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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1131 | supercontig | LSalAtl2s1131:332688..362616 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000793 >EMLSAP00000000793 ID=EMLSAP00000000793|Name=EMLSAP00000000793|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=706bp
MNIKLQGISLILWTLASVGFSHDPWGENQRAKINTDYVSSNSNAIYRFLG NQTHKDYFKLLRRDGNSLLIGARNVIYNVSLPDLVENIEQRITWTPSKKD VDICLVKGRSEDDCQNYIRVLARTKEDQLLVCGTNAFKPKYRIYTKNGSS YHVSEEFSGSGICPYDPRHNSTAIYSDPDFIGSMEDEDHIYFFFRESAXE YINCGKTIYSRVARICKNDNGGPHKFQNGWXXFLKTRLNCSVPGHEQPFF FNEIQSMTPVDSDLPVEDRIIYGVFTTPDNSISGSAICAFKMSSVVNAFD GDFRDQDESNSLWLPIPKSRTPSYPRPGTCYNDSRALPSSTLNFARLHNL MAQNVNPVGDRPLFVKTSLGERLTVIASDARVRDVLEPRNKFDVLFVGTT GGRVLKIVNSVLIESMQIYPYHVPVRNLMVLEDHLVILSDHEVSSIPLQR CSHPSAQSCGDCVALQDPYCAWNVLTSECVPHKGQDISKLLQNVEFGFHS GCPESSYSDSVPYFDNVNEEGSNNQYEVPRQFNKNYGPRFYPPTAYKDRN ERTIYTEKTFALATISAAFTALLIGFLGGYFISKRCEKPLKLEFLERRAG NLKAGVGRGGVIGSGGELGLDSGYATPSNLNSTSTNNTNSSTNNSKSINL LVNVPPKSETIKASPIQGSGTNNIISSPGNNQNINTTPGGSGSNVGTLQK VKRIYI back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1131:332688..362616- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000793-696640 ID=EMLSAT00000000793-696640|Name=EMLSAT00000000793|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=29929bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1131:332688..362616- (Lepeophtheirus salmonis) ATGAACATTAAACTACAAGGAATTTCCTTGATCCTATGGACCTTAGCCTC
TGTAGGATTCTCCCACGATCCCTGGGGAGAGAATCAAAGAGCTAAAATCA
ACACGGACTACGTATCGAGTAATTCAAGTAAGAGAGTAGTCTTTTTTTTG
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GTGATTATTTTTCCCCTATTTAAATTAAATATATTAGAAAACAGCATTGC
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GTAGCTACGAGGCTTTCTTCATTGAGTCCGGATTTGGGTTTGAAGTTGTG
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ATGGGGTGAGGAAGGGGGCCARATTTCTTTGCTTCTTTACATCTTGAGCC
TCCTGGCCTTCATGACTTCTTTCAGAAGGTGGCGTGGGGTTCTATTGTAT
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CATGCTTCGAGATTAACATCTAGAAGATCGTAGATGCGCTGCCTTTTGGC
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GGATGGATTTGACATTCTTTAAGGATCGGCAAGTCGGACTCGACTGAATT
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ATCGTACGTGTCCTTGACCTCATCCCAAATCACCTTCTCTTTTATTTTAT
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CTTTAAGGTAGGTAGTGAAAAAAAAAAATCCAACAGTTTTCTTTTCTTTA
