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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s124 | supercontig | LSalAtl2s124:357996..426231 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001472 >EMLSAP00000001472 ID=EMLSAP00000001472|Name=EMLSAP00000001472|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1231bp
VEFSADSLYLPILKLAKEASRLIVIHGRIGFNCRPTPPVLPVAFTSGDTY LICPTVVLSKVFKKIDIPGKPLYTTTWKCHINDKVTVLFGLKGASLDVFA IEILEGYLYLHLNLGPEALKIRASNQRLDDGTWHKIEIFLRSKSGTIKVN EDFQEFAIPGESNGLELLNSLYVGNIDHLDSKITPPPSIWSASLNKGFVG CLRDLEMNGNHIDLHHFVKHQDSGSILTSCHITPPKCTNRPCLNGGVCVD GWGRYICDCSLTGFNGPICGKAASILQFEGSQRLSISNPGEGXTEAENIV LRFRTPKAHGFLFEXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXRDNNGG NTADKLEFLLIDGKIEVFLKMGLTEKKLIAGNDLGDDKWHNIHFKRRGMI LSLAIDGNAPILAEAYGSMSXLGHTVLNLASRLYYTESLTPFSGHMQQFI FNGREYFEMIRSGTLVSSYSLTGVFYDANDSDVYHDVTFLSHHTYMGLPQ LKTYANIDLYFRLRTLETDGIIMFNAGRGQDFIAVELSNGHIHYVLNLGY GVINLRDNSPRKINDNKWHTVSIGRPSQFKHTLRVDTYHSSANSKGNESN LDLDGILFLGGVRKNMYSKLPSEIISTYGYQGCLACIELNGVAGDPINKA LVPSNQVSKGCEEEARNSRNNYELSDIDTQYVGLNYHRKQQIQNHFRQQE LDSSIISRCSCENDGICIEHGGSSPTCDCDLTSFSGPRCTEESVAYEWSN EPGLIRYNFPYDKRPDTRIDVLSLGIITPLNYAIIVRIDSASSNDFLEMQ IEDGYIHILYNLGTEDIMISDKNILVNDGNYHVIKFTRSEANSTLQIDDH PTQFKYPIALRRQLTVFNSQSQIHVGGKWNPTSHKIEKSFQGIIAGLVYN GLRPLDLVANRDGGAKIHGRNVKIVENIPFDYRDTHSPLFRRDNQQGFKQ MQMTNPSKYPDPGINDDLIYSKLECDEDEEKYYNPRCFAFEGSGDELITP VYTPPYNPLWKNRNTIQNCDDEEDCNTSTEGSGHSHDSTTKAFVYTTEPS PPTTWAPWETTSTPFEEMTQSKEKIVEVNEESSSQRPPIIYENYDTKYNV YDNEPEPKTPIYDTDRPRVTSAATSSTIMVISIILVAIIAIILIIFIVLR MRTRDEDRGYKVEESRTYQFDSTALVSSSNTTNNADLDEGEGGSLLGNTT SSNGFYARNLAVVKKPSSSSSSSKPIREWYV back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s124:357996..426231- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001472-697319 ID=EMLSAT00000001472-697319|Name=EMLSAT00000001472|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=68236bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s124:357996..426231- (Lepeophtheirus salmonis) GTGGAATTCTCTGCAGACTCCCTCTATCTACCCATTCTCAAACTAGCAAA
AGAAGCATCACGACTCATTGTCATTCATGGAAGAATAGGCTTTAATTGCC
GACCTACCCCTCCTGTTCTCCCAGTGGCTTTTACTTCTGGAGATACTTAT
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TCTGACTTTTGAAAGTTATTTGATATTTTTGACTTTGAATGATGAAATAT
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ACATTTAATGAATTTGTAACTACATGACGTTCCTCTTTTGTAAGATGCTG
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AAGTTATAGCTGTAGTAATTCATCGAGCATTTTGAACAGTTCCTGGATGG
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TGCTTGTCTACCCACTTTCGATGTTGAAAGTAAATTTTGGGGAGTTGCTA
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GTATTGTTTCTCTGTTCTCCTGGTTGGAAAAATTTGATTATTTGGCCTAT
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AGCTTTCGYGSRCCGCCGTAATTATGGCATTGGTTAATAATCGAGGTGAA
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TTAGCGTATCCGTAAGAAGCTAGAGGATACCTGGGATGTTGATGCCACCA
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CAAATTATCATATTTTCTATTATGAAGTTTCCCCTACTTTAAAATGTATT
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ATTTCATTATACTAATATAAAAACAGTGTAAACAATTTGAATGCCTTTCT
