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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s10 | supercontig | LSalAtl2s10:144553..177864 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000642 >EMLSAP00000000642 ID=EMLSAP00000000642|Name=EMLSAP00000000642|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=319bp
GKVVLILILCPIFAFSSKNLPKKDKFLSLFHIVTFQDFICPSALDSRNGT CLSAQKCTTNSGIPSGKCASGFGTCCVFETQTCGSKVLRNMTYITSPDYP SMIKSSLTQCDYRIQAEMKNICSLRLDFDRFEVRGPPGRNELNGGACSLD TFVIQGTLGSVPVICGLNTGAHIYLDVNDNALKSGIELKFQFKGXGQRRW RILSSEIECNNPGRARPGCLQYYFESTGRINTFNFNAMGSSHLASQKYAI CFRRNLNTCCIEYRVCEDEKEAFTLGISPNADCTEPFEIRIRTDETASVA MALTNRGLCLEYRSIECNL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s10:144553..177864+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000642-696489 ID=EMLSAT00000000642-696489|Name=EMLSAT00000000642|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=33312bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s10:144553..177864+ (Lepeophtheirus salmonis) GGAAAAGTTGTTTTAATTTTGATACTCTGCCCCATTTTTGCATTTTCAAG
TAAGAATCTTCCTAAGAAAGATAAATGTAAGTTTGTTTATGTGCAATTAT
TGTTATTATTATTAATTACTCTTTTGATTTCATGGCAGTTTTAAGTCTTT
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ATTTGGTGTTTTTTTAAACAGTATGGAATGTGGAAATTCATACGACTCAT
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GCGGCTCAGCTTATGTATTTTACAGTTTAAACAACTTCCAATTCTATCGA
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GTTCGGTTCGGGTTCAATAATTAATATAATGGGGGTATATAAAAATAACC
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AAATTATCATCCGATGTGTTTTAAGTATGTATATACTGTTTACATGTCCA
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ATAAATGATTTAATTAAAGGTATTCAATATATTTCTTCATTTAAAGTTTT
AACATAACTATATATGGTATCAAGAAAATGTTTACCATTCTGGAATATAT
ATTTATAAATGTCAAGAAAAAAATCCCTGTTTTTCCTGATAAACTAAAAA
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ATTTTTTTCCCCAGTCTACCTATTTTTTATGAAGAAAAAGTGAATGTATA
AAACAAAATTACATATGTACAATTGTTTTTATAACGTAGGAGTTTTAAAA
ATTGCTCTTTCATTGATTTTTTAAGCTAACCTTTTTCTACTTTTTAAGGA
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TTATTCAAAGTAACTTATTTACTACAGCTGTTAATGTTTAAGAGACAATA
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CAATACATTTGCAACTCTGGTAGGGTATATGTTGGAGATTCACGTTTTTT
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ATAGATTAATCATGGAATTCTAGAAAGGTAGAATTTTGTTTTTACGTTCA
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ATGCCAAGCATACTTTATCTGCATTTAGTGTTAAAACGCTGAGTAAATAA
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AAAGAATTAGTGCAAAGAAATGTAGATAGTGTTTATAATTTAAAGGTAGG
