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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s170 | supercontig | LSalAtl2s170:378620..402092 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000002987 >EMLSAP00000002987 ID=EMLSAP00000002987|Name=EMLSAP00000002987|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=141bp
MGKSNSKLKQETLNRLLAETYFTEKEIKQWHKGFLKDCPNGLLTEHGFIK
IYTQFFPNGDPTKFASLVFRVFDENQGQQPVNEDENTPQKRVEKIFDQMD
KNGDDKLTIEEFKEGSKADPRIVQALSLEPDTSNTVSTKIS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s170:378620..402092+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000002987-698834 ID=EMLSAT00000002987-698834|Name=EMLSAT00000002987|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=23473bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s170:378620..402092+ (Lepeophtheirus salmonis)
TGGAGGGGGAATGGAACTCATTTACTAAATATGATTTGGTGTCGTTGGTT
TGAGGTGTGAGGATCCCGTGGTAATTTACTGTAGTATATAGTAGTACATA
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TTTTTTATCTATCGTAAATCCTTTGGAGAATCTCCGCCGAAATAGCAATA
ATGGGAAAGAGCAATTCTAAATTGAAACAAGAGACATTAAACCGCCTATT
GGCCGAGACATATTGTAAGTAGACCTTATTTTATGATACTCTCCATTCCT
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ACGGAGCATGGCTTTATCAAAATTTACACACAGTTTTTCCCGAATGGGGA
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CTGAACTGGACCGGACTGACATCTTTAGTCCTAAAAGAGGAAGAACAGAA
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GCAATACCTATCCCGAATATAACTATAAGTGGCAGCAAGATAGTGTTCCA
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GGATTCTGGGTCAATGTGGAAAGCAGAGCCTGTGCCAATCCTCCCTCGTT
TGTCAACGCCCTTGAAGTTGCAGTTGAATAGCGTGATGTCGACGTTCTGA
GGGTCTGCAGTCGAAGAATCGAGGCCATGGTTGAGGCAGAAGGTGGACAT
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CTTTTTCTACAACCCGCCGCCTTCAGGAGACATTGGACTTAGCTCAGTTT
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AAGCTTGTGGAATGAAGCAGAGAATTTATATAATCAGGTATATATANTTA
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GTTTGTTCAGGTTCAGTCATAACTGAACTTGTTTCTAAAGGATCTTTATT
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AATGTAGCCACCCTTAGTGGCGATGATTACTTCCAGTTGACGGCGGAAGG
CCTGATACCCGCRAGGATGTAGTCATGTCCTAGAGTTCCCTAACAGTGTC
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TTGCACCCAAAAGGTGTTGTCAAGAGGGTTGGTAAAGGGGATATAGGGAG
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TAAAGGGTCACGCTACCAGAAAGGTTGAAAACTACTGCTTTATGATCTCA
ATATATTGACTGATTTTATTCTCAATGCTAATTGATGTGTTGTACAAATA
ATATGATTTATGCAGGTAATTACATCTCAGTTGACGTTATTTGTGATCAA
TATTCTCAATTTTAAAGCACATCTGACATGATCAACAATTCGTCTATTCC
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TCAGCCAAGTACCCCCTGAACAGTGAAAAATATTTTTAGTAAGGAAAAAA
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TAAAAGATTGTCTCTCAATGTTCATTAATGTCATACATCTAATAATTTTT
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GTTTTAGTTACTCATATAATAATGATATGTTTCAATTCCCATTAGGTGCT