ATATATATGTATGTAGGTAGTTTGGCCTTCTACAAAACTCTCTACTAACT
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CTGATCAATTTATAATACAACGAGCTTGAACTCAAAGTGTGTAGGTTCGA
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TAGCATTCATCATTTGGATTGAAGGGGACCTTGCCACGCAAATTATCAAC
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TGGGAGTTAACAAGGTAAGTCTACTCAAGGCCCCCAACAATTTGGCCAGC
TTCAAGTAATCGATCATGAAGTACTGAGCCAAGGTAAATCCCTCACACGT
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CAACCACCCCCAAATGTGGCTAGCGGCGGTACTGTATTACATATAATATG
AATATTTACTCCAATTTTCTTGGACAGATGGATTAATTGCAGTAATGAAA
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AAAAAAAAAAAAATTAATGGAAATAGAAGCTTAATATTGTAAATTAAGCT
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TTTGGTTGATTTCAACTTCATTCAAAAGTTTCATAATTTTAGTTATAAGT
AACTTTGTATGTTCAAAGCCAGTTAAAAATTAGACATTCTGGAGACAATA
TTCTACCTCGGTCAATTTTTCTTTGGGCAATCTTCCTGGTGCCCTTATGG
ACGCAACTCCATCTGACCAATGAGGATACCAACATAAAACAAGTATAAGC
TTGATATGACTGAACTAATTATATAACCAAGCTCCATTAGGACAGTTCTT
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GTGTTGTGTATGAACTTTTATTTAGAAAACAGAAATTAGGTCCTCAATTT
TGTTCAAATGTTTCAGACCATGGTCCGGACCAAAATATTATTTGCCTGAC
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AATTTTTCTTAAGCTTTCAAGAATTACCAACAATTTTTGAACAATAATTC
CATAATCAGAAGGAAGTGGCTAACCACCAATTGATTTTAAGCCTTTTTTA
TGCTTCTTTTTTACGGAAAGGTTACGGGATACAATTAATATAACGACGTG
GGATATTAATACATTTTCACAATGTAGAATGAGCTTAGATTGGTTAAATT
CTAATAAGCTTTCCTCAAACTGTGAGTATTCTCAACAATTATTGAATAAT
GATTCCATACATTGGAAGTATTGAGGAAATCACCTACTGATTTCGGGTTT
TTTTTTTGTATGAAAGGTTGCAATATCAAGTAAAATCACATAAGACGGAA
TGACAATGACTAATGAATAATTCGGTCTTGGACCGAGTCTCAACACTAAA
ATTTATCGATGTACATAATATATAGATATTTTTGACTCTTTATGTGTACA
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AGTGATAATGTATCAATAAAAATCGTTTGTAGAACAAAACAATAAAATAT
AAATTACTTTTTTGTCAATAAAATGGCTCTTTCCTTTAATTTTCCACGGT
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TGTTGTTTCATTGATTTTCCGAGTCGGAGGAAAAAAGCTACAAATTGATG
ATTAAAAAGATTAAATATTTATATAATATCATTGATTTACTTGCATAAAT
AGCCAGGTTGGGCGTTTTTAAGAATCTATAAAATCCTTTTTGATTCTGTC
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TCCATACATTCTATTAAGAGATGTAAAAATTACTGGAATCTTGGTGAGTG
TACAAACCATGTCTAAGAAAATATCATAACAAATATGTTAAATATGAGAG
ACGACATATTTGCTAACGGGGATTAATATTATGATCCTTGTCTGAAGATA
ACATTTGAATGTTCTAAATAGGTAGCTCAAATTTGTAGCATTTTTAGCTT
AAGAAACATTAATATAATCTATATATCCCAAAGTTTCTGTTTATGTGGTC
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ATCATCTTAAAATAAATGGGAAGGATGCCATCAAATGCAAGTAAAAGTTG
AAATTTTCCTCACTAGTGACAATCAGTAAGAGTGTAAATGTTTTGTAAGT
GCTAATATGAGATGTCATTATTTTTTTTTACAAGCCTGTTTTGCTTCATT
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ATATGCTATTGCTATAATGCTGGATAATTAGTTGTTATTTGTGTTGATTT
CATTTATCCCAGAGCTCCTTGTAGCTTAACATATGAACGTCATGGGAGTG
AAGCTGTTCATCTACAAAACATTCTTCCAAATTGTGAGCCAGAGTTACCG
TGTTGATTTTAAGTTATGATTATTTTAATATAGTGGCGGMTCATGTGATT
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CTATTTTGAATTTCTCTGGGGGATTTGAAGGCGTTTACCCTAGTCACTCA
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TTATCAAATTTTGAACTTTGGTACAGTGAATTCATTTTACACTTAAAATA
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