EMLSAT00000000793, EMLSAT00000000793-696640 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000793
Unique NameEMLSAT00000000793-696640
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1131supercontigLSalAtl2s1131:332688..362616 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000793 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000793EMLSAG00000000793-683559Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000003473EMLSAE00000003473-712401Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003474EMLSAE00000003474-712402Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003475EMLSAE00000003475-712403Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003476EMLSAE00000003476-712404Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003477EMLSAE00000003477-712405Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003478EMLSAE00000003478-712406Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003479EMLSAE00000003479-712407Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003480EMLSAE00000003480-712408Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003481EMLSAE00000003481-712409Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto776492auto776492Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000793EMLSAP00000000793Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000793

>EMLSAP00000000793 ID=EMLSAP00000000793|Name=EMLSAP00000000793|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=706bp
MNIKLQGISLILWTLASVGFSHDPWGENQRAKINTDYVSSNSNAIYRFLG
NQTHKDYFKLLRRDGNSLLIGARNVIYNVSLPDLVENIEQRITWTPSKKD
VDICLVKGRSEDDCQNYIRVLARTKEDQLLVCGTNAFKPKYRIYTKNGSS
YHVSEEFSGSGICPYDPRHNSTAIYSDPDFIGSMEDEDHIYFFFRESAXE
YINCGKTIYSRVARICKNDNGGPHKFQNGWXXFLKTRLNCSVPGHEQPFF
FNEIQSMTPVDSDLPVEDRIIYGVFTTPDNSISGSAICAFKMSSVVNAFD
GDFRDQDESNSLWLPIPKSRTPSYPRPGTCYNDSRALPSSTLNFARLHNL
MAQNVNPVGDRPLFVKTSLGERLTVIASDARVRDVLEPRNKFDVLFVGTT
GGRVLKIVNSVLIESMQIYPYHVPVRNLMVLEDHLVILSDHEVSSIPLQR
CSHPSAQSCGDCVALQDPYCAWNVLTSECVPHKGQDISKLLQNVEFGFHS
GCPESSYSDSVPYFDNVNEEGSNNQYEVPRQFNKNYGPRFYPPTAYKDRN
ERTIYTEKTFALATISAAFTALLIGFLGGYFISKRCEKPLKLEFLERRAG
NLKAGVGRGGVIGSGGELGLDSGYATPSNLNSTSTNNTNSSTNNSKSINL
LVNVPPKSETIKASPIQGSGTNNIISSPGNNQNINTTPGGSGSNVGTLQK
VKRIYI