TTTTTTTCATTTTATTCAAGGTATTTTCCATAAATTTTACCTATGATGAT
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ATAACGGATAGTGTTACCAGGTGGTTTAAGCAAAATTGGCAAAATGTACT
ACTACTTTAGGGTGAACATTTTAAAATATGAGGGTGTTTTATTCAAAGCA
GGGACTATTCCACTTAATAAACAATGAAAAAAGAAACCTTCAAAAGTCAA
CAGTTGTTACCATGAGAAGAAATTGGGAGTTATGGCTGCTCCACACCCAA
GTGAGTATCGAAGAGACCATAAAGAAGTAGGGTACTCGTGGAGTCTTGTT
ACCAAGATTAAAACATGGTAGCTTCAAGTCAAAGGCTCTCAATCTCAATT
AGACATTGAGGAAGTATGTAAAGGATTTGAGGGGGGGGGGGGGCTCTTAT
GTATGACCTTGGCAACTGCTTTCACGAGACAACGAGGCGCCAATCAGGTG
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ACCACTCTCTTCCACAGACTGTCCCCCTCTACTTTGCCATTTTGTGTGTT
GTCGAGAAGTGAGCCTATGCTACCATCACCGAAATTTGGGTGACTTTTAT
CTCGCTGGTGTCGATTCTTGAGGCATACTACAATAAACCTGAGTCGAACA
ACCATAAAGCTAGCTCAAAGTTTTTTTAAAGTGTGAAGCCTTATCTTTCT
TACACCATCTAGCGTAAACCGATGTCACTTATACACCGTGAGACACACAT
TATTAAACCCATCCAATTGAGAAATGATGCATCTCTTTTTTATTACGATA
TAATGTTTCAAAATTTCAACGGGATATGGTTGCTTCCAGGAAATGAATGA
ATTGTAGAAATTCCGTGAGGCTGTTTACAAAAGAAATAAGTTTCCCTATK
CCGCCATTTTTGAAAGTGCATGAATGTTCTTTTTGAGGGGAAGGGGCATT
TAAAGTATTTACCAMAAATTTTACCCCATCAAAGTATTAGTTTATATGGT
CAAATCCAAATATTAGACATTCGAATATAATAAAATACGTTTATAGTCGA
ATTTTCTCTCAGATATAAGTTTTAAATAACATGAAATGCTTGGCATAGAA
GAAGGTCGGAGTAAAAATCCATATAAAGTCAACTTTTTCTTCTCTTTTTG
GAATAAATTTCATAGGAATCCCATGAGGATTTTTCCTTTACAAATTGCAA
GCAGGAGCCAAGATTTTTGTTCTGAATCAGAACGTTACTCCTCAAATACA
AAAATACCCAATGTGTTTTACAGCTGTCGCTGTCTCCCTTGATACATTAT
GTGTATATCATAGTTTATTCTTTTTGTTAGATAAACGAAATAATAAGTTA
TTCTATACTTATGCTCTGTTTCCAAAGGACAGGAATATGATTTATTGTTG
AGCCCTCGTTATATACATATATATATAGGGCATCTTATTATTTCTATCAA
TAAATTTTGACTATCCCATACTAATACAAATCTATTAAAGCTTTTAGTAA
AAGGTTACTCAGGTATATTATGTTAAGAGTATCGAATAGAATAGGATTTA
ATATTATGAAATATAGGGTATACTCGTATATATATATCATTTACCAAGTA
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AAATCCCAAAAGTCAATATTTGTCCATATATTAAAAGCAAGAATGTGTAA
AATTTAATATGTTATGATTTTGTTTTTGGTGAGCAATAAAGCTTATAGAA
ATACCTTTATTATTTCCTTGCATAAATTTCGCATGTATTATTAGGAGAAG
ATCTATAAATAATGTTTTAAATGAATCTATTTATATTAGAAACATACCAA
TACCTAAATTTCAGTCGATATACATTCCGATACCCATTCCTTATTAATAG
TATGTTTAAAGGAATTACATAAAGAAGAGAAGAAAAAAACACTTTTTTTA
TGCTTAACTTTAAATTAGTTAGAGCTTGACACTAAAATATATCAAACATT
ATTATGTTCATAATTAAAATTATTTATAAAGTTGGNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCCTCTCCTTGT
TCAGGASTCAATTTTTCCTAGTTGGTACATATACATATATTGCCCTAAGT
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ATACTCTATACTATGATCCTCACATTGCTTGAGTATTAGAATAAGTAAAG
GTATGGGTGGAATCGACATTATTGAGTCTATTCTGGTGCATAGCTGCACC
CCCTACTATATGTTAGACTGTACGGAAATGACAAAAGTTGGGAATTTGGT
ATCCCCGGATATTTTTTATTTTGGATTTTATTCCTTTAAATAAGGAAATA
ACCATCAAACGTCCAAAAAATGGGTCCTCCATGACTGCATTTGATTTGAA
AATTGGTCAAATATAGAAAAAAATGAAATTTTGATGTTGTTTCCTTAAAA
TGATCGATTTGAATCAAGTTACAGGATTTTTATTTTATTAAGTATTATAG
ATTAAACATATATTTTGCAAAAATATTTTACCAATTTATCTCTAACTTGC
CTCATGTTAGGAGTATTTTAGTTCCAAACATGTTGCCAATAAATAAAATT
TCTCTTTTAGTACTGCGTATTACGTGCATGTATTTTGATCATTTTTTCCC
CTCATTTTTTGATAAAAAGTATCTAATTTATTATTATCAAATATATTTTC
