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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s1009 | supercontig | LSalAtl2s1009:51583..59082 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000050 >EMLSAP00000000050 ID=EMLSAP00000000050|Name=EMLSAP00000000050|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=665bp
MEVKQGVLMFKDQYRATMQYSLPREGRQDQSRSHQDWFCGQCGVQNFRRR
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LQKMGWKEGLGLGKSNQGRTSIIEAGQRNMQAGLGSQGSRVKSDPNDSYK
ECVKKTMYQRYHDLT back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1009:51583..59082+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000050-695897 ID=EMLSAT00000000050-695897|Name=EMLSAT00000000050|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7500bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1009:51583..59082+ (Lepeophtheirus salmonis)
GTCTACCGATTATAAGGTAGTTTGAGTAACATTGCTACATTATAACAGCC
ATTATATGTCAATTCTTATTGGGTTTTTGTATGCAATGACCTGGTCGAAG
GTTACGTAGGTACATACAGAAACATTTATTTATTACATATCAATATTTTC
CTTTCAGGAGTATATAATATCATCATTACTGGGGACCCCTGTCCTGACTT
ATGTCCTTTCTATAGATAAAATACTTATAAATATAGATAATTTCGTACAA
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ATTCTTATGAATTTTTTAAATCTCGAGAGTCTTAGAATTATGAGCATTAA
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AGTTGCTCCACAAACATAAGTATACATGCGTAAGACTCCTTAATTAAAAA
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GGTCCTTATTTAGGACCGTGGTCCGGTCCAGTCCAGTCCCAATTGTCGGT
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CCTCCTTTTAATTATTCTATTATATAATAGAATAAATTATATAACTAATT
AATATTATATCGTATTATATTGTATCATAATGAAAAATATAATATTTTTT
TGTAAGATATGTGCAATAATCTTAATACATATTTCATATATCTTATTTGG
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ATGACTGGKCTTTAGGACTGTCGGTCTCGGGAACACGTTTTTCCTAATAA
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ATATCTTGCAAAAAAAGAAAAAAGTTATTTTCATTGTAGTACAAACATAC
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AAAAATCCCTCTCGTTTTTTACAATCGATAAAAAAACATTATTCAATTCA
TTGTTTTATTTAACCCTTTGTCTTTATAAAAATATATGTATATTATTGAA
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CGATCACGCAGGGTAGCACTCATTTTGCACAAATGAATTCAATGCAAAAA
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ATTCGAATTATGAAATATCTGGGGTTATAGTAATTCATTAATTATTATCG
TTCAGAGTCATTTTTACCCTTTAAAACAATCCCCAAATTAAAAGTAGGAC
TAATAAAACTTGTGTAAAAGGGTTTTTATTGATTCTGTGTCTTGTTCTGA
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TTCTTTAGACCCGTATAGCTTATTCATAATCTTATTTTTAATTTGGGGAT
TGGTTTAAGGGTAAAAAATGACTGAACGATAATAGTCTCGAATTACTATA
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ATTAAAGATTTTTTTTATGTCAACTCACCACATGTTACGAATATAGCTTT
TTTCTATAATTTTTAAAATCCACATTTCGATTTAATATGTCTGAATAACA
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TTATTATTCTTATATAAGCCGTATAACACAAAAATGACTATTAAAACTTT
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TTCAGTGTCGTATTTCGACATGAGAGAATTATATAGATGAGATTCAAAGT
ATTATAAATAAATATTAAAAACAAAATTTTACCAAAAATCAATAAAAATC
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ACTTCAGCCAGGATATAAAGCACTAGAAGAAAAAATAAAAAAAAGATATT
AGCTTCGTAGTAAGGTCCTTGATTTAACTTGATTTTATTGTGGGTATAAG
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AATTTGTTATTTACTTTGATTTTAATTTATATAGTTCTTTTATGTCGAAA
TATTCCATTGAATTGTAGACATACCCTAAAATTTTAATTAAAAAAAGCTT
TAAAGTTTGAAAGTTTTAATGGTAATTTTTGTGTTCTACGGCTTTAATAA
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GTAATATCACATTTAAAAAAATGTGATATGATTAAATTATTGTATACAAT
ACAAATTTACAATTAGTTATTGATCTACAAGCCCATGTTTGAGCTATTTG
