EMLSAT00000000501, EMLSAT00000000501-696348 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000501
Unique NameEMLSAT00000000501-696348
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1079supercontigLSalAtl2s1079:22787..36043 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000501 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000501EMLSAG00000000501-683267Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000002183EMLSAE00000002183-711111Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002184EMLSAE00000002184-711112Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002185EMLSAE00000002185-711113Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002186EMLSAE00000002186-711114Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002187EMLSAE00000002187-711115Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto769818auto769818Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000501EMLSAP00000000501Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000501

>EMLSAP00000000501 ID=EMLSAP00000000501|Name=EMLSAP00000000501|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=47bp
MFSNGETPSSRRARSEGPIHRIPLLSTVPLKSNNTGSTSGKRDDKKT
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1079:22787..36043+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000501-696348 ID=EMLSAT00000000501-696348|Name=EMLSAT00000000501|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=13257bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1079:22787..36043+ (Lepeophtheirus salmonis)
CCACTCCTTAATTTTATTTCAACTACATACATACTTTATTCTCAGTCATT CGTCTAAGTAACTTATAATATACATAGTTTTTCTATACTTTGAAAGGTTT TTTTCCCCACATCTTGATTTATCAATATTGTTTATTATATTTGTGTGTGT GTTTCTTTGACAGAAATAAGTATTACAATTTGTTATACAACGTGATACCA TTTGTCATATAGTCTTGTATTTGTGATTTAAATCTATCATTTGTATTGTA ATCTTGTGAGTTCCGTGACATAAAGGTGGTGTGTTTTAATAGCAAATGGG GCAATAAAGCAGGAGGTAAAAATGACTATTAATTTTTTATGTTTACTAAG TCAAACATGGAGTTATTAATAACTAAATATGATATTTGACAAATAAATAA TAATTATTATTTTGTACAAAATACACCGTGCAAAAGGGCTTTACCGATAT TTATATTTTTTTAAATATAACTCGGTATTATATTTCATATTAGAGACCTA GGGGAGGAAAAGGTAAAAAGTGGAGGGGGAATCAAGTATGTTTGTATGTT GGTAGAAAGGCTTTGATAATAGAGCTCTATTATTGTTTAGTTCTATTTTT ATTTTTTATTTTTGACTTTGTGAGGTTTCATGTTCTAAGATTGACGTTTT GAAATTTGCAATCTAAAGAAAGCAAAAGAAGTAAAACAAATAATGTTAAA TATTTAGTAAGAAAATTTCCTGGTTTTTTTTGTTTCTTATCCATAGTAAA