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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s12 | supercontig | LSalAtl2s12:1107868..1133783 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001734 >EMLSAP00000001734 ID=EMLSAP00000001734|Name=EMLSAP00000001734|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=595bp
MCPTKFEENNISKSSLATEYNQVSSDDNFFEGVEKLXEVWFTTSKTNVNE CDLRKIPRECLELLLENVQCSIVSSSSNAILDAYVLSESSLFVSQRRFIL KXCGTTTPLQCLDELYRLVKKYTGFDEFEEIFYSRKNFKKPELQYKPHKS FDQEAALLDKIFPDGSAYCMGSMNKDCWYLYALNPLDRYVSGRLDEEPDQ TIEIIMTELDPEDTNDFGLGEYCTIHITPEPEFSYVSFESNIPSSSYLDI LQRVLSTFRPGKFLVTVFSNRKSKSVDSHKELFKATNMGEWNIVKTWLKE MGKTNHGRKLTFLYLANDVVQNSKKKHPEYAKEFGSIMKGVVEHLANTHL DQKTIKSIGRLINIWRERSIFEQSIQTDITRIWTGKTLESRVEADSTPPP QKKSKTWRKKSVEDEQQEEEEEEEEERDSNVLDSPPASVADPPEPEELIK ALQDLENSASSDAVIREKIARLPPEVSEVSQLSNLQSAEEGYKLMHKVSQ ATELLSAYNERLQQELKDRKRVGKMITDFLSAQRDLEAQAEERLXXYRDK LEKVNAVKNDLKSHISSLPDLTKLPDVTGGLAPLPSAGDLFTIAK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s12:1107868..1133783- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001734-697581 ID=EMLSAT00000001734-697581|Name=EMLSAT00000001734|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=25916bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s12:1107868..1133783- (Lepeophtheirus salmonis) ATGTGTCCTACAAAATTTGAGGAAAATAATATATCGAAATCATCATTGGC
TACGGAATATAATCAAGTGTCAAGTGACGATAATTTCTTTGAAGGAGTGG
AAAAATTACMCGAGGTTTGGTTCACAACTTCGAAAACAAACGTCAATGAG
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TCTCTACCTCTTAAAAGAAGGATTAATTATGAATAATACCTTTGTTTGTA
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ATGAGAGTGATTTTCTTTTCCTATATGCATGTAGATAGTAGGCCTGTTCA
TGCTGAATATGCACTTTTACCAGGAGGAAACTATTCCTTAAACATACCCC
TGGTAATGCATAAAACTTAACCAAGATGCACTCTGGATTTCTGTCTTGTT
TATGCGTGGGTTTTTTACAAACTACTAAAAGTCCAAATATGATCATAAAC
CTTGTATCAAGTAAATTAAAAGAAATTCCCTACTCTTTCCATGCAGTGAC
TATTATTAGAGGAAAGTTACTTTCACCTTCCTCCTCGTCCACAAATATGT
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AATATACATAGTGTATATTGTAAAAAATATATAGTAATTTTTACAAACAT
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AGGAAGGGATGTCAGTCCTGTGAATTTTTTAACTGCCCTATGTTTTTTTG
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NNNNNNNNNTTAGGTTCTTCTTGATTTTCGATATTTTGATGTAGGAGAGT
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TCCCCTCATTTTCATTTAGTGCCAACCTTCAAAAGACAGCTGTCAAACTT
TCATGACAATTTGTTCTTTAGTTTGTGAGTTATTGTCCTAAGTGATACGC
TATTTTTGTCATTTCTAAAACAATGGATCAAAAACAATTTCCCGTGAATA
AATAATAATATTTATTAAAAAAAGCATATTTTGATCGAAAAAAACCCAAA
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CTATCAGAATGAACCTACAATTACAAAGGTTGTACCATAAATAGTGTTTA
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TGTGTGTTCATTTCCAAGTTCAGTGGCCTCATGCTATTCGTACATATAAT
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CATCGTGAGTTCGTCTTCCAATGCTATATTGGACGCCTATGTTCTGAGTG
