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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s116 | supercontig | LSalAtl2s116:1856086..1878679 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000981 >EMLSAP00000000981 ID=EMLSAP00000000981|Name=EMLSAP00000000981|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=869bp
MTIMEKSSPHSPSSTNTSSDYSATISTNNAPSSTSSSFNMVDCSDKRKKN PSGVLRVGFYEVERTIGRGNFAVVKLAKHKITKTQVAIKIIDKTQLDKAN LEKMYREVEIMKLLNHQHIIKLFQVMETKSLLYIVSEYASKGEIFEYIAI HGRMTEPAARRTFWQIVXAVDXCHRHHVVHRDLKAENLLLDLNMNIKIAD FGFSNYFQENSHLGTWCGSPPYAAPEVFEGKHYKGPEVDVWSLGVVLYVL VCGALPFDASSLHALRDREQVPVEFQNQSSIKEPSSQPRIISEKVLRVMQ SLGVDPTRTKESILKDSYDHHAAIYYLLLDRFSKPKTSHKAKTTTPSSSF DGMKLALNQNSTSSCVPKPVVSQSSFSQYAQENAHWADGDSNLKCFTCGG PILGSSSNTCVICVRLRTRRRNFAHPLNWNPLNIPTPPTSSGVNSIEPRG PYDSRDSGVSSGSSQDYGEITPPVHEKSFPSRFHELSSREAASSSSENPF SQLVRKLSEVERPPSIKSSEDEGVEFDEEGHSQSLNISELQFPSYYSTTS LEDNEGSQVSIQKTYKSVAPFEVVDASSNFTQSLPSCSPSAEDRNITSEI LASNLAIKNDFSYVSCNSRGASNVMMPNFRYERRASDTSTLRPIGXETFR FNTPLSGVFDVNEEHTALKYKYGQNDFGVFNPSTTLVSGMGIPFSHNNME XAILXHPYQXRISIPSNLNFFPIPTPLPASSNGSIRSPFQQNRLLQRRLI LQKNARRLSRQGANKYSIPSSHKYHQHLNNTLQSHHPLQLDYPLETPTPE YLFQPIVEDETDEFEELLGKKEERKELSSSASPVGDWQTLPVFMAESCRL ESNSPMSPYLSSKKDNMDM back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s116:1856086..1878679- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000981-696828 ID=EMLSAT00000000981-696828|Name=EMLSAT00000000981|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=22594bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s116:1856086..1878679- (Lepeophtheirus salmonis) ATGACCATCATGGAGAAGTCATCTCCACATTCTCCATCCTCCACGAATAC
GTCCTCAGATTACTCCGCAACGATCTCAACCAACAATGCACCATCATCTA
CCTCTTCGTCATTCAACATGGTAGACTGTTCGGATAAACGAAAAAAGAAT
CCGAGTGGAGTCCTGCGAGTTGGATTTTATGAAGTTGAGCGAACCATTGG
ACGAGGGAATTTTGCTGTTGTTAAACTTGCTAAGCATAAAATAACGAAAA
CGCAAGTAAGAAGAAGATTCTCTTTTCATCCTCCCAAATTCTCTCATCAT
CTCCTGACCTAGTTTCCCCTTCCGTTCGAGTAAATTACATAATAACACAC
AATAACACACACACGCACGACTACCACAAATGGTACAGGCTTAGCAAAAT
AGCCAAATGGAAAAGAAAGCCTTTATTTTTATTTTTTGTTACCTTAGAAT
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ATATAGTTGATATTTCCCTTTTTAATATTGCATTTATTGACCTAGATCCA
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AGTCCCTACCCCAAGAACCATAATGCAAGTCTCAGAAACATAAATCAATA
ATTATGCTTATCATAATGACCTAAATTATGATTTTCTTTACCTTATAACA
