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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s125 | supercontig | LSalAtl2s125:470334..530529 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001515 >EMLSAP00000001515 ID=EMLSAP00000001515|Name=EMLSAP00000001515|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=485bp
MSGQWMLLFLIYFVFVQDTNCRRLGSKSPTFISKSQRLDEKIHETVLFEC HVDNLGKKIITWYKVMGGKKKLIYAGNINIFQDPRLSAGNNGLHLAISNL KEGDDGEYFCQVNTNREDEIRLHHYLKVRVPPVIKPDPENGNINIVKVNK TATLKCIATGSPKPYITWSKLDKPEVVISRGEQILIQDVTRLDADIYECK ASNGVGDDAKAQIRLEVLFPPEVHVPVHKIYTGTPSSSLGHGHHRRDILT CIIYGEPEPRVFWIGPSNNVIPSSSHNFNATRNTDPRKKEPLYYLNVLYA RDHKHFGKYKCIGENTLGTAEGTIELTGAPQKPIIISDSIANSKNTYTLR WTVKSPLRLKNQKVNYWLEKTSGSYEATYSSPIYYNQDNGNSTTLHINHQ QLIKAMDITTTXPNRDPDLXAYEMAIAELFPDSNYVVQIEAENAFGKKNT RPSVQAQSVSKGNRGTPWGELHLILLLAIITRLFR back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s125:470334..530529+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001515-697362 ID=EMLSAT00000001515-697362|Name=EMLSAT00000001515|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=60196bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s125:470334..530529+ (Lepeophtheirus salmonis) AAGAAGTTCTTCATAGATGAACACTCTGTGCTATATCAAAAGAGAAAGAG
ATTTTTACAAACTTTTTTACGTATCCTCTTAATAATATGCAATAGAATCT
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GTACAAATAAAGTATTGCTAAATATAATTAACGTCTCTAGAAAAAACAAA
GTTTGGTATAAAAGATACATATGTTATACATTACAATTATTCATGAATTT
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AACGAGACTGATTAGCATTCACAGTATCGCCAGTTCTCGAAATAATTATT
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TAGATTGTTACGTTGATTTATATTGTCAGGTAAAATGACTGTGGGTAATT
TGATTGATAAACAATTTGGTCTTTGATACTCATGATAGAGGCACTTATAG
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GAATTTGTTAAAGAGTTATAAATGAAAGTCCTTGTTGGTGCTCAAATAAG
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TTTCTTTCACTTTTATACTTGCTTGTAGCTATCATAATAAAATGTATATC
CAATTAAGCAGCTCTCCTCTCAAATACTATTTAAATTGTGAAGGTTACCG
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TTAGACTTCCAAGCACCTCCATAGTACAATAAATATACTCATTTTTGTAC
ATTTATTGTTATCCATGTTTAACTTTTAATTTTTACTTACTTTCACTCTA
TCACCCATCCACAGTCCCCCCCCCCCCCCCCTTGAAGAAAACTTCAATAT
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ATTTCTGATCTTAAATATATTTATGTACGATGTATATTTATTTGAAAAAG
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AGTTTATTCGTATATATTTAGTACCGGGTAGTCCATTGAAACTGAATACT
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TAAATTTTTTTGGAAAGCATTTCAAAATATATACTTATTCTCAAAATATT
CCAAATTCCACTATTGTTCACGAAATATTAATTTTTTTGAAAAATAATTA
CAAAAATTATGCTTAAAATATTAAATTCAAAAATTCATAGTTATTTTCAA
AAAGTTAAATTTTCGGAAAAATAATTCAAAAATCTCCAGCTGTATAATTT
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TAAATTAATTTTTTGGATTTTTTTTTTTTCAAATATTAAATTTTTAGTAA