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CTTGGTTTGCAGAGATTGTTGGTATCTATATGCTCTTAATCCATTAGATC
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GACGATCGTCATGATTTTTAGTGAACCAAAGTAATCTATTCCTTAAATAA
AGTACGGTCCAGATGAGTCTCATTCAAAATTCGGTCAAGTCTGATTATAT
ACATTAATTGTGGATGACGTCAGTTGTGTTTCAAAAATGGAAACATCGGC
CCAATGTTGAGTTAAATGTGTTGCATAAATCATATATGTACAACTCATAC
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TTTTTCTCAGTCTATGGATCGACTTTAAGTCCATCTTTTCTCTTCTCTTC
CCCTTCCTCTGTAAACTCCATAAGAGAGAAACTCATAACTTTCTCCACAT
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AATATCTCGAAAAAGTCAAAGTCCTTTTTCTCCTACTCCAATGAGAATAA
TATGTTCTTAGCTTCGCAATGTTATTTCCAAAGTATTTAAAGGTTGCAAT
AATTTAATTTCAACTTTCCGCTGACCCTGTCTCCGATTTCGAGATAGAAA
GAGAAAGTATGACGTGTGGGTCAACTTATATAGTGTGCCCAATCAGCATA
GGTAGAAAATTTGTACATAGATTGGGATCGAAGCAATCGTTTCACGATTA
GAAAACGATTAATGGTCGGTCTACAGTCTGAAATATTGATCCAAAGACCG
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AAATTATTGTGAAAAAAATTTAAAAAATACACAGCTATTCACAAAAAATT
AAATTTTTCCCCAACTACTTGGAGTACACGAATGAAAATTCGTGGATCAC
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GCTTTGTTTTGTGACTAATTGTTTATGCTTTAATATATCGAAACATGAAT
CAACCTTCATTAATTATTGAATTAATAAGTGCTCAGATTTCAATGGACCC
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TTGTAGTAAGACTTGGTGGTTTAGGCCCTCAAAAAGGCCAACATCAGCAA
TGCTAACGCCACCTGAAAGTACTCTATTGATAATTAGCATATTTCCTTTT
GTCACATTATAGAAATCCGGGATCGATAAGATTCTTCCCAATATGGAAAT
TGATGACTTTCTTTTTAAACCTTGTGGATAKTCAATGAATGGMATTCTTC
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TGTCTTAAGAAGGGAATAGATAAGAACATGTGTATTTACCTTATTTTTTC
ATCCATTAGGGTGAATATTGTACAATTCATATTACTCCAGAACCGGAGTT
TTCATATGTGAGCTTCGAGAGTAATATTCCGTCTTCCTCCTATTTGGATA
TATTACAGCGTGTTTTAAGCACTTTTCGTCCAGGGAAATTTTTGGTCACT
GTTTTTTCTAATCGAGTAAGATTTTAAATGTTTATAATATTATCCAACTG
GAATACTATATACACCATTTTTTAGAGTAGCAAAGTTATTAAATGAAATG
GAGAATTGAATAATTGTGTAATGAATGTCTTAAGACTTGAAATATTTTTG
TAGGTTGATTTATTTTCTGTTATCAGAATAATAGCTAATAAATAAAAATC
TAAGATCCCCTTAAAACATTCATTACAGGCCTCTTTTGATTAAATTATCT
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GAGTTATTAAGCTAAAACTATGTATATATGAGACAGATTAAGAAGTAAAT
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AAAATTATATTTAAAATATTAAATTTTTTGGAAAAAATTTCAAACATCCA
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GAGTTAAATTTTTTGAAAAAAAAATTGAAAAATTATATTAAATTTAGAAT
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TAGTGGTAGTACACGGCATGGCCCATAATTGTTTTGCACCGACGAACAGA
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TTTTCATCTGCACACTCACAAGCAGTTACACAATACTTGGATGTTCTCTT
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GACGTGAGGAGCAAGAGAGTACTTTAGACTTCAGCTTTAGCTACAGACGT
TGTTTTTAAAAATGACTCCTCATCTCATACTTTAGAGTATAGAGTTGGAT
GTATGAGTTGACCTAAACGTTCTTTCTTCTTTTTTAATATAGCGTGCACA
TTCAATTGTAGCGTTATTTTTTAGATCAAGTATCTACACTCAAAAATGAC
ATATTGATAGCATACATTCAAATATACATAGATACAAAAACACATAAAGA
TAGACAAACTTTTATTCATAAGTATAAATCAAGGTTAATAGAAATAGAAG
