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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s104 | supercontig | LSalAtl2s104:500942..512548 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000337 >EMLSAP00000000337 ID=EMLSAP00000000337|Name=EMLSAP00000000337|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1122bp
MQLWSLSILSLFILFYTPRVKSKKCPQSVEIQNGLIKYSYNHLTHDCQGH
VLCKKDYFKTKETLSNQEQIRCSKKESYPNDEEHQERERDNDYGSYYEYN
YSDYDVNETSTSAYSTEPYTEMTTLTMDTSQVIPEETTTHVEIQEGVTEE
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ENILLKGKSYSVILYKCEEGYALSSESTGQLFCQENGWIGIQPTCXIDXS
SNAXTTXSINSNTSDPNESLLSQCNKDCDHKCEINENGEPKCVCAEGYTI
LDGETDCSDIDECLFDSGGCDHICINKPGSFVCECPPGFAPEGLECVDEN
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NGCSMEGLVDQTHRYFCSEMESSPGFYPVGTICQSLCTPHNYTSVRKMKK
ECQFDGQWGLSNQTCAKMECPPLLDNFGNVILEPPNCESKPQALQSVCRV
SCLPGYKLMGSHIIRCRKDLRWHYPDIIEFLHDGRNSAYVEIPRPATNVN
WENNVVAEPPIAKSLKLELPPGTHYIRFVAQLQGQREANCNLSINIIDRT
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YGRHTIIYEAGDDHGNKIRCMFHFNVIRRKRRKKLKRKKGRREWVLCRIG
STGRQIKLLMSNVPKGCRKLPD back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s104:500942..512548- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000337-696184 ID=EMLSAT00000000337-696184|Name=EMLSAT00000000337|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=11607bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s104:500942..512548- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGCAGCTCTGGAGCTTATCCATCCTTTCATTATTCATTCTATTCTATAC
CCCACGAGTTAAAAGCAAAAAGTGTCCTCAAAGTGTGGAAATCCAGAACG
GTCTTATCAAATACAGTTATAATCATTTGACACATGATTGTCAAGGCCAT
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AGAGCAGATAAGATGTAGTAAAAAAGAATCGTACCCGAATGATGAAGAAC
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GCCTTATACTGAAATGACTACTCTGACTATGGATACCAGTCAAGTTATCC
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TCGATAGAAACCACTACCGTTCTCACACCAGAAGACAAAGAAAGAGATGA
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AGTACGAAAATTACGAATCCGACTACGAGAATGAAGAAGCGGACGCAGAG
ACCGAAATCCTCTATCAAAACTACGAAATCCTTTCCAACTTTTACAAACT
CTACTATGTGGATCTACGCGTCATTGACACTAGCTGTACTTCCCACAAGC
CTCCTCCACCGGAAATAAGCCATGGTTATGTTGCTGAATTCATTACAAAG
GAAAATATTCTCCTAAAGGGGAAAAGCTATAGTGTCATTTTGTATAAATG
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AAGAGAATGGGTGGATTGGGATACAACCCACATGTRAAATCGATMCTTCA
AGCAATGCAMCTACCACTMCATCCATTAACAGCAACACATCCGACCCCAA
TGAATCCCTTCTCAGTCAATGTAATAAAGACTGTGATCATAAATGTGAAA
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CTTGATGGCGAGACTGATTGTAGTGACATAGATGAGTGCTTATTTGATAG
TGGGGGGTGTGACCATATATGTATTAATAAGCCTGGATCATTTGTATGTA
AGTAAAAGCTGTTTATTTGTCATAAAAATCAATACATAATTATTTACATG
