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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s142 | supercontig | LSalAtl2s142:1169705..1201115 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000002260 >EMLSAP00000002260 ID=EMLSAP00000002260|Name=EMLSAP00000002260|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=540bp
MFKDVRKFMISLGISPLEYTLDDDNMPGTTSKQVIHSKSTDRQIQPLSCI SETKRETGVCMFAWNCVEAGGLHLGTCIDRFYFGSCCKLPKPSLEENSVN EVSNEVILDNEFIYKKVSESPIITTTSTTTTTTTTTTTTTTTTSTTTTTT TTTXTTTTKTTTTTTTIAPTTTTTPWTSTTTPTRISTFTVPFIYPDTTTS PSLIKIIPINHFITSTNDNDEMTIPDTTPSITKNTSSTTPNSLINEVKPS LVEPNLVSDGSWTPFKPTINVPEDSIGEALSEMSEMKVPFERLRTSDEIV KALSKMNYEEGACIKSCGRRPWFQVNNRNKLYPDGHRNGPSSAPIGGSKP RRRKVSRARSHRNSKFLRTWKDPAGSLREGRIVNGDTSDYGEWPWQISLR QWRTGKKLLISFKYFISISPDDLSLRMGEYDLNSVDEPHTYLDRKVQIVA SHPKFDPKTFEYDLALLRFYEPVPFQPNVIPICIPDDDRRLVGETAWVTG WGRLYEGMAYLVKYVFSLRTMIVEIQPQKYVNMYVNVKIK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s142:1169705..1201115- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000002260-698107 ID=EMLSAT00000002260-698107|Name=EMLSAT00000002260|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=31411bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s142:1169705..1201115- (Lepeophtheirus salmonis) ATGTTTAAGGATGTGCGTAAGTTTATGATATCCCTGGGCATTTCTCCACT
TGAGTACACACTTGATGATGACAATATGCCGGGAACTACAAGCAAGCAAG
TCATCCATTCAAAAAGTAATTCTTTAGAAGGAAGATATATTTCTCCATCA
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ACAAAGTTATTTTTACAACTTGAAAAAAATAGATTGTCCCAAAATGCCAA
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TTTAAGAATTATTACTTTAAAATACTCAGAAGAGAAAGTGCTTTAATTTA
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AGAAAGAATATGAATAAGCCGAAGATTGTTTTTTGAGTTTTTCACATTAG
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GTCCATTAAAATTTGAACGCTTTGAATTTTAAAATTCAACAAGATATAAT
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GTGTCTGATCTCTCTTAATCCTTAATGTAGCCGCCCTTAGTGGCAATGAT
GGATTCCAGTCTGCGGTGGAAGGCCTGGCACCCTTTGTGGATGGMAGTGG
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TGTAATCGAGGGGTTGTTAGACTGGGCGGCGAAAAAAGTTCAAAAGAACT
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AGTTTTTATAGCTCCATGGATATTCTGGTGTGAAACCCCGAGATATCTTG
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TTTTTAGTTTATTTTGCATAAAATAGTTTTGATAGAATTTTTTCTAACCT
