EMLSAT00000002958, EMLSAT00000002958-698805 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000002958
Unique NameEMLSAT00000002958-698805
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s16supercontigLSalAtl2s16:529691..537674 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000002958 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000002958EMLSAG00000002958-685724Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000013072EMLSAE00000013072-722000Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013073EMLSAE00000013073-722001Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto778411auto778411Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000002958EMLSAP00000002958Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000002958

>EMLSAP00000002958 ID=EMLSAP00000002958|Name=EMLSAP00000002958|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=155bp
MMDGGDAVTSGGGKSRGGGGGAHDSDLLDDSILRETENPFLDVLLSGFQR
KPEKKNYHFKFDELARTECMIAKQNLINVCKSSRYCQNSDSMRLSVEEMC
TEYDELIEMSYHAAEQLLMIVSVFCFCFVLYMXLLAIEKITVHFFGTKNE
GQGDY
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mRNA from alignment at LSalAtl2s16:529691..537674-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000002958-698805 ID=EMLSAT00000002958-698805|Name=EMLSAT00000002958|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7984bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s16:529691..537674- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGATGGACGGAGGAGATGCTGTCACCTCAGGAGGTGGTAAGAGTCGTGG TGGTGGGGGAGGAGCACATGACTCGGATTTGTTGGATGATTCAATACTAA GAGAAACGGAGAATCCCTTTTTGGACGTACTACTGTCAGGATTTCAAAGG AAACCGGTATGTGGAGAGATTGGATTGATAATTAATAGTAACAATAAGTT TTAGTTTCGATAAAATATATATATGTATATTTACAGAAATTAGGGAAATT CATAAAAACGTTGATTGGAACTTTATTTTTGAAAGTAGGACATTGGAACT TTGCATATATAATTTTAATTAAATTCTTTATATCATAAAAATACATTCAA AATGACCACCTTCGGCCTTCACAGTTGCAGAAACTTATTGACGGCGGCAC GGACAACTTCATGACCGATTTTGTCCCATGCCTTCACCAGCAAAGTTTTC AATCTCTAAAAACTCATATGAGTCCTTGTACATGACTTTTCTTCAAAAAT CGGCCACAAAGAGTAACGCATAGGATAAAAACCGGGTAACTTTGAGGACA TTCTTCTTAGGGATTCATACTTATTTTCTTCGTCTAACGATTGCTTGTAG CTGATCTATTGAAACTTCATGGCAGSTAAGCTTCTCTCCTCCAAAAGTTC TTTGAATTTTCAAGGTATCCAAGGTCATTTTCTGTTTCTTTTATTTTTAA ATACCAACGCCATAAGATTTTCCGTCTTGAAATAACTAAACAATCACTTT ACCCTAGTTCTTAGTGAGGGCCATGCTGGTGAAATAGTGTGCCCATGACG TTAAGATATCAACCGGCCCAGTATGAATAAATATTCAAAAAATGAAGCTT ATATAACGAAACCTCACCCATCTAGACACTAACATATTTGCGATTACCTT AATTTCAMTACCCACTGTAGAACACTCCGTAGACTACTGCAAACTATTTG