EMLSAT00000000475, EMLSAT00000000475-696322 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000475
Unique NameEMLSAT00000000475-696322
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s106supercontigLSalAtl2s106:86488..94304 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000475 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000475EMLSAG00000000475-683241Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000002095EMLSAE00000002095-711023Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002096EMLSAE00000002096-711024Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto771773auto771773Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000475EMLSAP00000000475Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000475

>EMLSAP00000000475 ID=EMLSAP00000000475|Name=EMLSAP00000000475|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=71bp
MPTRYNIGIKFDFHRQKRPQGLYEEYEGKKICLKRYKGQVQVQNLENIRI
PLEKWLNIARSHLPEKQRIIF
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mRNA from alignment at LSalAtl2s106:86488..94304-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000475-696322 ID=EMLSAT00000000475-696322|Name=EMLSAT00000000475|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7817bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s106:86488..94304- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGCCTACTCGCTACAATATTGGTATTAAGTTTGATTTCCATCGACAAAA ACGTCCTCAAGGGCTCTATGAAGAATATGAAGGCAAGAAAATTTGTTTGA AACGATATAAAGGACAAGTACAAGTCCAGAATCTGGAAAGTGTTTTTCCA AAGGTTAAGATTCTAAGAGGAGGCGAGATAATTCTGTGCATTCTTTAATA TTATATTCCACCTTTGTTTCAAACTATTTCTCGATAAAGTAAAATATGGG CTCAAAAGTCCTTTGTGTGAAGCCCGGCACTTTTCATCACATGTGTTATA ATAGATATTCACATCTACAAATAAACAAAAAAAACAACAACCATAAATCA TAAATAAATTTTATTAAAAATATTCAATTCTCAATTCATGGTGTTATGAG GAGGACCACACAAAGTATATGTAAGTGCTATATGTGAGGTTGTATGTATG TAGTTTGAGGACCCTTGAGTAGTGTATAAAGAAACAACTGCAATAAATAT GCGATTTTATGACCGGACAAAGGAAGCAATTGTACATTTCAAGATCCCTC CATTCCATGAGAATTGAGACATCTTTCAAAGGACCCCCTTGAGCCTCTTT CTCAATACAAGGGTATACAACATACATATATTCTATGTTGAAGATGTACA ATCTAAAAACTCTGTAGGTAAATGTAAATGAATATTTATTTAAGAAAAAA AAAATGGAAATGGAAATAGGGAAAAGTTTCATTTTTTTACTTTCTATATA CTTTTAACATATGTATACTTTACGTATGTAAGGGTAAGGCGATTGAGAAG TAATGAGGCAATTTATTCAAGAAATCATTAAACACTCCCCTTAAAAAAAC AGCTTCTTTAGAAAATTATTTGCAAATATATACATATTTGCAAATCAAAT CTAACAAAAGTAATTTATTTTATTTTATTCATCTCATTACTCACTGTCAT CCAATTGGCAGATCCATACTCTATAGATATTCATTGATAGGTGTGAGCAT