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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s1452 | supercontig | LSalAtl2s1452:4718..14583 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000002379 >EMLSAP00000002379 ID=EMLSAP00000002379|Name=EMLSAP00000002379|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=656bp
MGRXGPITNQVFCLSFLTFKVCSAKDIFAPKLKDGSYTQVAIKKLAXPFQ
TAIHAKRTYRELRMLKHMNHDNIIGLLNVFTPSKTLHEFNDVYLVSHLMG
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AHIDQLTRILALCGTPNEDSLSKITSEEARNYIRSLPKMEKRKFSEYFKG
FNPQAIDLLEKMLELDADMRITAEQALEHLYLTPYSDPTDEPSSLPYDQT
FEDYDLPVEQWKEYVWKEVISFKPEHNAPAKLHPVDRDFYPFYDLFLNLV
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FNDDINRHVDSKWELFNGTIHDLNSDYWRTGKFIYYQSGYVTEKESDIFI
QSGFEKLLIDHLRLRDKFLHNANENLMSIKKQIGTKKSNLDNKMEIQKII
VLSVVSLTCVTGDCFFEGRRICENSISKHPFTGIVRHCKDGVLRVEVESD
VRGRFDARYDCDWYGLRYCHEDTINGLIPWWFFTKCRDGIVKIFPKPPIT
AEEAPK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1452:4718..14583+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000002379-698226 ID=EMLSAT00000002379-698226|Name=EMLSAT00000002379|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=9866bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1452:4718..14583+ (Lepeophtheirus salmonis)
GCTGTACTAGCAGGTTTAAGCTCTATCTAAAAAATAAAATCATAACATAA
ATAAACTTGTAACTATTTCGACAGTTCAGTTCATTTCATATTATTTATTT
TAATTTTTATTAATTATTTAACTCTTTGATTGGATTTTACTTGAAATGAA
GGAGGACTACTATCAAATTGAGCTAAATAAAACGGTGTGGGAAATACCAC
GTCGTTACGCGGATTTGTCTCCAGTCGGATCGGGTGCTTATGGGCAGGKA
AGGTCCCATCACGAATCAAGTCTTCTGTTTATCATTTTTAACTTTTAAGG
TATGTAGTGCTAAGGATATATTTGCTCCCAAGCTCAAAGATGGATCCTAT
ACACAAGTCGCTATAAAAAAATTGGCTCSTCCCTTCCAAACGGCCATTCA
TGCAAAAAGAACGTATCGAGAGCTTCGGATGCTCAAGCATATGAATCACG
ACAATGTAAGGCATGAATCACAATCTGAAGCACACAATAAGTATTAAATC
CTTTTCCCTCGTTTTTCTTAGATCATTGGACTACTCAATGTATTTACTCC
CTCCAAAACATTACATGAGTTTAATGACGTTTATTTAGTTAGTCATTTAA
TGGGAGCTGATTTAAATAAAATCATCAAAACACAGAAGTTAACGGATGAT
CATGTTCAATTCCTTGTTTATCAAATTCTTCGAGGCATGAAGTATTTCCA
