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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s12 | supercontig | LSalAtl2s12:1554037..1587021 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001752 >EMLSAP00000001752 ID=EMLSAP00000001752|Name=EMLSAP00000001752|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=247bp
MRFLHLNLCIILVSNVSAMSTSSLLHSLSSLASLSWSNNFPSSRSNPSPS NLNDQGPHFSSRAGRRNDKYLTEWESKKSADSNALSKMENSPITFIKLPP SMYVLQSRNSNKGGIFSSKNHLSDRPKGESVRGGSGNRLSVNRPNVQYIS NGKPFSVYKWIQRMKQVSTTTKTTTTTTTTTTTTIAPTEDNQSTVTDSPI IWLGKFFMNGLPNKLYEFKSPFSSLYWSNSLEETKAPSSPILRLFRR back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s12:1554037..1587021+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001752-697599 ID=EMLSAT00000001752-697599|Name=EMLSAT00000001752|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=32985bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s12:1554037..1587021+ (Lepeophtheirus salmonis) TTTGAAACAGTCGAATTAATATGTCATAAGAAATCCCAAAGAAAGAAATA
TATATTCATAGTACAAAAATAGTGAAATTGAAATATTATATCATACATAT
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GTCATTTTTCTTCGACTTTAGAAAATATAATCTATCTTCATTTCTAAGAA
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TTTTGTTTTTGTTATTAGAGATAATTAAGTTCTTGGTTAGAAGTTGATAA
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AATTTTCTTTTAGAGAACATCTTTTTTATCATTTTGTTTAATGAAACAAT
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CAATTCTGTTGCGATATTTACCATCAATGAATTGCTCTTATAGAGTATTT
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TCTTTCAATACATCTAAATATCATTCATTCATAATTAAGGAAAAAACACT
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AAAAAATAATATAGAAAAAAATCTTTATTACAGTCCCGAAAAAACGTGTC
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TTTTGAAAATATATTTAAAAAATAAATCAATTAAGTCTGCGTTATATAAT
TGTAAATCCAATTTAATTAAGTTTACTTCATAATTAAAAAAGTAACTAAT
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ATGTAGTCCTGACTCCATTTTGAGACAAATAATATTTCTTACTTTTGTGT
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TAAAATATTCAAGGGCATGAAGGCCAATCCAACCTGAAATGTCATTGATC
TTTTGACATACTACCGCGGCCATGCCCTTTTGTTATTCTTCAGTAATTAC
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GCTTATATAATTAAGTAACTCAGTTCGCTATTAGAAATATTGTATCAAAC
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ATTTATTGTTCATTAATGATTGGGGATGGTAACGTCACTGCCTGATGTCT
ACGTGAAGACCATTTACCTACAATTCTTCTATAGGACGACTTCAATACTC
AGACAATATCTGACAAGAAGTCAAAATTTAGGGTACACTACATTCCTTGT
AATTGCAAACAGTTCTTGAATTACATGTGGGAAAATTCCTTATTTTACAA
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TAAGGTTTTAAGTCTGCAAAATATGGACTCACGTCTAAGTCGAATCTCAA
GTCCTAGTCCCCACTTTAGTCTTGAATTCATTTTACTCTGTAGATTGGTT
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CATCATTAGTTATAGTCGTGTATATATTGCTATTACATACATAGGTATTG
