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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1049 | supercontig | LSalAtl2s1049:76194..90926 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000323 >EMLSAP00000000323 ID=EMLSAP00000000323|Name=EMLSAP00000000323|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=383bp
MCLFFCYTDPFPSPGRFKLILIMNRDEYFDRTTSPAEWEDGILCGRDTFC EIHGGGTWCGMNKKGRIGILTNIFEGQGAKHLASRGSLVTDYLKFQGFKS PMDYMKDIXSSGXLXKPYNLILMEQNAKTGSYELFYCAQGLNATRDGPRK LTNNHSCLGNHFLRRPFLKTMAMDEEIMEFIEEHNTVQNKENIIRNLYDI FGTRYSYFPDPEIEKLKYSDDFLMKNDKYIACPYITHSNYKGRSYGTRSQ TIILINYYDEVSYYETTRHFNPQTKEEHYSKLNVRYHFSKPKHWAKQSVL SRVEGCERVENRIYHGDPVERRNFSWMGDSGGGLFVDQNLVGLISFGTYL ETYPHCRGKFPTFYTKVYLYAQWIDSILASNSD back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1049:76194..90926+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000323-696170 ID=EMLSAT00000000323-696170|Name=EMLSAT00000000323|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14733bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1049:76194..90926+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGTGTTTATTTTTTTGCTACACGGACCCATTTCCTTCTCCTGGACGATT
CAAATTAATACTCATCATGAATCGAGATGAATACTTTGATCGAACCACTA
GTCCCGCAGAATGGGAGGATGGGATTCTTTGTGGTCGAGATACATTTTGT
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GTCGAGGGAGTCTAGTTACAGACTATTTGAAGGTGACAACTTTTTTTTAA
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GTTTAGGTCTCAGATCTTTCTGGATAATAAAATTTAACTTACACTATACC
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TTTTTGTGTGGTGGAAGTCAAACATTAGTCGTACAAGCGTTATTGTATAA
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TCAGACTTGCTGACGGCATCTTGGAGACAACAACTGCTTGAATTGTGCGA
AAGGAAATTTGTCAATCACGTTCAAGTGTCATTTTCTTGACTTGTACTTA
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ATTTACCGAAATATGAACTAATTTTAATCACTCAACCTTAATTATTGATT
GAATTAGTAAGTGTTCAGAGTTCAATGGACCACCTGGTACCGTACACGTT
CAAATGATTGTCTGTTCCTACATGGAAACTTATTCCAGCAATTGTGATCG
ATTGAGTCCACATTTATCTCCTCCTAATCAAATAATATATTCTTTGCTTA
GTAAAGTTATTTCCTTATTATTAAAGGGTTGCGATAATATAATTTCAACT
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TTCTACAATGTATCCTTCTTCAGTTCTAAATAATGGCCGACACAACACTA
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GTGGAGCGTAGAAATTTTTCCTGGATGGTGAACATACATACCAGAATATC
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ATTATCGACTCAGTTCGAAACGAGTTGTCTCCATGATTTTTCAACTCCAC
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GTACATATAGGCCTTATAAACCACATTTGACTCCATTTGGAGTTATTTTA
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AAGACTGGCTTATGTTTTTCAAACGGAAATCTAACAATAGTTTTTATTAA
GGCAAGTTTGTCAGTATTTTTGTCTGTTTGTCGATGTTTAATAACTTTGA
GCAATTGATACATCTTCAATGTATATCATCAAACTGTTCTTATTAAGCCT
TTGAGTGTGACACATATTACACTTTAAGTACACACAATTGATCATCACAA
TAAAATAATGAGAAATTGATAAATTATATGTATTTGAAAGGAGCAATATA
AGGCTCTTAAATCTAATTAAGCTTCTAAAATATATGATACCATTCTTTGG
