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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s1185 | supercontig | LSalAtl2s1185:44264..52957 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001105 >EMLSAP00000001105 ID=EMLSAP00000001105|Name=EMLSAP00000001105|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=558bp
MKKPWTNRYSVNNHDYSNIRTTEDDETIYLEPTSSIYASIKPIKERLPQE
RHNCNIILEQSNQGEKIFRDAIVEGNLKNVNDFVNETCSVAVLLRPLRGK
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QRPLFRPLLLIKEGIFLGFVFAGLLDEGNTAMIYRGRSCTISWVRLFVSI
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FCQTTDTPIYNKINENESLDYSNLQLTKYRTLLQTIESIPHQNFPNESGY
TNLYWNNR back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1185:44264..52957+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001105-696952 ID=EMLSAT00000001105-696952|Name=EMLSAT00000001105|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=8694bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1185:44264..52957+ (Lepeophtheirus salmonis)
CACTAAAGCATTTATTAGTGTATGTAATCATATTGGAACTGATAAACTGA
TAAACAGTTTGAAGGATGAAGAAACCTTGGACAAATAGGTATTCGGTCAA
TAATCATGATTATTCAAATATAAGAACTACTGAGGATGACGAAACAATTT
ATTTAGAGCCAACAAGTTCTATCTACGCCTCTATTAAGCCCATAAAAGGT
AGGCGAGTCCACCGTCATCTATATATTTAATTAGCCCTTTCACATAGGAA
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TCTATTTTTKGGAATACTTTTACTCCTCAAAATTAGTCTTTATCTATTAT
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AACCTTCTCGTTTCGGAGGCATTCGCAGTATTATATTCTTTTTTAGGAAA
AAAATTCTATAAAAAAACTTGGTCCCTAAATTCTCGTAAAAATTTAATCT
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TTCTCCCAATACCGTATGTGGTAATGGCTGGAAAAGGGAAAATTGTCCAT
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ATCGGCATCTTTGTAGTTCTTCCACATATCATTGCTAGATACCGGGTGGG
ATTCGTGTTAATTTCCTTCATCTCAGGTCTGCTAGCAGATAATTATTTAA
TGAAACGACATGACTGCACTCCTATAAAACATTCTTCAAACTGTCAAGGT
GACCACGCTAATTTTAGGGTTTTTTTAACCTATGGTAGGTGATGTTATTT
GAACCTATAAATATAGTAACTTTGAGAGACGACATATATATTGACAGAAT
CACTATAAACTATTTATAATAGTAATGGATGCTCGTTAATAAGCAGGGAT
TAAAAAATATGAAAATTGAAGATCCATCTATTTTTCTAATTGCCACTATA
AAATGTAATATTTACCAAAAGCTGTCATCATTATTTCTTAMCAGGGGTGC
TCCCAGGTTGTGGGATGGAGGGGCTGTATCTCCCTTAATTTAGGGAAATT
TTGCTTTATATTAGAAAATTTCATATTTGATTTTTTTATTTATTTAATTT
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CGAATAGATACGATTTTGGAAATTTTCTCAAAAAAATTAATTTTCTCCAA
AAAGTTTTGGATTTATAGTATTCTTTTCCAAAAAATGTAATTTTTTGAGA