TTCAGAAGGCTATTGAATTAAAACCCTTGTTAACAAGATTTGCATTTTCT ATGATTTTGGAGGGAGAAAATATAATAATGCAATAGAGAGCAGAATCTTC AAACATTAGCATTAGTTCAGTAAAATATGTTAAATTCATATTTAAATATA TATATATAACTATTTTGTTATGCGTTAAAAAAAAATAGACCAAAAGTACG CGAGAATTCTTCACTCAAAGGAAGACGTTTATACCACGAGGTTCTATTAT ACAATGAAAAAAAAAGACAGATAACTCGAAATGTTTGACTTATTTTAAAT CACAAAACGGTTATTTTTTTCTACGTTTTGCCCGATCTTAGTCCTGAATA GAGCTTTAAAGGATGCCTTGTCGGTATTTTATAAAAAAAGCCAAATAGGA CCGTGAAAGCCTTGCCAATTTGAAATAATGTTTGGGATGAGAGCAGCTAG CTTTTGTAGAGTTTTATTAGATTTGCTGTTGTGAGAGGATGGAAGTACAC ACAAATTACTCTTTATATCCATTAAGTACATAAGCAGGAATTACTACGAT ATCAATCCTCAATTCTACTTTGACCCCAACATGGACTCTCTCGTATTATG GTCGGACATAGCGTCTAAAGACAAAAGGAAGAACAAAACGTAGAATGAAC AATTTTTATGAGGATAATTCGAAACAAAAAAATTATGGAACAAAGATAAA CCAGTTAATTTTACGGTTAAAAAATTTCTTTATTCGCTTAAATATATATT TGCAGTAAATTTTAGGAACATTTTTAGTTTGTTAATATGCTCAATTGGCG TTATACCTATAGGTTTCACGTTTATTGTATTCTGACTTCAAATTGCTAAG ACTCCATAAGGCGAAAAAAGACTATTGCATGATGGGCTATATAAAGAAAA TTGTTATAACATCTATTGCAAATGTGATAAAAGAAGATAATGTTGGGGCA GAGCCATTACAAACAACAATTTAATCAGCATCATCAAAATTCATGCCTTC AGATCTCTTTGTTTATGCATTTTCTTTATCTCATATTTTTTTTCTTCCAA GATATCCTCATGAAAATGGTCTGTTCTACGTTTTGTCTTTCCACATTTTG TCGTTTGTCCTAGTACCGTTTTTTATGTGAACACGCATTTGTGGTTAAAT GATAATTTATGCTCTCTTTTCAAGAATTTAAAAGTAATGATTTCAGCCTT GGAAAACAAAAGCCCCTGCTCAAAGTGCCAATGACAAAAAGTCTCACACT AGTTTTAGGTTATTATATTTGTTACAATTATAATCATATCTCAGAGGCAT TGTCTCTCGGGATCCCTTTATGTTTTTAAATTTGAAAAATTCCTAATAAA AACTAAATATACTATTGATGAATTATTTTCTTGAAAGTAAATTCTATATA ACTCACATTTAAAAAACAAACAAACAATAACCAAGGAATTGCATTAAGTA CTGCTAAGGAAGTCTATATTAAAAAACAAAAAACAAAAAAAACAACCAAT ATCATTCAAAATACTAAAAATTTTATTAGGATTCATGCCACCGACAACAT CTGGGGAATCAATAAGAGGTTTTTCCGGAGTTGGTTTATTTGTTTAAACT ATTTAGTAGATACAAGTGTTGATGGTTACATACGTATTTGAAGTCTATAG GATGTGGGATCTACCTAATATTATATATTGTGTATAAATTGATAGCCAAA TGATTAGATTTTTATTAAAGCTATTATAATGGTATTTTATTCACGATTAT TAAGATTTATGTATAAAAATGAATACCTATATATATACCTATTAATACAA GGTAAATGAAATAAACATCTTGCATTACTCCGTTATGATTAGATATTAAA AAAAATTTATAATTAAGATCTTTTAATCCCGCAATCCCATGATAAGATTT TTCTTTAAAATTACAATCTGCATATTAGAAATGAACTCATAAGAAATTTG ACCAACTACCAATTAATTGGCTGTTGTTAATCGGCCAATTGTTGGTTAAT TTAATAGTAAATACTAAATATAGTTTAAAAAAGCCCAGTAAACGGCAGCC ATTTTTATAAAAATTTTAAAATATATCTGGCAACACTGCTTTAGCCTTGC ACAGTCTCTCAGTACGGGTACGCTATTCAAAGCTATAAACCAAGTGGCGA AACGTAACCTAAGTGATGAATATTTGAAAGTAGTGGTCTTAACGGCACTT TTTTAGCTCGCTAGGGGCGTCAAGTGCATTTTAATATTATTCTATAACTA