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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s12 | supercontig | LSalAtl2s12:909316..1005829 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001770 >EMLSAP00000001770 ID=EMLSAP00000001770|Name=EMLSAP00000001770|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=648bp
MRTTDLPQAFHNFSSSVSLLENVNVSTVPYTPLQATLIGLAGGLLSLLTT VGNVMVMISFKMDKQLQTISNYFLFSLAIADVIIGMISMPLFTVFIIQKE WTLGANICDAWLSVDYLASNASVMNLIVISFDRYFSVTRPLTYRARRTTR KAALMIFSAWAIXAVVWPPSILAWPYIEGKRTIPPNDCYIQYIYSNEFMS IVTVMIAFFIPVSIMIGLYVRVWWETVKRQRELVHLQAGKKSHSKKSDSS EEVGTGTEHSVKGIWKTSQPTAGSSRSRESHQEITYVPTSALRRSTSFTN QPTKISLRTTTYKGNAGFLLGNSCLDPDRHGGNPGGVDDPSSEGYATPRS NETPLPTTSKCPSLNYIRDPYANVNRYSRGEANRPKSLITTTSVNKDSNT XGSSXSPVGTTASGGGDNNNIYTILIRFPPKEVSEKRASLRKSDPSLEDK VVSASIQMLCDKSSSDFYPRSLPISRKTTGSRSPPPPKRGVSATTSDITK LPLDSGWVGRQMIKRSQSGGSSYSPHNTLQRLTGGGKKNPGKVKKTNEKK QXRKAAKTLSAILLAFIVTWTPYSVLTVLNAVLGKETADVYIPPTLWDFA YYLCYINSTVNPVLYALCNAAFRRTYVRILTCRWRARFRQPFNRYYYG back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s12:909316..1005829+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001770-697617 ID=EMLSAT00000001770-697617|Name=EMLSAT00000001770|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=96514bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s12:909316..1005829+ (Lepeophtheirus salmonis) TGTAATCAACCAATCAAATAAATGAGAGTGCGAGAACCATTATACAAAAA
AATAAAAAAATTAAGGTAGACGAACTTACTTTTAACATGTAGTATGTAAC
TCCATACACAAATAAAACATTAAATATGTAGTGACAAATAGGCTAAAGAT
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AGTATCACATGCTATATATCACCAAAGCTTTTTAAGTGGTTGGATATCAT
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ATCCCCTTTTCGTTAAAGTAAAGTGTTCCTTCTTTTTAGCTTTTTTTTTT
CTTCCAACGCCTTGCTTGACAGGGACAAAAGTCTTTTTGGGACTATACTC
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TATCCAATAAGGTAATAAAAGTCTTGGTATGTATTTTGAATAAATTATGT
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CAGTATCATCATTACGATTTTATAGCAATTGKCTCTCTYAAGCCGATAAT
ATCCCATCTTCAGTTTTTCAAGAACTGTTTTACAGCATTTTAAAGTTGTA
GACTCTTACCCAAGGAGTTATTAGTATATAATGTGTCGTTGTGTCTAAAT
GACCAAGAGATTTTTTTTTTTCAACTATCCTTACAGATATAAATATCGCT
TCATGCCCAAGGAATTCTTGAAATAAGCTTTTTTGATAAAATATCGTTAC
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CTCTTTGCTGATGTTGATGTTATTTTTATATATAAAAAAGTTACTGCTAT
CTATATGACTTTTCAATATTACTTGCTTGCTTTGCGTTCAAATACTTTCA
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TTATTTTTCTTAAATTTGTGTAGTACGTAATATTTTACATCTGATATAAC
