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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s110 | supercontig | LSalAtl2s110:165584..172366 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000690 >EMLSAP00000000690 ID=EMLSAP00000000690|Name=EMLSAP00000000690|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=639bp
MKNQSIFMHSLRGAYRYISLLLLMKYYELKDVSVPVVFSRTVKKHGDSPA
IFFEDVVWTFLDLESYSNRVARYLISQGFVPGDCVALYMENRPEYVGIWL
GCAKAGIVPALINTHIVGNPLRHSIXVASAXAVIYGVELSKPINEIKSLL
PNIKYYESGSTTTSPEYSEISVHHGSTSDHHDQQHSAQQLSFTDDKLLHN
PNCDLTSKYFDTEIKKFSTESVPPPILDKSSNFRSKLLYVFTSGTTGLPK
AAVIKQSRFYYFAAGSYYLNNMGNIKDLCLYNPLPLYHSAGGLVGIGIMM
VFGVRIAIRRKFSVRNFWKDCIKYNCTGAQYIGEICRYLLSSPETPEDKS
HNIQLLFGNGLRPTIWNQFTERFGVTRIAEFYGSTEGNANLMNIDCKPGA
VGFASRLFPSVYPVRLVRLREDGNVLRDPRTGLCVLCKPGETGEFVGKII
KNHVMRSFDGYIDKEATEKKIVRNVLYQGDSWFRSGDLLNMDECGWMYFI
DRIGDTFRWRGENVSTIEVEAVLSNVLQQRDNIVYGVEVPGAEGRAGMAX
IVGDELDLGGFLAAIKNQLPAYARPLFLRLVKSLDITGTFKLKKRCLQNE
GYNPHVIQDPLYFLDTVKGVYRKLDAILYNDIMEMRCRI back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s110:165584..172366- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000690-696537 ID=EMLSAT00000000690-696537|Name=EMLSAT00000000690|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=6783bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s110:165584..172366- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAAGAACCAGAGTATTTTCATGCATAGCCTAAGGTAAATGTCGTTGTT
TCATATTTGGACTTGCCCCTTAATTGGTTAATAAGAGGAAATCTCTTCTC
TTATTTCCCTTCCTCCTCTTGTCTTCTTTTTCTCCTCTTCTTTTCTCTTC
TTTTTCTTCTCCCTTAGCTTCACTTCTGGATGAGTGCTCGGCTCTCCTTT
CCCATTACTTTGCTCCTATTAGTTATTACTCACCCTCCCTCCAACACTAT
CCCGGAATATTTATCTAATTCATTTTGTATATTAGTKCATTCTCTAATAA
ACCTNNCCCACATCACGCGAGCCCCTTCGAGATCCACCAATATCACAGAA
ATCCTTTGACAAATCATCATGAAATCATTCATTAATTGAGCGCTCAGGGA
TATTTACCCATTTTTAGCGATCAAAGTCACTAATGCAGGATGTTAGATTG
ATTTAGAGTCGTTTGTCACATGTGTAATGTAGTCATGTAGCCTGGAGTTT
GCCACTCTGATCTGGGAGAATCGTTCATATTATTTCTTAAGTTATAAAAA
CGAAATGATTTACTTTAGTTTAATTAGTTTTACTTTTTTTGATTTGATTT
TTGATAAGAAAAGCACGTATTTGTTGAGTTTGACAATTTAATATCCGATA
TTTTATTATGTATTTCGTAATGAAGAACTTATTAGTTAGCTCTGAACCCT
