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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s1205 | supercontig | LSalAtl2s1205:8164..20174 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001258 >EMLSAP00000001258 ID=EMLSAP00000001258|Name=EMLSAP00000001258|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=65bp
MQFNLKVIFALLSIFALAMPMALGEHKDHSGKRSIRSAKTHAKGKGGKRS
IRSAKGHAKGQTNST back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1205:8164..20174+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001258-697105 ID=EMLSAT00000001258-697105|Name=EMLSAT00000001258|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=12011bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1205:8164..20174+ (Lepeophtheirus salmonis)
TCTCCATCGTTTTTTTCCCATACATATGACATTTGGCAATTCTGTTAATG
AATTAATACAAAGTTGTCATTTTAAGAATTTAACGAGTATCACCAAGTAT
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TAAAAAAAAACAAAAAAAACATAAAGTTTGAGTATTCTGTATAAAACTGA
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTACTT
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AACACATTATGGCTTTCTATAATAATGGGGATGTTATTCTTCGAATGTTG
TAAGAATTTGATGAAGGCAGCTCAAAGTCTTCCAAAAATATTACTCACGG
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AATTTTTAAATTTAATTAAACACAGAAACTTATTAAACGTGTATGTTGAA
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GAATCGTTTTTCATAAAGGAACTTTGTATTGTAATTGACACACGATGAAT
AGAATATCCCATCCTTTGGATATTTAATTAGGATCAAATCTCCAATTATA
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AATAAAAGCTAATAATTTAAAATACAAATATCAAAATTTTTAAAATAGCA
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AAGAACTTGTCGATCTGCAATAAAAACTAGGCTTAAAAATGTCCTTCTTT
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TGTTTAAAATTCGATGGAGCGTAATGATATCATTAAATGCACGTCTATGA
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AAACAGTCAGTAGTACATAATACATAGATCCAATTACGTAAACATAAAAA
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AGATATACAATCTGATATCTCTTCATTGCCTTAATAAAAATCAACATTTT
CAAGAATTGACAGTTTTAAGGATCTCTCCCATGAACTGAAAGTCCTATGG
ACAAATTGGAATAGTCCTAAGACTGAACCTTAGAGAATAAGACCTTTACG
ATACCTATTATAAGTTAAAATAATAAGAAGTTAATAAAAATATAATTACA
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AAACAAAAAATAAAATTGTATAAAATTAAGATCCAATTTAAAAAATAGCT
AGAGCTAATTATTTTAAATTTGAAGAACAAAAATATAATTCAATATGAAG
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TCATTTCTGCATTACATATTATATAATTCATAAGCCTTTTTAAATTTACA
GAAACGATTATCTCCTTCAGATTTTTCCATACGTGTACCATTTGGTAATT
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CTCTTTTATCCATCTTTGCTCTTGCCATGCCCATGGCCTTAGGAGCATTT
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TCATTCTTTTATAGAGAGAAGTGTTCGCTCCGTAAAAGGACGTGCCAAAG
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TCCTTTTTATTTTAGGCCGATAAAATTCTGCTGGAGTTCAAAATGACTAT
GGATATTATTACTTTATATTCCTTTGTCTAATTTCTTGAATTCTAAAGAT
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TTTTATAAAATTGATGTACATTTTCACAAATTATAACAATAATTATTGCT
CTGTTACTCCATCGTCACATACTTCAAAACAACTGTTTGGTTTACCTACT
TATTATAGACATATAACATGATATGGTTTTGCCTTTTGTTCTACATACAT
ATATAAGCAATGGGCAAACATGTGCAAGCAATCTATGAACAACCACAATT
TGTTTAATCGAGTCAAAGAATGATCGAGTGATAAGATATATCTACTAATT
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TAGTTCTACTATTTATATACGATTCATATACACCAATTGGTATGTGCCAA
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CCTTGGACTTAAGACTAGTAACTCGACCCGATATTAAAATTNAAAGACAT
GCTACTTGAATCAAACTCGATAGTTTAGACTTGTAACTCAGTTCGGACTT
GAAAATAATAAGTATTGACTTCAAGAAAAGGTTTAATACTATGGATAKTG
TTTCATAAGAATGGGCTTGAAATGAACTCAAAAGAAATCTGAGGACACCA
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CTTCTGATATGTTTTTTATTTCGTTGGTTTTACTTTCCAAGATTCAATAA
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CCTTTTTCAATAACTTTCACTTCAATAAGGTTTAATTTTTCTACATTCTG
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TCTGACCATAGCATCATATTTTAAATAGTACAAGTTGTCTAAAAGTGGCC
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AAATATGATTAGTTTAGCCTTAGTTATGATTTCAATTCAATTTTCTCAAA
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TGTTGTTCAATTAATTTATGAATAATTATTAGAGAGAAAAAGGTAGGCAA
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GACACAAACAAGAAGTAGTTTTATATGGACTATCGTCATTCTAATTCATA
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TATGGCCTTCTATAATAATGTTGATGTTATTCATCGAATGTAACAAGAAT
TTGATAAATTACTGGTTATGGAGGAAGGACCTCATATTAAACCTCATCAT
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TCCTTCATAGTTCATCCATCATATTTATGTTCTATTGGAGAATAGAATCT
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ATTTGATTTCCTTGCAGAATATATGTGTAATATGCGCATTTTGCAAGAAT
TTATGATCAAGAAAGCCTCGACATCTTCTGTACAAATATAGCATATACAT
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TTAATTATGAATTAGTCTATTTTTTTTGCATATTTTTGTTATTATCGTCA
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TCATTTCTAATTGATTTCAACTATAACTTTCCGATATTAATTCATTACAT
TATATTTATATATAGATGCTATGAATCTACTTCAATTGGCATAACTCATG
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AATTATAACGATCATTATTGCTCTGTTACTCCATCCTCACATACTTCAAA
ACAACTGTTTGGTCTACTTACTTATTATACACATATAACATGATATGATT
TTGCCTTTTTGTTCTATATACATATATAAGTAATAGGCAAAAATGTTGAA
GTAATCTTTGAAGCTAACACAATTTGCTTCATAAAGTCAAAGAGGAAGTT
GATAAGATATAACTATTTATTCGCATCAAAAGCCGTTCTTTCAAAAAAAG
GATAAAATCGACAGAAACTGATGAGTCAGTCATATTTTGCCCCCTCAAAT
TTCTAACTATT back to top
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