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TCTCCCTTTTAGTTCACTCTCACTGAATGTCAATGCTAACTTGATGTATA
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CAGCCTTTTCTAAATGAACGGGATTTTTCTTATTTTTCATGGCTGSTATC
ATCACTAACTAATTATGATGAGGGAACATCAAAGTATATAGTAAAAATTA
GTGTTCGTGGTCATGAAAGACTGTAAAAAATAAGAGTTTGGTTAGGAGTT
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CAGTAAGGTTAATTTTGTTTTTACATAAACGATATTACAGGAAATATATG
ATAATAAGTAGAATTACTATTGTTTGTGCTAATACCTATAGAAGCAATAA
GGATATTGTACAGTATTAAATTAGGAACACTGAAATGTTGTGTTTCCCTT
ACTTTGGACCTTGCACCAGCATAACTTAAGTATTGACCAGTTAAGGTCWC
CTCTCATGTGATGTGAGTATTAATACTATTCTTTTTTTTTTTAAATTGTA
AGCTACGTGCTATTGAAATGTTTGCTTGATATTTGATGGAAACTACTTAG
ATATAAAATAGGACATATTGATTAAATCAAAACAATTTTAAAATATCCAA
GCGACGCACAAAAAAATCAAAAAGTGTTTTAGATCAATATANGGTATGAT
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ATATTCCATTACAATTATATTTGATATAATCTATTAAAACTATCTAATTA
TTTTATCGATAAGTATATAATTATAATAAGATATTTATATATAAAAAGGA
ATTAATCAACTTATTCAGGCTTGTATAAATTTTCAAATATGTATAAACAA
AAAGGAAATTGGGGCTAGTTGACATGCGATATAGTTGATTCACTTCAAAT
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GTTGCACTAGCTACGGCTATAATATATTAAAGTGTGATACATTATCTAAA
TTTAGACTCTCTGATTATTTTTTTCATGTTTATTAATTATCTTCTGAAGT
TAAAGTACTACTATAACTTTATAAACCCTTTTTTTATTTGAAAAAATAGT
TATTTGTGGATAMTTTAACTTTAACACAATGTTGCATTTTCTTTATAAAA
AAATTCTAAACTAGCCTACTTTCTTTCTAAGTGGACACCCTGTATATTGA
ATAAATTCAGTCGCATCATAATATTTATACCATTGTTCTAGACTAGGAGT
TCTCCACCGCTTTTTGGGTGTTAGCTAAAATGAGAGGAAGATATATTATC
ACTGGCTACAATAATGAAACATTGGCTTCACTGTTAATTGAACAGAAAAT
AATATATAAACATGATAATAGTCATAGATGCTTAAATATTTTTCTTCCTA
CATATTTTTACTTTAATGACTGTCTTTTGCTCTTGAATTCGGAGTTGTTG
AATTTTTTAAATTTAGCATCCAGACTGGTTGTGGCAATACTCATAATCTG
ATCTAAGGGCTGATGAATGAGTTTATTATGATATTTTTTTTTTCAATAAA
TTCATCTAAAAAAACATGACCATGTTGTTCAGAACATTCAACAAATACAA
ACACCCAATTGTTTGATAAGCTCAAATTATAATGACAATCCAATCTTGAA
TGGTTCTATATAAGATGATGGTTTCAATAAATTTGATTGGATATGAATCA
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TTTCATTTCCATACACTATAGAGAAGGGAAGAAAATGGGAAAATTAATCA
GTAAAAATACACTTTTGCAATTATGGAAATTTCAAAAACTTTGATCAAAT
TATCTGATCTCTCACACATTTTTTTTTTGTTGCTTTCTTATATTTTTGTT
ATGATTGCTAACATATAATCTTCGTAGGTTGTTCGAAATGCACTCTTGAG
CCGAACATGGTCTACGGGTAGCTTGTTGAGAATCCCTATTGTAGGCACAA
GATGTACATATAATTATACCTATTCGTAATTTTTGTACAAAAAGTGACAA
AAAAAAAACCCAAAAATCTATTAAAAATATTGAATTTTGGATCCTATCAA
CTGATATTAATTTTGGTGTAAAGTTTCTATATAGTTTACATATATTAAGA
AGGAAACATTGTCTCTATATTCGTATTATATATATTTATTTAGATATCTA
AAAACGTCTTATAAAGATGTAAAACAAAAGTTATTTTTCATTAATATTAT
CAAAGACTACTATTATTATTATTATGAATGTAAATCTGTGCCAAAAACGA
TAATATCAATATCTACTTTCAGTAAAAAAAAGTGCATCAAAATTATTTAA
