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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1190 | supercontig | LSalAtl2s1190:119180..160561 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001148 >EMLSAP00000001148 ID=EMLSAP00000001148|Name=EMLSAP00000001148|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=136bp
MRGSNHFIMFLNRLGAINNIIMNKFVVFGLLLFLCKTEIISSFPILNEDD SSEPNLFNSYENYKNYEKKVIDYIRNLELEMNELNGSDQLSDMMNTDYHN IDKRRNGGKRSLFKRNGKFIPITTLSSKLLNLPNFG back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1190:119180..160561- Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001148-696995 ID=EMLSAT00000001148-696995|Name=EMLSAT00000001148|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=41382bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1190:119180..160561- (Lepeophtheirus salmonis) AAAGTGTTAAATCACATTTGTATCCAAACAATTCAAATGCGAGGATCAAA
TCACTTCATAATGGTAAGTCAAAATTAGTATCCACTATTAAATTTATATT
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GTACTAAAATTATTTAAAACAAATAATTAAATGTTGTGTTTAATAAATAA
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GCGAAGAAATCAATATTGTATAAAAAATAAGTGGATATAAATAAATATGA
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TATCTTGAATATAACAAATATGGATTTTAATTATCTTTCTAACATAACCG
AATATGATGCCTCTTTTGCCTTGTAATTTTGAATATTCTCTCTAAAGATA
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ACTTGCATATAGCATGGAATAGTTTGTAATAAAGACTAATAATAGTTCTT
CAAGCAATAATAAGAATTATTTTGAAATCTCTGCTCGCCTGACAAGAATA
TCAATAACGAAATATCAATTGAATGTCCAAAATAAAATTAAATGAATCAA
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AATTTAGAGGAATATCGTTCCTTCTAATGATTTTTATTTGTTCAATTAAT
AGTCAAACAATTGCATTATTACTTTGATACATTTTAACTATTGTATTCAG
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AATTGCAACGAAATTCAAATATACCAATAGAAATCTTTAAGAAGTTACTT
ATATTTTTTAGTACAATAGTGAATTAACAGCTCCCAATAACTATTTTTAT
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CAAGTAATATAAAAATCAATAATTAGGGGTGAGGGTTAAGTGTCCAGGTT
ATATAGGGATGCATAAAGACCATACAGCACAAACTCCATCTTATAAATTG
AATTGATATCAATGTGATTGAGGTATGATATATCTGCATCATAAACATAA
AGGAAACTTATGAATAAAATAGATTTATTAGTATATTAGACGAAGCAGAG
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TCAATATATTTAATAGGAGAGCTTATTTTGTTACATCGTTAAATTTATTT
ATTTTAATTAGACGAAACGGAGAAAAGGACTCAAGAACTTCAATGCAGGA
