|
Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s106 | supercontig | LSalAtl2s106:86488..94304 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000475 >EMLSAP00000000475 ID=EMLSAP00000000475|Name=EMLSAP00000000475|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=71bp
MPTRYNIGIKFDFHRQKRPQGLYEEYEGKKICLKRYKGQVQVQNLENIRI PLEKWLNIARSHLPEKQRIIF back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s106:86488..94304- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000475-696322 ID=EMLSAT00000000475-696322|Name=EMLSAT00000000475|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7817bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s106:86488..94304- (Lepeophtheirus salmonis) ATGCCTACTCGCTACAATATTGGTATTAAGTTTGATTTCCATCGACAAAA
ACGTCCTCAAGGGCTCTATGAAGAATATGAAGGCAAGAAAATTTGTTTGA
AACGATATAAAGGACAAGTACAAGTCCAGAATCTGGAAAGTGTTTTTCCA
AAGGTTAAGATTCTAAGAGGAGGCGAGATAATTCTGTGCATTCTTTAATA
TTATATTCCACCTTTGTTTCAAACTATTTCTCGATAAAGTAAAATATGGG
CTCAAAAGTCCTTTGTGTGAAGCCCGGCACTTTTCATCACATGTGTTATA
ATAGATATTCACATCTACAAATAAACAAAAAAAACAACAACCATAAATCA
TAAATAAATTTTATTAAAAATATTCAATTCTCAATTCATGGTGTTATGAG
GAGGACCACACAAAGTATATGTAAGTGCTATATGTGAGGTTGTATGTATG
TAGTTTGAGGACCCTTGAGTAGTGTATAAAGAAACAACTGCAATAAATAT
GCGATTTTATGACCGGACAAAGGAAGCAATTGTACATTTCAAGATCCCTC
CATTCCATGAGAATTGAGACATCTTTCAAAGGACCCCCTTGAGCCTCTTT
CTCAATACAAGGGTATACAACATACATATATTCTATGTTGAAGATGTACA
ATCTAAAAACTCTGTAGGTAAATGTAAATGAATATTTATTTAAGAAAAAA
AAAATGGAAATGGAAATAGGGAAAAGTTTCATTTTTTTACTTTCTATATA
CTTTTAACATATGTATACTTTACGTATGTAAGGGTAAGGCGATTGAGAAG
TAATGAGGCAATTTATTCAAGAAATCATTAAACACTCCCCTTAAAAAAAC
AGCTTCTTTAGAAAATTATTTGCAAATATATACATATTTGCAAATCAAAT
CTAACAAAAGTAATTTATTTTATTTTATTCATCTCATTACTCACTGTCAT
CCAATTGGCAGATCCATACTCTATAGATATTCATTGATAGGTGTGAGCAT
TTCAGAAGGCTATTGAATTAAAACCCTTGTTAACAAGATTTGCATTTTCT
ATGATTTTGGAGGGAGAAAATATAATAATGCAATAGAGAGCAGAATCTTC
AAACATTAGCATTAGTTCAGTAAAATATGTTAAATTCATATTTAAATATA
TATATATAACTATTTTGTTATGCGTTAAAAAAAAATAGACCAAAAGTACG
CGAGAATTCTTCACTCAAAGGAAGACGTTTATACCACGAGGTTCTATTAT
ACAATGAAAAAAAAAGACAGATAACTCGAAATGTTTGACTTATTTTAAAT
CACAAAACGGTTATTTTTTTCTACGTTTTGCCCGATCTTAGTCCTGAATA
GAGCTTTAAAGGATGCCTTGTCGGTATTTTATAAAAAAAGCCAAATAGGA
CCGTGAAAGCCTTGCCAATTTGAAATAATGTTTGGGATGAGAGCAGCTAG