TGCTATGTAGTTTTAAGAAATGTCAATTTTTATCCTAAGTAATGATACAA
GGACGGTATCCTTAAAAGCTTTCTCACCCTAATTAAACGTAAGAATTAAT
AATTTATTTTTTATGTTTTTCCATTAAAATGTTGCATTTTGGACTCTTTA
ACCCTGTAAAGACCAAATGATTTTTTAAATGTTTTTTTGCATTAATATGC
TAAAAAGTTAATTGTAAAACTGGGGGAAAATTTGTGATAAAAATATGCCC
TTCAAATAACATATATTCGTACCAATTAGTAGCTCAGGCTAGCTAAAAAA
GTCAAATGCTATTACATATCTATTATAATTTTTTCTTATCCATATGCTTA
CCTAAAAGTGAGGTAAATATATATATTGGTGGAGTAAAATGTACCTGAGC
TCTACCAATATTCCTTGCAATGTAAACAATGGTGCAAGAGGCNAGGCTAT
GTAGGCCGTTTTTTTAAATTATTGTGTGAGCGATAATATATGGAATAGTA
CGCTACTATTCCAGCTGTAAAATTTTAGTTCAACGAGTCTATTCTTCCTA
AATCCACATTTGTTTGAAATGGAACAAATATGCTCCATTGTCTTTTTAGG
TTTAATATCTTAATAGTCAATGGACAAAAGGTATTAAAAAAAATTTTATA
ACAATCCCTCTTCCATGTTATATCTCTATGTATTTAATATTTATAATATA
ATAACGATTCATCCCTACATTTTTTATTTACCTTCGTGATGTAACGATTA
TGTAACCATAAAGTATATTCTCCTAGTAGTCTAAGCTCCCTTCTGTATTT
TAACTTCATACTCCAATTAGAAAATATACCTATTTCCTCTTAAAGAACCC
TGTTACTAAGACGGAATGTGTATTAACTCTTGTCATTTCTTAATACTGCA
TACGATTAATATTTTTTCTCCATATTTTGATACTTTGCAATGCATATAGG
CCTACATTTGTATATTCCTTTGTCATAAAAGGGGGGGGGGGAGACGCGAC
AAGAACGACAAAAAAAAGACAATTGCAAAAATTATTATTTTGTTTGTTAT
ATGACTTATTGTTTCATTGGTTCGTGAAAGTGTGTTGTTTAAGTATTTAG
AAGTGAGTTGTTGTTGCTATATGGAGGTTAGGATTTCTTCTGTTGTAATT
TTAAAAAGAGGAATTGAACTGAATACTTTTTAAGGCCTGTAAAAAAATAA
TAATGGTAGAATACACATCCTTTAGTTACACACGTGTGGTGTCAGGCAAA
ATTTTATTATTAAACTTCTGAAAGAAGATAGCTAATTTTTTTTTTTTTTT
TTTATATAGAATTGGGTTCTTTGTATCTTAGGTCTTTGCTCTTAGTGTGA
TTCTTTTTATTTGCCTCAATTACTATTAATGATTATTCATATAATGATTC
TGGCTTTAATCCACTGAGGTTTTTTTAATAAAAAGATATTAATTACAGGG
CACACCCTCTATTCGATCTATGAATCATGTCTCTTCTGTCCGTTTTTAAA
GTTATGATCGATTAAACTTTGGTCAATTTATGCCTTCCTAATGTATTTAC
ATATTTGTTAAATATATATGACAAACAGTGTTCATTTCTTTGTCGTAGAC
AACTCCCTCTTAAACTTTAGTACTCAGTCATTTTAGCCTGACATCTGTCC
CTACATACCTTTATATAAAAACTTCTGACACACGATCTTTGACCATGAAT
TTTCGTTCCTAACTCAGCTTGTGAAATATGTTAATACTCTCAAAAACTTA
TAGCATGCTGGGATCAAAGAACAATTTAAATGTTTTATTTAATTATTAAC
AACAATTGATTGTTGTTAATATTTCCTTTTGACGAATTAAAATTACTCAT
TGATGAGGGGAATAACTCTCCGGGATCCTATGGGTTATCTAATAGAAGGT
TTTGAATGCTTTAATCATTATATGTTAAGTCAAAAATGACATAATTCAAT
TTAATTTACAGTACTGTAAATTCTGTATTTGAAAATGCTTAATCTCATGC
TTGTGAGTCGCAGTCTACCGATTAGGTTCTWCTAACTTCCCCCCCCCCCC
