EMLSAT00000000209, EMLSAT00000000209-696056 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000209
Unique NameEMLSAT00000000209-696056
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s102supercontigLSalAtl2s102:309071..333337 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000209 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000209EMLSAG00000000209-682975Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000000963EMLSAE00000000963-709891Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000964EMLSAE00000000964-709892Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000965EMLSAE00000000965-709893Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000966EMLSAE00000000966-709894Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000967EMLSAE00000000967-709895Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000968EMLSAE00000000968-709896Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto776185auto776185Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000209EMLSAP00000000209Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000209

>EMLSAP00000000209 ID=EMLSAP00000000209|Name=EMLSAP00000000209|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=332bp
MGRVHLPAKVCTYLFLYFEKKWSYLYSIVVLSVSTSECKSTSGATCKFPF
GYKGEMYDQCTNVDFGNAFWCAVSVNKNGDVRGYGICSSDCPRYSNISKN
KYANKSGVACIFPYKYNGKTYEAYTTAGNSGFPWCATSLNVPEGYQVFCC
PTTNGKTCTFPFSWEGVNFDGCTDASNNGVQWCGVTIGSLDNNIKENMDC
SSSCRVAATASNSGCLSTQGLPHILPFIYKGVIYSKCTVQDLGSTFWCAT
SVNTAGNYLSFSTCSRSCPTNQLTSPEIGQAVSSSPEVWMCLPSPGIEKI
PVIVMISARHESKIIADTLKVAELYVKRELID
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mRNA from alignment at LSalAtl2s102:309071..333337+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000209-696056 ID=EMLSAT00000000209-696056|Name=EMLSAT00000000209|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=24267bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s102:309071..333337+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGGGCGTGTACATCTTCCTGCAAAAGTATGTACTTATTTATTCCTGTA TTTTGAGAAAAAATGGAGCTATTTGTATTCCATAGTGGTATTAAGTGTAT CCACTAGTGAATGTAAATCAACAAGCGGGGCTACGTGTAAATTTCCTTTT GGTTACAAAGGGGAAATGTACGATCAATGTACAAATGTTGACTTTGGAAA TGCCTTTTGGTGTGCCGTGTCAGTGAATAAAAATGGTGATGTAAGAGGTT ATGGGATATGCTCTTCTGATTGTCCAAGTAAGTACCAACCTCTGTATGAA GTACTACATTTTGAATTAGACAATTTGCTTATTAATACTCTTTTATAGGA TATTCAAACATATCTAAAAATAGTGAGTATATTTGATAGTTATAGTTTCT TTTTATGAGGAATAATAACCAATTTTTATATTTTAGAATATGCAAATAAA AGTGGAGTGGCCTGTATTTTCCCCTATAAATATAACGGTAAAACATATGA