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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s172 | supercontig | LSalAtl2s172:228886..241761 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003048 >EMLSAP00000003048 ID=EMLSAP00000003048|Name=EMLSAP00000003048|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=323bp
PPITRFSRGSSIRQFKSVHQHVSLSRANSAPPSTSLNSRQSDDLLLHRGN SFVMSSLATPPLPRPRLNVKQDGTAAAIKVFLPSGEAKQIKAPDTIDIKG IIQLLMSRLSDDEKAYTHLYAMRLMNAEFREPIWLHQDMTLSQVKANYFD KMNSKDWVFELRIRYLPTDLSDLYDRDKITFSYYYDQVRLDYLNKNFESL DLDTAIQLCCIEIRRNFKDMPGNVLDKKSNFEYLEKEVGLQTFFPSAILK NQKSKVLRKLIQSNFKKYGNFTDYECVFKFFEILKSVYRFDLERFRCALG AITCFFPYYTYIFFAFYTQTYTK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s172:228886..241761- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003048-698895 ID=EMLSAT00000003048-698895|Name=EMLSAT00000003048|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=12876bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s172:228886..241761- (Lepeophtheirus salmonis) CCACCCATCACACGGTTCTCGCGAGGTTCTTCCATTCGACAATTTAAATC
CGTGCATCAACATGTGTCTCTATCTAGGGCTAACTCTGCCCCACCATCCA
CCTCTTTGAATTCAAGGTAACTCCTAGTTCTACTGATATATGTATGTAGT
GTGCTCCAAATATTTATTGAACTACTTCACCCCTGACTTTTTTGCTGCCT
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GCACCCTACAAAAGTAATCAAAGGGGTTCAGAAATCCGCAAGTAGTTTTG
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GGAAACGGAAGCTTTAATTAATATTAAATTATTATGTAGAATACATATAA
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TGCTTGTAAAACTTAGCTTCAGGAAGGAAGTCGTTGAACTTGAAGTTTCA
TTTCGTTTCGTTTTATTTCATTTCTTTCTTCGTCTCTCTGTTCCTTCTTC
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CGAAACAACTGCCCAAAACGGTTACGGCTTRTTRTWCTCCRKTRCKTGTT
TTTTTTRTWACTWCGTARAYRATACATTWTWCCTGTCTTMGTGCGATCAT
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CTTGCTTAGAGTAATAAAATGCAAAATAATAAATATCCGGTGATACCAAA
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AGCTATTCGTAAAAAATTAAATTTTTTGGAAAAAAAAAATTAAGAAATTT
GATGCTCTACTTCAATATTTGCACAAATGACGAAAGATAATTATAGTAAA
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TAATTTAATTTATTAGACTAAATTTGGCCTCTTACAGTTCTTACAAAATT
CGTTTAAGCTTGCTTTTGTCTTGATGGTCCACATATTTTGTATTTACTTG
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CATGCAATTTGAATTGCACGCGTTGTTGCTCATTCCTCTTCAAAATTGAA
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TAACTTCTTCATATTTTTATTTTGCGCCATTTTAGGGCAAACTTTTTAAG
CAAAAGTTGGTCATTTAACAATTTTATTCAATATGTCCACCTCCATTCTG
AATGATGGCTTCAATACGGGGACGTAGAAAAGTACAGTTTGCCTTGATCA
AGTCCGAGGACAAGTTGTTCCACTCCTCCGTGATCACGCCCTTCTGAGCA
AAGCCATTCGGATGAGAAGTCTTGTTCGTCTTCCCCTCCAAGATTTCTCA
AACAGTTAAGTCCAGGGGTTCACGTTGGGTGAGGACGAAGGCAAAAAGGC
CAGAAGGCAGCCATGCTCKCCCTGCCGAAATGCTGCAACTTCTTGGACGT
TTGTGCCTGGGTACCGTCTTGGATAAACACATAGTTGCCCCTGAGGAACG
CGCTCTTCAATCATAGCAAGGCATGGTACCGGAGGACCTTATAGTAGACG
TTCGTATTCACTTTCTCCTGGGCCTTGAAGAAGTAGGGATGCATCTTGTT
GCCGTCGGACGCCACGAAGCTGAGGACTCTAACTTGAGATAGATGTTTAG
