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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s111 | supercontig | LSalAtl2s111:28738..42624 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000746 >EMLSAP00000000746 ID=EMLSAP00000000746|Name=EMLSAP00000000746|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=437bp
MSILYGSVGTMEKDDGDYPNNLGFLTANYVLDSDALLETMQPEFDTIMCF STTKWIHLNFGDEGIKRTFKRIYAQLNPGGKFILESQGFTSYRKKKKLTQ KIFENFNKIKLRPEGFGDFLINEVGFVSRELIAVPQHPSRGFQRPIQIFT KPSIQKSPSSNLTTSSSAKNSPSVIVTLDEENKTKKKDVSKPGSSSSSST ASSPSVSAQKSAKNRTNKLCKPSTSKSKDKLAPKSSPYYTIGGGPTPPGR TPSIGMTPQYDLGTPCYNPEELDIPPGGYYGYNTPGITPGYSGPSPDGYS NCGHIPPIQRHHSPVYTGPPPGTFSGASTPGNDESGYTPHYSGYTPSYEG GSTSNNCRRNVYTYSPGNGTHSPRTGSAPGYTQPPCLTWNTKSSCITWHA KFTCLPWSSKLPCIITWTFELSKVSSECSSITPYFKK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s111:28738..42624+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000746-696593 ID=EMLSAT00000000746-696593|Name=EMLSAT00000000746|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=13887bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s111:28738..42624+ (Lepeophtheirus salmonis) CTATAAAATATAAATATGCAAAATTCGATCAGTTTGAATCGGGAGTGATT
TTAATATTTTGAAGCTAGATAGTATAAATATCTCAGTTGAATAGATTAGT
GACACGAATTACAAATTATGTGATTGCTAGTTAACAATTATAATTAATAA
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TCATGGCAACAAGCTTAAAGCCTTTTTGTTCAAATCGCTTGACGATATCA
CCTACGATCCCCCGGTGGACGCCATCAGGCTTGATCATGATGAAAGTTCT
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GTTGCGTTGAAGTAAACATGCTTATAACCAGCAACCCCTGTTTCATATCC
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TTCATTTTTTTTGGTGTTCACCATCTCTGCATACAAAACACAATCGAAAA
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GAAAACAATCATATTCTTACTTTAAAGGTATTTATTGATTTTGGATAGGT
ATTACCCAGGAAAAGATTCTCATTTTGACGTTGATCCTCTTTGATTAATG
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ATATTAACATATCATGCACCACATAATTTATTCGTTATGATTTTAATTTC
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GTATTTGTTAGAAGACTTACAAATTGATTAGCCCTTATTTTTGTATTAAT
TATCAGAAGTTAACAAATTTTTGCCCTTGGATTAAAATGGTAAAATTAAT
ATGAGAAAATTCAGTAAAATTTAATTATGAAAGGTAATTTAAGAAATAAA
TGGAAATTCCTTTACTAAAAATAAGTTAATGTGAGAAAAAAAAAATTGAA
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AAAAAAGGCCCTCCACTTTTATCTTTCCCCCAGACCCGCTCACAATAAGG
CCAAATGGCTATGTACAATGTATATACGCATCAAGGAGGGAGGGTGGAAA
TAGTTGAGAACATACTTAGTACAAGGTCCCTAAAACTAACCCTGTGCAGA
GTAATTTTTGGTAAAAATAAAGACAAAATTAAATTTTTTTGGAAAATTAT
