EMLSAT00000002942, EMLSAT00000002942-698789 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000002942
Unique NameEMLSAT00000002942-698789
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s168supercontigLSalAtl2s168:571962..593342 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000002942 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000002942EMLSAG00000002942-685708Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000013001EMLSAE00000013001-721929Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013002EMLSAE00000013002-721930Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013003EMLSAE00000013003-721931Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013004EMLSAE00000013004-721932Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013005EMLSAE00000013005-721933Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013006EMLSAE00000013006-721934Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013007EMLSAE00000013007-721935Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013008EMLSAE00000013008-721936Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto778658auto778658Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000002942EMLSAP00000002942Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000002942

>EMLSAP00000002942 ID=EMLSAP00000002942|Name=EMLSAP00000002942|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=490bp
SQSKHKKALDILDSLLQNYDRRATPTNHIGKATEVAIKLYVRSLGSINPD
TMVIDLYLRQHWFDSRLNHPGLLEPMDLNDPNLVKALWKPEVYFPNAKDA
EFQYVTVPNVLVRIDPGGAILYMLRLKLKFSCMMELSKFPLDEQYCTMEI
ASCKIIIHKGIISTFKNHNFFSLIVSKTTKELILRWKDTKPIDISKEVKM
PQFEISTVIPSICQETFHIGNYSCLLAQLHLKRSLGFHMVQSYIPTILIV
VISWVSFWMDVESVAGRTTLGVTTLLTVSSKASDVQAEVPLVSYVKAIDI
WMGACTAFIFAALLEFTFVNYMWRRGKKKTMYFGIESGSRILENQKDKVE
DFLVPLSQINEDNEESCNQANNVAMERAVKKSSTEVNRRGQVLLMKPTTK
NRRKSNFLWKXSKSQGDDAERRTALNMDVEQSNGEVRMLKSSSDDLIKES
SISEFGLSHCKLALQIDECSRFIFPLCFCIFNLLYWSYYT
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mRNA from alignment at LSalAtl2s168:571962..593342-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000002942-698789 ID=EMLSAT00000002942-698789|Name=EMLSAT00000002942|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=21381bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s168:571962..593342- (Lepeophtheirus salmonis)
