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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s165 | supercontig | LSalAtl2s165:330445..342919 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000002870 >EMLSAP00000002870 ID=EMLSAP00000002870|Name=EMLSAP00000002870|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=99bp
MVLFVLFFRTLFKSCVNPMRNRVPHEDSTLIDRASTTIQGLSNSNNKVLI
EAFSFLNGTSHKKFAYIYTNITHRIIKMRSKFTHQYKARSNKYDFVTDK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s165:330445..342919+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000002870-698717 ID=EMLSAT00000002870-698717|Name=EMLSAT00000002870|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=12475bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s165:330445..342919+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGTATTATTCGTCCTCTTTTTCAGAACCCTCTTCAAATCTTGCGTCAA
TCCTATGAGGAACCGTGTTCCTCATGAGGATTCCACTCTAATTGATCGTG
CTAGTACTGTTCGTTGTTGACGTATCTCCTATCTATCATACAAACTGAGC
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ACGAATTAATTATCACTGCAGAAGGTAGTTCCAATAGCTACGCTTTTTAT
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ATTTCCGTTAATTTCTTTTGTGAAGAGGAATAACATTTCAACTTGACTAT
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ATTTTAAATAAATTAATTTATTATGTTAAAAATTTTTTTTAGATATTTTT
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CTTTGATATGTGGGGCATATACTTATTTCTTCTCGATAAGAACTAAACTA
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AACCTTATTCTATTTGTACACCTACTTAATAAATATCCTCAATTTATTGA
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TATATATGGTCGAGGATGGGTCAATTATATGCCTTCCCGAGACGGAGTTG
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ATCTTGTTAGTTATCGTTTTATATGCTAGAGTATTTTCTCTACATATTGT
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TTTTTTTTATTTAAAAATAAATTTGTAAAAAAAATTAAAGTTATTTCTTT
TGAAAAAAAGAAGTTTGATTATCATGTAATATTATTTAAAATTTTTTATT
TTATTCATCCCAATGTTAAAGCCGTTCTTATAAAAAAAATATTTAAATAT
AACAAAAGATTAATAATTAATATAACATAAAATATATTTAAACAATAAAA
GAGATGTTAACACCTCCACGTTGGGATGATTCTGTGCTTCTGGAATTCTT
TGAACCAAGTTTTTTAAGAAGTTTTGTAAGATTGGGTTGTCAACTAGGAA
CCATATTCTTTCATTAAAATATCCAATTTATATGAGATAAAAACCCAGGT
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ATTATTGATTTTTTAATTAAAACTAATAAATTTCCTGCTATGGTCGCCTC
CCTGCCTCCTTCCATAGGTCAAAAAAAAGGAAAGTTCTTGCCTTTTCCCT
TAATTTTAATTTTGCAAGGATCTTCGATGCAAGATGCCTTAAGTCTTTCA
ACATTTCACACGACGACGTATAAATATGAAGTTGCCTATTGATTTCACCA
CATCTACAAGAGCACAGCCTTCCCTCTTTGGTTTTCCCAATAAAATTATT
GCAAAAAAGTGTCTTACAGTTTATGTATATAAGCTTGTAGGTTTCTACCT