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AAATWTTCACGACTGATTTTTTTCCTGCTCGGTTTAAAGTTACTTTTTCT
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TCAAGCCATGGACTGATTTTTTTGGTCTTAATAAATAAACTGATTTTATT
CAGTATCAATCTGAAAACCATTTTTTTTCTCCACTCCTGATTTATGAGTT
GTACAAAAATGATTACCTCAAATATGAAGTTATTGTATATTTCGATGTTT
ATGCTTTTGAAACCCACAACTGACATCATTAATAATTAATATATAGAATA
CTTCTATACCGTTTTTAAATGAGAACAGTCCAGACAAAATTATGCTATTA
GGACCGATCTATAGCGAATTTTCTTTGATACAGGTTCACTCTGTCCTTCT
TTAAAGGGGAGGAGTTCGGTCTCACATCGATCTAGGAGATTCAGACCGAA
ACCCAACACTAATATATATATACATTGATAGTCTTGTGTTTGTCTTTGTT
TAGGACTAATTCAGTCTCTGTCTAATGACGTTAAGTCCCGCATTTTAGAC
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TGTATTACTGACTGTCCTATGGAACAATAGTCTTCAGCACAGGTCCCAAA
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CAAGTACCTAGAGGCTACACTCTACATAGATGAATAGAGAGKCCATCTGT
CTAGTARTGGAACATCAACATTGATTTTCACAGCTGATAATAGTTAGAGA
CTTACATACACTAATGTGTTATTTTGTTCAGGAAGAACGAAGGGAATCAA
AGTACCTAATTGCAGGTGTGATATATGTGTAAATTTTACACAGTACTTTG
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ACATATCATTAAATCATTAAACCGGAAAAATCGTCTTTCATTTCCTTCAT
TTGAATCTTGAAAATAAATATGATATTTCCGTCAAATGATTTTTAAATTA
CATAGTTATAAGTAGTTTTGATTGACGTCATCAACTTTATGATTTTAGGA
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TATTTAAAAGTGTTTGAATTTGATATCAACAGTTTTTTCATTATCAAATT
AAAAGAAAGTAATCCTTATATAAATAAATATTAGTGTTGGGAGACTCGGT
CTGAAAATCCTAGCCCGGTTGTAGGGCTTTATGATTTTTAGTGGACCGAA
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TTTGTTTTGGATCCGTCTTACTAAGATATCGCATAAAATTCAGACATTAG
CGATTTTTAGATGAATGGTTGATGACGTCATTCATGTTTTAAAATGGTGG
ATATGGGCACAATTAAGTAATATGAAGTTAATATTAACCAAGTTTTTGTA
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CAACACTAACAAATGTATACATACATTACTTGTTGAGCTTATTTTTTAAA
TTGTCCAAATGTTGACCCTTTAGTTATGTCAAAATGTTATTTTTGGTCTA
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GTGAAATTTTATACTTTTTCAGTTTAAAATTAACATAACAAATTTAGTTT
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ATCTATTAATTTAAGTGTATAGACAATATAGACACAGAGCCACCATTGGG
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TTCAAATTTGAAAATGATATCTTTAGTAAACAAAACAACAAACAGACTGA
GTTCTTGAAGCTATAATATTGCCTGAATTAAAAAAAAAAAGCTCACCCTA
ATGTATTTTATATGAATGCTCTTAATTTTTATATAATTAATCATCATCTA
ACTTGTGTTTGCTTCTGTGAATAGAGAGATAGACATGACTTGAAGTTACT
TCTTTTTCTCAAATGACTCGTCAAATATGATTTTAATAAGTTCTTCCTCA
TTGTCTCAAGACAAGTTTTGCTGAAAGAAATTTTACAACAATAGTTCCTG
