EMLSAT00000000316, EMLSAT00000000316-696163 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000316
Unique NameEMLSAT00000000316-696163
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1047supercontigLSalAtl2s1047:1859..17658 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000316 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000316EMLSAG00000000316-683082Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000001446EMLSAE00000001446-710374Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001447EMLSAE00000001447-710375Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001448EMLSAE00000001448-710376Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001449EMLSAE00000001449-710377Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001450EMLSAE00000001450-710378Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001451EMLSAE00000001451-710379Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001452EMLSAE00000001452-710380Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001453EMLSAE00000001453-710381Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001454EMLSAE00000001454-710382Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001455EMLSAE00000001455-710383Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001456EMLSAE00000001456-710384Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001457EMLSAE00000001457-710385Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001458EMLSAE00000001458-710386Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001459EMLSAE00000001459-710387Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001460EMLSAE00000001460-710388Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001461EMLSAE00000001461-710389Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001462EMLSAE00000001462-710390Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto768241auto768241Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000316EMLSAP00000000316Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000316

>EMLSAP00000000316 ID=EMLSAP00000000316|Name=EMLSAP00000000316|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1338bp
MEARVPRQSNVAKTSTRPTHKRLSRKPRRAELDGKTSSTTSTKKMSSLRE
RLAIFMSQFDGRIDCKWSDFSSWSDCSQSCNGGVQFRERKILILARQGGS
PCRGERKESRVCSTQQCPHFVGDVPDVNCPLVNVIGATYANCDGRYKVTN
NKVPWASERPVYKHTRKNRYIFWNAGGLGWSIGKREYLKTGSHWHRSGLD
TDEPWEGKWEEGVRVECVGGSKKSPSSASTSDDTGSVDCLWSSYGQWSRC
SVSCGTGTQQRKRMILQPSTNGGKSCRGDAIESRQCNAGATCPVNCEWSN
FGQWSSCSATCGGGRQTXRRNIRRRASGSGRPCLGEKAETRSCSTNPCSR
FGAKTESRHSSSNSDIDNSISSSFSTIPTSSPLYTTLFPSSTTTTTITTT
