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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1420 | supercontig | LSalAtl2s1420:21426..31801 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000002221 >EMLSAP00000002221 ID=EMLSAP00000002221|Name=EMLSAP00000002221|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1559bp
MEQLNQDEEANSTTMYLNGFCSDRDPFWDPDYAWNTNDPNFTSCFRKTIL VWIPCLFFWAFLPFHIYKLYHSKARKVPLKTLGRVKALSCFILILIAFVD LGYWGSKEFYPKDLINPIIRAITFLAVFILLFVERARGYRISPLLTSFFL IYFATNTIDLYGHIRWVMMSGTTXLADITFFLHFFCIIVSFLCHFFVEPR PLYEDTAVNDIKSNNPCPLITSSFPSQISFSWLDSLLWTGFKRNLSFDDL WDLVPSLSSRTVVPIFLQRLDSALRRVKTNENGITYAKGDDNVEVKTKHE KKPQLSILPALARTFGPSILSAAVIKIVSDSLNFVPPLILKRIIKFSTNQ EELWKGILYAVILFASSTVGSLVLSKFFYKMYVVGMKIKTSLISTIYRKA LRVPTSTKKNISTGEIVNLMSVDAQKIVDLMPYINTVWSAPFQITIAIYL LWQTLGPSVLAGVLVMILLIPFNGFIASRTKTLQTNQMKEKDERIKLLNE VVQGIKIVKLYAWEQSFLDIISNVRSKEVKILTHIGYLQAGNSFIWTCAP FLVSLVTFATFILSSPENVLDSEKAFVCLTLFNILRFPLSMLPMIIGSMV LAGVSIKRINKFMNSEEIDEEAVEKKTAYPDDKFAINLEKACLKWESDED KNILSDVSLDIEVGSLVAVVGTVGSGKSSLLSAILGEMDKVSGLITVRGS IAYGAQQAWVLNTSLKNNILFNKSYDGDKYTRIVEACALKSDLDMLPGGD ETEIGEKGINLSGGQKQRVSLARAVYSGSDIYLLDDPLSAVDSHVGKHIY DNVISSSSGILKDKTRVMVTHGVTYLPFTDKIIVMKDGRVSEIGTYKELL RQKGAFAEFIVQFLSEANENEVNENIKHDIEESFGKNELLEQITKAKQIV RERSVSLNSGDLVTSLVKNNPTNSASGSTTSLKENSGDESTDNDTKQTRP TTSQTQQYQDEKVETGSVKWNIYMHYVKNMSIILVVACSSCFVIYQALNT LSNVLLAWWSDAVMKIEVRTGLNDNRTLDEINQDIMDXQVYYLSIYGGYC LGQGIVVVMGFVFMYLACMEAAQRLHNQMLESILKSPMSFFDTTPQGRIL NRLGKDLDVLDSVMPMVLRGWISCFLGVLSSLIVVMVTTPVFIIPASLII ICYFFIQRIYVATSRQLKRLESSSRSPIXSFFSETVSGAATIRAYGQSST FISESESKVDDNQKANFPATVSNRWLAVRLEVVGNLIVFTAALLAVLGRD SLSPGLVGLSVSYALAVTASLNWLVRMASEVETNIVAVERIQEYTKAEKE APWIIEDTKPDEDWPRKGEISFKNYSTRYREGLDYVLKNVSLDIEGGEKI GIVGRTGAGKSSFTLSMFRIIEPVTGNIIIDGVDITKLGLHQLRSRITII PQDPVLFSGSLRRNLDPLDEYNETNIMEAISHSHLKPFIDSLKDGLEYHV SEGGENLSLGQRQLICLARALLRRTRVLILDEATAAVDLETDNLIQKTIR SEFKDSTVITIAHRLNTIMDYSKILVLKNGERVEYGTVAELLADKKSQFY SMCSDAGLV back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1420:21426..31801+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000002221-698068 ID=EMLSAT00000002221-698068|Name=EMLSAT00000002221|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=10376bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1420:21426..31801+ (Lepeophtheirus salmonis) AAAGTCAATTATAAAATCGTAGCGTTGTTTTTTTTTTGCACTAAGCGTAG