AAAAAAATAATAATCATTTTTCAGAGCTTCTTTGATATTACTCTCAATCT
TGTATGTCCTAACAACAGAGCGTTTCACAAACGCCATCAATCTCTTCATA
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TACATCAAATGGACAAATTTTAAATTTATCTTGATGAAACTTCATCAAAT
TGCTGTATGAATAAAAAATGGGGTTCAATTCAAGGCTGTACAATTATCGC
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TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCAAAAAACTGAATATTTGCAATT
WTTTTCCCAAAAAATGTATCTTTTATGAACAGCTCTTAATTTTTTAAGAA
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TTAAAATCCTTTTTTGACTTTAAATTACAAAACCAAGGGCCTGAAATAAT
GTGGATGTCTGATATATAATAAGACTGGACAATATAGGGCTACATTTTTG
AGGGACAAAAAGGTTTCCGTCCCTTAGTTTCTTAGTCCCATTTAAAATCG
AATAGTTCAATAATTTTCCTTAATATTAATGAAGGAAGTCCTTTGATTCT
GATTCAACTTGGTTTGTTTCGGCCCCCAAAATGGTCCACATCAACAACAC
TGACGTCCCAATGAACAAGCTCTATATATATCTCTGCTATTAATAGTCTT
CAAACATTGTATAGCATTTATAAATAGATCAACAATGGTCTCTCACCATG
AGCGCAGCAAGAGGACTTGAATACAAATCCTCTTTAAAATTTAATTAATC
CTTTCATTTTTTTGCATCACTCCTAATCTGTATATATGAAACATATTAAT
GAAGGGTTCATACAGCTGAACAAAGGAAGAGCAACAAGAAAATCTGATTG
TTTTGCATGTTGAAGAAAGCATAAAAAGGATTATTTTTACCCTGGATAAA
AAACACGGGAGAGAGTTTATCTTTTAATATGTGAGATTTTTTTCTTCATA
CACATGATCATAGGGAAGACGGGTATTTGGACAACTTATCGCTCAATTAC
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TGATGTCTGCTATTGTTTGAATCTATTGAAAAGTTATACAAGTCAATAAC
GATTCTACAAATGACATTTGAATGCAGCTCGTCAAATATTGGGACTATTA
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TTTGGCTCTTGATGTAGTAACTTAACTTGACTTTTTTTTTTTTAATCAGG
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GGAAAAGTTGTCATGTGTAAATAAAATAACCAATGCAAAATTTCATTTTA
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ATAAAAAATATTATAAGAAAATTGGGAAATTGGGATCTTTCCTTTTTGAA
AATATAAGAACATTTTCCCCAACTTTTTTTTTGTATTTTTGTTCCATACA
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ATCCGATGTGAATCCATGGCCGACTTTTTATCCACTCCAGATTTTGAGGT
CTACAAATATGATAAGTGTAATAAAATTAACTTCATATGACGTTATTGTT
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GTTGAGGTTTTTGGAAATTTTTTTGAAAAAAATCCAAAAACTATTTTCTT
TGAAAAATCCGAAGCTGTTCACAAAAGATTAAACTTTTTAGAAAAAAATT
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CTCTCTAGGCCACCCCTGAGGACGCGCCTGAACTTAGCCCGTTTCTGGAT
TTTTGATACCGATACCCAACACTAGTACTTAGATTCATAGATGATAATCA
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ACAACTTTTCCCTCTATATACAAAGGTATATTACTTTGGGTTTTTATTAT
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CCACGATGTTGTTCCTGTCATTGTCCARTAGCCACAGAATAACCATATGT