GCAGAGGATGGAGTATGAAAGATTTTATGTACTCTTGATTATAAAGGTAA
TGATTCACGAAGTCAGAAGTCACTATCACAGACTTTGATGTGAAGTGTAT
TTCCAAAATAAAGGATTCTTCCATTAAGGAAATGAGATCCAGCAAGAGGC
GAGATCCCTTCAAAATAAAGTTCAGAACTTTTTATTCTCTTACGGCTTTT
ATTATTTCTCTATGAGTATCAGTAGTAAGTAAAACTGAACTAGGGTCCGT
TGTGACGTCATCAACAAAGTAGACTGCTAACGTCAACCAGACTGCATGAC
AAGTTACTTATCGACACACCTTATATATAGTCACATTGAGAAGACATGTC
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AATCCCTTTTGCATTTTAAATCTAATGGAATTGAACATTCTGAATTCCTT
TTTAATTCATAAATAAATGGACAAATATATTTTTAGTGTTTGGACAAGTT
AGGAAAATATTTTTGGTTTGAAATGAAGAGATAATGCACATGATTAGCAT
GCAATACAGTTAAATAAAGTAAATCTGACAATCTCTTAAGATTTTTTTGA
TTTATTTTTCAAAAGGTTGACGATCTTCATCTGAAAACTCATTATTCTTG
GTTGTTGTCTCAATTGAATTGATACAATAGAATATTTTCATCTTGAAATA
TTTGTTGATTAACGAAACGATATATCCATACGATATACCCATATCTATAC
GATCTAGAAATGATTTAATATAATGAATTTCCTTCTCAAAATAATCTTTT
TTTCTTTCCATAATGTAAAAAAATTCTGAAGAGCTCAGTTAAGAAGAATA
AACTCACTCTTGAACATGTTTATTTTTCCACCTCCATAAATTTTGGGCAG
CTTAAATAATAATCACCCGTGAAAGCTATATGTACTGCCTGAAGTGTTGC
CCTAATGGATCTGAAGTTATATTACCTAAACAAACATATTTGAGTTCTTT
AACGTCCAACAAGTATGTAGACAGTTCTATAGTGCTTGATGTTATATGCT
TAGCAATCATAAACGTCTCATTGGTATGTCCCCTTTGGAAAAATGAAGGT
GATGCGTTCATTGAGTCAACCAACTTAAAAATTCCAAATTGGTGACTTGG
TTAATGGAATGGCTTTGTTTCCTCTCTTTGCTCTATAAATGATGATTCGA
GATTTCTAACTGAAGTTACACTCCAAAATGGATTAATCATTTAAGAATGA
AGATGTATGGCACAGATCTGGAGTTACAGATGATGTAAAAGTCAATTAAT
TGTGGAGAACCTGAAACAATGTGGAGCCAAATCTACTTTAACTTTTTTTT
GATTTGTCAGCTTCAAATTACTAACATTTTTTACCTGGTAGCCGAACTTG
AAGCAGTAGTTCTTGGAGCTGGATGTTTTTTTGTTTTTTTTTACTTTTGA
TTTGTATTACATGAACACTAAAAAACATAGAAGGAACTACATTTTTCTGT
AAGATTTGACGAGAGAATAGTTGGTATTTTTCTATAGAGGTTTGAAACGG
TTCACTCATATATTTAGTTCTTGTCTGTAATGTTTCCTATATAATCTTGA
ATTTTTATTCCGTTCCTAGGTCTAACTAAAATATCATTGAAAGATAAATA
AGTAAATTCATATAAACATAAGAGTATTTTTAATAAATTATAATTTTGAA
CATTTGTAATTATCGACTTCAAGCCAGCAATTATTGTATAACGGAAAATT
TAGTGATAATTATAGCAACAGCAAAATTGTCTTGACTAATTACAACCTCA
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GCGATCTATTGCTCTGAAAATATCAGCTGTTCATCCGTTTGAGCGATCTC
AGAAGTCACCTTCCAAATATACAAAATCTAATTGGATAATCCTCATTTCT
ATGTATCGTTATTTGTATTATCTAAGCATAATGAAGATAAATTAATTTTG
AATTATCTATCAATTCATTTTCATACAATCATTTGCATACCTACTATGGA
TTAGGTATCTTAGATATCCTCGTCTTCTACTGGTAGGCTGTATATAGCCG
TCGTTCAAGATCTTTCCTTGTACAAAAAAAGTCAATGAAGCAATTTATTA