AGCCTATACCACAGCAGGCAACTCAGGATTTCCATGGTGTGCAACATCAT TAAATGTCCCAGAAGGATATCAAGGTTAGGGAATCTGTAAAACAAATAGC CCTGGTAAGAGGTCATTTTAAAGTATAGTCGAGATTGAAACTTTTTGTTT CATTCTAGAAATCTATCAAATTTAATATTTTTAAGCTATAGTGCACATTT TACGCCAAATTTTGACAAATGTCAAACATATATATATATATACATGTAGG TACTAATTAGGTATAAAAATATTGCACCTTTAAAATAAATTTTTTAATTG GTTTTTAAAGATATGGGCGTATAAATTTAGCAAAATTATTTATCTTTTTT TTCAAAAAACAAGCCAAAATTTGAGTAAACTCGCACTTTTACATCAATTA ATCACTCATTTTTTAACCAATTATTATACTCAAAATTCATGAGTAGACCA ATTAAAAAGTACTAACTGTATAAATGTAAATTTTTTGAATATTATTGGAA GTATTTTATATTTATTCATTATCGCTCAAAAATACCTGGCATTCATTTAT AACATACATTTTCCAGCCTAATTTAAGGCATTTAGCTGAGCAAGGTAGAA ATTTTTTTTGTAAACTATAACTTAAAAATATAACTTATTTTTATACTGCT CCACCAAATGACTTAAAGTTATCTTACAAAGCTTGTGTTAGAGATAACTG CAAGTTAATTTTTGACGGGTTATACGACATAATTCATTAAACATCTATAA TATTTGGATTCGTATATTTTTTAATCTACACAAAAAAATTTCAATAAAAA TGGAGCAAGTTATTGAAGTGAGATTCTAGGATAATTTCGTTTTGTTTTTT GAGGAAAATAAATTTAATTTTGGAAACTGAGCTAATGAACGAATGTTTCT TGAACTTTCAGTATTTATATACCTCAGTAGTATCTACGTCCTGTAAAATA ATCAGAGAATAATGAAAAATGTGGTTAATTTCCTTGGTGGTTTTGGCGTG GAATGATACATCTTTCAAACTTATTTATAAAAGTAAGTATACATATACAG AGGCATTGTTAGTTTTCATCATTTTGAGGGAGTTCGCCCCTAAATTATCA TCACTATAATTTAATTACTTTTATAAAAAAGTGTCTTTATATATACACTG GCAAGAAAAAGTTTGTAAAAAAATAGAATTTCACTTATTTTCTAACTACC TATGACTTGATCATCAGGTATTATAGTAACTAGCTTTTGAAATGAAGAAA AATTTAGGTACAATATGGTTATAAACATTTAATTGTAAAAAATCAAAATA TTTTTGTTTAAATTTTAGCTTCATCAAAAATATTCGGTTTGCCGCTATAA CGGCTTTACAGACTTTTGGCATTCTTTCTATTAGTTTTTCAAGATGGGCA GTCGTGATATCATTCCAAGCATTCTTTTAAATGTGCCATAACTCTTTCCT ACAGGTGGGGCACATTTTTTGAAATTTTCTATCTAGGTGTTCCCACAATA GCTCTATTATATTCAAATTGAGGATATTGAGCTGGTCATTGCTTAATAAA TCCGATTTAAGAGGTTTCTTTCTTTTCCAAGAAATTTTTGCAAAGGTCGG GTGTATGTTTAGGGTCCATGTTTTGTTAAAAAACAAACTTCCTTCTATTA ATCTTGCGTCGTCAAGATAAAATGATTACAATTCTGAAAGAATTAACTAC CAATCTAATCATGCCAGAGAGAAACATTACATATGAAATTAAGGCTGGCT AGAACAGCTGGAATTTAACTGACAAATAATAAAAAAATATTTCATGGATC TATTTTTTCCATAATAGTTGTCATTCTTCTAGAGTAAAAAAATATTAATA AAGTCATAGAAATTGATGAAAATGACGAAAAAATATTTTTATTAACTTTT TAATGTCAAGGTATATTAGAAGAGGGTACTCACGTTGCAGAGCTGAATAA AGGGAATAGAGACAAAGAATGAAGGTAGAAAAAAAGAGAGGGATGTGGAA AGAGAAGAGGGGATCAAGAAAAAGGAAGAGACAGAGAGAAAGGAGATATA TTTAGAAATATAAAAGGGTAAGGAGTTTTTATTTTGTTCAAAGACAGTTT CTTAACCTCGGAATTAAAAAAAATATCTTCGGAACATGCTTGATCATTTT ATATGTCTACTTGCAAAAGCTCAGACTGATCTGCTCGACAATTTTTGACT CCATATGTGATAACACCAAAAAAAAAAAAAGAGACTAATAATTCGATATA AATCACGCTGAAAATTCTACAAAAAAAAAAATATCTGTATATGTAAATAT ATTTTGTAAATTTGTGTAGCTTAAAATAAAGCAAAATTGGCATTGATAAC AAATATGCAAATTTGTATAAAGATCACAATTAACTTGAATATTGGTTGTT ATTGTATATTTATAAGGCATTGGGACTTTTATCTGGTTCCTTGTTCATCT