TATATTTTAGTTTTCATAATTGTTATCGCATTTTTATAGGACAGAAAATC
TATGTAGATGACTAATCTAAGTATGATACATTTGATGAAAAAAATATTTT
TAAATAGTAAACTAAATTGATATTTTTGTTCAAATGATGCTATGTTTATA
TTCTAAACTCACATTATAANCCCAGGACATTAGTAAGCTATTAATTATTA
TTATTAAAAATGAATTTCACCGCCAACAATAGTTGAATTTTTGTGTGGGC
GACATCCGTTGTACCACCTACTTATCTACAATCATACATGCAAAGAGGAA
ACAGACTTTTTCATGGAAAGGGTCGAGTCTCTCTGTTGCTTTACTATCCC
TATTCTTTTTTTGGTTACAGGGCGTTCTTATGTTCAAAGACCAGTATCGA
GCAACTATGCAATACAGTTTACCACGAGAAGGGCGTCAAGATCAGTCTAG
GTCGCATCAAGATTGGTTTTGTGGTCAGGTACGTCAGATTTTAAAACATG
ATACATCATTCCATCTCATTCATAATTTGTTATTTGTAGTGTGGTGTTCA
AAACTTTCGTCGTCGAGACATTTGTTTTAAGTGTGGAAGTCCTAAAACGG
AGTACGATGTGATGCAGGAAGGAACTGATGAAGTCAGTGTTCATCCTACC
ACATGTAAGTACATTTTGCCGTGTACTTTTGCTTTAAACCATTTGCCCTC
AATGCCATGTTGTCCGAAGGATATTTTGCCTTAATATATAGATAAATGAG
GTTTTCTATTCGAAAAATGATGGAATTATGATCTTGCTTCACATTATGCC
TGTTCATCAATCCATGAGTCTTTTCTAGCATGAATAATCCATCATGTCTA
AATGATAATTAATACTGGAGAAGTGATGAGCACTTCTTCCGTTCGAATCG
TTGAAGTGTTAGTTTATCCTTATTTTTCTAATTGCAAAAATTTTACAAAT
ACCTATTTAGTATCTGATTCATTACATAGTAAAATTTTGAAAATATGTAT
GTATTGAAATTTCGGGACATAATTTTATCAGTATTCCAATAGAAAACAAC
CATTTAATGTGGTTTCGTCTAATACACATTACATATTTTGATTTAAAAAC
TATGGGAACATCAATTTCAACAAAAAAAAAGTATCTAGAGCCCATTTTGT
ATCCCATTATTTTTTATCTGAAATTATTCTGTAATTACATAGGTATACTA
TTACGTGGGTTGGATGCTCTCACTACCGAAGAGTCTGTGACCAATGTTTT
AGCCACACTAACGGCTCTTCCAATTAAATCCGTGCAAATTGCTAGAGATT
CTCTCACCAATATGTCACGAGGATTTGCGTATGTTGAAATGTCATCTCTT
CAGGACGCTATACTTCTCCATAACCTTTTACTCGGAGCACCACCCGTCAT
AGAAGATAAATTGGTTGCTATTTCCTACTATAAGACTCCTGTTAGTACAT
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TCCAATTCTGGAAATACTAGTAGTTCAAGCTTAACTCATAATAGTAATTC
TCAAGTCGCTAATCTTGCTTTGGCTGCAGCTCAATGGAGTCACAAAAATG
AAGAACTGAAAGATTTAGATAAGAATCAAAGTTCAACAAAGCATACCCCA
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ACGGAGGGGATKCCTCGGCTGCCTCTGTAGCTCTTCGTGGAGGAGAAGMA
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AAAATATCGTGAGTTATCCTCATCATATTTGGATAGATATTGTAAATGTT
ATCTACTTTTTTTTTATTGCAGCAAGCCCTGACGTAAGTTCATACCAATA
TGACGAAACTTCTGGTTATTATTATGATCCTGTTTGTGGTCTGTACTATG
ATTCAAACTCGCAATATTACTTTAACTCAAAAACTAATCAGTATCATTAC
TGGGACCCTGACAATCAAATATTCTTACCAGTTTCTTCAGACTCCATGAA
CGACGGAAGTACTAGTAATGGCTCTAAAAAAAAGGAAGATCGTTTCAAGG
ATAAAAATAAAACCGCAAAGAAAATCGCGAAAGATATGGAACGATGGGCA
AAGTCCATGAATCAGCGAAAAGAAGCTGAGAAAGAAAAGGCTGCTGTTGC
CGCCACGGTAACAATACAAAGTAAACCAACTCCGCCAAAACCAACTCCTA
TTCCAGCAAGTACGATAGTGGAATCGAAGTCATCCATGAATGATGTGGCA
TTCACTGCCATGATTCAAAGTAGAACTGTTAAGCCTGAAAATACACTTTC
TGTTACGGGTTTGGCTGGAATATCTAATTACGGATCAGAGGAAGAGMCTG
GGGATGATAATAACGATGATGATCAGCATACTAATTGGGAAACACTCGCA
TGCTTACTCTGTAAAAGGCAGTTTATTTCAAAAGAAAAATTAACAAAGTA
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TAGACACAATCAAATGTCGGATCTGCATAAACAAAACTTAGCCTCCTGGA
AGAGTTCTCGAGGACAATCATCTCAAGCGKCTTCAGCCTCTTTATCCACA
CCTCAATATAGGGATCGTGCTAAGGAACGTAGAGATAAATTTGGAACTCT
TGATGAGGAACCTAGACCAAATAAATTGAAAGAAAAATACTTAAAGGCTA
TAGAACAAGCGGAGACCTCTGGTACTAATGAAACTCCTAACAAAGTGGGA
TCTGACAATATTGGCAACAGAATGTTGCAGAAAATGGGTTGGAAGGAGGG
ACTTGGGCTTGGAAAAAGTAACCAAGGAAGAACGTCAATAATAGAGGTAA
AATAATTCATTTTCTTGTGTCATTCACTTCGGATTTGATTTAACTATTAT
TATTTACATATTTTTTTCAGGCTGGACAAAGAAATATGCAGGCAGGATTG
GGAAGCCAAGGCTCCAGAGTCAAATCAGATCCCAATGATTCATATAAAGA
ATGCGTGAAGAAAACTATGTATCAAAGATACCATGATCTAACATAAGTAG
TTTAGTAGTGTAAAATCTTAGTTTTATTGTGTAATTCTTCGACATATTAA
TCATTCCCTTCATTGGCTCTTACAATTAGTAGTAATGCCTCCTTTTTGTA
ATAGACTATTTTTCTTAAAAAAGTTTAACATATTCATATTTATTCATTCG
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