GGGATATCCAACACGTGGCCAGTGGGCTGCATTGGTGCCCGCTTGATGAT
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CCGCATAATGTCTTAGTACAGCCCACCACTCATTTTCACTTCAAATAGTA
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CAGGATTTCTCATAGGTGTAAAATCCCGAGAAATTTCGAAAAAGGGGATT
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GTTAATTTAATCCTTGATCAATTCCCTTTGATATATATATATAGGTACTA
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TTCCTTACTAATGATCTGTTTAGAGAATAGTGAATAATATTATATGATCT
TTTTAATTCTTCTGTGATAGGTGGCGATTAAAATAATCGACAAAACACAA
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AGAGCTTGCTCTATATTGTGTCGGAGTATGCAAGTAAAGGTGAAATATTC
GGTAAGGGATTTTTCTAAAACAATACGTAATATTATTATGTAGATATAAC
CCTAATTGTCGTTTCAAATATAACATCATATAGAGTATATAGCCATCCAT
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GGATTCTCAAATTATTTCCAAGAGAACAGTCATTTGGGCACTTGGTGTGG
TTCTCCTCCCTATGCTGCTCCGGAAGTATTTGAGGGGAAGCATTATAAAG
GACCAGAAGTGGACGTATGGGTATGTAATATTTAGATAACAATTATTCTA
TATATGACGTAGAGCTTAATATGCTAATAAATTAGCTGCAAGAATCTGTA
AGAGGAAGGATATATACACAGATGCTGTTGTGTCGGKCCCATTCAGTCCA
GTCCTGCTTGTTGGTCCTTAGAGAAGGTAAAACTGATCACATTCGACATC
ATTGAGGATCCCCCCCCCCTTTTTATTATTATTCCGTAATATATGTAATA
GAATAATAAATTATATAACTAAGTGCAATATAATATGTTCGTGTTATAAT
GTACTATAATGAAAAAACCTTTTTTTTTTTGCTAAGAATGTGTAATACNN
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GGTATAAAATAAAGCTGTCTAAGAGCCCCAGATAGCTCATAAGACTCCAG
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CATCTTGTGAGCCCCAAACTCAATCAGTTAGACGATTGGGATGGTGAACA
GTTCAAAGATGGACTGGTCAGAGAAGAGAACTCTTCTCCAGTAATTTATT
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TCCGTGAGTTTAGGCTGCATTCGAGACCTGTATGGAAATACCGTCAGCGA
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GTTTTGGAACTCTCGAAAGTTTTTTCTTCCTTCCACATCCACCCTTATTC
TCGATGCTCTCCCCGGAAAGGTAACAGTTCCGTCACCTACGAATGGTTTG
GGCCGAAACGCAAAGGTCCCAAGGGATCTCAKCCTGCCTATTCCTTGCCT
CAAGTCGTCCTACGGCCCTGCTTCAGGTGCTTTAAGGAGTGCTCCTTCAC
CTTTCTGTAATGTGTAAATTTCAATTTAAAAAAAATATTTAAAGGTTGCT
TCCTCACCTTAATTTGGGTCGATATATATTTTTAAGATCCTCTAAGTCCA
CGTGCTTATATTCTTATGTTTTTCCTTATCTTCTTTTTGGAGAAACTGCA
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TTGAATAAGTGTTCACATGCCGGTCCAACTCGATGATTTCCATTATTTTA
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CATATTACCAGAACGGAATGGTTGGAACAACACTACTTTACTGTTGCAGT
CGATACTGTATTGGGTCCATATTTTGTTTTTCTTCGTAGCCTGCTCAACG
