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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1162 | supercontig | LSalAtl2s1162:40054..58981 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000933 >EMLSAP00000000933 ID=EMLSAP00000000933|Name=EMLSAP00000000933|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=750bp
MVGGCCVCSDERGWDENPLVYCDGVCCSVAVHQACYGIVCVPTGPWFCRK CESQERSARVRCELCPRRDGALKRTDSSSWAHVVCALYIPEVRFGNVSTM EPIVLGLVPPDRYIQSCYLCVKGGRQNRASCGACMQCNRPGCKQSFHVTC AQSQGLLCEEAGNYLDNVKYCGYCEYHYSKINKKVIKTIPAYKPVSSSIS SLSPCSSPDKMEIKSCATNTSTFNKKNKKSRCHRSGSVPYTSNISTITLM NSITDNSRASTQLVTLDSTPSSKSSQVFISDLQPANEEIRMCATSLSSKF SELDQLVCSRSTKEEDSGSEVNEVLSIENSTVFKIDDVGPVSQSTKNDGK LISSEKLEVRDVSNKVINEPNSNDSKISAKQGSEVHLNSVDILKTSPVPS SSTCKELELLVSQNANMQSTSVPPVFTSSPQTCDSSINNPTPSIISSSVV TQISSEVPINAKSEEVSRTTVHSEISTVLTDVINHSDDLNLEKAVIESTD EYAFSQENNAKDLSVRSLYNGVNKRGIGRPPGKGAQIPSDSISTSGLVEQ FSYSSDNQTARSPISSPELESASSLKKKRKRLSNCIKLPTSVSNTGNEKA STVWMMGTSINPTSNVAKEMNVVLENEITSHSSYEGLFQENLVGVSVPIK NEKGMSDISSKRYHIQPQSLKDLLERQWEQGSHFIMEQASHFDIASLLSS LNQLKEENVELEHNVDKLIQRRDHLLAVRARLMAISINNVQSSGMCQFSE back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1162:40054..58981- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000933-696780 ID=EMLSAT00000000933-696780|Name=EMLSAT00000000933|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=18928bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1162:40054..58981- (Lepeophtheirus salmonis) ATGGTGGGAGGGTGTTGTGTTTGCTCTGACGAGCGTGGGTGGGACGAGAA
TCCCCTGGTGTACTGCGACGGGGTGTGCTGCAGTGTGGCCGTGCATCAAG
GTAAGGTGTCTGTGTATTGTGTGGGCCAGTCCAGTTTCTTTGCTTGAGTT
GCAGCCTGCTATGGAATCGTGTGCGTGCCGACGGGTCCTTGGTTTTGCCG
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ATGTGTCCCCTGTTTGCTCATAGCTGTTTGTTGCAGAGATGCGAGTTGTG
CCCACGGCGTGACGGAGCGCTGAAGCGAACGGACAGTAGTTCTTGGGCAC
ACGTGGTGTGCGCCCTCTACATCCCGGAAGTCCGCTTCGGCAATGTGTCC
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TTTAGGCATATAATTTGAAGACTTCGTCCTTTAACATTTATCGAAGTTCA
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GGAAATATTCTTATCACTCTCCTCCTTAATTTGATCATAATCTTATTTAA
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AATAATTGTTGGTTTCCCGAAATTTAGTAATTGGATTTATTCACATTTGA
TTTTATAAATTTTATAGATTTTATAAATCTATTTTGCTTTGATCCAATTA
AATTTTTTAGGACTTCTCCATAAATTTAATTTTGTTATCGCTTAATGCTA
GATCTTAAGTTGTTTTTTTTTGTCATCGACAGTTATGTTCAAGAGACATG
CAAACAAATTCTTAATTTACCAGTCGTTTTTAATTCTATTTTCAATATTG
AAAAAGAAAGACTTCTCCTTTAGCTTTCTTCAAAATATGATCCAACCCTA
GAAAATAAGGGATAAATTATAATAGCTTCAGAAAAAGTGGGCATCTGCGG
TATTTAATTTAGTTGGTTATGCCAGCTGTCTTATATTTGAATAATCTGGA
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AACGTCGAAACAATAGTGTATTAAGTTGGCTAGCTATATTTCCGTACTTG
GATCAAATAGAAAATCTGTGGATAAATGTCCTTAGAAACTTTTTAAACAA
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TGATAATTGAATTTTCGGATATAGCCCTCAAATAAACAAATTACTTACCC