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ATTCTCTTTTTTTTTTTGCCCGTAGATTAGCTTTAGATAGAAACTTGATT
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TTGTCTCCATTCAAACTTTGAGCTAGATGTAATACCTAAAGACAACATCG
TAGGAAGATTAAATTTAGCAACAGTTATTTCCTTACCAAATCCCAACATT
TCCAAAACAGCCGTGATCAAAAATTTGAAAAAAGTTGAAACACAAGCCGG
CCTAATTTACATATGTACTTGATCTATGTTGTCTTAATCCATTGTAAGTA
TGGGATCTCTGACTTTATGATGTATGTATGTAGTACAGCCATTTCAAGAA
AAAAACATTGGTTTTATTCTATACATGGAAGTATGAAGATATTAGAACAA
TCATGTTACTACAAATATATCTCTCAACCTTTATTTCCCAAAGCTAGAGA
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TAGTACTAAAACCCGTAAAATTGGATAAATCATTTTTCAAAGGCCACTTT
TTACTATTTTTTTATGATGGTTAGGACTAGTGATGAGACAATTAATCGGA
ATTGATAAATTGACTGTTTTTTTATGGAATCAAGATCACATTTTTATTTA
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CCCTCCCCCTCCCATTTTTGGTTTTTACTAGAAAATTTAATATTTGAAAA
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ATTTTTGTGAAAGGCTGAAGATTTTGGAAATTATCTCCAAAAAATTACAT
TTCTTTTAAATAACTGTGGATTTTTGACTTTTTTTTCCAAAAAAATTATT
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ATTTTTTTTTTTACTAAAAAATATTGACTATATTTTAACATTTTTGACAA
ATCCATTAAAGGTTTAGCAACGATCGCTGTCTTTTACTTAAACTATTATA
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ATTTTACCTGGCCCGTTTTTTGAAATTGGTAATGTGAAGAATAAATTTTC
TTTTCCTCGGCAGTTATCATTATTATTTAATTCCTAAATGGGTATTTAAT
TATATTCAAAACCTGATTGAGCATTCGTGTTTTCATAAAGGACGGGCCCG
TAATCCTGAGGATTTGTTGCGAAATTCTAATTCTAATTCCTTGTTGGACT
TAGGGTAGAATTGGGAATCGAATTCGCACTCATTTTTTGCCAATGTCTTT
TTTACTTTCCTCCCTTGTCACAGCTGATTGAAGCTCATGTCTTCCATAAC
ATTCTTCAAATTGTCAGGGTTGCCATGTTGATTTTTTTTTTTTAACTAAA
CCCATTATACAAACGATTTTCATCACAAATTATGAGGGGTAATGACGTTG
CATGTAGCGACTCCAATATCATCCATTTGATATAGTACCGCAAGGCTCCC
ACAACGAATTTCAGAGCAACTTTTTGTCTACAATATGAACCCATATCATA
CTATCATGATCTACTCTGGGTCTAATGTTTGTCAACAGTCTGCATTACTA
AGTTATTCTAGTAGAAGGATCAGATGACTTTAAAACTAATCTGTCGGAAA
AGGATCGCTAGGATGATGTCAATATGTAAATATTTATACATATATTCCTT
GCAGTATATATAATAGTGATCGGATGATTAATCGGAAAATCGTTTTTTTT
CTGGAATCGAGATCGGCATTGGTAAAATACTGTTTAATTTGCGACGATTC
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TTTTTAGTACATAACTGTGTATTTTTGAAATTTTTTTCCCAAAAATTGAA
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AATTTATAGGTAAAAAAATGTCGATTAAAATATCATAGGGTAACTTTTCC
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AATGCCATATATTCATAAACTGAGCTTTCAAAGTTAAACGTTAAAATTTA