ATACTATAGACATATAATATGCTCATCTGTGAAAGAAATCTGAAAAATGT
TTGTCTAAAGAACTCACAAATATGTTGGTAGATACAGCATACATCTATTG
TTATTCTTAATCATTGATGGAGAATATTAAAATGACCATTCCCACGATAA
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TCACCAAAAATGTATAATAAGTATATAAGTAGTAATCGTCGTATCTTCAT
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TTAGTAGAAGTCAATAATTGTGCAGACTTTATTGCAGTCACTTAAAAAGA
GCTCATTCTAATTTAACCAATCAACGTTCAGGACACCGAAGAAGACAATA
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GAGTTTTGTAGTTTCTGTTGGATGGAACTGTTCCGTCCATTTTATTTCCG
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TTGCCCCCACTATATAGAAGAGTACAAAAAGTTGAATAAAGTATCATAAT
GGAACGACGTAGCTCAATGGGCAACGCGCCCGGTATAAATTATTCTSTTG
AACTCAATGTGCCTACGCACATTGAGTTATTTTTTTGTTACATTAATAGA
TACATTACAATTACAGYGGCGRCCGCAGGGGGGGGGGGCTGAAGGGGCTG
TAGCCCCTCACCCCAATATCCAAATTTCCAAAAAAAAATTCCAAAACAAT
TAATATTCTGTGAATAGCTATCTATTTTTGAATTTTTTTGTTGTCAGCTA
TGGATTTCGGATTACAAAAAAAAATGTATATTTGTGAATAACAACGGATT
TTTAGATTTTTTTTTCAAAAAACTTTTTAAAAAAAGCCCCCCCCCCCCCA
TGAGGACACTCTATGACCTCTCCTAATTGGTGGGGTGGGGAGCTGACTCA
TAGAACCGTTACGTTCGCGAACGACACATCACTAATATTTGGGGTGTCCA
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TTCTCAACACTAATAATTCCATAAAGATAAAAAAAGGTTGTAAAATCTTT
TTTTGTTGTTTCATATTTGATGGATTCAAAATCACTCAAGTATTATTTGA
TGTTCATTAATAGCGTTTTGATATGAATTTATATGTATATATATATATGT
ACCATGTTGTAGGAGGTAAAAGCAACACGCCCTCTCTGTAGCTAAAATAT
CTTGGAGCCAAATATAAGTACCTCTACGAATTAATTTCACCTTGGGGCGT
CGTTTAAGAGGCTTATATATTGTAAATGTATTTATTTCTTTAAAAATATA
GAGACCAAACAATTAATAACGCCTTCTAAAATGGGTTGAAACTTCTACCT
ACCTGATGACGTCTTGACAATGTTTTTTTAATGAGTACGGGAGAGAGCGG
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CTCTCTATTCAACACTTTTCACACACACCCATAAAATTATTGTATATAAA
AAGTTTAAAAAGAAATTTTCATCCCTCTCCAAAAAACCATTAACATTTTT
GAGGTTTTAAGTCAATCCCTTATGGTTTGAGGAGGGGTCTTCATCACACA
CCCTTTAAACGAAGGATATGTAAAAAAGGGTTCTGCACAACAATTGGAAC
AAACTTGAACCTCATCCAGCAGATCCTGAACAAATATATGTATTGTGATC
AGTTTTTTTGGTTTTTTAATAGCATATTCATTTTCAATATGACCTCCATG
GATCTCAATAACTGCCTCAATTCCACTATTTTACTTCATCAAGACAAATA
TTAATCTTCCTTAAACGTAACTATTCTTGCACATGAAACAGTTCTTATAA
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ATTTCGTTGTTTCCTTACATACATATCAATTCTGGTTCGTTCCTTCATCA
TAATATCAACAAACGATTACCACAATCACGTCATCACATTCATGATAGTT
TGAATATATTTGCATAAGATGGAAGAGTAATTGGACTCTCTYCAATCATC
ATCCATCATCAAAAAATTGCAGATTCTTCTGCGTTCTGTTCCCTTCATCT
CTTTATTTTAAGCATGCATGCATGGCTATACAATATACATCTATTCCCTG
