EMLSAT00000003050, EMLSAT00000003050-698897 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000003050
Unique NameEMLSAT00000003050-698897
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s172supercontigLSalAtl2s172:319007..348347 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000003050 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000003050EMLSAG00000003050-685816Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000013380EMLSAE00000013380-722308Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013381EMLSAE00000013381-722309Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013382EMLSAE00000013382-722310Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013383EMLSAE00000013383-722311Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013384EMLSAE00000013384-722312Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto776544auto776544Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000003050EMLSAP00000003050Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000003050

>EMLSAP00000003050 ID=EMLSAP00000003050|Name=EMLSAP00000003050|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=353bp
MSSPLKSITPLSILRKDYWMIEKXGCGGFSKVYLXRHKIDKTYRAAKHQR
VTDSNLMKVSRREARVLLHLTEGRAEYLRKHIVNFINYFEGEGQSVILME
YLPGGELFQRISSPSYKLTEAKCRDFVRQILLGVEFIHSSGIIHLDLKPQ
NVVFTSNNQSSPSGSRESDTLKIIDFGLARYLESDTIPINRCGTLEFISP
EVLKCIYAGTFSDMWSVGVIIFMMVSGGYSPFWAGDEYKTTRRIKRCQYA
FDPTIFKSVSTQAKNFIDKLLTESTLERLSATQALKHEWMTGSYLETLKV
LETTWMRKYLARRRWQRWFNAVKAMNRLTRLLNSDDKSSWDSKIGLEVTN
GIS
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mRNA from alignment at LSalAtl2s172:319007..348347+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000003050-698897 ID=EMLSAT00000003050-698897|Name=EMLSAT00000003050|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=29341bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s172:319007..348347+ (Lepeophtheirus salmonis)
TCTCTGCATACAACATACTTTACCCTTTATGTATTTCATTTTTATTTCTC TGCTTCTATGTATTTTTTTTAGTCATCGTATTTTATAAATAAGATGTAGT AGTTTTGAATATGTTTTCATAATGTGCGGAGGGACCGTGTGTGGGTTATA TATATACAGTGAAACATTATTATTCCTCTGTGGTTCTCTCATTTTCTAAA CCTATCAAATTAAAAATATAAGTTTTGAGATCATAAAACGCAGGCGACTG ATTTATTCAGTAAGTTAATCTTTTATATTTAGGTATCATATACAAAAAAT CTTCAAAGATCCCTTTGATAACGGTTGTTATTTACGTACATTATTTGTTA AATGATGTTCCTTTGAATAATAACATACTGGTTCCGTTTATTTGTAGTCA TTAAACTTATCTAAGGGAGTATTTCAATGTTTTTTTGCGTATATGTATTT TAAGAAGTCAAGAATATAATAATAAAAATCTCTATATTAAAAATGATGAT TTAGAAAGCTTGTNTATATATATACATAAATATAAGGCTTATAGCAATAG TATGCATTTAAAAAAGTATGTAATAGGAGCCAAAATATATTTCTACAACC TAATAGTATTATATGTTTAGCTACTTTATGTATTATTTTATTTGTTATTA GCAAATGATTTTAAAAGTAATGTTTCATTTATAATAATAATTTGTAAATA TTTGTCAAAAACATTTTGAAATGAATCAAATTGTGTATTAATAATTTTTG AAATCTTAAAGATGTACATACTGTCCGTCCAAGAAAATGCTTAGCATTCA AATACCTATTTTTCGTCGTTATTTAATGACATAATTCTTTATTTACTAGT CACTTAAAAACAAAAAATATATATATATAATTAATATTAAGAAAAATCTA ATCAAGGTTGCACGTATAACTTTCTTAGAAGGAGATTGTGTGTACACGAT