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AAACCTTCGTCACAATATTCTAATAAGAAATTCTATAATATAATACAAAT
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CCCGCTGGCTAAAACCCATATTTATGCTTGTTATTTAAGCCATAGTATAC
GAAAACAGAAATCAAAATTTACAATCGCAGTATGTTTTGGTCTACAATGC
CTTTCTTTAAATCACGTTTTTAGAGTATAATTTTGAAATCAAATAACTAT
ATAGATTAAAATTAATTGTAGAAACATTTCAGTATTCAAAAGTTCAAATA
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TTAAGTTGTACCTACCTCGCTGAGCTTTCTTGATATATGTCTTAATAAGT
ATACATACATTATGGTAATCATCATTGGTATGATTGCGGTTCCAATTATG
GCTTACAGAAAGGKATAATATATTTGTAACCATAAACAGAAGTTTTGATT
AAGGAGAAATTGATTTGTTTTTGAGATTTCCGTTACTTAATTTGGTGGTA
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TATTTAACCACTCATCCTTTGAGTTGCACCACGATATACAGAGTTCTAAA
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GACTTATACTTATAACAAGTGATGAAAATGGGGACTATTTTTAACCTCAC
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TGTACTTTTCTACTACATAAAAGATATCATTGATGTATTCGAAGCCAGAT
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TTAATAAAAGACTATGACAGCTTAGCTGCTCTCCTTCCTCCAACGTATTC
ATCAAATCGTCCGGGTATAGTATCCCTACCTATGTTTATAATACAAACCT
TTAGCTAGCTAGTTTTAGCTAGGAAAAACCTAACTGATATTTGGTCTCGA
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TAGGACATACCTAGTTTTTCATAATTGGTTTTGGCTTTTTGTAGTTCAAA
AAATTTTACCGCCTAAATAGAGTTTCTGAAAGATTTCAACATTTTGTTTT
GTTTTTGATTAGTGACTCAGCAAAATATATTGTCATATAATTATGACAAT
AACTTTTCTAAAGCCTCTGTCCACTGAACCTCGTCGCTCCATAATTTTTG
ATAAATTTTTCAAGGCGTGGTTTTTTGTGCTCACTGGTATTCCAGCATTT
TTAAATCTCTAATCACATTCTAACGAGACACAAACGTATATTATATATGA
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CCTTATTTGGTTCATGTAAAACCATAAACCTCACTTTTGATAATCAAATT
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GGATTTTGATATAATACTTCCCCTATAAATGGTGTACATGATACCTATAA
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AATCAGTGTTATGAATGTTGAATGATTTTAATTCAAATTATTACCTATAA
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TGGGTTGCTTTTGATACGTTTTTCTCTTTCCTTTTTCTCTTAAACATTTT
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TTACAAAAAAACTAATTTTTTTTTCATTGTGATTCAAAATTAACAGTTTA
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TTTTACTTACAAAAAATTTATCTACAAATTAAATGTTTTTTCTTTCATTT
AGATCTTTCAAAGTGTTAAATAAGACTAAATCAAGTAGAACTCATACAAA
AAATTAACACGTACATAAAATATTATGTAGGCCTTAAAAGCAGACATTTC
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ACGTGCCAAGTTTTTTTGAAATTTGGTTGACTATTGTTATTTTACACGAT
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GTATTTTCAGAGTACCCAAATAAGTCCAACGATCAAATCAACTTAATTGT
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GGATAGGAAAAAGGGTTTCTATTTTGACTATGGTCAATTGCTATAATTTA
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GGTATTAATCATTCAGTGCATACTATGCTCAGTCTMCCTCCAACCTTCTC
ATTATGTTCTACAAATCGATCATCCCTAGCAACAACCATCATTACCTATA