TTGGGGATATACTCTAAATCTGGCGCTCTCCTCCTTCAATTCTACTGTAA
ACCATCAACTGTTATATGGTTTTACTAATTCCAATCATTATCCAATCTAA
ATTTCCATCAATAAATCTATCATTTAAAAAAAATCCGTAGAGAATACTTC
AATTTTACTAAGGGTGACTGTCTTTCAATGAATAAAATACAACGCAGGAT
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ATCCTGGACATCAATAAGAAATACATACATTTAATTTATTAGTTACTATA
TATTGTGACAAGTGCATAAGATTAAGCATGATAAAAATGATAAAGAAATT
AAACGACTTGTCTCTTCAAAACGACACTCTTAGGATCCCTTCAGACGGTT
TCCAGTTGAAAATAATCTATCTGTTATATAAATAATAATTATTATTATTT
GATAAAATATGATTAATAATGTGATTGAGCTACTATCAAATCATTTTCAC
TCCAATATATCAAGAAGAAGAGTGTGGATTCTAGTAACAATACAATTGGG
TCGATTTTATAGGTTATTAAAAAAAATATATACATATTTTCCTTTAGATT
GCTATAGTAATCAGACTTATACTTTGGAGGACACAATGTAACAGGCATTA
TTGCCAATTAGAATGCGGAATTCTGATTCAATTGTAATTAAATAAACAAT
TCTATTTACTTTCACGAACCTCAAATGATTGAAATGATGATAATTTCCAT
TCCTTGTTGTGTCAGATATTTCTTCTATTGGAATAATGAAAAGGGAACTC
CGATTTCTGTTCCAGTTTTTTTGTGTTGCTTTGTCTATTACATCATATTA
TAAACCTATCCTGAGCTAATGCTCCAGTTTAGTACTTATGCAATTTGTTG
CCTAGTAACTCTTCATTTACCAACAAAGCTCAAATGCTTCTTTCCAAATA
TGGATGTGGTCTCTCTACTCGATTAGTGTGTGGTTAATAAGCTTGAGTGT
CGGGCTTCACGATACCTTATTCCAGACAATCTTGTATTATAAGTTTTGAT
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CTCGAACCAATACGTCAACTACTTTCTAATATATTTCATAGCAAAAGCTT
CTGGAAATTTTGTAAATGCATCGATGAAGATTAACAGGTATCTTGGATCA
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ACCCACCTTTTAGCTGTCATAACTTTGTTTTGTTTTCCTTATCCTCCAAC
GTCTATTGTGATTTCTTTGTCCATAATAGACAAACGTAAATATTGCTTAG
CCCCATAATCTTTTTATTCCCTATTCCAAGATGTACAGACAATACATGTA
AATGAAAASCTGCCATTTCAGCGACATTTAGTAAGCTTTGTTACACATAT
ATTTATATTACCTGAGTCTTCCTTGATGTATTATTGTTAACGCTTAATTT
TCAAATAACTTAATATTTGCACTTCAATTAGTTGTTGATGTCTTATCATT
ATTTTTATAAAACATTTACGGATTTCATCTAGATGTAGATTCTTTTTACT
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TCAATTTTTGAGAATACACTGTGTGGGGGTTCTACTGGCTATGACATTAT
ATATTGAACATTTTTTATTTTTTTTTATTTACTCCCAGTTGTCATTGCAT
CTACTCCGACGGCTTTTTATTTTTACCGTTTCTATTTCTTCTTTTATTCC
TTAATGGTCAGGTTGTCGACTTAAGGCATCTGCGTTTTAATTCGAATTTA
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CTATGAAGCATGCCCGAAAGAACATTTGTTTTTATAAAACATTTCAGAGA
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TTAACTTTTAATTGCTGGAAGATTGCATGGTCTGACTGGAGCTGCTCGAT
TTCAAGTCTGTAGTGCTTGGCGACACACTCAATGACACAGGTCTCCACTT
CACTGTCATTAACAATTGCAATGAGATCCATTGTGATGTATGTATCGTCG
