|
|
Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s1031 | supercontig | LSalAtl2s1031:59705..66924 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000232 >EMLSAP00000000232 ID=EMLSAP00000000232|Name=EMLSAP00000000232|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=546bp
MPLENEENTDEDSRSEEETNISNLPRSQLITNAECKKTDFPSYRNCKSNS
SSNWAHTDLKIPTIKLNESFGPTSCDTSRKPHEFLNCFFETLVYNKVVCN
CHEDSKLLNVIDLVEKLYYARNIALRQELGARLQLALHDFLEEFIHHMSE
EEKVFQPLLNKYFDQKELENLLNTVLEQHRLWKEKVSAEKSLKLVKRKRK
FDEDEYIAEIASAKMDHLRFRRSYCEEVNDFFGKRFTSAAVLRFEXLPNE
IVIRIFGYLSPYHLISSCSRVSRKWNRLCVTPNIWRNLYPVMWARGHWSF
HFDETLIESCIDDDKQYNFFDSDDDDDINNPIIKNDNGVNKEDKEAVFLG
KMALYLLPKIGTGVRRLVLSGTRSLSSSTARSFLMKLPDLQHLKLSYCPN
IDDDAFKGLRRYAALRQLRTLDLSGCKRLTDRTFERISSCYFPVRRARKM
SQLRKISLSGVHNITNDGLDQLQLHAKTLEFVDLSGCFRLSGTHLNAFIS
HCSQLKPENLYYCNMISNGPFPNSANGCQNLDCPLRNCCQLSTIRY back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1031:59705..66924- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000232-696079 ID=EMLSAT00000000232-696079|Name=EMLSAT00000000232|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7220bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1031:59705..66924- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGCCACTAGAAAATGAAGAAAACACGGATGAAGATTCTAGGAGTGAGGA
AGAAACAAATATTTCCAACTTACCAAGAAGTCAATTGATTACCAATGCCG
AGTGTAAAAAGACTGATTTTCCGTCTTATCGGAATTGCAAGTCAAACAGT
TCATCCAACTGGGCTCACACAGACTTAAAAATTCCAACTATTAAATTAAA
CGAAAGTTTTGGCCCTACAAGTTGCGATACTTCTCGTAAACCTCACGAAT
TTTTGAATTGTTTTTTTGAAACTTTAGTAATTCAATTATTAAAAAAATAT
ACAATGATGTATTCAGGTCACAAGGGGAATCATAGTTTTGACCTTTCAGA
TGACGAAATGAGAGTATTCATTGGAATGCTACTACTATCGGCCTAAAATA
CTGTTTCAAGGGGAAGAATGTATTGGGAAAATGAATTGGACTGCTCGAAT
TTACTTGTCAAAAATTAATAATAATCATATGGGGGTGTAGACAGAATAGA
TGAAAATATCTCACACTATAGAGTAGCAATACGTGGGAAGAAATGCTTCA
TTCCTATTATGTGCAATTTACTGAATGCAAGTGTCAATAATCCATGGTTA
TTTGTTCGTCAAGATGGATATGATTGAGATTTATTAAGATTCCCACGTTT
TATTGTAAATCACTTATGATTTCAAGTTATAGCCAACCACCAAAAAAATT
CAGGCAAGAATTATAATATGAGTTTGGGTACACCAAAAAATCGATTTGAT
AAAAAAAATCATTTCATTATTGAAGAAGAAAATGAAAGATGTAAAGTATG
TAATATCAAAGTAATAATTGTAAAACTGCTTCCTCGAATATCTCAATGAC
ATACTTTATGCTTGAAGCTAGTTTGGGTTCATTTTGTTTATTTTTTAAAT