TATTTTAACAAATATCCCGGTTATCCTCAATTATAAACAATCATTATTTA ATGCTCTTTTTACAGTGTTATTTATGTTAATCTAATTTTAAATATTTTTC GAAAGTACTTCCGGAATATAAAACTCTGATTAACCACATACTTAGCAATA TCAAAGCTACGCTGTGAAAGCTGAACTTAGTCCGTACATATGATGATATG GATAAGTACCTATAATTAGGAATCATCATTTTAACTCTGACTACGCCCTC ATGACCCCATAAAATTTATTGCAATTGTCTACCGTAATTTTAAATATAAT CGTAATATCTGTGTTTATAAATTGGGAAATGAATATGTGCTTTTTTTATT AGACTCTAAATAACCTTGATTTCATAACACATTAAAATAAGGAAAATGAC TGTGTTGAAATGAAGTGTTTTGTTTATAAACCTATTTTAAATTATAAAAT TATTTTGAATTATACATACAAGTATTTAATTTTGCCGATTTTTTATTCAA AATATGTATGCTATAAGAGTTTATTGGCAACATGTAAGATGCATTAAAAA GTAAAAGTAATTTACATCCTCCATACATTAGTTATTCAAGAATCATTTTT TTAAATTTTCCAGCTGCACTCTGAATATCGTAGCACCTACCGATGGCACG AGTTTACTCCAAAACAACAGGATGTTATCAAAAAGCCACCACAGCCAATT AAAGGTACGTACATAAATAGCACGAATTTCTGCAGTCTTTATAGTGCGGT TTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTTTGCAACTTTCCTTATCATTGGGCATTTT ATCATATTGCGTTATTTAACCTTATAACTCAATTAACTTTTTTTTAATTC GTCAATTAACTTTTTCTTATTAGTATTACTTATCAAAATATATGAGTATG TTATATAATTATTTATTTCCTCTACTTTTTGCAGATGACATTAGTTTTTC AAGAAAAAAGAAGCATCCGGATGTAGCTTATCGTAGTCACGACTTTTTTG AATCAGATCTAAGACCTACACTTGTTCCTATTTCTACTTCTAGTGGAGGA GACGAAGCAGATTCAGGAAGAAAAACTAGAGTGAGTTATGGCTTCACTTA AAATCACTGACTGTTTATTACTTAATTATAAATCTATATAAATGCTTGGT TTTAAAATATTTTTATAAAGGAATTAAACATTTGGGAAAAAACAATTTTC AACTTTTCTATAGAAGTTTGCTTATTTCTAAGTACTTGATACAAACTGAG CCAATTTTTAAATACATACATAAAAATATTTATATGTATGTATACAGTTT ATTTCATGCTAAGAATACATATCGAAACATAAATCTAAAAAAAATACAAT CACAGAAAGTATGTGAAGAAAGGAGAACTTAACAAAAAAAAGGACTCCGA AGTCATTCCAACTCTAACTCAAGTGGAAGCCTACCTTGACTTTTTTACTT TTCTCATATTTAAAAAAAACTTATTTCCCAACAAAAACAAGTTCATTTTA TACATTCATAAATACATTTTTGCTTCTATTTTGGATCTCATGTGACCATT TTCTATTATTTTTTAGATTGTTTCAAGTCCAACTCCGATCTAACAAATTA GATAACGATATTTTTTTTTAATGGAAAATACTATAAATCGGTAGGGAATG ATGTGTATAAGATATAAGAAGTTGCACTTGAAACCCTGTAGATAGAATAC AATATCTAACTAAATTATTGATGAAAATCTTGTCAAACTGCAGTTGATGA CTTCATATATCGATTAATTCATTTGTTTTTGTTGATAATGCTATTCAAGG GTATTTATTTATAAATTTATTTCCCTTGTCTTTTAAGGTTGAAATAAAAT ATTTATAGGTATAGTTAGGTACGTTAGCAAAATACAGGGCGCTTCAAATA ATAGACCTTTTTGCCGGAGAAGGAAGCTTTTTCTATAAATTTTAAGTTTG AAAATATATTTGATTTATATTTTTATCATTTTTTAAAGCATTTTATTTTC TCCAAATTTACCCACATACTAACATGCTTTAACTATCATTTGCCAAAAAT TCATAAAGCTGACATGAGCTATCTACTGGATTTTGTATCCCAATAAATCC TACTATAGAATTACAGAAACGGTGAAAAAGAAGTCATAGTTTTTGTAGAA TAAATTTAGGAAATACTACTATCACTGAAAGCCGGAGAATGGAAACCATT AAATAAAGTTAATTATTGCCTTCAAATCTATTTTTTGCAATCTTTACGTA