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TCTCCGTCTTTCTCTCCAGTCCTGTGCAGTGCAATCTAAATAACGGACAT
GAAACAGTCTTTTTGTTGTAAAATCTTTTAAACTTTAAAAATCTCTCAGC
CCTTTCTACAGCTCTTGGTAGGAATATATAAAAGATGTTGTCAATTTATA
ATTTTTGTTGTTTATTAGGCCCGTCTTCCTTTAATTTGGCCACAAGATCC
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CTCCTCTATTTCCACACTCTTTCTTCCTCTCATCTTCGCCAAAATCTTTT
TATTTTAAATTTAATCAATAAATACATTCACATATAATACATTATTTACA
TTTTTTTATATAAAATAATATATAACATAGGTACGAACATACAGTACTTC
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TTTACATATATCATTAAGGAAACAATCTTATTTGAAAAGAAAATTGATTA
AGAGTAGTCCTTGATGTACACCTTTAGAGATATTTTATTCAATTTATTTT
GATATGCTTTTGATATTTTATTCAACTAATAAATGTCTTACACATATCCA
TTAATAAAATAATTGCGATACATCAAAAATTTATATTAAAAATATTACTA
TGGTTTATTTTACAAAAAAAATTGTTTCAATAATGTCTATTATACAATTC
ATTGTAATACTTTCTCAGGACCAAAAATACAACAACAATCATACATAAAT
AACACACAGTTACTGTCAGTATCAACATAATATAGCTGATACGTAATTAA
ACAGTCAAATCCAGCGGTCAGGAAGGAGAAATTGAAAAAGGGACACTTAG
TGGAGATGACTTTTTACCCCATGTATGGTATTTTGGAACAATTCAAAAGT
TGGAAATAGTAGATAAAAGGTTACAATCAAGGATTTAATTTACACCTAGG
TAGTAAAGGTAGAACATTTATTTCCAGACATAAATGTGCTGAAACGTGCA
TTCACGTTTATAAAAAAAAGATATTTTATGCATTAACTTGTCAAGAGAGT
GTCTATAAGTAGAGGTGTATAAAAATTGCCCTAGAAAGTGGCAGMAGTTT
GTTTTATTTTTCAAGGCTTTTGTAATAATTATTTCCTTCTTGACAAGAGA
ACATTTAAGGATAAAGTAATTACTAGTGTTTTGTGCTCATGAAAGAGGAA
GATAAACAAAAAAGACTTGCTCTCGATTTGTAAATGTAAGTCCTCGTTGG
ACTCGGAGTAGAATTGAGGATCTATGTGGGATGCAATATACGTAGTGGGG
CTTGCGTTTAGTTGTATAAAANGTGATCCTGATCCCATCCTCGTCGCCAA
TGTTGCGTCTTGACGAGGGAGAGACGCAAGCTTATTTCTAATAGGAGAGA
TCCAGGATGACCGGGAGAGATGAGAGGAAGAAGGACGTGGAGGAATGAAA
CTACACACTGTTTATACGCTCATGTGTATTCTAACTATACTCTAAATATA
TTTACATAAGACGACACTATTTATAATACACAAAACTCAGTACTTAAATA
CATAAGCGAATATACAGGAAGATAAAAACCAGAAAGGACATATTAAATAC
ATAACACTTCTCCTGTGCCTCAYCCTAGACCAMCTCGAGCATCCACTAGT
GGCATACGACTCCAGCTCGAAAACGAGTGTCAGGAAGCCTGGGAGCTCAA
AATGTTTAGAAGAATAGGCACTAACCCTTAACGAGCTATATGATAAGTTG
TAACTTGAAACATTACCTTCGGGATTTATACTATTAAATCCCCGAAATTG
ACCCATGTTAAGATGGAAGCGACTGAAGATAAGGGCCTTGATATTAAGGC
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TGTTTCTTTTGTTGGATCTTCTTTACCTTAATTTTATACTTGTTGAGCAA
TTTATGTTTATAAAGATACTTTTCATAATGACGTTTATGCNNNNNNNNNN
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TATTCTAATTATACTCTAAATATATTTACTTAAGACGACACTATTTATAA
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AACCAGAAAGGACATATTATATACATAACAAAAATAATTTCCCCAACTAA
GTGCCGGGGATTATAAGAACACGTTTAAAAAACTTTTGGATGTTATGAAA
TTCCTACATTGGGACTGGAAATAGGCACTTAGTACGCTGATATGATTAAG
TCAGTGGACTCTAACATCATTTGACTTTAGTTAAAAATTGAATCGACATT
