EMLSAT00000002260, EMLSAT00000002260-698107 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000002260
Unique NameEMLSAT00000002260-698107
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s142supercontigLSalAtl2s142:1169705..1201115 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000002260 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000002260EMLSAG00000002260-685026Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000010004EMLSAE00000010004-718932Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000010005EMLSAE00000010005-718933Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000010006EMLSAE00000010006-718934Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000010007EMLSAE00000010007-718935Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000010008EMLSAE00000010008-718936Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780493auto780493Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000002260EMLSAP00000002260Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000002260

>EMLSAP00000002260 ID=EMLSAP00000002260|Name=EMLSAP00000002260|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=540bp
MFKDVRKFMISLGISPLEYTLDDDNMPGTTSKQVIHSKSTDRQIQPLSCI
SETKRETGVCMFAWNCVEAGGLHLGTCIDRFYFGSCCKLPKPSLEENSVN
EVSNEVILDNEFIYKKVSESPIITTTSTTTTTTTTTTTTTTTTSTTTTTT
TTTXTTTTKTTTTTTTIAPTTTTTPWTSTTTPTRISTFTVPFIYPDTTTS
PSLIKIIPINHFITSTNDNDEMTIPDTTPSITKNTSSTTPNSLINEVKPS
LVEPNLVSDGSWTPFKPTINVPEDSIGEALSEMSEMKVPFERLRTSDEIV
KALSKMNYEEGACIKSCGRRPWFQVNNRNKLYPDGHRNGPSSAPIGGSKP
RRRKVSRARSHRNSKFLRTWKDPAGSLREGRIVNGDTSDYGEWPWQISLR
QWRTGKKLLISFKYFISISPDDLSLRMGEYDLNSVDEPHTYLDRKVQIVA
SHPKFDPKTFEYDLALLRFYEPVPFQPNVIPICIPDDDRRLVGETAWVTG
WGRLYEGMAYLVKYVFSLRTMIVEIQPQKYVNMYVNVKIK
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mRNA from alignment at LSalAtl2s142:1169705..1201115-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000002260-698107 ID=EMLSAT00000002260-698107|Name=EMLSAT00000002260|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=31411bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s142:1169705..1201115- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTTTAAGGATGTGCGTAAGTTTATGATATCCCTGGGCATTTCTCCACT TGAGTACACACTTGATGATGACAATATGCCGGGAACTACAAGCAAGCAAG TCATCCATTCAAAAAGTAATTCTTTAGAAGGAAGATATATTTCTCCATCA CATAATGCTAGTATGTAATATGTGAGCGTGTTCAACATGAGTTGAACAAA AAACATAATCTTTAAGTTAACTTGATTTAGAATAACCATGGAGTGTTGAT CCGCGTTATGATGTATCCCAGTTTTTGGAAAAATATATGGAATATGTGTG ACAAAGTTATTTTTACAACTTGAAAAAAATAGATTGTCCCAAAATGCCAA TGGGGGTGTTTATCTCCCCCAAAAAAACATTATACCTGAAATTTTAGACT TATGCGAGTACAAAGGCCTGTTTTGGAGTCCCTCAATTATGGCTTTCTTG AAGGACACTCTAAATTAGGCGGGACATTACTCCGTTTAGGCTCAACAGAT TTTAAGAATTATTACTTTAAAATACTCAGAAGAGAAAGTGCTTTAATTTA ACTTTTATTAAAAAATAACGTTTGTGCAAAATAACATCCAAACATTATTG TGKAATATWAAAAATGGCGCCCAAGCCATACTTTAAGTTTGATCAGGCCA ATTTTTTGTAAGAAGTTTAACCTACTCATACACTTCATTTAGGCTTATAA TTGAAAAGGGTAATATTTATCATTATAGTAAAATATTTATTTTTCATGAA ACAAGAATTGTTAGATTAGTTTCGACTTAGTTCAGTCCTCAGAGTCTGTC CCTTTTGTTTTGTCTTTTTCGAAGATAAAGAAGAGCTCACATCGTTTCGG TAAGGATGTTACAAGGTAATATAGTCAATATGAAGTGCATCAGAAAAGTG ATGTTGAGGAATCTAATTCCCTGTACAATGCGGATTTCATAAAACGTAGA