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GACACGCATATGAAAAAGTAAAGGGTTGAGTCACTTATTTATCTAAGTGT
TAATAATATTTTAATACATGACAAGAATTTGAAAGGAGCATTAAAGCTGA
CTTACTATCTCCTAAAATCGACTTGCTTTAAATTTGTTTGCACGTAGGTT
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TTTTATGCACAACATTTTTTTTCTCAATATAAGAATAATGAAAATTCATG
GTCTTTATATTGACCTTTGTTGTCTAATCAGGGGTATGCAATATTTGTTC
AAAAATGGAAAAAAAACTAAAACTACGTATAAAAGTTGTCAAAAACGCTT
ATGGTAAAATACAATTCACATTCTGCTGACAAATTGTGTGGGATCGGTCC
TAGGACTACAGTCCTGGTTTGTCTTTTCTTCCCTTTCAGTCTTTTTATCT
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TGAGAAAAGGCAACGAATGACGACTCTCATTTCGTGCAGGAATGAAATAC
GTTGACTCATGAAGAAAGGCTTTCTTGTCTTTTTACAAACAATCCCGATG
ATGATCCTTAGAAATAGATGAAATATAATGAATTTGAATTCTTCCTTGAT
CTTCGAAAAAGGGTTTATTTATAAATTTTCTGACACATAATAATGATAAC
CACGCACGTCTCAATGCACTCAATCAAATATTATAATAAAAAAACATCAA
TTGATGATAATTTTCTTTAGGCCTGATTTCGTAACAAATAAAAAAAAGTA
AGCACGTCCCTGTTCTCTTTTCTGATGCCCATGTGCTGTAACACACCTCC
TATTTTAAAATTTAGGCATCTCGTCTCTTTGAAAGAGGTTATAATAAAAC
TGTGACAATTCGAATAAAGTAGTTACTATAAATAACCAACAAGGATCGGC
CCTTGGACTAACAAAATTAATCGGGAATGGACTGAGTAGACTGCAGTTTT
TAAGTTTTTTTGAACGATCCAACATACAGACAAATAATTATTTGGGAAGT
AGGCTATAGAAATTTGGGTATTTATTGTATGAAAATTGTAGCTTACGAAT
AATATGAAATCCTTAAATGCTATTTGTATTTTTAAAGAAAAATAAATATT
AATAAACCTTTTAATATCCAACGCCACCTAAAATATATTCAACGTTTAAA
AGATGGTTTATTCATATATAATTCAACAATACACATATTAATAGCACATA
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TGTGTAAACATGCTAGTACAGTGAAACTCGATACTAGGATATATATCTCA
TTACATGTTAACGAAAATGTATCTGCAGTTACATAAAATCAAAGTATTAT
TGAAAATGATACTTTAGAATATAGAATTTCCATTATGGAGGTTACAAAGA
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TAATCATATTTAATAGTTTTCAAAATATATATATATATATATATGTTAAA
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TTTTACCTATTAAAGAAATGTATATGGATTTTTAAGATAATTTTTTTAGT
ATTTTTCTTTATAAAAAGAGATTCTTTTTTTATGTTATTTGATACTATAA
GTAAGTGAACATCCATCAACTACTGTGGCGCGGAGTGGTTTAAAAAACAC
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ATAATAATTTATGAGATACTAAAAAATTATTTATATTTAACAGGATGTAA
TCTGATTATGTTTGGGCTGTTGTAGTATGTTTTTTTCTTCTCTATGAACC
TTCATATGTTATAATTTATCATTTCTAAATACACATTTTTGGAGAGAGAG
AAGATTGAAAGCATGGCGATGTTGTTATGTGTGCATAATATTGGATCTTG
TTTTGATACTAACACGTTATTTTTAATACTAATAAAGCTATCCTTAATAA
GTATTATTTGAAGAAATATTTAGTTATATAGGCAATGTCAATTTTAACGT
ACATAGATTCTCACTCTTAGGCTTTGCATTGTATAGAATTTTACATATTG
TCATATATATTTCCAGTGAGAATAAATTTCTGAAACAGGCCATAAAAATT
GATTTTGTTTAAAAAAAGTAAAGTTTCACAATGAAATATTAGCATAATTT
ATTAAAAAAGATCACTTGTAAGGAGAAAAAAAACTTGTTTTTAATTTTCT
GATAAAAACAAATCTTCTTCTTTTTTTTTCAAAATTATGACAAATTTTTA