GTTTCTTCTTGGTTGTAGTGATACTGAAGACTGTATCGAATTTTCTCTTT
TTTTACTTCCATTTTGGAACGCTGCAACACAAAACTATAAATCAACTTTT
TAAAAGTGTACACTTAACCCTTAAGCATACTTTAAGTTTTTTTTATGCAA
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GTATAGCAAAAAGAAAGTACCGAAAAATGACCATTTGAAGAATGTTTTGA
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TATACTATGTGACCTGAACGTGTCGTCATACCATATGTAATCCCATACAA
TAAGTCCTTTTCGTATTATCATTGCATGAATGACGATTTGTAGTCAAGTA
ATACGTAAAATAGTTAGTACATTTAAAGTAGTTGAATATTGAATTTCATC
CATTGTGAGTTCTAAGGTATAATTCATGTACTGTGTTCATAAATAATGTA
TCTACTACTTAGTGCTTCTATTATTAACAGATGAAGCTTTATGTAGCTTG
ATATATGTATACGATATGTGTTCAAAAAGGGAGATGACTTGTCTAAGTTT
TTTTATGTTGGTACACTCGACACGAAGATCTAGTTAGTCTTTCAGCTATA
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GTGTTCCGCGTATTTTTTACTTTTGAAAAATATGGATAAATGAATTTCCA
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TTTTGACAATGGCATACGGTGAAACTGTTCTGAGTTAAAAACAAGTTTAC
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TTGACAAAAAGAATCGTCCCATTTTTGTGCCCAAAACTAAACCGCAATTA
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ATAGAGGTCGCACCCTATATAGGATACATAAATATCCTACAAAATATTAT
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CGTACATATATTCAATACGAATTAAAAAAACGAAATTAGGTAAAAGAAGA
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ATGTACACAGAGTCAAGGCCTATATCTACTTCTAAAGTATGTACTATATT
GACATAGATATCCATGGACAATCCCTAAATATGCTCCAATATTTTTTTTC
TAAATCATGGCCTTAACTCAATTACTCGTTATTTTGTTCTCATTTTTTGA
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GTATGTATTTTAGGGGTGCAAATTAAATTAAATTAGAATGTGCACTCTGT
CATTATGGGGGCAAGAAATATGTAGAGTAAGATTGAGGCTTTCTTAGGTA
GTTATCTTCTATAACTGTTAAAGCAAGGTTTGTTTGTTCGTCTGTGCATA
ATACATCCAGGGAATGCCAAATGTTACCAATGGATATCATTTGCACCACA
AAATACAACAAAAATGCGGTGTACAGCATTGTCAAACGGCTGCAAAGTGG
CAGAGGCATGCTGCTTGTGGTCCTCACATGGCCAAAAATTGCAACCTATG
TTTTCTCCGCCTTTCTTAGTAGCCTGGACTCTGTGACTAAAGCTAATGGC
GGCCATATCGAGMACAAAGTAGACCTGAAAATTAATATTTTTGAAAAATA
TCTGCCCAATTGTGAAAAAAATAAAAATATAATGGGGCTTAAAGTTTTGT
GTTAATACTTCTGCCCACCTCTGTAATAATTCTACCTTCCCAACATGTCT
TATGATGAAATATATGACGTCAGTCTTCACATTCTTAATCATTGAAAGAT
ACATATCTGTATTTTTCGAACAGGTATTCGGGCATTTAATTTTGCTATTA
TCATATTATTCACCATCAGTTAGATTTTTTTTATTAACTTTATTATCATA
ATTTATTGACGTCATTATAAATTTGCAGCAAATATTTAGGCTTAGTCCTA
ATTTTAGATACGAGTAGAATATGCTTATGTTTGCGCTAAGAAAACATTAC
ATTCTTGACGTGGGATATTTTTATCTTTACTTCAGTTTGTGAAAAAATTA