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TAAGAACTCAATCGACAASTAGAAATATGCTCTACAACATCCCTCATATG
CAAATTGTAAAAAAAAAACATCACTCATAACCTCTCAAAATTTGCGTAAT
AGATATAAGTAAATTATAACTGTGTGCCGGCTTTTTGCCTGTATTTATTC
TGCATATTCTCCTTCAAAAATCAATAACAGTCTCACCACACTGTCAAACA
GATTGGCAGSTCTTGACGATGAAAGTCATGTCTATGGCGMACCACGCRGT
CATGATGACAGCTCCAAATTTGGATGAGTAGTGTGGCAGACATTTTTCAC
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AATCCACCATATTGTTGCTGGACATGTTTGGGTTCTCCTAAGCTGAATGG
AGGTGTAATGGTAACTTCTTGATGCTTTAGATAATCTGGATGGAGATGCC
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ACACTCGTTGCCTTTTTTAGTTGATGCTTCGATATTTTTACACTTAGAGA
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GGAGTAATGTTACCTTGTAATTATATGCTACTGCAAGATTTGGTTCCTCA
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TTTGAAATTGGAGCGAAGAGTGAACAGTAGGGCCAAATCCTCGTTGAATA
CAGGGCTCTCAAGTTTTGAAATCAATTTGCTGTCAGATTTTTTAATCTTA
CTTTGTGAAGGGATTCAGCCTGACTCTCATGTTCTTAAATAAGTTTTAAA
AATACCAGAGATCTGAAATAATCACGTAGAAAATTTATGTCCACATGTGG
AGAATATGAAAGGAGTACGGGACAGATTTTTTAATTTTGAAAAGTTTAAT
CGGCCGGCCAGAAATGGACTAAATGACCTCTTTAAAAGAAAAAATAATAA
TTTCGACCCGTTTTCCCATTTACCACATTCTTGCAAAGTGATAATTTTCT
GGTTAATCKCATAATTTTTTCCCTGGAGGGGGGGGGGGTACTCAAGTCCC
TCGGCCCACTGATTGGCAAGAGGAGAAATAAAGGAAAACAAACTTAATTT
AATCCATGATAATTCCATAGGCTTAGAATTCTATAGTTCTGACATTATAA
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TTGTAAGAACTGATAAATTACTACAATGAGATAAAATAATTTCATAATCC
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TATCTTCAAATAGTCGAATGCATAACTTTCAGTATAAAAGAGGACCATCA
TAGGCTTGATATTAGAATGACAGAATTTAAAAAAAAAATGTGATTTATGA
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TGTCATACTTTTTTGTTGAAAAGGTTGTTTCTTTTTGACAATTTTGACAA
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AATAGACAAAAAATTCCCTTAAATGTAAGAGTTTATTTATTTTAAAAGAA
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TTTCTGGGGAATGATGACATTTAAAATTTCACAGATAGGAGAATAATTCT
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CTTGAGAGCCTTGGACTAAATTTATACTAATTGGTTTTCCAATCTATTAG
GCCCTGGAATTAAGCTTCCTTGTATAAGTAATGAGGTAAAGTTCCAAAAT
TATTGATCGATAAAATATGTATCTTAAACAGGGGTGTCCACAGAGGGTTG
GTTAGGGGGCTGTAGTCCCCTCCCAAATTAAGGAATTTTTGTTTATTATA
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TAAAATTTTTTTCGCAAAAATTAATTTTGTGTGAATTATTATAGACTTTT
GAATTTTATTTCCAAAAAGTGGAATATTTGGAAAATATTTTTAAAATTTT
TTTCCTAAAAATTGAAACTTTTTTTCAAAATAATATTTAATTATGTTTTT
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TAAAACAACACGACTTTCTTTTCACCTGAAAATAAGATGATTCATAATGA
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ACACCTAGGTACCAATTGCCGAAAGTCTCATTTTATAGGCACATACCTAG
CATATCAAAGTTTTGGAGGAATCGGGGCTTGCCCAGAATCTTTTTTTTTT
TGCGACAACTGTAGACTTAGTACAATTATAGACGGCTAGTTCAGGATTTT
GAAGAGTCTATATTCTTCTATGCTGTCTTTTACAAGAATATCCTTTCTTT
TTCCAGATTGTAGATTGAATCGAGCAACGCTGAGTCATATTAAGAATGGA
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AATTCGTCTAAAGACTATCGGTCCCAAAATTTTAAAAACCCTTCCAAAAT
TCTAAGGATACATCTTCTGGGACGTTAAAGCAGCCCATAAAACAACCTTT