TCCTGAAGGTTCCCTGGACGTGAGCTCTTGATTAAGCCCAGAACCGATCA
TTTCTCCTTTTCAGAACAGCGTCCACTCTGAAGATGTTCTTGTCAGAGAT
CTACTTGTCTGCGGAGGAGATCGCACACCCTCTGCCTTTTTGCTTGTTGT
TCGAACTTTTTTGATCGCATAAAAACAAAACAAACATCAAATTGTTGCTT
TTTGTCAGCTCTTTTGAATCCCGCCAAAATTGTTAGACTTTTAGAACTGA
GTTTAGAAGGACTCGGAAGATTATTCTAACTTTTGAGTCATCATCCTGTA
CATTGTTTGTAGATTAGACTGTCCACGTTTCGAGTTAAATTTTAATCAAT
TTGACACTGGGAAGAATCAAAAACTAACTGTGGCAAATTTAGAAGCCGTT
GTTGGCATGCCTTTAATTTGAAAAATATGATTTTTAGCTATTTTCAAGCC
TTTTTCACCGTTCCAAATATGAGTCAGCCTTTTCCATTTTATTATTTGAC
AAGGTTGTGCCCATTTCAGGTTCAGCGGTTCTATCAGTCCCGATCTCGGT
TCTGCTTTATCGTTCTCACTTCCGGTTTTCGGTCTCTGTTAATTTTTATA
CAGGCTCGTTTTGGTAACAGGCACTTAAAACAAGGGTCGTCGCTAGAAAA
TTTGGGCCCAAGAAATGATATTAGATATAAACAGGGCCGCAACTACCTCA
TACGCATAGTGTGTAATGCCCCAAGTTCCAGCAGGGGTCCCGAAAACTAA
GGTTGCTTTTTACAAATCGAGTGCCGTGAGGGAGGCTAGGGGGATTTTAA
TATTATTAATTTATACATGTGTAATTCTGAAAGTAATTTTAAAAATTGGG
AATAAATATGGTTGACTAATTTGGCTAACTACCTGATTATTTCGGTCTTT
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TGTTTTATTTACATAAAGTTATGTAGATGGAATATTAAGAGGTTATAAAA
ATACTAAGAAATACAACAAACGAAAATAAGTACAATAACCGAGGCCGATA
AGCAATATATTGTGGTCTCGGTTCGACTTTTTTGGTTCCGGCTCTAGCGG
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TTGGGTACATTATATAAGTTTTCCCGTACGACATATTTTCTCTTTCTATC
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TTCCCATTAATATTTCCAAATTTGACAGGATTTTGATTTTTTCTCTTAGT
GGATAAATTTTTGTAAGAATACCGTCTCAATGGTGGTCAAAGCTACAGGG
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AAAATTCCTTAGGAGCGTTGTATGAGTTTTCATCATAAACATCTTGGGAA
CGGGGGATTTTCTTCTCCGATGAACAATTTACGGAATCTGTCGTCGCTAC
TTTACAAATAAATCATCTATAATTCATAATTTCAATATAAAAACATATTA
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CATTAGCGAACAATGCTGGCCATTTTTTTTTTTTTGCTAGACCTTTGAAA
AATTTACTTCCTCAGAATATCACAAAATTTAAAACTACCTATGTTATTGA
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ATACAAACCCGTAATCAGAAAGAAGGGCACAGCGTGCTCTACGGAATATG
TTAAATAGTGATGTTAGTTCTTGAATTGAAATTGTTTTCCACTCTTAGAA
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ATTTATGTAATATCCACTTAAGGATAAAATAGCGTGAAAAGAATCCCCCT
GTTTGTCTTTATTTTCTTTTTGCAAGAGATTGACCCTTTTTTCGTAGTAT
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ACATAAGAAACGCACGCTCAAAAACGGTTTGGTTCATGGGTATGTTGTAC
ATAGTATGTATGTACATACTATGTAGTCTTGTACGAAAACTTAAATAATA
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TCAATTGTGTTACTCTATAAAAAGAAAAGGAAAGAGTAGTGAAATTAAAT
AAAATGATAACTCTATCATCCACAGTCGTTGGAAACAAACATTACTAATA
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GATTTGATTCATTTGTGTATTACACAATATGAATGCCGCTTGGYACAAGC
GMCACTCTATTCTACTTMAGGMACCTAATTGGCCTAAGCGTTTACTTCAT
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GTCTGCATCCTCCTCTCCGGATTGGAAGCTCTCTGAGAGTTTTATATCAA
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CGTCGGATCCGTCCTCTCTCCGTTGGAGATGCTGCATTTTCAAGGTCTGT
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TCTTCATATTCCTCTAATAGCTGATTACTTAAGCTCACATGGCTTTTTAT
TAGAATCTGTTGAGGTGTATTTACATTAGAAGGGTTTGATTTTCTACTTT
TTTCGAATTTCGATTATGGGTAGTCTGAAAACGTTGTCATATTTTTTGGG
