EMLSAT00000000540, EMLSAT00000000540-696387 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000540
Unique NameEMLSAT00000000540-696387
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1088supercontigLSalAtl2s1088:53016..73480 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000540 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000540EMLSAG00000000540-683306Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000002329EMLSAE00000002329-711257Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002330EMLSAE00000002330-711258Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002331EMLSAE00000002331-711259Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002332EMLSAE00000002332-711260Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002333EMLSAE00000002333-711261Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002334EMLSAE00000002334-711262Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002335EMLSAE00000002335-711263Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto771330auto771330Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000540EMLSAP00000000540Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000540

>EMLSAP00000000540 ID=EMLSAP00000000540|Name=EMLSAP00000000540|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=378bp
MFMMTGTNNPALSYQDNESEKDHNVLCSYANNVVSIPSSLAHLRKENESS
SSTYSTFIQSALIHFEIIKNIQNGLLSAAQLPHNNYWSNAYHNYYDQQHN
QSQQQQINGXGYXASTTNNNGSNPPQGLQYQRNEKLNLESPPTPESILSG
EDSNPSSPTNTSLSEERRKSIELSTPVQSHSKVQKIQSRAKEGRECVNCG
ATSTPLWRRDGNGHYLCNACGLYYKMNGSNRPLVKPKNSRVSTSKREGTV
CSNCKTNQTTLWRRTPSGETVCNACGLYQKLHNTPRPITLKKECIQTRNR
KMTTSSTNKSESSXSHPXVYAYNXSHHNRQQDQSQSSTNNTHHNLHLRYQ
QQQQQMYHSNNPSQSSLQLATSSSSNFK
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1088:53016..73480+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000540-696387 ID=EMLSAT00000000540-696387|Name=EMLSAT00000000540|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=20465bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1088:53016..73480+ (Lepeophtheirus salmonis)
CAACAGCCCGCTTCCAGGATACGAAGAAAATACATTGATATTAATAAGTT AATTTCTGTTGTATGATCTATAAAAATCAAATTATTGATCAAAGTGGTGA TAATCTCATTATTAGTTCATGATATAAAAGGTGGCATTCTTCATCTTCTT CCATCATCATCCAACCATCCAGTGAGTCAATCAAAGGACAAACTATTATA CGAATTTTAGAGACAGAATAACACACTTTTTTCTTCCTGGATCCATGGTG TAGCGGTGATGTTGTTTTCTTATAGCTTCCTAAGAAAAAAATAAAACATC ACATCACGAAAAAAGAAGGAAAAGTTTTAAAAAAATGTAAGTTTTTCTTT TTTTTTTTGTATCTTTTCAAATGATAACTGAATATTTTTTAAAGTGATAA TATCTTTTTACATTTAATGATACGACCAAACATAATGCAAAAACATACGC CATAATGACATTGCATTCCTTAGTTTGTGAATTAATGTGATACTACCTTT AAAGTTTTTGAGAAACATAAAAACACTCCCTATGTAACTAGGTAGCTAGA GTTGTAAAAAAAAAAACCATTTATTTATTGTCGAAACTCTGCATCTTAAT TGGTTAAGAGAGATTTATATACTTCTTTTTGAAGTTTCCTCCCTCTTTTT