GTTGCACACTTAAATTATTCCTCATTCCTAATAGATACTACTGAAATGTC CAATAAAAAAAGGTTATTTATCTTTTTCCCCGATCTTACTCATTTTAAAA CCAGGTTTAGTTTCATATAATATATTAACCCCTCCCAAAATGGAGGTTTG GACCTCGTGCCATCCTTTTGGCTTACAATAGTGCAATAATTAAGGCCAGT AAATTTGTACATTGAAGTGTTATCATGTTTTTATTCGACCAATAATTTGA GTAAATTGTTTTATAAACTATCTTGTAACAATATAATTATCTTGACTTAC CAGTATCCTAAATAGAATTGGATTTTTGTAAAGGTATGATACTTAACACA CAAAAAAAGTCATTAAAAATCATTTTTAATATAAATAGTACTTAACTCAC TAATTACGAATACGCCACTATGTTTTTCGTATTAAATCGGGCTATTGAGG AGTATTGATTTGAACTTTTTGAATATTTTACTCTGGTATAGTTTTGAGTC GACTTTTGAAGAACAATAATCCAGATTGATTTTTTTTTTTTTTGCATAAT ATTGTTTTAATTTCAAATATGCACATGCATTTAATTTGCAAAGACCTACT TGTAATAATAATAATTCAATTTAAAGGTTAAAACATTATCCTATATTAAA NGATTTTACTTGAAAATTTATTATTTTTTCCTTTTTTTTAACTTTTTTTA CCATAAACAATTTATTTTGAGTTTATATAATTAGAGTTTTATAAAACAGT ATTTGGTTTTAAGAGTTTTAGTTCAATATCGATTTGATTTCATTTATTTG AAGCAGACATTTTTAAGGTTTAGTGTTGGAATCTATATTTTTCTAAAATA TTTTTTTTTATTGAACAAAAATATGAAACATAACGAGTTCTACACATATC TGGAGTAGAACAAGCCTCAGTAACTCAACCTCAAGTAGAAGGAAGTGTAT TTTTTATTGGTAAAAACAAAAAGTAAAACCCAATTGAGTTTGTACAATAT TACTATCTTATTATTTCATGTACATCATAGTTGCTAGTTTAGTCACGTGC TACACTTAATATATTTTCCACGAAGACAACATTTTTGAATTGAAATAAAA AAGTTTTTAATTAAAAAAAAACAAGTTTAGAGTATGTATTTAAGCTTGAA AGTACTACATACATACTTTTAACATTTTGTTACAAGTCAACAATAAAAAA ATCACAAAAAGTGAAGCTTATATTGAACATTTTATTTGTTAAAGTTAGGA ATCATCTTTTTGGCAAAGGATGTACAATATATATGTTATAAATCTTTAAT TTAGAGCTAAAAAAGAGAGAGGATCAAAGGGAGGACTTAGGCACCAGCAT AGTGTATGTCCAATTTTCATTTCTTTACTGAATATTATATTTAGGCTGTT CCAAAATGATAGAGACTGCCTCCGTAAGACAAGAAATTACATTCAACATA CATAAAAAAGTACTCAATCATGTCACATAGTCTAATCCGGGTCATATAAC TTCATGGAAATTGTTTTCCAACCCCTACAACTTAATGGAGAGCTCCTCTT CGTTCACTAACTTCATCGCCCACTGAACACCGGGAGTGAGGTCTTCATGG CTATCAAAATCGTAATCCCGTAGCAGGTGCGTCAGCTTACGGAAGAGAAA TCGGTCTCAGAGATTCAGTTCGTAAGGACTCTGTTTGATCGTTTCCACCT TTCTCCGCATTCAGAGCTGTTTCATCACTCATTCATCCTTATTTGCCTGA GAGAAATATTGGAKTACCCACAGGCTGAGGAGGTTTTTGAAGCGGATATT ATCAGGCAGGATTATAAAAACTACTGTGGTTGGTAGGGAAAGCTCCGCTG ATACCTTTCCAACTCTCAATTGGAGTTTGTTCTTTACCAAGTCCTTTACC CGGGCGATGTAGCTGGATGCCCTTGTTTTTCGGGGACGTCCTGATGAGAC ACTTTGCTAGAGATTAAAAGTACCATCGCAGATCTCACCAGCCCATCAAA ACATATGTTTGCAGAATGTATCAGTGTAACTGATAGTGAGGTTGGTGTGG ATCTCAGACACTGTTTCGCCCAGTTTGTGCCGTATCAAATGTACAAGTGA AAATTGTGAGTCTCCATTTTCAACGACGAATTGAGAAACATGTCCAAATG TGGTATTTAAGCATGATCTATTTTGTCTTTGAATAACTATGGAATGTTTT TCCACCAAAAAATTCATGAGAGAATCAATGCTGGGGGAATTTTGATGTTA ACTTTTCTCCTTTCCCTTTAAACGAACCTGTCTGAATCATTTTGGAGCAG CCTAATTCTTGAAATACTAACTATAACCCAGTTTTTGAATAAAAAACTTT