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TTCAAATATTAAATATTTTGGAGAAAAGTTTCAAAATCCACAGCTGTTGA
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TAAAAAAATTAAACTTTTTTTTTCTAGTAAAAAGCAAAAAATCCTTAATT
TGGAGTCCCTCCACCCCACGCCCCGCGGACACTTCTGCATCTATATGAAT
AATAACCATATTTTATACTTATACCTAAGTCGTCTAAATGGAAAGCAGTA
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TGTTTTTAAAAAAACTTGTTTAAATCTGTTGCGTAGGATTCTTAAAATTT
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GGCAAATTATGCAGCAGAGCTAAAAATTTAATTTTGCCCCAGGCCAGGCC
TAGGGTAGATTTTTTATATCAATAAATATTTTGACTGAGAAATACATATT
CTTTCAGTAAGGTGAATTGAAAGAAATTTGATTTTTTTTAAAGACATTAA
AAAAAAACCAACAACTTTTAGAGGATCCCCCAATATAAGATTTAAAATAA
AATTCCCATAGGGAATAGCATTTATTTGCTAAAAAAAATAAGATTCGAAA
TAAAATTTAAAAAGGAAGGAAAGAGTCATAATAGTTAACTTTGCTCCAGG
ACCTGCTCACGTTAAAACACTTGGCTGTAGGAGACAATTTTTGACTTAAG
CATAAAATTAAAGGGGGATGTCTTAAATCTTTTAATATAAATTATGATTT
CAAAAAAATCCCCTCCCTTGTTCTACAACTTTCAGCTAGGGGACATAACT
CAGTGTAAATATAAATACCTAATAAATCAATAAGTAATAACATAGTCTAT
GGTCTAGGAGATGATGATTTTTTACCTCCGCAACGAAGATGTTTTTTTCT
CTGTTTGTTTGTTTTTTAGTCAACAGTATTACGGGAAAAGTTAAGATCGA
TTTTGTTGAACTTGGTACGAAGATTATATATGAACTCAAAAAGAACCATT
AAATGCTTGAGAAATCAAGATCAAGGTAACACAAAACCGAAAAAATACAT
AATCGACCATAGCTTTGAAACAAATTGTTATACATACATCACTCAATTTG
ATGGTAGAGGTTTTGCGCCCTATCGAGTATGCATACTAGTTTGACCTAAT
TTTCAGTGCAGAACTCAAAATTCCAAATATTTTGCTTCAAACACCTATTT
ATGTGAATTATATCAGGGGCGTACGCAGGATTTTTTTTTTTGGAGGGGCT
TGGTTTTTGGATTTTTTTTGAAAATTATTTCAAAATTCCATAGTTATTGA
CAAAAATTTTCAAAAATCCATAGCTATTTACAGAATATTAATTTTTTRGA
AAAAAATCCAAAAATCCACACCTATTACAAAAANNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTACAGCCTTTCCCGTACACTCCCTCC
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TGTGGTTGGAAATCCTGACCTTTTTATTCGTTGTGCAGAATCAAAGAAAA
TATGAATATGCAGTCAAATTTGGATAAGACGAAAATTCGCTAAAAAACAA
CTTTTTCTTTACTTTAAGTAACGACTAGCGCGGTTAAATACAATAAAACT
ATGAAATTAGTTGAATTATAAATGTATTTCTTTTATTCCGAGTTTTTGAC
ATAACTGACTAATGGGCCCATTAGTCACAATTCTTTTGTCTACTCCAAAT
GGTCAAGGTAAAGGACATAAGGAAAAGAGTTCACACTCAGTAGAAGAAGA
ACATGTTTTTCCCTTCTCTTCGCATATTGATCTAAAATTATCTSCTGCCA
TAACATCTGTTTGGAAGGTCTTGGACAATTGGAGAAGTATTATTTACTGT
CTTGTGGACTTAATTTAATTAGCCAATAATTAATAATTGCAATATATTTT
TCATGATGGTAATGTCAAGTGTATAGTACAGTTTATTATAAAAATAGATC
AGCTACGGATTACAAGTCTCCAGACTTCTCGTCTGTGAAAATGCTTACCT
TTCCAAAAGACATGAATTAAAATGGAAGGAATTTGTAGAGCAATGCCATC
AAACGTGCTAATTGGAATCCATGCAAAGTCTCGGGAGTTTGTCAAGTAAT
ATAATCAACTATTTATACTATATGAGGGATATAAAAATTAAATTAATGGT
TTCCTTTAAAAGGATGCCAGAAGGTTTTATAATCTATTTTCTTAGGCTCA
TTTTGAGATTAATATTTCTGAGGTAGTCTCCAAAAAGACGGTGGATTTTT