ATAGCTATTGGTTATTGAATTTTTTGTCTAAAAAGTTTAAATATTGTTAA
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AAATTTAACATTTGAAATTTTTGTTTCAGAAAATTTGAAAATAATTTGAG
AATTTTTTTTTTTTTCCTAAAAAGTTTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTGAG
TAGCTGTGGATTTTTGAAATTCTTGTACAAATATTTTAACTAAATGTGAA
TTACCGTTAATTTTTTAATTTTTTATCAAAAAATGTAATTTTTTACGAGT
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AAATCCAAAAACCAAGCTCAGCCAAAAATATAATCCTCCGGTTACCCTTG
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AGTACATGTTGCAACATGTATAAGCAAATTGAACAAATTACAACCAAAAA
TCATTTTAATTGAAGAATTTATGGCTAKTACTATAYTTATAATGAGGATA
AWATAAWATTTATATMTATATTACGTAGATGGTCCATGAATTAATAGTGG
AAAGTTGGCTTTACTAATTGATTTGAAATATTCTGTGGCACATTATCAAG
TTAAAATAATCACAAGTATATATACTAATCGTTAATTCATCTTAGTTAAT
ACGATAATGTTTTACTCCCGGCCATACATATATAATAACATCATATCTTG
CGTCCTTCAATCTAGGTATGCAAAGTGCCCACCATGAGATACAATTTAAG
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TTTGAAAAAAATCTTACTCATTGTCTTAAAAAAGCAACAATGCTTCAATT
AAATACCCATTTACCCAGTAAAAAATAGTGTATGAATGTTAAAAAATTTA
TCATATTCATATTTTTGATCTAAGAAATAAGAAAGTTATCATATTAATGA
AATTTCGCAGGAGTTTTGGATGTAGTATCGAGCGTGTTTACAGACTTCAC
TGTATATATAGCGATCTCTGATTTATATTTTTGATATAATAAATAACAAT
GTTGTCATACTAACGAGGGTTAATAGAAATAAAAGGTTTTCCCGTCATAT
AATCATTCTTGCTAGAATTTTCAATTTTTGTCCTGTTCTGACTGTACGTC
AAACAGACAAATATGACGTCATAGAGTATAACAGCGATACTCTAACAGTA
ACAGTGAAAGAAGGCGATATATAAATGCTCTTGGTAACAGGCATACTCTT
TGACCTCACAATTTAAATTTGTAGTGGATTTCAAACATTTGTCGGGAAAG
TGTTATGATATAATCTTGTATTCCTATTAACCTTGATATTAAGGAAATCC
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AGGAAACCCTCTTGAGACAAAAGTTATCCCGGGCTTATCAGTCATAACGT
CATTTTTTTTCTTTCTCAAGCTGCTATTATTAGTCCTTCATTCTTGAGGA
GAGAACATCTATATATTGAGTAACTCTGTGTGAGTTTACTCATGAAAAAC
AGTAAGAAACACTGATAGTTTCTTGGGTAGTTATCATCTATATTTTTTGG
GGAAAGGTTGTTTGTTCAACGACACTTAATTACTCCGGACAATGCCGAGG
ACTACCGCTAATACATAATAAATAACTACATTCAAACCTGTATTTCAGGG
TCAAGAAGATCAGGTTTGAATGTGATTTCAATGGATTTCAATGAAGTAAT
TGCATCAATAACTATTTGATAATTAAAATGACCGTCTTGTAGTTAAATAA
AACGCAATGAGACGTAAAATTTGTAACTTTTACAATCACTGTATATGAGT
TTCAACTTGTACAGAAGTCGTAACTTGTACATGACATACATAAATACATA
CATGTAAAAGTCTGAGCATGAGGGTATTTTTATGATATGTAGTCAATTTC
AAAATACTCAATGTAAGAAGGGGTGTACTACTAACACTTAGGCTTTGATA
TCAAATTGTTTATAACTTGCATTTGACAAAATATAGTAATGCTCAAAGTA
TAAGTAGGTGAGAAACAAAATGTTGTAACTAGATCATTTTTGAATTTTTT
TGCGAAAACATCAATATAATGATCATTATTGGGGGAGGATCAGAATTTTT
TGTCAACTTTTCTATGACAAAATTAGATTTTTTTAGCATAAATATTCAAC
