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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s1004 | supercontig | LSalAtl2s1004:40970..48940 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000014 >EMLSAP00000000014 ID=EMLSAP00000000014|Name=EMLSAP00000000014|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=164bp
MDELESTNSGETNNGEEEEEEGEGEEEEDTGLTFSRELGDGESTSPNNTI
QELPAAIQKKASKSTRNFSDRARRSRSEVRRQQQKTEPLDNRAWSKSPVK
CRYRRPKNFLQTKPIPDLSERLSNSSSTSSFTQSLGELIPYIEGLLNRKL
SGPNLCIKFNNQNN back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1004:40970..48940+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000014-695861 ID=EMLSAT00000000014-695861|Name=EMLSAT00000000014|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7971bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1004:40970..48940+ (Lepeophtheirus salmonis)
GGTTCTTATATCCACTGACTTGTTAAGAATAATTAATACTTCATATTCAT
TACTGTGTTACTACCATTGCATTCTTCTTTTAGATTCGACAGCGTACTTT
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CAAAAAGAAAAGAATATGTTAGAAACTTTGATAGACAACAGTATGCTGAC
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TTTTAGCTGGCCCGTTTTTTTGGAATTTGTATTCTGAAGAATTTTCTCTT
CATTCGCTGTTGTCAATATTATTTACCTCAAGAGTATTGAACTTCCTTTT
CTACGACATTCAGTTATATTCCAAATCTGATTAAACATTTGTGTGTGCAT
ATAAAAGGCAGATAGTAATCTTGAGTATTTGTTGTGGAGTTATAATTGTA
AGTCCCTGTTGGACTCTGATAGAATTGAGGATCGTCATCNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTGGAGTTATAATTGTAAGTCCCTGT
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AGTATATATGTTCACAGTTTGGGAAAAATAATTATGAATATTAATACCTT
GCAGGTTACCAATACATACTTTTTTATACAAGGGTTTTATACGGGCGGTA
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AGGACTGGTATCGGTGGAATGGGAATTATTGAGCCGATTGCGCTACTTCA
AAAATGGTCAATTCTTGTCGTTTCCGATGCATCAGTACACCCCTAATATA
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TGTTACTCACCGTCTTTTTTGACAACACGTACAAGTTATTACTTTATACT
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AAATATATTTTAAAAAACTATTATGATTCTATATTCCTTAAATCCTATTC
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TGCGTATATATACATAGAGGAGTATGTGTTGTACTCATAAATAAGTGATA
ATGTTTTGTCTGTAGTAGTACTAGAGTTGTATAAAATATGTACTAGATAG
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ATGACACACCCTGGCCGTAAACATCTTTGATGATCTAAGGAAATGTCATG
GCAGSTAAGCTGATCGCCTCCCAAAATATTCTGCCAATTGTTAGGATTAA
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TCATTCTTTTCGGTTCCTCAGTCAAAATTCACAGTTCAGGGTCCGGTTAA
TTTTGTAAGAACTGGTTTTTTTAAAAGTATTTATTATATGTAATATAATA
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TTATTTTAATTGTCAGCGAAGAGTAGTTAAATCTATTAGGGATTTATGAT
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TTGCACGTATTCAATAATAAAAGATGCCGGGGAAAAACTTGGTAATCCAG
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TATTAGATCAGCTGTCTGCAACCCTAAGAGAAATGAAATACACACTAATC
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AAAATCCTCGTTGTAAGTCTTTGTCTTTTATGATCAGAAACACTAGTTAA
TACTTTATCCTTATATGTTCTGTCTTAAAGAATTAAATGACAAATATAAA
ACTCAGTTCAGATTCCCAACTACAAGAGGTTTCTCCTTCTTTCTGAGACA
TATTTTGTACACATCCTGATTTGTAAGTTGGGATATACTAGTTTTGCATT
TCAGTCTAGAACCCCTTCACTGATTCGAGACATTTATGGTTTTTAGATGA
TCATAACAATTCTTTCCTTGAAATAAATTCGGTTTGATCCGGTCTCGAAG
AAAAATTCGATTCCAATCGGTTTTACACAAAATCGGATTGATTCAATCTC