AGTCAAAGTAAACACAAAAAAGCATTAGATATCCTTGATTCGCTACTCCA AAACTACGATCGACGTGCTACTCCAACAAATCATATAGGTAAGAGAATAG ATTAATTTCCTTTTATATAATCTCAACTTATGCATGAAGTTATTTCTTGA AACTGAACAACTGATTTTGACACAATTACTAATGAGTTAGGCAGGGCATT TCTGAGTAGGTGAGGAGCAAGAGATACTATGATATACAGTACTACTCAAT TAAGACTCATATTAACACCAGCTGCCTTTTATCTGGGGTTTTTTAGGGGG AGGGGTTATTACTGCAATAAAGAGAATACACTTTAACATTTAAAATATGA TTTTATCATAGAAAATATTTAATATTGTTTGTAAACATTTAAATAGTCTA ACAGATAAACAAGGGCATTGTACTTGAATTMCCAGCCACATATGAGAGGT TGAGATTCTTTGCAACCATTTGATTCCGATTTTACTGTAAATATATATTT GCACATCCAACAGTATATGACATCATCCTTCAGCCATATTAAATTCAGTG TAATTGTTTAAACCATGTGAGGAAAGTATTTTTTTTTACCATTTTTTTAT ACGGAAAAAATTATTTTGTTAATTGGACTTTATAGTTGATTAAATTTTTT GTGCAAACACAGATTACATAGTCAACACAGAAAACAATGTAGTTTAATTA TATGGTAATAACATTACATTTATTTGTAGTATAATAAAATATATGAAATG GCTGTAGGTGGTAATACGAACACACGACATGATGTAATATTGTCCATAGG CTTCAAAAWCTTCAAAATTGGTTAAGAGGKGSATCCAGAACTAACAAGGT TTGAAATTAAACATAGATTTGTCAAAACTTGCAAAATAGGGGCTGTAACC AATTTTTAGCCAAACAAACACTTCTAGCCTACCCTGTCTAATTTATTTTA CCAATCATATAATACTTTTTATACATTATTACCAACATATTCTAAATTTA GTTACATATATCCTAATGTCACTTTGGAGACTCATATTATCCGGTAATAT GGGGCTTTTAAAATTTCTCAAAATGGGCTGCAACTTCAAATATATTTGTT TTTTATAGATAAGTGATAAAAATGTTTAATGCGCAGCATGAAGGTTCATC TACTATGAAAGCTCTATCTACATGGCTCTAATAGATTGAAAAATAAAGAT GGTTTAGAAAAAGTAGCTCATATCATCTCAGTAATATCTACTAATACATT TGAGTATGTGAAAATTCAGAAGTTTAGAATATGATGAAAGTGATCATTAT AAAATTTGTAATACCGTAAAATCCTATTCCAGTACAACTTTTGGAAGGTC CCCAATTCAATTAAATCTTTGTTTATAACTATTTTTTGAAATTATTAATA ACAATTTTAGTCAGCAATTTTATTCCTAAGCTCCTAGTAAACAGAAATCC TATGCTTTACAAATAGATAGCCTTAGTAATGCCTATCTTACGTTGTAAAG TGCAATTGATTTATGCTGGATTCCGTTAGAAAGATAAGATTTTCTAATAA AAAAACAATTAAGACAGTTTAGCTATTGTTTGACTTAATATAGTTGAAGT TTGCATCAAAGATGGAGAACAACCAAAGAACCCCCCCCCCCTATTTTACA CTTTTTCTGCGCATGATATTAACAAGGGTCCTAAATTGAATAGTCCCATA AGTATTGCTACTGTATTTTCTTGCCCTCTATTCTTTTTTCTTTACAAAAA TGACAACCGGGGTATTTAAATCAGGGCTGCGTAGTCTCTACATAAAATGT CCGACTCCAGTATTTTGAATGTCACCAATGTCTGACAAATTTGACTATTC ACATGACTAAGTAATGAACTAGCATGGATAGTGGCTATGCTCTATTCAAA ATAATAATTTAGAGAAGTTCGGGAATGGTGATTGTATAGACTAATGTGCA TGTTTCAAATGTGTGAAATAAACTTACAAATGAGCTAACTTTCGATCAAG TTTCAAAAATGAATAGTATTTAATACCTCTTAACCATGAAGAAAAAGACA CATTACGAATGCTCAACCTAAGCCAAATTATAAATATGTTTTATTTACAT AAATTATAATATTTTTTGTAGCCGGAGTTGGAGTAGGTACAAAATTTTCC