GTACATAATGCAATTCCTACCTTATTTGTACATTCTAAGATATAGAAAAA
ACCAAAGCTCAGGTTTAACTGAAACTTTTTTTTTTTGGCAATCTATCTCA
TGTATTCTAACATTCATTTACCAAGAGGAATCAGCGTAGTTATTTCCTTG
CCTAATTCTTCCTGTTTCTTCGAAAAAGTTCTTAGATGAGCTTGAACTGG
CTCTCATCCTCATTTAAGTGGTAATTTCAAAGAAGTTCGACCCTCGAAAC
GGTCTTTTTTTGTGACTTAGGACTGACTCACAAAGATAACGAATAGCTCA
CACCGTTTTGGATAAGCGTTTTTAATAATAATATGAATACGTCCATTAAT
GAATTACTCCTTGATACGTAGTAACAGATGATTAACTTAAATAGAGTTCA
TTGCATGATAGTAATTTTGAGGAGCTTTGAAATTAATAATTTTTTTCATT
AAGATAGAATTGAATTATTTATTTTATAATCTATGAGGTTAGGCTAATTT
CAAATAAGTTGATTTAAATTTATTTTATCACTTATTTGAATAATATAATA
TTAAAAAGATTGTGACGATGGTATTGATTTAATTTTTGTTTTCCACACTA
TCACTATGCATACAAATTAATAATTTGTGAAGATGAAATGAATCCGAAAA
GTAATGATGAGTTCATTAAATAGTTCTTCAAATATTTGATTAGAAATGGA
TAGGACCATTTTTGACCCTAAGATTGCGCACCTATGATAATTTAATCTTC
AAATAACTATTAACATAATGTCCCCATGTCAAAAATACAACTTATTGTTC
GTTCATATTGTAAATTTCTGAAAATCGTCAACACTACATGTATATTAGAA
ATGGTACTCTGTAGAGCTCTAACCCTCCTCTAAAAATCAAATTGAGTGAT
GTATCTGAATTTGTACCCAAGATATGATCAATTATGCAGTACCTTGACCT
CTCAAAATTTAATGGCCTATGCGGCCATATATAATCTTCGTACCAAATTT
TATCTTTTTTGGGCCTGATTTAATTAATAGCTCAAGAGAAAGACCATAAG
CCTAGTGTTGGTGATTACCAACATAAAATTTTGTTGAAACAYCCAGCCGG
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CTAATAACTCAAAATTATTACAGACATGAATAAAAATGATTAGATGAATA
ACATTCGATAGTGTGAATGGTAGTGTATTCATTCAATTGCTCTATTTGAT
ATTTCTATATCAACGTGAAGGATACATATTCAGAAAAGGATAAAAAACTA
TCCTAATCGGGACAGAAACCAAGATTAAACTCATCCCAAGGTAACCTTAA
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AATTATTAAAGAATAAAACAGGGAACGAACATTTTCGTTCATTCGAAAGT
CGTATGAATGTTGCTAATAATGATGTTAAACATTTATTCGTTATCAGCAT
ATATATCTAACATAGTACACGATTTCAGTAGGATAATTGCGTCGGAGTAG
GTTTTTAAGCCTTGATTGCAAACTTCCTTTTGGGGAAAGCTTTCATTTGA
CGCATCTCCCGAGAAGTCTTAAGGCTAGCTTCATGGGGTGTCAGGCGTCG
GCGAATAGCACGGGTCTTCTTGGGGCGGAGGTCAAGGGGCTTGTATTTTT
TGTCCTGGAACACAAATATAAATGAAGGTGAAGTAATGACGAGGAAACAT
ATGTTATTGAACTAATGAAGAGTGAATTGCACTTACTCTGTAGAACTTGC
GAAGATTCTCTTTTTGCTTCTGGTGCATGACAATGTATACACGAGCAATA
GATTTTCGGACAACACGGATTTTGGAGAGCTTGGAAGCAGCACCTCCAGT
TACCTTGGAGACTCTCAAAGCTCCCAATTCAGTCTTGAGAGCATGGAGCT
GCTTTGTGAGTTCTTCCTTCTTCTTCAAGCGAAGTTCCGAGCACTTGATT
TTAACCTGTAATAATTATCATTTACGGGGATTACATGGATATTCCGGGAT
TAATATTAAGATAAGGTATTTTACCATGGTGATGTTCTGAGGATCGCCGT
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TACAATATATTTAAAAATAACGGCCAAATCGGCCAAATATCTGTAGTTAC
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CTAATAATGTAAGTATATATACATAAATAAATGAAAGACAATCCAATCTC
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ATAATAGCTAAAAAAAGCTATATTACGTCATTAGAAGTAGCTATCGACGA