GTTAGATAAATGATTTAGTATTTAGAAGTACCTTTGTATTTTAGTCTGAC
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ACTAATTCATATCAATTAATATTTGAAGAACATAATTTAGTCGATTGTTG
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TATAATTAAGAACCTTGATTTGATTTAGTAACTCTCCTATATGGCCATTC
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AAGTTTGACAACTGATAATGATTTTATATGGAATTGATGTCCAAGGAGTA
GATAAGTAACAACATGACCTTAACGGGTTTCTTCTTAAGCCACTCCTTTG
TTGGTTTGTACGTATGTTTTGGATCTTTGTTATACTCAAAGAACACCTAC
ACAATCCATTTTCACTGCCCCTGACTTGAGGAAAGAAGGTTCTCGTCCAT
GATTTCCAGTGTAAATGACACTGTTTATCTTTTTTTGTTGCAGTAAAGTT
GTCCTTTTCAAAATATAATGTTTATATCCCTTTTTATTTTATCCATTTTT
TATTTTTTATCCCTTTTGTTTTATCCATTTTTTTTTGTTCAATTACATAT
ATAACTTTCTTTTCCTTATCGGTGGKCAAACTTAAAAAATCTGCAAGGGA
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TTTTTAGACATGATCAATAATAATTAGTTGAATAATACAAGTGTCAATTC
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ACACATTTAAATGGAATATAAAACAATTTTATTTTTTTTTTGGTATTTGC
TGTATATTAAATTTTCTATAAAACCTGTAATAAAAGCAAAATGCATTTTC
ATAATACCATCCATGAAAAAATAACTTCTTTAATTTTTAATGACTATCTG
TTTTTCAGTTAATGTTCATCACATAAAAATGAAAGACAATTTTGAAATTT
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TGTAAATCTTTGCTAGGCATCACTATCATAAATATGTGGCTARTCAACAC
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TGTCTTCTTCAACAAACTATTGTCAATTTTTATCTACAAATTGTTCTTGT
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CTGGGGAAAAAAGAACTCCAAAAATAAAAAAATGCATTATTATATCATAT
TACAGGCCATTTTTTTAAATTTTATTTAACATGAATTTTATGCTGACGCA
CGATAAGTTTGGTCCAGCAACACTAAAATAAGACAGTAAAGTTTTTTCTT
AAAATAGAGTCCGGATTATATTTGTTGACATAATCTAGTTTTTCTACATT
TCTATTAATAAATTATTTTGATCAATCATTCAACAGTACCGCAAATTGCA
CTAAATCACTCTGAACATTATCGATCAGTTTTGGAAAAAAAGAGTATAAA
TTCTATATAGTCCGTTTATGAAATAAATTCTCTAAACTATGGAATAAGCT
TTAGTATAATAATTTAGTCTCACTCCATTAAAGAAATTAAAATATTAAGC
CATTATTAAGATTAATGAATTAGTAAAATCAGTTATACCTATTTATAGAA
TACATAAATAAATTATAAATGATTGATTTTTGTTCCTGATTATTTCTATG
TTGACACGCCACATATGTAGTTTGTAAGAAACTTCAAAGTATAGCAATTG
GATTATCGTTAGCATAGGATTGAAAACTTTACAATAGCTGTCAAGGGAAT
TACGATAAATATTATATAATTAATTTATCATATTATTATAGAAAGTACAG
ATATTCCCTAAACAACAAATTACCTTGTTATTATCCTGTTTGTTTGTCGA
TACATATATTAATATAAATAATTTCCTTCCTTAATCATCCATTCCATGTG
GAAAATCCTTTCATTAAAGAAAAAAAAAGTGATCTACGTACACAGCAAGA
GATTAGTTTAGAGCTTTTTACGTTTTAATCTATGTTGTGGATATTTTAAT
CCATGTATATTTGTATTTCTTCAAAGAAGGATCTAATTATAGTAAGGGAC
GACATAGATTAGTTCCTTTTTATTCGTTCTTGATTTGATTGAATAAAATA
TTAATTTACAAAACTATTAAAATGTAAAAGATTTTGACAAATGTTTATAA
TAAATAAGTTTTTCTTTCCTTTCATTCGTGCATTTTTTTAAACGAAAAAA
CGACAATTTGATTCATTTGTACTCAAATTTCGTTGACTACGAAAAAAAAA
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GAAGTGTAACATTTTTTTCTGACGGTGACCTTCTTTGCTTTGTCTCCTCA
CTTTTAGCAAAGCTCTGCCGTATTTGGCGATAAAATCTAAAAGAAAACCC
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CTCTTTTTTTCTTTCTATTTTACTTATCAAGTAAAGGATAGAATAGTTAT