ACTACTATCTTCCATGAATTCACCTTTTTTACTGACTCAAAAAGCTGAAT TCTGCAAAGTGAAAAAAAAAAAATATGTCATGAGGGAAAATGATCAAGTG ATATAATAAAAAACGACATCTTGCGTGAGAAAAAGTATATAAACTAGACA AAGAATTACTCAAGGTAACATGCATATATTACCACTCTGTTTTAAAGCAA TATCACTATTATTTTGTAGAGTATGCTCTTAAGTCTGTTATAAATGCAAT CCCATTCATTCCCTTATAAATTAAATTGATAATTGTGGTCCAATAAAACA AAAGCAAGCTTGGATCTGTATTATATTTCCATTTAAAGTAGCCGATATTG ATTGGACAGTTATAAATGATAAATTAACAATTTTTTTATTTGAAAGGTGC AATATGAGGGGCAGTATACAGCTCCTAAATCAAATAAGGTTTCTAATCCA TAGCTAAAGTTCTTGAGTATTTTAAATAACCCCATAAATTTGAATACAAG GCCTATAACTGACTCAAATATGGGCTATGCATATATATGAAGTAAAAACT AAATTGATCTGAGGGCAATAATTATATATACTTCTGTGGGATATATCGTT TTACTTAAAGATCTAAAACTTGTCAAGTAGCTCGTGGAACTATGCTCTTG ATTTTGAATACTTATCGTACACCACATTCCCTTCCATACTATTCCACGTT GAAGTGTATCCCCGGGTAGTATGAATTTTTTTTGAAGAGAGATAAACATC ATAAATTGAAGAGTACTACATTATTTTATCATTGTTGTGTTTTAATTAGT TGATTATTTTTGATACTTTTATGGATGTTTGATCTTGGTTTGGAGATCTA ATTTTAAACTGCAATTTGTAATTATGTTTTGTTTGCCTTAATTCTTTCCA ACATTTTATATTGTTTTGAGGCTATGTGTAGTTATATTATTTTAACTATA GTTGTACATATATCATCAAAATATGAATAAAGACTTTTAAGTTATTTTTT TGGTTATTTTAACTCACCCTATAAGCTTGAGTACAAAACCTATAACTGAC TTAAATATGTCTATGAAATATTTGGGTATGTATGTATATGAAGTACAAAA CTAAATTGGAGTTTTACCCATTTTTTGATTTTGGTTCAAGATTATTTTTA TGTTGATGTTCCACCAATGCTTAGGTCTTGTATTTGCTCATGTTGTTATT CGAGTATTGATCACTAAAGTTGTAAATACTAAGCATTTTTGTAGTTGGCA ATCATTTAATTTCTTATAAAGTAATTGTCAATTACCAATTAATCTGCTTA GAGGCAGATTAATCTGTGAGTACTACTTGCAGAATGCTTGAAATATCAAA TACACACATGTACAAGAATATCTATGTAAGTAATTGTAGATACAGTACGT AAGATTAAAAAAAGCTCGATTTTTTAACTATTAATAGAAAAAGTTGTAAA ATAACAAAAAAAAAACTTTTTACTCTGACAATTTTCTCTTTTTACTTTAT TTCTCTTCTTTAATCTTGGGAAAAGAAACAAAAAAACAAAACAAAAAACG ATAGCAACACTAATGATCAAAATGGAAAAGAATACTTGGTTTTGTTTTAA GTAAAGAAAACAAAAACTTATACAACATACAGTACTCAGAATAGGGGCTC ATTTATATGCATGAATTAGGCATGTAAAAGTATTACTGATTAATTAATAA TTATTATTTTATAAACACTCCAGCGACAAAATTGGCGCTAAAAAAACAAT TTCAAACACAATAAATAAATACTTAAAAATATTCTTATTGAACAAAACAA ATTGTTCCGTTTGCTAGCTCATATTTTTTCCCCTCAGTTCAAACATCTGT TCTGCTGAAAACAATAAAAAAACGGTTCAAAATTTTTTATAGTAAAAATT GACCATTTTGAGCTCCCTTGACCCGCAACAAATACCGGTAGTTGCATAAA TACGCGGACTAATTTTTAAACGCTGAGATCTCGAGGTTCCGTGACCGGAA ATAAAAAATTTCAGCCCAAGTAACTCGGTAAATCTTTTGGCTTTGTTTTG TTTTTCTTACTCGCATCAAACAAAGTCGTTCACAATGAATGACGAGGCCA AACATCATATGGTTGCCACTCTCCTCCGGTCCGGTAGGTCTGTCAAGGAG ATAATCAAGGACACTGGATTATCCAGGACTACTGTTTTCAAGGTCCAGAA GCTTTTCAAGGAGGGAGAAGATCTGAAAGMCCTGCCCATACCTCTGGAAT GACTCAAGATTGGCTCGCTGCCAACATGCCATTTTGGAACAAAAACCTTT