EMLSAT00000001734, EMLSAT00000001734-697581 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000001734
Unique NameEMLSAT00000001734-697581
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s12supercontigLSalAtl2s12:1107868..1133783 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000001734 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000001734EMLSAG00000001734-684500Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000007651EMLSAE00000007651-716579Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000007652EMLSAE00000007652-716580Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000007653EMLSAE00000007653-716581Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000007654EMLSAE00000007654-716582Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000007655EMLSAE00000007655-716583Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000007656EMLSAE00000007656-716584Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000007657EMLSAE00000007657-716585Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000007658EMLSAE00000007658-716586Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780428auto780428Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000001734EMLSAP00000001734Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000001734

>EMLSAP00000001734 ID=EMLSAP00000001734|Name=EMLSAP00000001734|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=595bp
MCPTKFEENNISKSSLATEYNQVSSDDNFFEGVEKLXEVWFTTSKTNVNE
CDLRKIPRECLELLLENVQCSIVSSSSNAILDAYVLSESSLFVSQRRFIL
KXCGTTTPLQCLDELYRLVKKYTGFDEFEEIFYSRKNFKKPELQYKPHKS
FDQEAALLDKIFPDGSAYCMGSMNKDCWYLYALNPLDRYVSGRLDEEPDQ
TIEIIMTELDPEDTNDFGLGEYCTIHITPEPEFSYVSFESNIPSSSYLDI
LQRVLSTFRPGKFLVTVFSNRKSKSVDSHKELFKATNMGEWNIVKTWLKE
MGKTNHGRKLTFLYLANDVVQNSKKKHPEYAKEFGSIMKGVVEHLANTHL
DQKTIKSIGRLINIWRERSIFEQSIQTDITRIWTGKTLESRVEADSTPPP
QKKSKTWRKKSVEDEQQEEEEEEEEERDSNVLDSPPASVADPPEPEELIK
ALQDLENSASSDAVIREKIARLPPEVSEVSQLSNLQSAEEGYKLMHKVSQ
ATELLSAYNERLQQELKDRKRVGKMITDFLSAQRDLEAQAEERLXXYRDK
LEKVNAVKNDLKSHISSLPDLTKLPDVTGGLAPLPSAGDLFTIAK