TATTCCAATAAATACTAATTACAAATCTTAAAAGTGGATGACAGTCAAAC ACCTTCMCCACCCACTACAACCCCAACAACTACGAAAAGTGTAATAATTG CTTTAAAAAAGTCAGGAAGAAAAACAAATATACTGAAAAATCCTACAACC ACGACAATAAAAACAACTACAACGACATCTAAAACAACAMCCACCACTAC TAAAACAMCAGCCCCTTCCAATTCAATTMCCTTATCTATCGGGGGTAAAC ATACTAATAATGCTACAGCAACAACTATCACAACAACCCCAACAACAGCA AAAGGTAAAATTAGTTTGTCTGCCTTAAATTGGTATCTTTAAATCCATTA ATGAAGGATTTGAAATATGATGTTCTCCGTAGTTTTTTGTTGCCCTACAA CTAATGGAAAAACGTGCACCTTTCCATTTTCCTGGGAGGGCGTCAATTTT GATGGATGTACAGATGCTTCCAACAATGGTGTCCAATGGTGTGGCGTCAC CATTGGTTCCCTAGATAATAATATAAAAGAAAACATGGACTGCTCATCTT CTTGCCGAGGTAGTCTTCTACATTTATTTTCCTGATTAATCCAAACTAAT TGGGATTTTATATTAAGTTGCTGCAACGGCTTCAAATAGTGGATGCCTTT CAACACAAGGACTACCCCACATTTTGCCATTCATTTATAAAGGTGTAATT TATTCCAAATGTACAGTTCAAGATTTGGGAAGTACATTTTGGTGTGCTAC ATCAGTTAATACAGCAGGCAACTACCTAAGCTTCAGTACTTGCAGCAGAT CATGTCCTAGTAAGTAATTTAGTTATTTTAACGTAAACCCATTGGGTTAA 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TGAAAATCCAACATATAATTTACAATGTGAAATACTGACTTTGATCAATA CAAAGCAATTTTTCGAATGTTTGATCCTGTGGTTTATTTAGTGTAATTAC TAACTTGCCATGTTCTTTTTTCAACCATCATGAAGATGGAAGATATATAC TAATATTAAGTACTTCATCCTCTTCCTAGTTCCCTTTTTAATTAATATTT AATATGTTCTCCCTTTTTATGTTAGTGCAATAATTCTTTTGTTAGATTTT TAATTTTGTTGGTGCATTTTCGAATCAACAACCCATTCCAAAAAAAAAAA AAACACTTTGAGACACAGGGAATGGGTCTTGTTTTATTAAAAAAAAACAA TTATTTGTGAAAAATCAAAGTTGTCCTTGAGAAAACAGGAATCTAGGTAG ATCTGAATAAATTTTCTTTCGTCAAATAAAAATACTAAAAAGTGGACTTT GAAAAATGTTCCCAAAACCATGATATCCAGGAAGTATTATGAACTTGATT GATTCAGAATATATTTATTGGAATTGGATTAACTTAATTTAAAAAGTTAA AAGTGTACATATTATATATTTTACTAGTCAAGCTTTATTTGCAGAATATT AATAAAATAAATATAGAAAGCTCTTAACTGTTTCAATTTATTTCAATAAT GTGATTTTTATTTTATTTTTCATCCTCCACAAAAAGAAGAAGAAACTGGT TTTAATTCTATTAATTTGTATAATATACAGACCTTACACCAACTCTTTAC ATAAATAAATTGTTATTCAGCCTGAAACTTTTCAGGCCACGTGTTACATG TGAAAAAAATATTTCTAGAAAAAAAAGCCTACTTTTAGAAATATTTTTCG TCATTAAATTAAAAATCGATAGAAATAAATAAAAAATTATCTAAAATGAT CAGGCCAAAAAAATCAAATTATTTTTTAGTAACCATCATTTGATTTTAAA 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CAAATAAATATCCATGGTTTATTAAGACAAATAAGATATATGAAATATAT ATTAAGATTATTTGCACATATCTTGCAAAAAATATTATTTTTTCATTATA ATACGAACATATTATATTGTTACTTAGTTATATAATTTATTCTTTTATAT AACAGAAAAATTAAAAAGAGGAAAAAACACACTCATTGACGTCACGAGGG ATCAATTTTCTTTTCTTTAAGGACCGAGCAATGGGACTGGATTGGATGGG ATGGGACTGGACTGCAGCCCTAAATATGGACCGTCACAACTCTAGTCACA AATTATAATTTGTACAAAAATTGTAAAAATATGATCTTGCATGGTTGTTT TTTTTCAAAGTTCAAAACTGAACGATGAACGGAAACTTTACAGAAAATGA ACAAGTAAACGCAAGCTCATAAAAAAGATGAACGGTCCAAGCCTGTTTCG TTACTTTGTTACAGCGTATTCCGATCTGTTCTTCGTATAACTGGACATTC