TTTTSTTTTTPTSTTTTSTTTTTTTTNTPIDNEVNAALKDQPIPDDDLST
TNNSRSSIKRVQDCEWSDYDTWSVCSKPCGVGVQYRNRSIVHPSRNGGNE
CPGRAFQSRICNRHTCGSGADQCCERVIVKANGNAKLDQSLYLGAYNKIS
DSYNGRFAYEREGREQLYIXFFKSQADSLNLWVIGPELGQFIAGIRNDGQ
ETCIHKTAQEWKYASRAGVWKDDDPTLAVECFNGETTTTTNSNFGNRQQI
SRRTTVSTTTTTQLSIIRNRPEGVNCEWSQYGEWSPCSKSCGRGIQFRTR
RVAVTPKNGGSNCVGSNKDTRSCNVKSCNFFTTTTRPPTTTTRRPVVKAK
PIDPNRRVKCFACGSLFSTDAPECDKFDVSASQQQTTCARGEACLWYSYH
KSAGDIAIIRECFSTSILLGSIENPIAPSHECVPRPVENDDSIMACICAT
DFCNGYDGGSPVNLKXTTTPTPLRLPQSQTERPRILCHQCGSLFSGSGNP
PCEEGNAGKTEYCKEGEACLWYSWKKSNIETSIIRECFSKSILLGSIDKP
LQLRRECVPQDIXETRASNIYACLCDTERCNANGERSVESDSSSSSNDRF
DSSQVNQEQNNNRNRNDNNSKNNQQTSRRPTTTRRPSFTQTTPSSQFRXP
STPPPRSQNTFSGGPGLQCYSCGSFPLLPTTGCNIRDISEPQSSSIEACL
CTTDFCNDDLGRSPGGDATSQIQERQTTRSRFTDTTNSPTRSRFSETTKS
SNFFERTTKASTFFDQKSRASTPGFRPDFNDLPDKFEFNRNDNLRKTSCP
RGYTLTPTGCYQISDRRMGWIEAKKLCESENGNLLAIDNEEERQAILELI
SESSPRTRFEFWLGGNDIEIENRWXWXGFGNTILXPDFGWLDRPVPSVEE
NCLTWSITLARKGSRRRSSEGWHSDSCCNAIKYICELK
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1047:1859..17658-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000316-696163 ID=EMLSAT00000000316-696163|Name=EMLSAT00000000316|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=15800bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1047:1859..17658- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGAGGCAAGAGTACCAAGACAGTCCAATGTTGGTAAGGGTGATCCTCT TAAGATATATATAATTATATTGTTGAGAATGAAAGCTTATACAGAGGCGT CCATAGGGGAAGGGCTGGACGGGCTAGAAAATGTAATAATTAAAACAAAA ATTCAAGAAATTTAATTAAATTTTTTGGAAAAAGCTATGAATTTTTGAAA TTTATATTTAAAATTTAATTTCCGAATTTTTTTTTTTTCTTATCAACTCA TAATTTTTTAATTTTTTTTGGAAAAATTTATATTTTTAAGGAAATAGCAA TGGATTTTTGAAATTTTCCTCAGAAAATTTTAACATTTGAAATTTTTTTC CAAAAAAATTTCTGTTTTTTCTGAACAACTCTGAATTTTTTAAATTATTT TCCAAGAAAATCTATTTATTGAGAGTAGCTATGCATTTTGAATTTTTTTT TTTTCAAAAAATGTAATATTTTGTGAAAAGCTGTAGATTTTTGAAATTTT CTCCAAAAAATTTAATATTTGAAATTTTTTTCTGAAAAAATTAACTTTTC AATTTTTTTTCCAAAGCCCCCAAAAAATATATATGTTTATATTCCTGCGG ACGCCCTTGTTATAATATGAGAGTTGAAATGATATTTTGATACGTAAATG CTGTTGTTTGAGTTGGGTATTACATATTGTACAAATATGTAAGCCGTTGT CAGCTGAATGGATAGCTATGTGACTTTGAATATTGTAACTATTAAAAAAA TGATAATCAAGACATATTTCTTATGCTAAAGGTAGAATAGAGTGCTATCA GTGCGGGAGTTTAAAAAAAGGCGACTCAGAACCCTGTGATAATTTCAAAA GAAATGATCTCTCCATGAGAGCATACTGTAATTATGGTGAGGGCTGCTTA TTGTATACTTGGATGAAATCCTCAGGTCAAAGAGGTAATTAGATTTTCTC ACTTTTTGAAACAAAGAAATAAAAAATTGTAAAGATTATTTTGCCTTTAA AGTAAAAATATAAAAGAATATCCATTTCATACCGATCAGGAATGTACCGA GAGTGTTATCCCCTGGATAAACTACTGGGTCCGGCAGAGAACCCTATTGA AGTGACTGAGGATTGCTCTCTTCAGCCTACACAAAGAGATAAGGAAGCAG ATATTCTTGCTTGTCTCTGTACTACCCCACTATGCAATGACGTTCCAAGC