AAAAAGAAAAAAATGAAGAAGAAGAAAAAAAAGTATTTAAATTGTACATT
ATGTTTCAGACAGTTGGATATAGGTATACATAACATGTACAGGGATATTA
GGAGTTATATCCCGGGACAATGATTATCCTTCTCCCGGTATTTTCGGGGT
TTTATACATATGGGTAATTTCCAGGATGTTACTGCATTGATGTATTCCAT
AATAATGTGGCATTTTAATTAACTTTTAGCCGGGAGGGACGGGCTGTGTT
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AAAAAGCGGGTCCTGCAGGCTCTACAAATATCAACCTGCAAACGATTAGT
AATTATGATAAAATAAAGAACATGAGCATTGAGAATATTTGAGAAGAAAC
AGCTGAAAATGTATTCTTTTGTTTTAAAATATAAAAAATAAATACTTAAA
TTTCAAAATAGTTATTATTGACTGACAGGATACCAAACTGAAAAAAAATA
TTTCCCGGCATCCTGCTCAAATATGATTTCCCGGGAAATAAGAACCTCAT
ATATATAGCTATATCTGCATACATCACGCAGGGGTGGTGGACAAAATTTG
TATGCTTAGGTCATGCCTATCTAATATATGTATGGGTTATCTTTGGATAT
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GAAATAATAAAACTATTTTATTTTTTATTTTTTTAGCGACAGGTTCTGTA
TTTTTCTTTCTTTCTCTTATTCTCAAGAATAAAAACTTACCTACCTATAA
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CAATATTATTATACATATATTTATGAGATCGAGATGCATTGAATTTGAAG
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GAATCAAGACCTGATCATCTCACAAAAATATACACTTTTGTTAGCTGTTC
ATAACTTTGTTTATAGATCAGTTTTCTGAACGTTCTTTGGTTGAAATATA
ATTAGCTCTTGATAAGTCGTGAGCAATTCCATATAATATTTGAATAATTA
TTCCATACTGGAAAATAATTGAGTAGCTGCTACCAATTGATTCTGAGTTT
ATTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTCTTACGAGAAAAATGGAGAGAAAT
AATCCAGTTANTGTTTCGAAGAGTTTATTGTATTTTAATATCAAAAAAAC
AATCTTATGTTAAAAATCCCTAAATTATTTTTAATACTTAATAAATATTA
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AATATTGAGTATGGATTGACCATAGTTTGAGTTATATAGAAACATTCTTA
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GAGGATCGACAATGGCGTAGTTCCTGCATGTGTCATACCTAGAGATGGAG
TGGAATTTGTGTGTATTTCCTTACTCTTAAAACTGTTGCAGCTTATATAA
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CAAATAATGTCCATCATTTAATTGAGTGACATTTATGTGGAATTTGTGAC
GTCTTTGAAGAATTAATAACTTATTAGTCGAAATAGAAGATTATTATTTG
AAAAATACAAATTGAATTCAGATTTAAAATATCTGGCTTGCTTTTATGTT
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TTGTATATTAGAATAATTATATAACACCTTTAATTTATATATATATATTA
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ATACATACATAATAAATATGTCGTTTATCCAATTCATAATTATATGAGCA
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GCTACTAATCAATATGTCCTGTCGAAATAGAAACATGATCCGAGATCTTT
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ATTAATTTATTAAATGGAGTCTACTTTTGTATTGACAATTTCCATGTGGG
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GAAAATTTCTCTTAATAATGACTTACTCAAAGAAATAATATAATAATAAG
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AATAGAGGAAACTAGTTGTTCATAAGTCCTGAATCATTCACTTGATCTGA
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ATTTCCATTTGAATCGTGAGACAAATTTTGAAGGTCTTAGTTTCAAATTC