TTRATYAATAAAATAAATTTTGTTGNATTTTTTAATTATACAATTAGACT
GTATATTGAATCTACTGTTTTAACCAAAATTATATTAACATAAACAATTA
TTATAGTATAATAATGCATTTGTAAATGTTATATTTTTGATACAGAAATA
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ACTTTTAAAGAATTTTAGTTTATCATGCATTCATCTTATTCCTAATATAT
TAAATTATATACCAATTTATGAAAAAACTTTGATCTTCAATATGGCTATA
ATGGATACCCTTTAATAAAGTATATACCATTATTTTTCAAAGAAATGTCA
GGTTCTTGACATTATTAATTCCATTTTTATGAAAAAAATGTAAATTTGGT
ACAGATAATGAATTATTTCCTGAAAAACTAATATTGATTTTAATTTTTTG
TATGGATTTATATTTATATATGAGACCATGTGTAAAAGAAATGTTTGTTT
TTAGAATAAGTTCTTTTTTATGTACTAACAAAGGAATTTATAGCCCATTG
GTTCTTCATCACTTCTAAGACTGAAGGGATTTATCTATAGCAAGGGTATA
GAGCCTTTTCTTCTTCTTCTAAAACCTCAGATAGTATGCATTACGTTATG
CTAATCCAAAATCATAAATTTTATACTAAAGAACACTTTGTTATGGAATA
TGTATTTTTTTGTTTTCCCCTAATTAAAGCCTATTTTTTTAATATTCTAT
TAATAAAATAGTTATAGAATAAAAAATGAAAATGAGTTAAGTCATTTGTG
TAATGAGTTAAAAGAACTGTGTTAATTAGTTACTTTTCTGATAATACACA
TATAAAAAAAAGACAAATAATTTTGTTTTTAAATTTCTTGAGATATTAAG
TACGCAATTGTTTTAATATAACTTCTTCTTTCATTTCATAGATATTTCAA
ACTACCTAGAGTAAAAATAGTCCTTAGTTCGTCAAAAACAAACAAACAAA
TAGATGGAAAACATTCATGGACTAATTATAATAAGGCTCAGTCTGGGTAA
TTTGCTGCCTTATGTGAAATATCATTTGCCACCATTATTCTCCTATTTTT
TCTAAAATAACGCTAAACTGTGTTGTAAAAAATCTTAAAGAACCTTGTCT
ATTCCAAGTGACAATTGCACTCCTGTATTGATTAATTCGAGACTGCAACT
CCAAGCAATAATCAAACTGAATCTATTACTGTGGACCGGACATAAGTATA
TATAACCATAAGTAAAAACTTTTCTTGAACTCTGTATAATATTTTTAGAC
TATTCAAGGTCTAAGTAATTCAAATAATAAGGTTTTAATTGAAGCATTTT
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ACACATTTATATTTTTAAAACATATACTTTTATATTTTTTGGTCAAATAT
GAAACAATATTTTAATATAAATGTTTTAAAAACTCACGGGTTGTCATTAA
CATACAAAAAACATTAGGTTTTCTCTGGACCTTTTTTAAAATACTACATT
AAAACCTTATTAAAAACTTATAGAAATCTTTTTTACGACTGTATAGGTTT
GAAAAAAATAATCAAAAGTGAACTAATGGATAACTGTTTTTGTGAAATAA
AGTGATTTAAGATAAACAAGAACGCTCGTGATTGCTTTTTTGAACATTCT
TCATTACGTGTAAATACATCAAAAGTAAAATATGTAATAATGTCTTTTAA
TACAATGTCATATACTTAAAAAAATAATAATAATAACATTGCTTTTTTTA
AAAGGTATGAATGAAATAAAAAAGTTTAGTTTTAATTTATTTAAAATACA
TACTTTATTTTGTTACAAATTTTAACTTNTTTAATATCGAAAATTGAAAC
AATAAAGATGTTAGGACTTCTTTTTTAAGAGGTATTTCAATATTAATAAG
TAAATGTTTTTGGTCAAATATTTGCATCCTTATCATTCACCCAATGGAAA
GAATTTAGATCTAGTTCTAATTTCCATGGCCTGCTGGCGGMTCAGAATCT
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GGCTCCCAGTTGTATGATTCAACAAGCTCGCGGTTTGCTATAGAGCGATG
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ATATTGGACGTTTTTGGCGTAAAGCATGGTTCAGATCGGCCAATTGTTGT
TGGTAGCGATCACCATTAACGGTTTGATCGGTTTATAGAAGGTCATACCA
TATGACAGCACACTGGTCCCAGAACGCACACATCATTGCCTTCTTTCTGA
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ACACATCAATACAAAGCACGTAAGAGTGATTTTCTTTCGAAAATTTAGGT