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AAAAATCCCAATATAATTCCCCCCCCCCCCTTAAAAAAAAAAAAATAATA
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AGGGGTCATTTCCCGCCCCTCATTTGGAGAGTTTTTGTAGTTACATGCCA
TAATTTTTGGTAAAAAAAGGAAGTTCTTTTTTATTTATTGTATTCATTCA
AATTTAGTCTCATCCGAAAAATATTAACTCTAAAGTGAGGAAAACATTTT
TGTCACCCCTAAAAAAAATACTTGAGATTGTCTACATAGAAAAGCCAAAC
GTAACTGATATATCATTTGTTCCCTACGGTACTTATCTTTCAAAATTTTG
TAAAATATAATGCGTAATTCGTATTACGATGACAGATATGTTTAGACTAT
ATGAGAGAATATTCAAGATATACTCCATGCACGGTTTTTAAAATTGAAAG
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TTATTATAAATTCAAACAAAGTGGCTCGTATTACGCAGCTCTAGTTAGAA
CATTAGTTCTTAAACAGGAAGTGGGGAAATCCCTCCCCCCCCCCCCAGTT
ATGACTTTTATACATTATTTGCGTTGTATTTGGTTGTGAGATCATGAGCG
TCCGCAGGGGGGGTGTTGGAGGAATTGTACCCCCCCCCCATCAAATTAAA
GAATTTTTGTTGTTTTTTACTAAAAAAATGTACCATTTTGAAAAAATAAT
TAAATTTTTCAAATTTTTTTCTCAAAAATTTAATTTTCTGTGCATACATA
TGGATTTTTTTAAATTTTTCTCCCCAAAAAATGAATATTAGAAAATAAAT
TTTCAAATTTTGTTGGAGAACAGATGTGAATTTTTTCAAAAAATTCACAA
AAATTTAATTTTTTTGAGAATAGCTGTTAATTTTTGAACAAATTTAACAT
TTGTAATTTAACTTTTGAAGAGTTGTGAATTTTATCCAATGGCTTTTGAT
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TTCCTAACAATTAAATTTTAAAATTTTTTTTACAATTTTTTTTTTCAAAA
TAATTAATATATATAACCCTGTCGACGTACCTGAAGATGTCAATTTTTCT
GTTTCTTTTCCTCTTATCAGTGCTCTGAAAGTTGATTAATTGATTTTGTA
TTAACTCTTGTTAACAATTTCCTACTATTATTGAATTATAATTACCTAGT
TATTTAAAACCAAGTGATTTTGGGCCTTTTCTCTCTTTCTTTTTGAAGGA
AAGGTTACGTTATACAATTAAGTTAACACGGTGTTACCTCACTGACACAA
GGATATCTTATATATTTTGCTGTCACCAATCAATTCCCTTGTTTCACTTG
ACACGTCATGCCATTTTTAATTTATTCTATTGAATAAATGAACGAAGTAA
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AGCTCTACTCACGCCTTCTCCTTGTGCTCTTACAAAAAACTCACCTCTAC
TTATAATACAGCATTAAATAATAATAATTCTATGTATGATTTTTATATTA
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ACTTCAATGAGAAACCAAAGAGGAATTTTTAAAGGCCAAATAGAATATTA
AACCGCTGAAAAACTGTCCAACAAGTTATTAATATGAATTATATTTGTTT
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TTCTTAACTAGCTAATTCCTTTCTTCTTTTCGTTATTCTCGCAACGTTAA
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ATCAATGTTACCAAATAACCGATTTTCATTAGGTTCAATTAACCATTAAA
ACTGCATCTCCTAAGGACTTTGTCATTTTTTTGAATTAATATCAATTATA
GTACTCAAATCAATAGATACGTTTATTATACAGTCACAATATTGATAAAA
AGTATCCCAGCTTTCTTTTATGTTATTCACTACAAAAATATTAAATATGA
CAATTATAGCCTTGTAGTACTTAAGAGATAAATAGTAGTTGGTGTGATTG
ACTTATTTCGCTAACTACCAACTGATTTAGAGCCCTTTTTTTATTAATTA
TTGAAGGAAAGTTTGTGATATACAACAAAGGCAATAATGTGTAAGAAATA
ATCATTCGCCGCAAGCATTTTTGCCCCATGGCAATTTGGAAAATTTGGCT
GATAAATAGTATTTTATATATTGATATATGCGGTGGCCTTTTTAATGACA
TTTAAAATGCTATTATCATAAATAGATATTGTCATTAATCTCTTAGCTAT
ACTGGCCACACCATTGGGCCTAGGAGGCTAATACTTTGTATGGGTGCTTC
TTTTGAACCTGGCCAGATTTTTGTTGAGGGGGTAAATATACCCAAAACAC
