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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s108 | supercontig | LSalAtl2s108:303359..316843 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000548 >EMLSAP00000000548 ID=EMLSAP00000000548|Name=EMLSAP00000000548|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=72bp
MYHKYQPVEHTKYLIKNVKSIKKDIAKIFASLFEDSTMRAIEEKTDFVAR
ISYEDSWCRADPSIRISNSTYA back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s108:303359..316843+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000548-696395 ID=EMLSAT00000000548-696395|Name=EMLSAT00000000548|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=13485bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s108:303359..316843+ (Lepeophtheirus salmonis)
CTCCTCGTTAGTTGTATGAAATGAATTACGAGCGTGCGATTCATGGCAAT
ATTACGTGTGTAATACTTTACTTAAAAATAATGATGAGGAACAGTTGATG
AATCAACAATGTTGTTTTAACCCAGTAGCCCAAAAGTTCCTTTTATAGTA
ATACAGTAATAATCTCTCAAATTCTACATATTACACAATAACTCCTTTTA
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TGTGCATACCATTTTTTTGCAAGAAAAAAAAAGAAGATTATTTGGCGGGA
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TGATCATTTCTTTGGAAACGCCGCAAAATCGTATGATTCCCTGAGCCTTT
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AAAGTATCATATATAAAATGAAGGCTCCAGACTACATTTATATTTTTAAT
TCTATTAAATTCTACCTTAAGGATTTTAGGAAGGGATTGCATGGAATCTT
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TGTCAACATTTATAGCTTGAATTTCAAACAATATGTCATGAATATTTGTT
TGTATATGATTCATTTTAATTAATAATTAAATATAATATTAAGTGTTTAT
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AAAACTGTTATTATCTTATTTTTATTAAAAAAATTGTATTAATCTTTTGA
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ATTGTTTTTGACATGGAGGATAATAGACATGAAGTAGCTGCTCTGCTTCA
TGCAGGAATAAGCCACAAGGAGATCTCTGAGGCCACCAGCATGTCCACCA
GCACCATTGGCAGGGTCAAGAGGAGGTTGGACAAGGGGAAGGCCTTGAAG
ACAAGCCTCGAAGTAGGAGACCTGTCTTAAAGGCCACCAAGGCCACAAAG
AAGAAGATTAGGGCCCAGATCAAGATAAACCCTCTTCTGAGCATCAGAAC
AATTGCCAAGAAGAACAACATGGGGAAGACTACTGCTGCCAACATTGTCA
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ATGGCCGATATGGAGGCCAGATACATCCGATGCAAGAAGATTTTGAACAA
CATGAAAAGTAATGGGGACAGAATTCTCATTTTTTCCGATGATAAAACTT
TTACAGTGGATCCAGTCTTCAACCGCAAAAATGATCGCTACATTTGACTT
AATGGTTATGTGGAATCTGAGAAATATGTGTCCATGACCAAMCKCCCAGC
CAGCATCATGATGCTTGGAGTTGTTTGCTCAGATGGTAAAGCCAGCATCA
TGATGCTTGGAGTTGTTGGCTCAGATGGTAAAGCCATGCCTCCAGTCTTC
ATCCGAGAGGGCTACAGGCTCACCTCGGAGGACTACATCAAGGTGGTCCC
ATGGATCAGGAAGGAGTATCCTGGCAAGAGGGTGTTGTTCCAGCAGGATG