TAAATTTCAACACAATGGCAAGAGGAAAAAACATGGAAATAATAAAATAT
GTCCATTTGTCCAGTACTAAATGAGGGAGGATTTACGACCCCACCTTGTT
TTTACAAACATATGTACTTCAATATAAATATTTGTGCCTTCCATTCTAAA
AACATATTCCTCGTAATTATCAACAATATCTCACGTCCGTAGGGAGTGGT
TGGAGGGGCTGTAGCCCTCCCCCACAAATTATAGAATTTTTTCCTTTCTA
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ATTTAATTTAATTTTTTGAATGTTTTTTCCAACAAAAAATAATTTTCAGT
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AAAAAAAATCAAAAAATTATATTTTTGAACTTTTTTTCCAAGAAATTTTA
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ATTTGAAATTTTTTTCTAAAACATTTAATTTTTCAATTGTTTTCTCAAAA
AAATTAATTTTTGGAATTTTTTTCCTAAAAATTCTCAAAACCAAGGCCTC
CCCATCCCCCAAAAAATATATATAATTCTGTGGACCCCCTTATAGCCTAC
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TGAATAGCAACAGAGTCCAATTGAGGGCTCGGCATAGAGCTGTTACAAAG
ATTATTTGGGGGGAGGGGGCGGGGAGTAGAAAGAGATTTTTGACGAAAAT
TATACATTTTTACTGATTGTTTTTTAACATATTTTTATTAAAAAAAACGC
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TTATATTCACGGCCCTGGCTTCGTCACATCGTTTTTGAAAGTAGGAGCAA
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ACACTCTCTTGGGCAAACACGAGCACTTAAGCAGCTGGTTTTTTGCTGTT
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ACGAATTGGAGCCCTCCTTGGAATCCGCTCCGGAAGCGACAAGATAACTT
TTGCCAGGACCAGAAGGTCAACAACTGGTGGTTGCTCCTCGTTCCATGGA
TGTGCCCTTCGTCATGGAGACCATGTTCTCACTCCGTGACATGGTGCTTT
CTGTGGTTAGCTCCAAAGCCCACGTTCTGCTTCTTCATATGTTCTTCCAA
GCCCTCAGGCTCAACAATGATGCTAGAGACCAATATGAAGCTCTGGAACG
GCATTGTTGACAATGGGAGGCCTTACACAACCCAGCAGAGCTTGGTTCTC
GGCCACATCTCGAAAAATGAAATAAATCAGAATTAATTCACTTTTCAGAA
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KCAGCCACAAAAGTTATTTTTTTCATTTAAATAATGCATATTTATCCCCG
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TCCCATATTGCGTTACTCATAGTACCGGGTGATACATAGAAGTCTGAACA
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TTCTATATATTAAACCATAAACAATTAGTTACAAAACAAAACAACCCTGA
GCTTTCTAGCTTACGTATCAGTCATGAAAATGACCCTTGAACGGGATCAA
CGAATTTCTATTCGTGCACTCCAACAAGTTGTGCGTCTCCAGGAACACCC
TCTGTGCCGTAAGCAAGTCCGAAACGTGAGAGAGAAAGAAGGAAGCAGCC
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GAGGGTCCATGCAAGAAACCCCTGATGTCAACCCCCTTGACATGAAGTCG
AGGKCCTGCAGTGTCCATAATCCAAACACCGAGCTCCTCAAAGCCACTGT
CAGCCATCACTAGGATGCTGTGACAGAGTACTTCATCTACGGTGGGMACC
ATCTCTTTCACCACCCTCTAAATGAAGCCATCATTGCCGCTAAGGGCAGC
TACATTAATGATTAAATGAGCTCAGATGAACATCCATGTTTTTATAGTAT