AACGATGGTCGATCTTAATAAATAAGAAGCAAGCACTAGGTTGCATGAAG
GAGCAGTGTAAAAAGGCTATTGGCAATTTTCTTCTCATTAAGTTTGTAGC
AGTGATGCCTGTGTGAGTCTGTGTGTGACATGTGTGGATTTCTGTTCAGC
TGTGAACCCGCCTTTCGGTATTTACTATTTAATATTTTTTTGCAAGCTTT
GCCATGCCCATTAGCATCATCCATGACTAGCGATCCATCAGTCAAGGAGA
GATTTTTATGGATTTCCATTGTATATATTTAATATTCTTCTCACTCCTTT
TTGAATCCCGCATCCCACGATTTTTCTATTGATTTAGGAATGAAAAGAAG
TTTCGGTATTTAGTCCGAACGCATGTCATTATGGCCCTTAAACCCCTCTG
TTTTGTTTCATAATTACAATCGGGTTAATCTAAATTTGATATCTGACATT
TACCTGTGACTCAGGTATAACATTGAATCTTAAAAGTAGGCAAGGGAATC
ATCCCAAGGCAATTCAACTCTATTCGGGAATGGCACACACCTTACTTCCA
TGTATACTCCTTCATATGTTGACATTCCATACTTGTAATATATGTTTATA
TACATTTTCATGCTAAAAACTTTGTTTTCCTTCCTCTAACAAAAGGCATA
TTCTCTATTCAGTTTGATAGGATATGTAATTCTGAGTTGAAGGACTAGCC
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TATCTACTCATATATATATATACATGTAAATGCTTCTCGGATTAGCTCTA
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CTTATCAGTCACTCAGCAACTCTATTTCCTTTAGAGGATAATGATCATAT
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TAAATAATAATATCTTGAACTGAATGTAGTAACTACCTTTCTTTCTTCAT
TTTTATTGTATATTAAGATTGACCCGCTGTATTCGAGAATTTCAATATTT
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ATATTTTCAAATAAAGAGATTTATTAACAAAAGAGCTCTTATCATTTAGT
ATATAAATTGCTAATTCATACGTTCCTGTAACATAGATACTATTGGTTTT
GTCTCTTTAAAAAAAATCAATAAGGGATAACTTAAATTAATTGGGAGTAT
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GGAATATTACAATTTAAAATACAAAGTAAAGACAATTCGAAAAATTAATC
TTTTCGTTGTATCATTCAAATTATTTAAAGGGACTATTTTTCTTTGAAAA
AAAAAAGTATGTTATTTAAAATACATTTAATGATAAATAGTAATCAACTC
TCGAGCATTCTATAAATGATAATTTCTTATCTGTATTTTACAGCAACTAT
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CGAAGAAGCTAACAGTACTACTATGTATCTCAATGGGTTTTGTTCTGATA
GGGATCCTTTCTGGGATCCAGACTATGCTTGGAATACAAATGATCCTAAT
TTTACGAGTTGTTTTCGTAAGACCATACTAGTGTGGATTCCGTGTCTATT
TTTCTGGGCTTTTTTGCCCTTTCATATTTATAAGTTATATCATTCCAAAG
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TTTATTCTCATTCTCATCGCTTTTGTTGACTTAGGATACTGGGGATCCAA
AGAGGTAAGTTCAAACTTTTTATATAAATGAAGTACCTATTATGTATAAT
TGAAATCGTTTTATGGTATTTTCTTTTTAGTTCTATCCAAAAGACTTAAT