TTTATTTCAGCTTAAAAATGCTGTGTTTGTGAAGATAAATCAATTGTAGA CCGTTACTTCGAATAGATCATATGATACTGATGAAATAACAAGGGATCAA TTTTGTACAAACTCAATTAGGTCTTGTCAAGTAAAAAAATTGAGTTTTAT TGATTAAAAATTTAAAAGTACAATTTTGTTTTGACTTTTGCAATCATTTT AAAAGCAAAGACCCCCCCTTTTAGAAAGAAAAAAAACAACTCCATGCATA TTTTTTAATAGAAAATATATTTTTTATCTAAATTGCTTCTACTACATTTA TTTTTCTTGCAGAGTCTCTTGTACCTTCCTAAAAAAATGAAAACGTTCTT TATTTTTGCAAAGAAAGTGACATAAAAACACACAGAAAAAAATGTCATGA GTAAAATAGATTATTTTTCCGTCTTTATTCAAAATTTTACTTGCAGAAAA TAAAGATATTATATCATCGTGATTTTTTTAGAATTTACTATCTTTATAAC TTGACATTTAGAAGTTTGATCTTTGAAGGAATTTTTTATATTCTTATAAT TTCATTCAAGCAGCTTTTTTCTTTAGTATAATTATTTAAAAAAGTTACAA GCTCTACTGCAAAAATTGTTGTAGTTGTTGTTGAAGCAAAAAACAAAACA CTTCTTATTTTCAACTTGTTGATAAAATGCAAAGCTTTCTAACGCCATTC CCACACAAAAATGTTCAAACTATTAATATCATGTTGTTGTTATGAGATCA TCACTATGAGTGTAAACGAAATGATGGAAGGAGTGATATTCACTAGATGC TCTTTTTATTCTTAATATATAATAAMTAWATTACATCTTTGTCCAGGGGA AGAGAAGCATGGAAAATGTGGTAACTATCATATTTTAATAATTAAATTTG TTATTTGGGAAATTCTTAGATTTTATTATTTAAAATAAAAAACCCCACTT TATTACCGTAAGCAACATTCTTTTTTTCATTTTTTTTTTGCTAATAAATT ACTCATATTCCATACCTAAATATGGGTCTACAATTCATATTTACATAATA GGAGAAAAACCTGCCGGCTTTGCTTTTCTTCTATTGGATAAGTTACCTTC ATAAAAACTTCTTATTATGAACATAAATAGCATAATTTTTTTTTATGTTT TTGAGGCGTCTATTAGCTCACAAGATACTAAAATACTAACTTGTCTATAC AAAATTGATTGAAKCAAAATATTAAGAGTGATGAAAATCGTGTGGTTGTT TTTAGCTCGCCCGTTATCTAGAATTGGTGATCTGGAAAATAAATTTTCTT TTACTTAGCTGATATCATAATTATTTTAGTTCTGAATAGTAAATGTCCTT TCCTACAACATTATTTTATATTTGAAACCTTATTGAGCATTCGTGTGAGC TCATAAAAGACGGAGAGTCCTCTTGAGTATTATTTGCGGATATATAGTTA CAAGTAATTGTTGGACTCAGAGTATAATTGATGATCAACATCAGAGTGAT TCTTGCTCATGTCAATGTTTATTTCCTTCTTCTTCCCCTCCCTTGTCACA ACTGATTGTAGCTGATATAATGAAACGTTATGACAGTTAAACTGCTCCCC TTTAAAACATTCTTAAAATATCGAGGGTTAGCATGTTGATTTTTCTTTTT AGCATCCCTAAAGTACGCAGGACGCAACATATTGATCAGTGGAGTGATGT AGTGAACAACGCGCTCAGGAACACATTAATAGCGTAATCTTAATGCGCGT AGATTCAATTCACAGTTGCTTCTAGAGAAATAAATATACATTATGTATAT GGAGTTTAAAGACAACTCCCAGATTAGATGGAGTAATTGAATTTTGATAA TATTTACTTATACTTAAACGGAGCAACTTATTCTGACCAATTAGAGAAAC ATTTAAAACAGCTTAATTATTAGACACCCTTTGANNGTCGGAAGTAAAAA CAGTAGCTGTTTAAGGCAATATATGCAACAACAATAAGGTAATAGAACCC GCTGTCTCAGGTTGTAAAACTGAGCTTTAACATACGAAACGTTGAACAAA CAAAATATCGAATGGACAAAACCTCGAATTACAAAATATGGACAGAGGTA CATTGTACATACCATGTTCAACTTTAAAAAAATATGGGACATCAAAAACA GACCCTTGCACTTCATTGACCATATTATGTATCATATCTTATGTATCATA TTTTTTTCAATTTCATATGGTATTCAGCACGTCCTTTCAATTTATGAAAC TCAACGTTTTGTGTCCTGAGGTTTTTCCACGCACCCTCCCTGGTTCCTAA TTGACGTTCAACTTTACCAAAAAATAAGAAAAATTTTATTGGTCAATCCA