLLDMSKETEILDTNYMNISTRESLPLPPPPEYSEYSLIENDSDEEMPPPLPNNVMVPNL
Sbjct: 1 MFLEQDVSQIQVQISHAIDGGYQKEFRETYGQKAKMPRLERCEVNKNEAARLSNFFSNYESKAIDYDILDKITTANLKANERKRTESFKEAYENIFNPQTTNPCMSIRNSVSNQDKFIATGSPHRLKKVDIPLMAFEVPEKKSPPPVQTDNTYVNLNELDESTDTYAAFDKLLLDMSKETEILDTNYMNISTRESLPLPPPPEYSEYSLIENDSDEEMPPPLPNNVMVPNL 231
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of EMLSAG00000010344 vs. GO
Analysis Date: 2014-04-02 ( Blast vs. GO)
Total hits: 0
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
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BLAST of EMLSAG00000010344 vs. L. salmonis peptides
Analysis Date: 2014-05-10 ( Blastp vs. self)
Total hits: 1
| Match Name | E-value | Identity | Description | |
|---|
| EMLSAP00000010344 | 5.998e-171 | 100.00 | pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s685:28109... | [more] |
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Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s685 | supercontig | LSalAtl2s685:281092..291372 - |
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Description | snap_masked-LSalAtl2s685-processed-gene-2.17 |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
| Note | Hypothetical protein |
Cross References
External references for this gene
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at LSalAtl2s685:281092..291372- Legend: mRNA Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAG00000010344-693110 ID=EMLSAG00000010344-693110|Name=EMLSAG00000010344|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=gene|length=10281bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s685:281092..291372- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGAAGATTTACTCGAGTCCAAAAATGAGCTACTAAAGTTAGCCCAAGG
CTGTACTTCAAACTATAAACACAACGTAGATGGATCCTCTTTTGTCTATG
GGGATGCAAATAGGAAAATATCTCTTACTGAGGAGACCGAGATTTTACCC
TCTGTCATTGGATCGGAAAATATTAAGTTGACTGCCGACTGCATGATCAA
GTTCGTAGATTGCTTTTAATTATGCTTGTTATTATACTTTATACCTTTGG
TACTTTCGGGAACACTTTGCTCTAATTCAATTAGAAAGAGGGGGCGTATA
GGAAGTGTTGTGTCAGTGCTTATTTATTGGGTCCAGTCCAATCCAGTATT
AAAATCGGTCCTTGGAACTGGTCTTTAGGACTGTCAGTACTAGAACAATT
TAAAAAAAAAATAATAATAAACTTAAGTGACGATTAAAGGACGGAAATTT
ATAAGTTTTTAGAGCTGATATGCAGGACTGAACTAAACCGAACCGAAAAT
TATCTTTACGGGACTAAAATGAACTAAACCGGACCGAAACTAAACTAGAC
GGGACTGAAGTATTATGTTTTAAATAAGGACCGACACAACACTATGTATA
ATTAGATTGATGACCATAATGTGATTTCCAAAAAAGAGGTCATTTGACCC
AAATCAGTGTTGGTTATTTTGAAAATGGTAAAATTTAGGAACAAAATATT
TATAAACTTTAATTCGTATTGATTATCTTGACCATTTTTCAAAATAAAAA
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AGGGCAATTTTTTGAAAGTCTTACAAAAAATTTCACATCCTTAAAAAATA
AAGGCAAATATTTGTGTGTTTGAGGTACACCCCGGAATACTCCATACTTC
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GTTTTTGGATACTTAAGTAACTAATTAATTTTGAAACTTCTTATTTTAAG
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AGTATTGACTAACAAGCAATGTGATATGAATTTAAAAAGAAACCTCCAAT
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CTTCATGAGAATTCTTCATTCTCATGAATTTCAATGAAGTTGATTGCAAA
AAAAAAAAAAAAACAAGAAGAAAAAGTTGACTTTATGCAGATTTCTTCCT
TCATGTTTCTTCTATGCGAAATATTTTATGTATTAAAATACGTTGACCAT
GAACGTATTTTTCTTATATCCGGATTTAACGGTATTTGTAACGGGGCATG
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TTGATGATCGTTACCTGTATCGTATTTCGAGACTTTTTAATTCAAAAAGA
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TGGAATATTATATTTGATCATTGTTCTGAATTGTTTAAATCTTAACAAGA