AAAAATTGTTTTTTGGACCTCAAGGAAACTAGATAGGGGGTTAAGTTATA
AATCAAGAAGTGAATTGATTGGCAACTATACTAATAAGGATGTTTCTATA
TTTATTGAAAACCATAATTGTTATGTGCAACAAGAAAAAATGGGTTGCAG
TTTTTTGTTTTTTTTTATATATGCAAAAAAGAAAAAGGATTTCCAATAGA
ATATTTGATTTGTAGGAAATTTCCTAAGTTCATAAGAATTTGTCTCGAGG
TTGGATGGGATATAAATTTAAAAACATAAAATTCATGTTTAACTGAAATA
TCTGTAATTTTCAAAATAATTTTTCTTTTTTTTCATCAAAGGACAATTTT
CAATTTTTAAGAAAAAATGCCCGAACGACGCCGGGTAACGCTTTCCTAGT
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TTTGGAGAATAATCTTTTTTTATTCACTATATTCATTAATCATCATTGTT
TCAACACAACACAGTAGCAAGTGGTTTGAACACAGATCGAATCCTTAACC
GTTATAGTACTTTATTATCCATACATTAAATCTAATATGTTTCCTTATCT
CCACTGCAACCCTAGTTTTTTCCAATGAAGTTTTTCCAATTTTGAGAACA
GTGTACGTCCCAAATATTGTTAATCTGTAGAATCGAAACCATGGGGGTTA
AATTTTTTTAGACTGTGTTTTATTCATTGTTACATAATAAAATTATAAGA
TTGCGTTACTATGATATTACAATTATATAATTTTTGATCAGGCTTGATAA
AGATTACAATGGGATTCAATGTATATGCTACCGGGTTCTGTTTATATAAT
GATTGTCGATGAATAAACTTTTAAAAAAAATATTATTCTCTAAAATAACG
CTCACCTATTTAAAAAAATATAATATATCGTACATAATCAATATAAAATT
GAATATTATTTTTTGGCCAAATGTCTTAAATTTTACAAAATATTTAAGGG
AATTGTCCGCTCACAGTAAAAAAAAAAAAAAGGGCTAAAATTGATTAATA
ACTAGTTCTGGATTGGTCCTGAATTACTTTTTTTTAATTGGATGGATGGG
ATATCTCTTTTGCCATTAAACGGTCTTAAGCAACAATAAGTAAAGTTGAT
AATATTGTTGAGAAAAACGCGTGCAAGGAGAAGGGGGAAAAATACATATG
GTATCATTGTTTAAAATACTGATGTGATTATCATCTGCCTGCTTTATTAT
GATTTTTGAGGGTATAACGAATGTATTTATTAGCAAAATGTTTAATGAAG
ATATACTGCGTATAATTGCCTTAGACGTTTTTTATCCGTTACATTAGATT
TTATAACATCACACTCTATGAAATTGTAATTCATTATGAACCTWATTCTC
AGAATAATAGCTAATGAAACGACAAAGTAGAGTATTTNNNNNNNNNNNNN
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TGTAACTACCCCTGTTGTTGTGACCATTTAAGCAGTTGTTTTTGCCTTTT
ATGAGTTTTCTGAACACCATTTCTTGGAGCCTATCAACCATAGCTAAGCC
TTAAGTAATTWAAAAAAMTAATATTTATTGACTATGTAATATTGGAAAAC
CTAATTATCATACCCAAGTCTTTAAATGAAGAAACTAGTCTCTAATATAA
TATTAATATTGAGTAATAAATGATAACGTTCTTGATTGATAGAAGAAGAT
GTATATTATTTAATCAAAGATACCATAAGTATTTCCTCTCTTCTCCTCGC
ACGCTTTTCTATTCTTACCAAATTAATTATCACCCTTGCCAATAAGTTGG
TCTATCATTCCTACAGTCCTAGCTATTTGTATAGCTAGGATTGAATAAAT
CAAAAAGGAAGAAAAAAATAAATGATAGCTAAAAGTTATAATAACAAGTT
CTAGCCACACAGCTCCTACTTTACTTCAGCTATTTTGTCTCTTGAAAGAG
GTTATGTTAGACAACTCAAAGGACATAATTAGTTTCTGCGCTATTTCAGC
TGTTGTAGTTACCAAAAATACCAATAAGGAAGGGTTCTAGGAATAACAAA
TTTTATTAGGACCGGACTGATACGACTGGAGTCTTTTTAGTTTTTTTTAA
AACGATCTAATACTATTTTTACTAATAAGTACAAATGATGCCTTTTGGTG
TTTTTCATCAATATTATATTTCAAAAACCCAAAGTAAAAAAAAAAACATT
TGATGCAATGAAATAAAATATAGAAAGTTAAATTAAACAAGGATTTTAAT
TAAACATGAATGTAATTCCATGAATGTCTTTTTATATTAGTTTTGCTAGA
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ATTTATTAGTCGGAAATCATTTCCAACTATTCAAATTTCATTATTCAAAC
GGATTATTATAACTACAGTACATACCATATCAAATCAATGTATAATTTTT
GGCATGAAACGAAGCTATCAAGTAGGAGAGACTCCTGTAAGTTGAACAAG