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ATTTTCGACTATAAATGATATTATAATACGTATTCAGTTACTTCTGTCTG
TTTATTTATAGGAATTCTTAATATATATTACTAATGTTTATATATTACTT
ACTTACATAATTATTAATGTAAACTTAGTTTTATAAAACAGTCATCTTTT
TGTTGATATTAGAGTACGCAAAGTATTAATATATACATTTTTCAATGATT
ATTTCTAATGATTTATTAATTATTTTTAGTTGATATGTGGTCTGTTGGTT
GCATAATGGCTGRGATGCTCMCGGGKAAAACATTATTTCCTGGGATTGAT
CGTAAGTCATTTTATCTCTTTTTTATATATATAAATTCATGATATATTTA
TGGACTTTTAATAAACATGATCTTTAAAATGTAAAAATCCTTATATAGAA
GAGAAGCTGAGACTTCCCCTTCCTCCTTTCAATTGGCGCTTTAATTGATT
TCCTTGTTAAAAAGAGTAGATAAATACATTTAGAAAGAAAAAAAATTATT
TAACTTTTTGCATTTTGAGATGTTATTCCCTTATTTGTAATCAAGTGATA
TTACCTTCTTTTTTTTAAATACAAAACACAAGCCAAACTCATTTCCATTA
TCCTATTTTTCATTATAAATGATACCAATTGTAGATATTGATCAGCTTAC
TCGTATAATGACTCTTGTGGGTAAGCCGGATGAAAAACTTCTTGCAAAAC
TTGGTTCTAACGAGGTACATACATAGGTGTTCTTTGATCACTTGTGAATG
TGTTTTTCATATTTATTGTGTGTGACCATTTTAAGTTCATTTTTAGCTGC
TTTGCACGTCTAACCTTAATTCTTACTGTTCTGTTTTATTTTTGGTTTTG
TGTTGGTTATACTTTTAGATATTGATCAACTAACGCGTATTCTTGCTCTG
TGTGGTACACCTAACGAGGATTCTTTGAGTAAAATAACCAGCGAGGAGGT
AAGTCAAGCGTAGAATGAAGCTTTGTGTTGTTTTTCATTATTTATTTGTT
TGTCTTATATTGTTGGAAAATCAAATGGAACTCCCTTTATATACATATTA
TATTGATAGGCTAGAAATTACATCCGATCGTTACCCAAAATGGAAAAACG
AAAATTTTCCGAATATTTCAAGGGATTCAATCCACAAGGTATTGTCATGT
CATCATTTGACTATTCCTAGTTTTTCACATTTAAATGTTCCATATTAATT
TTCAGCTATCGATCTATTGGAAAAAATGTTGGAACTGGATGCAGATATGC
GGATTACAGCAGAGCAAGCTCTAGAGCACCTCTATCTCACCCCTTACTCT
GACCCTACTGATGAACCAAGTTCTTTACCATATGATCAAACATTTGAAGA
CTATGATCTTCCTGTTGAGCAATGGAAAGGTATGTTCATTCAAAAGTTAC
CGTTTCAATATAGAAATATATTCAATTTTTTATATTTTTATGTTTATAGA
ATATGTCTGGAAAGAAGTGATCAGTTTCAAGCCTGAGCACAATGCACCAG
CAAAGTAAAGCACAAAAAATTCATTCGGCTTCTGAGTTACTTCCTAATTA
ATTTTCACGTAAAATTCATAAACTTATTTCCTTCTTTACACGTCTACATA
ATATACTTGCGACTTATGTATTATTCATGATGAAAAAAATTACTCTTAAC
GGTTTATTTTAAACTACAATTACATTAATATATAATCCATTTATTGAACA
CTAAAATAATAGCAATAATAACCATAATAACACATCACAGTAAACTATCC
TTTTTACAATACTGTTTTCTTAAAAGTTGTATGTACTCATGCAAGCACAT
ATTATGTTGAGTACATTAGAAAGGGAACTAAATGTTGTCTGTACCTACAT
AAAAAAGGAAAGAAAAATGGWGAAGTGGAATTGTTTTTTATTACTACTAT
TTATAATTAATAACGTCCATGGTGATGATGAAAATGCCTCCAATAGTAGT