AAGAAAGGTTTTTACGTATGTAGATGATCCACTAGCTCTCCGTTTATTCT TTAAATATTATTGAGTCGTTCAATAAACATATTTTATTAAAATTAATTGT AAAAGTTATTTATTGGCTTCCTTATTTGAACTTTGAATCAATCTCTCTTT TATACATCATTTTAGATACACATATCTGTATAATAGCTGTAAGACTGTTT GTAGTCTGACTGTTGTAATGTTTTTCTTCTTGATGCGTCCTTGCAAAATG AAGTGAAACCTTGATGAGTCTCGGACAAAAAAATATTAAATAAATAAGAT GTAATAGCGCAAATGTAGAGATATCATTTATTCGATATATTTGACTTCCA AATCACAAAATATATATATATATATATACTTAAATCAATAGCTCTATACA ACGAGTTTTATAACATCAGTTGAGTACATAAATATATTTATTTAAGTAAG GTACTTTGATATAGTGTAAGCGTTAGTTGATGTGTTTAAAAAAAAACACA TATTTATTTTAATATAATATTGTTATTTGATTTCTATGATATTATTATTA TTCTCTTTAATTGTGTCTCAGTGTGTATTTCTTCTCTGTGAAAAGGCAGA CAAATACTTGTTGCTTTAAAGTGAGTCAAGGAATTTGAAGTTTGGTTGCG TTTATAATAAATCCACTTTCTCACTCTCTATACTGTTTGGGTAAGATAAG TACTAAGCAGCATAAATCATTCCTAATATAAAGTGGTGTTAACTGAAAAA AAGAATGGAAAGAAACATGTTAAGATAAGGATTGTCTGATAGATTGATTA TACACTCTATGTACAAATGATAGGTATAATACTTTCTGTACTTATTTACC CCATTTTGATCGTAAATATTAAATAATACTCAGTCAACAATCAACAATAT TAGAGGCAAAATCAAATTAAAGCAAGTATGACGTCATAGTTCTAAACTTT AATAATTATCAGATCATAATAATTCATCACCAGTCATTGTCCAGTGTAAT ATGTATGACGTGAGAGTTTTAAATTATGCACGGTCCTTATTGATGAACTT TAATATACATTATATATACGAGCCTTGTTCTTATTAATAGCAATAAATAA TTGTCTCTTTACATTATTTTTTGTCTTGAGGGAATTGCTTTTTGATAAGA GCTATAAAATATTTATTTTATTTTTCAATCAATATTATATGTATGTAGGT AACTATTAACATTATTATATCACTCAGGTATTTGAACAATTTTTATATAT TTGTACATAGGAAAGTAATGAATGGTTTCTATTTTTATCTTTCAATCACT TTAGATAAGAACTTAATCGTTACTGTATGTATTTTATCATCATTTTTCTA TTTATACGTATAATATCTACGTACTTTCATGGTCACAGTTTGATACTTGG AGCTTCCAGATCCCTGACTACGGGGAGTACACTCTCCTTGACTAAAATTT TGAAATATTTGCTGTTAAAGACAACTGTTGTTGTCAAAAAATGAAGTATT ATTGTCAAAATTTAATATATATATATATATTGCTAGCGGTAGTCCCGCCA TTGCCAAAGTTATTAGGCGTCGACGAACATACACATTTTGCTTTTAATAA TATAGTTAGATAACTCCCAGAGAAATTCTTGGTATTACTCTCCGTTTTGC ATGAGCATACTCACACGTAATTACTCACTATGTACTTAGACGTTCTCTCC TCAAGAATAAAAAATAATAATAACGGACTGAGAAAAAAAATGAGACAGAG AGCATTTTAGCTCTTTGTTAAATCTCATCTACAGTCATATTCTTTTTTTT TAAATGCTATACAAAGTACTTCCCTTTTTTTCCCTTGAACTATAGACCTG TGAAGTTTTATTCATTTTATACAGTGTTCCCTGTATATTATACTGCCTTG TTTTATTGTGTTTACTTTTTTGGTTTGATATACACGAGGGAGCACTAGAT ACTGTGCACTTTGTGACTGCTCTTTATGCATACATGCACTTAAATCTTGC TCTATTAATACAGATAATTAATTTGTCTCGATTTTCGTTCGATAATTATT ATTTAATAGTAACAAAAAAAAAAGTTTTCAATTTTTTTAATAAAGTGTCA AAATATTTTTTCAAAAGTTTTTGTTAAAAAGAATGAAGTAAACCCAGATT TTATGTAAGCTCATATGTAGAGCATAGTCTTAGGAACTGGGAAACTTTTT TCAATGGGGGTAAGCGTTGTTTACTTATATTTGTTTGTAAATAAAGCGAC AGAGAGTAGAGCGGTCTTGTGGCAAAAAAATAAATCAACTACCTCAAATA TATTATTTAATACAAAATAATATAAGCAAAGATGGAATACTTGTCTTAAT CCTCGTGAGTGTAAATCAAAAAGAAATTTATATGTTGGCAACTTTCTTGG ACGACATATCTACTGAGAAAGATCACTAAATAAAGTATAGTGCTCCTTAA TTAATATTTACATCCCCAAATATAGCATACTTTACTCACATAGAGAGCAC TGTAAATATTCTTCTGAGCCAAGCTAAAGACTGTCACACCACCTTGCGGA TAGTAAATAATCATTTTTAGTTTGCTCATACCCAATTGCTAGACCTCTTA