GGGCACCCGCACACACAGCCAAGAACACCCAGAAGTGGTTGAAGGAGAAT
GTGGATTTCTGGCCTAAGGACTTCTGGTCCCCCTTCTCCCCCGACCTGAA
CCCCTTGGATTTCAGCATATGGGCGCAGGCTTGCAAAAAACGCCACAGCA
GTACCAAAGCTCTCAAGGCCAGTATCACTAAGGCCAAGGGCAAAATAGAT
GCAATACATCAAGAACACCTGCTCCTCCTTCCGTCCCCGTGTTGTGGCTG
TTATGGYATCTAAAGGCCAAATTGTTAAAAACATACTATAGATTATAACC
AAGCCAAGTTTTTTTATTAAAAACATTTCTCTGTATATCTACTTTTAGTC
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GACACCCGGTATAATATAAATAGGAATAAACAGACATTTGACACCATATT
ACAATTACAATTACTTGACTAAAATAAATTCATACTTTTTTTAAATCATT
GAAAAAGATGACTTCAAATGCACGCCTTATAAATTGAATAGGAAATCAAT
TGTGAAATTAATTTAACAACTAAAAACTATTGGAAAAAAAAATTAAAAAA
CTAACAGTAATAAACTAAATATGAGAAATTGATTCATTTTGAAACTTTCT
AAAATTGCGAACCAATCAACTAAGGAACTTTGAGCTTCTACTTGAACAAT
ATTGAATAATATCTTATTAAACCTCCAGCATAGCACCATGAAGTTAAACC
AGTATTAGGAATCTTGATTAAAAATGATGAATATCTTGCTGCAGCTGAAA
TCATTATTGTCCTAAGATTTTCTACCCTGATGGGCTCTGCAATAGGTAAT
TTTTCAGCTATAAAGCTTTTAAAGCTTCTAATAGTATGTTCAAATACTCA
ATTTTTAGCATTACGTCTTTTCGAAGGGAGTCCAAATAATAATAAAGGGG
AGACAAACTTCGCCGTAATCTTTGGAAAATTCAGTGTGACAAACTCTCTT
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CATTGAATCAAAATCCTTACAGGGAGCGTCAAAATAAATGCAGCCTGATT
AAATTTGAAATTGGCAAGTAAATTTTTTCCCATACTTTATGTTAGAGATT
GACCATAATTCTGCTTGTTCATTCACAAGGTGAATCTAGTAACACTAGAA
AATAATCACATATTCTTGTAGCTTCTGCTTCTGTTTGAGACAAATAATTC
ATTACCAATTGCCACGGTACAGGTAGCAAATGATTTAATGCTGCTCTTTT
AAGTGGGAACATACATTTTTGGTAACTAAACACTGAGCCATCGCCAATAT
CGTGAATTGTAATAATATATATATATATATTTTTTTTTGGATAAAGCCTC
TAATTCCAGCTTTGGCAGGNATAACTTGTTTTTAAAGAAAACTTTTTACT
CACAATTCCGACGCAGAATGTCAATTGTTGAGGAAGATGTAAAATTCGGC
GTAACTTTCCAAATAATTCTCTTGCTAGCTCAATAAATACATTTTGATAT
ATTTTTGGTATAATTCTCGACAGCAAGGCCAACACACTTCCTAGCTTCTT
TATAGTTTTTTTTTTAGAACAGTAAAATAAATTCTTGAAACAACAATTTT
TTTCTTCAATTGCCTTCTCAGCGAGCCACGGAATAGCTGTTGCCTTTTTA
TATTATATTATGAACAATTTTGAAACATTATAGGTCAATCCTTTTTTGAA
GATTCAAACTTCTCCATTGGTATATGGAAGACCACACATATTTTTTTGGA
ATGCCCAGTTTGAATAAGATGCACCTTTTGTATTCTATATAATTCCTAAT
ATTTCAACAGTGTCATTAATTGAACAGCTGCTAATTTTTATATCCTTACT
TGGGTTCCATTTATCAGTAGGAACAACAACTGTTTTTTATAGTTGATCTT
CAAACCGGACATCCTTTCATACTTCTTGAAGTAATTTAAAATCACGTCAA
CCAGTTTATTTAATCGCCCCTCACACTTAGCTTCTAACATCAATGTGACG
TCTATATCAATTATATGTCTTGAGGTCCCAAAATCCACTTCAAACCCCTT
GAATTTCCTTACAATTGAATCTCCAAGATCTTTTAGTGCAACGACGAATA
ATAGATGGGCTGAAGGGCAACCTTGATTGTAACTCTTTCTTAATGGGTCA
ATAATCTATGTCAAATCAGCCAATTTTTTTCAAAATTTACACGAATGCGT
TTAGATTTTCTTCATTTTTAGATATGTTTTACCTCTAATTATAATAAATC
TCCTGCCAAAATTTGAAGTCATTAAGATTAGGTGTTATCGATTAACTGAT
GTTTTTGTTAAGGCCTCATTTCCAAATATGGATATCATCACATAAAGATC