TGTTTATCTCATGAGCCTTCTGTCGTTGTATTTAATGTAAAGGGTCGTCT
AGGTAATCATATTTGGAGTTTCATGAAGGGACTTGCTGTAAAATCAAAAT
ATGGAGTGAATGTGCAAGTCATGACAAAAAACACTGGATTATTTATATCC
ATTTTTCCCCAATACCAGACTGCATCCTGTTGATCGAGATTTTTATCCTT
TCTATGATCTATTCCTCAATCTAGTGGGTAACAAAATACAAGATCACTAC
AGAAATTTATCTGGGAACGCATCTTTAGTTCTTGAATATAATGCAATCAA
CGAAAATTGGAAGATTCCTGAAGATCTCTTGCATTTGAAACAATTTAACT
CATGGGATCTCATTAATTCAAGGGAATTCAATGATGATATAAATCGTCAT
GTTGATAGCAAATGGGAACTCTTTAATGGAACCATTCACGATTTGAACTC
TGATTATTGGAGAACCGGCAAATTCATTTACTATCAATCTGGCTATGTAA
CTGAAAAAGAATCTGACATATTTATCCAATCTGGCTTCGAAAAATTATTA
ATTGATCATCTTCGACTTAGAGACAAGTTTCTTCACAATGCAAATGAAAA
TTTGATGTCTATTAAGAAGCAAATTGGAACCAAAAAGGTATTTTAAATCA
AATTGTATGCTTTTTGATTAATATGACGATAAAAAGTATTGTCCTTCTAT
TCAATATAATACTCCTTAAGCTTTAAGTGTCCAATGAGGGTTAACCAATT
AACTAGATCTCAACTCTATTATTGCAAGAAATCATATACATCATAAAAAA
AATCTTTTGATGCAAAAGACCAATACAATACAAAAACAAGCGTAGTACAT
TTTTTCAGAAATTATATTGCTTAATGTTATGAAGCTCTGAATGTTGAATG
CCTCAACACGGCGTTTAATGGTAGTATTATTTTGTCTGGATATTTAATAT
TTTTTCCCCTTACAATCACTTTTAGTCACTAGTAATTATCGTTCTTTAGA
ATGTTATCTTTGTTGGTATACACTCAAGACGATCAGATCATATCACTTTT
GAAAAGAAAATTGGACTAAAACCTTTGAAAAATTCGTATTATCTCAAAGC
AATACGACTCTTCAGGCAAGAGTTTGAGAAAAAGAAAAAATCAAAAAAGA
ATGTAATTGCTTTTATCTTTGTGAGTGATGACATGGAATATGGAAGAAAG
GTGTTACTACCCAATGAAAAAAACATTTTTTTTCTTGGAACGGGAAAAAC
AGAATCAAATGAAGGCATCGGAATGGATTTAGGGATTCTTGCATCATGCA
ATCACACCATTCTTTCATATGGTTCTTTTTCATATTTTGCAGGGTTTTTA
TCCGGTGGAGTTAAGATCATACCTGAGCATTTTGGCGAATACAGAACAGA
CTCTAACAAGTTTTTAAGTTTATGGGATAAAAATCCATTTGATCACCCTT
TACCAAGACTCCACTTTTTTGATCAAATGTTTTAGGCATAATATATGAAT
TGTAAATATGTATATTTGCTTAAATAGATAACTATTTAAATCATCAATGT
TTGAAATCAATAGATGATGAAGATTTTGTAAACATAACTATTTATTAATG
TACTCTCTAAAAATCCTTTGAATTCTAATGGAGTTATTATAGCAACTTTC
GGAAGTCATCATTCAAGAGGTGGTCAAAGTTTTCTTAGAGTTGATATTTT
CTAAATATAGATTTAGAACTAAAAATTAAGAAATTAGCTAAACCTTCATA
TCATTACTGTGGATATACTTTAATTTATTTCATTTTCATCCATAGATCTG
TTATCGTAGTTGTTGTTTTTTATTAGTAAAAAATTGCTAACAAATATACA
CTATTAATGTTTCACAAAATCAATTTTAAAATTAGGATGTAATTGAAAAT
TACTCTCTCAGATACAGAAATACAAAGCGTATCACGAAAATACACATTAT
ACATGCATGCATATATAATTATTGTGTTTTCATGTTGTAAAGGTTCTCAA