TTTTTACATACACCTTCAAAGTGCTCGTAATTTTTTGGTTTTTATCATTT
AAAACCACAAATTCACTCAAACATTGATTGACGAATATGCCTAGCCTGTT
TTAATCAATATCACTATAAACATTTTCCACTATATAATATCTCCATACTG
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GGCAACTCCCTAGAGAGAAACAACTAAAAAAATATGTAAAGGAAACTAGT
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GCCTGAGGGGGATATAGCTCCTCCCCACTAAATTAATGAATATTTACTTT
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ACATTGTTTTTTCATGAGAGCCTTCCCGGAACGWTTCTTGGTGATGACAG
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CTTTGAATGTCAATGTTCGGATGGATATATATTATACGAGTCAAATATGT
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GTATATACTAGAATCAAACGTATGCCAAGACATAAATGAATGTGAGGATG
AGTTTATCTGTAATCATGGATCAATTTGTGTCAATTTTGAAGGTAATAAT
TTTTTCCAATATCACAAAATGTTAGGACTGAAGACTATTGAAACTTTTTT
TTTTATGAAGGATCTTACAGATGTGATTGCTCAAGTGGCTATGAATTAGA
TGAAAATCGATATTGCCAAGACATTGATGAGTGTTTGCAATTTGATTCTT
GCAACAATGTTAATTCTCATTGTATCAATAATCCCGGCTCATACTTTTGT
GAATGTAACGCGGGATATTGGAACAACAGTGGATTCTGTGACGATTTTGA
TGAGTGTTCAGATAGGAATGGAGACTGTAGTCAGATTTGTATTAATTTAG
AGGGATCCTATCGCTGCGATTGTCTTTCCGGTTATCATACAGATTCCGTA
AACTCTAATGAATGTGTGGACATAGATGAATGTGCCAAGGGTTATCATAC
TTGTGATCAGAACTGTGTAAATAGCCTGGGATCATATTCTTGTTCATGTG
ATTGGGGATTTGAAATGTCTCATGAGGATCCTTTCAAATGTTATTCCCTA
TGTGATAGAATGAATTGTGTCTATGAATGTATCAATGGAACGTGTATTTG
TCCTAGAGGATACGTATTAAGTAATGATAATGTCTCATGTGTTCCGAAAA
AGAACAATGGGTGTTCCATGGAGGGTTTGGTGGATCAGACCCATAGATAT
TTTTGTTCAGAAATGGAGAGTTCTCCTGGTTTTTATCCAGTTGGTACGAT
TTGTCAATCTCTGTGCACACCTCATAATTACACCTCCGTAAGGAAAATGA
AGAAGGAGTGCCAATTTGATGGACAATGGGGACTCTCAAACCAAACATGC
GCCAAAATGGAGTGCCCTCCATTGCTTGACAACTTTGGAAATGTTATATT
AGAGCCTCCTAATTGTGAATCAAAGCCACAAGCATTGCAATCGGTTTGTA
GAGTCTCATGTCTTCCTGGATATAAACTAATGGGTTCTCATATAATCCGA
TGTCGTAAGGATTTAAGATGGCATTATCCCGGTGATAAACCAAGTTGTAT
CCGGTCAGATAAACAGTTAATAAAAGAAACAGTCTCCAATGCAACAATAN
CAGCCAGACATTCAATGCCCTCAAGATATTATTGAGTTTTTGCATGACGG
ACGCAATTCTGCGTACGTAGAGATTCCTCGCCCTGCGACAAATGTCAACT
GGGAGAATAATGTAGTAGCTGAACCTCCAATCGCTAAAAGCTTAAAATTA
GAGCTACCTCCAGGAACTCATTACATACGATTCGTTGCTCAACTCCAAGG
ACAGAGGGAAGCAAATTGTAATTTGAGCATCAATATTATTGATAGAACCC
CTCCAAAAGTTTATGATTGTCCAGAATCTTTTGAAGTCAAGTACAATCCT
AGAGAACTCAAAAAGGTTTGCAAACAAAAAAAAAGACCTATTTTCATTTT
TGCCTATTGAATAATGTTGTTCATTTTATTTTTTAAGGTTTTTTGGGAAG
AGCCTAATTTCAGTGATAACGTGAGGATCGCACATATGATTACAAATAAG
CTATCTGGAGAGTTGTTTCAGTATGGAAGACATACAATCATTTACGAGGC
CGGAGATGACCATGGAAATAAAATTCGATGTATGTTTCATTTCAATGTCA
TTCGACGAAAAAGAAGGAAAAAGTTGAAGAGAAAGAAAGGAAGGCGAGAG
TAAAATATTTAATAAGTTGAATCCTTAATAATATATCTGGCATGATCCTT
TCTTTTCTTTTTACAGATGGGTGTTATGCCGAATCGGTTCCACGGGAAGG
CAAATTAAGCTTCTAATGTCAAATGTTCCTAAAGGGTGTAGAAAACTACC
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