TTTTTATAAAYATCTTAACAAAAAAAAAAAAAAAGATTTAATTGAGAAAA
AGWAAGATAAGTGAAAAAATATATGAAGTGTGTCAACATAAAAACTATCT
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TATATGAAAAATTTAAATTCCATACTCATCGTGAATGGATATTTTTATTG
TTTCGATCCTGGGTTCTCTCTCCCACACTCAAAGAAGGAGTCCACTCAAC
TCTCATATGAAACTTGGTAATTTTCCTAGATTGAGTTTTCATCCCTTCGT
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TCCCTCTATTTTCTAGTGAAAAAAAAATGATGCTATTCTGGTAAAACCAT
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TTGTGCTTGTTGTATATCCAAGATATCATGTTGTTCATAGGAAATATTAG
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GTCAATGTCAAGTCATACGTCCTCAACTCTATATTAAAAAGTGATGACAA
GATTAAAATTCATCTGAGGAAAACTACCAGGCTTCATAAGAGAGGAAGGA
GATTCCAGGATCGAGACAGTGAAGAGATCCATTCACGATGAGTAGTGAAT
TAAAATTTTTCCAATATAATTAGTAATTACTTTATTTGAATTTGTACGAA
GCACAGTATTATGATATTAACTACTACGGGGTATGATTTCATTATCACGA
CCTTAAAATTGTAAACAATATTAAAATAAGGTTTTTTTATTTTCTAGTAG
AACTCCTATATAAAATATGATCACTCAAAAAATACAAAATACAACCCAAA
TCCTTTGAATATACATTTTTTTCAATAAGTGTTTTTTAAATAAATTAGGG
AATGTTTTTTAAAAATAATATAAGCTATTATACTCTTTATCACAATGAAT
GATAAATAAGTTGTAAGTATAATTAACTTATAATTTGTGATTGATCACCC
AATCACTTAAAAATGGCTCATCTACCTAGGGGTAATCTACCTGCCAAATT
CTCCTTCATTAGGCTCACTTTTTGGAGGTAAATATATATATGATAAAATC
AGGGTAGTGATTACATGATCAATATATGAGGGATCCAGATTCTGACAACA
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ATCCCCATTGAATCTTACAACAAATAAAAAATGTCTCCATCTAACAAGAC
TCATGATGACCTCCTCAATTTCAAATTCCCTTTAACTAATAGTGTNTCCT
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AGAAAATCTTTCTAAAATCTTGATTTGTTGATATTATATAGCAAAATTTA
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TAATTTAAGTTTTAATTTCAAAAATTCTAAGTTGAATTAGAAGGGCCTAA
AATAAAGTGTTGTTGTTCTTCAATTTTAAGTATAATTTGCGACGCTCCGA
AAGGGTTGATAAGAATATGATGGAAATGGAATTTGTCCAGGAATACAAAT
GTAATCCACACTCAATTTTGGGAAAAATTATTCTTGCTTGATTTTTTGCT
GAGGGGCAGTATCTAATTTTAAAAATTATATTTTCTGTTGACTTGCATAA
ATTATTAACGTATGTATTATTCTTTTTTATCATGTAATCATAATCATATT
TACAATTTTACATTCCGAGTGTTCCATTGAAATCTGAACACCTTGAAATT
TAAACTTGAAGAAGTCATAATTTATTAATTAACAATCAAATTAAAAAATA
TACTATAAGTAAATGTGTGTCTGAGCTCTCTTAATCATTAAKGCAGCTGT
CCGTAGCGGCAATGATGGGTTCCAAGCCGTAGCAGAAGGCCTGGCATGTG
GAGTACTCTATTATGATGTCCCAGCACTGGCTGACAATGGCTTTGAGGGC
CTCGTGTTTGTAGAAAACGGGCACTCCAGGCCTTCCCCTCAACATGCACA
CAAATGTTGTAGTCGAGGGTGTTGGCATCAGGGACAATAGTTTTAAAAAA
CTGTTCAAAAGAGTCTTATAATTGAGGAAATGGGGGTCTTTCATTGTCAA