CCAGAAGACGATTTTTTCTTATTCATATAATTATAACAAATTCTTCAAAA
ATTTGGGTGAGAAATGCTTTCTTTACCCTTATTGATCTGGTGCAACTGAC
CTTTTTATCTACTTACGCTTAAACTAGCCTTGTATAAGTCCCTATATTGC
AAGTACAAGTAGTCTCATGTCCTTTTTCAAATTAAGTGCAAATTACGAAA
TATAATATCAGTTACTATTTAAGGTTATAGAAAGAATTGCATATGTGGCT
GYTCAACATTAAAACAAGCTCAAATGTGTTTTTCTCAAAATAAAGTATGG
ATTACATTCTTTTTCTTTGAGAAATAATAGCCAATGTTTATTAAGAAACG
ATTTATACTACTCTTTCAGTAGTCAAAATTATTCATTTACAAATCTACAC
GGATTAAATAATTGCGTTTCCGTTTGCACATAAGTGAAGAAGAGTAACAC
TCATAATTTGCAGGGAGTTTTAAATGTAAATCATGGTTGCACTCAGAGTG
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ATCCAACCTTTTCTCTCAAACATTATTTAAGATATATGGTTCAATAAGTC
ATTTTTCTGTCTTTTTTTTTTCTTACTAAAAGTGTTAAAATCTACAATCT
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TTTTATTTAAAAAATATATATAAATACACTAAAATAGATAAACGGTCGTA
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ACAATATGAATTCAAAACTAACATATGTCTGCAAAAATAAGGCTTCTGCT
ATAATTTATCATTTTGATAAATCATAAAATATCATTTCAATAAACTCATT
ATAGACTACTTTAGCTGTAGAATTTCTCTTCTTGGCTTTCGCTTTCCGAT
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TTAAACCCTTATTTTTAAAGTAAATTTTTGTTGACTCTTGTTATCAGGGG
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ATTAAAATTAGAATAATGAACTTCAGTAAGATATAATTTATTAATTAACA
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GTTGTTAAAAATGAGTCTTACCCTCATAGTTTATAGTTAAAAATGTCGTT
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TGTTAATCAATTAATAAGCTGCTTTGTACATGNNNNNNNNNNNNNNNGAA
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CACCCTTACGACAACCAAATGATTATAGTGAGCAAATATGCACACAATTT
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TTTAAATTTAAAAAATTTAAAAAAATGAACGTTGTGCCGACATATATATT
TTTCTCAGGCCATGCACCTTGCAATGACTGGGTTGCCTTGAATATTTATT
TGTTGTTTAACATCCTTTGCTCCNTTTTTGTAGCTCAACCTCCCTCATAA
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TACCATAGACCTTTCCTCAAACAAAATCTGAACCTCCTTCCACGAAAAAA
TAATGAAACTTTTTGATGAATTATCAACCCATATGTTCATATTGTTTCGT
CTTTTATATAAATAATTTTTATTTCTATATTAACTTATTCTGCTGACAAG
CAACCTTGATTCCAATGTAGGCACATTAGAGAGTAGTGAACTTTTGCTGA
AAGCTACACTCATCAGGTATGATTCCTTTTACTCATTTAAGGTTGTATAT
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AAATTAATGTTATAGTTTAAACAAAGTTTTAGAGGAGAACAGGTCAGCTG
TTATGATGTTTTATTATATTAGCTGTAAGCAGCTTTAAGAGGGTAGGGAA
GGAAAGTAATTTAAAATCCCATTCCTTATTAAGTAGATTCATGGAACATA
ACTACTCCGATGGGAATCCTCAATTCTATTCCCAGTCCTACTCCACAACA
TTAACTCATCAATGTTCCTCTGAATCATTTACCGGCACCTGATAAACTTC
GATGTTCCCTCCCCATTAATATTTTCTGCCTTTCATGAGCAAACTCGTTC
GTAGTCGCTTTATAGTTAGATTTTTTTCTCATCAAGAATTAAAAAATAAT
TATAAAAGGTTCCCCTATGTAATTAATTAAATGAAAAGTTGAATACATAT