TGATTATTTTTCTATTAGTTTTCACGATTTTAATAGCAGATTGTTTATAC
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AAAAGGAGATTTAATCCGCGTTGTAGATTATATAGTTTTATATTTTAAAA
AGAGCAATAGTGTTGCTCTCTTTATCATCAAAAAAAGACAAATACTCGTA
TAAGCCAATTATTCTCTATGATCCATACCTATTTTTTTTTGTTTACTCAT
AGGTATATTTATAAATAGTTTCATTACTGCACCAATTACACTTTTTATAC
TCATATATCACAACACAAAATTGAATGTAATTGTCAAAAATACAAAGAAA
AATGGGCAACAAAGAAAACAGAAATAAAAAACAGATTCAACACTTGGTGG
TGGTGGTGGTGGTGGMGGMAGATACTGTTGTTGAATCTTTCATCATGAGG
AAGGGATGAAGCGATGATGAAATGAGAGTATATGTAATGGCAAGAGTATA
TGTAGAGACCACAAAAGAATTTTTTATTTATTATGTATTTAATATCTACA
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ACATGAAATTTTGATTATTTTCCTGGATGTCGTACATATGTAAAGCCCCT
TTGCAAAAGGATATGTTGCATACATCTTTGACATGATCAAAAATAATTCT
TTTGGATGCAATCACTACAGCTTGAATCCTTAACTCTTCCCCAATGGGAG
TGCATTTTCAAAAACGTCAGCAATTGTCTCATAATTGATGGAGGTGACGC
GGCATATTATAAATATTAGGGACTCAGTTAATATTTTTAATGAATACAAT
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AAACAAAACATTACACTACTTGAGTACTACTTGATACCAATGATATAGGA
AGTCAATCAAATTACTAGCTGCTGAAAGCCCTTTTGAAATGGGCGTCTTT
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CATATTAGGGTCAGATAAAGGGGCAGATTTATGATAGAGAGTAGAAGTAG
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ATTGTTCCCAATTTTCTTTCATAATATAGATAAATGCTTCCTTAGTCACC
CAATTAATTTGCCATATTAAATGACCAAAAAAGACTGTTATGACTACAAA
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TTTCGTTTATTTGATTGGAATCCATTCTTACACACACAGGAGCTTGAAAG
AAAAATAAATCGTTCGTCACTATATTTTTTTAATTTTCTTAAAATTAATT
TCCTTTTAANTTTAATTCATTTTCTATTTAATGTATTTTTAGTTGTCGGT
GGGTACTAGTACCATATTATATTATACTATACTAAGTGTTACTTTTATAC
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TAATTTCACTTTTTATTTTCTAAGAATCCCGTACATACAATATTAAATAT
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ATGACTTATGAGTAGTACCATTATGTTAATACATACTAATGTATTAAAAT
ATGAGGGTTTTTTTTTAGGTGTCTGTATTTATATTTCACTTTCGCTGAAG
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TTGACACGTATCTCACATTAGTTGCTCACTCAGGGAAAGTAAAGCTTTTA
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GTAAATATTAATATATTTATCTTTAGTACATAATACTATAGGAAGTTTTC
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AATTGCTCAAAAAAGAGGATTTCTTCAAATTTTACTTCAAAAATTTAATT
ACATAAAAAGAGCCGTTCTCCAAATATGTGTTCAAAACAATTATAATTGG
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TTTTGGATTGTTTTTTGTCTTAAAAAATCATTAAAAAAGTGTGTCAAAAT
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GGTGGTGTAAAAAAACAGAACAATCTTTGCTAAATGACGTATTCCCTGAA
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GGTATCAATGATTTAGAAGGATGATCATGGTGAATTGATTCCCTTAGTGT
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TAATTATAACATTCCTAAAGGATGTTTGTTTGTACGTTTGTTATATTTGA
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TCTCACAAACTTCATCTTATTACTCGTCAATCCTTTTTCCTACATGAATT