TCATTTTGTTGAAACTATATTGTTAATTAATAAATTATATCTTGTTGATG
TTTAAAATTAAAAGTGTTCAGACTTTAATGGACCACTCAGTATAATATGT
ATAATTCTCTCTTGACCTTGGGTCTAATAGATTTGTCATTCTAGAGGAAT
TCCCAATTTTAGAGAAAAGCAAAGTTAAAAACTCTGTTCAGCAGTCCTAC
ACATGAACGTCCTTCCATGGATGAGATTATTAGTAGAAAAATGGAATCTT
CTTCACCTGTGACGACAAAGTTTCATCCCTATAACAATTATGTATTATCC
TTTTCAACCTACATGAATATAATATATAGGCAGCAGCTACCTATGTAGGA
TGTATGAAGATTCTGTTGTTTGTATTTTTTACTTTCATGTCTTGGTTTGA
AAAGTGAAAATTCGCTCTGTAATTTACTTTAAAAAATATGAAGAATGAAA
AAAAAAAACTTACCCGAATGTTGTACATATATTTATATATTATGTACATA
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GTGTGCGCGGAGGAGCACGCTCCTTGATATTTTGTCTTAAAATATCAAAT
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CCAGTCACCTATTTTAAGTGAATCAAACAACATAATTAGTAGTGATCATT
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AATGGAGGGGATTATCATCATCACCACCTAAGAAGACCTTCACTACAACA
ATCAATCAAAGTTGTTATTTTATTCCTCCACTGTCATCCTTCATCAGCAT
CTCCAAGGGGTTTCTCCAATGATGAGAAGATAAAAAAACGGTGGAAATAA
GTCATCACAAATTAATTATCAATCTTAGGATAGGAGTAAGTCATTTAAAT
ATTATCTCTGTATGCCAATATATTATTATATCTACTTTTTGCCATCTACA
TTCAGCATGGGTGAAGAAAACCTGTTTTCTTCTCCTGAAACTAAGGCTTC
TAATCTTCCCCATTCGACACAGGGATAAATAACGATGGGATAAAAATATT
GAAAGGGAAAATTCTATATATATATACCCATAGGATTATATTATTAAATC
AAAATGTGCATTTGCCCTACCATTGAGAGTCCTTATATGTTGCTCATGTC
GTCAGAAATAAGTCTTTTGACCGTTTCATCTCCACATAATATGCACAATG
ATTCGTTTTTTTCTTGAAAATATAAAATGTAAATAAGCAACATCTTAACA
ACCTAATATCACAGTTATAATTTCTTTTCCTTGCGTCATTTGTTTCATGT
TTAATACATGTATTATATTTATTAGTATTCACTACTCCTGCTTCTAAAGA
GTTGTCAATGATTAACGGATTTGCAAAGGTACTAAAAGAACATACCATAT
GCTACGCACATACATACAAACTTTCAGCCTTAGTATCCAGTGTTTGATAT
TAATTTGATATATCAATAGAAAAAAAGAAGATGATGGAATATAAGGGCCT
ATGATGTACATGTAATCTAAGGCTGGTAAACCATCCTTCTTTCCCAGGAC
ATGTCCTCTCTTTACATCCTATAATCCTAAAAAAACATTCTATTTGGTGT
GTGGATATAAACGTTAAGGAAATGTTCAGTTCTTTGTGGAACAAATAAGT
AAAATTTGAATATCCACTTATAGTAAAAATAGGATCCGAAAACACAAAAC
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GTTGCATATTTCTTCCATTATAAATACATATAAGAATATTAATCAACCTT
CTCCCGATCAAAATATAAATGCCTAAGAGTCCCCATATTTTGATCTCCAA
TCTAAAATATTATCAATTCTTGTTGAAACAAAATATTTTGGATCTTATTT
TTAAATTACAAAAAGTATTTCTTCTATTTCAGTTAATTTTTAATATTTTC
CCTTCATATTTTGATTTTTTTAAAGACCTCAAAGTCGTTGTAGAGGATGC
AAAATATGTACATGTCCGGAGGAACGAGGGTCGTATGATCTATAGTATTA
TACTATTGTTAGTTGCTAGCTGACGTTCAAAGAAAATATATTTATAGAGA
AGAAAAAGTGAAATTAATATTTTTTAAATTCTTGGAATTAGTGGGAGTCG
CGTAAATGAAAGTAAAATAGGTAACAACTTAGGTACATTGTATTCAAAAA