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mRNA from alignment at LSalAtl2s12:1107868..1133783-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000001734-697581 ID=EMLSAT00000001734-697581|Name=EMLSAT00000001734|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=25916bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s12:1107868..1133783- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTGTCCTACAAAATTTGAGGAAAATAATATATCGAAATCATCATTGGC TACGGAATATAATCAAGTGTCAAGTGACGATAATTTCTTTGAAGGAGTGG AAAAATTACMCGAGGTTTGGTTCACAACTTCGAAAACAAACGTCAATGAG TGTGATTTGAGGAAAATCCCAAGGTATAAATAGATAGATCAATAGTCCCA TCTCTACCTCTTAAAAGAAGGATTAATTATGAATAATACCTTTGTTTGTA TTATATATACAGAGAATAGATATGAATGATTAAAAATAATCAAAAACATT ACTCTATACAATATTGCGTCATGCCCTTTCACAACAAAAATAATAAAAAT ATGAGAGTGATTTTCTTTTCCTATATGCATGTAGATAGTAGGCCTGTTCA TGCTGAATATGCACTTTTACCAGGAGGAAACTATTCCTTAAACATACCCC TGGTAATGCATAAAACTTAACCAAGATGCACTCTGGATTTCTGTCTTGTT TATGCGTGGGTTTTTTACAAACTACTAAAAGTCCAAATATGATCATAAAC CTTGTATCAAGTAAATTAAAAGAAATTCCCTACTCTTTCCATGCAGTGAC TATTATTAGAGGAAAGTTACTTTCACCTTCCTCCTCGTCCACAAATATGT ATATCTAGCTGGGCCTTTTCTATTATTTTCTCGCAGTATAAACTTTTTAC AATATACATAGTGTATATTGTAAAAAATATATAGTAATTTTTACAAACAT GTCCATATTTTCTACACTCTTTTTCCCTCCAAAAAATGGCCAACAAGGCC ACCCCCCCCCAAAAAAAATAAAGCAGAGAAGGAATGCATGGTTCATGCAA TTTACATATCCTCATATAAGATTTAAAATAAATATAACTGAGTGGAAAAG GTTGCCATTTTTTGAATTAATGAGATTATTTACTAATTATTATTTAAGTC ATGTCCTCTAAAATAATCATGTATTTGACAAAATAATTTTTTTTTGATGA ATGAAAATATTTAGTCACTCTCTTCAGTCTGTAATGTCGCGTACACGTGT TCAAAAATGTAAAATCTTGATCCTTTTTTTTGTTGATAAAATAAGACAAA CTATATTTAATTTGCTTTTTTGATGACACAAAAAAAAACTACTAGACCTT GTACGGTTTGATTTATTTATAAGTTTCTATGCCCGTGTTGCTATAAGCTC ATGATGAACAATTTAAAAAGTTACAAATTAAGAAGTCTATATAGTAACTT CCATTTTATAGGAGTTTGTTTACCAAATGATTAAGGGTGGCGCCATCTTG TAGAAAAATAATACACCCCCTCGAATGATAATATTATTTAATTTATTTTT TTATTATTTGTAAATTAAAAATTGTCGTTTTTTTATTGTCATTTAAGGAA AATATTTTTTTACAATTCGCTGCTTTAGTGTAAAAATGCCCTATTCAGAC ATCTCAAAATTCTTCAAGAGAGGCAAAATTTATGTTATAACCAGTAAATA TAAGATTCACACTATAGAAACATTATTACATTGATAAAGGACACAATAAT AGGAAGGGATGTCAGTCCTGTGAATTTTTTAACTGCCCTATGTTTTTTTG AATTGGTAGTCTGAAGAATGAATTTTCATTTCCTTAGCATTTGTGATAAT TATTTAATTCCTGAGTAGTGAACTTCCTTTTCTAAATAGATTCAATTATA TTCAAAACCTGATAAAACAAGCATTCGTTTGTGATCATTAAAGACGGAGA GAGTCACCTTGAAGATTTGTTGTGGAGTAATAATTGGTAGTCTGTGTTGG ACTTAGAGTAGAATGGGAGATCGACATAGAAGTAATTTTTGACAATGACT TTGTTTATTTCCGTTTCCCCTTCCTCCTTTGTCACAGCTGATTGTAGCTG ATCTACTCCAAAACTTTATTCAAATGATCAAGCTTACCATTTTGATTTGG GTTTTTTTTAACATGCCCAAAAAACACACGATTTCCATCACTACTTAGGA