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1131:332688..362616-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000793-696640 ID=EMLSAT00000000793-696640|Name=EMLSAT00000000793|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=29929bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1131:332688..362616- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAACATTAAACTACAAGGAATTTCCTTGATCCTATGGACCTTAGCCTC TGTAGGATTCTCCCACGATCCCTGGGGAGAGAATCAAAGAGCTAAAATCA ACACGGACTACGTATCGAGTAATTCAAGTAAGAGAGTAGTCTTTTTTTTG TATCTTAAATGATTTAATGGGGTAGAATATCAATGTTTTGACGCTGGGCG TTGTTGCTTGGAAGTTCTAAAAAATTTAATTAAACTAAAAGTCTGGAAAT GTGATTATTTTTCCCCTATTTAAATTAAATATATTAGAAAACAGCATTGC ATATTTCCAGTTCGCTGTGTCTCGAGCATCCATTACTACAGAGAGTGGCC CATGTCATTTTCTTCCATCTTAATGATATGTTTTGCTTCTACTCTCGCGT TTTGTTTTTATCGTTCTTCTTCGGGTTGTTTTTTATTCTTCCATGATGAG TAATTATTAGTGTAAAAGTAAGCGCTCTATACCTAATCATAGGGTTTGAK CCCTTTTTCAGTAAAGTGGACCCTTATTAGGTTGGTCTGCCATGTATATA TGTAACGTATATACATAGTGTTTATTCAATGAGGGTCTAAATTTAGCAAG TCCAAGACCGGAAGCCGGARAGAGAGACAGATGGRTTATTATTGTTTTTG TAAACGYCATCGTTTCTTTAAAAAAACAAAAAACTATGTACATTATCAAG ATTTGCAGGGTTTTATTAAGTTTTTTTTCTTCTTTAAACAGTGGGGATTC GCTCATTTCCTTACGTTCTGTATCTCTGTGTGTGTATATATTTGAGTACT TTGTAAAGATTGGTTCTTGCTCTCTGYCATGTTTTTTTAACCCCCCTACC AACGCTGATTTTCTGTTCTTTTCTTCTTCTTTTTGTATATATATACCTAY RTATATATTTTTACCTGAAGMCGGAGTCTCCCCCTCTTGCAGAGTCTGTA CCCTACGTTATCATTACTTAGGGGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNATTAGTCGTCTACTGTAATTCTACATAAATAAGTAATT TGCTAGGTATATTAGTTTTAAGGCATTTCTCCAAAGTGTTGAGACTCGGT TCGATACAGAGTTTTATGCTGGTTCGGTCTGAAATTAGGTTTTGTTTTTT CTAGACGGATTTGGAACGATATTTCGTTTTGTAAAGAAAGAAATTGTTAA AAAATTATGAGTTTTGTATAGTTGTTTATTATATATGATTAAAACTAATA ATCATCAGCTTACAACATGAAACTTGGTCTAATATTTTCTGTATTTTTAG AAAATGAAATATTCCTAATTAGTGGTTTTGTTTATTTGTCTGAAACGGAT TTATTTCATGGGTTTGGTTGAGTATTTTAGTCCGTTGACAGAAATATAAG TCACGGACCGTTTTCGTCTCTTCTAAGTCCGGTCATGATTCTATTATTTC TGCTAGCCCTAAATTATAAATTATATAATTTTGTGATATAGTAATAAAAT AACCTATTTTAAGTGGCATTGTCCTTCGAAGTCTGTAGGTCGCAGATCTA GATAAAATGAAGAAGAAAAGGCAAAAACTCTTTTTTCCATAGTAAATATA TATTATAAGAATATATTTTTAGTTATTCCGAACTAAATAGTTTTGATAGA CATTTTTTAACATATAAAAAGTCTTAAAAGAAGTTTTCTTTTTCAATAAA AAGCTAAGAAGATTTGATGATCGGCGTATAGCGCGCTATTTTTTTTTTTT TTTTTTACATTGTCAAAAAGGAAAAATCCCAATTTTCTTTTGTTATTCTC AAATTAAAACAAACTTTATTAATATTTTTTATAGGTGAGAATATTCTCCA TCAAAATACATTTATGCAAAGTTATGATTAATGCGTTCTTTTAGTCTTTA TAGACAAAATAAAGAGGTTTTGTATCCCTACAAACTTTGAGCGAGATGTG CTTCCTAAAAATCACATCGTAAGGCAATGAAGTTTTACATAGGTGATTTT CATAACATATTACAACTTTTCCACACTAGTCATAATCAAAATTTACTTCC ACTTTACCCACTTTCATATGCAATAAGGTAGAGATACAGGTGAGATCGGA TCTCCGTACAACACAGGGTATTTTGACAGTTGCAGCTGTACGTAAACGGA GCGTCTCTCTTCATTTCTTTCTATATTTATATGTAAAGTACAATTAAATG TATATATATATATATATATATATAGKAGGTAGGGNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNAAGTAATAATATAWATYTATATKTATAWATATATAGGAGGGTTGG