ATTTATTTTTAAGTCTATATGTAGTGTGTAAGGGTCTCATTTTATCACTT TAAACATATAGAGTACATATCAAAAAAATAATAATCTTATTAAAGTTTTA TATACGTACTATCAATAACTCCAGAACAATTTAAAAGGTTATCAAACAAC ATATACTCATTTGAACTGTTATTTCTGAGACCTTGAAGTTATGTCAGCCT TATGTTCCTTGTTTATTGTAAAAATGGGTGTGTTCATTCAATATAATAAT AGGATATAAGGGGGGAGGGGGTAATTCCTTTATAAGACATAACTGTTTAT CAAGTCTTCCTAATGACCTCATGAAACCCCGCTTTTACTTCATTATTTAT TGTCAATCATGTTTAACGTCTGGCACGACTTGTCTGTATCGTGGTAAAAC TTAGTAGGATATATACAATAATTATGACTGAAAACATTATGAAATGTGAA AATCCCAGCTCAAAGCACAGTTGATATCACAAAAAAATGATGCCAAGGAG TAATTTAATTTTTTTTTGACAGAAAGTCGATTTTCTCTTAGTGTTTAAAA TTTGAGATTCTGTCAGGTTTTGATTGGATCGAGTGTGTCTTAGTTGCTAT TCTTGTTAATCAATTTGTATTTTAACAACATAGATGGCGTCCCCCAAAAA AAATATGTTCGATCATTTTATATTTGATTATATTTTTGTCAACTCTGGCA ACGAAGTTGAACGGAGGTTATGTTTTTTCTCTCTCTCTGGTTGTCACCAG GATTAAGGCAAAAGTTACAGATCAATTTTGATTTAATTTGATATGAGGAT TATATTTGGTCAAAGTAAGAGGCCATTAAATTTTGAGAGTTTAAGATATA ATGTCAAAATAGCGGAAAAATATAATCTACAATAACTTTGGAAAATTATA CGGTACAGAGTTCAAATTGGTATTTTATGTAGGTTTAATAAAAGTGCTTT ATATAGTAATAAATTCAAGGTTAATATGAAAGGWCAAATTCACACAAAAG GTCAAAAATGCATAATCGACCATCACTTTTGAACAGATTGTGATACAGAG CTGAAATAATCTCTTTGTGGCACACAATATGTACATATACATATATAACA CATATTAAAATATGAATACAATAGATATTAAACTCAACTTTGCCCATTTT CACTTAAACATAGAAATGATGTTTCATTAAGTAAAAATGACCATAGGGGA GATTTGCGCTCTACCGAGTACTCTTTCTATTTCTTATGGAACTTTTCTGT TTTTATAGAAGTATAGGATGATTCCATACAAGATTTGGAGTAATTGATGT GTACTTAACTATATTTTCTCCGTTGTTTTGGTCAACTAACTTGACGTGCA AGAATAGCTACTAGGCCGCCCTCTATACAATTAAAAGCTGACAGGATCTC AACTTTTAAATGCTAAAAGGAAATCAAATTTCTGTCAAAAAATTAAATTA CTCCTTGGTATCATTTTTTGTGATATCAACTCGTCTTTGAGCTTTGATTT TTCACATTTCATATTGCTTTCAGTCATAATTATTGTTTAAAATCCTATTG ATTTTTGCTGCGACACTTGCAGCGTGTATCTGCAAACAAGTCGTGCCGAA CGTTAAACATTCTCCCTATAGGGACTATTCAAGAGAATAGCTGAATATAT TCATTATTAGTACTTTGGAATATAGATTATGGACTATATATGTGGAACRC AAATGGGGGGGGGGGGGTCCTCCCTTATCTTTGATAAGGAAGTCTTATCC CTTCAACAAAAATCTTCATACATACAATTATGTACATGAATATTAAAAAT ATAATGTCCTTGTTTTAACATTCTATCAGTATGTTTTGTATTTATATTTT AAGAAGGAATTTGTCACTTAAAACWCAATTTGTATTCCCCCCCCCCGTTT TATCTAATGCATTTTACTATAATGTATCAAGTTTCCTGTTAGTCGGTAAT TCACTGAATATATTTTCGATGTGATAAAATTGGGTTAATTTCGAGACTTA TTATTTCTCTGTAAAAAAATGTCGAAAAATACCTGTTAGCTGAAGGAGAT TTCCGTCAAAACTTCGAAACTCCCTCAAGATGTCACGATCTCCTGCACCG ATAGCAGTGCCTAGAAGTCTGCAAAGACCCTTGGAACNAAAACTTATGCA GAAACAATATGATTGACTTCTGGCCTACCTTCATGTGGCTCTCCTCAAAC CCAGACCTCACCCCCTGGGATTCTGCAGTTTGAGACAACTTGAAGAAGAA TGTCTGCCACACCTCTCATCCAAATTTAAATTTGCTGGGATAACAGTGTG GTACATCATGGCACGGCCTTAATCGTCAAGAGCTGCCAATATGTTCGCCG GTGTATCGAGGCTGTTATTGCTATAGAAGAAAGACATATTGAATAAAAAT ATAGCTAAATATAGTACATAAACATGTCACAAATAGGTTTTGAGTTATCT GGGTTCCATAAAAATCAAATTTTTCGTAATTTAGTCATCCTACAACAAAT ATTGGGTCCCCACTCTGTAGAGTAATACATTTATAGCATCCTCGACGTCC TATTGGACATTAATATATGTATAATTGATTTCTTCCTGTATAAGTTTTAA TTTGTATACCTAAGTAGGAATTATGTATCTCATAATTGATGTTATTTATT ATAAAATGTGCCAAAAAAAATAATTATCCATTAAATAACACAAACGTTTG CCCTTGGATTGAGATATCTTTTATCTGTATAAACAAGAAAATAACTGTAG GTATAACTCAAAATTTCTACTTTTGTTACAAACAGAGAACAATATTATGA