TAAGTTGAGCATAAAGGTAGCCCTGATAATTCAATTTTCCAAATTTGAGC AGATATGGCAATTTTATCCTAAAAGAGCAACCATAATACGTGGAAAATCA TTTGAACTCTTTCTTAAAACTTTGGGGTTATTGCGTGTAATAATTGAATT CATTGCGGCTACTTGTGATATATTTATTAAACTTGTTGATAAAGACACAT ATATAGAAGATGATAATTTTTTAAGTGTACAACTTCAATTTTTCCAAAAT ATTAATACATAAATCAGTATACATATATTTGGGACTAAGCTGATTAATTC AATGTTGTTGTTTTTTTGTGACAACTTTTTTTGAATAAAAACAATTTCTA ATGACCCTGAATAAAACCCAATTATTAATTGACCTTTCTTTTTTATAGAT TTTTTGTTGAAATAAAGACATAACTTTGGTCGTATTAAAAAAAAAATTAT TTGACTGTAGTAATTTCGTTTTAGGCGTTTTCAACAATTAAAACCAATTA TATACTCGAATATTGCTTGCTTTGTTTAAAATGGGGTGGCAATTGACCTC ACCTCCCTCCTGCCCCAAATCTCCTACACCTATATATATAAGCATTTAAA TTCATATATATCAAAATACATATTTATAATAAATTTATAAAAATAATGTA TATAATTTGAAAAATCACAAATTTTGGAATTTGCTCCTAATTATACAGAC ATCAATTTTGATCGCTACATAATGATCTCAAAGTCCTGGATTATATAACA AAATGCATTTTTAGAACGTGTTGACTAATGAATTAGAGGTTATACAGGAT TCACAATTCTCCCCATAGTGTGGAGTATCCCTCTCATCACAATGTTTTTT TTTTCGACTATGAAAGTATTCGAAGATATAAAAACNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNTTAGGTTCTTCTTGATTTTCGATATTTTGATGTAGGAGAGT AAAACCTTTTCTTGGAGAGAGTTGCTCCACTCTCTATTTTATACGTATCT GACTTGATCCTTCGATATAAAACTGTAAATGATCATTTCTTTACAAGTTG GACTAAAAAGTCCAAGGCTTCACACATAGATTACGCTATTTTTTTTAAAT TCCCCTCATTTTCATTTAGTGCCAACCTTCAAAAGACAGCTGTCAAACTT TCATGACAATTTGTTCTTTAGTTTGTGAGTTATTGTCCTAAGTGATACGC TATTTTTGTCATTTCTAAAACAATGGATCAAAAACAATTTCCCGTGAATA AATAATAATATTTATTAAAAAAAGCATATTTTGATCGAAAAAAACCCAAA AACTTTGCTTTTATTAAGTCCAGGACTTTTCAGGCAATGTGGAATGTTCA CTATCAGAATGAACCTACAATTACAAAGGTTGTACCATAAATAGTGTTTA CTTCTATCAATTTAAATCATGACTTTATTTATGGATACTACGTGCATATT TTGTCTAAACATTATATTGTTGATTTAACTTTTCTGAAAAAAATACAGGT AATGATTTGTCAAAAGTAGTAGACATGAAAAAATATCTCATTGTACAGGG ATGAGTACTAAAATCATAACGGAATGTTGATGCCTTCAAAGACTGGGGAC ATACATATATGCATACAAAACATTACTCAATGTATTGTCAATCAAATGAG ATGTATTTTTTTTTGTTTTTTTTGTAAAATTGTAAATAATTGATTAATTT TTCGTAGAAATAATTAATGATATATTTATTTTTAAATTATTGGTGCCATG TGTGTGTTCATTTCCAAGTTCAGTGGCCTCATGCTATTCGTACATATAAT TTTGCACGTGTGTTTACATGATAGATGATGTTTATTTTCTTGTTTATTTT TTATTTTTCAGAGAGTGTTTGGAGCTTTTATTGGAGAACGTTCAATGCAG CATCGTGAGTTCGTCTTCCAATGCTATATTGGACGCCTATGTTCTGAGTG AGAGCTCCTTGTTTGTTTCTCAACGACGCTTCATTCTCAAGKCCTGTGGA ACCACCACGCCACTCCAGTGTCTTGATGAATTGTATCGTCTTGTAAAGAA GTACACGGGTTTCGATGAATTTGAGGAAATTTTCTACTCGAGAAAGAATT TTAAGAAACCCGAGCTTCAATACAAACCCCATAAGAGTTTTGATCAGGAG GCCGCACTCTTGGATAAGATCTTTCCGGATGGATCCGCTTACTGTATGGG