AAATCCAATTATTAGAGCAATTACATTTTTGGCTGTATTCATTCTATTAT
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TTTTTAATATATTTTGCTACTAATACAATAGACTTGTATGGTCATATTCG
ATGGGTCATGATGTCGGGKACAACGKCTCTGGCAGACATCACCTTTTTCC
TACACTTCTTCTGTATTATTGTCAGTTTTCTATGTCATTTTTTCGTGGAA
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GGTTAGACAGCCTTCTTTGGACTGGATTTAAAAGAAATTTGTCTTTTGAT
GATCTTTGGGATCTCGTCCCCTCTTTGTCATCCCGCACTGTAGTTCCTAT
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ATGGAATTACATATGCCAAAGGCGATGACAATGTTGAAGTTAAAACTAAG
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TAACAAATTGATCTAAATTTTTTATTATGAAAATTTTTTCATTAATTTTT
TTTTTAGCTAAGTATTCTCCCTGCTCTAGCTCGAACATTTGGACCATCGA
TATTATCTGCAGCTGTCATTAAAATTGTTAGTGACTCTTTAAATTTTGTA
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TGTGCCAACTTCTACGAAAAAAAATATATCTACAGGAGAAATAGTTAACT
TGATGAGTGTGGATGCACAAAAAATAGTGGATCTCATGCCTTATATCAAC
ACGGTTTGGTCGGCTCCTTTTCAGATTACAATCGCTATATATTTGTTGTG
GCAAACGTTGGGCCCAAGTGTGCTAGCTGGTGTTTTGGTTATGATACTTT
TAATTCCCTTTAATGGATTCATAGCTTCAAGAACTAAAACTTTACAAACG
AATCAAATGAAGGAAAAAGATGAAAGAATTAAATTGTTGAATGAGGTCGT
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AGTTTTCTTGACATTATTTCAAATGTTCGTTCAAAAGAAGTCAAGATTCT
TACACACATAGGATACTTGCAAGCTGGAAATTCATTCATATGGACATGTG
CTCCTTTCCTTGTATCACTGGTTACCTTTGCTACTTTCATTCTCAGTAGT
CCAGAAAATGTTCTGGATTCCGAGAAAGCATTTGTTTGTCTCACTTTATT
TAATATCTTAAGATTTCCTCTCTCCATGTTACCCATGATAATTGGAAGTA
TGGTTTTGGCCGGAGTCTCTATCAAACGCATCAACAAATTTATGAATTCT
GAAGAAATAGATGAAGAAGCCGTCGAGAAAAAGACTGCTTATCCAGATGA
CAAGTTTGCTATAAATCTAGAAAAGGCCTGTCTCAAATGGGAGTCTGATG
AAGATAAAAATATTTTATCTGACGTTTCTCTTGACATAGAAGTTGGAAGT
CTCGTAGCAGTTGTTGGAACTGTCGGCTCAGGAAAATCTTCTTTATTATC
TGCCATCTTGGGTGAAATGGACAAGGTATCTGGTTTGATTACAGTCCGTG
GTTCTATTGCTTATGGTGCGCAGCAGGCTTGGGTTCTAAATACATCCCTG
AAGAATAACATTTTATTTAATAAATCATATGATGGAGATAAATATACCAG
AATAGTGGAAGCATGCGCTCTCAAGTCAGATTTAGATATGCTTCCTGGAG
GGGATGAAACTGAAATTGGAGAAAAGGGTATTAATTTATCAGGAGGTCAA
AAACAAAGAGTGAGTCTRGCKCGAGCCGTATACAGTGGCTCAGATATATA
TCTGTTGGATGATCCATTATCAGCAGTCGATTCTCATGTTGGTAAACATA
TATATGATAATGTTATTTCAAGTAGTTCAGGAATTTTAAAGGATAAAACT
CGAGTCATGGTAACACATGGAGTCACATACCTTCCATTTACTGACAAAAT
AATTGTAATGAAAGATGGCAGAGTGAGTGAAATCGGTACTTACAAGGAAC