AAATCCTAACTCCGACTTTACAAAACTGTACCGAATCTAACTCCAACTAT AAGTCTAGCTCAGTTGGTCTATTTGTCTGTCGTAAAATCATTTATTTATG TGTACTTAATAGCAAAAGATGGGTTCACCCGATTTTTTTTTGAACTTGTA TATATTCTCCTTTATTGTCATAATTATCAGACTTGATTTCATAGAAAATT TATGGAAACATTTTTATCATATTTATGATAATTATAATAGCAAATAAACG AAGATATAGGGTCAAATATCTGCGCAATCACATCAACAAAACCTTATCTA GAGCTGCATAACTACTTGATCTAAAAAATAACAATGTAGCAACGAGCATG TTTTAGTGTCTCATATTAAAGAAGAACAAAAATGGGAGTTCAGACATAAA AAAGGAATGCAATTTTAGATTAGGTTTATCAAGAAGAGTGAGTAGCTAAA CCTCAGCACGTCATATTACAAAATAAGTGGGAGTACAGTGTACATTGCAC ATTGGCTGAAAAGTCTAGGGCTTAAAAAAACAAAAAAGAAACATCATATT TTTGTTATTAATTCTTTTATTTATTATTATTATTTTTAATTCCCTTTATA GGGTGGAGTACCCATAACACTTTTCAACGCATTGCTTAGCTTGAACATTA TGTTTTCCTTTCAAGAAGCAGTATAAAATTAGAATACGAAATTTTGCATA ATTTATGCTTTGGGAATAACAAAAGTAGCGGTAGACTTAGCACAATCACT TAAAAAACTGAAGAACAAGTTGTGAAGAAATTTTGACAAATGTATTTTGA AGGAAGGTTCTGACTGAAAAGGAGATGAATTAATAAAAAAAAGCACTATT TTTGATACTATCGCTTGTATAATACTAAAAAAACAAAAACACTTTTGGCT ATTAATCTTTGTGGATAAAAATATAAGTTTCATAAATTTTAGAGAAGTTT GTAATTTGTAATATCCTTTGATTTATTCCATTAAAAAAGTTTTCCCTCCC TTTCCTCTACATGAGTTGTAAAAAAATGTGTTTCCCATATTGAATCAGAA AAAATGATATTTCTTACATTTGTGATCACAAACAATCAAAGTTTTTTGAA GAATATTCTGAATATCAATCAATCGTTTTAAAGGATATCCAAGGTTATTT TAAACATTTATTTGTTGGAATTAAAGTTTTAAAAACAAAGTATTTACACA AAAAGTTGTCAGTTTTCTTTTTCTATCAATTTTCAATTTATTTCACTCAA GAAGATGTCCATGGATGATTTCAAAATTTCTTTCAAAAAGAAAACGACCA AAGACTCAAAATCAACGGTTGTAGAACTTATCTGCGTTTGATTGTTGGGA CATTTAATACTAATCAGTAGAGCTTAATCTCAACATATCAACAATAAAAC ACTAATAGTCAATAGGACTCCCATTTCCAAAAATCAAAATCAGCTGTGAA GTTAATGCGTAATAAGTGTGTATGTGGGGTTACATTATACATAGTATTGA ACCTCTTTGTTCTACTAATTTAGAGTTTATTCTCATATCATAGAAATTAA TTCCTGAGTTGTTAAAACCCATGTCGGAGTCAAATGAGGTCACAAATGAT ATTCAATATGTATGATACTAAAATATATTCAAGCAGTTCCTTATAGGGAT TGTCTTCCGTGATGTTTTTTTTTTCCAGGGTGTCCAAAAAGTTAAATTTG TGATAAAAAGTCTTTTATATGTTAAATGTTAGTCCGCAAGTTGACTTTTA TTCATTTTACATTATTGTAGTAGAGGGTCATGCACTACAATTAGAACAAA TTTTGACCTCATTCAGATCTGGAACAAATTCATTGTCACAACTTTTTGAT TTGATTAAATTTAATAACATCAATTGTAATGGCATATTATTATCTTTTTT TTGGTTGGAATGATTTATTTATATTCTACAATACAAACATTGTAAATAAT GAATACACATAAAGATAAAAATAGATCATATAAATAAAAAGTAACAGAAA AATTACGTTTAAAAAAAACATAAATTAACATTAAAGTTCATATTGAATGT CCTGAAGTAAAATAACTTGCTATAATATTAAAAAAAATGTCTAAACATCA GCTAAGATTAATAAAAAACGACTATGTCTTCTTATCATTGACTTGATGAG