CGAAAAATAATTTTTATGTAATATTTGAAGAAGTACTCGTAGAAAAAGAC
TAAGAATTCCATGTGTGTTCATTTTTTGATGTAGAATTCTAAAAAATCAA
TATTTCTGTTTCAGTGACCGCACCCTCCTCTGCGGTCCATAACCCCAATT
TTTGTAAACATTTGTTTGACAAATTTATTTTCTATATACTAAAAACTAAT
TTATGGAAATTTTGGGGTTTGAGAAACGTCCATTAAATACAAAATTAACA
ATTTTAGATCAAGTTAAAATCTACTCAAAATTTTCACTTCAAGAGATAAA
ATCAAAATAATTTCTGCAAGATTTTTGAAAAAAAATGATCTGCTTAAAAT
GAATGTCGAACATAACTGCAGCATAAGAGCCAACTATGATCTCGTCCAAG
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GCACCATTTTGCCCCAATTTTATCAATACTTAGTGGAATGAACTGGTGTT
AAGATTTGATTCCAGGAACAGCACCCTCACATCAATTCCATCGTAACGAT
TTGCATGCAGAGTTCGCCATCCTTCCATTTCAATCTTAGGTAACATACTT
AAATACAATAAAGGGCAACATTCAAACATTTCTTCTGAGATAGAATTTGG
TTGGTGTATTGCTTGGCTAAGCTTTCTGCAGCAGTAAGGCGTTTGACAGT
KCCACCCTACCCATTGCATGGGGATTTCCGATGAGAAGTAGGAAATAAAT
TCCACTGATATTCAATACCTAACTCCCTTTCAAATTAGCAAACGTTGCAA
AGCATCTTCCAATTTTTGTATTACCCTGAACAACCATAAGTAAACAAATG
CAAGAACTGCAAACCAGGTAATCTCACTTTCAAATCTTTCCTGATGACAT
CCAGGACTTTAAAACAAAGTGTACGTCTTCAGTGCTGTCATCAGAAATAA
TTGCATAGGAGACATGATTAATAACATTGTCCCACTTAAAGTAGAGGACA
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AAGATGGCATGTGAATAATAGAAATCATTTTTTTAGTTGGTTAAGGTAGC
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TCAATAAGTTTATCGATGAAGCAAGTTACATCTGAAACCATGTGAGTATA
GATCTATCAGTGTTCGCCTACTGAATAAGAATGACTTGGTGATCATCATT
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TGAGGAGTTTGTCTTTATTCACGATTTGAAAGTTGCATTTTGCTTGGACG
AGATCACTGTTGGATCATATGCTGCAGTTATGTAGGACAGGTGCTGGTGG
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GCTGTGATGGGATTAAAGTATTCCAAAAGGAAGAAGTATTTTATCTGCTT
TCAAAATATGACTGTGTATGACAGAATCAAAAGCTTTGCTGAATTGTACG
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TCTTGAAATATTTCTCCCCTTTAGGAAGGCCTTTTGTTCTTTACCAACTT
TGGAGTTAAAAATTGGTTATATTTTACTGGCAAGAACACTCGAAAGAATG
CTTATAGATCTCATTGCGCACCGTGATAGTCTCTAATTGTTAAAATCGGT
AGCCACCCTTTTTTAGCGATCATTAATATCTAGCCTCTTGTTATGGACTG
TGGAAGCTTCCGACGAATTTCCATAGACTTCTCCKGCTCAACTAAATAGG
GAAGAACCTCATCTACGCATTGGGTGAAAATCTTCCCATCATCTTCAAGA
AAAACAAAAAATATCTACCATTTATGACTTCTTTCCCAGTCAATAGACTT
TCTTCATTCGCCTTCAAAAAATTTCCTTTCCTCACAGCCCTTGAATAAAG
TTAGCGAGGAGTCTCCCCCTCTCATGGTCTCTCAGTCGGGCGCCCTGACA
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GTTGTCATACCAAAGTTATTTCCTTATTATTAAAAAATTGCGATGAGTAA
ATTTCAACTATCCTCTCTCACTGTCTCTAATTTCGAGATAGAGAGAGAAA
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ATAACGTTCTCAGACCGGTCAATGATTTCCAGACCGAACCCCAACACTAA