TTTTGAGGCAAAAGGGAGCTTTCGCCGAATTCATTGTGCAATTTTTGTCT
GAAGCAAATGAAAATGAAGTTAACGAAAATATTAAACATGACATAGAGGA
ATCTTTTGGTAAAAATGAACTCCTGGAACAAATAACAAAAGCTAAACAAA
TTGTGCGAGAGAGATCTGTTTCTTTAAATAGCGGGGATTTAGTTACTTCG
TTAGTCAAGAACAATCCGACAAATTCAGCAAGTGGATCAACAACAAGTCT
CAAAGAAAATAGTGGTGATGAATCGACTGATAACGATACGAAACAAACGA
GACCAACAACATCACAGACACAACAATACCAAGATGAAAAGGTTGAAACT
GGAAGTGTTAAATGGAACATTTACATGCATTACGTTAAAAATATGAGTAT
CATATTGGTTGTTGCTTGTTCCTCTTGCTTTGTGATTTATCAGGCTTTGA
ACACTCTTTCCAACGTACTTCTCGCTTGGTGGTCAGATGCCGTCATGAAA
ATTGAAGTTAGAACAGGATTAAATGACAACAGAACACTGGATGAAATTAA
TCAAGATATCATGGATAMTCAAGTCTATTATCTTTCCATTTATGGTGGRT
ATTGTCTCGGGCAAGGGATAGTTGTGGTTATGGGATTTGTATTCATGTAT
CTCGCTTGTATGGAGGCTGCTCAAAGGCTTCATAACCAAATGTTAGAAAG
TATCCTCAAAAGCCCAATGTCCTTTTTCGATACAACGCCCCAAGGAAGAA
TATTGAATAGACTTGGAAAGGATTTAGATGTGTTAGATTCTGTTATGCCA
ATGGTACTGAGAGGATGGATATCTTGTTTTCTTGGTAGGTTGGAAATTAT
TTTATTCATTGTAGTGAATTAATTATATTATTTATATGTAGGTGTACTTT
CAAGTCTCATTGTGGTTATGGTCACAACTCCTGTTTTTATTATTCCAGCT
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TTCCCGTCAATTGAAACGTTTGGAATCATCATCAAGATCACCTATTTMCT
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CAATCATCAACATTTATAAGTGAATCTGAATCCAAAGTTGACGATAATCA
GAAAGCAAACTTTCCTGCTACTGTTTCCAATCGTTGGTTGGCTGTACGTC
TGGAAGTAGTTGGAAACTTGATTGTATTTACTGCTGCTTTATTAGCAGTT
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TGCACTAGCTGTTACTGCTTCGTTGAATTGGTTGGTACGAATGGCATCTG
AAGTGGAAACAAATATAGTAGCCGTTGAAAGGATCCAGGAATACACAAAA
GCAGAAAAAGAAGCACCTTGGATTATTGAAGATACCAAACCCGATGAAGA
TTGGCCGAGAAAAGGAGAAATATCTTTCAAAAATTATTCAACGCGATATA
GGGAAGGATTAGACTATGTTCTGAAGAATGTGTCTCTTGATATAGAGGGC
GGGGAAAAGATCGGAATAGTGGGTCGAACAGGTGCTGGTAAATCCTCTTT
TACCTTGTCAATGTTCCGAATTATTGAGCCAGTCACTGGAAATATAATCA
TTGACGGTGTTGATATAACAAAGTTGGGACTTCATCAACTACGTTCAAGA
ATAACAATTATACCTCAAGATCCTGTTTTATTCTCTGGTTCCTTGAGGCG
TAACCTGGATCCTCTTGACGAGTATAATGAGACTAATATCATGGAAGCAA
TTTCACACTCCCATCTAAAGCCTTTTATTGATTCATTGAAAGACGGATTA
GAATATCATGTCTCTGAAGGAGGAGAAAATCTCTCTCTTGGCCAGAGGCA
ATTGATTTGCCTCGCTAGAGCCCTTCTTAGAAGGACGAGAGTATTGATTC
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GTGAGAGAGTTGAGTATGGAACAGTTGCGGAGCTTCTTGCAGATAAGAAA
AGTCAGTTTTATTCGATGTGTAGTGATGCTGGTCTCGTTTGATGCAATGA