CTTTTGTAGAGTTTTATTAGATTTGCTGTTGTGAGAGGATGGAAGTACAC
ACAAATTACTCTTTATATCCATTAAGTACATAAGCAGGAATTACTACGAT
ATCAATCCTCAATTCTACTTTGACCCCAACATGGACTCTCTCGTATTATG
GTCGGACATAGCGTCTAAAGACAAAAGGAAGAACAAAACGTAGAATGAAC
AATTTTTATGAGGATAATTCGAAACAAAAAAATTATGGAACAAAGATAAA
CCAGTTAATTTTACGGTTAAAAAATTTCTTTATTCGCTTAAATATATATT
TGCAGTAAATTTTAGGAACATTTTTAGTTTGTTAATATGCTCAATTGGCG
TTATACCTATAGGTTTCACGTTTATTGTATTCTGACTTCAAATTGCTAAG
ACTCCATAAGGCGAAAAAAGACTATTGCATGATGGGCTATATAAAGAAAA
TTGTTATAACATCTATTGCAAATGTGATAAAAGAAGATAATGTTGGGGCA
GAGCCATTACAAACAACAATTTAATCAGCATCATCAAAATTCATGCCTTC
AGATCTCTTTGTTTATGCATTTTCTTTATCTCATATTTTTTTTCTTCCAA
GATATCCTCATGAAAATGGTCTGTTCTACGTTTTGTCTTTCCACATTTTG
TCGTTTGTCCTAGTACCGTTTTTTATGTGAACACGCATTTGTGGTTAAAT
GATAATTTATGCTCTCTTTTCAAGAATTTAAAAGTAATGATTTCAGCCTT
GGAAAACAAAAGCCCCTGCTCAAAGTGCCAATGACAAAAAGTCTCACACT
AGTTTTAGGTTATTATATTTGTTACAATTATAATCATATCTCAGAGGCAT
TGTCTCTCGGGATCCCTTTATGTTTTTAAATTTGAAAAATTCCTAATAAA
AACTAAATATACTATTGATGAATTATTTTCTTGAAAGTAAATTCTATATA
ACTCACATTTAAAAAACAAACAAACAATAACCAAGGAATTGCATTAAGTA
CTGCTAAGGAAGTCTATATTAAAAAACAAAAAACAAAAAAAACAACCAAT
ATCATTCAAAATACTAAAAATTTTATTAGGATTCATGCCACCGACAACAT
CTGGGGAATCAATAAGAGGTTTTTCCGGAGTTGGTTTATTTGTTTAAACT
ATTTAGTAGATACAAGTGTTGATGGTTACATACGTATTTGAAGTCTATAG
GATGTGGGATCTACCTAATATTATATATTGTGTATAAATTGATAGCCAAA
TGATTAGATTTTTATTAAAGCTATTATAATGGTATTTTATTCACGATTAT
TAAGATTTATGTATAAAAATGAATACCTATATATATACCTATTAATACAA
GGTAAATGAAATAAACATCTTGCATTACTCCGTTATGATTAGATATTAAA
AAAAATTTATAATTAAGATCTTTTAATCCCGCAATCCCATGATAAGATTT
TTCTTTAAAATTACAATCTGCATATTAGAAATGAACTCATAAGAAATTTG
ACCAACTACCAATTAATTGGCTGTTGTTAATCGGCCAATTGTTGGTTAAT
TTAATAGTAAATACTAAATATAGTTTAAAAAAGCCCAGTAAACGGCAGCC
ATTTTTATAAAAATTTTAAAATATATCTGGCAACACTGCTTTAGCCTTGC
ACAGTCTCTCAGTACGGGTACGCTATTCAAAGCTATAAACCAAGTGGCGA
AACGTAACCTAAGTGATGAATATTTGAAAGTAGTGGTCTTAACGGCACTT
TTTTAGCTCGCTAGGGGCGTCAAGTGCATTTTAATATTATTCTATAACTA
ACTACTATCTTCCATGAATTCACCTTTTTTACTGACTCAAAAAGCTGAAT
TCTGCAAAGTGAAAAAAAAAAAATATGTCATGAGGGAAAATGATCAAGTG
ATATAATAAAAAACGACATCTTGCGTGAGAAAAAGTATATAAACTAGACA
AAGAATTACTCAAGGTAACATGCATATATTACCACTCTGTTTTAAAGCAA
TATCACTATTATTTTGTAGAGTATGCTCTTAAGTCTGTTATAAATGCAAT
CCCATTCATTCCCTTATAAATTAAATTGATAATTGTGGTCCAATAAAACA