TTTTTCTTGTCCCCAAAAATACGATAAGAGGAGATTTTCTGTATATAAAA TGTGAGTCGTAACGTATTTGAGTAATTCCTTTAATACCAGTGTTTCTCAA CCTCTTTTTTCCTTCTATTTTTTTTGGCCATAATTGTGTGCATTTTGCCT TCCCCTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTGAGTTGCTAATCGAATGAATGATT TTTTTTTTTAAGTTGTCGTTATTATTATTTAAGTCTTGAATAATGAACTT CCTATTCTTTTACATTCAATTTGATTCAAAATCTGATTGAATGTTCGTGT GTGCTCATAAAAGTGGGAGAGTAATCTTAAAAGATTTGTTGTTGAGTCAT AATTGCAAGTCCTTGTTGGACTCAGAGTCGACTTGAGGATCGATGTCGGA GTAATTCTTGCGATGTACTTGTTTATTTCACAGCTGATTGTAGCTGATCT TATGAAACATCATGGAAGCTAAGCTGCTCTACTCTAAAACATTTATAAAA TTGTCAGGGTTGCCATGTTGATTTTCGGTTTCATTTATTTCAACATGCCC AAAATACACAATATTTTTACACTATAGATATTATTATGTGTATGTCCTCA CTAATAAAGATGGGATGTGTATAAAGAAAAAACTAACTATATAGCGATTA GAAAAGTAAAAATGGTTGAGCGTGTGCTCTTTTTTCTTTTTTGTTCATTA TTTAATCAGTCGTGGGCTAACATCTTGCTCTAAAGAAAGAATTCTCGCCT ATTTATGGTGTAAATTATTTTAAAAATGTATAATAAAATAAAATGTATTT AAATATAACTACAATATTTTGGCCGCATTTTAGATGTAGAAACTTATATT CAGCAWGGCAGTATTTTCTCACCTKCCCCCCCCCCCCTACAAAAAAAACA AAAAAAAAAACATAATAATAATATAACAATCAGCTAATATCAATGGTCTG 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GCTGATTTTTTGGGAACAATTTTGTCAGCTACGTACCAAACCCAATAAAT AGACCTGAGATTAATCTACCTATGGATGCAACTTGAATTAGGTACTTCAT CTTTTTAAAATCTGAAGCACAAACTATTAGATTAATTTCTTTGTTAAGTG AAATGGATATAGATTTTAAGGAACATATTGATGTCAAATCCTTTGTCTCC AGAATACATATTTTGAAGGAGAATTAAAAAAATACAAGTATTGTCGTTTT AGAAAGAATATGAATAAGCCGAAGATTGTTTTTTGAGTTTTTCACATTAG TCCTTAGACGAGGGGAAATTTTTTTTTGTCTTTGTATTTATCTCAATTTA ATCCATGACAAGTTTTCTTTTCATCTCCATGGATTTATGCCACTTTCAAT AGGTCAATCTGAGCAAACAGGAAAATGATTTTCCTTGACGGTTAGACAGA AAGAAGGGATTTCTAAAACATGATTGGTTAGTGTATGTACATACCGAGTG GTCCATTAAAATTTGAACGCTTTGAATTTTAAAATTCAACAAGATATAAT TTATTAATTAACAATAGAATTTCAACAAAATTAAATCTATAAATAGATTT GTGTCTGATCTCTCTTAATCCTTAATGTAGCCGCCCTTAGTGGCAATGAT GGATTCCAGTCTGCGGTGGAAGGCCTGGCACCCTTTGTGGATGGMAGTGG MCTGTCATGGCGTCCAAGTGCTGGCTTGCAGTGGATTTGAGGGGCTCCGT GTTTGGATGATGGGCACTGCAGGGCTTCCACTCGATATGCACTCAAAAGG TGTAATCGAGGGGTTGTTAGACTGGGCGGCGAAAAAAGTTCAAAAGAACT CAAAAGACGCATTCAAAAGAGTCTTGTAATAGAGAAGATGGGTTTCTTTC ATTGCTAGAATCAAAGTGACCTGTCCACACTAACATTGCTTTTTGGCACA 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TATTTTTTTTTACATTTTTCAAAAAGGCAGGATCAAATTTTTCTTATGGG ATTCTCTTTTTTTTTTTGCCCGTAGATTAGCTTTAGATAGAAACTTGATT AACTTTTTCTATAGGTTAGAATATTGTCTATCATTATTTAATTAATGTAA AATTAGGAGTATTGCATTATTTTAATCTTATTTGACGTAGTAAATAACTT TTGTCTCCATTCAAACTTTGAGCTAGATGTAATACCTAAAGACAACATCG TAGGAAGATTAAATTTAGCAACAGTTATTTCCTTACCAAATCCCAACATT TCCAAAACAGCCGTGATCAAAAATTTGAAAAAAGTTGAAACACAAGCCGG CCTAATTTACATATGTACTTGATCTATGTTGTCTTAATCCATTGTAAGTA TGGGATCTCTGACTTTATGATGTATGTATGTAGTACAGCCATTTCAAGAA AAAAACATTGGTTTTATTCTATACATGGAAGTATGAAGATATTAGAACAA TCATGTTACTACAAATATATCTCTCAACCTTTATTTCCCAAAGCTAGAGA GAGTAAAAAGGTCCAAAATCAATGGCATTAAAAGGGGTCCTCCTTATTAC AGCTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGGAATCAGCGTTGTTAGGGGACTTTT TAGTACTAAAACCCGTAAAATTGGATAAATCATTTTTCAAAGGCCACTTT TTACTATTTTTTTATGATGGTTAGGACTAGTGATGAGACAATTAATCGGA ATTGATAAATTGACTGTTTTTTTATGGAATCAAGATCACATTTTTATTTA TTACTGGTATTGAACTATTTATTACTTTTCTAAGTTCTGAAAAAAATTCT CCCTCCCCCTCCCATTTTTGGTTTTTACTAGAAAATTTAATATTTGAAAA TTAATTTAATTTTTCAAATTTATTTTACAAAAAATTTAATTTTCTGTGAA 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