AATACACGTGTCCCTTTCTTGTCACTGCTATGTTGTTCTGTTTCATTTTT
TATTTTATTTTTCTATTTTAGACAAACATGTATATGTATGTATAATATAT
GAAACCGTTGATGCATATGAGAGTCAACACATTAACCTAAGAGGACCACA
CTCGCCCAAACTTATACATCTTTCTACCACTTTTCTTCTTTGTCCTTGAC
ACTGTTTTCAACTTTCTGTACGAGCTGTATATACAACAGCAGTAGTTAGG
GGTACCTATTAATGATTAATATTGAATATCTAAGACGAAAACCCCTTCTT
CATGAGTGTATCTATCGATATTTTTTCAATTTGTTCTTATATTTTTTAAA
TAAGAAATTATCACAGGGGTCTCCGCGGGGGGMGGGCTGGAGAGGATGAA
GCCTCACACKCCCCCTCCCCCCCCCCTCAAATAAAAATTAAATAATTTTT
CCTTTTTCCCTCAAAATTTAATATTTAAATTTTTTGTGAATAGTTGTGGA
ATTTTAAAAAAATATTCAAAAATTAAATTTGAAATATTATATTTTTGGAG
AAAAACTATAAATTAATAGCTGTTTACAGAAAATTAAATTTTTTGTAAAA
AAATTTCTCTAAATTGTACCTATTTAGAGAAAATTAAATTATTTGTAAAA
AAATTTCTTGCCGATTCGGTATGACTTTGTAATTTATTTACAATCATATC
AGGGTTAAGAGAATAGATTTTAATAAACTCGTACTTGAAAATTTGTAAAA
TTTGAGACACTCTAATTATGCTTATAATTGATAGTTATCAACGCTTCTTT
TGGTTTCAATCAGTAGTTTTTCATACAAGAACGGAATGACTTGTGAATTC
CTATTTTCATTTATGACTAATATGATATAAATTGAATAACATAAGTAAGT
GTATGTTTGATAAAAAATCATGTCTTATTTTTTTGTTTTTTTAAAGAATT
TCTAATGAGAATTGGTCTTATTATTTTTTTTTGTGTATGAAAACAGATTC
ATAAAACTTACTAGGAAATGTTGTCTCTATGTAAGATTGAGTGTTTAAAT
GTATAATATGTATATACTCTAAGGTGAAAAGGCTATTTGAATAATGCACT
TTGAGAAATATATACAATATATAATTGGCAAAATCAAAAAGGTAATTAGG
TATTTGTGGGAAAAAGTTTGTGAAATTTCTTTTTCAGCACCAATTCTTTC
TTCATGGTTATTAGTTGTTTGAACTCAAATAATATTAGTAATAATGATTT
CTTCATTCCATTTCTCCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNAATGTGTACAAATTGAAGATTGTACAAGTTGTCATTTCTTT
GTCTTAGAGTGCTTCAATTATATGATTCAGGGTGTTCACAAGGAGTGGAC
TAGAAGGGATATAGCCCCCCCCCCCCCCTAAAAAAATAANNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NTTTCCTGTAATTTTTCAATTTTTTATAAGTAACTATGAATTTTNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAATATCTTCCCCCCAAAAAATTCCA
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ATAGCACCAACTGACGTGCTAGTTTTAGAAAAGCATGCGAGGTATTTGCA
CTTGGCTCTTCCCTTTGGGTATAATGAAATAGGGACCCTGTGCATTGCAC
ATGAATCGAATAAAAGGACACATCATATGGTCGTTGCCTCAGGCGTATGA
GATGGTATTTGNNNNNNNATCTCACATTTGGTCGAATTTTTGGTACTAGC
TGTCAAAATATTGCCCGAATTGACCATATTACTTAATATTGCCGAATATT
GCTTAGTTTTAATTAGGGGAAAGAGGGAATTTATTGAATATAACCGGCCC
ATTGTTGAGAGTTTTCCGTCAGGCCCCACTCACAGTAAAACAATTAATTA
AGACCTATCATATCATTTTAATTTATTAAAATTACTGGGTTATTATGTTT
TTATGTGTAATAAAACTGTAAACACTTGAAGTGGATTATGTGCCACAAAT
TATTAATAAGTAATGATTAGTAATTTTGATTAAAATAATGAGAAATTACA
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