ATCTATGAACAAGTAAATGAAATTTTTTCCAATGTCTCGTACAACTACTC ACTTTCCCTCCCTCCCTCTCAGAATCCCTTGGGTAGTACTCGCACACGCA CACACACACACGTAGATATAAATTGTCAGTTTCATGCAATGACAATTTAT CTTTTTTATAACTTTCTTTACAAGCACCAACCACTTGAATTCCATTTGCT TTTTCTTACAAAACAAAAGTTAGAACAAACATAGGCATTACACGTGCCTA TTTGTTTAAACATACAAACAAACAATCAAAGAACTATGTGGAAAAAAAAA TCTTAAGAGACTTGATTGTCAAGACATGGAATTCAAAATCCCTTACTTTT CTTGGTTTGCAGAGATTGTTGGTATCTATATGCTCTTAATCCATTAGATC GCTATGTGTCTGGGAGATTGGACGAAGAGCCGGATCAAACCATTGAAATC ATCATGACAGAATTGGATCCTGAAGTTATGGATATTTTCTATGAAAGTAA TTCAAAGGATGGTCGTGACGCTACCATTGTAAGTTGCCTTTAGCCTAATA CAAGTCCATTTCTATTATTGTTGGGTTTCGGTCTAAAAATCATGAGGGTC GACGATCGTCATGATTTTTAGTGAACCAAAGTAATCTATTCCTTAAATAA AGTACGGTCCAGATGAGTCTCATTCAAAATTCGGTCAAGTCTGATTATAT ACATTAATTGTGGATGACGTCAGTTGTGTTTCAAAAATGGAAACATCGGC CCAATGTTGAGTTAAATGTGTTGCATAAATCATATATGTACAACTCATAC ATCAGTAGGGTACACTGTGTAAGTTTCCCCGCACTTTTTCTTTCTATCTC AAACTTGGAGAGAGTGAAAATTAAAAGTTGAAATTCAATTATAAAATTGA AATAACTTTGCTGGACTAGGGGTGGTTGATCTGTTTGGCTCCTCAAGCCT TTTTTCTCAGTCTATGGATCGACTTTAAGTCCATCTTTTCTCTTCTCTTC CCCTTCCTCTGTAAACTCCATAAGAGAGAAACTCATAACTTTCTCCACAT AATGAGACCTTCCATCTACTTTCACGATCCTCCAAAGTGCTAATTGTCGG AATATCTCGAAAAAGTCAAAGTCCTTTTTCTCCTACTCCAATGAGAATAA TATGTTCTTAGCTTCGCAATGTTATTTCCAAAGTATTTAAAGGTTGCAAT AATTTAATTTCAACTTTCCGCTGACCCTGTCTCCGATTTCGAGATAGAAA GAGAAAGTATGACGTGTGGGTCAACTTATATAGTGTGCCCAATCAGCATA GGTAGAAAATTTGTACATAGATTGGGATCGAAGCAATCGTTTCACGATTA GAAAACGATTAATGGTCGGTCTACAGTCTGAAATATTGATCCAAAGACCG AAACGACAGAAAATTTTGGTGTTGGACTGAGTGTCAACATTAATATCTAC TTCAGGGGCGTCCGCAGCATATATATTTTTTGAAAAAAAATCCAAAAAGA AAATTATTGTGAAAAAAATTTAAAAAATACACAGCTATTCACAAAAAATT AAATTTTTCCCCAACTACTTGGAGTACACGAATGAAAATTCGTGGATCAC TTTCAAGTGTCCTTTTCTCGACTTGTACGTTAGCTAAAGAGCTCAAGTTT GCTTTGTTTTGTGACTAATTGTTTATGCTTTAATATATCGAAACATGAAT CAACCTTCATTAATTATTGAATTAATAAGTGCTCAGATTTCAATGGACCC CTCGGAAATTCACTATTCTCCTTCATATTAATAAAAAATAAGGATTTTCA TTGTAGTAAGACTTGGTGGTTTAGGCCCTCAAAAAGGCCAACATCAGCAA TGCTAACGCCACCTGAAAGTACTCTATTGATAATTAGCATATTTCCTTTT GTCACATTATAGAAATCCGGGATCGATAAGATTCTTCCCAATATGGAAAT TGATGACTTTCTTTTTAAACCTTGTGGATAKTCAATGAATGGMATTCTTC GAAATGTAAGGSTCTATTAAAATTTGATTCTTAAGTTGGTATTTACATAA TATATTTACCTTTTTTTGTAGGATACAAATGACTTTGGATTGGTAATAAA TGTCTTAAGAAGGGAATAGATAAGAACATGTGTATTTACCTTATTTTTTC ATCCATTAGGGTGAATATTGTACAATTCATATTACTCCAGAACCGGAGTT