CACTTGTGCAGAGTTTACATATATGAATTGTATTTGTATACTGTTTATTT
TTCAATAATGTAAATTTTTGTCGTTTAGGAAGATAAGTATAGGGGTTTTA
TCTACGTTTTATCGATTTGATTACTGCAAATTTTATAGGGGGAGAGTAGT
GACAGCTTTTACATTAATGTATGCATATAACATATCCAATTTGTAGTACT
TGTTTGTACTTTTTTGATGACAAGCCATAATTAATTTGTTTTTGTAAACG
CAAGAAACGACCAAGGAACGTTATATATGTATATACTAATATTTGTTATA
TTCAAATAACCCGACACATTTTTACTATGAATATTAACGATTAATGTTTG
AATCTTTTTCTTTCTCATTACAGACATTTTTTTATTCATCAACATCTCCA
AATCACTCCTTCCTCTCTCTCTCGTTAGGTCCACCGTACAATATCTACAA
CCAAAAAATAGCTGTGTGCCTCTACTTATCTCTCCTCCCTTTCTCCCAAT
AGAGACCTCCTCAATTCCTACCGAGGATCCTTGTTTTATTTAAATCGCAA
TGATATTATATCGGTTAGGAATATGCTCAGCTTTATTGGCAGMATGGGTC
ACATCTTTCCTACCCAATACCGCACTATGTATGATTGCATTTATTTTCTA
TTACCTGACTGGTGGTCATGAGACCCTATGGCTCATAAGGCATACACTGT
TACGAGACCTCAGGCAAGTAGTATTAGTAATCGTATATTGATAATATCGA
ATATATTTAATTATATTCCATTTTCAGAGGGGCCTATCGCTACATTAGCC
TGCTCTTACTAATGAAATACTACGAGCTCAAAGATGTCTCCGTTCCTGTA
GTTTTCTCAAGAACTGTTAAAAAACATGGAGACTCCCCGGCTATTTTCTT
CGAGGATGTAGTTTGGACATTTTTGGATTTAGAGTCATATTCCAATCGTG
TAGCCCGCTATCTCATTTCTCAAGGATTCGTCCCTGGAGATTGTGTTGCA
CTTTATATGGAAAACCGTCCAGAGTATGTTGGTATTTGGCTTGGTTGTGC
CAAGGCAGGGATAGTGCCAGCTCTCATCAACACTCATATTGTGGGGAATC
CTTTGAGGCACAGTATTGNTGTTGCTTCAGCARCCGCCGTTATTTATGGT
GTTGAGCTCTCTAAGCGTAAGGAGGATCGATGTATTTATTTTGTCACTTA
GTGTTTTTTAAAGTATGATTCGAATTTTACTATTTCTTAATATACTCAAA
AAGACAAAAATAAGGAGGGGGGAAAATGTAGGTCAAATGTTCGTTATCTA
GTATTTTGCTTTTATTGGCCTTAAAAAGAAGGGGAAAAAAATAGGGGACA
TATAATTGTACAGGGTTTGTATTGTTTGATTTTCAACTGTTTAATAAATG
AAGAGTTCACGATGACTCGTTTTCTTCAAAGGGAATGAACATGTATATAT
ACAGGAAGACGTTTTTGATCTAGGACAAACAATAAGAATGACTTTGAAAT
CCTACACTCACTAAGTCAAACAATTCATTAACATTGTACGTACCTTCTAC
TTCTCCTCCCCAAAGACAATACATATGTATATTTGAATAAAGTATTGCTA
TATGATACTGATAATCCTTGTCATTCCATTGTTTTGATGACTCTTCACTT
TGATTTGAAAGAATTTTCAAAAMTATCTTCTTTCAATATTAATGATAATT
AATTCGTCTCATCTGTTTTCCTTTSCAGCCATAAATGAAATCAAATCCCT
ACTGCCTAATATCAAATACTACGAGTCAGGATCAACAACAACCTCTCCAG
AATACTCGGAAATAAGTGTTCATCATGGCAGCACTAGTGATCATCACGAC
CAACAGCACAGTGCACAACAATTGTCATTTACTGACGACAAACTTCTCCA
CAATCCGAATTGTGATCTCACTTCCAAATATTTCGACACAGAAATCAAAA
AATTCTCTACCGAATCAGTTCCTCCACCAATCCTCGATAAATCCTCCAAT
TTTCGTTCCAAGTTACTGTATGTTTTCACATCTGGGACCACTGGACTACC