TCTAAAATGGGCTCTCTTAGGCCTTGAATCCCCATCCTTCCTCAATCAAT TACAAAACCATATACTCGTACTTGTTGTGATAAAGTTCCAACTTCGTACA AGTTGCAAATTATTCTTCCTAAAATGCAATTTTTAATAAAAACACTACCG ACCATTTTAATTAACAGCTACTTATTGATGAATTGTATTAGTAAACTTAC TCATTTAGTATCTATTTACGAGTATGTGATATAAATCTATGGATTTGAAC TTTATAATGTCCCACATATTACTCGTCAATTAATTATTTTTATAAGAAAA TTATAGTATTACTGTTTTAATGTGTATATGAAGCATTGATTGAAAATCTA ATCATTGTATTATCTTTGCCACAAGTACTCAAAATCTTCATCTCATTTTT TCAATATTACTTTTGCATACATACAATCTGATTATTCAAATTAAAACGTG TACACGAGATATTGTATCAGGAGTGGAGTTATGATTGGTGGGACTAGACC AGTCATTTTTTATTTCATAAATGCATTGCAAAATTGTGGGGATTTGGGGA 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GTTTAAAATTTGATATTATGTCAAATTTGGATTGGATAGAGGGCGCCCTT GTTGTTATTCTCGTACATCAAAGAGKTCCTACAATTTGAAATGTGCTTAC GATTCGGAGGTTTTAGTAGAATAAAGTTTAAAACTATATTTATATTTAAG CAGAGGTGTTGCTAATTTTCATCATTTGGGGGGGACTAGGCCCCAAAAAT GTTCAACACCGTCATACTTTTATAAATAGGTTTGTTTTAAATATATGATT AACATTTTGTGGGAGCTTTTAGAAACTTTTTTCGGGGACTTGAGCCACCC TTAAAAGAAGCTAACTATACATTTGTATTTCAGTTGGAGGAAAGGGGATG TAACCAGTGTTACTTTCGTTTTGTTTTGTCATATTTAATACCGTCTTTTT CGGATTTAGCTTCGTATTTATTTCGTCAAGAAAATATTTTTTTTTTAAAC CGACTCAACATTTAAAACAAAATACTACGTTTCTTCTCGTCATCCTCATA CAAATAACATTCGTTAACACTGGGCATAAGCATTGTTTTGTGTGGACACG ATTCCCAAATGCCCCCTCAATTAGGAAATTGAAAGCTTTTGTATAGGTGA ATTAATCCTCGTTTTCATTGTAAGATTCAATAGACATAATTATAGTGTCA ATCAGAAACTTGTAGCAATGATAAATAGAGTAATTCTGCAGTTTTCACTC TCTTTTTTTTGCCTAATCAGGGTTTCCTCTCACTAATAAGTCGTCTATGT ATGAATTATTATTTATTCGTATCAGTCTGAGTCACATACTACGTCCTTTC AAATCATTTTTTAAAATAATATTTACTCTCTCTAAATATACACATACATC ATAGAATGACAATCAATTTGAATATCTTCTCACAGAGTAGTACGATGTTC TGGTGGCGTTGTTGACAAAGATAGTTTGCTATAATACATAACATAACATA 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GCATTGAAAAAGCTCATCGGGAAGAGAATTAGCCTTTCTTTTTATAATAT AAATATCATTTACATTCAATAAAGGAAGACAAATTATTTTATCAATTGTT ATTCTTCGAAATTTACAGGAATTGTATTTTTTAATTACTATTTAAAATAT TAATGAATCGTCCCATCTTGTAAGTTTGTTTTTTGGTGTTATCACAAATT GAATCCAAAACAGTCGAACAGATCAGTATGAAACTTAGCAAGTAGACGTG TAAAATAACCAAGCATGTTCTTATAATAATTTTTTGGGCCACCAAGGTCA TTAAGAGTCTCTTTTTGACCAAAATAAAACCCTCCTTTTTGTTTATCTTT TTCTATATCTATCTCCTTCTCTCTGTCTCCCCCCTCTTCTTTTCTCCCTC TGTCTCTTTCTACATCCCTCTCTCCATCTCTTTTCTACAACTTTTATTCT TTGTTTCTATTCCCCTACGTTCAGCCCCGCGAAGCTGGCAACCTTTGCGT ACAGATATTATTATATTGCATAAATACGCGGACTATTTTTGGCAAATAAT TAAATGTGTAGTAAAATTCGTATGACGTATTTTTTTTTCTAGAATTATAT AATAGAGAATTTATTCTGGTATAAAATTTAATATAATGACTGAATATAAC CGCCATCAGCTGGTATGAAACCCTCCATGCGCCCGCGGAAGGCCTTGCAC ATATTGATGATGTAATGGTCTTCCATGGATGCCCATTGCTCATTGGCGCT GGCCTTCAATGAGTCCAAATTCGGGTGGCGAGTAGCACAGGCCTTCTTCT CAATTTGCCACCACACACTGTAGTCAAGGAGATTGAAATCAGGTGATTGA GGTGGCCAAATGTTTTTGTGAAGGCCTTCTTCACCTCATCCGCATTGATT TTCCGTGGTTTGCCGGTCCCAACACCCTCCTTCATATATTTTTTCTCCTT 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