TTCATATGTGAGCTTCGAGAGTAATATTCCGTCTTCCTCCTATTTGGATA TATTACAGCGTGTTTTAAGCACTTTTCGTCCAGGGAAATTTTTGGTCACT GTTTTTTCTAATCGAGTAAGATTTTAAATGTTTATAATATTATCCAACTG GAATACTATATACACCATTTTTTAGAGTAGCAAAGTTATTAAATGAAATG GAGAATTGAATAATTGTGTAATGAATGTCTTAAGACTTGAAATATTTTTG TAGGTTGATTTATTTTCTGTTATCAGAATAATAGCTAATAAATAAAAATC TAAGATCCCCTTAAAACATTCATTACAGGCCTCTTTTGATTAAATTATCT CTCCTCTTTCATAATTATTTGTAATTAGTGGTAGTATGAAGCATTTCCCA GAGTTATTAAGCTAAAACTATGTATATATGAGACAGATTAAGAAGTAAAT TACTTCATTTTTTTCTGTGATTTGCAAGGGGATCCACAAAATTGTATATA TATATATTTTTTTTGAGGGGGAGAGGGGCCTAAATTTAAAAAAAATCCAA AAAATCAATTTTTTGGGACAAAATTTGAAAAATTATTTTTTTTAATTTCA AAAATTATATTTAAAATATTAAATTTTTTGGAAAAAATTTCAAACATCCA TAGTTCTTCTCAAAAATAATATTTTTTCGAAAAAAAAATAAAGGAAAAAA CCACAACTGTTCACAAAAAATTAAATTGTTTCGAATTTTTTTTCAAAAAA CCAAAGATGTTCTCAAAAAGTATTTTTTTTTGAAAAAAAAATTTAGATAT TACATTTTTTGGAAAAAAAATTCAAAAATTCATAGCTTTTTTCAAGGAAT TATATTTTTGATTTCGAAAAACAAATCAAAAAACAATAGTTGTTCAGAAA GAGTTAAATTTTTTGAAAAAAAAATTGAAAAATTATATTAAATTTAGAAT AATCCAAGTAAAGAGCAAGAATTCCTTAATTTTTTTGGGGTAGCGTTTGC CACTTACGCCCACCCCCTATGGACGCTTCTGACGTTTCTTTTTTTAAAAG TAGTGGTAGTACACGGCATGGCCCATAATTGTTTTGCACCGACGAACAGA TAAGCTTTGCTTTAACTATATAGAAAATAATTCACCAAGAAATCCTTTGT TTTTCATCTGCACACTCACAAGCAGTTACACAATACTTGGATGTTCTCTT TTCAAGAAGGAAAGAATCATAACAACAGCTCGTAAATTAATTTAAAATAT GACGTGAGGAGCAAGAGAGTACTTTAGACTTCAGCTTTAGCTACAGACGT TGTTTTTAAAAATGACTCCTCATCTCATACTTTAGAGTATAGAGTTGGAT GTATGAGTTGACCTAAACGTTCTTTCTTCTTTTTTAATATAGCGTGCACA TTCAATTGTAGCGTTATTTTTTAGATCAAGTATCTACACTCAAAAATGAC ATATTGATAGCATACATTCAAATATACATAGATACAAAAACACATAAAGA TAGACAAACTTTTATTCATAAGTATAAATCAAGGTTAATAGAAATAGAAG GTTATACCATTACCCGTGTACGACTGGTTTTTGACTTCCACCACGCTTTT TAATAGTGGCGTCATAGAATATGATGTGTTGCGTGTTTTATCAAAATCTT GCCCAGCAGTTCGTACGATAAATCAAATTGAAAATTCAAGCAAGCCCTAT TACATTATGGTCTAACCTTGTACATATATAAATATAGATTTAATTTCTAC CCATACGTAGTTATTAGTTATATATAGTAAATAATTGTGATATATAAAAA GATTTTTTTTTTGAATATAAGATATTTAACTAGAATAACAAGGAATGAAA TGGATCAAAATTTATCTATTGCTAATATATTCATAAGTTTTGGATAATAA TTTATTTACTCGTACCCGAGGAACGACAATACCACCAACCTCTCATTACA ATGTTACATTTTCTGATGAAATTGACTATTCACATGTCTAATTAATGAAC TAGCACGGATACTCGCTATGCTCTAAGTAAATTATACTAATATAGACTCA GTTTAATTTACATAAATGATAATAATTTTTGGAGCCAGATTCGGTACAAA TTTGTCGACTCCTGACTCCGAATCTAACAAAAAAGACATCGTCTCCGCAG 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