TAAAGCCGCTGTCATCAAACAATCTAGGTTTTATTATTTTGCTGCGGGAT
CTTATTATTTGAACAATATGGGAAATATTAAGGATCTGTGTCTGTACAAT
CCCCTTCCACTCTATCATTCGGCTGGAGGATTGGTAGGGATTGGTATTAT
GATGGTCTTTGGAGTTCGAATCGCAATTCGAAGGAAGTTTTCTGTAAGGA
ACTTTTGGAAGGATTGCATCAAATATAACTGTACTGTAAGTAGTTTCTTT
CGAGTCTATGTATATAATTTATTTCATTCCTATTATATGTATAAAGGGAG
CTCAATACATTGGTGAGATATGCCGATATCTTCTGTCTAGTCCAGAAACT
CCAGAAGATAAAAGCCATAACATCCAACTCTTATTCGGAAATGGTCTCCG
KCCTACCATATGGAACCAATTCACAGAACGCTTTGGTGTTACGCGCATTG
CGGAATTTTACGGGTCTACGGAAGGGAATGCTAATCTAAGTAAGGACATA
TTTTAACTTAAGTTCTTCATCTGGAGTAATAAATAATACATTGTCCCCAT
TTTTAAATAGTGAATATTGATTGTAAACCTGGTGCCGTAGGATTTGCTTC
ACGACTCTTTCCCTCAGTTTATCCTGTCCGCCTAGTCCGTTTACGAGAAG
ATGGAAATGTTCTTCGCGATCCCAGAACGGGACTCTGCGTCCTTTGCAAG
CCTGGAGAAACTGGAGAATTTGTAGGGAAAATCATTAAAAATCATGTCAT
GCGTTCCTTTGACGGATACATCGACAAAGAAGCCACAGAAAAGAAAATAG
TGAGAAATGTTTTATATCAAGGAGACTCATGGTTTCGGTCTGGAGATCTG
TTAAATATGGATGAATGTGGTTGGATGTATTTTATTGATCGCATTGGTGA
TACATTCAGATGGAGAGGGGAAAATGTTTCCACAATCGAGGTAGAGGCCG
TGCTTAGTAACGTTCTTCAACAGAGAGACAATATTGTTTATGGCGTCGAG
GTAGGGAGGAATACTTTTAGGGGTCATCATTTAAATTAAAACTATATTCT
TCTTTTCCCTTCAAATTAGGTTCCTGGCGCGGAGGGTCGTGCAGGAATGG
CTGSCATTGTTGGAGATGAATTAGATCTTGGAGGCTTTTTAGCTGCCATC
AAGAATCAGCTCCCTGCTTACGCAAGGCCATTGTTTTTGCGACTGGTAAA
ATCGCTAGATATCACTGGTAAATCATCTTCTTTTAAGCTAAAGAAAATTA
GCTGCAGTGTGTTGATTGATATCTAGAGTTTCATATACTATTTTATAAAA
TGAAATAAGGAAAAATGAAACTGTTTGCGTATCAACAGTAAAGCTAGTAA
AAATGATGATTTTTATTRTTTAAAWAATAATTATCGTCCATTTTCATAAG
TAAATTATACTGATAACCCCTTCATAGGAGCCAAAAATGTAGTAAAAAAT
CACTGTGATAAAATAAATAATCTCATAATTTTCATTTGAAAGGCCATATA
GTCGCCATAAATAAGTCTCATAAATTAAATAAAAACTCTAGGACCAGTGG
TTTTCAACCCTTGTATCACAATGGAGCCCTATAACATTTTTTAATTTATT
TTTATCCCAGCATATCGTGTAATTTTATAATAAAGGGCCCATAATTGCCT
TGGAATAATGAATATGTAAAATACGGTGGACTGTTAATGAAGTAAAAAAG
TAAATTTTTGGGAATTTCTTGATTTTTTTTCTTAATTTTTTCTTGTTGAC
ACAAATGTTTATCAATATCAATCAACTATCAATTCTCATACTTATATAAC
TAATCGATTTTATCTTTTTCAACAGGAACATTTAAATTAAAAAAACGTTG
CTTACAAAATGAAGGATACAATCCCCACGTCATCCAAGATCCACTTTATT
TCCTCGATACCGTAAAAGGAGTTTATAGAAAATTAGACGCAATACTCTAT
AATGACATTATGGAAATGCGATGTCGAATTTAA back to top
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