EMLSAT00000000981, EMLSAT00000000981-696828 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000981
Unique NameEMLSAT00000000981-696828
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s116supercontigLSalAtl2s116:1856086..1878679 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000981 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000981EMLSAG00000000981-683747Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000004342EMLSAE00000004342-713270Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004343EMLSAE00000004343-713271Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004344EMLSAE00000004344-713272Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004345EMLSAE00000004345-713273Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004346EMLSAE00000004346-713274Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004347EMLSAE00000004347-713275Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004348EMLSAE00000004348-713276Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780895auto780895Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000981EMLSAP00000000981Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000981

>EMLSAP00000000981 ID=EMLSAP00000000981|Name=EMLSAP00000000981|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=869bp
MTIMEKSSPHSPSSTNTSSDYSATISTNNAPSSTSSSFNMVDCSDKRKKN
PSGVLRVGFYEVERTIGRGNFAVVKLAKHKITKTQVAIKIIDKTQLDKAN
LEKMYREVEIMKLLNHQHIIKLFQVMETKSLLYIVSEYASKGEIFEYIAI
HGRMTEPAARRTFWQIVXAVDXCHRHHVVHRDLKAENLLLDLNMNIKIAD
FGFSNYFQENSHLGTWCGSPPYAAPEVFEGKHYKGPEVDVWSLGVVLYVL
VCGALPFDASSLHALRDREQVPVEFQNQSSIKEPSSQPRIISEKVLRVMQ
SLGVDPTRTKESILKDSYDHHAAIYYLLLDRFSKPKTSHKAKTTTPSSSF
DGMKLALNQNSTSSCVPKPVVSQSSFSQYAQENAHWADGDSNLKCFTCGG
PILGSSSNTCVICVRLRTRRRNFAHPLNWNPLNIPTPPTSSGVNSIEPRG
PYDSRDSGVSSGSSQDYGEITPPVHEKSFPSRFHELSSREAASSSSENPF
SQLVRKLSEVERPPSIKSSEDEGVEFDEEGHSQSLNISELQFPSYYSTTS
LEDNEGSQVSIQKTYKSVAPFEVVDASSNFTQSLPSCSPSAEDRNITSEI
LASNLAIKNDFSYVSCNSRGASNVMMPNFRYERRASDTSTLRPIGXETFR
FNTPLSGVFDVNEEHTALKYKYGQNDFGVFNPSTTLVSGMGIPFSHNNME
XAILXHPYQXRISIPSNLNFFPIPTPLPASSNGSIRSPFQQNRLLQRRLI
LQKNARRLSRQGANKYSIPSSHKYHQHLNNTLQSHHPLQLDYPLETPTPE
YLFQPIVEDETDEFEELLGKKEERKELSSSASPVGDWQTLPVFMAESCRL
ESNSPMSPYLSSKKDNMDM
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mRNA from alignment at LSalAtl2s116:1856086..1878679-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000981-696828 ID=EMLSAT00000000981-696828|Name=EMLSAT00000000981|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=22594bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s116:1856086..1878679- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGACCATCATGGAGAAGTCATCTCCACATTCTCCATCCTCCACGAATAC GTCCTCAGATTACTCCGCAACGATCTCAACCAACAATGCACCATCATCTA CCTCTTCGTCATTCAACATGGTAGACTGTTCGGATAAACGAAAAAAGAAT CCGAGTGGAGTCCTGCGAGTTGGATTTTATGAAGTTGAGCGAACCATTGG ACGAGGGAATTTTGCTGTTGTTAAACTTGCTAAGCATAAAATAACGAAAA CGCAAGTAAGAAGAAGATTCTCTTTTCATCCTCCCAAATTCTCTCATCAT CTCCTGACCTAGTTTCCCCTTCCGTTCGAGTAAATTACATAATAACACAC AATAACACACACACGCACGACTACCACAAATGGTACAGGCTTAGCAAAAT AGCCAAATGGAAAAGAAAGCCTTTATTTTTATTTTTTGTTACCTTAGAAT ATATTTCTTTTTCTCCCACAGTCGACGGTATTAAAGTCTATGTTGCTTGG ATATAGTTGATATTTCCCTTTTTAATATTGCATTTATTGACCTAGATCCA ATTATAATTATTCGATCCCCTTAGGATCATTATACATGGCCTCATTCCTT AGTCCCTACCCCAAGAACCATAATGCAAGTCTCAGAAACATAAATCAATA