ACGCGATNGGACGAATAGTATTATGAATATTTGATGGTAAACATAAAAAT
GTTTGTAATATTTCTTTGTTATTGAAATAAATTTAAATTTACATTATTTT
TTTCAATTGATTATATAATAATAACATTATAAATCATTCGTTTTTATTTT
CCATGGTAACTAGCTGTGTCTATTTCATATTACCATTGAATTAAGACACG
ATGGAACAATAAATAATAATTATTAAGTAAAAACATAAATTATAATTCAC
ATTACATATCAAAGGTACAGCTAGGATTTTAAACTGGGGGGGAGAGGGGT
ATATTTCTTATTTTTAAAATAATATAGCGTTTCTTGTAAGTTGTAAATTA
AGAGTTAGTACCTGGCATTTCTCATGGTTATTAGGCGTCGACGGACAGAA
AACTTTAAACATAATTATTTAGGACAGTTATAAAAAATTCGGAGATATAG
TTCATCTATTTATGGTTCAAATAATTTTTTCAAAAATCTCTAAAGATACA
TGGGKCTCCGATAGGAGCCGGTTAACTAATCAACCTATAGCCAGTATCAA
TAGCATTTAGATATAAGAAGAGATGTAGGATTTGTAGACATATTTGTTGT
TAAATTATTGGATTAAATTTTGAAAAATTGTATTAACATATTCAGATAGA
TTCATAATGTACATACAGGAACCAAATTTCCAGGAAAAATATCGTAACTA
CTAGTAATATAATTGCATTTTTTTGTAATACTTAAAGAAGTAATGTCCAA
AATTGCATTCGCAACGCCCAAATTTTGCCGTTCCCTTACTCATTGAACCT
TTGGAAAGTCTTTAATTGAGGGGTAGAACTAATAAGATAAAAATAAAATG
TATTCTTATAATTCACTATGCCTACTTTACTTGTGAGAGGTTAAATTTTT
AACCACATAATTCCAAAATGGAATATAAATTTTAAAAAAACAAACCCGAA
ATGATTAAAAAAGATCCTGAACAAAATAAMGATTAAAAAAAACATTTCGA
ATTAAAATCTAATATGTATACTTTKCCCTATTCTTTGAAGCCATAATTTT
GAATTGAGCAACATTCTCGATTCGAGTTAGACTCTTGAGTATTGTGGCGC
CCCAGTAAATAATTTGTTTCTCTTTTTAGTATAATATTTATGTAAAGTAC
TCAGGACCACAGATAAATAGAAATTAATTAATATATAAGATAACTCCCCA
ACAAATATTCAGTGTTACTCTCCGTTTTTCGTGAGCACGCTCACACGTAG
TTAATCAATACTTAGATGTTATCTTCTCAAGAATAATTATGTGAGCTAGA
TAAAATAAAAAAACATAGGTTGCCAACAACAAATAAACTAGCGCATTAAT
AAATGCTTAGGATTTTCAACTCCAAATATATATGATGTCCTTTACCTTTT
TTTTGATATGATGCGCTGAGCTTTAGCTACACAAGTTTGTTTCTTAACCT
CATTAAAATGTGAACAAACAACAGTTACGTTTTTTATTAAATATAACATT
AATACAGTAGATTCGTTGTTGTCGAGAAAGATCTTCATAATTATAATTCT
CTTACTATGATAATAACGATGGAGTAGGAAATTGTATAAAGTATATACTA
TAACACCATATAAATCCAGTTAAGTAAAGTAGTCCACAGCACCCCCTATG
AATCAAAAAATTGTCTAGATGAGAAGTCCAATTTTTATTTTCTTCAAAAA
ATTTACAAATCGAAATTCGGGAAGAAAATTGTAAGAAACACAAAATTTGC
AAATTTTGCACAAAAAAAAGAAGTTAATACTATTTATTGGCATTTTAATG
AGAAACACTTTCTTACCACTATTTTTTCATACAACAAAACAAAAATTCAA
AAAAGTTATGGAGACTTATGTTGGCAAAAATTATAAGCCGCCATAACTGT
TTCATTTTTGCTAATATTGCAAAAAATATTAAACAAAATATTCCTGAAAT