GTTTAGAATTCGGTCTAGACTGATGCTATATATGAATTGTCGATGAAGTC
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TATTTATAGAACTCATTCATCAGGAATGAGCAAAAAATCCTTCTAGGGTT
GGAGAACGATTAAATGTTGATCTAAGGTCTGAGATTGCAGTTTGTATCAA
AATATCAGTTCAGATGGGTATAAAAATATTTTAAGATTGAACCGGAAAAA
AGTTTGGTTTTGGACCAAGTCTCAACACTAGTTTTTTCTTAGAATAGTTA
GGTATGTACTTTGCATGATCCAAATTTATTGTTGGCGTGCTTCAAATAAA
AAGCAAAAAATTATTAATAACCAATTTGGAAGTCAATATCATATCATAAA
CGGATTTATTAATATTTGAAGTTTTTTAAAATCATTAATTGAAAAAAGAA
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TGATAAAATATATATGTATTAGTTATTACTCAACAAACAATTTAGAAAGC
ACTACACATTAAGGAAAATTTCTTAATGCAAAAAAAAAAAAGTAATAAAA
TATATAATTTAATCCTTAGATAATTATTATTGGGGCCATGAAAGTAAGGG
CCTGTACCACTTTAAACTACTTACGGGAAAATAAGCTATAATTAAGGTAG
GGAATTTTGTTCAGAAAAAGTTGAATTACAGGAAATAAAAAATGTTAATA
TCTCTTATGAATAAAAATTGTAGTATATTGTTCTTGCATTAGGTTTGGAT
CACAGTACCCTAATTGTAAAGGGGATTATTCTCAGTGATGCATACAAGGT
ATGTAAAAATAAAAGAAACCAAAAATGAAATCAGCTTAGATTTTATGACG
TTATAGTAGATCAATGGTTGTATTGTCTAAAACAAAAAGCTCAAGGAATG
AAATAGAGGAACAATAATTGTTGTTAAAAATGACTATGAAAATAGTAGCC
ATCAAGGCAGTTAGTTAGGCAACTTCGAGCCCACTAAATGAAATAAAATA
GTATGAAATAAGCGCTATTTGAAATAATGCACAAAAAAATTGTGTAATTT
TCAAACACATAAAATATTTCACAATTTTTTTAAAATATAAAAACTTTTAA
AGGTCTTTAATACAATTAAATGTACAATAAGTTAGTTTGAAAATCAATTC
ATTATTATTATTGTCAAAAAATGGTGATTCTTCCTAATTTGTACTCAATT
TATGCATTAAATTGAGATATAAGGCGTCGACTAACAGACTAACTTTGTTT
TATTACTATAGAAGATTTTTTTCACTTGATGTGAAGAGCCAATAAATATT
TTAGTCTTTAGAGAACTCACTGGTTGTGCTTTACTTAGGCCCATACGTTG
CTAAACCTAATCTAAAGTCATATTTATTATTTTTTAATGATGTACTTCCT
TTTTTTTTGAAATACGAACTCATTGTTGAAAATGAGTCTTCATCTGACAC
AAACAATCAAATGCTAGAATATAACTATAATACAATTGTACTTCAAATAT
AATTCATCAAATCATCAGTATAGATGACAGATGGTAAGATTGGGTATTTT
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TTAGCACTAGAAGGCGTTTTCACTAACTTCAACAAAATTTGCAATTCTAT
CCCTCATAAAGTTAGAAAACCATTAGTGCTTCTCAGGAAAACACTAGCAG
AGTCCGGATCACTTCACCATGTCGTGAGCGCTCTCTTTCCCATTTTTAGA
AACAATAAGTTTGCTTCCACTTATCCTTAAATTGAGCACAAATTATTAGT
GTTGCTGATTGGGAGCATTTTGGGCATCTGAATAATAAAGAAACCCAAAA
KCAATATGATAACCCGCACAAAATAAAGAATGTTTTGGAGGAGAACAGCT
TAGCTGTCATGACGCTTCATTACATCAGCTACATTCAGCTGAGAAGAGGG
AAGGGGAAGAAGGCAATCAACAAGGACATTGGTAAGAATTACTCCAATTT
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ACTCAAATACTCAAGGCTACTCCCCACCTTTTATGAGCTGACATGCATGT
TCAATACGCTGTTGAATATAATTTAATGGAGCAGAAAATAGTTACATAAT
AATGACAACAGGTCATGAAAAGAAAATTGACTCTTAAGTTTGGAAACTCA
AAAACAAAACAAAAACGGGCGAGCTAAGAAATACACCCGATTTTTATCAT
GACTAAGTATGTTTTTCAATATTTGTTTAGAAAATACATTTTATATGTAA
GAAGCAATGTTTTTTCTCTCATCTTTAATAGTAAGCGCGCTCGCTCTTTT
GCACATGAATCTTAAGTACTGCTCACTAATGCTTCGAGAGTTAATAAAAC
TCTTCATAAAATAATAATAATTTAGATATAGTTTTAAACCTTTTAGTGAG
TTCTTCCAAAATGGACGAACTTGAGAGCACGAATAGTGGTGAAACTAACA
ATGGAGAGGAAGAGGAAGAAGAAGGAGAGGGAGAGGAAGAAGAAGACACT
GGACTTACATTCTCAAGGGAATTAGGAGATGGAGAATCAACTTCTCCAAA
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AAAAAGGCATCCAAATCCACTAGAAATTTTTCAGATCGAGCTCGCCGAAG
CCGGAGTGAAGTTCGTAGACAACAGCAGAAAACAGAGCCATTAGACAATA
GGGCATGGTCAAAGTCTCCAGTTAAGTGTCGCTACAGAAGACCCAAGAAC
TTTTTGCAGACAAAGCCAATTCCAGATTTGAGTGAGAGATTATCCAATTC
TTCAAGTACGAGTTCCTTCACTCAAAGCTTAGGTGAGTTAATACCATATA
TAGAAGGGTTATTGAATCGCAAATTGAGTGGGCCTAATTTATGTATCAAG
TTTAATAATCAGAACAACTAG back to top
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