GGAGTAATTAAKTATCCACTAAAATACCAACCTTGTTTTAATAATAAAAA AGTAACACCCCAACAAAGTCTCAGAGTCACTCAACTTTTTTCTTGGACAC ATTCGCACCTAGTTACTCAATACTTTGTTTTTCTTGTTCTCAAGAATACT CATTATAGTCTGAAAAAATCATTTTTTTATGTAGCTTCAGACGCTCGTTG CTAAACCTCATCTAGAGTCACATTAATTATTTCAGATTGGTACCCCTTTT TAATATGAAATTTAGCTCCTCCCGCTCATTGTTAAAAATAAGTCATCAAA TCATAGGGCTACTTACATTTCATTCTAGAACCAAGATTCTATAGTTTTCT TATAAATATAGTCAGTTGCTACCATTTTTATATAAATATATAGATAAACA AATTTTGCCAAAAAATTGTTGGACAAAATATTTAATAAAAATTAGCTCTT GGGTTTTTTTTGGTGCAATTTATGACAGTCAGTTAATTTATAGAGATGGG CTTCTTCAGTGCAATGATAATCTTATAGCTTTGAAGACACATAAACAAAA TTTTGAAATGCAAAAAATACGACATACATGTACTTTTACCATGGAGTGTA GTTTAACACATAAGCTCGCAACATTTAAACGTGTAAATACTAGAAGAATG TGGTGTTAATTAACACAACCGAAGATTAAAAAAATTTGAAAGACGATAAA CATACGATTAAATATAGGACAAACATGTAATTATTCATAGAATCCATTAT TAACTCCTTCTGAAAAATGGGTTTCTTACTGTATGATTAATGGTACCTTG AGAGTTCCAGCTTTGTTAGGTAAAGATACAAAAGTTCTCTGACTTATAAA TTTTTTTCAATTGTCTTTTGGAAAAAGGAATCTATGTTACCGCATCCTCT CTAAGTTAAATTCTGCCAAAGCTCAGAGATTACACATTTTTAATAATATT AAAATTTGAACGAATAAATTTATTGATTTACCAACCAAGTGCACTTTACC AAATTAATGTTCTAATTCACTTGATACGTAAATAAAACAATTTTTAAATT TCAAAATTGCAAAAATTTATTTTAAATCATTTCGTAAATATTTGCATTAC TTCAACCAACGAACACACTTTGCATGGAACATTAGACGTATTCAAGTATA TATTTTTATGAAGTTTCATATGTTTCCGCATTTCCCCCCCCATCTTTTAA GGTATGACAAGCTCAAAAATCATTTTTAGGAATCCCAATATGCATTATAC CCTTAAAGTTTTTCAAAAAAGTCATATTTGATGGTTTTGGGAAGTTTATG GAAAATAAAGTATGGATAAAACACACGATTGAAGGAAAAAAAAACATCAA ATTAACTTATGATAATTGTGGACGAATAATTTTTATATATTTTATTATCT 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CCACCTTCTGCTTTCCTTGATATGTCTTCTTTATCCCTCTTCGGTTTAGT CACCTTGAAAACCAGGTTCCTGGTGCACTTCCCAATTTCTATAATCCTAG CCACCTCAACTTGATTATCGAGGAGATCTGAGATGCGCTGCCTTTTCCCC TTTTCCTCATTCATGATGAGGAGATGACAAAATATTTATTATAAATTGCT TATACCCAAAGGATAGTTAAGCCAGAATATCAAAGTAAATCCCTAAAACT CCCTTTATTTTGTCTACCCTGAACACGTCAATAAATGATTCTAATGATTT TAACTATTTGACAAAATTGATTTTCTATCACTCCCCGCCCCCCCCCCCTC CCAACCCTTTTGTTCCWTTCAAACAACNCTMCTAAATTTTAAGTGTCCAG AAAGATTCTAGTTTGATGCCAGTTTTTCAAAATATTTGTCTTGAAGAAAT ACTATTCCTCTTATAAAATTGCTTATGTGTTAGTATAAAATGAATTTTTG AGTAGTATAGAAATGAAATGAAGGATAGAATTATATCAAAACAATCGAGT AATTAATGTCTAAATAGACTTTAGTCTATTTAGACATTAATTAATATTTC CTTGTGTTCATCAATTTATTTTATGTCATCAGAATAATTAATAATTGTTA ATAATTCCTAAAGAAATGCATTTTACGATTGTTTTTATATAATTATATCC TTCATTTTATATCTATTCTCATAATATAAAAAATTACCCATATATGTTAC ATGAAAAGAAAGATTAAGATAGAGTGCATGTTCAATGCTTCCCTTGCTTT ATGAAATATAAGTACTATATAAAAATTAGACATATACTGATACCTAATTT TTAGTTGATACCACCTTTGGGACGATACCAATTCCTTATTATTTATAAAG GTATTTCATAAACAATCTATAAATGGTTTACTTCTTTATGATGTTTAACT 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