TCAGAGTGTAGGTCTCATTGTCAAGCCTAAGACCAAAGGAACTTTATTAA
AATGACCCTTTCTTTAAAAAAATGCACACAACAAAAGAAGATCCTTTTTT
TACTTGGTTCGGTGTTAGGTGATTTTAACTAGAAATAGGGGCATAATGTG
TAACATATTGGAATACAGGGGACTGAAAGTCAATGGTACAATCTAAATGA
TAAATGTAAACAATGAGGAATCCAACGTAAAACTTACTCATACCATTTGG
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AGCTAAGCCACTGACCACAACACTAGATGTCAGATTTGCTTTGAATATAG
CGATACTTTGAACAGTACACTTAATTGGTTCCATTGATATATCTGACTGC
TGAAGAATCTCAGCACTAAACACCATTTGATTTTTGTTGATTTTATTTTA
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GCAAATACAAATCCATTTACTATCCCATTTGCAAATTGAATTTATGATAT
AATAGGGTCAAAATCAACTGGGCCCCCAATAATATCGGTCAGACTATAAA
TGGTGAGTCACACATAGTCACTACAATCTCCTCAATAACAAAATATTGTC
TATTTATGCTAAACTGTATTTTTAATCAACTTTGACTCCTGAAGGGAATA
ATTTGTGAGTAATGTGTGATTTTACTGCTTATTATTTATTGAGTTTGAAA
TTCTCTTAATATTGTATCTCTGTACGTTGAACCATTCTTCGAATTGATAG
ATGAAAACGATAGTATTCAAACTACAAACGTCTGAAATACCACAATAACA
TGTAATACTAGAAAATTTACTGTATGAAGATATTTATGCAAACTATGAAT
TTTTGCATAACCATCTACAGAACTATGCTTGTCATTTATTTAAAAGAAGA
AGAATGCTTATGTAGTTTTCATTTCGCATAACTTTAGKAAAGGRGATGAA
GAAGAGGGGGGGGGGGGATGTGAGAAGACAATACAATTTAAGAGACTTAT
TCATCATCAGTAGGTTTCATATTTTTTCATTATTTTCTCAGAGTAATTTT
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CACATAGCATAATCAAAGTTAGAACAATTAAANAAAAAAAATTATATATA
CATATATGATACTATCTCTCAATTTTTTTATTTTTTTTGTTTGAATTAGG
AACAAAAAAGAAGGAACTATTTTAGATAGGGATCATTCATTTAATAATCC
TACATATCTATGTACACATATAACCATTGAAGTTTTCGTCGCTGTAGAAT
GAAGATGTAGAGTTAAAATGGTACAACAGGTCTAGCCTTGCATTATTTAA
AAGCTTACCTTACTAATAAACACTTATAATAAGTCCCTTCTCATTCTTCT
AAAGATACATATCTTACATATATTTTCATAACAAAGCATTCAACCCCTTA
CAAAAGAAAATCAATTAAACCCAAAATATACCCCAGCTTTTTCCACAGAA
TAAATATGTTCATTTGTATCACCACCCTTTAACTATTTTTGAATCAACAG
CAGCCCCACTGATTTTGATTTTTTTGAGTAGATTATTTAGAAGTTAGAGA
GTGTGTGAATTTTTATGCTTTACATCGATTCTCATCATATACCGGGTGGC
CCATTGAAATTTGAACACTTATTAATTCAATAATTAATGAAAATTGAGTG
ATTGGAATTAATTCAGATTTCTATATATTAAAGCATAAATAATTAGTTAG
AAAAAAACAACCTGACCTCTCTAGCTTTTGCAAAAGTCAAGAAAATATTG
CTGGAACGTGATTGATAAATGTCCATTCACTCACTCTAAACAATTGGGCG
TCTCCAGGACGACTGCCCTCGGCAAGTCTGATACATTGGAAAGGAAGAAG
GGATCCGTCAAAATGGTGAAACTGGATCCAGGAGGAGTTAAAGAAAATAC
CCCAGGTACATCCCCATAAGTACATGTTGGTCNACATGTTGGTCAATAAA
CGAAATATTGGAGTTTCACACCAGATTGTCGTGAGAGCTATAAAAAAGTA
GGTGGAAAGAGCCTTGTGGGATTGAAGATGCCACTTTTTTATAGCAGAAA
TGAAAGAAACCCATCTCCTCTGTTACAAATCTATTTTGAATGAGTATTTT
GAACTCTTTTTTGACAATTTTGGACCCCCTACAGGCCTGATGTCAATCCT
CTTGACTATACCTTTTGGGTGCATATCGAGGGGAAGGCCTGCATTTTCTT
TCATCGAAACACAGAGGCACTCAAAGTCACTGTCAGCCAGCACTGGGACT
CCATGACAGAAGACTAAATCTGCAGCGAGTGCCAGGTTTTCCTACACCGA
CTGGAAGGCATTATTACCGCTAAGGGTGTCTACATTAATGATTATGAAAG