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TCTACATTTCTTAACATCCAACTCAAACTTATTTATTTTAACCGTCTCCA
AGTGACAAGGATTTTTACAAATACTCTTAAATCCGAGCTGGACACACACC
TGTAGCTAAGGACCTAGTCCCTAACGACTTTTACAACTCTCTCCGGCTAC
GTTGACAGCTGCAGTATTTGATGGTTCATATTTAACCATTTATCTTATGA
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TTGAGCATACAAAACATTTCCCAAGAAAAAAAAAATAATACATAATACCA
TTGATATGTAATCTAAGTTTCAAATGCATTTATTACTAATTCAGAATGCT
ACCAAGAATTTCATTTCATAAAACACAATTTATATTATCATTCTACTTAT
ACATAATTTACTTACAATTTCCTAGGCAGAATTATATAAAGGTTGTTGAA
AATGAAAGGATTGAAACAGTCGTGAAACAGGTAAACTCCGGTATTTACGA
TGCTAAAGTGCATTAATATTTATCCCTAAAACACATATTAACCCGATAAT
TGTTGCAGGGAGGGGGGGGAGACTTGCGAAKATAGGCMGAAAGGGTTWTC
CRCTCCCCCCCCCCCCCACCATCAGCTATCCCATGTTTGCATTTACTATA
ATTAGAGTTGTCATGTTTGATAGAAAAAAAACTACGTTTAAAAATAAGAA
AAGGAAAAACAGTTATTGCGTGTGCTCTTTCTTCATTTTTGTTCATTATT
TAATAGGTCGTGGCTTRTGCCTCTGAAATAAGCATTCTAACCACTCTGGG
GTGTAAATTGAATAAAATTGTGTATTAAAGTAAGCACACATATATATAAA
TTTAAATATAATAGTACAATAGTTTCCCTGCACTAATACTATTTTAAATG
TGAAAAATTATCCTCTTTATAGCAGTAATTCATTTTRTCCACTCAAAAGC
CATATATCAGGAAGAGGATATTAACAAGGGTTTTAATTCAGTAGAACAAT
AATTCCTTCTGCTTGAGCTCTTTTTTTCCTTGCAAACATGTCAACTCTAA
TTATAGCAGATGGGAACATAAGATAGTTGATGGGGGAGGGGGGTAAACAG
GTTGTGTATATGACCCCAAGAACTACATAATGGTAAAACATATTCAAAAA
TATCAAAGAGATGTACATAGATATATTGTGTTACATTTGATTTTGCATGT
CTAAATCAAAAGAACTCCGGGTAACTGGGCCAAAAAGCATAATAAGTATC
CTAAATATTATGAAAATATTGATTTGATCATTAAATTGAGTTTCAATGTT
CTTAATAATGTCACTCTTTATATGATAGTTAGGGTGTNGGAATAATATAT
TATTTCTTTATAATGATGGGGTATAACTTACCCAAAAAAATATTTTCTTT
GTAGCAATTTCTGATAAAATGTGAAATATTAGATGTATGTATTTATTTTA
CATTTTTACTGTAGGATTCAAAAAGGCGGTCATTTTTAAGAGTTGTAAAG
TTAATACAATCAATAAATATCATGCTAGGAAACAGATGTTCTGTTTGAAA
ATGCTAATAAAGTAGAAACACATCTTTGAGATTAGTATTTTGAAATCCAC
TTTTAATTTATGTGTGGCATTGTTAGGTTGGAGTTTTATCTTTCATTTTA
AAAGATTAGATAATAATATTTCCATTACTTGATTCATTTTTGACTAGTAT
ATAAATTTCATAGAATTTTAACGTATAAGCCTTTACGTTATGCCTTCAGA
GCGATTACCTCAAGAAAGACATAATTGTAATATTATCTTGGAACAGTCTA
ACCAAGGAGAAAAAATCTTTCGTGATGCGATAGTGGAAGGAAACCTTAAG
AATGTCAATGATTTTGTAAACGAAACATGTAGTGTTGCCGTACTTTTAAG
ACCTTTGAGGGGAAAGTCGGAATGCGAAGAGGATGACGGACAATTATTTC
ATCCCTTTGATTTGGCTATTCAATTTGAACAATTTAAAATTCTTCGCACA
TTAATTGATCACATAATTAGAGGTAAGTTGGATTAGTAATTTCATTTTTG
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TCTAGAAAATCTTTAATTTATAAAACAGACCAATATTTTCTATACCTATT
TCAATCAATTATAAGCTTTTTATTCAAATTTCTGATGAGGTGAGATACCT
AAGAAAAATACATTACATTTATTTGATTTAATTTGACCCTGATATAGCTT
TTGAAATGAAATCTGTAAATTCTTAATTTGATATCATCGTGACGATGAAT