ATTATTCATTTATGCCAAATATGACACTTTATTTTACTAATTATTAATTT
TGGACTACAAAAACTTTAGCCAAGGAGTATTTTAGTCTCTAGAGCCCAAC
ATGGCTCTGCTTTACCTACACACGATGGTTGTTGCTAAACCTAATTTAAA
GTCACATTCATTATATGTTTTTGTACTTCTTTTTTGCTTTCTTTTTTAAT
ATGAGCTCGTTGCTTAAAATTAGTTCTCATTCCACACGCAAATAAAGAAA
CAAACACACAGACATACTTTGCTTAATTAGCATAATAGATGTATTGGATA
CATAATAGACTTCATATTTATACATATACAAGTTATTTATATGTACAACC
AATTTAGTAAGTATATATGTGGCCTGTCAACACAAAACAAGCTGGAATTT
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TGATTTATTTTATTGTTAAAAAAGCCTTATCGGAGCTACTACAAGTCTCT
TAAATCTAAAAGAGGTTGTTATAAACTACGGTTAAACCTCTTGAGTATCT
GAACTCATCCCAGTATTTTGAATTATAAGGCCATGGTCTACTCAAATATA
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GATTTCATTCTTTTTATTATGGTTGTATGCCTATTTTTATGTTGACGTAT
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ATAGAAATTACCCGTCAAATCATAAGCAATCGGGAATGATTTTACATGTG
TATTTTTGTGCGAATTAACAAATTATTCTTATTAACTAATTGGGGTTTTT
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GAAAAAATTATTGAAAAGATGTTTTAAAGGGTCTTATCGGAGCCAATATA
AGTCTCTCAAATCTAATAAAGAATCATTAATGTGCTTAAAAGGCTAAACT
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TCTCCTTTCCTTGATGTTAATTCAATACTGTTTTTATCTTAAATTACCGC
ATATATAAATTCATTGTATATACAATCAATTTAGTAGGTAGGAAAGTATA
TATTGAATATAACATATAAAAAGATCTTCATTTAACAACATACATATACT
TGGAATTATTAAGTGGCCCCCCCCCCCCAACCTTTCTAATATATAAATTG
AAAAGAACGAAGATTAGACTTCTTTTGACTATTTTTTTTAATGAAATAAC
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ATAGACTCTACGTTGTATTGTGTATTGTATCTTCCTCTTTTTCCCCAACA
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GAAGGCCCCCATTGAAAGATACGAAGCCATTGCTCAGAACACTGCTAGGA
TGTTCCGTCGTACTTATGGCGTTGTTGTCGTCTGAAACTAATGAAACGGT
CAATTCGGCGATTTTTGACAAGATCAACCGTCCAGATTTTACCATCTCGG
AAGATGGTAATTCAACTAGCTGAAGCTGACTTCTAACAGTTCAAAAGTCC
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GGACACTTTCCACTTTAAGGACCACATTTCCCTTTCATCATCTGCCATTG
TAATGAATAATCCTTCACGCGGGAACGGCAAATAAGGACTTGTCTAAGAT
TATAAAAGTCCATATAAGGGTTATTTGCAATCAAAATATGGCTATTAGTA
CTTTGGGTTGTCATCTGAGTCAAGTTGGAGTTGCTGGAAAGAACAAAACC
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TTATAAAAGAGAGAAATAAGAATAAGACAWAATTCTTTCGATCAGCYCGA
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ACACTCTCCTTTTTGGAGATCAACATTCTATTCTGGTCGAAAACAATGGC
ACCGTCATATTTGTCAGATGCCAAACCGCTCAATATGTCGTTCTGACTCG
AAGCTCTCAAGGCTTCTGTGGATGAGCATTGGAACTCCACGAGTCCCAAT
TACATTATTAACTCCAGTTAGAGCTTCCAGCAGCACATCAAGGCCATTAT
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CAAAGCATTGAAACTGGTTTACACAACTTGGACTTTTTAAGATTGTTCAG
GAATCCACTAATTTCCATGCAAGACCCGGCATCAGTATATATCAAACTAC
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CAATAAGAATAAAATCCAAATGTTGTTAGGTATGGAATGTAATTAATGTT
GAGACTCATGTTTAATATCTTTTTTTGCATATAATACAAGTATATAGTTA
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TAAATTGTTCTATTCAATAGGCCTCAAAAAAAAAGGATTTGCCTCTATAC
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TCCAACGGACAAGGAAATGGGAGGATTAGATTTTGTGTAACGTACCCATG