ATGTCATCTGTAGAGCCTGGTAAATTTATACATATATATACATGAAAATG TTATTCCTTGAAAGACAAAAGGCTTAAAAGGCTCTTTTTGATTGATTCCT TTATTGCATACACATTATACACCTGCATAAATAAATTGTCTTATGAAAAG TCCTGTTCAGATAGCACCTATCACATGATCTATGAGTTTACTTGTGTTTC TCTCTTGAGTCTTTTTGTGAATGTTCCTTTTTCAATGTCTATGTTTGTTT GTATTTTTGTCATATTATGTATGTACATATGAAAGTACTTTTCACTCCTT AAGTAATTTCATATTTTGTACTTGTGTTGCTTTAATTAAAGCTATAAATC AAGTGGCGAAACAAAGCCCAAGTGATGAATATTTGTCCAACTATACCTWG TATGCCACGCGATAAGTTTTTGTCTACTATGGGRGTTGAGTGTACTTGAA TATTACTCTTTAACTAACTTTGCAACCTCCTTGGATTTACCCTTTTAACT GAATTAACAAGGTGAATTATTCTGCAAAGTGTGAAAAAAGAGTTGTATAA AACTGATTAAGAAATCAGTCGTAGGACCGATCCAACTATAAGTATCTTTG GTATCATAAAGATCTGACGTGGGGAAAAGGWTACTCATAATACAAAGAAT TTACTCACGTTTCGCCATTTTGTTTTATACCTTTGGTTTGAATAATTAAT ATTTTTTTACACTCATTCCTGCGTTTTTTTATGTTAGTTCCACATGTGTT GACATGGATATTTGTATTTATGTATTTGTATTTTTGAACTCGTTTTCTTG AGGTGTGTTTCTTTGTTTTGTTTATTTCAGCCAAAACATCTACTAGACCG ACACATAAAAGACTTTCTCGTAAGCCCAGAAGGGCAGAACTTGACGGAAA GACTTCCTCCACGACTTCGACTAAAAAAATGTCATCACTTAGAGAAAGAC TTGCTATTTTTATGTCTCAGTTTGGTAAGGGATTAATTAGAGTTTACATG TACATACACGAAATAGGGTTTCTCTCTCTTTTTCTTTTACATAAATAATG TCTTGACATACACTCGAGAGATTATTCTAATAGGGYTTTTGGGCCTTTAC ACCGTTCTGACTTTTTCCACATCTTTTGTATATCTATTATTTAAATCTAA TTTATAGGTTTTCCTATGTTAATGTATGTGGGTTGTTTTCCTCAATTCTG ATTGTTTTCTTTCTCTTTTCTGTATTTTAATGCATAATGATGATACATCT AGTGCGTCAACACAAAAGCAATTTGGAACAAAATCAATAAAACTCTTTTT TTTAGTGATTACTTTTACGTTAATACCTATAATACATTTATAAACGATTC AATGATTTATAAATATTATAATCAAARTCCTTGGATAAGTTAATATACCA CGGAATGGGCACTACTGGACGGTRCAAAGAAATCTGAACACTTACTAATT AARTAAGGTTAAGAAATTGAAATTACTTCATATTTCGATATATTAAAACA TAGTTGTTACAATTAGTTACAAGACAAAACAAACTTGAGTTCTTTAGCTT ACGAAAAAGTGGAGAAAAGGACATTTTCCGTGAACGACAAATTTCCATTC CCACACTCCAAGCAGTTGGGCATCTCCAGTACCACAGTCTACGACGTTAG TAAGTCAAAAACGTTGGAGTGGAAGAAGGGTTCTGTCAAAAAGGCCAAAC TGGTCCCGGAGTAGTTAAAGAAAACAGACCGGGCATATCCCTTCAATTCC ATGTCGACCCATGCAAGAGATCTCGGGGGTTCACATCAGACTTTCCAGTG AGCTATAAAAAAAGTGGACGGAAAGAACCTTGTGAGGATGGAGAGGCCAC TTTTGGCAGCTTTATTAAATATTAAGAGAGCCTAGACACACATCTATCTA TAGCATTTATTTTGCTTAAATTCTATTGTTTATTAATAAATTTTATCTTT TTGAAGTTTAAAATTCAAAGTGTCCAGATTTTAATGGGCCACTCGGTATT ATCCAGAACTGGAGTGTCAAGTACATTTTGGTATGTCTCAATGTGATCCT ACCAGTAAAGAAAATGAGGCTCTGGGATTGATAATATATACCTTTATTCA TATTCAATATTCTTATTCAAAAATGTTCAATTATTTTTTGCATATTCTAG ATTGTATGCCTAATTGAATATTTAAGCTGGCTCTCAAACAATACTGGATG ATTGAAGGGGGGGGGGGATATGAGTAAAGTTAATTCAATATATGCAGAAA TCATTCTTAKTTGCTTTTGTGTTGAGGGGCCACAAATATACTTATTAAAA CACACTCAATGACTTAACTARATAGTAGTGTTGGGGTTCGGTCTGGAAAT CCAGGACAGGTCAAAGAAATTTAAAATAYTTTTAACTGAATACCATCTCC AGTACCATTACCTTGGCCAGTATCGTTTTAAAATTATCTCTCTCTATTGA TCCGGTCTTATGTTGTCGTTTTTGAAGTTTAGAGAGAAAATCACATAGKC