TAATCCGATTCATGTTGTACATATGATGATAGAACATACACTGTAGACTC
ACAATAACGAATGCCTAAATGAGAAACTTATACTAAACCTACATTGAATA
TTTATTTTTTGCATTTAGGAGACATGTATAAATTTTGAATTTTTCATGAA
TGAAGACCACACTTTCACATTTTTGAGCCATTTGTTTTTCTTTTCATTGT
TGACTAATATTAAAATTTAAAAGCAAGTAAAATATTATTCTTTAAATGGT
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TGCCTATAAATTCAATTGTCTGTAAATTTCCTAGGTAAGGATTTCTCAAC
AGTTATTTAAGTGTTAGCCAATTTTAGTTGAAGAGATCATCTCGRTAGCC
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AAGATAAAAGTAATTAACTGTTGAATATTTTTAGTTAAACATTTCATAAC
TCTAATGATCGTAATATGTTCTTGAATTCGGAGTTATCTTTTTAAAAATT
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CTGTTCCTAAATAAGTATAGATATGAGATCAAACCAGGGAAAACTGAAAT
CGGTCGTTTGATCAATTTTACAAGTGAAGAATTTGGCGTGGAGATAATGT
TTGTGATTATAAAGGTGTGTGATGAAACTGATAGAAACAATTGGTAGCAA
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CAAAATTTTGTCTAACTATATCAACATCAAATGCATTTATTTCTATTGGA
CAATTGAAAATAAACCATAAAATTCCGCGGCTGTATAAAATTCACACGCA
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ACAATAATCCATTTAAGCCAAATATTCCCTCTTCTGTTTGATAACTTGTT
GCTAACCAAAATCCAACTTCATGATGCCCTTTTTGTAGAAGGTCTTGTCC
CCATTGGCAAACAAATGGACAATCAATTTTCACAGGCCTATACTGAGGCT
TAATTTGTACCCTCAAACAGGAACAGATGGTAGTCACTTGATGTCAAGTT
CGAACTGTCGAGTGGATGTAAAGAGAACTTCCCATCTAAGCTCCTGAGCT
CCTGTCGAGTTATCAAAGATGTGTGCAGCCTGGTATTGTCTTGATGAAGT
CTAGTTGTCTCCAATTCACTAATGCTGGCCACTTCTGCTCGATTGCCAGC
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TTACTTTTTCCCCACCATAACATGTCGGGATTATTTAATATTGAACACAA
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TAATGCTTACACCAAATATAATTTAAACTTATTATAAATATTATTATTTT
GTAGGTACATACATTATCTCTTATAAAGATAAATCCTAAATAATAAAAAA
TAAACTAATACATTAGTTTATTGATCTGTATTTATGCAAAATCTACTTAC
TAAAACAAATATAAATAACATCCTTTCCTATTTCATAACGTTCATTAAGA
AATATTTGATCTTTATTTAAATTTTATCAAAGTATCTTGTACAATACTAT
TCACTAACATATTTTGTCAATGAATAAATGAGTATTTACCACTCAAAATA
CATATAATATGTGTTCTGCAATATATAGTTATTTCAGAAAAAATAAAGAG
AAAAACATCAATCAATAATTGACAGATAATATATACATATATGTGAATCG
TCACACAAAAGCCAGCAAATATGATTTTTCTTAAAATTTAGTGTGAATTA
TATTTCATGGGGTGAGAGTCAAATTGTTTTTACTCAAATATTTACCTTGC
AGACTTAGGATTGGAAAGTCCATTCTTCCATTATGCATAATGGTATTTTA
CAATGAAATGGATTTTAAAAATCCATTTCCAAAGTTTGAGTTTCTCAGTT
TTTAAGTATTCGCATTTACCGGGTATGTTTGCTCTGTAGGGCATTAAGCA
TTAACAGAGTCAGGAGAGTCTTTTCTAGAAAGTCATGGAGATATTGGATA
AAAAAACGTCTGGATCAGTTACATATTTCCTCCGACCACCCTATTATGAA
TAATGCAGGAATCATTTTCCAACATCCCTTCACAAACTCGAAACAAAAGT
GGTTTCGCTATAAATTAGCTACAAGGCCCTTATTTACAAATAATAAGAAA
TCAAACTTCCTTGAGAAATATTGTACCTTTTATAATATGGAAGTAGAGTC