ATTATGCTTATCATAATGACCTAAATTATGATTTTCTTTACCTTATAACA GGGATATCCAACACGTGGCCAGTGGGCTGCATTGGTGCCCGCTTGATGAT TAAGTGCAGCTCACTACTCATTTTCACTTCAAGGAGAATTTTTTTTATAT TTGAGAAAGCAGAGAAAAATTAATTATTTTTATAAGAAATTAAAAAAATA ATTTTTTTTATGAGAAAACAGCAAAAAAATCATTTTTTAAAGGATTTCTT TTCTAAAAAAAGAAGGTCACTTGATCAAATTATGCAGGGGAAATTTTATT CAAAAATTCCAACAAAACAAAAAAAATCCTGCCGACGCCCCTGAACAGGG ATGCCAGATGGTCCTTTTTTAAAACAGTTTGGCTTCAAAAAATTGATTCG GCCTAAATTAGAAATAAATATGTATTAAATAGTTTTGTTTTATAAAGCCA GTTTTTATAAAATTTAATTTAATAGGTTTTTGACCCAATAAAATATTTCA TGTGATAATGCGGCCCATTACTTAAAAGGCTGGACATTCTTGCCTTATAA GACATCATATGTGGTGTGTCGACATAAAAAAAAATCTTGAACAAAATGAA GTATTTTTTTACTTCATATATCTCATTATTTTATTGACATATTTTAGTCC ATTAAAGGGATTGTATTTAAATTTATAGAAAGCATTTTACCAATAGTTAC ATTTATGAGGTTTATATTGGACCCAAAATGGTCTTTCTAATAAAATCTAT CAATTTTCTGATTTTTTTGTTGTGACGATACATTTTGGGTACTTATAGTG GAATTTGCAGGGGGTACAAGGGGTTCTTCATAGGTGCTTGCAGGTGGTGG ATTGAAGGAGCAGGAAGCCACTCGAGATCAAATGAGAAATTTTTGTTTTT TTATAGATTTTTTGGGGGTCAGGATGATAAAAATTTACGCCAAAATAAGG GTAAAAATTACTTGTTTGAAAGATTCATTCTCTTAAAAAAAAAGGTCGTT CGGGCAAATTATGCAGCAGAGCAAAAAATTTAATATTTGAAAAATTTTCG GGAATTTTTTTATTTTTTTGTAAATAGTTGTATATTTTTGATCTTTTTTT GAAAAAATTTAATATTTGAAATCACTTTTTTGAAAAAAATTTCCAATTTC TTTTCCTAAAAATATAACTTTTCTAAGTTTTTTTCCAAAAAAAATAATTT TTTGTCAATAGCTGTTAATTTTTGAATTTTTTTTCCAGTAAATTTAATTT TTTGTAAACAGCTAGAATTTTTGTAATTAAAAAAAAATATATATTTAAAA TATCAAAAAGTTATTTTTCTCTGAAAAGCTATAGATTTTTTATTTTTTCT MAAAAAAATATAATATTTNGAAATTTTTATTCCAAAAATTTTAATTTTTT GTAAATAGCTATGGATTTTTTGAATTTTTTTCAAAAAAATCCCCCCCCCC CCCCTCGAAATATAATTTTGCGTAGGACCCTTTTAATTAAAATATTTTTT TTAATCAAAATTGCTTATAATTCATCAGAAAATACTGATGTAATCCCCAG TTAATTTTGAGAAGAATTATTCTTACTTATTTTTTGTTGACAATGGTAAA TGAAGAAAATCAATATTAATTTGATTCAGGGCTTAGCATATACATAGATA TTGTATATATGTATCCTTCAACTGTTACCCTTCTTCTTTTACAGAAATAT CAACAAAGCACTCTGCTATATGCTTGACTATATATGTGTTGAAATGAAAG AATGTTTCAAATGACGTCGTTTCTAAGCAGTATATAAATTATAATATTTA ATAGGTCAGCGTCGGTATATAGGATAGTTACATATATTTTTAAAAATAAG AGAGATGTCAATTAATGAATAAATTATTGTACTTATATAACTATCAAGTT AAATAATTATCAGTGATAGATATTTTTGTTGAACAGTTTACTTAATTTTT TATGTATATATTTTTATTTATACCTAACAAAAAACCAAAACAAAAAACAA TTGATTCATGACAAAGATATTGGGATTTTCCTATACATATATACGGGTAC TACTTTTGGGTTCAGTCTGAAACACCTAGACGGGCCTGAGACAGTTAAGA TTTTTGGTGGATTTTTAGTCTTTTAAAGAAATTCGGTTTGGAACGGTTTA AAAAACCCCTCTGGATCGGGCTAACAAAAAAATTGGGTTCATTTAAAATT AGGTGTAGACCAGGGATGTCCAACCCGTAGCTCGTGGGCCACATTACGGC CCGCATAATGTCTTAGTACAGCCCACCACTCATTTTCACTTCAAATAGTA TTTTTTTACAAAATTGTCACAATATCATATATAATACGTAGAAACAATGA AAAATATATTCCAAAAAAATCAAACTTTGATAAAATTATCACATTGAGAG AAAAAATTTTAATGAGAAAACAGGAAAAAAAAATTAATTAAAGGAAAAAA AGGTCATCTGATGAAACTTTTGCGTAAGGGATGACCAACACGTGGCCTGT GGGCTGCATTGCAAAAAAACAAAACAAAAAAACTCCAGGGGACTCTCCTG AACAGGGTTGAACAATTGTCCTTTATTTAATTCTTGTTATGTGGCCCTTT AAATTATTTCAATTGGCGATGCGGCCCATTATATTAAAAGGTTGGACATC CCTGGTTATGGTCGAATATGTATTTTTAACGTTTCATGTTACTTTAATCT TGACCTCACAAAATTTGGCCTCTTACTGTGAACATTTATAATCTTCAAAT CAAGTTTGATCAAAATCGATCAGGCACGTTTTGAAGTAATCCTGGTGACT AAGAAACAAACAATAGATACAAAAACAGACCCTCCGTTCAACTTCGTTGT GGAGGTAATTATAAAATCATAGTTGAAAGGCCTCATAAAGGGATTGTCTG GAGGAGTTGGGTAGGAGGGGCTATATCCCACTCCCAAATATACAAATTCC CCCTCCCACCCAAAAAAAAAATATTCAATATTTTTTTCCGAAAAATATAA CTTTTCAAATTTTTTTATAGAAATTTTTATCATCTCTGAATGCCAATATC TTTTTTATTTTTTTTTTCCTAAAAATTTTATGAGCTTTTGGAAGAAATAT TAATTTTGGGATTGAAAAAAGATGTGCAAAATAATGGCAATGCGGTCCAT 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