GTGGCAAATCTGCTCCCAAGCTCTAATACAATCTTATTGATTGCAACATC
GAAATGTGTTTCACGGAAGTAGGATTCAGTTGTTCCTTTCCACTTTATTC
TCCTTGGAATCTTTGCCTCCTTGAATTCCAAATCAATTGAGTCCTCCTGG
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GGTTGACGTGTTTCCGGGCCTTTGTTAGGTCAACCTTTCTGCCTTGAAGT
TAATCTGACAAGCTAGATGTGTGTCTGAGGAGTGTCTTCAACAGTTCAAT
GCCGAAAACAAATTCGTGACTAAAGATGCTGTTGAGCAGAGAAGTTGCTG
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ATGATTTTGACCATCCCTAGAGCTACAGCGTGTACAGCATCGTAGCGGAG
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GAAAGAAAAGAATAAATACCAGGAATTCAAACGGAGATCTACCGGAGTTC
AGGATTGGGAACAATGTATTGGTACCAAGCCCTGTTTCCAAAACTTGGGT
CACTGAAGAAATCAAAGACATCTGAGATCATGTGAGATCATATATATTGA
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ATGTTGAGAAGGAGTGACCGGAATAAAAAGAACTAACAGTAGTAAGCAGT
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TCAAACAAATTTATACAAATACAAATTACATTCTTGTAGTAGAACTGCAT
CAGTGWTTTCGTCCTTTTCCATCTGCKCCGCCACTGTTGATGCTAACAAA
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AGAAAAAAAAAAGTGACATCTGAAGAAATTCATTCCCTGAAACCTGAAGC
ATTCGCTTTATCTGATAGTAATCAAGGGAAACGGCAAACTAGGACTACAG
AATCTTCATTTCCAACTTTAGCCGGAGAAACTGTCTCAAATTTATCCACA
CAAACAAAAACTGAAGCTGTAAATAATGTAGAAAAAGAGGTGAGTATCGA
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ACACAGTCAAAAGTGAAGGCGAAAGGACTGGGAGTCCTCTCCCAATAGAA
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ATATTCCCCACCATAAGAAAAAACTAAGACATCTCCACATATTATTGGTG
ATATTTCATGTAATCCAAATAAAGAAGATATATCAAGGGACTAAACAAAA
TATAGTAAATCCCTAAAGTTAAAACAGATAAGAGATCTCTCTGAAACGGC
ACACTTCTCTTATTCACAAGAATAAAAGGGGTTTAGACAAAGCTGAGTGC
GCTTTGTCGACTCTTGATGAAATCAATCATAATGTACAAACACCTCCGGA
TCCTTTAGGACCTAACGCTCCGAATGCTCTAGACATACTGATGTCCTAAT
CAAAAAAGTCAAGCCCGAACTTCATGAAAGAAAAGGGTAAGAGACTTCAA
AAAAATTCCCAGAGATTTGTAAGACCTTAATATATTCATATTAGAGTGTT
AGTGATATTTACGTTAAAAATTTCCAAGCATAATGCCTTATAACGTTAGC
CAATCAGTCCCATGCTAAGAAGATATTACAATACTTGAATACATTAAATC
TTCCTGGCGTATTAGCTTTAGTTTATCCTCGATTAGACAATGTCCCGCCT
AATGTATTGCCAAACACTCACACGTCATTTCTGTGCAAAGTCGTGTTGTT
ATCCAAGGAATGGTTTAATCCAATTCAGTATACTCAGAGCCAATGGGTAA
TCATGTAAACAAGAGTTTTTACCATCTATGTCCAAAATGGGAACTCTAGA
TCCTTTTTAGCGAAATAATAAACAGATGGATGCCAGGAGAGCTCGAAAAA
TTACTGTTTGGGGGATCTTAACATTACAAGAAATCCCTAAAGGGATGCGT
TCAATTACAGCAGCTTTAGAAATATAAAAAATGCACAAGATCTAGGCAAA