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TGCATGCTGAGAGATACAAAGTAGATTTGCGTATACCTATGTAAATAGGC
GTGTGTTTGAAAGGAGAAGGAAAGGAAGAACTTGCTCCAATTCGAAATCC
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TAAGTTTATTCATGGTTTTTTTGTACTCTATGTCTGTTTATATTTTTTAG
GGTGGTGTTGGTTAATACAAACGTGGTGTAAAATTCCAAAATATTGAGGG
ATTATGATAACAAGAAAATAAATGAGGCATTTCTCTTTTTTCATCGTTTT
TCTAGCAGATAAAAAAAAATCTTCACTTTCATCCAAGGATTGAAAGATGA
TGATTTTTTTTTAAATCTTATTCTTTTATGTTTTTTGATCAGCTTCACTC
TTCATAACTCTCGTACACTCGATTTTTTAGTAGATAATCATGTAACTTAC
AATCCCCAAAAAATCAGTAGTTCATAGTTGCAGTATTTGACAGCTGTCTG
TTAATCCTCGTTCTGCAACTGAACTTGTGGTAATATATTTTGTGAAGCAG
TTAACAATCATTTACTATTCCCAGGCCTATGACTACAGAATGTGCGGAGG
GCAGAGTAAATCCCCCCCCCCCTCTCTGGCAAATAGTTTTTGTCATTTTT
TTTTTTCGTAAAAAATGACAAAATGTATCAATCAATAAATGTGTATTTCC
TTGAAATATCCCTAACTTAACCAAAAGAGTGAACAAATGACGCGACTGGT
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GTAACACTTTATGTACAATTTATTCGGCAGCCAGAAGCAAAGTAAATATA
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TTAAAAAAAATATCCACCAAATCTCGTATTTATTAACAACTATAAATATT
AATTTTTATAAAAAAATATAACATAATGTAAAAATGTTTAATAAATAAAT
TTCAAGACTTGACTATTTACTGTCCTTGGCTATTGCTTGTTCATTTTATT
GGGTATCGTAAATAGTTTTTTTATCCATTCTCAATCATTACTGTCAAAAG
GGAATTGAAACATTTGAAAAAACATATGATACCTTCCCTTCTATATTTTT
CTTGTTACCAAATTTTCACTATTATTTAATAGTGTTGTAATTAATATTAG
TATAATTGAGTTGATAATTATATAAAATAAATATCAATGACTGACTATGA
AATGACAAGAAATCTAAGGAAGGCCCTTGAGTGATATCTATAAATTAATA
CAAAAATATAAATCCAATTAAATACTTTTTTTTAGTTCACAATACGCGTG
GCTCTTTGAGTTCTTCATATATTATCCTTGGTCAAAAGTAATCTATCAGG
GCATTACATAAGAATGTATGCAGTGCCCATATTTAATTATTGTTCCAAAT
ATTATGCTTCCATTTTAGTAAAATAAAGGATATGAAAATATCATGGGGTG
GAAATCTGTGCCAAGGTACGTTTCTTGAACAGATAATATGTATGAGACAA
TCTTTTAACCTATAACTTAATATTAAATCTTTTAAGATCACCATCAATGG
CACGTTGACTCACACTAATGAATATAACGGAAGTGACGTGTTTTTTTTTT
CTCTACAATTCTTTGTATATTTTATCTTCATTTTCTCATTTCATTGATAT
GATTTGAATAACATATTGATAAGAAAAAAGATAAATAGAAGGGGAAGACT
TTGGTTAGGGAGAATTATTCATTTTCATTGAGTTTATTTCCGTACTAACA
TTTTTTCATTAGCCTTTCCTTCCCTTCAAAAATAGAAATGAGTTTATGAC
GTACATAGATCATGCTTTAAAAAACCCTTTACTTATTAAAAGGGTATTTT
GTCAGGGTTTTTCTTTTCTTTTGAATCTCTTTTGGTATCAAAAGTATTCC
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ACTACACGAAATATACATAAATAATGACACTCTGACAAACAAAGACTATA
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TTTCCTATTTTACTAAAAAATTATTATATTTTTTTACCATACACGGTCAT
TTCTCACATACATTTAATATTTATTTGGTATTTTGTGGGCAACTGTCGAT
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GCTGTGAACAATTGACAAAAGTTATTATTAAATAATAATTCCAGTCATTT
GTTGGTGGCTAACTATCAAAGGATTTTGTGCATCTTTCTCCTATTTTGTT
ATTGTTGTGTTTTTTGTAGGAAAGGTTGTGAGATACAGTAAAGGTAGTCC
ACCTGGGTTGAGACTCCATCGTAGACTGATTTATTTTTCTCTTTGGTCTT
GAGCGATTATTTCTAGAGCTATTTAGACTGATTTTTTGCCCTCCCACTCA
GTGGACAAAATATCTCCCCATCCCAGTTATAGGGGTTGCATACATATAAA