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TCGCACTTTTAATTTTTAGAAACCAACAAAGACTATTTTTTTAATAAGTT
GTTATATATATATATTTATTTCTTTGTTTTTTATTTTATTTTGATATTAT
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GATAATTATTAAGTACATTGTAATTTTAAAAAGATACACGTTTTTATTAT
ATAGAGACCTAATAATATATTATAATTATATCTTTGTACTACGCAAATCA
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GTCATATTCTATAAATAATTTGATGGAGCATAAAACTTAAGATAAAAAAA
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TATTAGAAGTTCTTCGACCGTCAAGTAAATTTTCATTATTAGAAGATGCA
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TCATCTTGCCATCGTTTTTGAGTTTCTTCTGAAAGAAATGATGATTAGTA
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CTCAAGTAGTAGTAATAAAAAATAATAAATTCTTACAAAATACAGATTGG
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TGTCTGAGCTCTCTTAATCATTAAGGTAGCAGCCCTTAGCGGTAATGATA
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TCCCTGTGTTGGCAGATAGTGGCTTTGAAGGTCTTTCTGTTTGGATGAAG
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GGTTGGCATCAGGACTGTTGGGGCCAAAAGTGTCAAAAAAGAGACAGTGG
TCCTGGAGACGCCCAACTGATGGAATGTGCAAATAAAAATTCGTCGTTCA
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CTTTTTTTGTAACTAATTGTTAGTGCTTTAATATATCAAAATATGAATTA
ATTTCAATAACTCAACCGTCATTAATTACTGAATTAGAAAGTGTTCAGAT
TTCAATGCTCCACCCAGTATAAAATTTAAGAGAAACTGATGCTAAATGTA
CATAAAATTTGGCTCGACTCGCTAATTTAATAATTCATTTTCTAAGTATT
ATATAGGATGTTGCATAATTATCTTTCTTAAGTAAGGCTAAATGAACGTC
ATAGGATGGATTTTTGTCGATTATGTTAGAAAATACACGTATATAACAAT
AAAGTAATTTCACTCAATGTAAAAACCCTTAAGATCGGAGTTTATGGGGT
CGGAAGCTCTTGCAAACTTTTTGAATATACTCGGAATTTATGGAAGTCCA
GGCCTTGCTGACTGAAGTCTTGAGGTCATCTTGTAACACTCCTTACAGGC
CTCTGACTCCAAGTGCATCAGTCCAGGATATCAAGATTTAGGCTTTGCGC
AAGCAAGAATTCCTTAGTTCAGAATATTTTTTTCTGAGCTTAGATTAAGG
CCATCCCCAGGACGATGTTTCAGTTCGACTCCCACCTCCAGGTACCACTG
TACAATTATGAATTTATGAGGCTCATCTGCTCAGAAATCTCCTTTCTAGG
CCATCCCGCMCAGGGGGGGGGGGAGTGTGGAAATCTCGATGCATTTTTTA
GTATAGCTTAAACAATTTTAGTGTGTACAGGCAAATAACAATCAGTTCTA
TTAGTTTGCCTTTTTAATATTAAAATATCTTAAAATTTAGTAACAAATAA
TTTGAAGATAATTATGCAACACTCGGTACATCAAAGAGATATACATAACT
GACATCTTAAAATATATTATTTCATTGCCTACCCTTGGGAGGAAGAGAAT
TATGAGGTGATATTCCACATTGTCTA back to top
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