TTTTGCTACTGCAAGTGCAATTTGCAGTATTTTGAAAGAATGTGAAAGAA
TGCTCTAATAATAAAAATTGACCATCATTCAATAAAAATAATTCTAGCTT
GATTTAATTTTGACTAACCTCATTTTTTCCCAAATAAAATATTATTTAAT
ATAGTCGAGAGAATGTCAAACATCTATTTCATAACTTTTTTTCTATACAT
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GGACAACAAAAATTCAGGAATTAGATGTTGTGTTTATGGATTTAATTGTC
CGATATCCCGTCGCTGCTCATGCTCTCATGAACTCTTTTGTCTCATATGT
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AGCTTTTGAGTAATATAAAGGTTCTCAAAAAAATTGCGGCATCCGAAAAT
AACGAATTGCTCAGACACCCTCTCCTAGGGGTCTACCTCTCGAAAAAATG
GAAGGATTTCAAATTAATTTACTATCTGGGATTTATTTTCCAAATCGTAG
CTGCTCTTTGTGTGACAGGCTATGCTCTCGTTCGAAAAAATGATGATGAT
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GGAATATTTTTAGGGTTTGTATTTGCAGGTCTCTTAGATGAAGGAAATAC
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TCGTTTCCATTTCAACTATTCCGGATCAACGGTGTTTGTATGCTTATGCA
TTTAAAAGAATAATTGTAATTGCATTCTTTAAAGCCGGATTAGGCTCGGG
TATATTTTTTCCTCTAATAGGTTTTATATTGGGGGCCTATATTATGTCAG
AAGATGGGACTTCTTTCGTAAGTTGAACTACGATTAACCTTATGTATAAC
CTTCCATCATATATATTTATTTTTATTTAGTCGGGAGAGTCTTTGGGAGT
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GCCTCTCAGTAGCAAAGGTTCGAGAGGATGTTTTATCCATCCGTGGAGAG
GACTATATCAAAAAAATAATGACCTTAACAGTCTACAAATATCAAAAGTT
AATATTTTTTTGGCTAAAGATTTTAACATTTCTTAGAAAATATTTTTCCT
CGAGTTCATCAACGTACATCATTCTTCCAAAGCAATTTGAGGATGAAAAC
GCTCCCAAAAAAGGAGTATTTTCATTCTGTCAAACAACTGATACGCCTAT
ATATAACAAAATTAATGAAAATGAATCCTTAGACTATTCAAACCTTCAAT
TGACAAAATACAGAACTTTATTACAAACAATTGAGTCAATTCCTCATCAA
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AAAACTACAACTAATTAGTCGAGCCCAAACAAAGAACTCAATATCGACTC
CTTAAAGATGCAATTATTCGCGATATTAAGATCAACTATAATTCGAGTGA
ACGGACCCAAATCTTTTTAAACTCGTCCCATTTGACTCAATTAATAACAT
TTATATTAAAACTACGTTAATTATGTATATATATTTTGATAATATGTTAG
AACTTTTAATTTCCAACGATGTTACCTTCGCTAACGCAAAAATACCCTTT
GTAGTTTCTTTCCGCTGTCGATTTCCTCGTCTCACTTGATACGCCTTGGC
TATTTCATAATTTATTGTTTTTGATAAATAAACTGAGTAATAAGTTATTC
TCTACTTTTGCTCCGTTTCCAAAAGAACAGGAATACAACTTCTTGTTGAT
CCCTCGAAGTATATGTATATAGGGAGAGTGAGGATACATGTTACAAAAAA
TTCTATATATTTTTAAACTGTCATAAGTTTCACAATTTAAAAGATAATTC
AACGCCCAGGCAACATGGCATAGATAGTTACTTAAGACAAATGATCCCTA
AGTATTTTTGAGGTAGTGTAATAAGTGAATTAATACTTCTTTAACACAAT
ACTACTTTAACAGGGTTCTTAGATAACTTTATGTTATAAAATCATTGACA
GTGTAACATGTCTCCTCCGTAATAAGTATCCTCCAATATATATATTGGCT
TTTTTTTTTTTTCTATAAAGACATGTTGGCTATCATACACAGATTTCAAT
GTTTATCTACACTTTTAATAAAATATTACTAAGCAATATATAAA back to top
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