ATGCTGAAATGTTATTGATATCAGAAAAATACTCTTTGATAAACATATAT
GATCCACTTCGACAATAGGTATAGCAAGTCCTTTTGAAAAAATTGAGAAA
TGTTAATATACCTTTTCTTAAGTATAAACTTTTAGTAGAAGTAGATAAAG
TTGTTGTTCTTTCAGGAAAAGTTTGTTTTGTTGGAACAGCATCAGATTTT
AATTTATATCGTTTAAGTGGACTATATTTTTTGCCGAGTTGAATTTGTAT
CCGTTCTTGCATGAATAAAAGTCGATATAAGAAAATGCTTGCTACAGATT
CTTGAATATTGATTTGGCTCCTAGTTTTTTCTTTTGATGGAATTGACCAA
TACTTTAATAAATTCAGGATCTTTTGGAAACTTATAAAAATAATGTTTTT
TTCAACAATTTCTTCTTGACTATAATTTTGATAAGTTTTTTTTGCCTTAG
AATAACCAGTCCTACAACCTGGACAACAGAAAATCATTTTGTTTAAATAA
TAAATCCAAAATATCTATTTATAAGATGCAATTGTTAATAAATTCATTAA
ATAATTCCTATGAAAATGTAATACTTATATTATGTGATATATCATGTATA
TTTTATATATAATTAATGTCCCTAGAATGACATTCTGTATGTATATTATT
ATAAAGATTTATAATTAACAAATAAAAGTAGATATATAACAATTAACAAT
GGTTGAAAACAAAGATACGTTAATAACTTTAGCCACGAAGTCTCTAAGTA
CACTAAAAATATGGAGAAAAAATGAACAGTTTATCTTAGAGAGTTTAAAA
TAATCTTCCACTTGTTTTCTAAAGGTAAAATAGTCTTACGAGTACTAAAC
AAATTAGAAGTGAGGGTTTAAGTGTTGCGAGATGTATAATTGTCAATATT
GGTGGTACATCACGAATTCAAACTTATTAATGGAATTGATATTTGTGATT
GAGACTATTCAGTAGTAATTCGTGTGTTATATACATTAAGGACGCTAAAT
GACTCTTATTAAGGAAAAAGTTTACTTAATGTAGAAGATGAGTTGAGTTT
AGGAGGATTGAAAACAGAGTTTCAATGAAGGAGTTGTGGTTGGAGAATGA
TAACTTTCTTTGTTCCTCACTGTATTTTCCATTATACTTTTCTTTCTATA
ATTCTTACGTTCAATAATATAAGTATAAGATGGTTTGATACAAGAGGCAA
TAACTATTCATATGTAATGGGAGAATATAATATGCATTGCAGACATACTA
TCGATAAAAGATAGACACATTATTTTTAAGAGTCAAGAATAATCTTCAAC
TTCTTTTCCAATCCCAAAGGAGACTCACAAGTAATAAATAAAATCACTAA
TTAGGGGTTAGGCTTAAAGTGTTCAGGCTATACAATTATCCATATGGACC
ATACATTTATGACAAACTCCCCCTGATAAATTGAAGTGATATCAATGTGA
TTGACATTAGTTATTTCTGCGTTATAACTTGAATGTATCAAGGTCCCTTA
CCAATGAAATAGGTTTCTTAGAGCAGGAGACGAAAAAAAGTTAACTTAAA
GAGAAAAGGCCTCAAGAACTTCAATGAATGAGCAGTGGGTGGAGGATGAT
TCTTACTGGATCTTTCACTCGATTATTCGGTCTTTTTATGGAATTCCTTA
GTTCTTATATCAATATGTAGAAGTAATGTTAATATATTGGATATCCAAAT
AAAAAATATGGATTCCTTGGAAATTGAGGGGTGGGTGGATGCGGATCCAT
ATATTCGAATGCTTATTTATATATTCGTACGAAATATCTATCCAAATCAC
TATGAAAAAAATGAGTCTCGCTCCACAATGGATATCACTCTTCATCTAAT
GAGTAATAATATTTGAAATTTATATTTACACGCGTCCCAAGGTTTTGTAA
ATTAAAAAAAGTTATAAGGCCCCTTTCTATACTCTAAAGCAGTGGTTCTC
AAATAGGTCCGCGTACCCCTAGGGTACTTAAGATTTTGAAAATGTCATGT
ATTTTATTTGTACCCTGATTATCCCAGTTTTAGATTTTTCTCGTTTTAAA
AATGTATTTAGTTTTATCCTTTTCTATACGTACCTAATCTTTTAGTACTG