ATAAAGCCTCATAGATGAATAATTATATAACAAATCCTTTTATTTTCCAA 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CATAGCTGCTCCCAGCTCTTCTAATATAACGTCATGACAGTTAAGCTGGT GTCCTCCCAAACATCCTTCAAATTCTTAGGTTATTTTCTCTTTCTTATTA AAAACATATCAGTAGGTTATCTTTTTTACAACTATTATATATATTATTCA TGAAGATACCATTTTTGTAAAGAAAAAACTAAATTTAGTGATTTGAAAAA TAAAAATGGTTGTTGCAAAGGCTATTTCTCCTTTTTTGTTCATTATTTAA TAACCTCTTAATAATATGTCGTTGTGGTGTAAACTTCTCCCTCTGAAGTA GGTATTCTCGCCTATCTTTGATGTAGATTGTTTTAAAAATGCATAATACA ATAAATATACATGAATACTAGCAAAAGCTTATCTGACAATTATCAGGCCA AGGAGGAAGAAGAAAATCACATTGAAAAAAATTATTCAGAAAATACTTCT ATATACTAATAATTATAATATGAATGTTTTGTTGTTGTCGAGATAAATTC TGATAATTCTAATTCTAATCCACTTGGATTCTTTGTGCTCTATTAATCCG ATTAAGTAAGATAATCCACGAAGTCTCATCCTAGCAACCCCCTCCCTCAA AAAAAAAAGAAAAAAAAAGTAAAAACCCTCATTATATTGGCTAATTGTAA CCTTAATATTATTATTATTAATTAAGAAAAAAAAGTCCTATAAACTCAAA TAACATAACCAACATATATGCATAAAAATGGTCTAGATAAGAAATCCATT TTCATTTACTTTAAAATCCCAAATTGAAATTCTCGAAGAAAATTGCAAAA AAAAAAAAAAAATTGTAATTTTGAAAAAAAGGTGCGAATAGTATTTATTG GAATTGTAAAGAGAAACACAAATACACCATTATTTTTTTCGTATCTGCAA AAATAAAACAGTTACGAAGAATAATGTTATCGAAAAAATTACACAGTTAG 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ATAAAATTATTAATATACAGTACACTATGTATTTATATCAGACTTTAACA GAAAACATGTTGACTTGTTCATAGGAAATAGGTTTTTTTCCCCCCAAGTC ATTTTTCATAATTATATCAATGCAAAAAGGAAAAAAAAATACTCTGAAAT GTGGGGGCGTATATACTATGCGGTCTTTCATTGCCTAAGGCTTCAAATTA AAACTAATAAATGCATGATTTATAACATAAATCTAGTTTAAATAGTAATA CATATAATGGAATCATTGATATTAATTAATAAGGACATCATGCTTCTTTG ATTCAAGTTCAATCCTGGATTATAATTGTTATGTAACAACGACGTTTCTT TTCTTTTATTAATATGACGTGGGATTAGTTTTTAAGCATAGTCGATTAAT GTATCTTTTAGCAAGAAGAGTCAAATTGTATATATATTTTATTTTCATAG TGTATGTACATTCTTTTAAATAGTCATCCCTGTAAAATATATCTTAGTGT ATGATTGTMCCCCCGATCCAATCGTCTCCTTGTTTCGCTTTTCCTCCGGT CCGTTACTTCCGTATTTAGGTAGCGTTAGTGGAACACTACCATAATTATA ATGAATTAAGGTATTTTATTCAAAGCACATTCGAGTTTTGTTGTTGTTAA CTTGAACAACTTATTTTGCTAAGTTGTTGTCATTATTCTTTAATTCTTGA GGAAATAAGAGCAAAGTATAAAGTAATCCAACTGTGTGTGCTCATGAATG ATTAAAGATGGATAAAACATATCCTAGAAAGCGGGAACGGCGTTTTCTAG TTGGGAATCGGAACATGATTTGCTATTTTCTAAAACTGTTGTTATAATTT TTTTAATTCTTAAAGACAGAACATCAATGTGTATAGTAATAACAGAGTGG GAAATGTGTGTTAATTTCCATCCTTTCGCAGCTGCTTGCAGCTGATTTAA TGAAACGTCATGATAGCTAAGCTGCTCTCCTCCCCAAAGAGTTTTTGAAT GATGAGAGTAACAATGAGCAGTTTTTGGGGAGATATTAGAGTAAGTCCAT GTTGGACTCAGAATATTATTGAAGATCAAAAATGGAGTAATTCCTAATTA TGTCCTAACTTGATATGGAGTGAGGCTTGTGTTTATTTTTTATATGATTT TTTGACCCAGGGAGTACTTCATCACTTTGCTAGGCCTCTTCTAAATCATA TTCATTTTTTAAAATGTTATATAAAGTACTTCCCTCTTAAACAAAACGGC TGCAAGATTTAATTCATTTTATACAGTGATCCCTGTATATTATACTCCTT TTTTTATCTTTATATTTTATAAGATATACACAGGGAGCACAATATACCTT CAGATTGTTTTTCAAATGTACATAGATTAATTTTTACTGGCTAGATGGCT CTTAAGTTGAATCAATGTTACTTTTTAAAGACTTTTTCACGAGAATTGGC NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAAAATTCGTATGACGTAT TTTTTTTTTTTGTAGAATTATATAATATAGAATTTATTCTGGTATAAAAT TTAATATAATTACTGAATATAACTGCCATCAGCTGCTATGAGATCCTCCA AGCGCTCGCGGAAGGCCTTGCACACATTGAAGATCTAATGGMCTTCAATG 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