EMLSAT00000001752, EMLSAT00000001752-697599 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000001752
Unique NameEMLSAT00000001752-697599
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s12supercontigLSalAtl2s12:1554037..1587021 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000001752 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000001752EMLSAG00000001752-684518Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000007739EMLSAE00000007739-716667Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000007740EMLSAE00000007740-716668Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780818auto780818Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000001752EMLSAP00000001752Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000001752

>EMLSAP00000001752 ID=EMLSAP00000001752|Name=EMLSAP00000001752|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=247bp
MRFLHLNLCIILVSNVSAMSTSSLLHSLSSLASLSWSNNFPSSRSNPSPS
NLNDQGPHFSSRAGRRNDKYLTEWESKKSADSNALSKMENSPITFIKLPP
SMYVLQSRNSNKGGIFSSKNHLSDRPKGESVRGGSGNRLSVNRPNVQYIS
NGKPFSVYKWIQRMKQVSTTTKTTTTTTTTTTTTIAPTEDNQSTVTDSPI
IWLGKFFMNGLPNKLYEFKSPFSSLYWSNSLEETKAPSSPILRLFRR
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mRNA from alignment at LSalAtl2s12:1554037..1587021+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000001752-697599 ID=EMLSAT00000001752-697599|Name=EMLSAT00000001752|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=32985bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s12:1554037..1587021+ (Lepeophtheirus salmonis)
TTTGAAACAGTCGAATTAATATGTCATAAGAAATCCCAAAGAAAGAAATA TATATTCATAGTACAAAAATAGTGAAATTGAAATATTATATCATACATAT TCAACTAACAATACCTTCAAACCTATCAAGACATCAGTCAAACTTTTCTT ACAAAATAGAATCATCAGGAGCATTTGGTATTTTCAAATATATAATTTGA AGAATTCAAATTATATCCATAAATCTAAAGCTATTTCTTCACTATTTTTA CAATAACACTTCAAAACCAGCTCTTACATAAACGACAAAATGAGGTAAGA ATGACTATTGTTCATATACAGATATATATTTTCTTTTAACAAATCACGTA GAATTGACCTAGAGGTAAATTACATCATCAAATATAAAAAATGTAAAATT TACATATTAGTCCTAAAATATTTTCCCACTTCTTATACTTTTGTTATTTT TTCGCAATATATAGTTTTTTTCACATTTTAATCATTGCGGTTTCGTGTGT AATACATTTATTCGAAAGAATTGATTTATTGTCCAAATAAGAAAAAAAAA GATATCATCTTTCTTACGAAACGTTGTGGAATCTTCTTCTATAGGAAATT ATGAAAAAAAAAACAACTTCAAAATCAATAATATTGATTGGGGGTTCTGT GCAAAGTATCTTATTCCATAGTAGCAATTCCATCAGGCACTCTTCAGTTT TTAGTTTCCCGGATCGAACTGAACCATTTTTATTTCGAATGTTTAAAATT AAAGTAGTGTTGTATCGGTCTCAAGTCATATGAGTAGAGTCCTAATAATA TTTGTGGCTAAAACATATATTACTCAAACATTATACGTTCTAGCTCCCAT TCATTCTCTTCTTCCTTTTTAATTTCTTCAAACCAAGCTAGGAGTGAAGA AAATAAAAAATAACTAGAACTGTACGAGTGACTAATCGGTCCTCAATACC