GCTATATAAAGTAATTTTCTGAACGATCTCGCCCAGAAACTACGACCTCA
ATACCCAGGCATGACTTTCTTCTCACGGGTGTCTTCAATAAATCCCATTA
GAGTTTTACTTGATTATACGTTAGCTTCTCCTAACATCGGTATAAGTAGG
ATGGATTTTAAAGTCCTTCCTTCGTATCAATCCGATAATTCCCCCATCTT
AGCCAAATTTGCATCAGACTGCCCTAGAAAAAAATCTTTTTTGAAACTTA
ATATCTCTCTTCTCAAGTCTGAATAATTAAGAAAAAAGTGGGTATTAGCA
TAGATTATAATAAAGAAAGGCAGGATATGGGAATGTACTCATCTCTTCAA
ACTCTTAAAAAAATTGAGAACTCGACAAGACTTATTATGAAATTAGCAGG
GGAAAAAATAAATTCGGTCAAAGTGGAAAACGAAGTGTTCAGGGGGACTG
AAGAGGAAAGCAACAACAAACTCGAGAAAACAATGGAATAAAAATCAAGG
GTGATATGATAAAAGCTGAGTTGGTGAAAAGCAACGTTTCTAGTACTGGC
TATTTTAAACGGATATAAATACTCTCAGAGTAAAAAGATTACAAATGTTA
AGTTTANCCTGACAACTCAGTATCCAACAATCCAAAGATTGTCTCGCAAC
TGACGACCCAATTTTTTTGAGCATGTGTAAATGCTAAGACTGCAACAGAG
ATACCAAGTGCAGTTTTTGCAAAAGTTGGCGACAAAGTAATTCAAGCTAT
TGGTGGCAAGTTTTGTGTAAAAATAAAAACTCTAATTCAGGGAGAAAGAC
TGAGATAAATGTTGATGGAATACACGAGCCATTAAGTGTAATGGAATTTT
AGAATACTTATGCAGTTATAAAATATAAACATATGTCCCCCGGGCTATCA
AGACTCACTATCAAATTTTGTAAGACTTTCGATTCTTACTTAGCTCCGGT
TAAAAATCAGACTTTAGCGTACTGTTCCAATAGTACTAATACATATTCAA
GAAATCAAAGTATATATATATTTAAAAATAAGATTGAAAAGGGCCATAAA
GCATAAACGAACGTTTGGGAGACCTATTTTGTGGCAAAAACATTGGGGAG
GCGGGGCAATTTTTGACTTAAAAATATCTGCTGTAGTGTCTTGCAAGGGC
CGTAGTATAGTCTAGCTGGAACACATAGTTTCCCTCTGTGTAGTTAGACT
TCAACCAGGGTAAGACCACCTAATTGATGACGTCCTGATTCTGCTTGGCC
TCCATTTTCAGGCCTTTCAGGAACCAATACGGGGTATCCTCTTCCTGCCT
GATGCTATGATTTCCAGCATCCTCAAGGAGGCTGGGAACTTAGTCTGGTT
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TCCCGAATATTGTGTTAAAAAATCTTGATACCTAGTTCTCAAGTGAGGGC
TTTTTGACACTATTGAAGTGAAATTCGCAATTTGCTGTCGTACAGTGTTT
TTAGTACAACCTTATAACTGGAACGTGAAACGGAATGTGGAACAGAATGG
GAATCATGGCTGAACAATGAACGCTGAACGAAGAAAAAAAAAGGAACGGA
ACACCACAATAGCAGAACGCTTACAAGTCTCATTATAATCAACATTTGTC
ATTTTTAGTAAAATTATTTATTACTATTATTTCAAAGGGGGCCCAACCAT
TGTTTCGAGCGGGAAAACCGCCTTATTACTCTCCATAGTTACAGAATTGC
ATATATGTAATGTGATTGTAATATTTTAAGCATCCATTTAATCAAAACTA
TTTTTGTTAAATTTAATATATTGCAGAGACTTGGACTTATAGTTTCAAGA
CAATTTTTCTACCCGTGACTTCTATTATAGAGGTAGTAAAAAACTGGAAT
TGGATAAAAATTATTTGGGAATAGAAGGAGATTATTATAATAATATAGAA
CAAAATTTTATTTATTATTGATAACTAAAAACTGTACTAAAATGCTAGAA
ACATTTAATTACCTAAAGACTATGTTATTGATTCATTACAAATATGTTTA
AATTTATTTATAGAAAAATCCCCAAAGATTTGAAACCATATCCACTGAAA
AAATAAATATAATTTTCGATTAATATGTGTAATTCCTTGGTGAATCCTGA