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ATACTAACTATCATAATCTTTCAACACTTTTAGAAATGTCAAAAGCATCA
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CTCATGGTGTCGTGCGGATCCTAGTATCAGGATATCCAATTCCACTTATG
CCTGGTATTAATCCTTTTATTTTTCAAACCCTTTTTAGTTCCATTAAAAA
GTTTGTGGTAGACTTTGAGATATATTATGTAAAAGATATGGGCCATTATC
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TTTTGAGTGAATGTAATAAGAAAGAATGAACAGAATCAAAAGTTTTTTAA
ATATATCTTTATGGAATCCCTACTACAGTATTTGCATAAAAGACAAAACA
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AGCGATTTGATTTTCAACCTTTTTCGAATTTCGATTACGGGTAGTGGGAA
AAGTTTTCATATGAAAATTACCTAAACAAAATTTCATTGCCCTTGATCAA
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TACATTTTTAGTTATTTTATCTTAAATAATTTTGATATACATTTTTCTAA
CATTTAAAAAGCACTAAGAATGTTGTTTTCTCAAATTGTTTTATTGAGAA
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TGGTCCAGATTAGCTATAGAGAAAATCTTATACATGTTTTTTATAGGTTA
TAGTAGTCTCTATCATCATCAATTAATGTAATATAAGGATTTATACTGTA
TTTTAATCTTTATTGACGAAGTAAAGAACATTTGTCTACTTTCAAATTTT
GAACTAGGTGTGCTACTGAAAGATGATATCGTAGGAAAATGAAAGTTTCT
ATAGGTTATTTCTTACCAAATCCCAAATTTTCCAAACAAGTCGTAATGGT
AATTCAAAAAAAGTTAAAAAACAAACCAGCCTAATGTTCATATTTAAGTA
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AAATACGACCTTCAATGTTTCATAAAGAAAGATCAAAAATTAGTTGGTAG
TAGAGTTATCACATAATTAACATTTTTATACCATTTCGAGTAACAAAATT
TGCGTACTAGGTTGGGGGAAAATATATATAAATTAATTCAAAGTAACTCA
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CACTATAGTACCGGTATACGGTACAGTACTAGTTGATAGTTATCCAATAA
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CATCATTTTTCAGCCTAAAAATGGAAATATACCGAGTTCAGAGCAAGATA
AAGAATAAATAAAAACACCTTTGTATATGTTTCATTAATCCTATTTTTAA
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CGAATTACTACAATCTCAGATAATCTAGAATTCAGTATGAGAGAAAAACT
GATTTCCATTTTTGGATTATGCGCCCATAAATAAATTCGATTATTGTCTT
CAATTCATTTGCACAATTCCCCCCTCCCCCCTTAATTGTTCCCCTGTGTA
ATCGGACAAATATTGATTACATTGTATTTTTTTCGCTACTTAGGTTATAG
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TTATTAGTTACATAATAATATTTTATAGGGTATTTGAAGATAATATTGTC
ATTATTATTTACTTTTTACTTTTCAGATTCCCTCTTCATCTTTATGGAAA
CATAAATAAAATAAAAAGGTTATTGCATAAAAAGTAACCAAGCATTTATT
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CTCACAAAATAAAATGAATTATTTTTGTATTCAGCACAATATAATCTTTG
CTGTCTCTCGCAACCTTTCCTCCAAATAGAGAAATAAAAAAGGCTCAAAA
ATTGATTGTAGTTATTAGTATTAAGGCTCAGTCCAAGACCAATTTTGTAA
TACTCTGAGCTGAAGCGTCTCATCATTTTGGAAGAAAAAAAAGAAATTAA
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TCCTTTAAAAAGAAAACACCCAAAATCAGTTGGTG back to top
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