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AAAACAAAAGCGACAACAAATTGAAAAATTATTCAGCAAATGACTGATAT
TTCAGTTTAACATCAATTTTTAGTTGTCAAATATATATGCAAAATCATTT
TCAGGCTAATTTCTACAAACTTGAATTAATTTAGAAAATGTAGTTATTTG
AATTATTGTTTTTTATTAGGCCAATCACTTTTTGATTTATAACTCAACCC
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AATTATAATTATGCATTAATGTTTTTTTAGCATTCAAAATCTATTTTACT
TCTTAATGAAAGATCTCTACCGATGTGCATTTACTTAATTGGTTGTTAAT
TATAAAATAAAAACAACAACATGAACAAACTTTTTGTTTTCCTTCGTTAG
CGCACGGAATCATCCATCCTCAAAGATATAAAATAAATTACCGAGAGTCT
TTTAAAAAAAGTATATAAATGAATCAACTTCATTTATTCAGTTATTATTA
GTCTTCAAACCGGACTCAAGGGTGTTGCAGTAGAAGACAAGTAATTCAAA
AAGAATACATGTATTGATTGAAAGCACAACTGAAGAGTAATCTGGATAAT
AAAATGGAAATTCAAAAGGTGAGTTGATAGCTGTGAAATGACTTTTTTCC
AAAATATATTTCTATAATCATGACCACTACCACATTCATAAATATTTGTA
CTAAATAGATCATTGTGTTATCTGTGGTCAGCTTAACATGCGTTACTGGG
GATTGTTTTTTCGAAGGAAGACGAATATGTGAAAACTCAATATCCAAACA
TCCCTTTACTGGAATAGTAAGGCATTGTAAAGATGGTGTACTACGAGTGG
AGGTGGAATCTGACGTTAGGGGGCGATTTGATGCTCGATATGGTAATTAA
AACTTGAAACTTCATAATTATTTTAAGTAACAGTGATTCTAAAAATTTAT
TCTCTAGACTGTGATTGGTACGGACTTAGATATTGTCATGAAGATACGAT
TAATGGTTTAATCCCTTGGTGGTTTTTTACAAAATGTAGAGATGGCATCG
TAAAAATCTTTCCAAAACCACCCATTACAGCTGAAGAAGCACCAAAATGA
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GTGTTCCAAGATTGTAGCGAGCACGAGCAAATCCATTAAATCCATTCATC
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TGTTATTTTCATGTAAAGGGAATCCAGTTCATCATTTATCTCCTGTTCGT
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GTAATCTCGTTTTACATGTACCGCATCAAGGTGATCTGATAAACGACACA
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AAGTCACAATTATTTTCATGATGAGTAATTGCTGTTTTGACTAAAACAAC
ATCACATCCAAATTTAGTGTATTTGCATTCAATGGGTGCATAGACGCATC
TTTTTTCGTGTATCTGAACCTTAGAACTGAAATCTTCAAAATCACAACCT
TGATTCATAAATTTACATTTTTGAGGTAGGCGTTCTAAAAGTTTTTCTGC
AAATAACAATCTTCTAGAATCTAATGGTAGTCGACACATGGGACAAAACT
CAACTCTATCATGGCAACTTGAGCAAAGCATATGTCCAGCTGAGCACTGA
TATATGGGAGGAGCACGGCACAAGTTAAAGCAAACTGGACATTCTAAATG
TGATTTTAATTCTTCCAAAGAAACACTTTGACCCCACAAATCCATCACTC
CTATTTAACAAAAAAT back to top
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