ATATGTCAAAATATCCTCTTTTTTTTTTTACCTTTAAGAAACGTAGGTTG
TTTAGCTTTAAAACTGCATTTCCGCAGGATTGGATCATTAAAAATACTTA
AAAAATTATCGGAAGCCAGATTTGAAAAAAGTATTTACAAATCTGTAATA
AAAAGTAAAGTACTTCTGAATTTCAATACGGGATTTAAAAGATTTTTGAA
AAGTTATAATTTTGTTGAGTTTTGTAGTTTATTTTTGGATGATCTCTGCA
TATTACTCGTAAAAAGTATGAAGCTTCAAAATTATCCTTTACAAAACAAA
GAGGTTTTGTGATTATTATTATTTCCCCACGATCAATTAAATTTTAAATC
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CTTCTTCAAATGAAAAACATTTCAATCACAGAACCTCTTTATTTTGAAAA
GGATAATTTTTGAGGTTTGAAGAAATATACTGCTTTTTTAGAAATAAATT
GTCTATACATACCAACCACGTTGTGACGTTACAAGTCTTTGTGATGTAGA
AACTCAGTTATCTCACGAATATCAAATTTGCACTGCATTTTATTGTCAAC
TGTCGGTTTTTCTACTTGGTATTTTTCTGAACGTTGATTTGTTCGGGATT
AAATTAGCTCTTGTTAAGCTGTGAATACGTTCTTATATTGAATGTACCGC
AAAAAATTTCCTTAAAGAAAACAGAACAAAGCCCCAAAATAATTTTTTCC
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TAACCAATCAACGTTCAGAAAGTTGTAATAGGTTTCCTAAAAATATTGAG
TGTTGAATCAGGCCCAAAATAACAAACGTTGATTACGGCACTGATTAACA
TCGCTTAGTAAATCTGCGTCCTCTTGCAAGTATGAATATTTTTTTAATTT
GCCCATCCTTAATTGCCGAACAGCCAAAGGTGTATAAAACATGTCATAGA
AAGCAGGAACGGTTTTTTCTAGTTAGTAATTTGAACAGGGTTTTGATTTT
CCAAACCTGTTATCATTATTATTTAATTTTTGAAGACAACATCTAATTTT
TTACTATAAAGTAATAATCCGTGCGTGTGCTCATGCTAGACAAAAAGTAA
TAATAAAGGTTTGCTTGAGAGTTGGAAACCCTTGTTGGACTTAGAGTAGA
ATTGAGGATCGACATTGGAGTACGAGGGTGCCCTGAAAAGTTCGGATCTC
AATGTGAACATGACAGTACACGTAAAAACTTAAATATTCATGAGATTTAA
GTCCGAATAGAGTCTGAAGTGGCAGKTCAATGTGATTAAAGTACGATTCA
AGGTCTTGTTGTGATTAGGAATCCTTCCCGTCTTTGATTAATATATCATT
ATTGATATGATGGAAATTAATCTACACATCTATCCAGCATCTGTTGACAG
TCACTCACCAAAGTTTCACCCATTTTTGAGGCGCAGTTGTTATCGAACAG
TCGTTTGCGTGAGTTGATGTGTGTGATTTTGTGAAAATGAACAAATATGT
AGAGTATGAAGCTGTCATCAAATATCTGTTTTTGAAAGTTTAACCCTTCA
ATAGATTCATAACATAAAAGATACATTAAGGCTTGATGTGTTAAATTTTG
ACGCGTCCAAGTCAATCCAACTCGGATTAATTGAGCCAAAAACAAAAAAT
GTAGTGTAAAAAATTATTTTACAAAAAACAAAACAAACGCCAAGTACTAT
TTGGACGGGTTAATGAGATGGTAGCATCATTGTGAGAAGTCTGTAGAGTC
ACAACGATAACATCTCGTGAACAATGTTAAAAAATGAGGAAAAAATCAAC
TGATTTTGGGCCTTCCCCCTGTTTTTATTTATTTATTCATATTTAATGAA
TCCTTTACTCAAATCTATTTTATTTTAGACATTTCTTCTTTTTTTTTATT
TTACTTTTCTATATTTTGATTATTGTTTCCAATTGACGTGTGAATGTATG
CCTAGTTAGGCATACCTGTATGGAAGTATGTTTGTTATAAGCTTATATGT
ATCTAAAATAATAAATGTTTCATTTCTATGACGTCATTAATTGACGTCAT
GGGATATAATAAATACTTATCGAATGTATCAAAGTCTTTATATATACATA
TCTCTCTCTGCAAAATACCATTTATGCTTGATTAACAAATTATAACTATT
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