AATTGCAGTTATCTCGAGAACATGCCTATTTCTACATACTCCTTTACATC
TTTCTATTTATTCAGAAATTGGCGACGAGCTATATACATATTCCAGCTTA
ATACATAACGGAAAAAGATCATACATCACTGCAACTAAATATACTTTGCA
CTGATTAGAGGGTACTTGGCTCAAAAAATATTTTATAAGTGGTACATCAC
TGAAAAAAAAAACTGAAAATCCCTGGTTTAAAGCATTGAAACAGTTGAAA
AGTTTACAGCTTTATCTATTGTCCTTATAAAATTTAATAAAAAAATAATA
TACAAATGTTTATATATAGTCTACTTTTAAAAATCAATTTTAGTCAATAC
AAGAGTCAAATTATACAAGTGAAGAAGATGTTTCTACCTTTATCAGCCTG
ATATCTTCAAATTCCGCAATGGAATTAGATTCATTTAAAGGTTGCTCATT
TATTTTGTATGTGGCTGTGCTACCCATTCTATCTTAAAATCTTTAAATTG
GGAGTGCTGCACCAAGTTCTTATCTTCAGATGGAAATGTTACTTTATCAA
TGGATGGATTGGCAAAATATCAAGAATTAGACTCCTTTGTTAATGAAATT
AATGGAAGTGGTTTAAAAAAGCCCAGTAATCTAGTCTATCTTCTTTGAGG
ACATCTCTATGAACTGTTACAACATTTTTTCTTTCAAATAAAGAATGGCG
AAATATTATTTTATCTATGGCTACCCCAATAAGWGTTTTTKTAAAAGGKG
CACAAAGATTTTTTAATCCTGCGGTAATAATCATCTTTTCAGTAGCACTT
TCTTTAATCAAATTGCATCAAAGATGTTTAATATATTTGGAAAAAAAAAA
GAAAAGTGTTTGAAGCAAAGAGGCATCTTCATATTAATAAAAAAAGGAAT
AGTGCATGCAAAAATTCTTCTAATAGTAAAAAAATCAAAGCTGGAATCAG
TTGAACAGTTAATTAACTCCTTTTTTTATTCAATGTCATTTGTATATTGT
ACATATTATATTTGTTTCATTATGAAATTAATTTCAATTAAAATCATGGG
TTATGTTTTCAATAATGAAATTAAATTTTTAATAGTTTAAAAAGGGTAAG
TTATGAGTGACTTATGAGCTGTTAAAGTTTCAATTTACTGCATTTACTTT
ATTAATATGATAAATTCATTTGCACTCTAGCTGTTGATTAATTCGGTTTT
ACTATGGAGATGCAAATATTATTTCGTTATTGACATTCTTATCAGGTGAG
TAGAGAATTCAAAATCCTTATTATTAGTTGAAGAACTAATATTGCTCTGT
ATTTCAACTATTCCAAGCAAAATGAAAGTGGTGATACTTAAGGAAATTTG
ATTTCCCTAGTATTAATAAAATATATATTTCTCCAGAGAGAATAGTCAAA
ATCACAAGGCAAAAGAGGCTTATTCAAGGATTATGATTGCTTTCCAGCAA
TTCCAATCACTACCGTGTGGACGGGAGTAAAATGGTTACTACAGTTACAG
GAAATAGCAAGGGAATCCCAAAATTGGGGTCGGCCGGGATAAATGTCATT
AAAACTACCAATGAAGTTCACCAGTGGATCTGGTGTCACTCTGAATATTT
ATAGAACTCATTGGAACGCTGTTTAAAGATTTTTTCTATTTAATCTCTGA
GAAATGAACGGAATCGAACGTCTTTCCTTTCCTGCACAATATCCACACAT
AATACTTTGTAATTTTTACACCACTGGCCTGGGCAAATTGTACAATTTTT
TGTACCGAACTAATATATATATTTATTAAAAATAGAAAGAGAAAGCTAGC
TAGATAAAGAAAGAAAAGACCAGATCGATAACTAAAATCATTATTATTTA
ATAATGGGGCCCTGTTTGTGTTATTGTTACATAATATTTATAGCTATTGC
TAATATTTACTTAGCAGCTACTGTCAAATTACATATACATATATATATAT
ATATATTATGTACTTAATATAGTACTACAAAGCATAATGCAACAACTACT
TTAGCTTAAGGTTGAAAAATTGAAAAAAGAGGACAAGGACAGTTGCATAC
AAGCATATCTTTATTACGTCGCAGGGTTAATATTGATAATATGTATATGT
AGATATATGTAGAACTAATATTAATATACATCTTTCTTCTATGTATACAT