ATTGAAATATTGTACGGACCTCGAAGGAACAAATTTGAAGATATTTCCGG CCCATGCCCACGACGAAGATTATGACAGAGGGATTTTGATAGAAATTTCT CAATATCGAGCAACTGCGCTTATCATTATAGCTCTAAATTCTTCCACATG TAATGGAGAGTCAAGTCTTAATTATTTAGCTATCAAGGATTTAATATTTA CTAAAGAAAACTCCATGGCTTTGTGAACAAGTGAAGTATTTTTATTCCTC TTATAAGCTCCAAATAATATATTTGCCTTTATTAAGTTAAAAGAAATAAC TTTTGTCACACAAATGTTGAATTGGATAAAAAATTTGACTACTCTCAAAA CTAGGCAATCAGCAAAAGTGTGTAGGGTAGAGTTGAACATACAACCCCAG TCTTTGCAGGACAAGGAAGATCCCATGAAGGAGGAAGATCTTGTAGTACC AGATATTTATCTTACACAGACTTTACATCCATCAATGAATTTGGGCAAAA GCTCATTTTTAAAAACCATGGTTTCGAAGGAGTAAAATACTTAAGAGACC TCTCAAGAGGAAGACGGAATCTCCCACCCCAAAAGAGTGTTCCCATTTGG ATCCATTTATAATATTTAGAGGACGTRAAATTCMCCCTCCAGTCTCTCAA CAGGAATACTACAACTGCTCTTTCTTCATAGAATGGGNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCACTCATTCTACCCTCCAA CGAAATTATAGAAGAGCCGTGATTGAGTAAAGCTCGTAAAGGATTAAAGA AATGTTGTTGTTGTTCTTGTTGTTTTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGTTTA ACGATTTTAATAAATCTCATAATGTGGCAGKGACGTAGAGAGTCGAATGC TTTGCAAAAGTCAGTTGCAATTAGTACACAAAATTTGCAACTCATATTAA GAGATTCAATTGTTGTAGATATATTTGTAGAAATATCCGTAATTTTTCTA TTTATCAGGAAACCTTTTTGTTCATCTTTAATGTTTTGGTTTAAAATGGG TTCAATTTACTTAGCTAAAATACCAGACAATATTCTGTACGCTTCATTTA AAACTGTGATGAGCCTTCAGTGATTGAAATAAGTGACATACCCCTTTATA GGTATAAGAGCTATCCTACCTTTTGTAAGAGGAAGGGCCATTTTTCCAGA CTTCTCCATGGGTTTTCCTACTTTTAAAAGATATGGTACAATTTCTTAAG GAGCGAGAGAGAAAATTTGCCCACAAGTCCATCTAGACCCAAGGTTTTGG AACCCTTGAAATCATTCTTTATGTAATTTACGATATTAGCCTTAGTAAAT ACTCCAACCTTTGAGTGCCTCCATTTCATGGGGAAATTGAGTCTCTTTCT GCTTAAAACCTCTGAGAACCTTTTATGGAAATGTTGCAATATTTCAGAAG GCTTATTCACTGTTCTATTGTTAACAACAATTTTTTTGTATCGTAGTGGC TGKATGATTCTGTTTGCGAGATAAATATTTGGTTCTAAGAATGGGATCGG TTTCGTGATCTACTTTTCTTCTCATTTCAGTTTCAGAAATGTCCAAGATT CTGTCAAAGATTCTGTATGAATTCACCAAATCAATTTAAAAAAAAAAAAA AATAACAAAATATCTATCTAAAACTTTTTCACGACTCTTTTGGAACCTAT TTGCTTTGTTTTTGTGAGATTTAATAAATTTTTGCACTGTTTTAACAGCA ATATGAGACTATAATTTGTAAGCACATTGAGAAGGCAGATAACTAAGACC TTTTAAAATATTGGATTTTAAAAACTTTTTGAAATTACATTCCCCTAATT TTCATTTTGGAACTTTAAACTGATGACTACGGGGAATAAAACGTAAAAAT ACAACTCTTTAAATTCAGTAGATGTTTCATAATACCATATCTAACTCGTC CATCCCTTCTTCCCCTTATATTCAACGACAAAATGGTTCCATATACTTTA GATCATTTTAGATTTTTGGAGAAAAAAAGTCAGTTATTTTGTGCTGGGGT TTATTAGTCAGATACATTTTTGGGTTTCTTCATCTCGTACGACGTTTGGC AATTATAGTGCAATTCATAGCTGTTGCATTTGTTAAGTGATTTGGACCTA