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AATTTATTAATTACTCCGAAGATATTAAAAAAATAAATCAAACAAAAAAA
ATGCAATTTATTTAAACATTCCAAACAAAAAATATTCAAATCAACTCCCT
CTTTTATTTAATAACAACTCTACCAATATTAAAAAATAGTAAATACTGAT
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CTGAATTATAACAAATATAGATCCAATTAGATTTTTCAATATTTTCTAAT
AAAAAGTCACCAAATTGCTCAAGATAACACCAACTCTGGATGAAATTATT
TTAAGAAAGCAACGATTCATAAATAACCTAAAGGAAATTGGAAAAAATTA
AAGGCAAGGGTTTCATTCATTTATATTTGCCAAAGGTTCGCTAACAGTAA
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AAATGAAATGACATTTGACCAAATGTTGCAATTAAATAAGACATTTTCAG
AAATTGCAACTTGTGCAGACATTGCAACTTTTACACAACCTACAAATATT
TAACTACTCTTTACTTATATTAATAAAGCAAAGTTTATCTGGATGAATGT
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TTGAATGCCATGTTGATAATCTGGGTAAAAAGATCATAACATGGTATAAG
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GGGTATAGTTCCTCCAGTAATCAAACCCGACCCTGAGAATGGAAACATCA
ACATAGTCAAAGTTAATAAAACTGCAACGCTGAAGTGTATAGCGACTGGT
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CATATTAATCATCATATACTGAGCCAAGTTGTCTCATTAAGGTTTACCCC
TTCCTTATTTCCATCAAAATACTAATTGTAGTACTTTATTGGAATATTTA
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ATAGTGTACTGATGCATTGCAATCAGAATCAGCAAGAGTCGGCCTTTTAT
GAAGTATCTCAATGGGCTTTATTAATTATTATGCATACTTATATATATAT
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CTAAAAAAGAACATTAAATTTTAAAAAAACCAACGAATATCAAGATAATG
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ATGGGGTCTGAAGTAGTGTTATGTGAGTCCTTATTTATTTGATCATCTCT
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TGGCTAGGGATACAAATATTGGCTATATTCAGCTATGTATGTTTATTGCT
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TATTGACAGCAAATATGTCGTCACTCAATGGTACCATATTTCTATGGACT
AGATTAGAGTAGTTTGTAATAAAAAATAGAGGGCAAGAGTNCAAACATAA
TGTACACCAAAGTTAAGAACCTTTTTAATATCAGCTACCTGCTATATAAT
TTCTGGGGGAAAAAAATGAATTACTGCTATAAAGAGAAAAACCTTCTACA
TTTAGAATAGGTTTAGTGAAGAGAAAATATTATAATTGTATAAAATTCAT
ATATATTTATTTTTGGCAACAATATACACCAAAGATTAGTAGTAATGTAT
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GAGCACCTGCAACAACCGTTTTTCCTCCTTTAATCTTCAAATAACATTTT
TTTAATTACAAACTTCTCAACTTTATCTTCGACAAACACTTTGGCGAGGT
TTATACAGTCATCGCAATTGTGACAATATTCCCATCCAAATGGCTTAGTT
CCCTGCACATCTTGGCATCTTTTAATTCGTTTTTTTCTTCAACTATAAAA
GTAGATAACCTCATTCCTTTTTCCTTATGTAAATTATTAAAAGCACTGAG
GGAATTATTATGATCAAATATTTCCATTTAAAACTCATACATAAAAATAA
CGATGGAGACGGTTTAAACCCTAACACCCTTGAGACATTTTTATATAAAT
AAGTACATTCCTTGGGAGTTGGAAAACAGTTTGTTTATTTTATGTTTATT
CAAGAATTAAATGTTATTTGGTGAGAGGGTGGGGGAAGACCCTTCCCACC
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TTTTTATTAATTAACAATAGAATTTCAACAAAATTAATACTATAAATATA
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TGTTTATGCTTTAATGTATATGAATATGTTTTAATTTCAATCACTCAACC
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