GTTATACCATTACCCGTGTACGACTGGTTTTTGACTTCCACCACGCTTTT
TAATAGTGGCGTCATAGAATATGATGTGTTGCGTGTTTTATCAAAATCTT
GCCCAGCAGTTCGTACGATAAATCAAATTGAAAATTCAAGCAAGCCCTAT
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TTTATTTACTCGTACCCGAGGAACGACAATACCACCAACCTCTCATTACA
ATGTTACATTTTCTGATGAAATTGACTATTCACATGTCTAATTAATGAAC
TAGCACGGATACTCGCTATGCTCTAAGTAAATTATACTAATATAGACTCA
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GGTGGGCTGGTTAGTTCTTAATAGTTCATGCTTTTTACAAGAAAATTAAA
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TTTTTGAAAAATTTTAATATTTCAAATTTAATTTTTGAATTTTTTTTTTT
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TCTTCTTCTCTTCTTCCTTCCTCTCCACTTTCTATAATAACAAAAAAAGT
CCCTTCTTCTACTTCAATACTTCCATTAACTTCTCTTTATAATTTTAGTA
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CTGCTTCGAATATATTTAATGCTTTTGAATTTCAACGTCTTTTTATTTTG
CCTTCGACTCATGGATACGGTGTACACACTCTTACAGTCTTCCTTCTGGA
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CCCAGTCAAGATTAATGTAGAAAACAACGCAATGTTGACCATGAGCTACC
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ATTTTTTGTCGCAGCTTTAGAACGCTAGCAATTACTTAGTAGCCTTTTGC
TCAGCATGTAAACGCTAGTATTTAGCTATTAGTTTTTTGCTCAGCATTTG
TACCCTAGTTTATAGGCAGTATTTTTTTTTTTGATTGCATTTAAAATCTT
GCAAGTGATATGGTTAAACTATCTTTCAAAAGCTCCATATACATTAGCTA
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GTTACTATTCGTATAAGAGGAGGACTTAATTTGGACACGCCGGATGCGCT
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TCCATACTCTGTAAGGCCGATACTACAATCCTGAGAAATAACAACTAAAA
AAATAAAAATGTGCATTTAATAAAAAATGATTTTTGAATTTCTTACACCC
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TGATTGCTTTTCATAAATTTATTTTTTCCCTGAGTTACATACTTACGTAT
TATGACGTTTTTGGCATTTTTTTTTTTTTGGATAACTACAAAATAAAATA
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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ACAAACTTGATTATTTTTTAATAGATTTTCTCCTACACTAAGCATCCGAT
TTTACTAAAATTTTTGCAAAATAACAGATGAATAAAAAATAATATTCAAT
ATAATTACCTTTGGCGGCAATAACAGTCTCAAATCGACTTTGGAAATGGG
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ATCGTGGATATCAGATAAGATTTTCTGTTGCAGAAAGATGTCTTGGTGTG
TCCCTCAAATGCATCCCAAACAAAAAAGTCCTTAGGGGTCTACAACAAAG
TCAAAAAAACCAACAAAAAAAAACCGACAACCATCTCAAATATCACATAT
TGTATGATTAATATTGCAAATCATCTGCCACACAATACCTGATCGACTTT
TCAGTACAGATGAGATATCTGGCAATGGCCCTCATCAATGATTTTTTTTT
CAAATTTGCAATTAAATCTTGATCCCTCCGGCAGTATCACCTCATTTTGT
CATCAACACGCTATGTTGTTGATTCATAATCACCTCCAGGCTCTTTCACT
TACTTCTTGACTCTCCAGATCCTTGCAGCACAATTTTAAACAACCGTTTA
CCTCATCCAGATCCTGAACAAATGTATTTTGACAATTTTTTGGGTTTTAT
TTAATAGCATATTAATTTTAAATATGAACTCCATGGACCTCAATCGCTAC
CTCAATTCTCCCACAGAGTAACCATTTTACCATTTTATAAAGAAAATATT
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CAAAATTTTTGGGGCGCAGTACCATTTGAAGCCGTTGGTATTACTAACAT
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GTTGGTGCAGATCGGTTAATCCCGAACTGGACCCACTGTAGTCATTTGAA
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TTATTTTATTAATAACCTAACCTCTTTTATTATCACTGATCCATACAGGA