TATTTAAGTACGTTTGAACGTAGTTTTTGTCAGGTGATCAAAATTATAAG
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GCGAGTAGTGTATTAGTACTAACCATTAAGTAGGAGGGGAGTCTTTAGTA
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TCCACGACGAGACGGAAAATGGGACCAATATTAATAACAATAACTGCGAT
AGCAATACTAACATCGAAKCCGACGTGCAAAACTTTCTCAATAGTAACAA
AACCCTTGATGCCCTAAAATTGATCCTTCAAACATCTCCCGTGTCCTCAT
CGGTAAACTATTATAGATTATTATTTATAAGATATATGTATATTATTTTA
ATGATTAGTATAATGAATCAGGGCATGCCTTCCATTCCAGGATCCTCTCA
TGCCTCTCTTGATGCGAACCCTTCTCTCTGTCAAACAAACGCAAGTAGAT
GGAATAGTCAAAGAATTAGATACTGATCAAAGGGATGTTCTCATGCGATA
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CGTGTTTTAACAGATAGGAAACAAGCTCAAATGCGAACCCTTAGCTCATG
AATAAATATTATATATAGGGAAAACAATATCTAATTCCAAGTCCCCACCA
ATCCATCTTTAAATAATTTACCCATTTCAGTTCAATTTAGAAACAAAACA
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TTAAGCTTAATTAATTCCCCCATTCTTATTGCATTTACAAATCATGATTA
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TTTATAATACTCGAACGTTTCTTCCTGAGTAAATAATTCACTTTTTATGT
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CACATAGTAAATGTTTTTAAGTTTTATATTAAGTTTGTGAAGCAAGGATA
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TGTCGGTAGTACTTTTCTTATTGCCCCTCTTATTGAAGAAAGTGTCAATA
TTTAGTTCTAAATTATTTGAGATTATAATAGTAAAAGCTAAAAATTGTAA
AATGAATTTTTGTTTTCCTCGGAAAATTAAGGTAATATTATTAATTACTT
CATTCCTATGTGACGTTCGAGAATCGTTTTACATATGAATTGGACTTTTT
TTGGTTATAGTATTCTAATTTTCATATTCACTCAATTCATAATTATGAAT
TGAGTGAGTAAAAAATCTGTTTGTTTGAGTCACATCAAATATGAAATAAC
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TTGGATCCCAGTTTTAGTACTACATAGACAATAATAATAGAAATATTAAA
TATATCACTAGGAGCTCATCAACAGACGTTAAGTAAAGCAAAGAATGGCC
TCTCCAGAGGTTTTGGAAAGTCGTCAACATGTGGGATCCGCAAAAAAAGT
TACATTTGAGGAAAGGCAGAATGAAATTCGAAGAAGAAGAACTCCTCCAC
CTCGATATCCTCATCGTAAATCCTTTCGAAAAAGGAGCCACAGTTTCACT
GAAGGTCACGTGACTATTATTATGTCTATTTAATTAATTCCTATTGTCTT
AAATATATATATATATATTAATTATTATGAGAATGAATTACTCTTTCTCT
TTTTTTAAAGTCAACGCACTCATTCCTAGCAATCCATTCCTGAAGATGTG
GAATATTATTATAATGAATAATATTTCTTTTTTGTATGTTTCTTATTATA
GGGTCCTTTAAAAGAGCTAAAACCTTGGACAATAATGTTTTACCCTCCAA
ATTCCTTCTTGGAGGTAATATACGAGATCCTCTTAACCTCAACTCTCTGT
CTGATGAGCGTTTATCTGAGATCGTGAATGCTATCACACCTGAGTCCTCC
CCCGTTCCCACTCCTAAGCATCGTAAAGCTGAATATAAAATCCGAGTCCT
TATTCCCCCAAACATAACAGATCCTCTTAATTTAAACGCTGGGGTTGACG
AAAAGGAATATGAGTCCAGACTTCGTAAAAAAATACGCCATAGGAAAAGA
CCCTCTTATACGAATAAAAAGGAGGAAATCATTCCMCCTCTTCCTCCACC
GAATCCCTTGGAAATGCCTTCCACTTCCGCTACAGAACCCCCTGCAAAGG
TATCAAAAAACAATGTAGTGGCATCGAAATGTAAAGAATTGGAGGGGGAG
GAGCCGGAAGAAGAAGAACCAGAGGGTGAAAGTGCCAAGAAAGAGGTGTC