GGGAAATGACGTAATCAGATATCATTATGACAAAGCTATGTAATTTACGT
GTTTTAAAGATAGTCAAAGTTTTACTTTACTAAATTGATGTACTTTACTA
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ATAACCCTAAGCGATTTTAAATATTCTTTTACATTTGTTTTTAGCCTCAT
CTGAACCATTATTCAATTCGTTAGAATCTTCCAAAAACCTTCACGACATC
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CGGATCACGAAAATAATATTAAATTTTCAATTTCAATTCTTATTTGTTAC
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TTCCCTCCAAATTAAGCAGTTGTTTGGGTTGTTTTTTTTACTAGAAAATT
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ATTTTTCAATTTAATTTTTTCGCCAATTGTTTTTTTGATTTTCTGAGAAT
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TACACTGAATTGCTTTCTCAAAATTTAATGACCGTTTACTGTGACCATAT
ATAATACTCTTAAACTTTGTTGGGGGGGGGGGGGAAACATGCAAAATCTC
TATAAAAAACTGTTTAGCCATCAAATGACACAATTTTATTCAATTTACCA
TAACTTAATCAAAAGAAATGGAACAAATTCTATATAAAACACCACCAAAA
AATTAAAAGTTTCTTGATTATGGATTTAGTACTAAGAAGTTTGGTTAGAA
TCTCGTATGAGAAATGTTCCCAGATCTATAGTCTAAAAACATTCTGTCAA
AAAAGTACTGGAAATTATTAATTTAAATTGCCCACGCTGAAGGGATTTAT
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ATTTGAGTGTGATCTGTACACCAAATTGCTTGAAAAAAGTCGTCAGTCTG
CCTCACTTGTGCTCCACGATTTTTTTTACAATGAACGAAATTATTGGACA
AAAAATCGTCTTACCAGTTTAAGGGATTTATTATAATGCTTTCACATCTC
TCACGAGCCATTTGACGAATTTTCTAGAAAAACAGTACCATAAACAACCC
CATGTTTATTGAACGTCTCATAACTGGTGATGAGACGTGGGTCTATGAGT
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GAACAAATTGAGATGCATAACCCAATTTGATTTTAGGGGGAGTTTTTGCA
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TTTTGAGCTAAAATAATAGAAAAAATATTCAAAACAAAGTTTTAGTGACT
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GGTTTGTTATGTTGATATTATGAAGGGATCTTTTAAGTGTCTTTAAGTTA
ACAAAAATAGTTACTTGAGTAATTATGGGATAAATTTATTCAGCAATAAT
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AGGGCTGTAGCTCCCTTCCAAATGAAGAAATTTTTTGATTTTACTCGAAA
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GTAATATTTGAAATATAACAAAAAATTTCAAATTTTTTTTCCCGAAAATT
TGATGTTATAAATTTGATTTAATTTTTCAATTTTGTTTCCCAAAAATTAA
ATATTTGAAATATAATAAAAATTTTCAAATTTTTTTTCGGAAAATTTATA
TTTCTGTGAATAGCTATGAATTTTTACTCCAAAAAATTTATTTTTGAAAA
TTTTGTTGCTCAAAAAATTTATGTTTCGTTGAAAAAGCTATGAATTTCAG
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TTTTTTTTGAGAATAACTATGAATTTAAAAAAAAAGTTATATCTGAAAGT
GAATTATTAAAAAAATTTAAAAAAAAAATTAGTTTGTGGATATCTCTTTT
TAAATCATCCAAAAAACAAGCTCCACCATACCTAAAAAATATAATACGGT
GGACGTCCTTGAAATCCCGTATTAGTCCCGATACAGTCCTAATATTTAGT
ATACACGTCCTTTAATTAATTTTTTTATAGGTTTTTAAGACCCTTGGTAA
CACAACCTACTGCTCAGTCTCAGCCTTAAATGAAGGATATCCATGTGTGG
TGAGTATTTAGAATCCTTAGACTCCATATGATGTACCAATAAGCATATTT
TAAATGTAGGGGGATTCCGGAGGTGGACTTTTCGTGGATCAAAATCTCGT
GGGTCTCATCAGCTTTGGGACATACCTGGAAACATACCCTCATTGTAGGG
GCAAGTTTCCAACTTTCTACACTAAAGTCTATTTGTATGCCCAATGGATC
GACTCCATCCTTGCTTCAAACTCGGATTGAAGGAGCTGTTATACAATGAA
CAGGGATTAATCATTTAAATTATAAGAAAATTTTTTATTGCTAATATTTA
AATTATATATTCTTCTAACAATGGCTTACCTGGCGTTGTTCGGGCGGGTG
TAGAAGTACATACGTTATAATATTGCACCTGTA back to top
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