CTTGCATGATAAAAAATATCGGACCGATAAAAATAAAGACTGAAAAGGGG AGGAAAAGACTGATTAAGAAATCAGACCTAGGACCGATGCAATACTAAAT CCATTAAAGTAATTAACATTACAAATATTTGATTAGCACAGAACAAGAAA ATAGATTATTCTGGCTAATTAGAAAATGCCAGTTGTTGTTGAAGGAATAG TTACATGATTTTGTGACATTTTCTCTTGACTCAGAGTCTCTTCTTCTATT TTTCTTGTTTTGTGTACAATATGTCTCSTGCCCTTTGTGCTCAACTTCCA TAGGACTTTACTACCACAGTATGCTGAAAAACAACATTTATGATACCCCC ATTATACTGGAATTTTCACTTTTTCTACGGTCCACTTCCTCATAACCAAA TATAAACTTTTAGCTATCTGAGTTACAAAGTATACTGGGCACCGGGATAG TGATTTTGTGGACCCAGAACATATATTATTATGACAGTGAATGACAAAAT TCAAAATCAATCAAGACTCTGGGGTAGTGAAGTTATTCGATGTTATGTTT TTTGTATCTTTTGTATTTTTTTTTTTTTGTAATTATATTACAAAAAAAGG ATGAATTCATTGAGAAAAGTTATTTTTTCCTTTATGTACTATTTATGGAG GAGACACACGCTTTATAATTAAAATGTATACGTTAATTATAGAAATATTA TTGTTTAAACAAAAAAAAAAAAATAGATTTTCTCTTTCTTTAGAAGAGGG GTTTTCATTCATCTACATAAATTAATACTGATTTTCTTCTCCTGTACTTT TTAAACTCATCTTCAAAGAAAATGAAAAATAACAATAATAGCTCCCTAAA TACTTGGTAATTAGTATTCTAAATGGAAGCACAAAGGTGTTCATTATATA ATTATCCTCAACAAATTCCTTCCCTCGGGATGTCTTTTTGTTTTTCTCAA TAAATTGTTGCATGAGAGTCCAGCTATCCTCCCATGACTTAATAGAATCA AGGAATAAGCCCACCGGTTCTCGGCCCCATTAACGCATCTTCTACCTATT TTCTTATTATTTCTATATTCAACCATAAGATAAGGTAATACAACAAAATC GAGAGAAAACATTCCCTTTCCAAACAATTTTTCAACAGTCAAAAAACTTT TACCCATAAACTATTCCCGAAAAAATCCAGATCAGTCTAACTTTTGCCCT TCATTTTTATATAGAAAAATTCTTTAAATTTCATACATAAAAAGATATAA GTATTTTTTGAATCCCCAGGGATGTGTTTGTCTTTTCTCAGTCCATCGTT ATATTGAAAGAAGATTTGTTCTATATAATAAATGGGCTTGACAATTCTAC TGTTGAGAAAATTGACAAAGACATCAGTCATTCTTAGCAAATACAAAGAA ATATGCTTTGAAATTATAGAAAATTATCTTGGTTCATTGTACAGTTCATC AAAAAATCAGATTTTGTCTTTCTCTACTTATAGTAGCAAAATCCGGAGAC GATCGACAATTAGGCTGAAGCAAAGGAGTTGCTATTATCTGTATTTCTGA TTCTACCCCATTTTGAATATGATTACGTCAATAGTACAGTACAATGCCAA CTCTTTTTCTCCGTCCCCCCTCCCATCTCACCTCACTCTGGGAAGTACGT ACACACCAATCTGGCTAGAGACATCCATCAAAAAAGGAATAATAGGATTG TCAATAATAATTAATTAATGATTTGTAATTGATTGTATATCATTATCGTA TTAATAGCCTTAATACGATTTAAATATATATAAAAACTGGGTTAGTCGTA CATTATATGTATTTATATCTATCCAAATATAATTTATGGGATTGGTATTG GATTTATAGAGCGTTTTCATGTGATGTTCGTATTGTCAATGTCAGTTATC 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ACGTTTACTGCATTAGAAGGTCATAAGTAAGAAATGCGATTTTTTTTTTC ATTTTATTGATTATATATTTGTTATTGCATCCATCAAGTTTTTTAGCTTA TAAAATGTTAAACTACTCAAATACAAGAGTTCAAAACTCATGTATCAAAT ATAATACGTACAGCGTTAAAGGATTAAAGCCATTTAATAACTTCTTTGTC CATTTTATTCAATATAAATTTTAACTATGACCATAATATTGTATCCCCTT CAATTCTGTTGCGATATTTACCATCAATGAATTGCTCTTATAGAGTATTT TGTTCGTCCAAATTAATTTGGTCCAGTCTAGGACCGGTCCCGAGGATCTG TCTTTCAATACATCTAAATATCATTCATTCATAATTAAGGAAAAAACACT TCAATGACATCACGAGGATTCGATTGTTTCTTTTTGAAGGGTTAAAAAGT GGCACTGGACTAGACCGAACTGAAGTGGATCAATATTCTTAGTCCAATAT