CTTAAGACGTATAATTAATTATAGGTCTTATTGGAGGAGTAAGAGGACAT
AAATTTTGGTCACCCGTGTGCCCAGCTGGCTATAAAAAAAAATAAAGTAG
CAAAAAAAGAGGAAAATTATTAGTATAATTTGTTAATTGTAAAATACAAT
TGGAACGGAGAAGAGGTCGTCTAGCTTGAAAGATTGAAAATAATATATTC
TTGCTCTCTCTCTCTCTCTGTCAGTCTCTCCCTCTGCTGCATGTTATTAT
GTTATGTGAGTCATATGAGTGCATATTTACTCATACTAAATGATATTATC
TTTTGATTTTGGTGAATTTTTATAAGATTTTGGTATATACTTATCATAGG
ATAGTTCTATAGGTTGTATAATAACATAAGAAAAGGAAATGAAATCTATG
GAGATGTCGCTAATCCGGCCGAGTGACGCTTCCAAGGCGATCTTTTCCGT
TCCACATGCGCGTATGAAGGAGCTTGTAGACCTTAATTTGTGTAAATTAG
AGAATCTGCGGGACTTTACGAGTGGAGATGTGGGAGGGATTCTTCAGAGG
ATCTACGTCTCCATGTGGGAGCTGAAGTCGCACGAGTACATTGAGGATAC
GTACATCCTGAATCGACTCAAGGACAGACTCCAGGCGAGAAGGGKAAACG
AGGCAGACTCTACGCGGGCGAATCCGTCCTCACTTTATTCCTTGAATCTT
TGCAGGTGTATAACAAAGTCGTGTGCAACTGTCACGAGGACTCCAAGTTG
CTGAACGTCATTGATCTGGTGGAAAAGCTGTACTATGCTCGAAACATCGC
TCTGAGACAGGAACTAGGAGCACGACTCCAATTGGCGCTCCACGACTTCC
TTGAGGAGTTTATTCACCACATGAGTGAGGAGGAAAAAGTTTTTCAGCCC
CTTTTAAACAAATATTTCGACCAAAAAGAATTGGAGAATCTACTCAACAC
TGTTCTCGAGCAGCATCGTCTCTGGAAAGAAAAAGTATCCGCGGAAAAGT
CCCTCAAACTTGTCAAAAGAAAGCGTAAATTTGATGAAGATGAGTACATT
GCTGAGATTGCATCTGCAAAGATGGACCATTTGAGATTTCGTCGAAGTTA
TTGTGAAGAAGTCAACGATTTCTTCGGAAAAAGATTCACATCTGCGGCTG
TTTTGCGCTTCGAGGAKCTACCTAATGAAATTGTTATTCGAATCTTTGGA
TATTTATCGCCTTATCACTTAATTTCCTCCTGTTCTCGGGTTTCTCGCAA
ATGGAATCGCTTGTGTGTGACTCCAAATATTTGGAGAAATCTATATCCAG
TCATGTGGGCTCGAGGGCATTGGTCTTTTCATTTTGATGAAACCTTAATA
GAGTCATGCATCGATGATGACAAACAATATAATTTCTTTGACTCAGATGA
CGACGATGACATTAATAACCCTATCATAAAAAATGACAATGGTGTCAATA
AGGAAGACAAAGAGGCCGTATTCTTAGGGAAAATGGCTCTCTACTTGCTC
CCCAAGATTGGAACAGGCGTACGACGTCTAGTTTTAAGTGGAACGAGAAG
CTTGTCCTCTTCCACTGCTCGTAGTTTCCTCATGAAACTTCCTGATCTTC
AACATCTTAAACTCAGTTATTGTCCCAACATTGATGATGATGCCTTCAAA
GGACTCAGGCGTTATGCGGCTCTTCGACAATTAAGAACTTTGGATCTTTC
TGGTTGTAAGCGTTTAACAGATCGTACTTTTGAAAGAATTTCCTCCTGTT
ACTTTCCTGTGAGACGTGCTCGAAAAATGAGTCAACTTCGTAAGATCAGC
CTCTCTGGTGTGCACAACATCACGAATGATGGACTGGATCAACTACAATT
GCATGCTAAAACCCTTGAGTTCGTTGATTTATCTGGTTGTTTTCGTCTTT
CAGGGACGCATCTTAATGCTTTTATTTCCCACTGCTCCCAGTTAAAGCCC
GAGAACCTATATTATTGCAATATGATATCGAATGGACCCTTTCCTAACTC
TGCAAATGGTTGTCAAAACTTGGATTGTCCTCTTAGAAACTGTTGTCAAC
TATCTACAATTAGGTATTAA back to top
|