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TAATTACAAAAAATACATTTTTAGTCTATTTACAATAAATAATTTTTGAT
AGGCAATTTGTTTATAAAGTTTGTTCCCTAAAATTGTCTTATGGAATACA
AAAAGATAGGAAAAATTGATTATCCGCGTTTAACCTCCTGTTTAACATTT
TCAGAATGGAAGGATCAACATTTTCTCTTTTTGCTCCGTAGGGTATTTTT
AGAAAAAAAAAACTTTATTAATGTTTTTTATAGATTAGAATCATGTCTAT
CATAATCAATTAATCCAAAATAATGCTTAATGCTGTATTTTAATTCTTAT
TGACGAAAAAATAACTTTTGTTTCCTTTTAAACTTCGAATTAGATGTACT
AACTAAAGATGACATTACCAATAGGGCAATGAAATTTTGCATAAGTTATT
TTCTTGCTATATCACATCTTTATCGAACTAGACATAATCAAATTTTGAAA
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ATTTGATTAAATTTTGAAATTCATACTTGTTGACAAATTTTCAAATTATT
TTCTTATATATAGCAGTATGCATCATGAGTTACAATTGTTTGTCCTTGAG
GGATGACTCTATTTTAGTTAGTTGAAACTCAAATTTATACAAGAGTAGTT
AATATTTTACTTGATGCAACATGTAAATATGTATATTTACATGTAGCTAA
GTATAAGAAAATATGTAATACTATTTTAATATATTTTGTAAGCGTGACGT
AATACTAAGGGTCATCAAAAATTAATTGCAATACGAATTGGATAGGATAA
ATGTCTCTATTTTTGCGTTATTGTTTTTCTTAACTAGAAAGTGCACCTTA
TTTATGAATTTCTCCTTCAACAAAAAAAGTATATATTATTTTACTTTTTG
ATTTAAAAAATAATTAATAGGTATCTATTAACTTAGCTTGTTGTTGCACG
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TTCGTCTTGATTACTTAAACAAAAATTTTGAATCACTGGACTTGGACACA
GCCATCCAACTTTGCTGCATCGAGATTCGGCGCAACTTCAAAGACATGCC
CGGAAATGTCCTTGACAAAAAATCCAACTTTGAATACCTTGAAAAAGAAG
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AAGGTTCTACGGAAGCTCATTCAGTCAAATTTTAAGAAATATGGAAATTT
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ATAGATTTGATCTGGAACGTTTTAGATGTGCCCTGGGTGTAAGTTTAAAA
TACGCATTATTTACTCATTATCCATATATTCTGATTCGGAAATCATTCAT
AGTCTGGTTGGTCCATACCTGTGGAACTCGTCATTGGTGCCTCCAAAGGG
ATCGCTTATATCATTGATAGTGCAGTTACGGTAAGAAAAAAAATCAATAA
ATAAAAGAACATTTTTAATAACTTTGTCACTACGCCTCACAGTCTTACAC
AAAAATATACAGTGTATTTCCTTGTCAACTGGTGATATTTTTGTTTTTTT
AGCCTAACTAATGTTCTGAGCGTTGATTGGTGGAGCTATCATTAGCTCTT
CTTAAGGTGTGAACGCTTTTCAACAATTATGGGATAAGAGTTACATAGTT
GGGAGGAATTGGGTAATTACCAATTGTTTTTGGGACTTTTTTCTGTTTCT
TTTCTAATAGATTATAAAATAAAGGGGTAATGACGTGTTGTGTGTAGAGT
TGCCAACCGTCCCTTGAAAAACGGAATTGTCCCGTATTTAGAAAAAAGAA
CACCCGTCCCGACACTTGCATTGAGGTTTCCCTTATGTATCTGGTGTGGA
TAGTCTTGTGTTTGTGGATATTTAGGTTTGAAGACAGCAGTCCCGCCCAG
TTCAGTATCGGTCCGATCCAGTTTTGTCATATAAACTTTCCTGTCCTTCA
TGACGTAACTCAACTTTATTTCTTCTTTATTTTATAATTTTTAGTACTCT
ATGAGTCTTAATGACCGGTGTTAAAAACTGATGGGACTTCTCCCAAGACT
GTACTGAACTGGACCGACACAACACTAGTTATGGACATCCTTTATATAAC
TTTATGATGTGTATATTATTTAGAATCACCACTTTATCCTTGAGATGGGA
GTAATAATACATTAGGATAGCTACTTTTAAAGATAATTGGAAATATATTC
TAATTTTTTGTGTAGGAAGGTGTCTGTACAAAATTATAATAGTATTCCTT
GGATTCCTTCCTTATATAMTAGCCATAATGCTGATAGTCCGTATAAAACT
CACAATTTAACAGTCATACGCTGTAAATTTATTGGATGATAATTGTTTCT
GCTTTTCTTATTAATTGATTTTCTAAAATATCTGCATACACATAGATAAT
AATACTTCTATACTTTTTCATGGAGTATTTTTGATGATGAAAGCAATGAA
TATTTATAATGTGATGTCTATTATGAGACGAATTGACAATAATAACTTAC
TCCTCTTTCGTCATTAAATGCCAGGGGTGTGGGAGGGTATTCCATGAAGA
CTACTACGATAATGATCTTTTTTAATTCATGAGATTCTATTTTTTTTTCT
CTATAAGGCAATCACTTGCTTTTTTCCATATTATACCTATATATTTTTTG
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