AAAACAATCTGGAACAAAAAAAACTCCAAAATATTTTTCAACTTTACTTG TACATTTTCACTTAATTCAAAGACATATTTGAGTTAATTATACACTTTGT ATTCAAAATCATGGAATACCCAATAACTGTAACTATAGTTTGGAACCTAA ATATGATTTAAAGTACTTATATTTGCCCCGATAATAATATATTAATTTAG ATTTATTTTTATTGTGCCAATCAAAATTAGTTACTCCATGGTTAATTTAA GGCGCAAAATAAGGGTAACAATAACTTGTTGAAAAAAATTGATGGTCTTT CTTTGAAGAAAAAATTTATTTCCCATTTAATTTTAAGAAAAATCATTCTA GCTTGCTTTTGTTCTTATGGTATACACAGATAATTTGATTAATTACTTAT GAAGATTTACGTGTATATACCCTGTTTTCTCCATATTATACTCGTCAAAG TTCAAAAAATACAAAAAAGATTTTGTATAGTTTTTTTTTCTACACAGAAC TGCCAAGAATATAGGTTTTAGTAAAATAAATACTGAATTGAAAGACATTC AGACACTTGGTATTGTAAAAAGTAGGATTTACAGGGCAAAAAATCAATTA TTCAGCACCAACTCGACTTAACTTTAAGTGGAAATTAAATTTAACAGAGC TTAAATGTATTGGTATTATAAGTTCCCGGAATACTTTAAGTCAAGTTGAT GCAACCGGGCCTTACAACCGTATAAATTTTGATATACATAGTAGGTCCAT TAAATTTGGAACATTTTGAACTTTAAACTTGAACAAGATATAATTCATTC ACAATAAAATTTTAACAAAATTAATAGTGTAAATACATGTGCAATTTGTG GCAATGATGGCTTTCAGGTGGTGGTGAAATGCCTGGCACCCACTGTTGAT GTAGTCTTCTGGTGGCTGACAGTAACTTTGAGAGCATCGGTGTTTGAATG ACGGACACTAAAGGTTTTCCTTCTGCATGATCCCAAAAGATTTAGTCGAG GGGTTTGGCATCACGGTTGTAGGGGTCCAAAAGTGTCAAAAAAGAACAAA ATAATTTGAAACACTCATTTAAAAGAGTCTTACCATGGTGGAGATGGGTC TTTTTCATTTTTGGTGTGAAAAGGGGCCTCTCCACTCTCACAAGGCTCTT TCTACCCCCTTCTGTTGATAGCTCTCGTGGCAGTCTGTTGTTAAAATACG ATATCTCTTGCATATACTCTCGTGAACTTGAGGCTATTAGCCTAGGCTGT TTTTTTTCACTCCTCCGGGTCAAGTTTGGCCTTTTTGACAGAACCTTTAT TCCTCTCCAACGTTTCGGAATTGCTTACGGCGTAGACAGTTATCCTGGAG ATGGCAACTGTTGTAGAAATTCGTCCTTCACGTTGAAGTGTAGTTTTCTC GACTTGTACGTTCGCTAGAGAGCTCAGGTTTGTTTTATTTTTTTACAAAT CGTTTAAGCTTTATTATACCAAAATATTAATTAATTTCAATTTCTCAGCC TTCATTATATATTTAATTATTAATGTTCAGATTTCAATGGACCAATCGGT ACATTGAAGGAAAAAAATATTTGAACCCCTCGCTGATTTTGGAAGTTACT ACTAATAAAGATTGTCTAAGCCTCTCTATTACCTTAATATACTTCTTCTT GAGCAAATTCTTACTTGCGATTTGCGTATGTTTTGGGTCCTAATAATTCT TGATGATCAATTTCACGACCAATTTTCTATGCTTGCTCCCAAGAGAAGTA GATTGTGGCCTCCAATTTTTGATACTGTTGACTCGTTCTTTCCCTTTAGC AAAGATATATCCATAAATCCTTAGGTTCCATCCGTATGCTTGATGTTAGG GTTGGTCTTCTTGGGGTTATACTCAATATTTATATTTTGTTCATATAATG TTTCTTATTATTTAAAGAAACCTATCATTAAAATTATAGACCCTCTTTTT CTAACCACTGTATTATATGTAATTGTTAATTAAATATAAATAACTAATTC CTCTCTCGTCTTAACTTTCTAGGAAAAGAAGAATTACCACTTTAAGTTCG ACGAGTTGGCAAGAACAGAATGTATGATTGCAAAACAGAATCTAATCAAC GTTTGCAAGTCTTCACGCTACTGTCAAAACTCGGACTCTATGCGACTAAG TGTTGAGGAGATGTGTACTGAGTATGATGAGCTGATAGAGATGAGCTATC ATGCTGCTGAGCAGTTACTTATGATAGTAAGCGTTTTTTGCTTTTGTTTT GTATTATATATGNTACTTTTGGCTATAGAAAAAATCACGGTACACTTTTT TGGTACGAAAAATGAGGGTCAAGGAGATTACTAA
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