ACACTTCAAAATTCATATGGAGGCATTGTGTTGATGTTCACCATTTGTAG
ACCCACATAAGGTCATGAACAAATCCCCTATCATAATTTAGAATAAGTAG
ATTTCAACAAATATTATTACGTTCTCGGAATTATCTAGTATTTCCTAACT
TATACCTAGCACCAGTAATTAAAATGCTTTACTACATAGTACCTTTGGTA
GGAATGGGTTTTTCATTAACAAAAGTGGATTGTGACATAGAAGGATAGGC
GCTGCAACTATATAAAATGGATGTTGATTACTCAATTTCAACTCAAATTT
AAATACAAAAACAAAATGAAATTATATAATTACAACCCTCGTTTTCAAAA
TAACATTATTTTTTTATTTAAACACACATCATAATATTATATACTAGTAT
AGTAATTAGCTTATTTAAAAGTATGTAAAGATATAAAATGTATTTATATC
TTAACAAATATATAATATTATTTGAAGGCTATAATATTCTCCCCCCCCCC
CCCTCTTTCCTTCTGAGTGTAATAGTAATATCAAATCAATTAACTCACTC
ACTTCAAATTTGACACGAAGATTAAGCGTCAGGTGTTTATGATGATTGTC
TGTTTATTATACTCGTATGGATGGATAGAATGATGGTTCTTAGTAATGCA
TGTAAAATGAAAGTTTATGTCCCTGTTTGCCTATGTAGCCTTCCATGTGA
CAAATGTATGTAGATATGTTGTAAGTCAACACAAAAGCAAGCTGGAATGA
ATTTTCTTAAAATGGTATTACAATTTAGTGGTGTCCGCAGGGGCTGGGCT
AGAGGGGTTGTAGCCCCCCTCACATTAAGAAATTTTGGTTTTTTACTAGA
AAATGAAATATTTAAAATTTGTATTCCAAAAATGTAATTCCTTGTGAAGA
CCTGTAGATTTTTTAAAAACAAATACTTAAATTTCAAAGTATTTATTAAC
GGTTTCCGTATTTTAAAAATTAGCTTCCCTGGGATTGAGAACCCCTAATA
TGTACATACATTATAAATATGTGAATATAATCTTATACATAGAGTCGTGC
TGCAGAGATTAATATGTAATATGAAGCAGATATCGGTTATTGATATTCAA
ATTGGTCGGTTGAAGAGATATGTACAATGTGAGTATGAGGGGTGGAATTA
CTATGTAAGACCCTTAGGATACAATAATAAGGGCTTTTTGTATTTAGCCA
TCTACAAAAACTCACACCTAACGATGCGACAGTGATGCTTTTGTTCTTTA
AAAAAAAATTTTGTAAAGGGTGGAAAAATCATTTCCACCATACAATGAGT
ACTTTATTCAAATTAACAAATGGAAGAGTATATTTAAAGAGGTCTTAACC
TACAATTGTTCCACCCGCCCCAAGTGACGTCATTTGTGACAAGTGGATGG
MGAAATAAATACTTAAGTTTCTTTCTACATACTAAGGTATACATAAATAC
TCTACTATTCAATAGATTAGAGTCAAGAGAAGGGTGTTCAAATGCTTTAA
TATTACACAGAGGTTGTATTTCCACAATATATTTGTACCGGAACCGGTAC
AAAGATAAGTATCGGTCTTTAAGTAAGTACTTTTTATACTTTTTTGGTTA
TAAATATCCTACAAAAATCTTTTACAGAACAATTTATATGCACTTACGAC
ATCTGTATAATTTTTCATTAAGGTGGGATCTCAATTTTGAAATTGGGCTT
GTATTTGGTAAATTTAGGAGCTTGGTATTGACAGAGGGGAGTTTCAAATA
CCGGTTCAAATACTATTTTAGTATAGTACCATTTTAATGCGCTTGTACAC
TGACATATAACTTTTACCCGTATTAATACTTTTAAAGAGCTTAAAACGTA
CTATTGCCAAGTGACGTCATTTGTCACAAGTAGATAAGGAAATGAAAACT
TAATTTATCTCTATAAAGCGTTGTCAATAGCATCCCAAATTGCATCACAT
TTGAAGACAACGCCATCTTCGGGGTTCATAGTTGATATTTTTACTACTTG
AAATGGATTAATTTACAATCAATATTGATGAAACTTTGCCAAATGGCTTT
GACAACAGAAAAAAACTTAAGAACTTTTCTCAATACTCCTTCATTTCAAA
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CGGACCCCCCTGTCATCTGCAAAGATTTTAAGAGACCCAGAATTGTGGAA
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ACCAAACATTCTTCAATTTGTAAAAGTTACCATGTTATTTTTCGATTTCT
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TATGATCAGCTGAATATATATAAGTATACATATCTATTTAGCATTCAGGC
CATGTTAAATAAATATATAAGTATACAGATCTATTTAACATAGTCTGAAT
GCTTATCATTCTAAGCATACTTCAACATATATATGTTTAACATATAATAG
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GATTTGCTTGAAACTGCAGCTCAAAGTTTGAACTAAGCTCCTCATAAGTC
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