CAGGGGCGTTGCTAGCTTTCKTCCATTTGGGGGGGGGGGCGGCTTAGCCA GAAGGGGAAGAGAAGAGCGAAGACATAGAAAGAAGGAGAGATATATAGAA AGAAAAAAGGAAAAGGAGGTTTTATTATCATCAAAAACAGGCTCCTAATT ACATCCGAGGCCGCAAAAAATATTATAAGAACATTTTTTGTTATTTAAAC ATCCACTTGCTAAATTTCAAATTGATTTGTTCGACATAAAAAACATACTT ATTAATATATATTAGATATGATAAAAATTTGGGAGCGGTTTCAGAAACTT TTAGAGGGGCTTAAGCCTCCTCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAGGGCTATC AACACCACRATTTATCTATAGTCATTTTTAAACATGGTTTGAAATGCCTG CTATAAAGAAATATGTATATTACGATAACAACCTTTTTGAAAGAAATGAA TCATTGATGAATTCATTCATAATTAACATATGTTAAGAAAGGTCTTTGTA TTATTAAAATATGTTATTAATTACCTCAACATCATTGGATAAAATATTTT ATTACTTAATTATTCTTACCATTTGTTTAATTTTATTTATTTCCAAACTT TTTAAAGGTTACCTTCTAATTCAAAATGCATAAATATGCAAATTAGAATA CAAATTTTTTATTATCACTAACAAAAATAAAATTAACTACTAAGGTTTAT GTACTTATGTACATAGAGAACAAAAAAGAAAAGAAAGCCTTATTCCTAAG TATTCGATAATAAAGAAGGATTGAAGAACTCAGCATGCTTTTTAATTATA TATATAATATAATATAATGGTTCCCTATAGAATAATCCTTGTTTCATTGA TTAATTACGACACCATGTCTAATTTAATTGTCTACCTTTTTAAAATGCAT TTGTAATGGTTGTTTTTTTTGTTATATATTTACTGATATTTTTCTGACAA AAAATCAAATTCAAGCTTATTTTTTTTCCTTTATGTCATTGACAGAAAAA ATCAAGATATAAATATATAATATTTCAAGATACTTTTGTACACTGATATT GATTAAAAAAACTTAAAAAACAAAAGGAGCAAGATATAAAAAAACTTTTT TTGATGTTTTGTCTTTTTTAAGTATAATTTTAAGAAATGATATTATTTGT TGATAGGAAATGTTTTTAGTATATAATAGAGTCTTTTTAAGTGCATACAT TATGATACTTTTGATATGCACTTTAGAATTATTCAAAACAATGGAATTTT GAATGGAGGAAAGCGTTGTCTCTGTATTTGCATCAATTTAGACAAATAAT ATTTTGAGATGTTGATATTAACAGAATGCATTGGTTTAAACGATTTTGGT ATTGAGTAATATAAAGACGACATAGCATATAAGCTCTTTCGAACAATTCA TATATCTTTTAATGATTGAAGATTATTAAAATTTAAAATAGAATAAAAGC TTTGACTCAAATTGAGTAGCTGTTAATTTATAATCTAATTTAGTCTAACA TGTACTTCTACAATTAATATGTCCATAAATTTTAGGTTTCAGTAAAACCC CTGCATTATTCCATAGGTTAATAAGAGGAAAAATATTAATGCATTCATAT TTCCTTAATTTGTAAGTCGATTATTGAAACTCAAAATTGAGTAAATGTGT TGACTAAAATTAAGTTATTTTTATTTCAAAAATAAAATTAATAAAGCAAA TACATAAATAACCAAAGGCCCATAAATATCAATTTTTAATATCACACTAC 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CTTTTAAAAAATATATATACATTTTTTAAAAAAAAACTTTCAAGTATGTA TGTAGATTGTACATTTGAAACAATACCAAATTTTTTATTTTTTTTTCAAA ATTGAAAATTGTTTTTTCTGTATATATGATTTTTAATACTGAGTGAATTT TCTTAATAAATTATACTTTCTTTATGTTTGCACGAGTGTTTGCTTTCATA TTTACAGCCAATCCGACGTAACAATAAAATGTTTTCTAACGGTGAGACAC CATCAAGTCGACGAGCTAGATCCGAAGGGCCTATCCATCGAATCCCTCTT TTGTCAACAGTTCCTTTAAAGTCAAATAACACAGGAAGTACTTCAGGCAA AAGAGATGATAAAAAGGTGAGGTTCACATCTATGACAAAAACTATTTTTA