CTCTCGCCATCTATTCTATACTTGTCTTATTGGGGCCCCCTCCGTAAGGC
AGCAGAAGGATTGTGACGAAGAACTTTTGGATTGATGATCTTTGGAGAGC
GACTGGCTCATAATGATGATCCAGGCAGTGAAAGAAAATATGAAGTTGGA
GTGCATCATAACAGACTTCCTCGTTTATAATTTTTGAGCATAATCAAAGG
AGTAGTAGCTGTCCCACAGCACTCTTCATAAAGGCAATTAGAAAATCACA
CCCCATTCGGAATTTTTTGGTCCAATCTTTTTTATCATTTGAAGGATCTA
AGGTAAATAATTTTTATTTTTTCACTAACAGCTAGGATTGAAGAATATAA
GAACTAATAAAATAATGAATTATAGATATAAAGTATAACAATACGTTCCA
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ATGATGAAATTTCAGCTACTGAAATGAAGTAGTTAGTATTTCAGATGTTG
TAGTTTCTGCAAAAGACCAATAATGACCGGTACTTAGACCGACAAATTTT
ATTAGGATTGCAGTCTTTTTTACTTTTTTTAGACCGATCCAACACTAATT
CTGAGCTTTCTTTGATGTACATCGGTTGTTTATTTACCTAAGTAATCTTA
TACTATTTATGGTACACACATGCGCTAGCTTTGTTGTAACTTACCTGTTG
TTTCTTTCATATTTATTTTTAATATTCTTTTTATATTTCACATAGGAGTC
TTTGAAGTTTAAAATGTAATGATGAATTATACTATTGTGTTATTTTTACT
CTTTTAACTTAATTAGAAATGTTCTATTCCTACTTAATAATTGTTTTGTA
TCGAGTTAAAGTTGTATCTAAATAAATATAATTTATAAAATTAAAAAAAA
AGTATCAAGATTGAATATTAAAATTCTAGTATGACATATATTCAATAACA
TTTATATTTGTAGTTTTTGAGTTACAACAATTTTGCTCTCAATCCTCAAT
TTGTATTCTTCGCTAAATTATTGTTAATTTTTGTCAAGAAATATACTTGT
TAATCCTTTAAAGGCGCCCCAATTTGTATTTAAAGAAGTGGATATTCATT
CTTTCAATAAAAAAATAACAAATGGATATACTTTATTTTTAAAGAGACCA
TATTGTGTACAAATATCATTATTCAAATAAAAGTTATATGCTATAACTAA
TTTTTTTGGTATCCCAACTTATACCACAATCTTTTAAATATACACAAACT
AGATTTAATTAGTAAAAATTATAAAAAACATATTTGTGCGTACTACGTAA
TACCAAAAGAATATATTTATTTACTTGTGAAATATTTATGACTATATCGT
TCATAATGGGAGTTAAAGTAAAGCAATTAACCCTTAAATACATTAAATTT
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AAATGGTACTAACGTCATACTAAATATCTAATTACACGTACCAAACAAGG
TTATATCAAATATAAAAAAATGGAAGTTTCACACCTTTCTGTTGAATAAT
TTATACATTTGCGGGTTTTCTTATATTGCAGATGCGCAACAAAAATCAAT
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TCAGTTGTGTAAAAAAAATACATAAACATACTTCAAAATTACATATAATT
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TCGTATATTTGACTAAAAAGAGCAAGTAAGAAGAATTAGTAAATTAGATA
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ATGCAATATGTTTTGCACACTTTTTTCCGATATCTCCACAGCCTCAGCTA
TCTCACTCGCCGATTGTCCAACACAATATCCTTCCCTTTTGTATGATTTA
CTTTGTGGTTGCAGTTTTTGATCATGTTTGAGAGATATGCGAGCACGTTT
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CGTAAAATTTTGTCGACTCCAAATAAATTTCCATATTCATTAATACATTC
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CATAATTTGATTGCAGTAGTATCTCTGTGTCAGGTTGAAAACCTTTACCT
ATAAGTACATGTATTGTGTTCATTAAACTGTCCCATTTTTAGGTTAACAA
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TAATATTTTGACAAATTCTTCAGATCATTGAACACGCCTTAGACCTCTTA
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