TTGATCACAGATATACAAGTTGATTAATAAATAACTAATTTTGAATAGAA
TCAACTGTATTTTTTTATTATTATTTCCATAAATTTGTGTGGTAACTAAT
AATTCTACAATTAAATAGACATAGCTCATAAACAGAAAAAAATATACTTT
ATTTATATGGATTTTACCAAAAGTTTCATAGGTTAGATGGAGTAATCGTA
ATACTATAATATTTACTAATGCTTAATCAGTGCAACTCCATCTAACCAAT
AAATGGAACATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTACTACAATTACTG
ATAAATCCATATTTATCGATATANTCCATTTTATTATTTATTAACTACAC
GTTACTACTTAATTTACAAATAACATTTATTCGGAATCTGAAGATTTGAA
AAATAGTAACAATAATTTAGATCGTTATTAAAGCCGTCCATAGGTTTTTT
TATTTTGGCTGAAACGAAAAGTATGTCTACAAAATTGAGCTTAAAGTTAT
TTTAATGTATTGAGATGCTTAATTTCGATCAAATCACCCTCTCACAATCT
ACTGGTATTATAATCATAATATGGCAGCCTGTTTTTTWTAATGTAAGTAG
TAAATCAACAGCGATGATGTTATCCATTCATGACATAGAAGATCTTTGTT
ATAGATAACTTTGTACGCAGAATTGAAATGTGTACTGATGAATGAGGTCG
TTAAGCATATTCGTCGACGTTATAATCAATGAAACCTATATAGTACAATC
AATATAAAAGACTAAAAATTAAGATGCATTTTTGATAACATAATAGTATC
TACCTAGATTTCATATTACCATTAATTATTTTGCATCTTTATTTTGATCC
TCTTCATATTCCATAAGTAATTAATTAGTAATTCTAAGTAGTTAATACTA
AATATAGTTAAATTTAGACTGATGAATATAATTATCCTTTTTAGACTGAA
TTTAAACTGATGAGCATAATTATACTTTTGAATTAATTACGTTAAGATCA
ATGGAGGATATAATATTGAATGAAATTTACTACATAATGAGCATGTACAA
AAACGATCCAAAGTTGATACTTTAGTTTTGAAGGGCAAATTTATCAGTTA
AATGATTTGTTATATAGTTATTTTTTCCTTTTACTTTAGAAAACATAAAC
ATATATCTTCTTTAATTTTGAGTTGTATCCATCCTTTTTTAGGATTTCAA
ATATAAGCCAAAATGAAAGAGTTGTTTAAAATAACACATGATGTTGATAT
AACATTACAACTACGACAAATATTATAGCTTTATATTAGTAAAAAGTTCA
TATGGATTCATCAAGTGGAATTTATCATTTAATAATAATGTTTTTCTACA
ATAGTATGTTGCGTGTATGGAGCATGTGCTCCTCCGGAGAGTATTAAAAC
ATATTTACTTAATTCATAACAATTAATGATAAATTAACTTTGTTTACACA
TACTTTTATTAATAATAATGAATTCTTTATCTCTCAAGTCATCCATATCT
TAATTTTTCCTTCTAGTCAAGGTTAATAAAAATACAAGATTATACCATAA
TCTTTTTTACAACTGATGTTAGACTACTATCACACTGTTTAATACTGGCC
TCATAGTGTATGAGTTGTTGCGTGTTTTTAAATATCTGTCTTTCTTCCCA
GAAGTCAGTTCGATACATCAAATAGAAAATTCTAGCAAACCCGATAACAT
GACGGTTTAACCTAGTATTTCTATTAACCTTGCTTCTCTTAAAGTTTCTT
GAATAATCTTTATTCTTCAGAATATTGTCAACGAATTTTTTATGGGATCG
AATGCGCCATGCTGTTTATAGCCTGTACGTTCATTATAATACTCGCTAAT
ACATTCGTATCAATATATATATATATATATGGTGAGTCAACAAGAAATAA
CGCTAGAAGGATTTTTTGAATTCTTATTTTTCTCCAACTGATATTGAGCC
TGGCTAGGTATTACGATTAAAGATAACTGGTATCAGCTACAGGAACTTTT
GTCCTCAACCTTCTTCCCATCATTCACCTTGCCAGGAATATGTATGAGAG
AGAGGAGTAGCTCTATCATTTAAAAGAATAAGGGTTCAAGCTGCTTGAAA
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