GGGTGTGTTTTTGTTATTTTTTTTTTTTTTGTTTGTTTAATTTTAACATT TTGATGAAAAATGAGATTGAAAGGAGATAACACACATAATATATTGTGAC AAAAAGAATAGATTTTTCACAACCGAATTTTAAAAAGTAAAAATTGATAA GTGTTGTTTTTTTTTACATATGTGTAGGAAAAGTAATAAATAGAGCTGAA AAAATTGACCTGCCGATATTCTAAAAAAAGAAACTGAAAATTGGATGCTA AGCATCATAATTTGATTTTTTTGGGTTGGGGAAAGGTACTTAGCTGACAT TTTATTAGATTAGCTGTGATCAGCTATGAGAAGAAGGAACTAAACAAAAA TCCCACTCCTTATCTAGCAGGAACACTTAAAAAAAATACTCAGACGTTTA TCTTAATTCTACTCTAAAACCAACTGGGGTTTACTCTTATAACTTCTCAA GAAATAAATATTGTTACTCTGAGTCTTTCATGAGCACAGGCACCAGTGTT TTTTCTTCATACTTAAATGCTCTCCCCTAAGATTGAAAGAATAAAGATAA 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TAAGAGGACAACCCTAAGACCTCCCTCACAACCCTTCTGATTGTCCCCTC GTCCACGTCAAACTCGTTAGAGAGGCGATTCATGGATTTTGTGAGGTATT TCTTGATCTTCTTCTTCAGTTCCCCCAGAAACTCAGAATCCCTTTTCAAG TTGTGTCCCCCACTTCCTTCTTTCCGTGAGAGGTCTTTTGTATCCTTTTT CATCTTGGCCACTTTAAAAATGAGGCTCCTTGAGTACTTGACAATGTCCA TAATCTCTGCCACCTCAATTTCTGCATCCAGAAGGTCTGAGATCATCTGC TTTTTTTGCTTCTTGCTCACTCATGACGAAAGATTTGAGAAATGTTTATT ATTGTTTACTTGTGCAAAAAGAACAGGAGATATGCAGGGAAAAATAACAA AACCTCTCTTTTTTAATTACATAATTTGCATTTATTAATAGTCCACGTTT TGCTTCCGAACCCTGTATGTATATTTATAACTTATATGTTATGTACTTAT AAATGATTACAGAATAAAATGGCTATGCAAAAATAAGAAAAATTGAAAAA AAAAAGTAAATTTCTTGTAAGATCATAAGTAAGTTATAAAGAAGCATTAT TTATCGACACCTTTATAATATATGACATAATATTTATGTTTTCAAATAAA TTTTGATTCATTTAACCATAAATGAAGACAAGTGTATTTGAAATTTTTTT TACCTACTCCTGTTATCCTATAATACGAGTAGCTTGTCGTCAACACATCG ATTATCTAATCATAAAATAAACGGCACAACATTTCGTCCCAGGTGTGATA TTTTTAGTATTTTTAAATTTACCGAACAAAATTTGTCAAATGAATTTTTA CAGTTCCGACTCAGTTTGATCCCTGTTTACGGCCTATTCAAGAGATAAAA CAAAGTAAAATGGAGGCTGGAAATTATCTCTGCCAGGAAAGTAGAACGGG GATTTTAAGGGGAAATTTGACTCTTTACCTAGTGCCCATTCTGGTGTATT TATTGTTTTTTAAAAAAATATAAAACTAGAGATTCAGAAAAAAACAAGGG TGACAATATCACTCTTTGTTAAATCTCAGGATGCTCTTAATGTGTCCATA AAATAAAGTAATGAGATACTACTTATGTCCACATACATTTATTATAACAT TTTTTCCACTTTGAAACTTTTCCCTTCCTTTACCATTTTTCCCTGACACC CATAAAGATGCATATGTATATAAGATTACTTGAAATATTTAAATTTTCAG TTTAATTGAATACAAAATATATAAGCTCTTCATAATTGAATTTCCCAAAT TGGGCGTTATTTTTGACACGCATTGAAAAATTAAGTATTTTTGTCTTACT ATTAAGTTAACAACTGGAATATGAATCATCAACAATACCAAGACATAAAT ATGAATTACTTTCAAGTTGAAGAAGTTTGTATTCTTATACCAATAACTGA AGTTAACATTTTCATGGAAGCAATAAAACCCGATTCAAATGTTTGTGTTA ATATTGAACCCTATTATTGTTTCTTTTTTACTAGCCTTATCGAAACCATA TAGTTATAANCATTTTGAAAAGTGAGACCTTTATGGTTCTTTGCATAATT ACACTTTGCTAATATTTAATCCTATAAAGAAATTGTATCATATAGATATA