TTGTTGGYTGAAAATGAGAAAAAAAGGTACMACCTAATAAAGAAACTGTT GATTCCAAAAGGTAAATAACATAATTCTAACAAAAAATAAAGATAAAAGG TTGACAAATGAAGAAAACTTTCATTTCCCTAATTTCATTTCCTTCAATTT TGTTATGGTTTATGAGCGGTGGAGGATTCCCCCTGGGGCTGGCTATCATC CTTGAAACGTCCTTTCATAATAATAACAAAACAAACTCATACATCATTAT TAGTTGTGTTTTGGGGTGGATTTTTTGTTTTGTTATAGTTTGATGGGCAA CTTCAAATAAATAAATAAATTTGCCCACCTATTGGTCGTTTAAAACCAAT ACATACAGGGTTGGTGAGTGTAACGCATACTCGAGAAGTTGATTTGGAAA TACTTTAATAATTTGTGTATTTTCAAATACACTAAAATTTGTACACCAGG GCTTTGCAAAATAGGTCACTCAATATAGCTAACTTAGTCATCAATCAGTC TTTAGACGTCGCTGGAAGGGCTTGTAGGAGTTGATAACAAGTTGTTCCAC GTAGCTACGAGGCTTTCTTCATTGAGTCCGGATTTGGGTTTGAAGTTGTG TTGGATTCTCTCTCCTATGTGGCTCACATAGGAAAATACAGATGGTTCAA ATGGGGTGAGGAAGGGGGCCARATTTCTTTGCTTCTTTACATCTTGAGCC TCCTGGCCTTCATGACTTCTTTCAGAAGGTGGCGTGGGGTTCTATTGTAT TAGGGCAATCCCAAGTTGGTCTTAACYGCCCTCCTGATGATCCTAGCAGT GATGCAGAAGTTGTTGATCAATCGATTTGGTAGGATCTTCTTTGAACTTT TTCYCAATGCTGCATAGGAACTCTGAATCCCTCCTTAAATTATACCCTCC ACTTTTTGCTTTCCTGGAGAGATCTTCTCTATCTTATCCACCTTGAAAAC CATGCTTCGAGATTAACATCTAGAAGATCGTAGATGCGCTGCCTTTTGGC TTCTTGCTCACTCATGATGACCAGATGACGAAATGTTTATTATAGTCTCT TTATGCACAAAGGATGGTTCAACCAGAATGTCAAAAAAAAAAAACCTCTA AAAATTCATGTATTAATGGAAAAATTAACATTAATTAACAGTCCACGTTT TGTTGACCCACCCCGATTGTAGTTTGACGTTGTATATCTCCTGTACAAGT TGTAACTAACATAAGCAAGATGTGCAAAAAGACCTCAATAACATCATGAG GGATGGATTTGACATTCTTTAAGGATCGGCAAGTCGGACTCGACTGAATT GCAGTCCTGAGCCCAAAATAAGTAACGACACCACTCTATTCATGAGACGT ACTTGTACTAATATATACTGAATTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNCATATTTTACAAACTTAAATACCAATCATTTTATAAATAAGTAT ATCGTACGTGTCCTTGACCTCATCCCAAATCACCTTCTCTTTTATTTTAT ATGAGGGGTTTTAAAGAGCTAATAAGTRCAATATTATTTTGTTTTTTATG CTTTAAGGTAGGTAGTGAAAAAAAAAAATCCAACAGTTTTCTTTTCTTTA TTTTGGAGAAAAGTCCGTTAAATGKGCGTGGTTCAGGTATTTTGTAACTT CAGCAGCGTGTGCTGCTGAACTTCCTCTGTTTTTTTTGTTTTTTTGTTTG TCGAGTTATGTTCATTATACATAATATGTGCTGCGTCAAAATAAAAAGAA TATTGAACAAAAAAAAAGAAGGAAAAAATCCTTTTTTTTCCTTCATATTA CATAGAATCCAATGTTTATCGGAAATATATTTCAGTCAATAACAGACTTT GTATCTAAATTTATGGGATGAATTAGGATACCCCAGAATTTTGGTTRTAG AACCTTTATTTGAAGTCTAAACTTATATTGGCCCGATATGGCCCCTTTCA AATAAAGTGTATCATTATTTTGTTGTAATAATAGACTTTGGGCTACTTTC AAAGTGAAATTTGAAGACGCACCCAAGGGATTACTTTGAAAAATTTGTTG TTAAAAATKATTGTAGCCTCCTTTTGTGTTGACGGTTTATATATATTTAT AAATWTTCACGACTGATTTTTTTCCTGCTCGGTTTAAAGTTACTTTTTCT CTACTTATTTGGATCGTGATGGCATACCTTAGCCCGAAACGTAATCATTT TCAAGCCATGGACTGATTTTTTTGGTCTTAATAAATAAACTGATTTTATT CAGTATCAATCTGAAAACCATTTTTTTTCTCCACTCCTGATTTATGAGTT GTACAAAAATGATTACCTCAAATATGAAGTTATTGTATATTTCGATGTTT ATGCTTTTGAAACCCACAACTGACATCATTAATAATTAATATATAGAATA