CTTAGACATACATCTTCTTAAATTATTAATTTTATTGAAATTCTATTGTT
AATTAATAAATTACATCTGGTTGAAGTTTAAAACTCAAAGTATTCAGATT
TTAATGGACCACTCGGTCAAATACTGCTTTCGAGATGGCCGGTCAAACGG
TAGTTTTAGTAAATTTTATTGWCCTTTTTCATCATAACGTTATATTATAT
ATGTATAAATATATATATGTATGTATATTTATATGGTTTTAAATGGGTGT
TTTAGGCACTAGCTCTAGACATTGCACTTTAACATAAGAAATAGTCATCC
TAGAATCTTCATTAGGTATTTGCTGTTGTCAAGCTTTCCCTCAAAAATAA
AATTATGTTGTCAAAGGGTTTAACCTTTAAGATAACACCTGATCCATATG
CCCTAATGTTTATATTTGGGTGTTTATCCTATTGGTCTTAGGCAATTATA
GTTTTTTAATTTTGTTTGCACCTATAGATATTATTTTCAACACATTTTTT
TCCAATATTCTTCTGTATCAAATTATATTCTAGGTATATATACACATAAA
AACATAGAATAATATCAATGTACCTAATTGACCGAATAATAGCTTGAATA
TAAAATAGTTAATACATATTTTTATTAAATCGACTTTATTATTGGTTATG
CATTGCTAAAGAAGTCACTTTGTAATAAAACCCATATTTTGTCATATAAG
TGTATAATTTTATATACTGAAGAGTAAATATGGGTCTAATGGACCCAGAT
GGAGTTATATGTGCAGTAAATTGTCTGCTATTTAAAGGGCTACGATTTAA
TAACAAATGAAAAATAAATTATGTTAAGAAGGATCAAATTTTATAATCTT
GTTCTTAGAGTACCGAAATTTCTGCAAAATCAGGATACAACTAATTTAAA
ATAAATAGACCAATAAAAATGACAACTTGACAAAAAAAAGTTATGAGCTA
AACAACCCAACCCTTAACCCTTTAAGAATTACCCAGCTTAATCATGGGCC
TAAAAAACTCCAGTATTTTTTGTCTTAGGCCCTGTTGATGGTAAAATTGG
CCTAGTAAAAATCAAACAAAAGTCCAAGTCTGGCCACCTTTATTGATTTA
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GAAAAAATATTTTTTTTAATAATAACAAATAGCAAATCGATAATAACCCG
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TACATATATGATATTTTTTTTTTCAAGAAAGTGTTTTCGTTCTTCCTATG
AAAATAGTACTATACATAAATGTTCCAATGGCCTTATATTTTTATCTTCC
AAGGTTCTATAAAATTTCAATGGTTTATTTGTTATGCTCTTTTATTTAGG
ACACGCTTGACTCTCTGTCCAACAATTCTTTTTGATAACATCTAAATAAC
TCAGCCTTTTTATATTTATGTACTTACATATATGTAATTAGTTTAGTATA
CAACGAAGAACTTCCGTCAAAAAGATTCAACAATTAACTATATTTGTTTA
AGTAATGTCTTTAATATTTTTGTGGATCTTTAATTTACATAATAAATTTA
ATTCTAGACAATTTAATCAAAACCTATTTTAAATGTAACAATTGCAAATC
CTTCACTTTTGTTTTATCCCAGCTACATGACTTTCTCAACATCTAGAACT
GGTGGTCTGCTAAAATTATCCAAAATATTTCATTTTTTGATTTATTTATG
TTGAAAAAACAATTAACATTTTTATTTCCATTTTAATTAACACATATAAA
ACAGAGAAAGCTTAATACTGTATCACAGGGCTGTTGCTAGTTTTCATCAT
TTGGGGAGAGGGGAATTAATGCCAAAAATTATGAACACCATTGTATAATT
AATTATATAAATATATTTATGATAAAAATTTGGGTGGGGCTTTTTTACTT
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TTGCCACTGCTGAATTATATTGCAGTTCATAGATTAATATGATTTAAGTC
AAATTAATATAAAATTAACTTCCAAAGAGAATTTGCATTTTATCTTAAAA
AAATTATTACTTTTTGATGTATTTCTCGATTTCTGATTTAAATTTTATAA
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AGAAAAGAAAAAAATCCCTAATTTTCTGGCAATTAACAAAAAGTAATTAT
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AAGTTGTACATATTTTTACAGTGATAGGGTTTTTTAAAACNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATATATATATACTAGG
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