AAAGCAAGCTTGGATCTGTATTATATTTCCATTTAAAGTAGCCGATATTG
ATTGGACAGTTATAAATGATAAATTAACAATTTTTTTATTTGAAAGGTGC
AATATGAGGGGCAGTATACAGCTCCTAAATCAAATAAGGTTTCTAATCCA
TAGCTAAAGTTCTTGAGTATTTTAAATAACCCCATAAATTTGAATACAAG
GCCTATAACTGACTCAAATATGGGCTATGCATATATATGAAGTAAAAACT
AAATTGATCTGAGGGCAATAATTATATATACTTCTGTGGGATATATCGTT
TTACTTAAAGATCTAAAACTTGTCAAGTAGCTCGTGGAACTATGCTCTTG
ATTTTGAATACTTATCGTACACCACATTCCCTTCCATACTATTCCACGTT
GAAGTGTATCCCCGGGTAGTATGAATTTTTTTTGAAGAGAGATAAACATC
ATAAATTGAAGAGTACTACATTATTTTATCATTGTTGTGTTTTAATTAGT
TGATTATTTTTGATACTTTTATGGATGTTTGATCTTGGTTTGGAGATCTA
ATTTTAAACTGCAATTTGTAATTATGTTTTGTTTGCCTTAATTCTTTCCA
ACATTTTATATTGTTTTGAGGCTATGTGTAGTTATATTATTTTAACTATA
GTTGTACATATATCATCAAAATATGAATAAAGACTTTTAAGTTATTTTTT
TGGTTATTTTAACTCACCCTATAAGCTTGAGTACAAAACCTATAACTGAC
TTAAATATGTCTATGAAATATTTGGGTATGTATGTATATGAAGTACAAAA
CTAAATTGGAGTTTTACCCATTTTTTGATTTTGGTTCAAGATTATTTTTA
TGTTGATGTTCCACCAATGCTTAGGTCTTGTATTTGCTCATGTTGTTATT
CGAGTATTGATCACTAAAGTTGTAAATACTAAGCATTTTTGTAGTTGGCA
ATCATTTAATTTCTTATAAAGTAATTGTCAATTACCAATTAATCTGCTTA
GAGGCAGATTAATCTGTGAGTACTACTTGCAGAATGCTTGAAATATCAAA
TACACACATGTACAAGAATATCTATGTAAGTAATTGTAGATACAGTACGT
AAGATTAAAAAAAGCTCGATTTTTTAACTATTAATAGAAAAAGTTGTAAA
ATAACAAAAAAAAAACTTTTTACTCTGACAATTTTCTCTTTTTACTTTAT
TTCTCTTCTTTAATCTTGGGAAAAGAAACAAAAAAACAAAACAAAAAACG
ATAGCAACACTAATGATCAAAATGGAAAAGAATACTTGGTTTTGTTTTAA
GTAAAGAAAACAAAAACTTATACAACATACAGTACTCAGAATAGGGGCTC
ATTTATATGCATGAATTAGGCATGTAAAAGTATTACTGATTAATTAATAA
TTATTATTTTATAAACACTCCAGCGACAAAATTGGCGCTAAAAAAACAAT
TTCAAACACAATAAATAAATACTTAAAAATATTCTTATTGAACAAAACAA
ATTGTTCCGTTTGCTAGCTCATATTTTTTCCCCTCAGTTCAAACATCTGT
TCTGCTGAAAACAATAAAAAAACGGTTCAAAATTTTTTATAGTAAAAATT
GACCATTTTGAGCTCCCTTGACCCGCAACAAATACCGGTAGTTGCATAAA
TACGCGGACTAATTTTTAAACGCTGAGATCTCGAGGTTCCGTGACCGGAA
ATAAAAAATTTCAGCCCAAGTAACTCGGTAAATCTTTTGGCTTTGTTTTG
TTTTTCTTACTCGCATCAAACAAAGTCGTTCACAATGAATGACGAGGCCA
AACATCATATGGTTGCCACTCTCCTCCGGTCCGGTAGGTCTGTCAAGGAG
ATAATCAAGGACACTGGATTATCCAGGACTACTGTTTTCAAGGTCCAGAA
GCTTTTCAAGGAGGGAGAAGATCTGAAAGMCCTGCCCATACCTCTGGAAT
GACTCAAGATTGGCTCGCTGCCAACATGCCATTTTGGAACAAAAACCTTT
GGCCACCTCAATCWCCTGATTTGAATCCCCTTGACTACAGTGTGTGGTGA
CAAATTGAGAAGAAGGTCTGTGCTACCCGCTGTCCGAATTTGGACTCATT
GAAGGACAGKGYCAATGAGCAATGGGCAGCCATGGAAGACCATTACATCC