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CAAATTAAGGAATTTATGCTTTTTACTAAAAATTTAATATTTGAAATTTA
ATTTTTCAAAAAAGAATTAAAAAATTTAATTTTCTCTCACTTGTTGTGGA
TTTTTGAAATTTTTTTATTTATAATTTAAATTTAAAAAAATGATTTTTTG
TGAATAGCTGTTAATTTTTGATTTTTTTTTTCCAAAAAATTTAATGTTTG
AATTTTTGTGCGAAAATGTTGATTTACAATTTCAATTTTGAATTTTTAAA
TCAAAAAAATTATTGTTCTATGAATGAATAGCTGTAGGTTTTTGAAATTT
TTTCCAAAAAATTTAATTTTTCAAATTTTGTTAAAAGAATTAATTTTGGA
ATTTTTTTCTAAATAATTCTAAAAAATAAGGACCCCCTCCCCCCAAAGAA
GATATATATATATATATATAATCCTGTGTGATCGTCGAAGACATTCTGCT
TTCCGCACACAGTGAAGGAGATGGTTTAGATAAGTCGTCAAATTAGCTTA
AGGGGCTTAACGTATCTCACGAGTCAGTTTGTACCATTCTGATTGAAAAC
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TCTACAAAAAAAAAGGTCAGTGAGCAAGTCACTTCGTACAATGGATCCAA
AAGAGATTACTTTGAAGAAAAAATAAATTTTATTGAAAAAATGTGAAATT
TGTGTGTTATATTTATAAAAGTTCCTGGTACTTTTATGGTAGAATGTATG
TGTGTTAGTCCATATGTACCATGAAGTTAAAATTTAGAAAGCAGTTGGAA
TAGCTACGGAGAAAAAACCTTTGTTTAAAATATATATTTCAAATTTTATA
ATAATTTTTATTTGATATGCGAGAGTCGTTTGAAGAGTCCGTGCAAAGTC
CAAGAGATGGCACTACTGGGATATATCGAGGTGATGTTTAGTTAGTAGCA
TCTCTTGGAAGAATACACACCAACTTTAAGCCCTATTGCTTTACTTTTTT
CTGTGTGGGATTCGTTTGAAGGGAGATATCGGCTGAAAAGATTATGACAA
CTGTCTTTTGAATTCACAAGGAATAATATATTCATCGACTATCTGGAAAA
TGGTAAAATAATAAACGATGCATCGTTATGTGACTGTTAGAAAACTGAGA
TAAAAGAAAAACGCCCACGATTGTACCACAAAAAAGTCATTTTCCATGAC
GACAATGCACCAGCTCACACCTCATCAGTTGTGGTCGCAAAATTTAGGGA
AATATGGTTAAGATGCCTACAGCACTAGCAATCTCACGCACCTTCACTAT
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GACCTCAACAGGGTGTCCAAAATATTACTTCTGCCCATTTTTTCACTCCG
AAATTTTTTGACACCACTTATAAACTGATCTAATCGAAGGTAGAGAGACC
CCACAATGTTTATCAAGCTTATTTTTTAGTCTCCTGAGCCGTTTTGCTTT
TCATAAACTAATGTTTTGTCAACGCACAAAATTCTTTTTTGTCCATTTTT
TTAAAATTGCTCCACTTCCTCGATTCAAACAAATACCAAACAGAAGTAAA
TATACAGATCTGGCTCAAAATTGGCATGCGTTCTTCCAGGATATGCTCTT
AACTAAATATAACCTCGACATGCACCATTAGTGTCATCTCTCGGACTTTG
CACGGACATTTCAAACGACCCTCATATTAGCCTTTTTTATTGTTAATTTT
CCCTTAAATTGAAGGGATCCATGACTTTAGGGACTATGACAATAAGAATT
AAGCGATGAATGAAGAAACTTGTTGAGAGATATCAAATTAAGCTTCCTTT
TCATCCTTATAACTTATAATAGAATTCACATAGCAATCAAATGAGCGCTG
TTTACTTATATCAGTTTTAGTGTAAGATTTAGGTCTGGGAATCCTAGAAC
GTTCTGAGACCGTTATATTTTTTGTTGGACCGAATTAGTTTCGTACAACA
AATAAGCTCAGTCTGTACTGGTATCATATGAAAATTCGGTCTAAATCTGT
CCAAATGAAAAATTCGGTCAGGTTCGGGCCAAAAAAAATCGGTCTGGACC
GATTTTACAGATAATTTACTTACAGCATGACATCATGTGTTTTTTCAAGT
ACAGTGACGTTATACAAAGTTTAAACAGAGATAGTTCCGATTAATTTTGA
TACCACCGTCTCTTATATGTAGAGGGTGCGGTTTTACAATTTTAGAATTT
TCGATACCAGGACAAAAACCTTTTTATTTCTTAAACTAGTAGAGATATTT
ACAAATCCATTTATTTGCAAACGTAAGGACCCTTTATGAACCTAATCATT
CAAGTCAACCACCCTCAGCCACGGCCTCTAACCCGGCACAGAACATGCTG
AACGCCTTGATCAAGTTATCTTTATTCATATTGTTCACAGCGTCAATAGT
GGAGGCCCTCAGAGAACCCAAATTGTTGAGAGCATGCTTCTCTAACTCCC
TCTCAAAGACACTCCATACGAAATAGTCCAAGTGATTGCATTTCCTTAGA
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AGAGAGGCTTKAGCMGTATCGGGATAAATTGGAAAAAGTGAATGCCGTAA
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