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TCATTTCTGGAAAATTACTGAAAAACTAAATATGTATTTTAGTATAATGT
TATTTATGCATCAAATACGAATCAGTGCAATTTAAAGGGAATTATGATCA
AATTAGGGAGGTCAGTCTTAGATATTTTCACCTCATTAAGAGATAATATC
TGCAAATAACATTTAAACCATCAAAATTAAAATGAATAATACAAAAAAAC
CTATTTTACATCATGAAAAATCATCGAAACCAAAAACTGAGTTATTAAAT
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TTTTGGACGATAAGGTTTTTGAACGAAGTACTTAAAAAAATGTATTATCT
GTGGTAATTGAAACTGAGTTATGCTCTTGTAATCTTGTAAGCTTCATACA
CTTTTCCTAACGATTTTCATAAAATTTAATACCATATTTATAATAATCAC
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AATTAATTTTGCCCATTGCAATTACGGATGGKGCATTGTCTTGATGAAAC
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TTTTTAAGTCCATGAAAAGTATCCCCCGGAAATCTAAAAATACAAACGTC
ATATAGCTGCTTGCTGATGAAACGGTCTTTGCCTTCTTGAGAGCCGGTTT
TCCCCTTGGAGTGCATTGTCTTGATGTTTCTTTTGTCTCCGATGTGAAGT
GATGGACCAATGTTTCATTCATTGTTATGAAACGTCTCAACAATTCTGCT
TTGTTGCTTTGAAACTTAACAACTCAAATGCAACTTCTTCACCATACTAT
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TGTTCGTACGGCCTCGTTTAAACTTAGCTACTCAAAATTTTAATTTTAAA
AACGGAGGAGCATACTCATCCAGAGTAGAATCCAGTTCAACTTATATATT
GGTCGAGTTGAGGCCTTTCAAATAAAAGTATTGTATCACATAACAATGCT
TCATTTTTACAAATACTACGTTTACTATTAATGACCACCAATTTAATCCT
AATCAATGCGGAGACTTCTATCTTGAAACGTATGCTGCATAGATTTACCC
TCTAATACAGTTATTTTTTTAAAACAACTACAGCCATCTTTTAGTCAGGC
TGGGTACTTATGGGGCCTATGGTATAACCTAAATCTTAACATAGAAGGGC
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TTGATGATAGGAGCAAGCAAGTTTCCATGAGTKGAAGTSCAGCCACTAGG
AGAGACTCCATACAATACTTGGCTAGAGTTAGAATCTGAGTAGAGATTTA
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CAGAACTTGGTCAATTATATTCCTTTATAATCAATCTTTAATAACCTCTT
TATTTGATGTTTAATGAAAATATTCTAATACAAACTTTTTATTAATATAT
TTGTATATGTATTTATTAAAAATATATTTGTATATGTGTTTTTATTAAAT
ATATATATATATATATATAACGCACGATGTCTACATAAAATACATTAACA
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CAGTTGCTGAATAAACATTAGTTTAGTTTCGAATATTAAAATTTAATTTT
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CGATTTTACAATTATCTTGTCGGACATATATTTTTTTTAAGTAATTTATT
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AAAATGTGGACTTTGAAAAATAATTTCTCTCATTTTTACGTATTTTATTA
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TAAACACACTACACTACAGCCGCACTTCAGTAAATCAGTTTGGGAATCCA
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TACATTTGGTGTGGTATGACCCTAAAACTTTTATTAAACCTAGGATATAA
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TTTTTTGCTTTATCTTTAAAAATTTTGGTATTGTTTTTCTTTATTTATTC
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AATTGTTTTTTTTTTTAAACGTAAAGAATTCCTTAAACTCGTCGTAAAAG
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TAATTTGTTCCCATCTATCCCGTCTAAATGCATTTTTAATTATTGGGTAT
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNATACAATTTGTAGGATCATTTTGTGTGGAATGAAG