AGCCTTTCTACCTATTTTCTCACTTATTTGTTGTTGAAAACGTCTTCATA
ATAATCATTGCATTTACAATTTGGGTTTTTCTAATAAAAATTTAGATAAA
TGTATGTATGTATTTAATTGGATATTAAGGTTTCTCCATAAATATACACG
GCCCATTATTTACCGACCAAATTCGGTCAATTATTCGATAGATATTCTAA
TAATTGGGATGGGTTAAGATACATAAGAATATGAAATATACACAGTGGGA
TCCAAAACTTGCAAAACTTAAGTATGCAACCAAATAACAGCTGAAACATG
GATAAAAACAAGTCTCTAATTTTAAAAATGCCAGTGCAATCACAATCAAG
GCAACACGATCTTTTCCGCGAGCTTGTCAGTGCCAAGAAGGCTGTAGAGA
CTGTTGTCCTCTCTATCCGGACTACCTACGACATTAACAAGCCCACTACA
GTCCCATGAAGCAAAATAAAACTAAAAATTCTACAGCAACAATATGGCAT
ACTTCTGKCCTGCCTCCATGTGGCACTCCTCCAGCCCTGACCTCAACATC
CTGGACTTTTCAGTTTGCCGAGTCTTGGAAAATAATACTTTTCGCAATTC
TCATCCAAATTTGGATTCACTCCAAGCTGTCATCATGACAGCGTGGTACG
CCAAGGAGTCGGTCTTCATCGTTAAGATATACCAATCTATTGCAGGCGTG
TCGATGCTGTTATTGNCCTGCCTCCATGTGGCACTCCTCCAGCCCTCGAC
CTCAACATCCTGGACTTTTCAGTTTGCCGAGTCTTGGAAAATAATACTTT
TCGCAATTCTCATCCAAATTTGGATTCACTCCAAGCTGTCATCATGACAG
CGTGGTACGCCAAGGAGTCGGTCTTCATCGTTAAGATATACCAATCTATT
TGCAGGCGTGTCGATGCTGTTATTGCTTATGGAGAAACATATATTGAATT
ATTTAAAAAATACCTAAATAAATTATTGAAACAGACCACAAATTGGTTAT
GAGTCGTTTTTTCTTCATTCCGTAAAAATCCCGTTCCTCGTCATTTAATC
ATATTAGTGTAAGTTTTGGGTCCTCAATTCTCTAGTATGGTGTCTTCATT
TGATATATGGAACTTGTTTGGTTCCTATATTACATTTTAATATAATATAT
ATTCCATCTATAATCTCTATAACTTGCAACGCCTCCGAATGATTTATCTA
AATAATTTATTAAGAGAAATAACATATAAGACTAAGAATACAAATTGAAT
CCAGGCTCACTTTTGAGAGAAATCTTCCTAGCCTGCTTTCGTGTTGACTG
ATCACATACTCGTATACTCTTAATTAATGTAGTACTTGTCTCGTAAATAA
GCACTTTTTTGTTAGATTTACTTTATGTATTAAGATCAAGTTTTGTGAGG
GTTCTTTCTTAGCCCTTAAAAAGCAGAAGTGGATCTCCAATTAAAGTCGT
AGTGATGAACTAACAGAACCGGTTTCTCAATCAATGTAATTATACATACA
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CGTTTATTGCTTAGTTTCTTTAGAACGATTAGAAGGGATGTACCAATTCA
AATTTTGTTCAATGTGGACATTAGACAAAATAAGTGTTTGATCCCTTGGC
GTTTTTGGGGAGTTTTTATCCATAGATTGAGAACGATGTTTTGCAAACGT
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TCTGTGAACGAGTCTGAACGCATATAGATATAAATCCGTACTCTAGACTA
CGATAGAAGTATCGTATGTGAAATGACACAGTCCTTGATTACAATATAAA
GGTCTTGTAATTACATCATTCTATTTGACAAGTACCTAAAAAAACAAAAA
CTGCCTTATCATGGGCATGGATAGATTGATGAACCATGCTTCCGTGCAAC
GACACAGTTTGAGGAACAAACCCACCAGGAAATATCTTCTTCATAAACGA
ACATCCCAGCAGTATGATCTATGATAGTAATAAGAATTACTTAAGGGAGC
AATTAAGTATATAAAATTAATTACTTTCATGCACTGATTGTTCCTCATTG
AGCATTGTTTTGTGTGCGTTCATAGTTATGAATTATATGCTGCCGCCTGT
AATTACTTTCTGCCTTTCGTTCAACCCTCTTAAATCATGTGTGCAAAAAT
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