TCAATGTGTGCAAGGCCTTCCACGGGCGCTTGGAGGGTGTCATAGCAGCT
GANNCAAATTGAGAAGAAGGTCTGTGCTACCCGCTGTCCGAATTTGGACT
CATTGAAGGACAGTGTCAATGAGCAATGGGCAGCCATGGAAGACCATTAC
ATCCTCAATGTGTGCAAGGCCTTCCACGGGCGCTTGGAGGGTGTCATAGC
AGCTGATGGCGGKTATATTYAGTAAWTATATTAAATTTNATATCAGAATA
AATCCTTTATTATATAATTCTCAAAAAAAATACGTCATACGAATTTTATT
ACACATTTAATTATTTGCCACAAATAGTCCGCGTATTTATGCAACTACTG
GTATAGTGCTACGAGTCAAAAATTTTACTTTATGTTGTTTTTAGTATTTG
GTTTATCAGTAAAAATATTGTAACCCTTGTTTTAAATATGTTAAGGGTTG
TAAGATGCACTCAATGATTTGCGGTTTACTTTTTGACCACAGATAATGAT
TCTCTTTTTGTTTAACAACTATTAATTAAACTAGGATTACCTTTTACTAA
AGGCGTTGCTTCCCTTTATCCATGTGCAGAGATAAATAAAAATATTAGCC
ARAAAAAAGGAYTGTCCAATAGGTATCTAATGATSCCCTYTATCCACTCA
ATCAAAAAAAAACTTTCTTTACTCTCAATCCTGCTTTTGAAACAGAAACG
CAAGAATGCATTTTAATGGGATATTAACCAGATTTATACTATAATATCCC
CCNNTTATTGGTCAGATAGAGTTGCACCAATTAAGTATACATTATACAAG
GTCTGATGTCAAAGTATTTTCCAATCTGATTAGACAATTTACAAATGATG
TACCTTTATCCTTGAAATCAATTCCTTTGTTTTGTCACAATTGCTAAGTT
TTGTTTGCATCTTGTTTTAGCCCTTGATTTGGTTAACGCTTTACTCGATC
GAAAAGGCTGAATCGTGAGAGTGACAAAGTACAATTTGATTCCGATTTAA
TAATGTTAGCAAGGTAAACTTGAGAAGCCTTGATTCAATCATGTATTGGA
TTTTTTACCTAATGTAAGGACCAGGGAAGCAAACTTTGTACTGCTTTATT
TTTATTAAGTACATAAGTCGTAAATAGTATATTCATCTATGGATATCAGT
ACCTTGTGCATTAAGCATTGCTCGGCTACAAAGATTCTATCCATTTTTCT
GATTGCATCATATAAAATATAGCAAAAAATGCCTTTATTTCTAATATTTT
TTCCGATACCGATACGATGAAGAGATTGGATATTTTATCTGATGTATACG
TTTTCCGATTTGGATCCTATATATTGGAATATACTATATATCCTATATAC
GTCTAGTAGTACTACAATTAATCTATTTGACTTACGAAATGAATTCAATA
TACATATTATATCCAGTCATGTAAATGGTCTAATTTTTTTAGCTTCCCGT
TCTGTTTTGGAGTTGATAATCTGAAGGATGAATTTTCTTTTCCTTAAAAG
TTGTTGTTTTTATTCAATTCTAGAGTTGCAAACTTCCTTTTCCAAATATA
CATTCAATTATGCTCATAACCTGATTGAACATACGTGTGTGCTCTTAAAA
GCGTAACCTTGTGGATTTGTTGTGGAGTTACCATTGTAAGTTCTTGTTGA
ACTCAGAGTAGAATAGGGGATTCAAACAGGAGTTATTCATGCCAATGTCC
TTTTTTATTTCCTACTCCCCCTCTTCCCTTGTCAAAGCTGATTCTAGGTG
ATCTCTTCCAAAACATTCTTCATTGTCATTCTCAGGGTTGCCGTGTTGAT
CTTCGGTTTCTATTTTTTATCATGCCCATTATATGCACGATTCTCATCAC
TAGTTATATGCATATTTCCTTCTCTGGGAGCGACAGGGTATCGAACCTAC
ACACATTGAGTTCATTGTCGTTTATGATAAGTATCACTCCTTATTTCTAC
TCTTTCGGTAAATCATCTATAACTTTTCATGCCAATTTATTTTCCAGAGC
CTGTATCCCTAACAAACTGTTTAATTATATATATATATAGATATAAGAAT
CCCTTTAGAAAAGTGGCTTAATATAGCAAGGTCTCATTTGCCGGAAAAAC
AAAGGATAATATTTTGA back to top
|