CGAGCCGAACAAAAAATGAGGGTCTCGGACCGAGTCTCAATACTACTAGA ACACTTACATACATAATTACGTCTTATTTTTATTTTTTTATCTCTTTTAT AGGAGCAACGCCTAACTTTAATTTCAATCAACGTAAGACATCTTATTCTA AAAATTACATGACGGACATTTTGATTAAACGACTTTTTTTTTTATTCTCT CCTTTATATATAATTGATCTCACACACATATTATCTATCTATCCTGTGTC CGACATTACATAACTACACGATTAGATGGACGAATTGACTGTAAATGGAG TGACTTCTCGTCTTGGTCAGACTGCTCACAATCCTGTAATGGAGGAGTTC AGTTTCGTGAGAGAAAAATACTCATTCTTGCTCGACAAGGGGGTTCGCCC TGTCGAGGGGAACGAAAAGAATCTCGAGTTTGTAGCACGCAGCAATGTCC TCGTAAGACTCTTAATAAAAAAATTACAAATCTACTATCTTTCCTTATAT AACTTTTTTTACTTATAAAAAATACGTTCTTCCATACTTATCTATCTATT TCCTGACCTATCTCTTCCCATTTCTACTTTCTAATGATTTTGTCCATTAA TTATTATTAATTTACTTTCTATTTTACATTTATTTATAGGTATATTTTTT AATCATATTTACGATACATAATTCGATACTCTTTATTATACAAAACCCAA AAATGTCTCCTCAAAAAATGCCTCCTCCCTGGCTAAATTTTGGATTTAAC CCCCAAAATGTAATCGTAGACTCTTAGTTTAGTCATAGTCCTTTGCATAG TTAGTTAGTTGATTAATTAGTCTTTAAAAGACTATTAATATACAATATTC ATTTTTCACCTGATTTGATTTTTGAGGAACACTTTCAATTCTCGCACAGT AGCCCCAGTATTTTGATTTGCCTTTAATAGAAAAAACAAGCACTCATTGC TACTTCATAAACGAATAACCATCTGTCAGCCATGTTTTGTTTTTTTCTTA CTTGGTATCTATCATCTATGTACACTATTAAACTTCTTAAATTTTAGTAA GCAGTGATTGTATGAGAATTGTTAATGTTCTTTCAAAAAGAATCATAAAT AGTTTTAGTTTGGTAGTTGATTTTTTATTCATAGATTTGTAATTAATTAT TTGTAGATAATTAATATATGTAGTTGGGTGTTTCTTTCTTTAATGGTTGG CTGATGGGTAAGAATATTCTTTATGAAGTGGCTTACATCAGGGAGTACTT TATATATAAAACGCGCACTCTTTTTTACCAACTAAAGGCTTTTTCTTTTA GAGTAAAAGGGCATTGAAATGTTAGAGGGAATGGAATTAAAACAATTCTG CAATGAATATCTTTAGAGATTTAAATATTTGCCTTGCTTGATTCATGTAT ATCATCAGAATTAGTCATGTTCGGTATTCCGGTACTATAGTGGCACTGAC GCATATAAAACGGCAGCACACTAAACTAATATTGAAACTGACACTTGTAT CATTTTAATAAATAATTAAAAAAGTGTTTTTTTTAAATTTCCTGTAGACA TTCATAAAATGATTGCTCTAATTCCATTACGCCTCTTTCATTTCATAACT ATTCTATGAAGAGAAAAATAGAAAAAAAGCCTTTGGTTAATTAAAAAAAA TAAAGGGGAAGMATTAGTGCTCGTTTCATGCATAGAGTATTCCTTGCCTA CATATAGCACTAATTATTAAGGATGTGAAAAAAAAAGTATATTTTGGTAA CTTACTGGATATTAGTACTGTTAATAATTATTTCTTCCTATCTTGAAAGT TTGTCAGTCATTATTTATTCGATATAATAAAGTTTTAATACCAGTCCTTG CGAGTAATGCTTAAGACCGTTGATCCTTCAGACTGTCGTTAATGGAACTG GTTAAAAAATGAACAAATACAGTTGAGTGATGTCATCAAGGTCCGAACTT TATCAGTTTCAGGACTGATATGCATGACTGAATTGAACTGGACTGAGACT GAACTAGACTGCAGCCCTAAATAAGGACGGATACATCACTTATTTCTAGC GTTGGGTCGGTCCTTATTTAGGTCGAGTCTGGTCCCATCCAATCCCACTT GGCAGTCCTTAAAGAAGGTAAATCGATCCTTTTTGACGTCATTGAGGGGT TAAGACTAGACTGGGTTAGACCGAATAAATAAGGACTCACACGACACTAG GGATCTCTGTCTGCAGATATGTCGTCTATTTAAGTGTCTAAAATATACAT TTCTTTTTTATTTACACTCCTGAGGATTTAGACAATTTTCCCATCCCTAC TAATTATAATATACCGTCGTATGTATGTACTCTTGACAACTCCTGGTGTG ATTTGTACGTACGTCCTAGCAAGCAATAGTATAATAGTCCATTCACAATT ATTTTAATTGATGTGTATTATTTATTCATGTACCTTCATAACTCCTTAGT