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TTCNGAATTACTTTGAATATAAAAAACTTCTTTATTTTTAACCCAAAAGC
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TAATCAAATTATAAAACATATTTGGAGATAATTTAACGACTCATATATCG
ACATGTAATTATATAATAAATTGGGGGAAAAGTGATTTTTTATTTTTCTA
TTTATTTCAATGCTTAGTTAAAACTGTTACAATCATCCACTTTATGTCAA
GTATGCCCATTATGTTCGATATCTTGTTACCAACGGTAATCCCACTTCAW
AATGCCCTTGTCGTAYAAGCCATTGTCTCCATTGGTAAAAAAATCAGACA
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GTACATAGAAAAGCACAGGTGGTAGACACTTGGTGTCAGGTCTGGACAGT
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GTCATCAAAGATGTGTGCGGCCTGGCGTTGTCTTGATGATGTCTATTTGT
CTTTTATTCGACAATGATGACCACTTCTGTTCGATCTCCAGCTTCAAAGG
GCCAGGTCGCTTAGTTTAGCTCATAGATACKCCCCAACTCACCCGAAATC
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CTATAAAATAAATCATAACTACACAGCTTAGTATAAATCCTCAAAAGTTG
CTCCTCCATTGATCTTTTCTTTTCCACAGACCTCATAGCAAGCTCAGTCA
TTTGCTATATTTAACAGTCATAAATAAGATGAAATTGTGTTTCTTCATCT
TCTTCACAGAGTCGATAGATCAGGTTTAGGGTTTTACCCATTTAAAAAAA
ATGTATATTAAGTTGTATGTGACCATTCACCATACCGACTATACTTGAGA
TTTGGTGTTTCTTGTATTAAACGGTCGAGTTGTTCACCATAGTAGAGGGC
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GTATAAATAACAAATTTTCTAGCTTGCTTTTATGCGTTTTTCCCTTTCAG
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ATGACTGAACCGGCAAAGCACAATAATATCAGAAAAATCATTGTAGTATA
TACTCACACCTTTACAATTTTAAATGAAATTAGAACAAACAAGAAAAAAA
AACTTTATTGAGTTGATATTTTAGAGTTGTAGTATTTAATTTTATATACT
AGAGCAAATTATTTTAAAATATTAATATGGAAAATATTTATTGTACTGAA
GTAAACTTTTCAGCAAAATGCTATTCGATACTCAAAAATCATGGATTAAG
AAGGAGAATATAAAATGTACCTACGAATATGTTTCCTCATGAATGAGGGA
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TAGAGAATCCAATATTGTTATATATTCAGAATTGGGTTTGTATTTATTTC
CTCCATATGTGGCTCATCTAATTAAATGAAACGTCATGATAGCTAAGTTG
CTATCATGTCTACCATTATGTTATTTTTTATCTATGAGCATCATCATACA
ATTATTCAATATACATTGTAACTTTAAACTTAACGCTATATCATGCTGTT
AAACACCAAAATATATTTAATAATTAACGATAAATTACTATGGAATTAAA
TGCTTAGAGTAGTTCGTTTCTCATTAGAATTATTAGTGTTTTTCCATTTA
GATATTGGATATTTCTGATTCTTTTTTGTTGTTCAAAATTACCTAAAAAG
TTTTATTGTTTTTTTAAACGGAACTTTTCCTTCGGAATGTACTCAATATT
TCAAAAGTTTTTCTAAGAAGTATTTTTTATCCAGTAAAGTTTATTTTTCT
TTTAAGGTTAATTCCTCTAAATAAAGATCTCTTAGAGGCATAAGTACTTA
TCAATATGTAAGTATGAAGATACAATTTCACGTATGATTTGACTTGAGAA
GTTATATATATATATTTCATATAATTTAACAAACAAACAGAAAATATTAT
ATTTCAAAACTGGGAAAATATCCATGATAACAATCAGACTATGAGTAAAT
ATATATATGCAATATTTCAAAAAAATGCAAATTTCTTTCAAATTAGTTTA
GTTTAAAATATGAAATATAGGTTATTCTAGTTTATTTCAGGGTCAAACAA
ATATGATTTTGTTACCGATAAATAA back to top
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