GCAAAATTGACCAATCAACAGCATTCAGTACATTGATAAGGGAAAAGATG
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CATATGAAAATAAACGGAAAAAGACCGAAAATCAGTTTGTAAATGGACAA
TCGTCCAAACTATAATTTTTTAGTATCTTTATTCATATCATGTATGTCAT
ATCATGTATATATACAAAACATGAAATAATATGATAAGAATGTCTAGAAT
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AAGCTATAGAATTTACCCATTCCTCGTCATTTGAAAATGATTTCTTCTAA
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TTATTTTTCAGCACTCCATATAAAGATTGTCGTAAGCTATTCAATACTAT
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TTATTTTAAACCTGAGGGGTCTGGATGATAATAATGTTAATATAATTACG
GCAATAATTATATTCGGCGTGTCATTAAAAAATAAAGAAAGTACTTCTAA
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TGATACATTGCAAAAATACTCAAACTTTTTAGAAAGAGAAAAAACAAAAC
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ATATATATTGTTAAAAAACTTTTGACAATTCTTATAGGGGTCGCAGAAAA
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GGTTCACGTCATGAAGAGTAATTGTTGTACCATATTCTGGCTCCATTATT
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GAGACAAATCGAATCGTTGGAATGATTTTTCCTTACTTGTACAATGTACC
TTCTACATGTAGAAATAATCCATTTATACTTATTTAAAAAAACATATATA
GCGTAATGAAACATAAAAATATAGTTCATTATGTTTTTAATAAGATTAAA
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TTTTAAATGTTCAAAGAAATTTAATCTTACACATTATATTTGCTTCTTGT
GGAAATGAGTAGAATCCCAAATGAAATCCCCATTTAATTTAGTCAATCTG
GAATAGAGTCTTTCTTTTTTTTGGAGGGATGTGGAGATTTTGATACATGG
AGACATCTGTGGGCCGTCATCATTAAAACAAATAATAATGATTTTCGCCA
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GGGATGTACCCTGACTGTTTTAGTGATGCCGACAAAAAAGTACGTATTTC
CACTCTGATTTTAAAGAAATGAATTAAAAAAATGACATTTCATGTATTTG
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ATTTTAGATAAATAATTAGGCATATAAAAGGAACTGTAAAAATCTGTTTC
AAGGACCCTTTGTCAATAAATAGTCTACCGGGGCCAGGGAGACTGCAGAG
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GGGAAGGAACAAGCATCAGTATCATGGATCGTTTTCGAAAAAGAAACGTC
CTACAAGAACTAGGCATGAGTGAGTGTGAAATGGAGTCTCAGCCTACTTG
ATGTGAGCTCTTCTGGTCTTATTCTTGGTCTCTAGTGTTATTTGGACGGT
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CTATGTACCCTGACTGAATTTTTTTTGATAAACACTGGTCTAAGACGTGA
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TTTTATAAATATATAACTTCAATATTCAAATTCCCTTATTAAATAGACAT
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TGTTTCTTCTTTTTTTTTTAAACTAACTTGTCCAACTAGGCATTTAGTAA
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TTTACCCTAGACCCGCTCACACTAAAACCGGCCTTGGTTATTAATCATCA
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AATGTCACAAAGTGCTTGGATTTGACAATTGTTATTTATAAGAATACTAA
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AATACATATTAACACAACTATGATGACACGGAATCCAGAAATGCATAAAT
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ATCTTCACTACCAATTGAACTTAATCGGCCCTGGAGGTCAGAATCTACTC
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GTTGCAAATATCAATATCAATCCCAACATTCCTATCTGTATTGGTGCATT
CAAGCGAGGGTATCTTTTGAAGAAGCCTATTTATATGGAAATTAAATAGA
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GTAAATACAGGAACACCTTCTGATAATTCTGAACGTCTCATCAAGGGTAT
GTTAATACAATTAGCTGCTGCAACTGCAGCGAATGGTACGAATCTACCAG
CAATTGGAGGAAGAGATTTAACAGCAGCATTGAGTCCAAGAGCTGTAGTA
AGAGCTCCTCCAGTAGCAGCAACATAAGAAGATCCTAGAGTAAAGGAATC
TATGGGTTTACTTCCTGAGCGATTTGTGTAATTAACAACAGCATTGAATG
ACTGATTAGTCCATTGCCAAAATATTGTTTGAGCTGGAGTTTTATAGAAT
GTCATCATTAGACCCGTGATGGTCATGTTCA back to top
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