CTTCTATACCGTTTTTAAATGAGAACAGTCCAGACAAAATTATGCTATTA GGACCGATCTATAGCGAATTTTCTTTGATACAGGTTCACTCTGTCCTTCT TTAAAGGGGAGGAGTTCGGTCTCACATCGATCTAGGAGATTCAGACCGAA ACCCAACACTAATATATATATACATTGATAGTCTTGTGTTTGTCTTTGTT TAGGACTAATTCAGTCTCTGTCTAATGACGTTAAGTCCCGCATTTTAGAC GTAAAACTTCATGATGTCACTCCACTTAATTTCTTCTTTGTTTCATCAGT TGTATTACTGACTGTCCTATGGAACAATAGTCTTCAGCACAGGTCCCAAA GACTGATAAGACCTTCTAGTACGGACCGTCCTCAGACCCTAAAGTATTAA GGAAACGGTCCCAAAGACTGATAAGACCGGTTTTTAGACTGGACTGAACT AGACCGAATAAATATGGACCAACACAACATTTTTTATTTATAGGAAAGGA ACAATAATTGAAATGGATTGATCGATTAGATTAGTAATTAAGACTATTTG CAAAAAAAACAAAAAAGCACTTTGTATTCCCTACCTCACTAATCATGGAT CAAGTACCTAGAGGCTACACTCTACATAGATGAATAGAGAGKCCATCTGT CTAGTARTGGAACATCAACATTGATTTTCACAGCTGATAATAGTTAGAGA CTTACATACACTAATGTGTTATTTTGTTCAGGAAGAACGAAGGGAATCAA AGTACCTAATTGCAGGTGTGATATATGTGTAAATTTTACACAGTACTTTG AAGAATAAATCCTCTTAATTTCTCATAAGTCTTCTTCCGTTCTTTACTTT ACATATCATTAAATCATTAAACCGGAAAAATCGTCTTTCATTTCCTTCAT TTGAATCTTGAAAATAAATATGATATTTCCGTCAAATGATTTTTAAATTA CATAGTTATAAGTAGTTTTGATTGACGTCATCAACTTTATGATTTTAGGA CTGATAYCCCGAACTAAACTGGMCCAGACTGTACTCCAGCCTTCAGTCCT AAATAAGAGCTCGCACAACAGTACTCAAAGGCAATTTTTTATACAATATG TATTTAAAAGTGTTTGAATTTGATATCAACAGTTTTTTCATTATCAAATT AAAAGAAAGTAATCCTTATATAAATAAATATTAGTGTTGGGAGACTCGGT CTGAAAATCCTAGCCCGGTTGTAGGGCTTTATGATTTTTAGTGGACCGAA CTCATTTGGTTACTTAAAGATGTTCGATGTTGACCACTTTCAAACAGAAA TTTGTTTTGGATCCGTCTTACTAAGATATCGCATAAAATTCAGACATTAG CGATTTTTAGATGAATGGTTGATGACGTCATTCATGTTTTAAAATGGTGG ATATGGGCACAATTAAGTAATATGAAGTTAATATTAACCAAGTTTTTGTA CCGCTTATAAATCAGGAAATCGGCCAATAAATTGTGAACGATTAAATTTC GGTCTAAAAAAAGATATTACTTAATACCGACCTTAAAAAAGAACACGTCT CAACACTAACAAATGTATACATACATTACTTGTTGAGCTTATTTTTTAAA TTGTCCAAATGTTGACCCTTTAGTTATGTCAAAATGTTATTTTTGGTCTA ATGATAAAGGTATTCATAATATTTAAATGTAGGTTAACAGTCCTTCAAAT GTGAAATTTTATACTTTTTCAGTTTAAAATTAACATAACAAATTTAGTTT AATCAAAAAGATACTTTCTATACTAACATATTTTATAGATTTTTATGAGA ATCTATTAATTTAAGTGTATAGACAATATAGACACAGAGCCACCATTGGG AAATTTCAAAAAAAAAAAATTAACAACTTTTAAATATTCTTCAAAAGTGT TTCAAATTTGAAAATGATATCTTTAGTAAACAAAACAACAAACAGACTGA GTTCTTGAAGCTATAATATTGCCTGAATTAAAAAAAAAAAGCTCACCCTA ATGTATTTTATATGAATGCTCTTAATTTTTATATAATTAATCATCATCTA ACTTGTGTTTGCTTCTGTGAATAGAGAGATAGACATGACTTGAAGTTACT TCTTTTTCTCAAATGACTCGTCAAATATGATTTTAATAAGTTCTTCCTCA TTGTCTCAAGACAAGTTTTGCTGAAAGAAATTTTACAACAATAGTTCCTG AAAAAAATAATAATCATTTTTCAGAGCTTCTTTGATATTACTCTCAATCT TGTATGTCCTAACAACAGAGCGTTTCACAAACGCCATCAATCTCTTCATA TATGTAATTGAAGGAGAGACCATCTTGGGGGCTCAAAGTTAATATTTTAC TACATCAAATGGACAAATTTTAAATTTATCTTGATGAAACTTCATCAAAT