EMLSAT00000001764, EMLSAT00000001764-697611 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000001764
Unique NameEMLSAT00000001764-697611
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s12supercontigLSalAtl2s12:1925067..1946656 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000001764 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000001764EMLSAG00000001764-684530Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000007816EMLSAE00000007816-716744Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000007817EMLSAE00000007817-716745Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780902auto780902Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000001764EMLSAP00000001764Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000001764

>EMLSAP00000001764 ID=EMLSAP00000001764|Name=EMLSAP00000001764|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=93bp
MLVLRYPSTEIISNENLLSLPKGSLYESIVGIQFWIRKDYFLAGKLKVQC
VARISDIYLEKSKVLIIGEYSEGPDKALSTTSFATEMNILKKN
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mRNA from alignment at LSalAtl2s12:1925067..1946656-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000001764-697611 ID=EMLSAT00000001764-697611|Name=EMLSAT00000001764|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=21590bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s12:1925067..1946656- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGCTGGTACTMCGCTATCCGTCAACAGAGATTATATCAAATGAAAACCT ATTGTCTCTTCCTAAGGGATCTCTCTATGAATCTATTGTGGGAATACAGT TTTGGATACGGAAAGATTATTTCCTGGCTGGAAAATTAAAGGTCCAATGC GTAGCTAGGATATCAGATATATATCTAGAGAAATCCAAAGTATTGATCAT TGGAGAATACTCCGAGGGTCCAGATAAGGCACTCTCTACGACATCTTTCG CTACTGGTAAGTATGCTAAGAAAATGACACGACGGAAAATTTGACGAATG CATTTCTATTTCATGCTCTGATTATTCGAAATAGATCATTGAAAATAAAT TAGGGCAGGTTTTCAGGAAACATTATATAGAGGAGGTAGTGAAGATGTTT CTCTACAGTAATATCATGAAGACTCAGATCCCTGTAGACTGGATTTGAGA AGAATCACCTACAAATTGGCTTGTAATATTTATGAGCCAATCATTGCTAA ATGCGAGTTCCCATGCTTTGAGTCCATATGATAAAAATGTAGTACTTAAA TCTGGAATTATAATTTATTTTTTTTATATGGACTCAGATCTCATTGTGAT TCGAAACCAAATGGACTTGGACGAAGCAATCCAAACAACATTCTTATAAA AATGACGTCATCAAGTTATGATAATTTAATCATAATCTCGCAATTTTTCA TTGACATTCCCTTTCAAAAGCTGAGAAGGGGAGTAATTGCTCATTCACGC CTTTCTTTTGATGTCAAATGAGTCGGACTCGAATATAGCTCTGTCATATT GTTTAAAATCAAAATTTACCTTCAGTCAAGATGGTGTTATATCATTAATT TTTACCTCATATTTCCAAAACAATATCTTCCAACTTAGTACGTAAAATAA TGTCAGACCTGTAATAAAAAACTCGAGTCATTTTTTATGGGCTAATGCTT 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