CAACTAGATTTACCCGTCATTGATCTGAGTTATTASGSWTTSRTGAACAT TGCTTTAATATGCTTTATTTTTTAATATGTTTTGTTGAGTTATACACGGT CGTAGCTACACTGTTATTTTTTGGATTGCTCAGTTTTAACACACTCAAAA ATAAGTACATCGGGACATACAAGCTTTGATTAATTACTAAACATAAAATT ATCTACCCTCTATTTGAGAAATTTAACTATTTGACATGATGATATATATT 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ATGCCACTTATTAAGAAAACAGTGAGAATAGGTTTACCAAAAGTGTGAAG TCTGTACGAAGTAACCAAAACAAGTAATTCTTTATAAATAAGAAACTGTA GACCTGCAACTCCTAAGTGTACTAAAGTTTATCAGGCTATATGAACATTT TGTTTTTTGTAATCTGTAAAATAAAGTATGTTCAGGTATTCCATTATTTT GTGGAAAAAACTTTGTAGCTATTTGTATTTCTATTTTTTTAATCCTTCAT TTTCTAAACTTTATTCATTTTTCTCAAGGCTAAATTAATTAAATGCGTAT GACTGTTATCCTCTTTTTGATATGATATATACATATGTAAATTTGAGTCA CACCACATTTTATAAATGTGATATAAACAAAATTTATGGATTTTTAAAAT GTGTTTTCTACTCTTTTTTTCTTTAGGAAAGTTCTCATCCTCCTGCAGCG CCTTCTAGCAAATGGAATTCTACTGAAAACAGGTGTGTTACTTTCGATAT AATAATAATTACTTTCCAAAAAAAAAAATATATATATTGAAACAATTTTT GCGTTTATGATTAGGATCTCAAGGGGGTTGTAATTTACTATTTCTGGCCC ATTTAAAAATAACTTACATATAAAGTACTTTTATTGATGTCACAGATAAT ATGAAAAATAAAAAACTTCGCGATTTTATGGGTATTAAAGATGGCACTTC TTTAATTCACCTTATTTTCAGTTATTAACAGCTTTCAAAAGACTGCTATG AAAGTTTTAGGGTAATATGTTCTTTAGTTTGTGAGTTATTCTTCTAAATT CGACACTACTTTTGTTATTTTCTAAATAATTGATCAAAAACTATTTTGTT TATTAATTTTACACTGCTTTTTGAAGGGAAAAATACAAATCTAGGAAATC AATGGCTTCAAAAGTGTTATGGGAGCATAAAGCTAATAAAAAATAATAAT 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CATCTATCTAATTAACCCATTGCAGGAATTATTATCACAATTTGTCTTTA TAATACTTACTATCAAGACCCTGACACATTGGAGAAACGCATTAGAAATA TTTCATGGTTGGTTATGGCTATGAGGGCACTGACTGACTCATAGAAATCC ATCTTTCTTCTGTTCCTTACTGGGTCTTCTTTTCATTACAAAGATAACAA CTCGTACAGATGATGACTTGAGGGTTGTCAGTAGTCCTTTGCAACGTCAC AAATGGGTAGCTTTTGAAGCTGGCTTCATAAATTGGCTCTCCAAATTTTA AAAAAAAAACACTTACAAATTATCTTTTTAACCAATTTTAACACTGTGAA AATTTGCACAAACACAACAAGGTTGTATGTGGATACAACCTTGTTGTGTT TGTGCAAATTGACAAATTTTGGTTCGTAGCTTTTTTAGCATTCTAGTGTT GAATTTCGGATTCTTGTCGAATTCAGACTTTTAGTAAAGATATTTGCTGT CTTCAATAAGATTCAGTAACAAGAAAGTCGAAATCTGCTGCCGTTTGATC TCTTTTATTGTCATTAATTAAGTTATAAGAACATACTTTTTTTAAACTTT TTCTTTATATTTAATGTAACTTTTTTTTCTTCTAACAAATGGTATAAATC ATTATACATTTTTCTTGTAAACAGTTTTGACCCTAAATTATGAAGGATAA ATTATGAATTAATATATAATCATATCATTAAATAATGCACAGGTGAAATT CTTAACCAAATATTAGATGGGCTGTGAATTAATGAAATATACTATAGAAA TAATACGATCCTTTTAATTTACATTTAATGAAATGTTGAGTAGTAAAATA TCTTTTTTATATTCATAGACATAAAGCCATGAAGGAATCATTATCAATGG GTCAGAT
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