TTTGGACTGAGTTTGACAACTTTGTCACTCAGAAAAGGTTTATTAGGCTT ATCATTATATAGATATGTTGAATTTGGTTTCAAGGAGTTCGAAACTAAGC TAACTATTTCCACTGTAGAATCTGAGATACTTTCATTATWAACACAAGAG TCCTGCKTAGCCGTTGTGAATGAAACAGGATTGTTCTTTGAATTAACAGT TGATGCTGGATTTCAATCTATTAGCTCAGCCCCGTTCGGTTATTGAGCTT TACAATCTTCCCCTCGTTTCACATTTGTTTTTCCCCTTATAACTTGCTCC TCTTATTGAGAGAAAAGTACTTTTTCTGTCCCATTGATTCTCTTAAGCCT AGAGATCATCCAAGACTTATAGTAATTCACCAATTTAGTTTCTTCACCAC AAGAAGACCTAAAATGACCAAACAGTTTCCGCACTGTCGAGAGTGGCCAA TAAACTCAATTGTTTCAATTTCATTTCCTAATGGAATCAGTGAAGGGATA TTTTTAGTATTTCCTGTAACATTTAGTAATATATCTGAACCCTTTGTGTT CCAATGTTGATATCTTTGATCATTGAAAATCCCAAATTTTTCTAAAGAAA TTTTTGAGATAAAGAAGCGTTCCCTATACGAAAGGAGATGATTGTAGAAA GGTTCGAGCATAGATCTTAATGCTTTCTCACAAATTTTTCCATAGCTATA TTTTAAATTAAAATCAAACACATGATCGCCATCTCTACCTAGCACAAGTT TACTACAATCTATCAAAGCTTTGAAAAAATTAATATCTTCGTCCTTCATG TTAATTCAATTACTTAAAATTTTTAGAATACACAGTTATGAATAAAAAAG AATTTTTATTATGTGACGTAGCTTTCTATTTTTTTTTGTACCTTTTGAAG GAAGAGATGCTGAATGAAAAACTATCTCAATATTATTAGTCCTTGTGAAC CATTTGAAACCGTTGGCATTATCGACATTTTATCTTATTTCAACTCTGCA TTAGTAGTCATAGAAATTCAAGAACTAAAAACGATCGTAACCATTTTACT TCATGACGAAAAATTTACTCTTCCAAAAACTGTAACAGAGACCGTTTTAA TAACTCTATCTGAATTAACTACCGCAATTTAGTACTATTAAATGACGAAA 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TAAAAATATACACTAGTTATTAATTAACACATACAAACATTTGCTAATAG AATTCCTTAGACCATTGAGCTCAATGAACGCACAATTATGTCCTCCATTC CTTTTGGAATTCTGACTCTGTTAGATTTAGATTTGTAGACTAGCCAAATA ATTTTAACTACTGTGCCTCCACTTTGTATTCTATTTGTCCTCTAATAGTG AATGCGATGAGACAGTCTTTGGGTGAGCGTTTTATTGAAAATATTGACAA AATAAAAAACTACAAAAAAGGTTTATCGGGAAAATTAAGTAATAATTGAA AAGGAAAAAAAAGTAATTTGATAAATATTACTGAAAGTTTTTTATTGTGG AGTCGGTCAATATGAAATGAAGGTTGTTGGAAAAAAATAACTCTCTCCAC AAAGAAAAATTATAGCGACGGACCTGGTGTATCAACAAGGATACACTTTT CTGGTCACAAAATTGTCTTTGGTCCATAGTTTTGTCATTAACAAAAATAG CGTCGCCACACGTAGGACATGAATGCACAATCTAATGAACAGAGTTATCC TTGCCGACTTACATTGAGTTTCCTATTAGGTAGGTTTTTTATATTTTTCA GAAGGCAGGAAGTTTGTACCTCAATTGCATCCCAGCATTTTTTGAAATGT TATATATGTTCACAAGTTGTAACTAAATACATATAGCATCTAGAAAAACT AATAACGATATTAAACAAAGTTACTCACAGACAGGCTTKTCAAAARCATC AGAATATTCATCAGAATAAGAAGAACTTGATTGAGGTGGTTTGACATATT ATTCATCTTTTTTTTTCCATTCCAAATCATCATTTTCTGAATTAGAGTAC GATGTGAGCACAAGATAAAGTCTTATTTTTTCAATGGATAATTTTTCTTA GACATTCTTGCACAATCAAAGATGGAAGCATAATGGCTAGTTCAGCAAAA 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