ATATTCTGACACAACACTACTCTAATATCATCTCGTTCTTATTTGATGGA TAATATCTACTTCGATAGCATTAGAGCTGTTGTTTACTGTATCTAACTAT AAAATATAAGCATTGGCAATATGTTAATTAATATGATCCTTTATATACAT TTTATATAAAGGTTTTTCTTGAGGTTTTTTTTTGTATGTATATAATATGT AAAGTAAAATTTTCAAAAATTGAATGATTTTTTTTTGTATGTGTTCCATG GTATATATAATTTACCGAGATTTTCTTTCTTTCTCTTTTTATTTCACGAT ATCATAATAATACACTTTTATTTCGTTCATTTTTTTTTTCCTCAGAGAAT TCGTGATGATACTGGGTGAACTTTAGTGCATATATACATTGAATATCTCA CATTATTTTTCATTCAAGTATCATCTTCATCAATAAGCTATGGGTAGGAA 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TTAACCTAGAAAGATTATATTATACTTCATAATTCCATTCTCATCAAAAG ACAAAAATCTCCAGGAACGAAGAAATAAAATCATTATAAATAATGACTCT AAAAGGAGATTTAATCCGCGTTGTAGATTATATAGTTTTATATTTTAAAA AGAGCAATAGTGTTGCTCTCTTTATCATCAAAAAAAGACAAATACTCGTA TAAGCCAATTATTCTCTATGATCCATACCTATTTTTTTTTGTTTACTCAT AGGTATATTTATAAATAGTTTCATTACTGCACCAATTACACTTTTTATAC TCATATATCACAACACAAAATTGAATGTAATTGTCAAAAATACAAAGAAA AATGGGCAACAAAGAAAACAGAAATAAAAAACAGATTCAACACTTGGTGG TGGTGGTGGTGGTGGMGGMAGATACTGTTGTTGAATCTTTCATCATGAGG AAGGGATGAAGCGATGATGAAATGAGAGTATATGTAATGGCAAGAGTATA TGTAGAGACCACAAAAGAATTTTTTATTTATTATGTATTTAATATCTACA CAACAAAGGGATTGACACTCTAAGCTGTTAATGTCTTTTATCTATCTTTA GATGAAAGGATCCGACCTTTACTGTCTATGTAATAATTACATGTGTACCT ACATGAAATTTTGATTATTTTCCTGGATGTCGTACATATGTAAAGCCCCT TTGCAAAAGGATATGTTGCATACATCTTTGACATGATCAAAAATAATTCT TTTGGATGCAATCACTACAGCTTGAATCCTTAACTCTTCCCCAATGGGAG TGCATTTTCAAAAACGTCAGCAATTGTCTCATAATTGATGGAGGTGACGC GGCATATTATAAATATTAGGGACTCAGTTAATATTTTTAATGAATACAAT GAACAAAATCCCAATAATAAACTCCATCAGATGACTTTAAAAATAGAATG AAACAAAACATTACACTACTTGAGTACTACTTGATACCAATGATATAGGA AGTCAATCAAATTACTAGCTGCTGAAAGCCCTTTTGAAATGGGCGTCTTT TTACTACTTATGCTATTTTGAATTGATTGGAGACGAAAAAAGTCGGATAA TATGAGATAAATGTCTGATGCTTGCAATTATAATGCTTAACTTATTGTCT AAACTACGTAAATAAGAATTTATAACTAGAGAAAGGACCTACTTATAATA CATATTAGGGTCAGATAAAGGGGCAGATTTATGATAGAGAGTAGAAGTAG AAGTCTTATTATTTGTCCGTCCATTTTGACATCCAAATACACTGAAATAT ATTGTTCCCAATTTTCTTTCATAATATAGATAAATGCTTCCTTAGTCACC CAATTAATTTGCCATATTAAATGACCAAAAAAGACTGTTATGACTACAAA AGTATTTGGGTATTTTTTGCTATTCCCTCACTTGTTAGTGTGTCCCATGA ATATAGTTATTTGCTTCAAACAAATGGTTGTATATTTGAGTAATCTTCAA TTTCGTTTATTTGATTGGAATCCATTCTTACACACACAGGAGCTTGAAAG AAAAATAAATCGTTCGTCACTATATTTTTTTAATTTTCTTAAAATTAATT TCCTTTTAANTTTAATTCATTTTCTATTTAATGTATTTTTAGTTGTCGGT GGGTACTAGTACCATATTATATTATACTATACTAAGTGTTACTTTTATAC TAGTAATTATATACTACTATCATTATTTCAATCCTCACTTTGGCAACATT TAATTTCACTTTTTATTTTCTAAGAATCCCGTACATACAATATTAAATAT ATAAAAAATATCTTTACAACTTTTGTGTGAAATTGTTTTTGACAATCATA ATGACTTATGAGTAGTACCATTATGTTAATACATACTAATGTATTAAAAT 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