TAGAAAGTAGATCTTGTCTAATGTCTCCATTCTAATACCTTTATTTGTTC CTAAATATATAATCCTACAATAGACTTACATATAACAAAAGTACCAATTG GTTATCCATATACTTTATAATTATAGCAGACTTTGTGGGAGACGTTCCAG ACGTTAACTGTCCCCTTGTCAACGTTATTGGAGCTACATATGCTAATTGC GATGGACGCTACAAGGTTACAAATAATAAAGTACCATGGGCCTCTGAAAG GCCCGTGTACAAACATACACGAAAGAATCGATACATCTTTTGGAATGCCG GAGGTTTGGGTTGGTCTATTGGAAAGAGAGAATATCTCAAAACCGGAAGT CATTGGCACAGAAGTACATGTCCAATTTGTAATCAAAGGATTTCCGATCG TGGCTGTTGYTAATTTGATTTTTTTGTTTTTGTCCTTCACTTGATCTCTA TCTATCTTTTCAAAAACTCCATTTACATTTATATATATATCTTTAAAAAA ATGTTTCGGAAATCTTTATTTTACAATCTATATATTGTTTGTCCATTGTC TTACCACTTTGTTTTTTTTTTATCTCTCTCGTTCCTTCTTCCACCCTTTA TCTACCACATTCAACCAATAATAGGTGGCCTAGATACAGATGAACCATGG GAAGGAAAATGGGAAGAAGGCGTTCGAGTCGAATGTGTGGGTGGATCTAA AAAATCCCCGAGTTCTGCTTCCACTTCTGATGACACAGGTGGATTTCAAA TCTGTCAAACTTTTTTTCTTTCTCTCCCTCTTCCTTCAATCTTTCAAATA TTTCAAAATCTCTACAAATATTTATTTTCTTATGTTTTTTGTGAATATTT TTACAAAGAAAAAAAAATTCTAACCATCTTATTTCCTATCTTTATTTTTC CCTTTTCCTCCAAGGATTATACTTTCATATAATCCGTTCTCATAGATTTG TAGCGTCCTTTCCTGATCCAGATATTTTTTCTCATGAAATATAGGTTCTG TAGATTGTCTATGGAGCAGCTACGGTCAATGGAGTCGATGCTCTGTGTCT TGCGGAACAGGAACCCAACAAAGAAAGCGAATGATTCTTCAACCATCGAC CAATGGTGGAAAGTCTTGTCGTGGTGATGCTATTGAAAGTCGACAATGCA ATGCTGGAGCCACATGTCCAGGTAATAGATTACAATGAGATMTTTCMGCT TGTACTTTGATTGTCTCAACTCCTCATACATAGTAAATTGTGAATGGTCC AATTTTGGTCAATGGTCATCATGCTCTGCTACTTGTGGAGGAGGAAGACA AACACSCCGCCGTAATATCCGCAGAAGAGCTTCTGGAAGTGGCCGACCTT GCCTTGGTGAAAAAGCAGAGACACGATCATGTAGCACGAATCCATGTTCA AGTAAGACATCCCCCTATTTTTGAGTTTCCCTCCGTCCCGAATACTCTTA 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ACTACACTTTTCCCTTCTTCTACTACAACAACAACCATAACGACCACAAC CACTACTACAAGTACAACCACAACCACACCTACAAGTACAACCACTACTT CCACCACAACCACTACAACGACCACTAATACTCCGATAGATAATGAGGTG AATGCTGCCCTCAAGGATCAACCCATTCCTGATGATGACCTCTCAACAAC AAATAATTCGAGTGAGTAACAACAAATCAATCAAAACAAGCAAACTAGTG TTGAAAGTCGGTAGTATAGACGTAAAGGCTAGGACAAATAGTGTTGTATC GGTCCTTATTTAATCGGTCCAGTTCATGCCAGTCTTAGGACCACTCCTAC TGTCCTTTGGGGCTGATCCTGTCTGCATTTAGGACTATAAGTACTCAAAC TGATTAATCAAAGAAGAAATAAAGTGGAGTTACATAATCAAAAATCCAAC TTTATCAGCTTTTAGAACTGATCTGAACGGGATTCTTCCTTTCTAAATAA AGACAGACACAACACTAGGGACAAATATAATGGGACCTTATTGGCTATTC ATATATCAATTAAAAGGGGATATGTACCCTTTAATTTACATACTTCAAAT GGGGCATGAGCGTTGTTTACTATTTTTGATTTGTAAACAGAGTGGAAGAG AGTGGCACTTTCTTGAAGGAAAAGAATGCAACTCCTTAGATGATAATATT ATTTAATATAAAATATAGGTATGTTACTCACAAAGAAGACGCTGCAAAAG ATTTATATTCTGCTAACAAGCCATAGACTTTCCCACCACCTTTGCAGATA CTAGTTGTTGTTTCATTTCATAATTCTTCATTAACTTTCGTAAGCAATTC TAAAAATGTATCCTTTTTCCAGAACAAGGAACATGTATTCCAATTATACG TTTTTTACTGAATGAAATCTTATTTCGTTCTAGTAGATATTCTTAAATGA 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