GGCCACCTCAATCWCCTGATTTGAATCCCCTTGACTACAGTGTGTGGTGA CAAATTGAGAAGAAGGTCTGTGCTACCCGCTGTCCGAATTTGGACTCATT GAAGGACAGKGYCAATGAGCAATGGGCAGCCATGGAAGACCATTACATCC TCAATGTGTGCAAGGCCTTCCACGGGCGCTTGGAGGGTGTCATAGCAGCT GANNCAAATTGAGAAGAAGGTCTGTGCTACCCGCTGTCCGAATTTGGACT CATTGAAGGACAGTGTCAATGAGCAATGGGCAGCCATGGAAGACCATTAC ATCCTCAATGTGTGCAAGGCCTTCCACGGGCGCTTGGAGGGTGTCATAGC AGCTGATGGCGGKTATATTYAGTAAWTATATTAAATTTNATATCAGAATA AATCCTTTATTATATAATTCTCAAAAAAAATACGTCATACGAATTTTATT ACACATTTAATTATTTGCCACAAATAGTCCGCGTATTTATGCAACTACTG GTATAGTGCTACGAGTCAAAAATTTTACTTTATGTTGTTTTTAGTATTTG GTTTATCAGTAAAAATATTGTAACCCTTGTTTTAAATATGTTAAGGGTTG TAAGATGCACTCAATGATTTGCGGTTTACTTTTTGACCACAGATAATGAT TCTCTTTTTGTTTAACAACTATTAATTAAACTAGGATTACCTTTTACTAA AGGCGTTGCTTCCCTTTATCCATGTGCAGAGATAAATAAAAATATTAGCC ARAAAAAAGGAYTGTCCAATAGGTATCTAATGATSCCCTYTATCCACTCA ATCAAAAAAAAACTTTCTTTACTCTCAATCCTGCTTTTGAAACAGAAACG CAAGAATGCATTTTAATGGGATATTAACCAGATTTATACTATAATATCCC CCNNTTATTGGTCAGATAGAGTTGCACCAATTAAGTATACATTATACAAG GTCTGATGTCAAAGTATTTTCCAATCTGATTAGACAATTTACAAATGATG TACCTTTATCCTTGAAATCAATTCCTTTGTTTTGTCACAATTGCTAAGTT TTGTTTGCATCTTGTTTTAGCCCTTGATTTGGTTAACGCTTTACTCGATC GAAAAGGCTGAATCGTGAGAGTGACAAAGTACAATTTGATTCCGATTTAA TAATGTTAGCAAGGTAAACTTGAGAAGCCTTGATTCAATCATGTATTGGA TTTTTTACCTAATGTAAGGACCAGGGAAGCAAACTTTGTACTGCTTTATT TTTATTAAGTACATAAGTCGTAAATAGTATATTCATCTATGGATATCAGT ACCTTGTGCATTAAGCATTGCTCGGCTACAAAGATTCTATCCATTTTTCT GATTGCATCATATAAAATATAGCAAAAAATGCCTTTATTTCTAATATTTT TTCCGATACCGATACGATGAAGAGATTGGATATTTTATCTGATGTATACG TTTTCCGATTTGGATCCTATATATTGGAATATACTATATATCCTATATAC GTCTAGTAGTACTACAATTAATCTATTTGACTTACGAAATGAATTCAATA TACATATTATATCCAGTCATGTAAATGGTCTAATTTTTTTAGCTTCCCGT TCTGTTTTGGAGTTGATAATCTGAAGGATGAATTTTCTTTTCCTTAAAAG TTGTTGTTTTTATTCAATTCTAGAGTTGCAAACTTCCTTTTCCAAATATA CATTCAATTATGCTCATAACCTGATTGAACATACGTGTGTGCTCTTAAAA GCGTAACCTTGTGGATTTGTTGTGGAGTTACCATTGTAAGTTCTTGTTGA ACTCAGAGTAGAATAGGGGATTCAAACAGGAGTTATTCATGCCAATGTCC TTTTTTATTTCCTACTCCCCCTCTTCCCTTGTCAAAGCTGATTCTAGGTG ATCTCTTCCAAAACATTCTTCATTGTCATTCTCAGGGTTGCCGTGTTGAT CTTCGGTTTCTATTTTTTATCATGCCCATTATATGCACGATTCTCATCAC TAGTTATATGCATATTTCCTTCTCTGGGAGCGACAGGGTATCGAACCTAC ACACATTGAGTTCATTGTCGTTTATGATAAGTATCACTCCTTATTTCTAC TCTTTCGGTAAATCATCTATAACTTTTCATGCCAATTTATTTTCCAGAGC CTGTATCCCTAACAAACTGTTTAATTATATATATATATAGATATAAGAAT CCCTTTAGAAAAGTGGCTTAATATAGCAAGGTCTCATTTGCCGGAAAAAC AAAGGATAATATTTTGA
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