CTTAGTGAAACCAACTGTACCTCCAGAGGTTAAAAAACGTGCTTTGGAGA
TTGTAAGCCCCGTCTTACCACTCAAAAAAAGAATCCATCTCCAAGGTTTA
AAGATAAAAACAGGAAATTTCAGTACGGAAACTATAATCGCTACTATGGG
TATCGTAAACCGTCAGACTCGATAGAGGAAGATCTAAGATTACGTTTTCT
TAAACCTGAATGGTACCGAGGGAAAAAGGTTTTGGATATTGGGTGCAATG
TCGGGAAATTGACTGATATTATTGCCAAATTATTTAGACCCAGAAGCATA
ATTGGTATAGATATAGATAAGGACTTGATCAATGTTGCACGTAAAAATCT
TCGGAAGAAGAGAGACGCACATGTTATTAGTGAGTTTCCAAAGTCTATGA
GCATTCTATATGGATCCGTTGGAACAATGGAAAAAGATGATGGAGATTAT
CCAAATAATTTAGGGTTTCTTACTGCAAATTATGTTCTAGATTCGGATGC
TTTGTTGGAAACTATGCAACCTGAATTTGATACAATCATGTGTTTTTCTA
CAACAAAGTGGATTCATCTTAACTTTGGAGACGAAGGCATTAAAAGAACT
TTTAAACGCATTTATGCTCAACTAAATCCTGGTGGAAAATTTATTCTTGA
ATCTCAAGGATTTACTTCTTATCGTAAAAAGAAGAAATTAACTCAAAAGA
TTTTCGAAAATTTTAATAAGATAAAGCTACGCCCAGAAGGATTCGGAGAC
TTTTTAATTAATGAAGTAGGATTTGTATCTAGAGAACTCATTGCAGTTCC
TCAGCATCCATCCAGGGGATTTCAGCGACCAATTCAAATTTTCACTAAAC
CTTCTATTCAGAAGTCTCCATCTTCCAATTTAACTACGTCTTCTTCTGCG
AAAAATTCCCCTTCAGTCATTGTAACTCTTGATGAAGAAAATAAAACTAA
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CGTCACCCTCTGTTTCGGCTCAAAAATCTGCCAAAAACAGAACTAATAAA
CTCTGTAAGCCTTCTACTAGCAAATCGAAGGATAAACTTGCTCCAAAGTC
GAGCCCTTACTATACTATTGGAGGAGGACCTACCCCACCTGGACGAACTC
CGTCTATTGGAATGACTCCACAATACGATTTGGGTACACCCTGTTATAAT
CCAGAAGAATTAGATATACCGCCAGGAGGCTACTATGGTTATAATACTCC
TGGAATAACTCCGGGATATTCTGGACCAAGTCCTGACGGATATTCAAATT
GTGGTCATATTCCCCCGATCCAAAGACATCACAGTCCAGTTTATACTGGG
CCTCCTCCAGGAACTTTTTCTGGTGCATCTACTCCTGGAAACGACGAATC
TGGATATACTCCTCACTATTCCGGCTATACACCAAGCTATGAAGGAGGAA
GTACAAGTAATAACTGCAGACGCAATGTCTATACATATAGTCCTGGAAAC
GGCACACATTCACCCAGAACTGGATCTGCTCCAGGNTACACCCAACCCCC
ATGTCTCACCTGGAACACCAAATCCTCATGCATCACCTGGCACGCCAAAT
TCACATGCCTCCCCTGGAGCTCAAAATTACCATGCATCATCACCTGGACC
TTCGAATTATCAAAAGTCTCCTCGGAATGCAGTTCGATCACACCGTACTT
CAAGAAGTAATAATAATACCAATAAAAGTTCTACCAACAACAACTCTGTA
TCCGTGTCGAGTGCCAGCAGTCGTAACAACAGCAGCAGCAACAGTAATAA
TAATAGGTGCGGCACTGGAAGTTCCACAACTACAACAACAACACCACTCG
TTTCTCCCCAAATTCAACAATCTGAAATATCTGGAAACACTACACCCCAT
CCAGGGACTTCAAGCTCTCCTGCAAACAGTGAGCAACATCGATATCTCTG
GTGAGTAATTAAAGACTATCATCATCATGTTTCATGCATGCAATCAGGGG
GCATCACTTTGGAGGAGGGGGGGGGGGGTTGAAAGCTTTTACAGTTTATG
ATAAAATATTTTGAAGAATTATTATTTATTTTATTTTTTACCCAAGTTTT
TGGCACTTTGGGACTATCTCCCCCATGTTCCCATTTGCATGACATAGTGT
TAGTACTTAATCATAGTTTATATTCTCTTCTTCAAAACCCCTCTCCTTCC
ACCTGCGTACGTACTTAGTACATAGCACCCAAGGTTAATAGAAATACAAG
GTTTAACTTCCACCACACTTTTAATATTGACGTCATAGACTATGAGTGGT
AGCATGGGTTGTCAAAATCTGTGTTTCTTGCCCGGCA back to top
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