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ATGAAGTTTTTGAATATGGGGATTATCCTCTTTCTCGCTCTCAGTCTTTA
TATTAATTAAAGGAACTTAAAAATTACAATACACTGTAAATTTATTCCTT
GTTTTATTTACCAATATCATCATCTTCAAAAACGGAACTCTCAGAACCAT
TTATTTTTTCTTGAATACTTATCAATTTTGTTTAGTAAAACGTAGTTACG
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ATATGTCGATAATTCTTGTGAATTAAATCCGTTAGTCTAAATTTTCCACA
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ATCTTTGATTCAAAATTTAGTTCGTAAAGATAGTTGCATTTCAATAATGT
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CATATTTCTTATAATATGCTTCGTTTTTATTTTCGAGTAAATATAAACAG
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TTTGCTGATTACAAAGTAAGTGTTTTCTACTGGCTATTTTTTTTTTTTTT
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AAATCTTCTGAGTCTGCCAGACAACTTTTCTGATAATACGGACATAGAAG
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ATGTTTCCCTCAATCGAAGAGACAATATCAGACAAGGTTCAAGATTCTCT
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TGGAAAAAGTGAGCAAAAAAAAAAGAAGAAATGCTAACTCATTTCCGCCT
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AAGTTATTCTTAAATTTGTTGATCAAGATATTCGATATTTTTTAAAATTC
CAAACAAACCTATACATCAATCAAAAACAGAATAAAATGTCATCTATTAC
TACAAAGGAACTATTTGTTTTTTTAGAAATCCTTTTATTGATGGGATATC
ATAAATTACCGTCTATAAAACATTATTAGTCTTCTGATATGGATGTAAGC
TTTTCATTTATTTCAAGATGCCTTTCAAGGAATAGATTCTTTCAAATTTT
ACAAAATTTACATCTCAATTATATTCAAACCATGACAAAGTATACTAAAG
ACAAGTTGTATAAAGTAAAAGTAAGCACCTTTATCGATGCAATATCATGT
AAGTGTGCATATCAGTATTGATGAAAGCATGATATTGTTCGAAGGACGTA
GCTCACTAAAACAATATAATCCCATGAAACCAATTAAACGTGGGTATAAA
ATATGGGCTAGATTAAATGAATGGTTATATTTCCAAATTTAGAATATATC
AAGGCAAAAATGGCGATATTGATAGTAGAAACATGCAAGCTGATTTTGGC
CTCGTGGGAAATGCTGTGATTTGTCTTACCAATGATTTATTTGGAAAAAA
TTACCAAGTTTACTTTGATAATTGCTTTTCCTCAGTACTTCCATTCGAAT
ATGTCTTCAAGTCTTTCAAAGTCAAGTTTTTTTTGTGCATCAATTCGTCA
AAACAGACAGTATTTACCCAATAACTTAAGTAAAAATAAAGAATTAACAA
GGGGTGACTTTGATTACAGAATTTGAAACAACCAAATTAAAGCTTACAAA
TGGATGGAAAGAACTTTCATAGGACTGGGAAGGAAACAGTTTCTAGAAAA
CAGCAAGACAAAAAAACTTTTGATTGCCCAAAAGTCGTTTCTGACTATAA
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GAGAGTACCAAAAAGTATTAAGTGGTAGCACATATTTTTTTCGGAATCAT
TGATAGGACATTGAAAAATGCTTATATTACTTTAAAAAAATTAAATGCTT
CAAATATAAATAGTTAAGAAGAAATATTGCAACAGGATTAATTACAGTGG
GACGTCCACCAAAGATAGGAGGCCCTTTAGTTCTCCAGTGACATTCAAAT
CAAACATAAGAAGAAAAACCAACTTCTCACTCGGCCAGAATATCCATCTN
NNNNNNNNNNNNNNATATCCATRTACAAAATTGTGGNGTACACTYGATAG
AATTCGCACACAAAAGATCTAGATATTAAGTCTGTGCAAATAATAGAATA
GAATAAAGGCCATTTAGTTTTTGTAGTAACTGTAAAGTTTTGCTTTGTTG
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ACTGTATGTAAATACTACTAGAGAAGGAGAAATATCAATAAATAAATGCA
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AGCAAAATTATTAAATATCCAAAATCGATAAAAAGGGTTATAAGACACTG
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TGTAATTTTATACTGGACTATTCCAATGAAAAACAAATTTTGATAATTAT
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