AGGGAAATCGTGTCCATGCCAGAGATGATTTTGATTAAATTATTGCCGAA
TGTATGTATTTTCATCCAATTGATTCCATACGGAGTTCCTTGGATCCAGA
AGACATATTCTAACACGAATTATGTTTTATAYCCTGCCACACCTTCAATG
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TATTTGTGGAGCGTAGTTGGGAGGAAAATGTGGTAACGCCATCCAAATGT
TGAAACCCTTTCATTTAATGACCCTTAATTGGTCTAGAAGAAATAAGCTG
TTCCCCTCACATAGCTTCTGGTCTAGTTTGCAGAACTTTATAGCGGCTGA
AGGGGTAAAATTTAATTATTAATTACACTATTTGAAACTGTTATTTCATC
TATTGTAAACTTATGAGTCACACCGTATAGTATTTAAATTAGTCCACCTT
ACCTAGGAATTGTCTTTGAACTCTTTAAAAATATATCATGTTTATTTCCT
TCACTAGAAGCGACTGTGATTCAAACATACGCACATTGAGTTCACGAGAA
TGATTATGATCGATGAAAATTATATGAATATGAAAATGGGTTTCTGCAGT
TGCTAACCGAATATTTTTTTGTTTTCCAAAGCCTTTATCTTTATTTTGAG
TCCAACAAGGACTTACAATGATAACTTTAAAAAAAAGACAACAACATATA
CCAAAGATAGGGGATAATGCTTACTACAAAGGTAGAAGTTGACACCACTA
AAAAATTAATGAACAAAAAGAACAGTTACCTTTTTCTAATTTTTAATGGG
GGGGCTATTCAAAATAAATTCAATTTTAGCCAAACTTTCTGGCTTTGATC
CTTGGAGTATCTAAAGTATTTCGTTGGCCTAAAACTTTATTTGTCTTTCA
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TTTGAAATTCAACAGAATAACTTAAAATTTCAAAATTCAGCAACATAACT
TTATAATTCAACCTTCTGAATTCCTTTACAAATAGAAAATGCCGTTAAAA
AGTGTCATTTTCAAATAGCTGTAAATGTAAAAAAAAAAAAAAAACCTTCC
AAGTCTGAAACATGAGCAACTTAATTTTTGTTGTAATAAATACAACAGAA
GATCGAATTAAAAGGTCCCTCTAAAAATTGGACAGACTAGTACACACGCT
AAAATAAAAGTTTAGAAGAAGTTGTTGACCTGTTTTTATCTTTGACCTTC
AAATTGTCTTTATAAACTGACAATGTTAGATATAACATTMGTATAAAGTA
AGTATAAAAAGGCTTTAATGATCGCTAAATGAGCGAATTTCTTCTTATCA
CTTTGAAAAAAGACGCTTTTATACGTGAAAAARTAATTTAGAGGGTAGGG
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTATACGTGAAAAAGTAATTA
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AGYGCTAAAAAAATCATTGCAACGCAAAAGTTTGGCTCAAATTTAATTTG
CTCATTTTCATGAATTAACTCCCCTTATTATTATGTCAGCTCTAAAAATT
AAAAAAACTTCTCAACAAATCCTCATTGTCACTCCATTTTTTATGAGCAT
AACCACAAGTAGGGAGACACTCATGCTTACACTTATATTCTCTCCTCAAG
AATAAAATAATAAGAGCTTAAGGTGAAAAAATAATATGATTTGATGTGCC
AGAAAGTACTTTAGTTCCTCACAAAGCCTCTTGAAAGTCACATATAATAT
ATTTTTATAAAGTACTTTCTTTTTTTAAATGACCTCACCTAAACACCAGR
AAGATTGAATTCACATGCCATTTGTATACAGTTCTATGGATTTGGTCAAT
GGCCAGGGGAGTGAAATGTGAGGGGATAAAATGACGGGGTAGTAAATGTT
TGTTTCACACCCACCTGAAATACACTCCAAAGTTACAATTCCAACTCTGA
CGAGCTCTGCAATTTTCTTTTGAGGAAATGGAGTGTGAATAATTTTTGAA
TGTATTTCCTTGAACCAAATCTTAGCTTTATAAACAAAACATTATTTCAT
TTGTATATTTGTACCCGTTTTTGCTTAAAATTAAAGCACAAACAAAGGGA
TATCATCGACCAACCACTTTTTATTGCTCACCTTGTACAATTCACTAGTA
GGCTTTTTCAGTCCATTCATTTCCTTTATCTTATACAAGTATAACAGTAT
GCATTACATTTCACAAAACATATAATTAATGACATATTGAGTTGCCAAAT
ATATTATATATATAATATAAAAAATTCTTTATAGTAAAATACTGCTTTTA
TATTTTGCTGCAGTATTTCATAACACTTCAACCAATTGCAAAAAATAGCG
TATAGATATTAGATTTGGGGAAAAAGTAATTTCGTATTTACTTCCCTTTT
TTTTTAACAAAGTATATCTTGTTCATTCTTGGTAACATCGGATCATGCGA
TAACGTGTGAGTGTATACTCCAACCGCTTTTCCGACAGTATTGCACTTGG
CTGGMTCAGMCCGGAATTATCGTGCGMCGAGMATGGAGGMCTCAAAGAAA
GAAATTCACCATATATTACCATTTTATTTCTTGAAAGGGGAAAACACGTC
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