TGCTGTATGAATAAAAAATGGGGTTCAATTCAAGGCTGTACAATTATCGC TAGTTCCCACCTCCCATTTTTGAAATTTTTCTCCAAAAAATTTTAATTTT TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCAAAAAACTGAATATTTGCAATT WTTTTCCCAAAAAATGTATCTTTTATGAACAGCTCTTAATTTTTTAAGAA TATCTATGGATTTTTGAATTAAAAAAAAATATATATTTGAAGTTTAATTT TTAAAATCCTTTTTTGACTTTAAATTACAAAACCAAGGGCCTGAAATAAT GTGGATGTCTGATATATAATAAGACTGGACAATATAGGGCTACATTTTTG AGGGACAAAAAGGTTTCCGTCCCTTAGTTTCTTAGTCCCATTTAAAATCG AATAGTTCAATAATTTTCCTTAATATTAATGAAGGAAGTCCTTTGATTCT GATTCAACTTGGTTTGTTTCGGCCCCCAAAATGGTCCACATCAACAACAC TGACGTCCCAATGAACAAGCTCTATATATATCTCTGCTATTAATAGTCTT CAAACATTGTATAGCATTTATAAATAGATCAACAATGGTCTCTCACCATG AGCGCAGCAAGAGGACTTGAATACAAATCCTCTTTAAAATTTAATTAATC CTTTCATTTTTTTGCATCACTCCTAATCTGTATATATGAAACATATTAAT GAAGGGTTCATACAGCTGAACAAAGGAAGAGCAACAAGAAAATCTGATTG TTTTGCATGTTGAAGAAAGCATAAAAAGGATTATTTTTACCCTGGATAAA AAACACGGGAGAGAGTTTATCTTTTAATATGTGAGATTTTTTTCTTCATA CACATGATCATAGGGAAGACGGGTATTTGGACAACTTATCGCTCAATTAC TCAGAGCTGGGTTGACTTGTACATGCGAAAATTTAACACTGTGTACCAAC TGATGTCTGCTATTGTTTGAATCTATTGAAAAGTTATACAAGTCAATAAC GATTCTACAAATGACATTTGAATGCAGCTCGTCAAATATTGGGACTATTA TTGCGTCAGTCTTGTTTGAGGACTAAAGCGGAAGTCTCGTATTGTTACGT TTCGGTTCTGTCCAATTCAGTCCTGCATATGAGTCTTTAAATTTATAAAG TTTGGCTCTTGATGTAGTAACTTAACTTGACTTTTTTTTTTTTAATCAGG TCGATAAATATAAGTCCTATGACTCTAATGGACCGAATAAATAAATAGCA ATAAAACATTAATTGTGTTCCTTTAGTCAGGATTAGTTGAAAGAGTTGGA AAATCCTTTTAATTTAAGTAGAATAAATAATATTTTTGGAAAACAAATAA ATAGACCTTTCAAAGTGTTTAAGATTTAATTTCAAATGTATTTCAGGAGA TTAGAATAATTGTTGATAAGATAAGTTGACTCACGACGCTTCTCTGGGCC TTGGCTTTGCTAACAAACATTCTCGCTTTGAAGTGGTAGTATGTATTTTA GGGTGGGGGTTTTTTTTCAACTTTTTTCAAAATTCCATTACTGCTAGTTT GGAAAAGTTGTCATGTGTAAATAAAATAACCAATGCAAAATTTCATTTTA CTACAATGTCCTCTTTAGGCAGTAGATCTAGTTCAAAGTGTGCAAAAGGA TACAAAAGTTATTTATATCGTCAACAAAGATTTAAATAAAGAATTAATCA CTTTTTCACAATAATTTATGATGATATACATTATTYTAACCTATAAAAAA GATTAATATAGTTTTTTTCTAAAGCTACCATATGGAGCAAAAAAAAAGGA ATAAAAAATATTATAAGAAAATTGGGAAATTGGGATCTTTCCTTTTTGAA AATATAAGAACATTTTCCCCAACTTTTTTTTTGTATTTTTGTTCCATACA ACACATATTAGAAAAAAAAACCTTTTTTACACTTCTTATATGTAAAAAAA AAAAAAAATGTCTCAAAATTATTTAATGCAAAATAACTAAAAAAATTCTT CAAAGTATTTATAAACTTTACTAAGTGAAGAGTTTTTGCCTTTTTTAATA ATTTTACTTCTAGATAACCTCGTAGGGCTCTACAATTTTTCATAGGTAAT TTTATACCCTAYCACAACATTTTCACACTAGCCGTAATCAAAATTCAAAC CGCTCTAATCGTGTACAGGTGATAAATCACTTGTACAAGCAAATTGTACA AATTACAATCCAAAAATGAGTTGAATAGGTGTTAAAATAAAGATTTTAGA ATAGTTCTGAGGAACAGAATGTATTAATTGAATATTGAAGATGATGTCAT TTTTGACCTTTTTTATGGAAAAATCCTCATTAATAAGTATTCTGTGGCAT 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